合成生物学相关文章
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当前共找到 1376 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-08-05 |
Protein modification: convergence of artificial intelligence, synthetic biology, and nano-assembly
2026-Jul-31, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.150606
PMID:42546624
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综述 | 本研究批判性地审视了生物合成蛋白质功能增强的最新进展，强调计算设计、人工智能引导的蛋白质工程和遗传密码扩展等新兴策略，以及化学、酶和物理场辅助修饰技术与宏观自组装和纳米制造相结合的综合修饰方法 | 创新性地整合了人工智能、合成生物学和纳米组装三个领域，提出闭环AI引导的蛋白质设计路径，并强调多策略协同作用对蛋白质功能的显著提升 | 未提供具体实验数据或详细案例，缺乏对实际应用中的挑战和局限性的深入讨论 | 探讨通过综合修饰策略增强生物合成蛋白质功能，以克服其在先进食品系统中的功能缺陷，推动可持续高性能蛋白质配料的发展 | 生物合成蛋白质 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 42 | 2026-08-04 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自主动脉内给药系统，涵盖合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗剂等策略。 | 强调通过纳米技术和合成生物学实现自主、可编程的鼻脑给药，模块化设计功能组件并整合宿主响应机制。 | 未明确讨论临床转化中的安全性、长期稳定性或实际人体验证。 | 探讨自主鼻内给药系统在治疗神经系统疾病中的潜力和设计原理。 | 自主鼻内给药系统，包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体给药剂。 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 43 | 2026-08-04 |
Mitigating chromium-induced oxidative stress in plants: a cross-talk between phytohormones and rhizospheric microbes
2026-Aug-03, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2026.2703740
PMID:42545045
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综述 | 本文综述了六价铬诱导植物氧化应激的机制，以及植物激素与根际微生物之间的相互作用，并提出了缓解铬胁迫的策略 | 整合了多组学和合成生物学方法，提出了ACC脱氨酶AP2/ERF通路是PGPR介导的Cr(VI)耐受的关键途径，并揭示了植物激素组合策略优于单一激素 | 缺乏田间规模验证，所有有效性指标均为实验室估计，需要多季节农艺确认 | 总结Cr(VI)诱导的氧化应激机制，探讨植物激素与根际微生物在缓解铬胁迫中的协同作用 | 植物、根际微生物（PGPR） | 植物科学 | 重金属胁迫 | 多组学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物激素与微生物信号通路 | 农业、环境 |
| 44 | 2026-08-04 |
Can Cells Be Fully Programmed and Engineered?
2026-Aug-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70331
PMID:42543882
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观点文章 | 本文从视角角度探讨了合成生物学中细胞编程和工程化的范式，提出应利用生物复杂性而非强制模拟硅基芯片，并展望了生物物理混合实体与生物安全措施的发展 | 提出将细胞视为动态计算资源而非刚性硅基芯片，倡导利用生物物理混合实体（如细胞-半导体壳、硅纳米线、聚合物水凝胶）增强细胞功能，并强调生物安全的重要性 | 作为观点文章，缺乏实验数据支持，主要基于理论论证和已有案例总结 | 探讨合成生物学中细胞编程和工程化的合理范式，主张顺应生物复杂性而非强制模拟数字计算 | 合成生物学中的细胞编程与工程化，包括生物物理混合实体（如细胞与半导体、硅纳米线、聚合物水凝胶的整合） | 合成生物学 | 癌症（提及癌症摧毁电路） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞电路（如癌症摧毁电路、爆炸物检测、炎症记录型益生菌电路） | 医学、环境、工业生物技术 |
| 45 | 2026-08-04 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Jul-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
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观点文章 | 提出一个受交响乐启发的系统工程框架，用于多微生物合成生物学，将群落设计组织在四个协调层面，并提供一个模块化工程蓝图，以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化。 | 将多微生物工程重新定位为协调系统设计而非孤立的遗传控制问题，提出模块化而非规定性的框架，允许根据应用需求和环境复杂性部署不同的协调层。 | 讨论了代谢物运输、群体漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束，但具体解决方案未详细展开。 | 为多微生物合成生物学提供结构化的系统工程框架，促进合成微生物群落在工业、环境和治疗领域的应用。 | 合成微生物群落（微生物聚生体）。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 协调层包括通信、时间调控、生态结构和预测建模，设计涉及振荡控制、合成生态学等 | 工业、环境、医学 |
| 46 | 2026-08-04 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类代谢工程中的应用，包括途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别 | 未详细讨论具体菌株和技术的实验验证细节 | 探讨微生物生产萜类化合物的代谢工程策略，并强调计算方法的整合以优化菌株 | 微生物菌株及萜类生物合成途径 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 基因工程、人工智能、机器学习 | AI/ML模型（未具体指定） | 基因组学、系统生物学数据 | NA | 基因编辑工具（未具体指定） | 微生物宿主（如大肠杆菌、酵母等，未具体列出） | 萜类生物合成途径的异源重构和代谢通量重定向 | 医药、营养保健品、化妆品、农业、香料、生物燃料 |
| 47 | 2026-08-04 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
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研究论文 | 本文提供了一个设计合成小调节RNA（sRNAs）的详细指南，以实现细菌中高效基因敲低 | 提出了综合的sRNA设计原则和关键优化因素，包括支架选择、目标mRNA结合亲和力、目标mRNA二级结构和Hfq表达水平，并强调跨物种适用性 | 文中未提及具体实验数据或验证，可能缺乏实际应用中的性能评估 | 提供一套详细的协议，用于设计和构建合成sRNA，以在细菌中实现高效基因敲低 | 合成小调节RNA（sRNAs）及目标基因mRNA | 机器学习 | NA | 合成生物学设计 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成小调节RNA（sRNA）基因敲低系统 | 合成生物学、代谢工程 |
| 48 | 2026-08-04 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2026, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
|
综述 | 本文综述了合成生物学在可再生燃料和绿色化学品商业化中的应用，重点探讨其如何通过DNA建模、代谢工程和微生物发酵的进步，优化来自非粮食原料（如木质纤维素生物质）的生物燃料生产，并分析行业现状与挑战。 | 从合成生物学视角系统探讨生物燃料和生物化学品商业化的潜力，强调非粮食原料的应用及可持续发展目标的协同，并聚焦菌株工程优化和产业化挑战。 | 综述未包含具体的实验数据或案例量化分析，对生物安全、知识产权等挑战的讨论较为概览性。 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用，评估其实现商业化及支持可持续发展的可能性。 | 产乙醇等生物燃料的工程微生物菌株，包括大肠杆菌和酿酒酵母等。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、DNA建模、微生物发酵 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 大肠杆菌、酿酒酵母 | NA | 能源、工业生物技术 |
| 49 | 2026-08-03 |
Bacterial surface layer ⸻ Properties, role, applications and challenges ⸻ A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Aug-01, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
|
综述 | 本文综述了细菌表面层（S层）蛋白的结构特性、生物学功能、应用潜力及面临的挑战，并探讨其作为下一代纳米技术工具的应用前景 | 本文独特地将S层蛋白的机制生物学与面向制造的工程化、蛋白质设计流程和商业化路线图相结合，提供了以往综述未涵盖的可行方案和基准 | S层蛋白向商业化规模应用转化仍面临挑战，包括高纯度蛋白生产的可扩展性、成本效益高的重组表达、恶劣工业条件下的稳定性以及生物来源纳米材料的监管路径未明确 | 综述S层蛋白在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用，并分析其从理论向功能原型转化的前景 | 细菌和古菌的表面层（S层）蛋白 | 合成生物学、纳米生物技术 | NA | 重组表达、融合蛋白技术、交联域工程、计算建模 | NA | 综述文献 | NA | NA | 细菌、古菌 | S层自组装二维结晶晶格，用于酶固定化、纳米图案化、脂质双分子层稳定化 | 医学、工业、环境 |
| 50 | 2026-08-03 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Jul-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
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综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂（PDAs）在分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼以及应用方面的最新进展 | 整合合成生物学、绿色纯化和纳米递送策略，以克服植物源抗氧化剂的工业挑战并提出精准设计和多功能应用的新见解 | 未提及具体局限性，可能面临天然丰度低、杂质复杂、稳定性差及提取中的污染和变质等挑战 | 总结植物源抗氧化剂的生物合成、精炼和功能性应用，以替代合成抗氧化剂并预防慢性疾病 | 植物源抗氧化剂如多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷 | 合成生物学 | 神经退行性疾病、心血管疾病、糖尿病、癌症 | 合成生物学、绿色纯化、纳米递送 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 食品工业、医疗保健 |
| 51 | 2026-08-03 |
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.738993
PMID:42539253
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研究论文 | 介绍“Caffeinated Coli”教育模块，通过工程化大肠杆菌进行生物测定实验，向高中学生传授合成生物学和遗传工程知识 | 将合成生物学引入高中课堂，利用仅能在咖啡因上生长的大肠杆菌作为教学工具，结合NGSS标准设计灵活模块，支持不同水平学生 | 模块已在8所德克萨斯高中实施，但未提及长期效果或推广到其他地区的可行性 | 通过实践学习激发学生对科学、技术、工程和数学的兴趣，并普及合成生物学教育 | 高中学生和教师，以及一种经基因工程改造以依赖咖啡因生长的大肠杆菌菌株 | 教育、合成生物学 | NA | 生物测定实验 | NA | 实验数据、教育反馈 | 8所德克萨斯高中，具体学生和教师数量未提及 | NA | 大肠杆菌 | 生物传感器（大肠杆菌依赖咖啡因生长） | 教育、生物技术 |
| 52 | 2026-08-03 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本文研究了源自ϕC31和TG1整合酶的杂交丝氨酸整合酶的体外活性，这些酶能高效重组混合attP × attB底物，同时保留对同源重组方向性因子的相互作用和方向性控制。 | 提出了一种模块化框架，通过利用TG1衍生的卷曲螺旋结构域保留与同源RDF的相互作用，并保持方向性控制，从而能够工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶。 | 研究仅限于体外活性分析，尚需通过结构预测工具和扩展的LSR发现与表征来进一步验证体内应用和定制基因组位点的理性设计。 | 开发一种模块化方法，用于工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶，以用于基因组工程和合成生物学。 | ϕC31和TG1整合酶产生的杂交丝氨酸整合酶及其对混合attP × attB底物的重组活性。 | 合成生物学 | NA | 体外重组活性分析，结构预测工具 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | 重组系统，具有方向性控制 | 医学, 工业生物技术 |
| 53 | 2026-08-03 |
Controlled assembly of exogenous DNA-based materials in living cells
2026-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.12.009
PMID:42539686
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综述 | 本文综述了外源DNA基材料在活细胞内的受控组装，涵盖多种刺激条件下的组装机制及其在生物医学和合成生物学中的应用。 | 系统总结了外源DNA材料在细胞内不同刺激条件下的动态组装，并重点阐述了其在改变细胞环境、干扰亚细胞结构和癌症诊疗中的三大应用。 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于当前技术对细胞内组装过程的精确控制和体内应用的临床转化挑战。 | 全面综述外源DNA基材料在活细胞内的受控组装机制及其生物学效应，展望该领域的未来研究方向。 | 外源DNA基材料及其在活细胞内的组装体和功能模块。 | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | 生物传感器、逻辑门、药物递送系统 | 医学、生物技术 |
| 54 | 2026-08-02 |
Applying the design-build-test-learn framework to precision fermentation for sustainable food ingredients
2026-Aug, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-026-02116-w
PMID:42534763
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综述 | 本文综述了设计-构建-测试-学习（DBTL）框架在精准发酵中的应用，用于可持续食品成分的合成，重点关注食品级微生物平台的开发。 | 系统性地将DBTL框架应用于食品级精准发酵，强调安全、法规和消费者接受度对菌株选择及工程策略的影响，并整合计算设计、自动化构建、高通量测试和数据驱动学习。 | 未提及具体局限性，可能缺乏对工业规模化挑战或法规细节的深入讨论。 | 探讨DBTL框架作为系统性迭代方法，用于开发食品级微生物细胞工厂，生产可持续的食品成分，如替代蛋白、风味化合物和功能性碳水化合物。 | 食品级微生物菌株，用于精准发酵生产可持续食品成分。 | 合成生物学 | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | DBTL循环（设计-构建-测试-学习） | 食品工业 |
| 55 | 2026-08-02 |
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04941-3
PMID:42176025
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综述 | 本文综述了芽孢杆菌来源的抗菌肽作为家禽生产中抗生素替代品的多样性、结构特征、生物合成、作用机制及其应用前景。 | 系统总结了芽孢杆菌抗菌肽的多种作用机制，包括膜靶向、生物膜调控、免疫调节和防霉菌毒素肠损伤，并提出了基因组挖掘、合成生物学和计算设计相结合的未来开发方向。 | 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响，且存在肽不稳定性、体内疗效差异、菌株差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战。 | 评估芽孢杆菌抗菌肽作为家禽生产中抗生素替代品的潜力，并总结其机制和未来研究方向。 | 芽孢杆菌来源的抗菌肽，包括核糖体合成的细菌素和非核糖体合成的脂肽（如表面活性素、伊枯草菌素和丰原素）。 | 微生物学、合成生物学 | 肠道感染、抗微生物耐药性、霉菌毒素相关肠损伤 | 基因组挖掘、合成生物学、计算肽设计 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 家禽 | NA | 农业、食品、医药 |
| 56 | 2026-08-02 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
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综述 | 本文探讨了绿色制药的变革潜力，整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能，以实现可持续的药物发现与生产 | 提出下一代绿色制药概念，整合生物多样性、绿色化学、生物技术和AI，以促进环保高效的药物生产过程 | 面临生物勘探伦理问题、保护工作和生物多样性资源公平惠益分享等挑战 | 探索绿色制药在推动可持续医药未来中的作用 | 植物、微生物和海洋生物中的生物活性化合物 | 机器学习和人工智能 | 不适用 | CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体萃取 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 不适用 | 不适用 | 医药 |
| 57 | 2026-08-01 |
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102489
PMID:42288134
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研究论文 | 本文首次为红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides）开发了功能性附加体质粒系统，并优化了转化效率，实现了多基因途径表达和CRISPR基因组编辑。 | 首次构建了R. toruloides的附加体质粒系统，通过筛选多种来源的自主复制序列（ARS）鉴定出功能元件C63F4，并开发了Cre-loxP介导的体内再环化策略以提高转化效率，同时建立了简化的CRISPR无缝基因组编辑工具。 | 文中未提及明确的局限性，但可能包括质粒稳定性和拷贝数仍有提升空间，以及系统对其他菌株的适用性未知。 | 开发并优化红冬孢酵母的附加体质粒系统，以加速代谢工程、合成生物学和基础研究。 | 红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides）菌株CBS14及其工程改造。 | 合成生物学 | NA | NGS（用于筛选ARS）、CRISPR-Cas9 | NA | 基因序列、质粒稳定性数据、基因表达数据 | 筛选了多种来源的候选ARS，具体样本数未提及 | CRISPR-Cas9、Cre-loxP系统 | 红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides） | 附加体质粒系统pC63F4，包含自主复制序列（ARS）C63F4、GFP报告基因、多基因代谢途径（用于三乙酸内酯、脂肪醇和柠檬烯生产）、以及基于CRISPR的基因组编辑工具 | 工业生物技术、代谢工程 |
| 58 | 2026-08-01 |
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102493
PMID:42314827
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研究论文 | 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统，通过定向进化和代谢工程，在解脂耶氏酵母中实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 | 通过结构引导的酶工程实现了P450BM3的区域发散性羟基化，具有高区域选择性和对映选择性；在5升生物反应器中实现了最高产量；意外发现糖基转移酶的混杂活性，促进了红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷的创纪录生产 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发可扩展和适应性强的即插即用氧化生物催化系统，用于可持续生产高价值芳香族化合物 | 2-苯乙醇衍生物，包括(R)-1-苯基乙二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷 | 合成生物学 | NA | 定向酶进化、结构引导的蛋白质工程、代谢工程 | NA | 文本、实验数据 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 解脂耶氏酵母 | 细胞色素P450驱动的羟基化途径 | 工业生物技术 |
| 59 | 2026-08-01 |
Evolution-guided high yield production of potent Gαq/11-signalling inhibitors FR900359 and YM-254890
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102497
PMID:42373013
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研究论文 | 本文通过进化引导的合成生物学策略，开发了稳健的异源微生物系统，用于高产生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890 | 首次采用进化引导策略，利用未培养微生物来源和链霉菌强启动子，实现了FR900359和YM-254890在异源宿主中的高产生产，并开发了双拷贝BGC宿主以进一步提高产量 | 未明确提及，但可能涉及异源宿主的生产稳定性或BGC组装复杂性 | 开发高产、成本效益高的微生物生产系统，用于生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890，以促进其生物技术应用和药物开发 | FR900359和YM-254890的生物合成基因簇，以及异源宿主Burkholderia gladioli Δgbn::attB和Δgbn::2attB | 合成生物学 | Gα突变肿瘤 | 异源表达、基因簇组装、启动子工程 | NA | 序列数据、产量数据 | 多个BGC构建体和两种异源宿主菌株 | CRISPR-Cas9 | Burkholderia gladioli | 生物合成基因簇的异源表达和双重拷贝 | 医学、工业生物技术 |
| 60 | 2026-08-01 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在疾病生物学研究中的最新进展，重点介绍其如何通过定点引入非天然氨基酸来解析动态蛋白互作、翻译后修饰和信号事件，并讨论该技术面临的挑战及未来发展方向 | 强调遗传密码扩展技术作为合成生物学平台，在生理相关环境中以高时空精度剖析疾病分子机制的独特优势，并展望新兴方法学 | 遗传密码扩展技术在更广泛应用中仍面临关键挑战，如效率、特异性和体内适用性等限制 | 探讨遗传密码扩展技术在疾病机制研究中的应用潜力和局限，提出其作为转化性合成生物学平台的愿景 | 疾病相关的分子通路、蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | 多种疾病（未具体指明） | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非天然氨基酸定点掺入 | 活体系统（如细胞） | 遗传密码扩展系统 | 医学 |