合成生物学相关文章
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当前共找到 149 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-Jul, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2025-07-06 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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research paper | 该研究设计和构建了在酵母P. Pastoris中光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 通过构建光调控的转录和翻译系统，解决了传统诱导启动子在发酵安全性和表达能力上的缺陷，并避免了化学诱导剂带来的复杂性 | NA | 优化P. pastoris在生物技术和合成生物学中的应用 | 酵母P. Pastoris | 合成生物学 | NA | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统设计 | NA | NA | NA |
| 123 | 2025-07-06 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
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research paper | 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜以实现新功能 | 结合合成生物学的最新进展，开发新型生物系统以应对全球性挑战 | NA | 研究工程生物学在细菌生物膜控制和改造中的应用 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学 | NA | NA | NA |
| 124 | 2025-07-05 |
Flippase-Mediated Hybrid Vesicle Division
2025-Jul-04, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504519
PMID:40613217
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研究论文 | 本文展示了在聚合物脂质混合囊泡中重组活性Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶，以实现囊泡分裂 | 通过重组Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶在混合囊泡中实现跨膜不对称性，进而引发囊泡收缩和分裂，模拟细胞分裂过程 | 研究仅针对特定组成的混合囊泡系统，未验证在其他系统中的适用性 | 开发能够实现蛋白质介导分裂的合成系统，推动自下而上的合成生物学发展 | 由磷脂和两亲性嵌段共聚物组成的聚合物脂质混合囊泡 | 合成生物学 | NA | 脂质翻转酶重组技术 | NA | 实验数据 | 使用特定组成的混合囊泡系统（含1或2.5 mol%两亲性嵌段共聚物） |
| 125 | 2025-07-05 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025-Jul-02, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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综述 | 本文综述了噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的最新进展 | 探讨了多种噬菌体工程技术，包括CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法，展示了定制功能噬菌体的潜力 | 讨论了当前工程方法的局限性，如噬菌体抗性、免疫反应等 | 探索噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的潜力 | 噬菌体及其基因重组技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法 | NA | NA | NA |
| 126 | 2025-07-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 本文开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 提出了一种简单的二肽，能够自组装成微米级液滴，并作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH下形成纤维状结构作为酯酶模拟物 | NA | 开发最小化的超分子催化剂设计策略，应用于酶学和合成生物学 | 二肽自组装形成的液滴和纤维 | 合成生物学 | NA | 液相分离(LLPS) | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-07-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
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研究论文 | 本文介绍了BioPKS管道，一种自动化的逆生物合成工具，结合多功能I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶，用于化学生物合成 | 开发了BioPKS管道，结合RetroTide和DORAnet工具，自动设计I型聚酮合酶与单功能酶的合成路径，扩展了化学生物合成的可能性 | 未提及具体局限性 | 通过合成生物学方法更可持续地生产化学品 | I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成工具（RetroTide和DORAnet） | NA | 化学结构数据 | 155种生物制造候选化合物 |
| 128 | 2025-07-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一个抽象层次结构，用于定义生物铸造厂的工作流程和操作，以促进合成生物学研究的互操作性 | 提出一个四层互操作性抽象层次结构，优化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，提高实验工作流程的模块化、灵活性和自动化 | NA | 提高合成生物学研究的标准化和互操作性 | 生物铸造厂的工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2025-07-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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research paper | 该研究开发了一种非破坏性、无标记的中红外成像和光谱技术，用于研究单个光开关脂质体的动态变化 | 利用散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM）实现了高时空分辨率的中红外成像和光谱分析，能够以30毫秒的采样时间跟踪动态变化 | 该方法可能仅限于特定类型的光开关纳米载体研究，且未涉及体内应用验证 | 推进光药理学、药物递送、纳米诊疗和合成生物学领域的研究 | 光开关脂质体（azobenzene-based photoswitchable lipids） | 纳米技术 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM） | NA | 图像和光谱数据 | 单个光开关脂质体 |
| 130 | 2025-07-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
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研究论文 | 本文创建了一个全面的RNA设计数据集，用于机器学习和RNA建模算法的基准测试 | 提供了一个包含超过32万实验验证实例的标准化基准数据集，用于RNA设计和建模算法的开发和评估 | 数据集虽然全面，但可能无法覆盖所有RNA结构和序列的多样性 | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战，推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术中的应用 | RNA分子及其二级结构和序列 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过32万实验验证实例 |
| 131 | 2025-07-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
research paper | 该研究通过挖掘乌头属植物的转录组数据，发现并验证了多种萜类合成酶和细胞色素P450单加氧酶的功能，揭示了它们在二萜类化合物结构多样化和生物活性形成中的关键作用 | 发现了9种能够提供ent-kaurene、ent-atiserene或16α-hydroxy-ent-kaurene骨架的TPSs和14种具有多功能的P450s，其中8种P450s能够在骨架的七个不同位点催化氧化反应 | 研究主要集中在乌头属植物中的二萜类化合物，可能不适用于其他植物或化合物类型 | 探索细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum）中的二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析和突变实验 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 两种乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum） |
| 132 | 2025-07-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了Vibrio anguillarum NB10的启动子区域，该区域在极端碱性条件下增强FK506结合蛋白型肽酰-脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一种新型极端碱性诱导启动子，可用于生物技术应用，如pH响应基因表达系统的开发 | 研究仅在大肠杆菌中测试了启动子活性，未在其他宿主系统中验证 | 研究Vibrio anguillarum NB10在极端碱性条件下基因表达的调控机制 | Vibrio anguillarum NB10的启动子区域及其调控的FklB基因 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析，β-半乳糖苷酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 133 | 2025-07-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
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研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定参与有效霉素生物合成的温度调控因子，并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现并重建了一个温度调控系统，用于调控放线菌天然产物的生产 | 研究仅在特定链霉菌株中进行，未在其他菌株中验证系统的普适性 | 鉴定有效霉素生物合成中的温度调控因子并开发温度调控表达系统 | 链霉菌(Streptomyces hygroscopicus TL01和Streptomyces albus J1074) | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析、启动子工程 | NA | 分子生物学数据 | 多种链霉菌株 |
| 134 | 2025-07-04 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2025-Jul-03, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析，揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN在嘌呤代谢和咖啡因生物合成中的关键作用 | 首次鉴定并功能验证了水平转移基因CsMTAN在茶树嘌呤代谢中的关键作用，发现其SNP变异导致酶活性显著改变 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时表达系统，未进行稳定的转基因植株验证 | 阐明茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱合成的遗传与分子机制 | 茶树(Camellia sinensis)叶片组织 | 植物代谢组学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联分析(GWAS)、体外酶活实验、瞬时表达系统 | NA | 代谢组数据、基因组数据 | 183个遗传多样性茶树品种的幼叶和成熟叶组织 |
| 135 | 2025-07-04 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2025-Jul-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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research paper | 该研究报道了一种全蛋白质基微三维打印机器人结构的逐步构建过程，这些结构由最小肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了全蛋白质基微三维打印机器人结构的构建与驱动，为合成生物学中生物分子活性的放大提供了新方法 | 该方法需要使用者具备生物材料专业知识，且完成过程需要15天时间 | 开发自供能软体机器人并推动三维蛋白质基机器人技术的发展 | 蛋白质基微三维打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维打印技术、肌动球蛋白涂层技术 | NA | NA | NA |
| 136 | 2025-07-03 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在构建新生命系统中对生命自组织基本设计原则的理解扩展 | 提出了将长度或时间尺度强加于生物活动是自组织的基本策略，并展示了如何在合成系统中实现这一策略 | 未具体提及实验验证或具体技术实现的局限性 | 探索生命自组织的设计原则及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学构建的新生命系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2025-07-03 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Jul-01, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
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研究论文 | 评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉发酵生产衣康酸的潜在影响 | 首次评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉发酵生产衣康酸的影响，并通过转录组测序揭示相关基因表达变化 | 研究仅针对纯葡萄糖和木糖作为底物，未考虑其他碳源的影响 | 探索锌和亚铁离子对土曲霉发酵生产衣康酸的影响 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 138 | 2025-07-03 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Jul-01, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
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research paper | 本文讨论了利用CRISPR工具包设计成功基因组编辑应用的原理和策略 | 提出了两种独立策略开发一锅质粒系统，并讨论了减少脱靶切割的方法 | 未提及具体实验验证结果或性能指标 | 开发基于CRISPR的基因编辑系统 | 微生物宿主（如酵母） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-06-27 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
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研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现并行计算，采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译，支持权重更新为负值 | 目前仅能预测和拟合线性函数 | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA |
| 140 | 2025-06-13 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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review | 本文综述了嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的发展历程及其在癌症治疗中的革命性潜力 | 探讨了从第一代到第五代CAR T细胞的设计进展，包括共刺激结构域的引入、双信号通路和细胞因子释放机制的整合 | 在实体瘤治疗中仍面临免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的最新进展和未来方向 | CAR T细胞疗法及其在血液系统恶性肿瘤和实体瘤中的应用 | 免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |