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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
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研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异,揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体,结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式(温和型 vs 烈性)对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体(686个)和烈性噬菌体(1516个)的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列(686个温和型 + 1516个烈性型) | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 82 | 2026-01-25 |
Prototissues: Assembly strategies, collective behaviors, and emerging applications
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.033
PMID:41567986
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综述 | 本文综述了原组织的组装策略、集体行为及其新兴应用,提出了一个理解原组织设计的双维度框架 | 提出了一个双维度框架来理解原组织设计,包括原细胞间粘附策略和空间编程方法,并总结了由此启发的关键集体行为 | 主要挑战包括实现动态和选择性粘附、在保持分辨率的同时扩展空间架构、改善信号传输以及增强生物整合 | 推进自下而上的合成生物学,以构建更复杂的人工生命系统,并探索原组织在生物医学、生物传感和智能材料等领域的应用 | 原组织,即由相互连接的原细胞组装体形成的结构 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物传感, 智能材料 |
| 83 | 2026-01-25 |
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Apr-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118371
PMID:41512477
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研究论文 | 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化基于转录因子的羧酸生物传感器的框架 | 通过整合控制转录因子可用性和启动子序列,建立了在无细胞系统中理性构建高性能生物传感器的模块化方法 | NA | 优化无细胞系统中的生物传感器性能,以支持合成生物学和代谢工程应用 | 基于转录因子的羧酸生物传感器,特别是衣康酸响应型生物传感器 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统,启动子工程 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 生物传感器(衣康酸响应型,3-羟基丙酸响应型) | 工业生物技术 |
| 84 | 2026-01-25 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Jan-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
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综述 | 本文系统回顾了微生物中靛蓝素的生物合成策略与应用,重点关注宿主系统、代谢工程和合成生物学技术 | 整合了微生物宿主系统、代谢与酶工程以及合成生物学技术,为靛蓝素生产提供了全面的路线图 | 存在途径优化、产量提升和应用多样性方面的挑战 | 探讨微生物中靛蓝素的生物合成策略及其在工业应用中的潜力 | 靛蓝素及其在微生物中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶(NRPSs)介导的生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株 | 靛蓝素生物合成途径 | 纺织工业 |
| 85 | 2026-01-25 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合了新兴诊断生物标志物(如病毒microRNA)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测和治疗特异性方面的机会 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要局限性 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并概述未来诊断和治疗创新的关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 86 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
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研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具,用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合,无需依赖线性反应阶段,在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学(抑制剂发现和生物标志物检测) |
| 87 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白(FuBAs)的结构、组装和功能,强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs(如CsgA和FapC)的β-螺旋折叠结构,由不完美重复序列稳定,具有高稳定性和低多态性,并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白,特别是大肠杆菌的curli(CsgA)和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli)、假单胞菌(Pseudomonas) | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 88 | 2026-01-25 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
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研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型策略,结合合成生物学、营养学和癌症免疫疗法 | 开发了工程化食源性益生菌,通过分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2等分子,在临床前模型中显示出显著的抗肿瘤效果,并首次在非小细胞肺癌的I期试验中验证了其安全性和有效性 | 存在定植和生物安全性方面的挑战 | 研究工程化食源性益生菌作为低毒性免疫治疗平台的潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、癌症免疫疗法 | 合成生物学 | 肺癌 | 工程化益生菌、可控基因电路 | NA | 临床前模型数据、临床荟萃分析、I期试验数据 | 临床前小鼠模型、非小细胞肺癌I期试验患者 | 可控基因电路 | 食源性益生菌 | 分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2的生物传感器或递送系统 | 医学 |
| 89 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15和TRAIL)的新型生物治疗方法,旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合,开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具(诱导型启动子、生物安全杀死开关) | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统(IL-12、IL-15、TRAIL表达通路) | 医学 |
| 90 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构,并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白,使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构,揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制,并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率,为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 91 | 2026-01-24 |
Pseudomonas putida JM37 as a novel bacterial chassis for ethylene glycol upcycling
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133884
PMID:41453527
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研究论文 | 本研究报道了恶臭假单胞菌JM37作为新型细菌底盘用于乙二醇升级回收的代谢和生物技术潜力 | 首次发现恶臭假单胞菌JM37能高效利用乙二醇作为唯一碳源和能源,并揭示其乙二醇代谢稳健性源于乙醛酸同化途径的遗传冗余 | NA | 开发用于乙二醇可持续升级回收的新型合成生物学底盘 | 恶臭假单胞菌JM37菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、定向诱变、异源生物合成途径表达 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 恶臭假单胞菌JM37 | 乙醛酸同化途径、中链聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、紫色杆菌素生物合成操纵子、PET水解酶分泌系统 | 环境,工业生物技术 |
| 92 | 2026-01-24 |
Bioelectrochemical energy conversion and wastewater treatment in microbial fuel cells: a review of progress, limitations, and future developments
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133903
PMID:41475609
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综述 | 本文综述了微生物燃料电池(MFC)在生物电化学能量转换和废水处理方面的最新进展、局限性与未来发展 | 系统总结了合成生物学与微生物工程在增强生物膜稳定性及促进胞外电子传递方面的最新进展,并分析了纳米结构电极相较于传统碳电极在提升电流输出方面的优势 | 面临材料成本高、电极污染、长期稳定性有限及规模化困难等挑战,阻碍了其工业化应用 | 探讨MFC在环境可持续性与可再生能源生产框架下的技术进展、挑战与应用前景 | 微生物燃料电池(MFC) | NA | NA | 生物电化学能量转换、废水处理 | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物工程 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 环境, 能源 |
| 93 | 2026-01-24 |
Pheromone-mediated quorum sensing enables dynamic regulation of cordycepin biosynthesis in Cordyceps militaris
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133915
PMID:41478417
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研究论文 | 本研究在蛹虫草中重构了信息素介导的群体感应系统,实现了对虫草素生物合成的动态调控 | 首次在蛹虫草中构建了基于信息素群体感应的动态调控系统,实现了细胞密度依赖的虫草素合成调控 | NA | 开发高效的虫草素生物合成动态调控策略 | 蛹虫草(Cordyceps militaris)及其虫草素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、保守结构域分析、2A肽介导的多基因共表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 蛹虫草(Cordyceps militaris) | 信息素响应型合成回路:α-信息素(mfα1)受色氨酸响应启动子P控制,激活关键生物合成基因cns1和cns2 | 医药 |
| 94 | 2026-01-24 |
Lyophilized chloroplasts as molecular capsules: A scalable platform for stable and functional human α-lactalbumin production
2026-Feb, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.12.016
PMID:41448438
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研究论文 | 本研究展示了在冻干转基因烟草叶绿体中稳定生产功能性人α-乳白蛋白(hLA)的可扩展平台 | 利用冻干叶绿体作为分子胶囊,实现hLA的长期稳定储存和高效生产,浓度提升34倍,并验证其生物功能 | 研究使用烟草作为宿主,未来需转向可食用植物宿主,并需进行体内和临床研究验证安全性和有效性 | 开发一种大规模、经济高效的替代蛋白质生产方法,以应对粮食安全挑战 | 人α-乳白蛋白(hLA)在转基因烟草叶绿体中的表达与稳定性 | 合成生物学 | NA | 转基因技术、蛋白质表达分析、Western印迹、体外乳糖合成测定 | NA | 蛋白质表达数据、稳定性测试数据、功能测定数据 | 冻干烟草叶绿体储存长达六个月 | 转基因技术 | 烟草 | 转基因叶绿体表达系统,用于生产人α-乳白蛋白 | 食品、农业 |
| 95 | 2026-01-24 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 本文开发了基于筛选元件(如启动子pENO和双向启动子pHTX)的单基因和双基因表达工具包,用于Kluyveromyces marxianus,以提升其合成生物学应用 | 开发了适用于K. marxianus的模块化单基因和双基因表达系统,包括利用短基因间序列(IGG)进行双顺反子表达,以及通过SV40核定位信号实现亚细胞靶向 | NA | 开发高效且响应环境的基因表达工具包,以促进K. marxianus作为工业蛋白质生产和合成生物学应用的多功能微生物底盘 | Kluyveromyces marxianus酵母及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建、荧光蛋白定位 | NA | NA | 多个K. marxianus菌株 | Gibson Assembly, BioBrick | Kluyveromyces marxianus | 单基因表达系统、双基因表达系统、双向启动子pHTX、核定位信号(NLS)靶向 | 工业生物技术, 食品 |
| 96 | 2026-01-24 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 本文介绍了针对硅藻Phaeodactylum tricornutum优化的电穿孔和聚乙二醇转化方法,以提高DNA和Cas9核糖核蛋白复合物的递送效率 | 开发了高效的DNA递送方法,包括电穿孔和PEG转化,并发现硅藻体内组装能力,适用于多种硅藻物种 | NA | 加速硅藻合成生物学项目及可持续技术的发展 | 硅藻物种,特别是Phaeodactylum tricornutum和Thalassiosira pseudonana | 合成生物学 | NA | 电穿孔,聚乙二醇转化,Cas9核糖核蛋白复合物递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Phaeodactylum tricornutum, Thalassiosira pseudonana | NA | 环境,能源,工业生物技术 |
| 97 | 2026-01-24 |
Bioremediation of ether PFAS alternatives: A structure-reactivity-partitioning framework for hybrid treatment design
2026-Jan-21, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181367
PMID:41570765
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综述 | 本文综述了醚基PFAS替代物的生物修复研究,提出了一个结构-反应性-分配框架,用于设计混合处理策略 | 识别了醚基PFAS的结构-反应性规则,并整合了混合处理(物理化学预活化与生物抛光结合)和基因增强系统作为创新修复途径 | NA | 探讨醚基PFAS替代物的生物修复策略,以解决其环境持久性和生物顽固性问题 | 醚基PFAS替代物,如HFPO-DA (GenX)、ADONA和氯化PFESAs (F-53B) | 环境科学 | NA | 生物修复技术,包括微生物、真菌、酶和植物系统,以及物理化学方法如UV/亚硫酸盐、电芬顿、等离子体和维生素B12/硫化物还原 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物、转基因植物 | 表达加氧酶、脱卤酶或氟化物输出模块的工程微生物,以及携带氧化酶的转基因植物 | 环境 |
| 98 | 2026-01-24 |
Next generation CAR-T cells to tackle down solid tumors
2026-Jan-20, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114650
PMID:41570863
|
综述 | 本文综述了下一代CAR-T细胞在克服实体瘤治疗挑战方面的创新设计与发展 | 系统性地比较了针对实体瘤抗原异质性、肿瘤微环境屏障和免疫抑制机制而设计的逻辑门控系统、多输入CAR、装甲CAR等新一代CAR构建体 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法改进CAR-T细胞疗法以治疗实体瘤 | CAR-T细胞及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 人类T细胞 | 逻辑门控系统、多输入CAR设计、嵌合开关受体、显性失活受体 | 医学 |
| 99 | 2026-01-24 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的潜力与限制 | 评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的酶候选机制,以及分子工程和合成生物学的前景 | 尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂,转化多涉及前体化合物而非终端PFAS,环境因素、慢动力学和机制不确定性限制实际应用 | 探讨微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的科学发展和应用前景 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS)及其在土壤中的转化 | 环境生物技术 | NA | 多组学、计算建模、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 100 | 2026-01-23 |
Development of a suite of activatable plant synthetic promoter systems using a bacterial LysR-type transcriptional regulator FdeR
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.005
PMID:41551741
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研究论文 | 本文开发了一套基于细菌LysR型转录调控因子FdeR的可激活植物合成启动子系统,以丰富植物合成生物学工具包 | 利用细菌LysR型转录调控因子FdeR开发了52个合成启动子系统,这些系统在配体非依赖性方式下被激活,表达活性范围广泛,最高可达CaMV 35S启动子活性的约65% | NA | 开发正交且可调的遗传部件,以在植物中同时表达多个基因,推动植物合成生物学发展 | 土壤细菌中的LysR型转录调控因子FdeR及其对应操作子,以及基于此的合成启动子系统 | 合成生物学 | NA | MoClo-based plug-and-play组装系统、酵母预筛选平台 | NA | NA | NA | MoClo, Gibson Assembly | 烟草 | 基于FdeR的合成启动子系统,包括配体非依赖性激活的合成激活剂 | 农业 |