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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-28 |
A comparative review of vector insertion techniques in Saccharomyces cerevisiae
2026-Feb, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107378
PMID:41435996
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综述 | 本文比较了酿酒酵母中三种主要的载体插入技术:体内同源重组、Cre-lox重组和CRISPR/Cas9 | 对酿酒酵母中三种主流载体插入技术进行了系统性的比较分析,突出了各自在基因组工程和合成生物学中的应用与特点 | 未涉及其他新兴或较少使用的载体插入技术,且主要基于现有文献综述,缺乏新的实验数据验证 | 比较和评估酿酒酵母中不同载体插入技术的应用、优势与局限性 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 体内同源重组、Cre-lox重组、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cre-lox | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术 |
| 42 | 2026-01-28 |
Classification, catalytic mechanisms, and functional characterization of non-heme diiron oxygenases: A review
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150277
PMID:41544786
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综述 | 本文综述了非血红素双铁加氧酶(NDOs)的分类、催化机制及其功能表征,并探讨了其在合成生物学和可持续生物制造中的应用前景 | 整合了结构生物学、光谱学、计算模型和动力学分析的最新进展,为NDOs的家族分类、催化循环和底物结合策略提供了系统的概念框架 | NA | 为非血红素双铁加氧酶的未来机理研究和蛋白质工程提供指导 | 非血红素双铁加氧酶(NDOs) | NA | NA | 结构生物学、光谱学、计算建模、动力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、可持续生物制造 |
| 43 | 2026-01-28 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Jan-27, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
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研究论文 | 本文提出了一种利用内源性微环境触发器在膀胱内原位合成糖胺聚糖仿生涂层的方法,以促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 创新点在于开发了一种基于内源性酶驱动的原位自组装系统,结合了抗黏膜冲洗的持久保留和微环境调节功能,模拟了糖胺聚糖的阴离子和屏障特性 | NA | 研究目的是开发一种用于膀胱黏膜修复的生物响应性治疗平台,通过模拟糖胺聚糖功能来增强屏障完整性和减轻炎症 | 研究对象包括大鼠模型中的环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎,以及藻酸盐寡糖共轭聚多巴胺涂层 | 合成生物学 | 间质性膀胱炎 | 原位合成策略,利用过氧化氢酶和过氧化氢驱动聚合 | NA | 组织学和分子分析数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 44 | 2026-01-28 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Jan-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 本文讨论了微生物菌株KT2440的分类学重命名问题及其对科学界的影响 | 从科学实践与社区共识的角度批判性地分析微生物分类学重命名的决策过程,强调历史连续性与实用性的重要性 | 主要基于单一菌株的案例讨论,未提出系统性的分类学命名改革方案 | 探讨微生物分类学命名决策如何平衡科学严谨性与社区实践需求 | 假单胞菌菌株KT2440及其分类学身份争议 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 45 | 2026-01-28 |
Advances in artificial cells capable of metabolic mimicry: from fundamentals to applications
2026-Jan-27, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01330e
PMID:41591296
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综述 | 本文全面综述了能够模拟代谢的人工细胞的研究进展,从其基本原理到应用领域 | 系统总结了基于物理特性的各类人工细胞在代谢模拟方面的优势与局限,并重点介绍了能量生成、合成代谢与分解代谢路径构建的新策略及其在生物传感和疾病诊断中的新兴应用 | NA | 为人工代谢系统的设计和部署提供有价值的见解,并推动下一代合成生物学工具的发展 | 能够模拟代谢的人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢途径重建,包括能量生成(如细胞器封装、光合磷酸化、纳米材料辅助ATP合成)、合成代谢(如碳固定、脂质生物合成、蛋白质表达)和分解代谢(碳氮代谢) | 生物传感, 疾病诊断 |
| 46 | 2026-01-28 |
High-Throughput Yeast Engineering in Biofoundries: Toward Autonomous and Scalable Synthetic Biology
2026-Jan-27, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程,推动高通量酵母工程向自主化、规模化方向发展 | 探讨了从设计-构建-测试-学习循环向设计-构建-部署循环的转变,以及自主化“自动驾驶实验室”的发展前景 | 存在协议可变性、人工智能工具整合不足以及标准化和可重复性挑战等关键障碍 | 加速酵母菌株开发,实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程与生物铸造厂 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-01-28 |
Probiotic and Microbial Enzymatic Mechanisms for PFAS Detoxification
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10921-2
PMID:41591586
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综述 | 本文综述了微生物和益生菌对PFAS进行生物修复的当前进展,重点探讨了酶促机制、微生物途径以及与常规处理系统的整合 | 系统性地整合了微生物(包括益生菌)对PFAS的吸附、转化和脱氟机制,并探讨了合成生物学在工程化增强PFAS降解能力方面的最新进展 | 当前微生物途径主要通过部分转化而非完全矿化作用,常积累稳定的氟化中间体;真正的矿化受限于酶效率低、底物特异性窄以及实验室成果难以转化到复杂环境基质中 | 评估微生物和工程化益生菌方法对PFAS进行生物修复的可行性,并指出知识空白和未来发展方向 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS) | NA | NA | 微生物生物修复、酶学研究、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌、真菌、蓝细菌、肠道微生物群、益生菌菌株 | 具有增强PFAS摄取和降解能力的工程化微生物系统 | 环境 |
| 48 | 2026-01-28 |
A Microbial Odyssey: Reshaping Probiotic Destinies through Advanced Delivery Technologies
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10926-x
PMID:41591587
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综述 | 本文系统总结了益生菌递送技术的最新进展,包括多种工程策略和材料平台,并批判性地探讨了临床转化中的关键挑战 | 全面整合了靶向递送系统、基因工程益生菌、微胶囊技术和纳米载体平台等先进递送策略,并引入了智能响应系统、仿生技术和合成生物学等跨学科方法以实现精确释放和持续定植 | 临床转化面临配方稳定性、个体间差异、监管不一致性和长期安全性等关键挑战 | 优化和高质量开发益生菌递送系统,为下一代益生菌生物疗法的合理设计提供前瞻性框架 | 益生菌及其递送技术 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病和神经精神疾病 | 基因工程、表面修饰、微胶囊技术、纳米载体平台 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 49 | 2026-01-28 |
Molecular gatekeepers: eukaryotic translation factors decoding plant-virus dynamics for resistance engineering
2026-Jan-27, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00273-2
PMID:41591594
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综述 | 本文综述了植物病毒如何利用宿主真核翻译因子(eTFs)完成其生命周期,并探讨了通过靶向操纵这些因子来工程化植物抗病性的策略 | 提出了一个以eTF为中心的抗性育种框架,整合了分子生物学与应用策略,为开发广谱、持久且环境可持续的植物抗病毒方案提供了新视角 | NA | 阐明真核翻译因子在植物-病毒互作中的机制作用,并探索通过调控这些因子来增强植物抗病毒能力的策略 | 植物病毒、宿主真核翻译因子(如eIF4E, eIF(iso)4E, eIF4G, eEF1A, eEF1B) | 合成生物学 | 植物病毒病 | 自然等位基因挖掘、诱导诱变、TILLING/EcoTILLING、RNA干扰、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物 | NA | 农业 |
| 50 | 2026-01-28 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素(由多种细菌和真菌产生的天然色素) | NA | NA | 组学技术、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌 | NA | 生物技术 |
| 51 | 2026-01-28 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Jan-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 本研究探讨了阿莫地喹通过靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶,增强减毒沙门氏菌抗黑色素瘤疗效的机制 | 首次揭示了减毒沙门氏菌VNP20009在肿瘤微环境中招募的主要是N2型中性粒细胞,并发现阿莫地喹能通过靶向谷胱甘肽还原酶选择性消除这些细胞,从而增强抗肿瘤效果 | NA | 增强减毒沙门氏菌在癌症治疗中的抗肿瘤疗效,并探索中性粒细胞在其中的作用 | 黑色素瘤、减毒沙门氏菌VNP20009、中性粒细胞 | NA | 黑色素瘤 | 化学生物学方法、shRNA负载工程 | NA | NA | NA | shRNA负载工程 | 减毒沙门氏菌VNP20009 | 负载GR-shRNA的工程菌株,用于靶向谷胱甘肽还原酶 | 医学 |
| 52 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题,并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题,并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟,未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 53 | 2026-01-28 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-Jan-20, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 本文综述了能量模型在计算从头蛋白质工程中的关键作用,分析了相关计算方法、工具及与机器学习融合的最新进展 | 提出了基于精度-成本-通量权衡的方法选择决策框架,并整合经典力场、量子力学方法与AI预测,为治疗性和工业蛋白质设计提供协同策略路线图 | NA | 通过能量驱动策略推进计算从头蛋白质工程,设计具有定制功能的新型蛋白质 | 蛋白质的折叠、稳定性与功能 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | 能量模型、AI驱动预测模型 | 蛋白质结构数据、能量景观模拟数据 | NA | CHARMM, Amber, Rosetta | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学, 工业生物技术 |
| 54 | 2026-01-28 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 本文综述了基于酵母的生物传感器在啤酒、葡萄酒和康普茶等发酵饮料安全与质量保障方面的开发与应用 | 利用合成生物学工具开发基因工程酵母菌株,通过荧光、颜色变化或电信号等报告系统实时检测重金属、霉菌毒素等污染物,为发酵饮料安全监控提供快速、低成本的新方法 | 目前主要局限于实验室规模研究,在鲁棒性、可扩展性和监管整合方面仍需进一步研究以实现广泛的工业应用 | 开发用于发酵饮料安全监控的生物传感器技术,以生产更安全、更高质量的产品 | 基因工程酵母菌株及其在发酵饮料(啤酒、葡萄酒、康普茶)安全检测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、基因工程 | NA | 生物传感器信号(荧光、颜色、电信号) | NA | NA | 酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器电路(包含感应元件和报告系统,如荧光蛋白、显色酶等) | 食品、工业生物技术 |
| 55 | 2026-01-28 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 报道了一种能够定向运动并现场合成ATP的旋转FF-ATP酶驱动胶体马达 | 利用光酸燃料驱动的纳米推进器,通过跨膜质子动力驱动ATP酶旋转,实现可控运动与现场ATP合成,并展示出向ADP/OH梯度的趋化性 | NA | 开发集自主运动与局部能量生产于一体的仿生推进平台 | 单孔胶体马达 | 合成生物学 | NA | 分层组装、光异构化 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生推进平台,整合运动与能量生产功能 | 生物医学, 合成生物学 |
| 56 | 2026-01-28 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-Jan, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于在酿酒酵母周质空间展示基因编码蛋白调节剂的合成生物学筛选平台 | 开发了模块化的周质展示平台,通过优化分泌信号和展示支架实现稳定配体保留和自分泌信号传导,首次实现基于信号传导而非单纯结合的功能优先筛选 | 目前主要针对G蛋白偶联受体进行验证,尚未在其他类型膜蛋白或可溶性蛋白上全面应用 | 开发用于筛选和研究基因编码生物分子的合成生物学平台 | 肽、蛋白质和纳米抗体等基因编码的蛋白调节剂 | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、分泌信号优化、自分泌信号检测 | NA | 蛋白质序列、信号传导数据 | NA | 合成生物学平台 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 周质展示系统、膜蛋白功能检测电路、自分泌信号通路 | 药物发现、蛋白质工程、生物技术 |
| 57 | 2026-01-28 |
Synthetic biology empowers development of traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.010
PMID:41584699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2026-01-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Jan-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK),一个基于Golden Gate的模块化克隆系统,专为大肠杆菌设计,旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点(RBS),提供了更灵活的转录和翻译控制,并整合了Cello库中的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化遗传电路组装工具,以优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环 | 遗传电路的设计与组装,特别是在大肠杆菌中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路,包括启动子、绝缘核酶、RBS和NOT门等基本部件 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 59 | 2026-01-27 |
Polyphenols as Modulators of Macrophage Polarization: Mechanisms and Therapeutic Potential in Chronic Inflammatory Diseases
2026-Jan-25, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.70181
PMID:41582068
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综述 | 本文综述了天然多酚通过调控关键信号通路(如NF-κB、JAK/STAT等)来影响巨噬细胞极化(M1/M2表型),及其在慢性炎症性疾病和癌症治疗中的潜在应用 | 系统阐述了多酚调控巨噬细胞极化的双重治疗潜力(促M2极化缓解慢性炎症,促M1极化用于癌症免疫治疗),并提出了利用纳米技术、合成生物学和人工智能等创新方法克服多酚生物利用度低等局限性的新策略 | 多酚存在生物利用度低和毒性低的局限性,文中提出的创新方法(如纳米技术、合成生物学等)仍处于提议阶段,需进一步实验验证 | 探讨天然多酚作为免疫调节剂,通过调控巨噬细胞极化来治疗慢性炎症性疾病和癌症的潜力 | 天然多酚化合物及其对巨噬细胞极化的调控作用 | NA | 慢性炎症性疾病(包括动脉粥样硬化、代谢性疾病、神经退行性疾病等) | 文献综述(基于Web of Science和PubMed数据库检索) | NA | 文本(已发表文献) | NA | NA | NA | NA | 医学(慢性炎症性疾病治疗、癌症免疫治疗) |
| 60 | 2026-01-27 |
Biomanufacturing polyhydroxyalkanoates from CO2: A critical review of advances, challenges, and solutions for autotrophic and hybrid systems
2026-Jan-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108810
PMID:41581798
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综述 | 本文系统评述了利用二氧化碳生物转化生产聚羟基脂肪酸酯的技术进展、挑战与解决方案,重点关注自养和混合系统 | 首次系统比较了直接自养与两步混合系统在CO2至PHA转化中的性能差距,并提出了基于合成生物学、反应器工程和系统集成的战略路线图 | 当前所有平台仍存在气液传质效率低、催化剂稳定性差(寿命<100小时)及下游分离能耗高等关键瓶颈,导致生产成本(3-8美元/公斤)远高于经济阈值 | 评估CO2生物转化为可生物降解聚合物PHA的技术现状,以推动气候缓解与可持续制造的融合 | 二氧化碳生物转化技术,特别是自养系统(如Cupriavidus necator)和混合系统 | 工业生物技术 | NA | 生物转化、合成生物学、反应器工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Cupriavidus necator | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |