合成生物学相关文章
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当前共找到 32 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-14 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2026-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
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综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义和研究方法，涵盖自然进化与人工设计两类，并探讨了该领域当前面临的挑战与未来方向 | 系统比较了自然进化与人工设计两类从头蛋白质的研究范式，强调了两者在生物学发现与工程应用中的融合趋势 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献进行归纳分析 | 梳理从头蛋白质研究领域的发展脉络、方法学及挑战，促进进化生物学与合成生物学的交叉融合 | 自然进化的从头蛋白质（源于非编码DNA）与人工设计的从头蛋白质（通过计算与实验方法从头创建） | 合成生物学 | NA | 计算设计、实验方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 2 | 2025-12-14 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1，以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中，仅过表达天然野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成，无需反馈抑制抗性变体，且开发了基于sRNA的系统动态抑制TCA循环基因以平衡细胞生长与产物合成 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了丙酮酸供应，需补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力，并优化L-亮氨酸生产 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、基于sRNA的诱导型调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制 | 工业生物技术 |
| 3 | 2025-12-12 |
Biotechnology of isopentenols production from microbial cell factories
2026-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133574
PMID:41167484
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂生产异戊烯醇的生物技术，包括遗传、转录和翻译修饰以及培养条件优化 | 这是首篇全面涵盖微生物异戊烯醇生产所有生物技术方面的综述 | NA | 综述微生物生产异戊烯醇的生物技术，以促进可持续生产 | 异戊烯醇（异戊烯醇和异戊烯醇）及其在生物治疗、先进生物燃料和营养保健品中的应用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌、纳氏弧菌、枯草芽孢杆菌 | 合成途径生成异戊二烯前体（IPP和DMAPP） | 医药、能源、食品 |
| 4 | 2025-12-12 |
Living materials for gas therapy
2026-Jan, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
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综述 | 本文系统总结了基于活体材料的气体疗法最新进展，重点按生物来源和工程设计原则分类，并讨论了其在癌症、炎症性疾病和组织再生中的治疗机制与疗效 | 提出活体材料作为气体疗法的新范式，利用工程化生物实体（如细菌、细胞、藻类）实现智能气体生成和可控释放，克服传统纳米载体的生物相容性、靶向性和响应性不足 | 生物安全性和可扩展性仍是主要挑战 | 推动精准气体医学领域发展，通过整合合成生物学和多模式治疗策略优化气体疗法 | 一氧化氮、一氧化碳、硫化氢、氢气和二氧化硫等医用气体 | NA | 癌症、炎症性疾病 | 合成生物学、基因编程、仿生工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌、细胞、藻类 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器 | 医学 |
| 5 | 2025-12-12 |
Rooted intelligence: Integrating AI, Omics, and Synthetic biology to engineer the plant microbiome
2026-Jan, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04614-w
PMID:41376894
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综述 | 本文综述了整合组学、合成生物学和人工智能以深化对植物-微生物互作的理解并支持可持续农业的最新进展 | 提出了“根植智能”的概念，将AI、组学和合成生物学整合用于工程化设计植物微生物组，旨在理性设计下一代植物根际促生菌和合成微生物群落 | 将实验室发现转化到田间条件存在挑战，需确保工程微生物的生物安全性，并解决伦理和监管问题 | 通过跨学科技术整合，支持可持续农业并设计适应不同农业生态系统的优化微生物群落 | 植物微生物组、植物-微生物相互作用、根际微生物群落 | 合成生物学、人工智能、农业生物技术 | NA | 组学技术（包括多组学数据整合）、合成生物学、AI驱动的预测建模和实时表型分析 | 预测建模、AI驱动工具 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具（用于设计微生物菌株和合成群落） | 植物根际微生物 | 设计具有增强性状（如营养溶解、胁迫耐受、病原抑制）的微生物菌株和合成群落 | 农业、环境 |
| 6 | 2025-12-11 |
The Road to Sustainable Soy Sauce Production and Consumption
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70352
PMID:41355608
|
综述 | 本文通过系统综述分析了酱油生产与消费的趋势，重点关注工艺优化、微生物发酵、安全性、废物管理和新兴分析技术五个关键领域，并提出了一个连接可持续性核心支柱的整合框架 | 提出了一个连接环境、经济、社会、技术和营养五大可持续性支柱的整合框架，并系统性地将传统工艺与宏基因组学、合成生物学、酶工程及多组学等新兴技术相结合进行趋势分析 | 整合传统方法与精准发酵等新兴技术仍面临微生物菌株不相容、可扩展性问题以及保持文化真实性和感官属性的挑战 | 审查酱油生产与消费的趋势，并为未来的研究、政策制定和工业实践提供方向，以促进可持续的酱油生产与消费 | 酱油的生产工艺、微生物发酵过程、消费模式及相关可持续性创新 | NA | NA | 宏基因组学、合成生物学、酶工程、多组学方法（代谢组学、基因组学、转录组学）、光谱学、传感器系统 | NA | 同行评审文献数据 | 181篇同行评审文章 | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 7 | 2025-12-11 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
