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当前共找到 1583 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Menaquinone biosynthesis in Lactococcus lactis: Recent advances and future prospects
2026-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100304
PMID:42761602
|
综述 | 本文综述了乳酸乳球菌中甲萘醌（维生素K2）的生物合成途径、生理功能及其调控机制，并探讨了通过代谢工程提高甲萘醌产量的策略 | 系统总结了乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的最新研究进展，并提出了将乳酸乳球菌开发为甲萘醌生产细胞工厂的高产方案 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于已有文献的归纳总结 | 总结乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的研究进展，并为开发高效甲萘醌生产细胞工厂提供参考 | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）及甲萘醌（维生素K2）生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 代谢工程、发酵优化 | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸乳球菌 | 甲萘醌生物合成途径 | 食品、医药 |
| 2 | 2026-09-21 |
Harnessing bacterial biology and components for next-generation vaccine development
2026-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108823
PMID:42705503
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综述 | 本文综述了利用细菌生物学及其组分（如类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影和乳酸菌等）作为下一代疫苗设计与递送平台的潜力 | 系统整合细菌组分作为抗原与内在佐剂的双重功能，并结合合成生物学实现针对新发病原体的多价疫苗设计策略 | 部分细菌疫苗平台仍处于研发阶段，尚未成熟；文中未涉及具体临床数据或大规模验证结果 | 探讨细菌生物学和组分在下一代疫苗开发中的应用，推动灵活、可扩展和多价疫苗平台的构建 | 细菌组分（类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影）及乳酸菌 | 免疫学 | 传染病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸菌, 细菌 | NA | 医学 |
| 3 | 2026-09-21 |
Beyond gene editing: the age of chromosome-scale genome engineering
2026-Sep-19, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.08.010
PMID:42763238
|
综述 | 这篇综述探讨了染色体尺度基因组工程的技术工具，包括染色体转移和靶向染色体消除，以及它们如何整合到染色体移植流程中 | 将染色体尺度操作确立为可操作的实验框架，并强调其在理解、构建和修复基因组方面的潜力 | 常规实施仍受限于分析需求和技术障碍 | 综述高等真核生物中染色体尺度操作的工具包，并讨论其在基因组工程中的应用前景 | 高等真核生物的染色体和大规模基因组区域 | 基因组工程 | NA | 染色体转移, 靶向染色体消除, 染色体移植, 大规模DNA组装, 合成生物学, 全基因组验证 | NA | 文本 | NA | NA | 高等真核生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-21 |
Cross incompatibility restricting genome exchange and diversification of primary gene pool in plants: challenges and opportunities
2026-Aug-25, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-026-05347-x
PMID:42642494
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综述 | 本文综述了植物种间杂交中存在的合子前和合子后障碍及其遗传因素，并探讨了体细胞杂交和胚胎拯救等生物技术手段以及合成生物学在克服杂交不亲和中的应用前景。 | 强调合成生物学可重新编程生殖障碍，把杂交不亲和转变为可控制的性状以促进杂交品种开发。 | 未提及具体的实验验证，侧重于理论综述与现有技术总结，缺乏原始数据支撑。 | 探索植物种间杂交不亲和的障碍机制，并总结克服这些障碍以利用作物野生近缘种遗传多样性的策略。 | 植物，尤其是作物野生近缘种与栽培作物的种间杂交。 | 植物遗传学与育种 | NA | 体细胞杂交、胚胎拯救、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-09-21 |
Fluorogenic RNA Aptamer-Based Activity Quantification of T7 RNA Polymerase
2026-Aug-18, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00336
PMID:42610739
|
研究论文 | 本文开发了一种基于荧光RNA适配体的体外转录 assay，用于定量测定T7 RNA聚合酶的活性单位 | 使用Broccoli RNA适配体作为转录报告基因，以荧光信号替代传统放射性聚合 assay，实现简便且安全的T7 RNAP活性定量 | 未明确提及 | 开发一种荧光基的体外转录 assay，以简便、定量地测定T7 RNA聚合酶活性单位 | T7 RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 assay, 荧光RNA适配体 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-21 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
|
研究方法教程 | 本文提供了一套利用抗生素抗性标记对大肠杆菌进行快速多重基因组工程改造的完整教程，涵盖实验方案、序列设计和DNA构建方法 | 提供了一套系统性的重组工程教程，整合了15种抗生素抗性盒用于多重编辑，可在三周内完成10-15个基因组修饰，并包含可供商业DNA合成的序列信息 | 该方法主要适用于易于操作的微生物如大肠杆菌，当需要无疤痕修饰时不具优势，且不适用于遗传难操作微生物 | 建立一套快速、高效的多重大肠杆菌基因组工程改造方法，简化合成生物学中的遗传设计原型构建流程 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 重组工程、双链DNA供体介导的基因编辑 | NA | DNA序列、实验方案 | NA | 重组工程 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-21 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
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研究论文 | 该文提出将复杂RNA分解为自包含RNA单元（SCRU），构建了包含超过61,000个SCRU的数据库SCRU-DB，并开发了SCRU-Seq和SCRU-Diff两种深度学习模型用于直接RNA序列设计。 | 提出将RNA数据稀缺问题归因于可及性和粒度问题，构建了超过61,000个自包含RNA单元的SCRU-DB数据库，涵盖超过8,200个独特结构簇，并通过三级接触聚类严格定义SCRU为结构自主模块；SCRU-Seq实现O(1)直接预测，SCRU-Diff达到79.2%的最佳NSR。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 解决RNA序列设计中因高分辨率3D结构稀缺导致的训练数据不足问题，实现可扩展、物理基础的多样化且结构准确的RNA序列生成。 | RNA序列及其三维结构，特别是复杂RNA分子分解后的自包含RNA单元（SCRUs）。 | 合成生物学, 机器学习 | NA | 深度学习, 图神经网络, 扩散模型, 三级接触聚类 | GNN, 扩散模型 | RNA序列, 3D结构 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRUs），超过8,200个独特结构簇；使用set112基准数据集进行评估 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-21 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 开发了一种基于热力学的机器学习指导的可编程核酸扩增方法，实现扩增效率的连续精确调控 | 通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦，实现高分辨率可编程扩增；利用2483个实验数据构建机器学习模型，将预测准确度从0.62提升至0.86；在DNA数据存储和临床RNA变异检测中展示了应用优势 | 未明确说明 | 实现核酸扩增效率的连续精确调控，并探索其在分子诊断和DNA数据存储中的应用 | 核酸扩增反应、DNA数据存储、宫颈癌RNA变异 | 机器学习, 分子诊断, 合成生物学 | 宫颈癌 | 核酸扩增, 机器学习 | 机器学习模型 | 实验数据, 序列数据 | 2483个实验数据；临床验证中10个模拟测序深度样本 | NA | NA | NA | 医学, 数据存储 |
| 9 | 2026-09-21 |
Quantification of cholesterol incorporation in giant unilamellar vesicles produced by a modified cDICE method
2026-Mar-25, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01124h
PMID:41801146
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研究论文 | 该研究开发了一种基于甲基-β-环糊精-胆固醇复合物向eDICE法制备的巨型单层囊泡中递送胆固醇的方法，并利用荧光膜生物传感器定量评估胆固醇掺入程度 | 首次将甲基-β-环糊精-胆固醇复合物用于eDICE法制备的GUVs的胆固醇递送，并建立了利用NR12A光谱成像和Flipper-TR荧光寿命成像定量检测胆固醇含量的非破坏性方法，证明胆固醇含量可提升至至少40 mol%，且能触发液态有序结构域形成 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决基于乳液的GUV制备方法难以有效掺入胆固醇的问题，建立定量、非破坏性的胆固醇含量调控与评估方法 | eDICE法制备的巨型单层囊泡，包括纯DOPC GUVs以及DOPC与饱和脂质（DMPC和PC(18:0-14:0)）的二元混合物GUVs | 膜生物物理学，合成生物学 | NA | 光谱成像，荧光寿命成像，eDICE法，凝胶辅助溶胀法 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学，材料 |
| 10 | 2026-09-21 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文综述了鸟氨酸脂（OLs）和其他酰氧酰基氨基脂的合成途径、修饰、分布及其在应激抗性和宿主相互作用中的作用 | 系统分析了编码推定OL合酶的基因的分类学分布，并讨论了OLs在合成生物学中的潜在应用 | 未提及具体实验验证，主要基于已有文献的综述 | 总结鸟氨酸脂及其他非经典膜脂的研究进展，包括合成、修饰、功能和应用 | 鸟氨酸脂（OLs）和其他酰氧酰基氨基脂 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-09-21 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
|
综述 | 本文综述了微生物-CCUS框架下细菌利用CO2合成生物表面活性剂的代谢与工程进展，重点关注厌氧和富CO2体系。 | 揭示了厌氧生物表面活性剂合成与CO代谢的关联，提出合成生物学、通路模块化、系统建模及人工智能整合优化CO2固定与生物表面活性剂合成的潜力。 | 仍面临技术和经济挑战，尚未实现高效规模化应用。 | 探讨微生物碳捕获与生物表面活性剂合成的结合策略，以实现温室气体减排和可持续生物制造。 | 微生物（细菌）的CO2代谢和生物表面活性剂合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统建模、人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 碳固定模块与生物表面活性剂合成通路的耦合设计 | 环境、工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-21 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
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研究论文 | 该研究设计并构建了生物传感器驱动的封装系统，通过自主控制Nissle 1917的荚膜多糖表达来改善细菌癌症治疗的药代动力学特征。 | 首次将生物传感器驱动的荚膜多糖自主调控系统与双态药代动力学模型相结合，实现了对活体治疗药物在体内行为的定量模拟；相比诱导型系统，生物传感器驱动系统能更有效地控制活体药物。 | 双态药代动力学模型仅是捕捉这类新型治疗药物自主特性的第一步，模型参数仍需进一步验证和完善，尚未进行临床转化。 | 设计生物传感器驱动的封装系统以实现细菌癌症治疗的全身递送，并建立药代动力学模型模拟其自主控制行为。 | Nissle 1917大肠杆菌（工程化细菌） | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因电路设计、药代动力学建模 | 双态药代动力学模型 | 模拟数据 | NA | NA | Nissle 1917大肠杆菌 | 基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动基因电路，用于自主控制荚膜多糖的表达 | 医学 |
| 13 | 2026-09-21 |
Navigating the next frontier in biomedicine: breakthroughs and insights in nucleic acid therapeutics
2026-Feb-18, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06966a
PMID:41635917
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综述 | 本文综述了核酸治疗药物（包括反义寡核苷酸、siRNA、miRNA、mRNA和适配体）的最新进展，重点关注其作用机制、化学修饰和递送工程，并讨论了挑战与未来方向 | 系统总结了核酸治疗关键平台的最新进展，并全面概述了化学修饰和递送工程策略（如骨架和糖修饰、GalNAc偶联、脂质纳米颗粒），同时展望了CRISPR基因编辑、合成生物学等未来方向 | 未涉及具体实验数据，仅基于文献综述；未深入讨论某些平台的具体临床转化障碍 | 总结核酸治疗药物的研究进展，分析关键平台、化学修饰和递送系统，并探讨未来发展方向，为核酸药物的开发和临床转化提供战略见解 | 核酸治疗药物，包括反义寡核苷酸、siRNA、miRNA、mRNA和适配体 | 生物医学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-09-21 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸的三链识别空间，实现了对标准、损伤或合成碱基对的中性pH纳摩尔亲和力识别 | 利用AEGIS核碱基扩展了三链识别密码，通过系统评估120种碱基三联体组合，鉴定出至少12种新的模块化三联体，可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向标准、损伤或合成碱基对 | 摘要未明确提及研究限制 | 扩展三链形成寡核苷酸的识别范围，以克服天然核碱基对靶标序列的限制和酸性pH稳定性要求 | 双链DNA，包括含有标准、损伤或合成碱基对的靶标 | 合成生物学 | NA | 三链形成寡核苷酸，人工扩展遗传信息系统 | NA | NA | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学，合成生物学，核酸纳米技术 |
| 15 | 2026-09-21 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-02-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
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综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的构效关系、应用挑战及前沿技术突破，涵盖提取、质量控制、结构修饰和纳米递送等方面的策略 | 系统整合了人工智能、合成生物学和材料科学三大前沿技术在药食同源黄酮类化合物研究中的应用前景，提出了精准营养和个性化医疗的发展方向 | 未涉及具体实验验证数据，缺乏对各项技术策略的定量比较和成本效益分析 | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声辅助提取，微波辅助提取，超临界CO2萃取，UHPLC-MS，指纹图谱，糖基化结构修饰，脂质纳米粒，聚合物纳米粒，微胶囊化技术 | NA | text | NA | NA | NA | NA | 医学，食品 |
| 16 | 2026-09-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 该研究重新设计了pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并开发了合成RNA调节因子控制的兼容性合成复制起点。 | 通过修改天然pMB1复制起点，实现了质粒拷贝数的可调性，并创建了由合成RNA调节因子控制的独立拷贝数控制的兼容性复制起点，展示了合成复制起点模块化响应多种信号的能力，以及多重复制报告的潜力。 | 合成复制起点质粒在E. coli中共同维持了一周，但长期稳定性未评估。 | 设计合成复制起点质粒，以增强质粒的可调性、兼容性和模块化，用于合成生物学。 | 质粒，特别是pMB1复制起点，以及合成RNA调节因子。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 6种兼容性合成复制起点质粒 | NA | E. coli | 合成复制起点 | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-09-21 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文通过评估分子通路、治疗选择和转化障碍，客观审视了肠道微生物代谢物对心脏保护作用的潜力 | 提出了免疫工程化框架，系统整合了微生物代谢物在心力衰竭和缺血后重构中的心脏保护机制，并探讨了后生元制剂、新型递送系统和合成生物学等创新干预策略 | 存在药代动力学、监管和微生物群异质性等重大转化障碍，缺乏临床验证和监管标准化 | 评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力，分析其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物（包括短链脂肪酸、尿石素、吲哚类、氧化三甲胺和硫化氢等）及其对心血管系统的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-09-21 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学分析、液体处理机器人和异源蛋白及代谢物生产实验，建立了在Cyanidioschyzon merolae中进行核基因组工程的框架，并发现基因组位置不影响转基因表达效率 | 首次在Cyanidioschyzon merolae中实验验证了中性整合位点，并建立了高通量转化方案；发现基因组位置对转基因表达影响极小，具有转录中性 | 未明确提及 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae（一种嗜热嗜酸红藻） | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人、异源蛋白和代谢物生产测定、顶空分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 40个基因间 loci（分布于20条染色体中的16条），验证了38个 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae | NA | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-09-21 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了植物和微生物合成生物学在农业、环境及未来应用中的进展，包括基因组构建工具、CAD和AI，以及智能植物和微生物组工程 | 将植物与相关微生物视为一个整体系统进行工程化，利用合成生物学工具扩展可工程化物种、增加工程化功能复杂性、控制环境释放并组装稳定菌群 | 传统育种和转基因方法速度慢、性状不可预测且持续表达，合成生物学在植物多基因组和微生物组工程中仍面临复杂性和稳定性挑战 | 推动下一次农业革命，并将植物工程拓展至制造、基础设施、传感和修复等新领域 | 植物（作物）和相关的微生物（真菌、细菌、古菌） | 合成生物学 | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计（CAD）、人工智能（AI） | NA | 文本 | NA | NA | 植物，微生物（真菌、细菌、古菌） | 响应环境变化的基因回路，可改变形态或应对威胁 | 农业，环境，制造，基础设施，传感，修复 |
| 20 | 2026-09-21 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了KSHV的致癌机制，重点介绍了其操纵宿主细胞信号、逃避免疫检测和促进肿瘤发生的能力，并探讨了下一代诊断工具和治疗方法 | 整合了新兴诊断生物标志物（如病毒microRNA）与下一代治疗策略（包括基因编辑和基于合成生物学的方法），为精准医学改善疾病检测、治疗特异性和患者预后提供了机会 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，在早期或不典型病变以及区分潜伏感染和裂解感染方面存在重要局限性；KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗，临床结果仍不理想 | 探索KSHV的致癌机制，并探讨下一代诊断工具和治疗方法 | KSHV病毒及其相关疾病（卡波西肉瘤、原发性渗出性淋巴瘤、多中心Castleman病） | 医学 | 卡波西肉瘤, 原发性渗出性淋巴瘤, 多中心Castleman病 | CRISPR-Cas9, 治疗性适配体, 先进成像, 分子生物标志物 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |