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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-06 |
L-xylulose, a new versatile rare sugar: recent biosynthetic advances and challenges
2026-Jul-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119125
PMID:42083189
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综述 | 综述了稀有糖L-木酮糖的生物合成最新进展,分析六种酶促途径并识别两条竞争性路线,同时探讨底盘细胞构建和工业发酵的核心瓶颈 | 提出AI驱动高产菌株筛选、关键酶催化优化和靶产物高效胞外转运/分泌三大突破策略,并主张合成生物学与智能制造融合是未来发展关键方向 | 未详细对比化学合成与生物合成的成本效益,且对六种酶促途径的工业化适用性缺乏定量评估 | 系统梳理L-木酮糖生物合成进展,识别核心瓶颈并展望突破策略以推动其在食品和医药工业的应用 | L-木酮糖及其生物合成途径中的酶和底盘细胞 | 合成生物学 | NA | AI导向的高通量筛选技术、关键酶催化优化技术、胞外转运工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品工业、制药工业、化学工业 |
| 22 | 2026-05-06 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了植物油脂体的多尺度工程框架,从多尺度结构到下一代食品系统提供路线图 | 整合物理场、界面工程和合成生物学等多学科策略,建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系,实现植物油脂体的可编程功能调控 | 技术转化面临规模化挑战以及技术经济和监管障碍 | 系统综述植物油脂体的多尺度工程方法,推动其从基础研究到工业应用 | 植物油脂体 | 合成生物学 | NA | 界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(种子) | NA | 食品 |
| 23 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
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研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架,用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA,并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架,能够高效构建大片段重复DNA序列,并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列(GVGVP)为模型,未测试其他类型重复序列的适用性;表征限于NEB 5-alpha细胞,未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列,并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽(ELP)质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒,并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构(通过dIII和HI消化及Gibson组装实现) | 生物技术、材料科学 |
| 24 | 2026-05-06 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-May-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的可扩展RNA平台,用于逻辑和多层细胞编程 | 整合了翻译到转录的转换器与合成RNA调节器,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,并利用天然核糖体介导的多种环境输入感知 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍是一个挑战 | 开发可扩展的遗传电路以实现细胞中的复杂功能 | RNA调节器和多输入逻辑门 | 合成生物学 | NA | RNA调控、基因电路设计 | 逻辑门(OR、AND) | RNA信号、代谢物信号 | NA | RATEX平台 | 活细胞(未具体说明) | 逻辑门(多输入OR和AND门)、信号放大和级联级联 | 合成生物学、生物技术 |
| 25 | 2026-05-06 |
Synthetic Biology-Driven Innovations in Triple-Negative Breast Cancer: Integrating Engineering Design with Targeted Therapeutics
2026-May-02, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动三阴性乳腺癌精准医疗的创新方法,整合工程设计与靶向治疗 | 整合合成生物学、免疫肿瘤学和精准医学,提出细胞工程、微生物系统和核酸工程相结合的多模式治疗策略 | 仅回顾现有进展,未提供实验验证或比较不同方法的疗效 | 探讨合成生物学在克服三阴性乳腺癌异质性、耐药性和免疫抑制方面的潜力,促进下一代个性化治疗 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 免疫细胞、细菌、诱导多能干细胞 | 合成基因回路、嵌合抗原受体(CAR) | 医学 |
| 26 | 2026-05-06 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于8种反刍动物的2325个宏基因组样本,重建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录(CRMC),并揭示了维生素合成微生物的分布模式和途径偏好 | 构建了目前最大的反刍动物胃肠道微生物基因组目录(CRMC),包含约39,696个MAGs,图谱拼接率高达83.45%,首次系统性地揭示了反刍动物与人类在维生素合成途径和基因节点选择上的趋同演化规律 | 可能受限于样本来源的多样性及宏基因组组装的完整性,未具体分析不同宿主间维生素合成微生物的功能差异或环境因素的影响 | 系统阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在宿主间的分布模式 | 8种反刍动物(牛、羊等)的胃肠道宏基因组样本及维生素合成微生物 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、宏基因组组装基因组(MAG)重建、维生素合成通路分析 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本,来源于8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物(牛、羊等) | NA | 农业、医学 |
| 27 | 2026-05-06 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
综述 | 综述微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程和治疗应用进展 | 整合人工智能、机器学习、分子对接与纳米技术来加速微生物代谢产物的发现和递送 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据,临床转化面临挑战 | 探讨利用人工智能与合成生物学工程化微生物菌株以产生增强生物活性化合物,并利用纳米技术优化靶向递送机制 | 微生物代谢产物及其抗癌活性 | 机器学习 | 癌症 | 分子对接 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 28 | 2026-05-05 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
|
综述 | 系统梳理了生物分子凝聚体从液态到固态转变的分子机制、控制策略及应用 | 整合生物物理学、合成生物学和材料科学,首次全面阐述液固转变的分子语法、时空控制工程策略及在生物系统设计中的新兴应用 | 当前对液固转变的精确时空控制仍面临挑战,未来需进一步探索其在系统化学和合成生物学中的设计原则 | 探讨生物分子凝聚体液固转变的工程化调控及其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体及其液固转变过程 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离观察技术、分子工程方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 液固转变调控回路 | 医学、系统化学、合成生物学 |
| 29 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
|
综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展,并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 30 | 2026-05-05 |
Recent advances in Chlamydomonas reinhardtii as a green factory for sustainable biofuels and bioproduct production
2026-May-01, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.04.005
PMID:42070768
|
综述 | 本文综述了莱茵衣藻作为绿色工厂在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产方面的最新进展 | 强调将生物燃料生产与高价值生物产品生产相结合的综合视角,以推动循环生物经济发展 | 面临碳和氧化还原分配、叶绿体-脂滴相互作用、产品一致性等挑战,以及规模化限制、生长-产量权衡和下游加工成本高等瓶颈 | 评估莱茵衣藻在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产中的潜力和工程策略 | 莱茵衣藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 莱茵衣藻 | 三酰甘油积累、乙醇发酵、光生物产氢、重组蛋白表达、类胡萝卜素合成、多糖合成、可降解聚合物合成等代谢途径 | 医药, 营养品, 材料, 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 31 | 2026-05-05 |
Breaking boundaries for PFAS surveillance in water reservoirs: CRISPR-electrochemical synergies from MXene to microfluidics- A review
2026-Apr-30, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118756
PMID:42070443
|
综述文章 | 本文提出基于磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a和微流体自动化协同融合的下一代PFAS监测框架 | 首次提出分子工程化磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a与微流体自动化的协同融合,实现皮摩尔亲和力、阿托摩尔灵敏度和分钟级检测 | NA | 开发超越现有方法限制的超灵敏、特异、便携且低成本的PFAS监测技术 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS) | 合成生物学,环境监测 | NA | CRISPR-Cas12a,微流体技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | NA | 生物传感器,基于适体的CRISPR检测电路 | 环境监测,水安全 |
| 32 | 2026-05-05 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-Apr-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了高渗透压枯草芽孢杆菌无细胞平台,用于快速表征基因调控元件 | 通过系统优化提取和反应环境,省去传统透析步骤,并利用高离子强度(400 mM谷氨酸钾)和渗透保护剂甜菜碱显著提高翻译能力,验证了该平台作为细菌生理预测代理的有效性 | NA | 开发一种简化且稳健的无细胞系统,用于快速表征基因调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、荧光蛋白合成、磷酸化级联反应 | NA | 基因表达数据集 | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 调控电路(CcpA与HPr复合物对含-box启动子的抑制) | 合成生物学、基础研究、蛋白质生产 |
| 33 | 2026-05-05 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-Apr-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
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研究论文 | 通过代谢工程策略改造枯草芽孢杆菌,实现了以马铃薯淀粉为碳源高产红景天苷 | 引入芳香醛合酶(AAS)合成酪醇,抑制竞争代谢途径,筛选内源醇脱氢酶,并利用群体感应动态调控系统优化红景天苷生产 | 未提及 | 开发可持续的红景天苷生产方法 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 群体感应动态调控系统 | 生物医药,化妆品 |
| 34 | 2026-05-05 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-Apr-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
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研究论文 | 构建一种多色细菌传感器,用于同时检测环境中的四环素和红霉素混合物 | 通过将两个基于转录因子的传感模块整合到单个质粒中,并引入抗生素抗性基因提升性能,实现了对二元抗生素混合物的定量区分,仅需通过智能手机拍摄的细菌图像进行荧光颜色对比 | 未提及对更复杂混合物(如三种或更多抗生素)的检测能力或长期稳定性 | 开发一种现场可部署的多色细菌传感器,用于定量检测环境中的抗生素混合物及其生物可利用组分 | 环境水样中的抗生素混合物(四环素和红霉素) | 合成生物学 | NA | 荧光成像、抗生素抗性基因工程 | NA | 图像 | 实际水样中的若干样本 | 质粒构建 | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器(基于转录因子的双模块整合) | 环境监测 |
| 35 | 2026-05-05 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-Apr-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 描述了酵母MoClo分泌和表面展示工具包2.0的改进及其在蛋白质-蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 新增基于截短Aga1和C端融合Aga2的锚蛋白部件,引入GFP荧光互补检测和高通量分泌增强蛋白,以及展示纳米抗体评估相互作用和PET塑料降解的全细胞催化应用 | 未明确提及,但可能涉及工具包在复杂环境中的稳定性和普适性限制 | 改进MoClo YSD工具包并拓展其在合成生物学和生物催化中的应用 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 模块克隆(MoClo),GFP互补,共免疫沉淀,流式细胞术 | NA | 蛋白质相互作用数据和酶活性数据 | 未明确样本量,涉及GFP标签蛋白和PET降解酶系统 | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示系统,包括锚蛋白融合、GFP互补传感器、共展示PET降解酶与MHETase的代谢通路 | 生物技术,环境保护 |
| 36 | 2026-05-05 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
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研究论文 | 该研究从传统中药材蛇足石杉中鉴定并功能表征了一种微生物样的二萜合酶MTPSL1,通过诱变分析揭示了其多功能性,并发现S224A突变能显著提升三种二萜骨架的产量 | 首次从蛇足石杉中报道微生物样萜烯合酶,并揭示了其多功能性的分子基础,特别是S224A突变能显著提高海洋特异性二萜的产量,为蛋白质工程和合成生物学应用奠定了基础 | 研究中未提及MTPSL1在植物体内的完整生物合成途径或与其他酶的相互作用,且仅通过转录组分析推测了下游修饰酶,缺乏直接的功能验证 | 探索传统药用植物蛇足石杉中微生物样萜烯合酶的存在及功能 | 蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1 | 数字病理学 | 不适用 | 转录组分析、NGS、诱变、结构解析 | 不适用 | 转录组数据、化合物结构数据 | 从蛇足石杉转录组中鉴定出一种酶,通过7种化合物解析其功能 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学,工业生物技术 |
| 37 | 2026-05-05 |
A Clozapine-Responsive GPCR-Based Gene Switch for Pharmacological Control of Gene Expression in Mammalian Cells and In Vivo
2026-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083381
PMID:42074026
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研究论文 | 报道了一种基于氯氮平响应性GPCR的基因开关,用于哺乳动物细胞和体内的药理学基因表达调控 | 首次将设计药物专一激活受体与信号依赖性转录调控结合,建立基于人GPCR的氯氮平响应基因开关,实现亚纳摩尔至低纳摩尔浓度灵敏响应及体内低剂量口服或局部给药诱导 | 可能涉及氯氮平的潜在副作用及长期体内调控稳定性需进一步评估 | 开发临床适用的药理学可控基因表达平台,用于哺乳动物合成生物学和细胞治疗 | 设计GPCR基因开关、cAMP或钙响应合成启动子、海藻酸微囊化报告细胞 | 合成生物学 | NA | 基因开关设计、cAMP/钙信号通路调控 | NA | NA | C57BL/6J小鼠模型,每日氯氮平剂量0.3 mg/kg | NA | 哺乳动物细胞(HEK293等)、C57BL/6J小鼠 | GPCR偶联信号依赖性转录调控回路 | 医学 |
| 38 | 2026-05-05 |
Osmotic signaling governs sunscreen biosynthesis to safeguard desert cyanobacteria against desiccation
2026-Apr, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70075
PMID:42079446
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研究论文 | 揭示了渗透信号通过调控防晒霜类菌胞素样氨基酸的生物合成来保护沙漠蓝细菌免受干燥胁迫 | 首次发现类菌胞素样氨基酸在干旱条件下作为渗透保护剂的双重功能,并鉴定出Dsp1-OrrA信号通路介导渗透诱导的MAA生物合成 | 未详细探讨MAA在其他胁迫条件下的具体功能,以及该信号通路在其他生物中的保守性 | 研究类菌胞素样氨基酸在沙漠蓝细菌应对干燥胁迫中的作用及其调控机制 | 沙漠蓝细菌(一种沙漠适应性的蓝细菌) | 合成生物学, 微生物学 | 不适用 | 基因破坏、生化分析、系统发育基因组分析 | 不适用 | 基因组数据、生化实验数据 | 不适用 | 不适用 | 沙漠蓝细菌 | 不适用 | 环境生物技术, 合成生物学 |
| 39 | 2026-05-05 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
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研究论文 | 结合膨胀显微镜与光激活定位显微镜实现细菌中蛋白质相互作用的分子尺度三维成像 | 首次在细菌中实现双色三维膨胀光激活定位显微镜,达到约3纳米的空间分辨率,并通过优化膨胀协议最小化色差和信号串扰,结合高度选择性倾斜照明提高单分子灵敏度 | 需要进一步验证该方法在其他高密度生物样本(如细胞器或分子凝聚体)中的普适性和可重复性 | 开发一种用于研究原核生物及高密度样本中分子组织的方法 | 细菌中参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 显微镜成像 | NA | 膨胀显微镜, PALM, 双色三维超分辨率成像 | NA | 图像 | NA | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 40 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程,并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用,包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具,及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径,用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症, 心血管疾病, 糖尿病 | 代谢组学, 单细胞代谢组学, 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |