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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-07-18 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程,应用于细菌孤儿受体 | 通过生物信息学和结构分析预测PAS域,利用片段库筛选出三种能显著提高CU228热稳定性的配体,并采用多种技术验证其结合特性 | 研究仅针对CU228这一特定蛋白质,未验证其在更广泛PAS蛋白中的适用性 | 开发一种筛选小分子配体的方法,用于增强孤儿PAS蛋白的稳定性 | 细菌孤儿受体CU228(一种PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR | NA | 蛋白质结构数据、光谱数据 | 约760种化合物的片段库 |
82 | 2025-07-17 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究通过结合合成生物学与合成电化学,开发了一种环境友好的方法来合成吲哚咔唑类化合物,并扩展了其化学空间 | 首次将合成生物学与合成电化学结合,实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成,并发现了N-N同源二聚化的新结构 | 未明确提及实验规模或工业化应用的可行性 | 开发绿色合成方法以扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成化学 | NA | 合成生物学、合成电化学、酶促糖基化 | NA | 化学合成数据 | 17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试 |
83 | 2025-07-17 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
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研究论文 | 本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架,旨在通过将代谢抽象为管道和阀门的网络,简化食品合成生物学中的设计和工程过程 | 提出了管道代谢模型,将代谢网络抽象为管道和阀门,分离酶水平控制和途径水平优化,简化设计逻辑 | 模型的实际应用效果和广泛适用性尚未经过大规模验证 | 降低合成生物学研究的障碍,促进可持续食品生产的创新 | 功能性食品分子(如碳水化合物、蛋白质和脂肪)的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | NA |
84 | 2025-07-17 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究介绍了一种由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂质聚合物的合成 | 通过将聚脯氨酸链锚定在膜上,实现了可逆的相分离,高温形成簇,冷却后分散,动态控制局部膜组成 | NA | 探索新型脂质聚合物在膜微区形成和渗透性控制方面的应用 | 由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜和FRAP分析 | NA | NA | NA |
85 | 2025-07-17 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 本研究开发了一种灵活的无细胞(膜)蛋白质合成系统(CF(M)PS),用于研究与膜蛋白相关的糖生物学,并成功应用于糖缀合物的生产 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统,用于膜蛋白的转录翻译耦合和溶解,成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并启动了EPS合成 | 研究未提及该系统在大规模生产中的效率或成本效益 | 扩展合成生物学工具包,研究细胞外多糖的合成途径 | 微生物细胞外多糖(EPS)及其合成途径中的关键酶和膜相关生化反应 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统(CF(M)PS),纳米脂质体膜模拟物 | NA | 生化反应数据 | 未明确提及具体样本数量,但使用了CGMCC 2876的膜结合磷酸糖基转移酶 |
86 | 2025-07-17 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
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研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母,实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 优化了酿酒酵母菌株,实现了羟基酪醇和红景天苷的高效生物合成,并通过增强UDP-葡萄糖供应显著提高了红景天苷的产量 | 研究中未提及菌株的长期稳定性或大规模生产中的潜在问题 | 开发高效生物合成羟基酪醇和红景天苷的方法,以解决其自然提取产量低和化学合成复杂的问题 | 酿酒酵母菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵技术 | NA | NA | 使用了优化的酿酒酵母菌株(ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3),并在摇瓶和15 L生物反应器中进行发酵 |
87 | 2025-07-17 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文综述了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学中的应用 | 系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其多功能应用,特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化中的潜力 | 面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战 | 探讨铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学领域的应用 | 铁蛋白纳米颗粒 | 生物医学 | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA |
88 | 2025-07-17 |
A digital plating platform for robust and versatile microbial detection and analysis
2025-Jul-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11525-6
PMID:40653544
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research paper | 介绍了一种数字平板(DP)平台,该平台结合了传统平板培养和数字生物检测技术,用于微生物的快速分离、定量和表型特征分析 | 提出了一个结合传统平板培养和数字生物检测技术的数字平板平台,实现了微生物的快速检测和分析,显著缩短了检测时间并提高了单细胞分辨率 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 开发一种快速、高效的微生物检测和分析平台 | 微生物(如大肠杆菌)及其在混合微生物群落中的行为 | microbiology | NA | digital bioassay technology, high-density picoliter microwell array chip | NA | microbial data | 未提及具体样本数量,但涉及多种微生物实验(如大肠杆菌) |
89 | 2025-07-17 |
Synthetic biology for space exploration
2025-Jul-12, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00488-7
PMID:40651964
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research paper | 本文探讨了合成生物学在太空探索中的潜在应用,包括资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康等关键主题 | 提出合成生物学作为推动人类太空和行星探索的有力工具,并为短期、中期和长期发展提供建议 | NA | 探索合成生物学在解决太空探索挑战中的应用 | 太空探索中的资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
90 | 2025-07-17 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文综述了50年来化学家设计和合成的糖修饰核酸(XNA)系统,探讨了其在生物技术和合成生物学中的应用 | 系统总结了XNA的构象行为及其与天然核酸的正交性,为XNA复制和进化提供了更理性的方法 | 未提及具体实验数据或样本量,主要为基础性综述 | 探讨糖修饰核酸(XNA)的构象特性及其在合成生物学等领域的应用潜力 | 糖修饰核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
91 | 2025-07-17 |
Expanding genetic engineering capabilities in Vibrio natriegens with the Vnat Collection
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf580
PMID:40650977
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研究论文 | 本文介绍了Vnat Collection,一个专为Vibrio natriegens设计的模块化工具包,旨在克服其遗传工程工具的不足 | 通过优化的Golden Gate克隆策略和改进的连接序列,实现了组装效率的300倍提升,并引入了新型操作子连接器和精确的基因调控系统 | NA | 扩展Vibrio natriegens的遗传工程能力,以充分发挥其在合成生物学中的潜力 | Vibrio natriegens | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆策略、NT-CRISPR方法 | NA | NA | 超过220个经过严格验证的模块化组件 |
92 | 2025-07-17 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出了一种名为DySEEP的方法,用于评估工业生物产品的生产潜力,并以PHB生产为例进行了分析 | 提出了一种结合动态通量平衡分析和经济指标的DySEEP方法,用于评估生物产品的生产潜力,并提出了提高PHB产量的基因改造目标 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物特性 | 优化生物塑料PHB的生产过程,降低生产成本 | 重组微生物的PHB生产潜力 | 生物工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | NA | 模拟数据 | NA |
93 | 2025-07-17 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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research paper | 开发了一种新型软件工具,通过计算模型预测ColE1样质粒的拷贝数,旨在简化质粒拷贝数设计 | 首次提出了一个能够从复制起点(ORI)序列计算预测质粒拷贝数的机器学习模型,强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 开发计算工具预测质粒拷贝数,优化合成生物学中的质粒工程工作流程 | ColE1样质粒的复制起点(ORI)序列 | synthetic biology | NA | machine learning | machine learning model | sequence data | NA |
94 | 2025-07-17 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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research paper | 本文探讨了机器学习概念在生物框架中的应用,以探索人工神经网络、信号通路和基因调控网络之间的结构和功能相似性(及差异) | 将机器学习概念应用于生物系统,探索人工神经网络与生物信号通路、基因调控网络的相似性,并提出适合生物分类任务的神经网络架构 | 研究尚处于初步阶段,未涉及具体实验验证 | 探索生物系统中信号通路和基因调控网络的固有计算能力 | 细胞内的信号通路和基因调控网络 | machine learning | NA | NA | artificial neural networks | NA | NA |
95 | 2025-07-16 |
Programmable DNA Hairpin Locker: Dual-Layer Encrypted Carrier Communication
2025-Jul-15, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c01802
PMID:40614219
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA的双层加密载体通信系统,利用DNA的可编程性和分子信标架构实现精确的信号识别与处理 | 开发了DNA发夹锁(DHL)架构,具有Exo λ抗性,支持动态响应DNA信号并保持稳定运行,同时设计了三种变体支持九种不同的输入/输出配置 | 未提及具体实验规模或实际应用中的性能限制 | 开发一种安全可靠的分子通信系统,用于生物传感和合成生物学应用 | DNA分子及其在通信系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子编程、lambda核酸外切酶(Exo λ) | NA | 分子信号 | NA |
96 | 2025-07-16 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展,探讨了其在精准医学和微创治疗中的潜在应用 | 纳米机器人技术通过结合纳米级工程、合成生物学和智能计算,开创了精准医学的新领域,从静态构造发展到能够动态导航胃肠环境的智能代理 | 讨论了自主性、脱靶控制和伦理法律框架等重大挑战 | 推动纳米机器人技术在胃肠外科手术中的临床转化和应用 | 胃肠外科手术中的纳米机器人技术 | 精准医学 | 胃肠疾病 | 纳米机器人技术、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
97 | 2025-07-15 |
Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects of Traditional Medicinal Plants for Urolithiasis: A Scoping Review
2025-Jul-02, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14132032
PMID:40648041
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综述 | 本文总结了传统药用植物在尿路结石管理中的抗氧化和抗炎作用及其分子机制 | 聚焦于传统药用植物的抗氧化和抗炎作用,填补了尿路结石研究中此类生物标志物的研究空白 | 仅纳入6项研究,样本量较小且地域分布有限 | 探索传统药用植物在尿路结石管理中的潜在应用价值 | 传统药用植物及其生物活性成分 | 生物医学 | 尿路结石 | 文献综述方法 | NA | 文献数据 | 6项研究(来自中国2项、印度3项、韩国1项) |
98 | 2025-07-15 |
Revisiting Traditional Medicinal Plants: Integrating Multiomics, In Vitro Culture, and Elicitation to Unlock Bioactive Potential
2025-Jul-02, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14132029
PMID:40648038
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综述 | 本文回顾了传统药用植物的研究,整合了多组学技术、体外培养和诱导策略以探索其生物活性潜力 | 结合多组学技术、体外培养和诱导策略,全面探索药用植物的生物活性化合物 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索和优化药用植物中生物活性化合物的生产 | 传统药用植物及其生物活性化合物 | 生物技术 | NA | 多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、转录组学)、体外培养系统、诱导策略 | NA | 多组学数据 | NA |
99 | 2025-07-14 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-Jul-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
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review | 本文综述了CRISPR技术在基因组编辑以外的广泛应用,包括分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用图谱和单细胞分析等领域 | 探讨了CRISPR技术在基因组编辑之外的新应用,如利用Cas酶的附带切割活性进行快速核酸检测,以及通过合成生物学组件扩展其检测离子、代谢物和蛋白质的能力 | 未来研究需要克服当前技术的局限性,如与人工智能、空间组学和微流体的整合 | 扩展CRISPR技术的应用范围,超越传统的基因组编辑 | CRISPR技术及其在多个领域的应用 | 分子生物学 | NA | CRISPR, Cas酶, 合成生物学 | NA | NA | NA |
100 | 2025-07-12 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-Jul-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究开发了基于CRISPRi的植物细胞正交抑制系统,利用具有两个相同sgRNA结合位点的FMV 34S启动子合成变体 | 首次在植物细胞中利用FMV 34S启动子变体开发CRISPRi正交抑制系统,并验证了相同sgRNA结合位点比异源位点具有更高的抑制效率 | 研究仅基于瞬时转基因表达系统,未在稳定转化植物中进行验证 | 开发植物合成生物学工具箱中的基因表达精确调控系统 | 植物细胞中的基因表达调控系统 | 合成生物学 | NA | CRISPRi、dCas9-SRDX融合蛋白、Cre/loxP RNA支架正交系统 | NA | 基因表达数据 | 33种34S启动子变体 |