|
综述 | 本文综述了工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的应用进展，包括细菌与肿瘤的复杂关系、细菌修饰的工程方法及其在增强癌症疗法中的应用 | 系统总结了利用合成生物学等工程方法改造活益生菌以增强其靶向肿瘤、激活免疫反应的能力，并探讨了联合疗法、个性化医疗及微生物组在提升疗效中的潜力 | NA | 探讨工程化活益生菌作为癌症免疫治疗新策略的潜力与应用 | 活益生菌及其工程化改造系统 | 合成生物学 | 癌症 | 测序技术、理化方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | 基于细菌的药物递送系统 | 医学 |
| 8 | 2025-12-10 |
Forged in O2: Transition metal ions and the rise of aerobic life
2026-Feb, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2025.113147
PMID:41265342
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综述 | 本文探讨了金属离子在需氧生命演化中的核心作用，从生物无机化学、酶学、合成生物学和微生物组科学的角度，分析了金属蛋白如何调控和利用氧气 | 整合多学科视角，结合仿生分子复合物及天然与人工金属蛋白研究，阐明氧气反应性的结构功能策略，并系统探讨金属离子在维持氧化还原平衡、宿主-微生物互作及疾病中的作用 | NA | 理解金属离子在氧气化学中的关键角色，以支持健康代谢和氧化应激相关疾病的研究 | 金属蛋白、金属酶、生物仿生分子复合物、天然与人工金属蛋白 | 生物无机化学 | 氧化应激相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-12-10 |
Biogenic amines in fermented foods: A comprehensive review from formation pathways, risk analysis, detection technologies to control measures
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117832
PMID:41360534
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综述 | 本文系统综述了发酵食品中生物胺的形成途径、风险分析、检测技术及控制措施，特别聚焦于微生物策略及其机制与未来展望 | 特别强调微生物控制策略作为内在兼容的解决方案，并展望了将微生物策略与AI驱动的生物传感器等智能技术结合，以及利用合成生物学提高酶产量的未来研究方向 | 在优化菌株效能、稳定性及大规模生产应用方面仍存在挑战 | 为发酵食品中生物胺的相关研究和实际应用提供结构化参考 | 发酵食品中的生物胺 | NA | NA | AI驱动的生物传感器、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 10 | 2025-12-10 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，将小鼠的H3K9甲基化酶和HP1引入酿酒酵母，探究H3K9甲基化及其阅读分子HP1对转录和染色质结构的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基化酶和HP1，以克服系统冗余问题，直接评估其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行，可能无法完全反映H3K9甲基化和HP1在高等生物中的全部功能，且未观察到对转录或染色质三维结构的显著影响 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的具体作用机制 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 引入小鼠H3K9甲基化酶催化H3K9甲基化及HP1蛋白 | 基础研究 |
| 11 | 2025-12-09 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
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综述 | 本文系统总结了稀有皂苷Rk1和Rg5在天然来源、提取加工、结构特性、药理机制及在功能性食品和营养品中潜在应用的最新进展 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌及生殖保护作用，并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其规模化生产提供的新途径 | 稀有皂苷Rk1和Rg5的天然丰度低、结构复杂且可持续生产面临挑战，其药代动力学特征尚不明确，缺乏严格的临床试验验证其疗效 | 系统总结稀有皂苷Rk1和Rg5的研究进展，弥合临床前研究与临床转化之间的差距，促进其在医疗保健和营养领域的更广泛应用 | 人参属植物（人参、西洋参、三七）中的稀有皂苷成分，特别是Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、神经退行性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、化学与物理转化方法、人工智能辅助生物转化、合成生物学策略 | NA | 文献数据、药理模型数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养品 |
| 12 | 2025-12-08 |
Creating a novel halotolerant whole-cell biosensor for efficient degradation and precise quantification of p-nitrophenol-substituted organophosphate pesticides in hypersaline ecosystems
2026-Feb-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118240
PMID:41285662
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研究论文 | 本研究构建了一种新型耐盐全细胞生物传感器，用于高盐环境中对硝基酚取代的有机磷农药的高效降解和精确定量 | 首次利用耐盐底盘Halomonas cupida J9构建了耐盐全细胞生物传感器，通过动态调控PobR表达水平显著降低了背景荧光，并将优化的生物传感电路引入具有降解功能的底盘，实现了检测与降解的双重功能 | 生物传感器仅对pNP取代的有机磷农药（如甲基对硫磷和杀螟硫磷）具有特异性，对非pNP取代的有机磷农药（如毒死蜱）无响应 | 开发适用于高盐环境的有机磷农药检测与降解技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、全细胞生物传感器构建、HPLC分析 | NA | 荧光信号、浓度测量数据 | 海水、高盐度河水、盐碱土样品 | BioBrick | Halomonas cupida J9 | 基于pNP响应转录调节因子PobR及其同源启动子与GFP报告基因融合的生物传感电路，结合有机磷农药降解通路 | 环境 |
| 13 | 2025-12-06 |
Microbial-mycotoxin interactions in food: A review of ecotoxicological implications and omics approaches for understanding detoxification mechanisms
2026-Apr, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2025.104955
PMID:41344758
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综述 | 本文综述了食品中微生物与霉菌毒素的相互作用，重点关注其生态毒理学影响以及利用组学方法阐明微生物解毒机制 | 系统整合了微生物解毒机制（吸附与酶促降解）与多组学技术（宏基因组学、基因组学、转录组学）的应用，并展望了合成生物学、CRISPR基因编辑和机器学习辅助生物信息学等未来方向 | 微生物解毒效率存在可变性、作用机制尚不明确、面临监管障碍，以及在复杂食品基质中检测掩蔽型霉菌毒素存在挑战 | 探讨食品系统中微生物与霉菌毒素的相互作用，以开发可持续的解毒策略，保障食品安全并降低生态毒理学影响 | 霉菌毒素（如黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮）及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 宏基因组学、基因组学、转录组学、多组学整合分析 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 14 | 2025-12-06 |
Fusarium-responsive materials: A next-generation strategy for sensing, actuation, and sustainable crop protection
2026-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128967
PMID:41061457
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综述 | 本文探讨了融合纳米技术、化学传感和智能驱动技术，构建能够实时识别病原体并自主干预的镰刀菌响应材料，以应对全球农业中镰刀菌属病原体带来的威胁 | 提出了“镰刀菌响应材料”这一新范式，将病原体特异性生物传感与刺激响应型纳米载体递送系统相结合，并展望了与机器学习、自供能传感器及合成生物学融合的智能、精准、可持续作物保护框架 | 本文是一篇展望性综述，主要提出概念框架和研究方向，未报告具体的实验数据或验证结果 | 旨在为应对镰刀菌属病原体对全球农业、粮食安全和可持续性的威胁，探索一种集实时传感与自主干预于一体的下一代作物保护策略 | 镰刀菌属病原体及其相关的生化特征，如挥发性有机化合物、霉菌毒素和酶标记物 | NA | NA | 电化学传感、光学传感、等离子体传感、机器学习算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 15 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
|
综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物，并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源（主要为海洋真菌）的抗骨质疏松天然产物，并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据，转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物（以聚酮类和萜类为主） | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 16 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
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研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台，通过人工智能辅助增强液滴检测性能，用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台，利用暗场成像显著提升液滴对比度，优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度，实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴，以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像，荧光成像，qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2025-12-03 |
Revolutionizing recombinant protein production in prokaryotic platforms - Methodologies and advances
2026-Feb, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2025.110778
PMID:41207077
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综述 | 本文综述了原核系统中重组蛋白生产的传统和新兴策略，包括遗传工程和合成生物学的最新进展 | 强调了新兴策略如改进的表达载体、工程化宿主、高通量筛选平台，以及融合标签、密码子偏好消除、启动子和RBS工程、伴侣蛋白辅助折叠等优化方法 | NA | 优化重组蛋白在原核系统中的表达，以满足各领域日益增长的需求 | 重组蛋白在原核平台的生产 | NA | NA | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌等原核生物 | 生物传感器、代谢途径 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 18 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
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综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述，系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析（2015-2025）与机制综述，系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果（尤其是在深海和沉积物生境中）联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析，多组学技术，沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 19 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
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综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 20 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
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研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子，成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统，并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子，54个功能验证，41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |