本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
|
综述 | 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜的最新进展 | 将合成生物学的最新成果应用于细菌生物膜的功能化调控 | NA | 开发具有新功能的细菌生物膜调控技术 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 102 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025-Jul-02, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因组重设计策略在治疗和环境应用中的最新进展 | 系统整合了CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、逆转录子等多种噬菌体工程技术,展示了定制化功能噬菌体的开发潜力 | 面临噬菌体抗性、免疫反应和当前工程方法局限性等挑战 | 探讨噬菌体工程技术在治疗和环境领域的应用潜力 | 工程化噬菌体及其基因组重设计技术 | 合成生物学 | 耐药性感染、癌症 | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、逆转录子、同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | 宿主范围扩展、生物膜降解、靶向抗菌活性、金属结合肽展示 | 医药,环境 |
| 103 | 2025-10-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
|
研究论文 | 开发基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计出能够自凝聚形成液滴的极简二肽结构,并发现其在不同pH下可形成具有催化功能的纤维形态 | NA | 开发具有酶催化功能的极简肽类超分子材料 | 由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽分子 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶学, 合成生物学 |
| 104 | 2025-10-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
|
研究论文 | 开发了BioPKS自动化逆向生物合成流程,结合I型聚酮合酶和单功能酶进行化学物质生物合成设计 | 首次将计算设计的嵌合I型聚酮合酶与酶催化途径相结合,创建了自动化逆向生物合成工具BioPKS | NA | 开发自动化生物合成途径设计工具以扩展生物制造化学品的可及空间 | I型聚酮合酶(PKSs)和单功能酶的组合系统 | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成,计算设计 | NA | 化学结构数据,酶催化反应数据 | 155种生物制造候选化合物 | BioPKS, RetroTide, DORAnet | NA | 嵌合I型聚酮合酶与单功能酶的组合生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 105 | 2025-10-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
|
研究论文 | 提出一种抽象层次结构来定义生物铸造厂工作流程和操作,以促进可互操作的合成生物学研究与应用 | 首次提出将生物铸造厂活动组织为项目、服务/能力、工作流程和单元操作四个互操作层次的抽象框架 | NA | 解决生物铸造厂标准化不足问题,提高合成生物学研究的可扩展性和效率 | 生物铸造厂工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | 抽象层次框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 106 | 2025-10-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
|
研究论文 | 本研究开发了一种无标记瞬态红外纳米显微镜技术,用于解析单个光开关脂质体在水中的毫秒级动态变化 | 首次结合散射型扫描近场光学显微镜的化学识别和高时空分辨率,实现了对单个光开关脂质体的无标记中红外成像和光谱分析 | 方法尚未在更复杂的生物环境中验证,采样时间虽快但仍可能错过某些超快动力学过程 | 开发非破坏性无标记技术研究纳米载体的生物物理化学性质 | 偶氮苯基光开关脂质体形成的单个脂质体 | 纳米光学成像 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜,中红外成像和光谱 | NA | 红外光谱图像,动态时间序列数据 | 单个脂质体样品 | NA | NA | NA | 医学,药物递送,纳米诊疗,合成生物学 |
| 107 | 2025-10-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
|
研究论文 | 本研究创建了一个包含超过32万实验验证实例的综合性RNA数据集,为RNA设计和建模算法建立了新的社区基准 | 提供了首个来自实验验证来源的大规模标准化RNA设计基准数据集,包含许多对现有RNA逆向折叠工具具有挑战性的结构 | NA | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战,推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术领域的应用 | RNA分子及其二级结构 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过320,000个实验验证实例 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学,生物技术 |
| 108 | 2025-10-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
研究论文 | 本研究通过挖掘乌头属植物转录组发现多个萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶,揭示了它们在三萜类化合物生物合成中的多功能催化作用 | 发现了14种功能分化的P450酶,其中8种具有多功能催化特性,能够在支架的七个不同位点进行氧化反应,并揭示了雷公藤甲素在乌头属植物中的趋同生物合成 | NA | 探究乌头属植物中P450酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物(Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum)中的萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析、定点突变 | NA | 转录组数据、酶活性数据 | NA | NA | 乌头属植物 | 组合生物合成途径,用于生产雷公藤甲素、冠芙二萜A和14种新型阿替瑟类化合物 | 医药 |
| 109 | 2025-10-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了鳗弧菌NB10中一个新型极端碱性诱导启动子,该启动子能显著增强FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一个位于鳗弧菌肽酰脯氨酰顺反异构酶五端上游区域的新型极端碱性诱导启动子,在pH 10条件下能实现2.88倍的基因表达上调 | 研究目前仅在大肠杆菌中验证了启动子功能,尚未在原宿主鳗弧菌或其他微生物系统中进行广泛测试 | 鉴定和表征鳗弧菌NB10中响应极端碱性条件的启动子区域 | 鳗弧菌NB10的FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶及其上游启动子区域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析、β-半乳糖苷酶报告基因系统 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | 报告基因构建 | 大肠杆菌 | 碱性诱导启动子系统 | 工业生物技术 |
| 110 | 2025-10-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
|
研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定到参与有效霉素生物合成的温度调控因子,并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现P启动子的温度调控机制,并成功构建了更高效的短启动子温度调控系统 | 研究仅限于两种链霉菌宿主,未在其他微生物中验证系统的普适性 | 研究链霉菌中温度调控系统在有效霉素生物合成中的作用 | 吸水链霉菌TL01和白色链霉菌J1074 | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析,启动子工程,基因过表达 | NA | 基因表达数据,代谢产物产量数据 | 多种工程化链霉菌菌株 | 启动子工程,基因过表达 | Streptomyces albus J1074, Streptomyces hygroscopicus TL01 | 温度调控表达系统,包含改造的短启动子和调控蛋白SHJG_5852、SHJG_6392 | 工业生物技术 |
| 111 | 2025-10-05 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2025-Jul-03, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
|
研究论文 | 本研究通过代谢组学和全基因组关联分析鉴定出茶树中调控嘌呤代谢的关键基因CsMTAN,并揭示其通过水平基因转移演化而来 | 首次发现CsMTAN基因通过水平基因转移进入植物基因组,并证实其F179Y突变会显著改变酶活性,从而影响茶树嘌呤代谢流向 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达验证,缺乏稳定的转基因植物系统验证 | 解析茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱生物合成的遗传与分子机制 | 183个遗传多样性茶树品种的嫩叶和成熟叶 | 植物代谢组学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联分析(GWAS)、系统发育分析、蛋白结构建模、瞬时过表达 | NA | 代谢物数据、基因组数据 | 183个茶树品种的两种组织(嫩叶和成熟叶) | NA | 本氏烟(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业、合成生物学 |
| 112 | 2025-10-05 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2025-Jul-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
|
研究论文 | 开发了完全由蛋白质构成的3D打印微机器人结构,并通过肌动球蛋白皮层实现驱动 | 首次实现完全基于蛋白质的3D打印机器人结构,采用最小肌动球蛋白皮层进行驱动 | 需要生物材料专业背景,完成过程需15天时间 | 将生物分子活性组装并放大至人造设备中执行工作 | 蛋白质基3D打印结构和肌动球蛋白活性涂层 | 合成生物学 | NA | 3D打印、生物分子组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动球蛋白活性涂层系统 | 工业生物技术, 材料 |
| 113 | 2025-10-05 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过构建新生命系统来理解生物自组织的基本设计原则 | 提出将长度或时间尺度强加于生物活动是自组织的基本策略,并展示如何在合成系统中实现这一设计目标 | NA | 扩展对生命自组织设计原则的理解 | 生物自组织系统,从细胞到有机体水平 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自组织系统设计 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 114 | 2025-10-05 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Jul-01, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
|
研究论文 | 评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用,并通过转录组分析揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源,未涉及更复杂的发酵基质 | 探究微量元素锌和铁对土曲霉衣康酸发酵的影响机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 发酵技术,转录组测序 | NA | 发酵数据,基因表达数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 115 | 2025-10-05 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Jul-01, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
|
综述 | 探讨基于CRISPR工具包的成功基因组编辑应用设计原则 | 提出构建一体化平台的策略,开发用于微生物宿主(如酵母)的CRISPR基因编辑系统,并讨论减少脱靶切割的方法 | NA | 开发稳健的CRISPR组件设计策略以简化未来基因组编辑应用 | CRISPR-Cas系统及其在微生物宿主中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 一体化质粒系统 | 工业生物技术 |
| 116 | 2025-10-05 |
Degradable living plastics programmed by engineered spores
2025-Jul, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01713-2
PMID:39169270
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学和聚合物工程开发了可降解的活性塑料 | 利用工程化孢子构建可编程降解的活性塑料系统,孢子能在材料加工过程中保持活性并在触发后释放降解酶 | 未明确说明该技术的规模化生产成本和实际应用环境中的降解效率 | 开发可生物降解的环保塑料材料 | 枯草芽孢杆菌孢子和聚己内酯塑料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、基因电路工程 | NA | NA | NA | 基因电路 | 枯草芽孢杆菌 | 木糖诱导型分泌表达伯克霍尔德菌脂肪酶的基因电路 | 环境,材料 |
| 117 | 2025-10-05 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
|
综述 | 本文系统回顾了CAR-T细胞疗法从第一代到第五代的发展历程及其在癌症治疗中的革命性应用 | 整合了合成生物学技术开发第五代CAR-T细胞,引入共刺激结构域、双信号通路和细胞因子释放机制等创新设计 | 在实体瘤治疗中仍面临肿瘤免疫抑制微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR-T细胞疗法的发展历程和未来方向 | CAR-T细胞疗法的技术演进和临床应用 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 细胞工程技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 嵌合抗原受体设计,包括信号传导通路和细胞因子释放机制 | 医学 |
| 118 | 2025-10-05 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统,用于DNA信息存储和处理 | 首次在体外构建了模块化、正交且可量化的遗传记忆系统,并成功应用于级联生物转化过程 | NA | 开发模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统 | 基于丝氨酸整合酶的DNA信息存储和处理系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 体外系统 | 基于三种正交丝氨酸整合酶的遗传记忆系统,包含两个非共价化学相互作用模块(链霉亲和素-生物素和parS-ParB) | 工业生物技术 |
| 119 | 2025-10-05 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
|
综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系,重点关注它们的适应性和利用昆虫宿主的能力,并回顾了天然产物研究的历史 | 系统总结了昆虫病原线虫-细菌共生体-昆虫三方伙伴关系的研究进展,并强调了利用合成生物学方法改进天然产物生物活性的最新方法 | NA | 研究昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系和致病机制 | 昆虫病原线虫(Steinernema和Heterorhabditis属)及其细菌共生体(Xenorhabdus和Photorhabdus属) | 微生物学 | NA | 合成生物学方法、高通量技术 | NA | NA | NA | NA | 昆虫病原线虫、Xenorhabdus细菌、Photorhabdus细菌 | NA | 农业、生物防治 |
| 120 | 2025-10-05 |
Microbial production of hyaluronic acid: The current advances, engineering strategies and trends
2025-Jul, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.03.015
PMID:40154620
|
综述 | 本文综述了透明质酸的微生物生产方法,重点关注工程菌株的应用、代谢工程策略和工业生产挑战 | 系统总结了利用谷氨酸棒杆菌和枯草芽孢杆菌等工程菌株生产透明质酸的最新进展,并探讨了合成生物学在解决分子量和副产物形成等问题中的应用 | 需要开发更高效、抗污染且能利用低成本底物的工程菌株 | 推进透明质酸的工业化生产并扩展其应用领域 | 透明质酸的微生物生产菌株(如兽疫链球菌、谷氨酸棒杆菌、枯草芽孢杆菌) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | Streptococcus zooepidemicus, Corynebacterium glutamicum, Bacillus subtilis, Pseudomonas putida, Halomonas spp | 代谢通路工程、生物合成途径优化 | 医药, 化妆品, 制药 |