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当前共找到 1106 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-23 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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研究论文 | 介绍一种用于构建、注释、可视化和共享动力学代谢模型的标准工作流程 | 整合社区标准和开源工具，确保动力学代谢模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | 未提及具体局限性 | 提高动力学代谢模型的标准化、可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | 系统生物学 | NA | NA | 动力学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 22 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角，并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征，植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限，酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识，并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌（Glutamicibacter） | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 23 | 2026-06-23 |
Bacteriophage therapy against multidrug resistant bacterial infections demonstrates clinical advances and engineering innovations between 2020-2026
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1865548
PMID:42326420
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综述 | 本文综述了2020至2026年间噬菌体疗法对抗多重耐药细菌感染的临床进展和工程创新 | 系统总结了噬菌体疗法的最新临床经验、基因工程进展（包括CRISPR系统）、组合疗法及合成噬菌体颗粒等创新技术 | 随机对照试验数据有限，监管标准、规模化生产和耐药管理仍面临挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药细菌感染治疗策略的潜力 | 多重耐药细菌感染的噬菌体疗法 | 机器学习 | 多重耐药细菌感染 | NA | NA | 文献 | NA | CRISPR-Cas系统 | 噬菌体 | 噬菌体递送的CRISPR抗菌剂、杂交递送平台、合成噬菌体颗粒 | 医学 |
| 24 | 2026-06-23 |
Global health preparedness for biosecurity threats: a review of emerging technologies and solutions
2026, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2026.1786846
PMID:42326940
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综述 | 本研究系统综述了新兴技术在增强全球卫生应对生物安全威胁准备中的作用 | 首次系统整合人工智能、基因组监测、合成生物学等新兴技术在生物安全准备中的应用证据，并识别出双重用途风险、伦理问题等关键挑战 | 仅纳入2015-2026年间英文文献，可能存在语言偏倚；且最终仅选取51篇文献进行综述，代表性可能受限 | 探讨新兴技术在提升全球卫生应对生物安全威胁准备水平中的作用 | 2015-2026年间发表的关于生物安全准备与新兴技术的同行评审论文及灰色文献 | 公共卫生, 生物安全 | NA | 人工智能, 基因组监测, 合成生物学, 生物传感器, 机器人技术, 数字健康平台 | NA | NA | 51篇文献（来自349篇初始识别论文） | 合成生物学 | NA | NA | 公共卫生, 全球卫生安全 |
| 25 | 2026-06-22 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jun-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 本文综述了在植物组织培养中，结合代谢组学与合成生物学及多组学框架，从试错实践转变为预测性系统工程，以提升高价值次生代谢物产量的方法 | 将代谢组学从分析工具提升为核心决策层，连接代谢表型与理性通路设计、遗传干预和过程调控，构建设计-构建-测试-学习循环范式 | 分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性方面仍存在挑战 | 探讨如何通过代谢组学引导的合成生物学策略，在植物组织培养中实现高产、可扩展和可预测的代谢物生产 | 植物组织培养中的次生代谢产物及相关的代谢网络 | 数字病理学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 合成启动子, 模块化基因回路, 异源表达系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 26 | 2026-06-22 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过对益生菌大肠杆菌Nissle 1917进行多层次的代谢工程改造，实现无抗生素条件下β-丙氨酸的高效生产 | 首次系统研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT四种转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用，并构建了无抗生素菌株，在5升生物反应器中达到60.55 g/L的产量，是目前益生菌生产β-丙氨酸的最高水平 | 尚未提及在工业放大或不同碳源条件下的性能评估 | 通过多层次代谢工程策略，实现益生菌大肠杆菌Nissle 1917无抗生素生产β-丙氨酸 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的代谢途径和转运系统 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 单一菌株在5升生物反应器中多次发酵 | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 异源关键酶引入、前体L-天冬氨酸双途径强化、竞争途径动态调控、中心代谢重编程、转运系统工程 | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-06-22 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
|
研究论文 | 提出了一种基于蛋白质语言模型嵌入的深度学习模型DeepSolNet，用于准确预测蛋白质溶解度 | 利用先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian结合双向长短期记忆网络、卷积神经网络和注意力机制的多模块架构，显著提升了溶解度预测性能 | 在独立测试集上的准确率仅为0.53，性能仍有提升空间 | 提高蛋白质溶解度的预测准确性，以促进合成生物学和蛋白质工程中的应用 | 蛋白质溶解度预测相关的序列数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, 注意力机制 | 序列 | 验证集和独立测试集包含γ-抗体、转谷氨酰胺酶和醛脱氢酶序列 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-06-21 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
|
research paper | 报道了一种名为SARGE的丝氨酸整合酶辅助快速基因组整合平台，通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计，支持快速可编程整合循环，无需抗性标记切除；引入双荧光报告系统和绿红筛选策略，实现裸眼菌落直接选择 | 未明确说明，可能涉及宿主范围限制或对非常大型DNA片段效率的潜在下降 | 开发一种简单、可扩展的基因组整合平台，用于大肠杆菌及潜在其他微生物宿主的基因组工程和合成生物学 | 大肠杆菌基因组整合盒交换过程 | synthetic biology | NA | 丝氨酸整合酶辅助盒交换 | NA | NA | 实验中测试的菌落数量未具体说明 | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶 | E. coli | 双荧光报告系统（sfGFP和mKate）用于筛选，正交整合酶PhiC31和Bxb1介导的盒交换 | synthetic biology, genome engineering |
| 29 | 2026-06-21 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 提出一种利用缓步纲衍生蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥条件下保存活性的策略 | 首次利用缓步纲来源的CAHS蛋白作为保护剂，实现无细胞表达系统在低成本室温干燥条件下的稳定储存，无需额外添加剂 | 未详细阐述CAHS蛋白保护机制及长期储存稳定性，且仅验证了单一来源的保护蛋白 | 开发低成本、便携式无细胞表达系统储存方法 | 无细胞表达系统及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、医学 |
| 30 | 2026-06-21 |
The Big Kinship of Proline: Counting Saturated and Unsaturated Secondary Amino Acids of Different Ring Size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
|
研究论文 | 本文对脯氨酸及其他环状二级氨基酸进行数学枚举，统计不同环大小的饱和与不饱和同系物数量 | 提出一种数学枚举程序，用于计算所有可能的环状二级α-氨基酸和亚氨基酸，并给出递推公式和显式公式，结果生成修正的卢卡斯序列 | 仅关注理论枚举，未深入探讨具体化合物的合成可行性或实际应用效果 | 通过数学和计算方法提供环状二级氨基酸的系统性分类和计数，辅助虚拟化合物库构建和化学合成计算机辅助设计 | 不同环大小的饱和与不饱和环状二级α-氨基酸和亚氨基酸 | NA | NA | 数学枚举 | 修正卢卡斯序列 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学、药理学 |
| 31 | 2026-06-21 |
The critical patch size problem on networks
2026-Jun-19, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
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研究论文 | 研究强异质网络环境中种群存活的临界斑块大小问题 | 首次在一般图结构中系统研究临界斑块大小问题，推导出谱图参数界以确保线性化算子的主特征值为正 | 主要依赖理论分析和数值模拟，缺乏实际生态数据的验证 | 探究图拓扑结构和汇点分布对种群存活阈值的影响 | 离散格子、多链接格子以及随机网络上的种群动态 | 机器学习 | NA | 图拉普拉斯算子分析 | 非线性动态系统模型 | 图结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、神经退行性疾病传播建模 |
| 32 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性，实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合，效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合，可能存在位置效应，且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术，用于作物改良和合成生物学 | 烟草（Nicotiana benthamiana）和水稻（Oryza sativa） | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织，具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草（Nicotiana benthamiana），水稻（Oryza sativa） | 位点特异性基因整合系统（含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫） | 农业, 合成生物学 |
| 33 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Jun-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
|
研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径，可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制，能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件，未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制，并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1，以及实际受污染地下水样本（含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹） | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 34 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展，重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合，突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角，强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料，重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学，应用微生物学 | NA | 3D打印，合成生物学，矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药，环境，工业生物技术 |
| 35 | 2026-06-21 |
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04999-7
PMID:42101569
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研究论文 | 通过GFP/mCherry模型揭示苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的调控作用 | 首次通过构建平行报告系统，结合定点突变和计算预测，揭示翻译耦合系统中SD2序列的非线性、结构特异性调控机制，并在不同宿主中验证其保守性 | 研究主要在大肠杆菌和乳酸乳球菌中进行，未在天然宿主酒酒球菌中验证，且GFP/mCherry模型可能无法完全模拟天然操纵子环境 | 阐明原核操纵子中翻译耦合的转录后调控机制，为酒酒球菌的工程化改造和合成生物学多基因系统设计提供预测框架 | 苹果酸乳酸酶操纵子中的mleA和mleP基因及其间SD2序列 | 合成生物学 | NA | 定点突变、计算预测（16S rRNA杂交能量和mRNA二级结构最小自由能）、荧光报告系统 | NA | 荧光比值数据 | 多个SD2序列变异体（具体数目未明确说明） | NA | 大肠杆菌、乳酸乳球菌 | 翻译耦合和非耦合结构的GFP/mCherry双报告基因系统 | 工业生物技术（葡萄酒酿造）、合成生物学 |
| 36 | 2026-06-21 |
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05004-x
PMID:42101779
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研究论文 | 通过鉴定强效内源启动子和优化农杆菌介导的转化程序，在银耳中构建了高效表达系统 | 首次在银耳中鉴定出三个比组成型gpd启动子效率高1476.74%的新型内源启动子，并发现棕色氧化铝处理可增加转化效率2.25倍 | 未评估启动子在银耳不同生长阶段或非酵母样细胞中的表现，且系统仅在实验室条件下验证 | 开发适用于银耳分子育种和合成生物学的基因表达系统 | 银耳（Tremella fuciformis）的酵母样细胞 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、扫描电子显微镜 | NA | 荧光强度数据、细胞密度数据 | 三个启动子（P4、P5、P7）在转化酵母样细胞中测试 | 农杆菌介导转化 | 银耳 | eGFP表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 37 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
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综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展，包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化，强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁，开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学， 疫苗学 | 细菌感染性疾病， 抗菌药物耐药性 | mRNA工程， 脂质纳米颗粒递送， 人工智能引导的抗原发现， 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒， 人工智能， 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 38 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力，提出周质体腔（PPC）作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔（PPC）作为工程化细胞区室的萜类合成潜力，揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证，需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔（PPC）用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔（PPC）、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径（包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达） | 工业生物技术 |
| 39 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能，并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR、AND等） | 合成生物学应用（计算、生物传感、人类健康） |
| 40 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器，实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链，通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制，并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及，但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |