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当前共找到 1806 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-10-30 |
AI empowers scalable and programmable RNA design
2026-10-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.025
PMID:42880215
|
综述 | 本文综述了AI在RNA设计中的应用，强调利用三级结构解释功能并指导序列生成，替代传统试错流程。 | 强调AI利用三级结构指导RNA序列生成，实现可扩展和可编程的RNA设计。 | 文中未具体提及 | 探讨AI如何赋能可扩展和可编程的RNA设计。 | 功能性RNA | 合成生物学，RNA治疗 | NA | AI模型，实验方法 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 82 | 2026-10-30 |
Programming biological behavior with AI-guided de novo protein design
2026-10-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.08.027
PMID:42880220
|
综述 | 本文是一篇关于如何利用AI引导的从头蛋白质设计来编程生物行为的展望文章 | 提出从头蛋白质设计应从双分子相互作用向自下而上构建蛋白质反应网络发展，并强调可编程、模块化、可控的从头设计组件可驱动复杂涌现的生物行为 | 需克服可设计的蛋白质动态、多步功能及非平衡系统等当前挑战 | 探讨从头蛋白质设计超越双分子相互作用、实现蛋白质反应网络自下而上构建的路径 | 从头设计的蛋白质组件及蛋白质反应网络 | 合成生物学 | NA | 人工智能引导的从头蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质反应网络 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 83 | 2026-10-30 |
Integration by parts: The multi-layered mechanisms of cis-regulatory control
2026-10-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.016
PMID:42880219
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综述 | 本文提出了一个将顺式调控元件的调控逻辑分为结合水平整合和转录水平整合两层的框架，并讨论了其定量模式及在合成生物学和治疗中的应用 | 提出将CRE调控逻辑分为结合水平整合和转录水平整合两层的框架，分类TF协同性沿正交轴，并揭示“乘法加饱和”的重复定量模式 | 文章为综述性框架，未提供新的实验数据验证该模型 | 理解顺式调控元件如何整合转录因子信号以控制基因表达的机制 | 顺式调控元件（CREs）和转录因子（TFs） | 基因调控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 84 | 2026-10-30 |
Craig Venter, a microbiologist
2026-Oct-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01732-26
PMID:42757841
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评论 | 文章回顾了Craig Venter在微生物学和疫苗学领域的革命性贡献，包括首次测序细菌基因组、揭示微生物多样性以及将基因组学和合成生物学引入疫苗学。 | 文章强调Craig Venter对微生物学和疫苗学的贡献应被铭记，而不仅仅是基因组学和合成生物学。 | 文章为观点性评论，未提供原始数据或系统分析。 | 论证Craig Venter对微生物学和疫苗学的革命性贡献。 | Craig Venter的科学生涯和成就。 | 微生物学, 基因组学, 合成生物学, 疫苗学 | NA | 基因组测序, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 85 | 2026-10-30 |
Critical review of artificial intelligence in synthetic biology: DBTL cycle applications, challenges, and design rules for microbial strain engineering
2026-Oct-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05314-0
PMID:42828724
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综述 | 本文综述了人工智能（包括机器学习、深度学习和语言模型）在合成生物学DBTL循环中的应用、挑战及微生物菌株工程的设计规则 | 系统性地分析了AI工具在整个DBTL循环（从设计到最终数据分析）中的应用，并评估了其验证水平和证据等级，同时提出了微生物菌株工程的设计规则 | 模型行为存在不确定性、数据验证和透明度有限、数据分析和解释困难、模型预测不确定，以及安全和伦理问题 | 分析人工智能在合成生物学中的应用，特别是神经网络在基因回路设计、蛋白质工程、代谢通路优化和多组学数据分析中的应用，并评估其验证和证据水平 | 合成生物学中的AI应用，包括基因回路设计、蛋白质工程、代谢通路优化和多组学数据分析 | 合成生物学 | NA | 机器学习, 深度学习, 语言模型 | 神经网络, 深度学习模型, 语言模型 | 多组学数据 | NA | NA | 微生物 | 基因回路 | 医学, 能源, 环境生物技术 |
| 86 | 2026-10-30 |
Spatial Control of Light-Responsive Proteins and Optogenetics Within Hydrogels via Volumetric Bioprinting
2026-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.74563
PMID:42573182
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研究论文 | 该文章利用层析体积生物打印技术，在厘米级水凝胶构建体中实现打印后对光敏蛋白开关和光遗传学电路的空间选择性激活 | 首次将断层体积生物打印技术重新用于打印后光遗传学刺激，结合计算机视觉和上下文感知模型生成，实现深层细胞的光激活；使用多波长体积生物打印机选择性刺激表达近红外光遗传系统的细胞 | 研究未明确说明所构建组织的长期稳定性、光刺激的精确分辨率限制以及体内应用验证的缺失 | 实现水凝胶构建体内光响应蛋白和光遗传学电路的空间控制，为组织工程提供远程、可重复、局部的生物事件调控平台 | 水凝胶构建体内的细胞和光敏蛋白开关/光遗传学电路 | 组织工程, 合成生物学, 生物打印 | NA | 体积生物打印, 光遗传学, 计算机视觉 | 上下文感知模型生成 | 图像, 荧光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 近红外光遗传系统触发基因表达和胰腺特异性转录因子诱导 | 医学, 组织工程 |
| 87 | 2026-10-30 |
EXPERT: A practical and forward-looking guide to capturing protein expression and purification metadata to develop machine learning models
2026-Sep-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113610
PMID:42810683
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研究论文 | 本文提出了EXPERT框架，用于标准化蛋白质表达与纯化实验数据的记录，以支持机器学习模型的开发 | 首次提出社区统一的蛋白质表达与纯化实验报告模板EXPERT，整合学术界和工业界专家意见，定义结构化数据记录标准 | 本文为指南性框架，尚未在实际大规模数据集中验证其有效性，且参数集可能需随领域发展迭代 | 建立一致、完整、标准化的蛋白质表达与纯化实验报告框架，提高实验室间可重复性并支持下游机器学习应用 | 蛋白质表达与纯化实验工作流及其实验数据记录 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术 |
| 88 | 2026-10-30 |
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100047
PMID:42088953
|
综述 | 本文综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及构效关系的研究进展 | 系统整合了原花青素结构、生物合成、调控及构效关系的最新研究进展，并提出了未来精准生物制造的研究方向 | 聚合位点、决定聚合物结构的机制以及精确的构效关系等关键知识缺口尚未阐明 | 梳理原花青素研究的最新进展，明确未来研究方向以推动精准生物制造 | 原花青素（黄烷-3-醇单体的寡聚体或聚合物） | 植物次生代谢与合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | 基因编辑，合成生物学 | 植物 | NA | 医药，食品，动物营养 |
| 89 | 2026-10-30 |
Trace elements and tumors: homeostatic networks, molecular mechanisms and new horizons for precision intervention
2026-Jul-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02754-y
PMID:42934669
|
综述 | 系统阐述铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素在生理和肿瘤条件下的稳态网络、分子机制及精准干预新策略 | 提出肿瘤细胞通过元素成瘾机制劫持微量元素调控网络；系统整合铁死亡和铜死亡等新型细胞死亡方式；将锰定位为cGAS-STING激动剂；提出元素代谢增敏与纳米平台、合成生物学工程化免疫细胞等跨学科干预策略 | 大多数治疗证据来自临床前模型，缺乏临床转化验证；当前认识存在知识空白，需在系统生物学框架下开展假设驱动的深入研究 | 阐明微量元素稳态网络与肿瘤发生发展的关系，总结分子机制，并为肿瘤精准干预提供新方向 | 铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素及其在肿瘤细胞、肿瘤免疫微环境、血管生成和转移中的作用 | 肿瘤生物学, 系统生物学, 精准医学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 90 | 2026-10-30 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
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研究方法 | 本文提供了一套详细的设计与构建合成小调控RNA的方案，用于在细菌中实现高效基因敲低 | 系统总结了合成sRNA设计的关键原则和优化因素，包括支架选择、靶mRNA结合亲和力、靶mRNA二级结构和Hfq表达水平 | 文中未明确提及具体局限性 | 为合成sRNA的设计与构建提供详细方案，以实现细菌中高效基因敲低 | 合成小调控RNA（sRNA） | 合成生物学与代谢工程 | NA | 合成sRNA设计与构建 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成sRNA介导的基因敲低系统 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 91 | 2026-10-30 |
Improving governance in the age of synthetic biology, artificial intelligence, and diverging threats
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1705143
PMID:42088837
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研究论文 | 通过德尔菲法咨询专家，提出应对合成生物学与人工智能等新兴技术带来的生物威胁的混合治理框架 | 提出了一个包含四个迭代组件的混合治理框架，强调提高意识、建立培训与监测系统、制定敏捷治理框架以及加强国际条约的相互依赖与同等重要性 | 基于德尔菲法的专家共识，样本量有限（13位专家），可能无法全面代表所有相关利益方的观点 | 识别生物威胁的优先事项并建立共识驱动的政策建议，以改进合成生物学和人工智能时代的治理 | 合成生物学、人工智能、增材制造、纳米技术等新兴和融合技术相关的生物风险与治理 | 生物安全治理 | NA | 德尔菲法 | NA | 文本 | 13位来自不同相关领域的专家 | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 92 | 2026-10-30 |
Engineering next-generation CAR-NK cells for hematological malignancies: genome editing, synthetic biology, and precision immunotherapy
2026, Frontiers in genome editing
IF:4.9Q1
DOI:10.3389/fgeed.2026.1943068
PMID:42947991
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综述 | 本文综述了通过基因组编辑、合成生物学和人工智能指导工程化改造下一代CAR-NK细胞以治疗血液恶性肿瘤的策略与挑战 | 系统整合基因组编辑、多组学、系统生物学和人工智能指导的工程化策略，提出可编程CAR-NK细胞范式，使其能动态感知、适应并响应肿瘤演化 | CAR-NK细胞体内持久性短、归巢与实体瘤浸润不足、易受肿瘤微环境免疫抑制、肿瘤异质性导致抗原逃逸，以及细胞来源变异、大规模扩增能力有限、功能耗竭和缺乏标准化制造方案；增强持久性还需严格安全控制以降低组成性信号或基因组不稳定性带来的毒性风险 | 探讨克服CAR-NK疗法生物学与转化障碍的工程化策略，推动向自主、可扩展且精准可控的细胞免疫治疗转变 | CAR-NK细胞、自然杀伤细胞、血液恶性肿瘤、肿瘤微环境、肿瘤免疫互作 | 肿瘤免疫治疗、合成生物学、基因组编辑 | 血液恶性肿瘤 | 基因组编辑、多组学、系统生物学、计算建模、人工智能指导工程化 | NA | 高维生物学数据、制造数据 | NA | 基因组编辑 | 自然杀伤细胞、CAR-NK细胞 | 嵌合抗原受体、可编程CAR-NK细胞 | 医学、精准肿瘤学 |
| 93 | 2026-10-29 |
Protein resource allocation across subcellular compartments revealed by large-scale absolute quantitative proteomics in yeast
2026-Nov-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2621208123
PMID:42945261
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研究论文 | 该研究构建了迄今最大的酵母绝对定量蛋白质组数据集，通过大数据分析和机器学习揭示了亚细胞区室间蛋白质资源分配的规律及其与细胞表型的关系 | 构建了覆盖两种酵母、300个绝对定量蛋白质组的大型数据集，首次在系统层面定量解析亚细胞资源分配与生长速率的协变关系，并发现少量蛋白质即可预测资源分配变化 | 研究仅限于两种酵母物种，预测模型的普适性有待在其他真核生物中验证，且未深入探讨资源分配调控的分子机制 | 揭示真核细胞亚细胞区室间蛋白质资源分配的普遍规律及其与细胞生理表型的定量关系 | 酿酒酵母（Crabtree阳性）和另一种Crabtree阴性酵母物种 | 定量蛋白质组学 | NA | 绝对定量蛋白质组学、大数据分析、公式拟合、机器学习 | 机器学习模型 | 定量蛋白质组数据 | 300个绝对定量蛋白质组 | NA | 酵母 | NA | 合成生物学、工业生物技术 |
| 94 | 2026-10-29 |
Molecular Biology and Synthetic Biology-Guided Development of Recognition and Reporting Elements of Biosensor
2026-Oct-28, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_370
PMID:42944860
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书籍章节 | 该章节综述了微生物细胞生物传感器的组成、工作原理，以及利用分子生物学和合成生物学技术改造生物识别元件和报告元件的最新策略与进展。 | 系统整合了分子生物学与合成生物学技术在改造生物传感器识别元件和报告元件方面的最新策略，为微生物细胞生物传感器的研发提供了新见解和有价值的参考。 | 作为综述性章节，未提供原始实验数据，且未对现有技术的局限性进行深入批判性分析。 | 总结微生物细胞生物传感器的组成与工作原理，并介绍近年来利用分子生物学和合成生物学技术修饰生物识别元件和报告元件的各种策略及最新进展。 | 微生物细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 分子生物学技术, 合成生物学技术 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | 生物传感器（生物识别元件与报告元件） | 医学, 环境 |
| 95 | 2026-10-29 |
"Illuminating" the silkworm chassis: Synthetic biology-driven evolution of genetic-based sexing circuits
2026-Oct-27, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70385
PMID:42947535
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综述 | 系统总结了家蚕遗传性别控制回路的构建策略、优化元件、基因组操作工具演进及工业化应用 | 提出了远红光光学标记、基因组安全港靶向整合及人工智能与高通量光电分选硬件集成的工业界面，并引入边界绝缘子、条件表达和自动切除网络等保护性分子策略 | 未提及具体实验验证数据，侧重于概念和策略总结 | 探讨合成生物学驱动的家蚕遗传性别控制回路演化及其在现代蚕业和全球害虫管理中的应用 | 家蚕（Bombyx mori）及其遗传性别控制回路 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9、转座子插入、远红光光学标记、边界绝缘子、条件表达、自动切除网络 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 家蚕 | 遗传性别控制回路、生物传感器（光学报告系统） | 农业、医学（害虫管理） |
| 96 | 2026-10-29 |
Binding pocket optimization of Pueraria mirifica type II chalcone isomerase synergizing with a necrosis-attenuating host transcription factor for persistent daidzein biosynthesis
2026-Oct-22, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2026.111883
PMID:42945726
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研究论文 | 该研究通过改造葛根II型查尔酮异构酶的活性位点并结合宿主来源的MYB60转录因子，在烟草中构建了一个可减轻组织坏死并持续合成大豆苷元的合成生物学平台 | 利用分子动力学模拟与结构导向突变鉴定出I195V变体以增强异甘草素选择性；用本氏烟草内源MYB60转录因子替代拟南芥MYB12以减轻组织坏死；采用P2A核糖体跳跃肽实现多基因级联表达 | I195V在植物体内提升大豆苷元积累的效果在不同实验批次间存在波动；蛋白丰度无显著差异，说明增强机制不完全明确 | 克服非豆科植物底盘重构豆类异黄酮途径时异源酶效率低和宿主组织坏死严重的问题，实现持续的大豆苷元生物合成 | 葛根II型查尔酮异构酶与本氏烟草宿主转录因子 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、结构导向突变、定量蛋白质组学、瞬时表达 | NA | 序列、结构、蛋白质组数据 | NA | P2A核糖体跳跃肽、结构导向突变 | 本氏烟草 | 多顺反子多基因级联途径 | 医药、工业生物技术 |
| 97 | 2026-10-29 |
Synthetic Reconstruction and Characterization of Endogenous Bacteriophage Genomes from Desulfovibrio vulgaris
2026-Oct-19, Viruses
DOI:10.3390/v18101159
PMID:42944078
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研究论文 | 本文提出了一套整合基因组引导的工作流程，用于发现、验证并合成重构硫酸盐还原菌Desulfovibrio vulgaris Hildenborough的内源性前噬菌体基因组 | 首次针对厌氧硫酸盐还原菌的内源性前噬菌体建立了从生物信息学预测、UV诱导验证到合成重构的整合工作流，并成功构建了三个逐步截短的可活性合成前噬菌体基因组 | 合成重构的前噬菌体在实验条件下仅产生局部浑浊表型而非典型裂解噬菌斑，未能实现高效裂解性增殖，且前噬菌体功能性与计算预测的完整性并不完全相关 | 建立针对厌氧硫酸盐还原菌内源性前噬菌体的计算与合成生物学工程框架，为微生物诱导腐蚀控制奠定基础 | Desulfovibrio vulgaris Hildenborough菌株及其内源性前噬菌体 | 合成生物学 | NA | PHASTEST生物信息学分析、UV诱导、全基因组测序、长片段PCR、无缝等温DNA组装、Nanopore测序、电穿孔、定量PCR | NA | 基因组序列、DNA序列、基因表达数据 | 鉴定出7个前噬菌体样区域（其中5个为完整前噬菌体），验证了4个可诱导前噬菌体位点，构建了3个截短合成基因组（约36、33和29 kb） | 长片段PCR、无缝等温DNA组装 | Desulfovibrio vulgaris Hildenborough | 合成重构的前噬菌体基因组（逐步截短版本） | 工业生物技术、环境 |
| 98 | 2026-10-29 |
Protein Self-Assembly as a Design Principle for Enzyme Immobilisation in Biocatalysis
2026-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27209187
PMID:42941956
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综述 | 综述蛋白质自组装作为酶固定化设计原则，涵盖天然结构如细菌微区室及工程系统如病毒样颗粒、ELP和SpyTag/SpyCatcher，并重点讨论催化活性包涵体（CatIBs）作为无载体自固定化平台 | 提出蛋白质自组装作为统一设计原则，在温和条件下实现可编程组装以克服传统固定化策略的权衡；聚焦CatIBs作为简化、无载体、自固定化的平台 | 作为综述未提供原始实验数据；CatIBs等自组装系统在工业规模下的可放大性、过程稳定性与成本效益仍需进一步验证 | 探讨蛋白质自组装作为酶固定化的统一设计原则，以克服传统载体固定化方法的局限性并推动工业生物催化应用 | 酶固定化策略、蛋白质自组装材料、细菌微区室、病毒样颗粒、类弹性蛋白多肽、SpyTag/SpyCatcher系统、催化活性包涵体（CatIBs） | 合成生物学，生物催化，材料科学 | NA | 蛋白质自组装，酶固定化，合成生物学，材料科学 | NA | 文献 | NA | SpyTag/SpyCatcher | NA | 多酶级联反应区室化，可编程酶组织 | 医药，生物燃料，食品，工业生物技术 |
| 99 | 2026-10-29 |
Evolution of (S)-2-Aminobutanol Synthesis from Chemical Resolution to Biomanufacturing
2026-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27209203
PMID:42941973
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综述 | 系统总结手性(S)-2-氨基丁醇从化学拆分到体外多酶级联及全细胞生物合成的发展历程与最新进展 | 系统梳理了从传统化学法、酶动力学拆分到AmDH/ω-TA体外多酶级联及合成生物学全细胞工厂的完整技术演进路线，并提出体外连续流微反应器、全细胞+无细胞杂合体系与AI整合的未来趋势 | 综述性文章，未提供原始实验数据；文中指出45.3 g·L滴度实为上游前体L-2-ABA而非终产物，且中间体2-OBA的胞内毒性等瓶颈仍待解决 | 总结(S)-2-氨基丁醇合成路线的演进，评估各代技术的工业化潜力并展望绿色低碳制造方向 | (S)-2-氨基丁醇（抗结核药乙胺丁醇及左乙拉西坦等抗癫痫药的手性前体）及其合成路线 | 合成生物学, 生物催化 | 结核病, 癫痫 | 化学合成, 手性拆分, 酶动力学拆分, 多酶级联催化, 全细胞发酵, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 基于群体感应的动态调控, 外排泵工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 100 | 2026-10-29 |
AI-Facilitated Discovery of Microbiome-Originated Antimicrobial Peptides: A Perspective on Combating Antibiotic Resistance Within Public Health and Food Safety Frameworks
2026-Oct-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14102360
PMID:42943597
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综述 | 本文综述了人工智能驱动的微生物组来源抗菌肽发现的最新进展，探讨其在公共卫生和食品安全框架下对抗抗生素耐药性的潜力与挑战 | 从One Health和气候敏感框架视角，系统整合微生物组科学、深度学习和合成生物学，提出AI发现的抗菌肽作为下一代抗耐药干预措施 | 未涉及具体实验验证，综述了药代动力学、毒性、制造可扩展性等转化挑战，缺乏原创数据 | 总结AI驱动微生物组来源抗菌肽发现的突破，评估其临床前疗效及转化应用前景 | 微生物组来源的抗菌肽、多重耐药病原体 | 机器学习, 公共卫生, 食品安全 | 感染性疾病 | 人工智能, 机器学习, 宏基因组数据挖掘 | 深度学习 | 宏基因组数据, 肽序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 食品, 环境 |