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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-21 |
Constructing cellulosomes to enhance lignocellulose degradation and biotechnological applications: A review
2026-Mar-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151467
PMID:41856184
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综述 | 本文综述了天然和工程化纤维小体的最新进展,重点介绍了其结构多样性、协同机制及工业应用潜力 | 系统比较了不同来源天然纤维小体的进化特征,并总结了通过合成支架设计、宿主优化和操纵子工程构建'设计者纤维小体'的新策略,包括双对接模块、三方对接相互作用等新兴概念 | NA | 开发高效的木质纤维素生物加工策略,以促进可持续生物燃料和生物化学品的生产 | 纤维小体(包括天然和工程化系统)及其在木质纤维素降解中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成支架设计、操纵子工程、微生物宿主优化 | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、马克斯克鲁维酵母 | 多酶复合体(纤维小体)设计,包含支架蛋白、粘连蛋白-对接蛋白特异性模块及半纤维素酶、木质素酶等酶整合 | 能源、工业生物技术 |
| 22 | 2026-03-21 |
A Review on Microbial Lipids Conversion from Organic Wastes: Adaptive Laboratory Evolution-Driven Strategies for Enhanced Biofuel Precursor Synthesis
2026-Mar-17, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
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综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化技术将有机废弃物转化为微生物油脂以生产生物燃料的策略 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略,以拓展ALE技术在有机废弃物资源化利用中的应用边界 | NA | 提高有机废弃物发酵液中微生物油脂的转化效率,以促进可持续发展和生物燃料生产 | 产油微生物及其在复杂发酵液环境中的代谢适应性 | 工业生物技术 | NA | 适应性实验室进化,合成生物学,精准代谢工程,基因组编辑,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源, 环境 |
| 23 | 2026-03-21 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Mar-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本研究开发了一个名为Rhodo-Box的合成生物学工具箱,旨在促进Rhodobacter sphaeroides的代谢工程应用 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,创建了首个针对Rhodobacter sphaeroides的标准化、自动化兼容的遗传元件集合,包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和终止子 | NA | 开发一个合成生物学工具箱,以克服Rhodobacter sphaeroides中缺乏标准化遗传元件的限制,促进其作为可持续生物制造底盘的应用 | Rhodobacter sphaeroides(一种紫色非硫α-变形菌) | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、遗传工程 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 诱导表达系统(如NahR-P, LacI-P, VanR-P, XylS-P)、启动子库、RBS库、转录终止子 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 24 | 2026-03-21 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Mar-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 本文综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物胁迫适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控方面的见解,突出了BAHD酰基转移酶在植物适应中的核心作用及其在可持续农业和生物技术中的转化机遇 | 讨论了功能冗余、底物混杂性和生物安全性考虑相关的挑战 | 探讨BAHD酰基转移酶基因家族的进化、功能及其在植物胁迫适应和生物技术中的应用 | BAHD酰基转移酶基因家族 | NA | NA | 比较基因组分析、结构研究、生化研究、组学调查 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业、生物技术 |
| 25 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势,即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢,为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解,并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 26 | 2026-03-21 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Mar-04, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 本研究提出了一种结合机制模型与机器学习的方法,用于解决合成生物学中资源竞争导致的基因电路意外行为问题 | 提出了部分不确定模型结构(PUMS)概念和嵌入式物理信息神经网络(ePINNs),通过共享损失的双神经网络架构实现机制模型与机器学习的无缝融合 | 未明确说明模型在更复杂生物系统或实际实验数据中的验证程度 | 开发能够同时保持物理一致性和数据驱动优势的混合建模方法 | 合成生物学中受资源竞争影响的基因网络模型 | 机器学习 | NA | 物理信息神经网络(PINNs) | 神经网络(ePINNs) | 模拟数据 | NA | NA | 活细胞 | 基因网络(受资源竞争影响) | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-03-21 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统,用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌,以促进非豆科植物的生物固氮 | 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统,首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 | NA | 增强非豆科植物的生物固氮能力,减少对合成肥料的依赖 | 根瘤菌和非根瘤菌微生物 | 合成生物学 | NA | 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 | nod基因报告系统,包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 | 农业, 环境 |
| 28 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
|
研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 29 | 2026-03-21 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用酵母转化相关重组技术开发了一个伪狂犬病病毒基因组组装平台,成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病病毒基因组,并结合CRISPR/Cas9进行体外编辑,实现了快速灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株,且在小鼠中仍能引起致死性感染 | 开发伪狂犬病病毒的基因组编辑平台,以促进减毒疫苗研发和基础研究 | 伪狂犬病病毒PRV-GX-2011株及其合成拯救病毒PRV-GX-Syn1 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9编辑、斑块纯化 | NA | 基因组序列、病毒表型数据 | 使用Vero细胞进行病毒拯救,并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TALEN | 酿酒酵母、Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间非编码区插入egfp基因的合成病毒基因组 | 医学 |
| 30 | 2026-03-21 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 本文探讨了一种受光合作用启发的跨物种可植入ATP电池技术,旨在通过光能驱动在受损人体细胞内自主再生ATP,以治疗多种疾病 | 提出了一种模仿自然光合作用的人工光合系统,能够在细胞水平上实现光驱动的持续ATP合成,并将合成生物学、材料科学和靶向递送策略整合到一个治疗平台中 | NA | 探索跨物种可植入ATP电池在疾病治疗中的应用潜力,旨在通过恢复细胞生物能量学来治疗疾病 | 人工光合系统及其在缺氧肿瘤微环境、代谢受损组织再生和能量缺陷神经元等病理环境中的应用 | NA | 多种疾病(包括肿瘤、组织损伤、神经元疾病等) | 人工光合作用技术 | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统,包括光氧化模块(将光能转化为电化学质子梯度)、光磷酸化模块(利用梯度驱动ATP合成)和封装系统(用于空间组织、功能完整性和靶向细胞递送) | 医学 |
| 31 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
|
研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶,显著提升了其催化活性和热稳定性,并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程,通过改造底物结合腔和优化相互作用,大幅提升了酶活性和热稳定性,并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性,也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略,实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体,以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 32 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构,以及多种氧化修饰,通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物,特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 33 | 2026-03-20 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶促修饰以创造新型核糖体合成与翻译后修饰肽(RiPPs)的策略 | 首次将fuscimiditide前体肽的前导序列从N端重新定位至C端,并证明graspetide合成酶ThfB仍能保持底物选择性修饰功能,同时实现了由两种不同家族酶(套索肽酶与graspetide酶)共同修饰的嵌合RiPP产物 | 前导序列重新定位后酶促修饰速率降低了约2倍,可能影响整体生物合成效率 | 开发合成生物学策略以扩展核糖体合成与翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,创造自然界不存在的新型机械互锁肽产物 | graspetide生物合成途径中的前体肽(特别是fuscimiditide前体肽)及其修饰酶ThfB | 合成生物学 | NA | 前导肽工程策略、酶促反应重构、嵌合肽合成 | NA | 生物化学实验数据 | NA | 前导肽序列重定位技术 | NA | 双前导序列引导的嵌合修饰系统(N端和C端各一个前导序列分别引导不同家族修饰酶) | 工业生物技术 |
| 34 | 2026-03-20 |
Engineering smart bacteria for the next generation
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102681
PMID:41850245
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综述 | 本文综述了智能细菌的理性设计进展,重点探讨了其在合成生物学中的时空精确传感与信号处理能力,以及作为诊断和治疗工具的临床应用潜力 | 通过整合复杂遗传电路,实现微生物对环境及疾病相关信号的高精度检测,推动了原位治疗递送和远程控制激活等创新应用 | NA | 总结智能细菌在遗传电路工程方面的最新进展,探索其跨疾病背景的临床应用,并讨论转化为下一代精准医学的关键挑战与未来方向 | 智能细菌(工程化微生物系统) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌(如大肠杆菌等) | 传感电路、信号处理电路、逻辑门、生物传感器、振荡器 | 医学 |
| 35 | 2026-03-20 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Mar-17, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
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综述 | 本文提出一个整合逆合成规划与生物约束的概念框架,以革新细胞代谢途径重建 | 通过结合逆合成规划和生物约束,实现个体与系统层面的建模,并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估和优化 | NA | 革新合成生物学中的细胞代谢途径重建方法 | 细胞代谢网络 | 合成生物学 | NA | 逆合成规划、大语言模型 | 大语言模型 | 代谢网络数据 | NA | NA | NA | 代谢途径重建 | 工业生物技术 |
| 36 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 37 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力,并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力,探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine(一种细菌来源的胞外保护化合物) | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 38 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
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综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台,并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系,支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术,以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 39 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |
| 40 | 2026-03-19 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Mar-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 本文综述了基于纳米颗粒膜包覆的凝聚层体系,重点介绍了其界面组装机制、理化性质改善及在仿生应用中的潜力 | 系统归纳了纳米颗粒膜包覆凝聚层的三种主要组装驱动力(界面能驱动、静电作用主导、多机制协同),并阐明该技术如何突破无膜结构的动态不稳定性限制 | 当前纳米颗粒包覆凝聚层微滴的设计与调控仍存在局限性,如膜结构的精确动态控制与功能集成度有待提升 | 通过纳米颗粒膜包覆技术增强凝聚层的结构稳定性和功能可编程性,推动其在合成生物学和仿生材料领域的应用 | 由液-液相分离形成的凝聚层及其纳米颗粒包覆复合体系 | 合成生物学 | NA | 界面自组装技术、纳米颗粒包覆技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生功能模块(细胞代谢模拟、吞噬作用、运动性、信号转导) | 材料, 工业生物技术 |