合成生物学相关文章
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当前共找到 555 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-19 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 本文提出了一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计框架，用于在酿酒酵母中重编程转录网络 | 开发了首个用于启动子-转录因子结合位点重组的神经网络工具，实现了无需实验表征的高效启动子工程 | NA | 通过合成启动子设计实现真核生物转录网络的重编程 | 酿酒酵母的启动子和转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络 | ANN | 启动子序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母 | TetR和Mig1转录因子结合位点的启动子工程 | 工业生物技术 |
| 42 | 2026-03-19 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Mar-17, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 本文深入综述了植物中构建体设计原则和靶向DNA插入（敲入）策略，为合成生物学、遗传学和作物改良提供实用指导 | 系统评估了当前敲入方法在短片段、大片段和多片段插入中的优缺点，并探讨了非植物先进技术在提高植物敲入效率和精度方面的潜力 | NA | 为促进敲入技术在作物遗传改良中的有效应用，减少脱靶效应 | 植物基因组中的DNA插入构建体设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 43 | 2026-03-19 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Mar-14, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过一个协同循环，从根本上改变了蛋白质研究，连接了结构预测、功能注释和理性设计 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式，将深度学习确立为蛋白质科学新时代的基石，将领域从描述性观察转变为有原则、可编程的生物分子功能工程 | 在数据稀缺性、模型可解释性和分布外泛化方面仍存在挑战 | 展示深度学习如何通过一个协同循环，连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计，从而加速药物开发和合成生物学领域的发现 | 蛋白质，特别是具有足够进化信息的单域、球状蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习，生成式AI，逆折叠模型，冷冻电镜与AI集成 | 端到端深度学习模型（如AlphaFold2），多模态模型，生成式AI | 3D坐标，序列数据，相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发，合成生物学 |
| 44 | 2026-03-19 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Mar-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
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综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来展望，强调其在资源回收中的潜力 | 聚焦于电子转移网络框架的动态耦合机制，并详细阐述了调控策略如环境参数优化、基因工程和微生物电化学技术 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略及其电子转移机制 | Fenton污泥及铁还原细菌 | 环境生物技术 | NA | 生物还原、基因工程、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | 铁还原细菌 | NA | 环境 |
| 45 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展，包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构，揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制，并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制，主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略，以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶（OSCs）及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜（cryo-EM）、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 46 | 2026-03-19 |
Improving the Skin-Conformability of Wearable Continuous Glucose Monitors With Synthetic Hydrogel Electrodes
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517501
PMID:41572506
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研究论文 | 本文介绍了一种通过合成生物电子策略开发的酶水凝胶电极（GelZymes），旨在克服传统酶电极的机械和界面限制，提升可穿戴连续血糖监测设备的皮肤贴合性 | GelZymes提供了两个核心创新：一是采用单块可扩展的3D架构，统一了酶膜和电极，简化了制造过程并消除了界面不稳定性；二是实现了类似组织的粘弹性，结合了拉伸性和粘附性，这在刚性酶膜中很少能实现 | NA | 研究目的是开发一种改进的可穿戴连续血糖监测设备，通过合成生物电子策略提升其皮肤贴合性和生物电化学性能 | 研究对象是酶水凝胶电极（GelZymes），用于可穿戴生物传感器 | 生物电子学 | 糖尿病 | 合成生物电子策略、酶固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 47 | 2026-03-19 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用，并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全性评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素 | NA | NA | 组学技术，基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌，真菌 | NA | 生物技术 |
| 48 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体（TCR）和嵌合抗原受体（CAR）在信号传导架构上的差异，并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异，并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略，以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效，通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体（TCR）、嵌合抗原受体（CAR）及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 49 | 2026-03-19 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 本研究为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包，以促进其在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 开发了基于筛选元件（pENO启动子和pHTX双向启动子）的单基因和双基因表达系统，并首次在马克斯克鲁维酵母中实现了稳定的、受遗传元件组合、碳源和培养时间调控的表达，以及利用SV40核定位信号实现亚细胞靶向 | NA | 开发适用于马克斯克鲁维酵母的基因表达工具，以克服其表达工具有限的障碍，推动其作为微生物底盘在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 马克斯克鲁维酵母 | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建、荧光蛋白定位 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | Kluyveromyces marxianus (马克斯克鲁维酵母) | 单基因表达系统（含短基因间序列IGG用于双顺反子表达）、双基因表达系统（基于双向启动子pHTX）、核定位系统（利用SV40 NLS） | 工业生物技术 |
| 50 | 2026-03-19 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 本文综述了叶际微生物组在可持续农业和环境健康中的关键作用、潜力及当前应用挑战，并探讨了利用组学技术、合成生物学等前沿手段开发精准农业工具的机遇 | 系统性地将叶际微生物组定位为地球最大微生物栖息地之一，并强调其在精准农业和环境可持续性中尚未被充分开发的战略价值，提出了结合组学、合成生物学和生态建模的精准部署新框架 | 叶际微生物的实际应用仍受限于环境不稳定性、田间持久性差、功能表征不完整以及叶面微气候多变等挑战，植物-微生物互作的特异性和微生物相互作用的复杂性也增加了部署难度 | 探索叶际微生物组在推动精准农业和环境可持续性方面的潜力与实现路径 | 植物叶际（气生表面）的微生物群落，包括细菌、真菌和酵母 | NA | NA | 组学技术（omics technologies）、微生物群落工程、纳米递送系统、合成生物学、生态建模 | NA | NA | NA | NA | 植物（泛指） | NA | 农业, 环境 |
| 51 | 2026-03-19 |
The Role of Bacterial Outer Membrane Vesicles in Tumor Development: Facts, Potential Applications and Future Perspectives
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S582600
PMID:41847176
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡在肿瘤发展中的作用，包括其促进或抑制肿瘤的机制，以及作为工程化纳米疫苗和免疫治疗剂的转化潜力 | 系统性地将OMVs的作用与癌症的14个标志对齐，并探讨了其作为可编程纳米平台的工程化应用前景 | NA | 探讨细菌外膜囊泡在肿瘤生物学中的角色及其在癌症预防、诊断和治疗中的潜在应用 | 细菌外膜囊泡及其在肿瘤发展中的机制 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌 | 可编程囊泡设计 | 医学 |
| 52 | 2026-03-18 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸（pBzF）作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用，涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基元，用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用，包括光化学、结构编程和生物控制 | pBzF作为一种非经典氨基酸及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化、光化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 53 | 2026-03-18 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-Mar-16, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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perspective | 本文探讨了RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域，聚焦于RNA修饰如何影响适配体折叠或结合，以及适配体如何用于检测或调控表观转录组状态 | 首次系统性地探索RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠，提出其潜在融合作为创新前沿 | 这些领域之间的直接调控联系尚未完全阐明，需要未来研究进一步探索 | 激发RNA适配体和表观转录组学研究社区之间的讨论，并吸引对未来研究前沿的关注 | RNA适配体（通过SELEX等方法体外选择的单链RNA寡核苷酸）和表观转录组修饰（如m6A、Ψ、m5C） | RNA生物学 | NA | SELEX（系统进化配体指数富集）及相关方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、分子传感、合成生物学、转录后调控、RNA基础治疗 |
| 54 | 2026-03-18 |
CRISPR-Cas9: Genome Engineering and Future Vaccine Applications
2026-Mar-16, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01563-4
PMID:41840308
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9系统及其衍生平台在疫苗设计中的应用，探讨了其从基因治疗工具向疫苗学关键资产转变的潜力与挑战 | 系统性地将CRISPR-Cas9技术从传统基因编辑领域拓展到疫苗设计领域，提出了结合合成生物学实现精准、可编程疫苗的新范式 | 存在脱靶编辑风险、体内递送效率低以及转基因疫苗监管路径不明确等技术转化障碍 | 探讨CRISPR-Cas9技术在疫苗开发中的应用前景与挑战 | CRISPR-Cas9系统及其衍生平台（碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 55 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
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综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术，探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制，并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物（包括古菌、细菌和真核生物）及其酶（极端酶） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑，基因组尺度代谢模型，比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术，环境 |
| 56 | 2026-03-18 |
A protein-fragment complementation assay to quantify synthetic protein scaffold efficiency
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag003
PMID:41836103
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研究论文 | 本研究开发了一种基于二氢叶酸还原酶蛋白质片段互补分析（DHFR PCA）的方法，用于量化合成蛋白质支架在酵母中的效率 | 首次将DHFR PCA应用于酵母中蛋白质支架效率的定量研究，并识别了影响支架效率的关键因素，如PBD-肽相互作用强度和结合可用性 | 研究主要聚焦于酵母模型，可能不直接适用于其他生物系统，且支架表征依赖于生长速率耦合，可能受其他因素影响 | 探索和量化合成蛋白质支架在酵母中的效率，以优化支架设计工具 | 肽结合域（PBD）和肽的相互作用、支架架构和表达水平 | 合成生物学 | NA | 蛋白质片段互补分析（DHFR PCA） | NA | 生长速率数据 | NA | 蛋白质支架设计 | 酵母 | 蛋白质支架，用于诱导酶的空间接近性 | 工业生物技术 |
| 57 | 2026-03-17 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
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综述 | 本文探讨了大型语言模型（LLMs）作为自主代理在合成生物学设计-构建-测试-学习循环中的协调作用，超越了传统的文本生成功能 | 将LLMs定位为能够解析生物系统深层逻辑的语义引擎，并作为自主代理来协调合成生物学的完整实验周期，而非仅作为预测工具 | 新范式引入了计算成本高、可解释性不足以及伦理治理等深刻挑战 | 系统展示LLMs如何转变合成生物学的研究范式，从手动特征创建转向语义驱动方法，并探索其在可持续制造和医学等领域的应用前景 | 大型语言模型（LLMs）在合成生物学中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大型语言模型（LLMs） | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 58 | 2026-03-17 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-14, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料的生物降解机制，从微生物作用到工程系统，并探讨了其在循环生物基框架中的实施与环境安全性 | 对微塑料生物降解过程进行了机理整合分析，明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化等不同阶段，并特别关注了环境安全考量与循环生物基回收框架的整合可行性 | 尽管酶工程和合成生物学在受控条件下显著提高了解聚效率，但规模化、法规遵从性和生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及在循环生物基实施中的环境安全性 | 微塑料（小于5毫米的合成聚合物颗粒）及其生物降解过程 | NA | NA | 微生物降解、酶降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 59 | 2026-03-17 |
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31050845
PMID:41828832
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研究论文 | 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性，以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 | 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性，并识别出多个稳定且可溶的候选碱基，为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 | 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估，未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 | 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基，以支持DNA类似聚合物的设计 | 14种商业可得的替代核碱基 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱（H和C NMR） | NA | 光谱数据 | 14种化合物，在98%和81%浓硫酸中孵育3周 | NA | NA | NA | 天体生物学、行星科学、合成生物学 |
| 60 | 2026-03-17 |
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15050843
PMID:41829116
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研究论文 | 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶，以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 | 构建了突变酶142P-242K，将果寡糖转化效率从29%提升至52%，并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 | 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) | 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 | 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 | 合成生物学 | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 制药 |