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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-04 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的最新进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成途径的设计、代谢工程策略及系统生物学技术的应用,并指出了该领域的发展方向 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的生物合成途径与工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业、医药、生物材料 |
| 2 | 2026-02-04 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
|
研究论文 | 本文报道了一种新型的脂多糖依赖的T9SS底物外膜锚定机制,并基于此机制开发了用于革兰氏阴性菌的表面展示平台,成功实现了PET降解酶的展示与功能验证 | 首次揭示了T9SS底物通过脂多糖(LPS)依赖的机制锚定于外膜,并利用该机制构建了可编程的表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在革兰氏阴性菌外膜的锚定机制,并开发基于该机制的表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS蛋白质组学、生物信息学分析、基因敲除 | NA | 蛋白质组数据、序列数据 | NA | 基因融合表达 | Cytophaga hutchinsonii | 异源酶与T9SS底物CTD结构域的融合表达系统 | 环境、工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2026-Apr, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定并表征了掌叶大黄中负责大黄素糖基化的UGT酶家族,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在完整植物体系或代谢工程宿主中验证这些酶的体内功能,酶学特性研究局限于体外生化实验 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点突变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 4 | 2026-02-03 |
Solvent-Mediated Dewetting Principles for Cell-Sized Liposome Formation
2026-Feb-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512610
PMID:41622818
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研究论文 | 本文研究了溶剂介导的去润湿原理,用于细胞尺寸脂质体的形成 | 揭示了溶剂介导的去润湿过程中同时涉及溶剂去除和机械刺激,并建立了脂质体去润湿的机制框架 | 未明确说明实验的具体样本量或重复次数 | 阐明溶剂介导的去润湿原理,以改进细胞尺寸脂质体的生成方法 | 脂质体、双乳液模板、溶剂介导的去润湿过程 | 合成生物学 | NA | 微流控生成、光学镊子 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-03 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Jan-31, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
|
综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路的设计、发展及其在诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了从早期miR-OFF系统到近期CRISPR关联系统及非相干前馈环架构的演进,实现了从被动感知到主动治疗的转变 | 存在泄漏、细胞资源竞争及递送效率等挑战 | 探讨利用microRNA构建合成基因电路以感知细胞状态并实现治疗干预 | microRNA及其合成的基因调控电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、多层调控策略、非相干前馈环 | 医学 |
| 6 | 2026-02-02 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在价值 | 系统区分了微生物胞外多糖作为益生元与生物活性物质的精确作用机制,并提出了“EPS-微生物群-宿主轴”概念,同时探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据或案例研究,主要基于现有文献的归纳分析,且未详细讨论不同微生物来源EPS的具体生产工艺差异 | 阐明微生物胞外多糖在食品系统中作为功能性成分的双重角色(健康益处与技术功能),并探讨其产业化面临的挑战与解决方案 | 微生物胞外多糖(EPS) | 食品科学与生物技术 | 糖尿病、肥胖症 | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 微生物(未具体说明种类) | 定制化多糖的生物合成途径设计 | 食品、医药 |
| 7 | 2026-02-02 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了激素响应的液-液相分离凝聚体,用于基因调控和转录放大 | 创新点在于将核受体配体结合域与共激活因子结合,构建响应内源性激素或药物的化学诱导二聚化系统,并首次设计出激素响应的液-液相分离凝聚体,实现可调谐的转录控制 | NA | 研究目标是开发一种能与内源性信号整合的化学诱导二聚化系统,用于合成生物学和基因调控应用 | 研究对象包括核受体配体结合域(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)和TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化系统设计、液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 两输入转录开关、激素响应的液-液相分离凝聚体 | 医学、基因电路、生物传感 |
| 8 | 2026-02-02 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
|
综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用,以推动农业、环境及未来应用的发展 | 介绍了合成生物学如何通过新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能改变传统植物育种和基因工程范式,实现“智能植物”和整体系统工程 | NA | 探讨合成生物学在农业、环境及未来应用中的先进技术,以驱动下一场农业革命 | 植物及其相关微生物(真菌、细菌、古菌) | NA | NA | 合成生物学、基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的电路,如生物传感器、逻辑门 | 农业、环境、制造、基础设施、传感、修复 |
| 9 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
|
综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径,探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |
| 10 | 2026-02-02 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Jan-26, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
|
综述 | 本文综述了外泌体作为药物和基因递送载体的精准工程方法,包括表面修饰和装载策略,并探讨了其在精准医疗中的应用潜力与挑战 | 整合外泌体与合成生物学策略,开发新型工程化方法以增强靶向性和装载效率,特别是用于CRISPR/Cas9递送和癌症治疗 | 面临大规模生产、免疫安全性问题和监管审批等挑战 | 探索工程化外泌体作为多功能平台,用于精准药物和基因递送,以促进疾病治疗 | 外泌体作为细胞间通讯的囊泡载体 | NA | 癌症 | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-02-02 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
|
研究论文 | 本文介绍了PanForest,一种使用随机森林分类器根据基因组中其他基因的存在情况来预测基因存在或缺失的软件工具 | 开发了首个基于随机森林的基因共现与互斥模式预测工具,能够大规模分析泛基因组并量化每个基因对预测其他基因的重要性 | 未明确说明模型在非细菌基因组或其他复杂真核生物中的泛化能力,且分析依赖于现有基因注释的准确性 | 研究基因共现与互斥模式,以揭示基因组组织的基本原理,并应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌(Escherichia coli)基因组中的12,741个附属基因 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学、合成生物学、分子生态学 |
| 12 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文综述了在植物分子农业中,通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合,以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产,包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累,提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶,首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷,包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |
| 14 | 2026-02-02 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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综述 | 本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略,以提升其作为生物工厂的潜力 | 整合了化学/电磁信号传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子扩增系统及重组酶处理器等前沿技术,提出植物细胞包和自持生物发光系统等快速原型平台 | 未提供具体实验数据验证所述技术的实际效率与稳定性 | 开发可控制转基因表达的系统以克服烟草生物工厂的规模化限制 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、重组酶技术、病毒复制子技术 | NA | NA | NA | CRISPR, 重组酶系统 | 本氏烟草 | 条件性基因表达电路、信号传感器、合成启动子、转录信号放大系统、细胞记忆模块 | 农业, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-02 |
A Comprehensive Multiomics Approach Illuminates the Biosynthetic Mechanism of Scoparone in Artemisia capillaris
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70398
PMID:41078345
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研究论文 | 本研究通过多组学方法阐明了茵陈蒿中主要活性成分滨蒿内酯的生物合成机制 | 首次生成了茵陈蒿的全长转录组和整合代谢组数据集,鉴定并表征了催化滨蒿内酯生物合成最后一步的新型O-甲基转移酶AcOMT1 | NA | 阐明茵陈蒿中滨蒿内酯的生物合成途径 | 茵陈蒿(Artemisia capillaris)及其活性成分滨蒿内酯 | 代谢组学 | 肝病 | 全长转录组学、整合代谢组学、加权基因共表达网络分析、系统发育分析、亚细胞定位分析、酶活性测定、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 滨蒿内酯生物合成途径 | 医药 |
| 16 | 2026-01-30 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-Jan-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合结构生物学、计算模拟、多样化工程技术和先进筛选方法,以应对萜烯合酶催化复杂性和序列-功能相关性弱的挑战 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱导致工程化面临显著挑战 | 工程化I类萜烯合酶以生成多样化的萜烯骨架,这是合成生物学的一个关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 17 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制,并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化(BCM)、生物诱导矿化(BIM)和微生物影响矿化(MIM)三种机制,弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低,MIM机制仍处于早期发展阶段,且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-01-30 |
Revolutionizing bio-hydrogen production: smart integration of nanotechnology, microbial engineering, and circular waste valorisation
2026-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-01001-4
PMID:41604032
|
综述 | 本文全面综述了纳米技术、微生物工程和循环经济原则在生物制氢系统中的革命性整合 | 创新性地将纳米技术、先进微生物工程(包括CRISPR-Cas9合成生物学方法)与循环经济原则相结合,用于提升生物制氢效率和系统稳定性 | NA | 探索可持续能源替代方案,通过生物制氢实现碳中和能源生产并解决有机废物管理问题 | 生物制氢生产系统,包括可再生原料、微生物创新、纳米技术应用及纯化存储技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术、纳米金属催化剂、酶固定化技术、等离子体纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源、环境 |
| 19 | 2026-01-30 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了工程化细菌作为癌症治疗剂的进展,重点探讨了合成生物学在增强肿瘤特异性、调控治疗递送和激活宿主免疫系统方面的电路策略 | 通过合成生物学扩展遗传电路工具箱,实现细菌从简单定植剂向多功能治疗平台的转变,并编程时空控制和群体行为 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用,并推动下一代微生物治疗剂的理性设计 | 工程化细菌及其遗传电路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤特异性增强电路、治疗递送调控电路、免疫系统激活电路、时空控制电路、群体行为电路 | 医学 |
| 20 | 2026-01-30 |
Isolation of Antigen-Specific Nanobodies From Synthetic Libraries Using a Protein Selection Strategy That Combines MACS-Based Screening of YSD and FLI-TRAP
2026-Jan-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5570
PMID:41607705
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研究论文 | 本文介绍了一种结合MACS酵母表面展示和FLI-TRAP细菌遗传选择系统的两阶段平台,用于高效筛选和优化抗原特异性纳米抗体 | 创新点在于整合了MACS酵母展示的高通量筛选与FLI-TRAP系统的胞内结合评估,通过Tat途径的共转运机制关联结合亲和力与抗生素抗性,提供了一种成本效益高且严格的胞内兼容性筛选方法 | NA | 研究目标是开发一种高效筛选和工程化高亲和力、特异性且功能表达的胞内蛋白质结合剂的方法 | 研究对象是抗原特异性纳米抗体,通过合成酵母展示库和细菌系统进行筛选 | 合成生物学 | NA | MACS酵母表面展示、FLI-TRAP细菌遗传选择系统、Tat途径共转运 | NA | NA | NA | 酵母表面展示、细菌遗传选择系统 | 酵母、细菌 | 利用Tat信号肽标记的蛋白质与β-内酰胺酶标记的抗原靶点共表达,设计基于共转运的筛选系统,仅高亲和力结合对能共转运至周质并赋予抗生素抗性 | 医学、合成生物学 |