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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-06-26 |
[Neo-chemical industry: a new perspective for understanding biomanufacturing industry]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260154
PMID:42343785
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评论文章 | 引入‘新化工’视角重新理解生物制造产业,分析其工业化挑战与战略路径 | 将生物制造重新定义为合成生物学驱动的化工产业范式重构,构建了涵盖原料、工艺和技术的三维分析框架 | 基于单一案例(l-丙氨酸厌氧发酵)进行理论推导,缺乏对不同类型生物制造过程的系统验证 | 澄清生物制造产业性质,提供理解其本质和价值的直观框架 | 生物制造产业及其工业化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 1042 | 2026-06-26 |
Engineering growth independent production: programmable control loops for high-titer rhamnolipids for improved green surfactant sustainability
2026-Jun-25, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03375-x
PMID:42347958
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综述 | 综合讨论了鼠李糖脂生物表面活性剂的工程化生产进展,重点关注生长非依赖型生产、高产策略及可持续性 | 将代谢途径优化与生长-生产解耦的动态调控系统相结合,并整合了过程强化技术,为工业部署提供技术经济与生命周期评估框架 | 识别了代谢图谱与规模放大实施之间的关键研究空白,但未提供具体实验验证数据 | 提高鼠李糖脂产量、速率和收益率(TRY),降低下游回收成本,解决生物安全性限制,推动绿色表面活性剂商业化 | 鼠李糖脂生物表面活性剂的生产工艺与工程化策略 | 合成生物学、工业生物技术 | NA | 代谢工程、高通量细胞培养、原位泡沫控制、膜分离 | NA | 文本综述数据 | NA | 代谢途径优化、辅因子再平衡、动态调控系统 | NA | 生长非依赖型生产调控回路(如动态开关、反馈控制系统) | 农业、个人护理、环境修复、医疗保健 |
| 1043 | 2026-06-26 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述了转录因子作为第三代核心传感元件在开发低成本、现场快速检测食品污染物技术中的应用 | 提出了近端诱变策略并整合人工智能辅助分析来优化转录因子及其DNA结合位点 | 仍面临优化和实际应用挑战,具体局限性未详细说明 | 总结转录因子在食品安全监测中的传感应用及其工程化进展 | 转录因子及其用于检测食品中小分子和重金属离子的传感器平台 | 机器学习(与合成生物学交叉) | NA | 转录因子工程, 人工辅助分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物系统 | 生物传感器 | 食品安全 |
| 1044 | 2026-06-26 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-06-23, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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review | 综述了微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解 | 整合了微生物分类学、酶解聚和多组学功能分析,提出了连接微生物特性与塑料降解四个关键阶段的框架,并批判性评估了降解指标的稳健性和可比性 | 现有研究碎片化,降解效率、机制和实际应用报告不一致,聚合物特性、实验条件和评估方法的变异性严重阻碍了跨研究比较和实验室向实际应用的转化 | 梳理微生物降解塑料的最新进展,弥合实验室发现与实际生物降解策略之间的差距 | 塑料降解微生物及相关酶 | NA | NA | 多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成微生物联合体 | 环境 |
| 1045 | 2026-06-26 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-06-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种可扩展的基于RNA的逻辑和多层细胞编程平台RATEX | 通过整合翻译到转录的转换器与合成RNA调控因子,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,能够利用大型翻译调控因子库和核糖体介导的环境输入感知,实现多输入逻辑处理与信号放大 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍然具有挑战性 | 开发可扩展的遗传电路以实现活细胞中的复杂功能 | RNA调控因子和核糖体介导的传感机制 | 合成生物学 | NA | RNA调控 | NA | NA | NA | RATEX平台 | 活细胞 | 逻辑门(6输入OR逻辑门、混合3输入逻辑门、3输入AND门),信号放大级联 | 合成生物学, 生物技术 |
| 1046 | 2026-06-26 |
The Gut Microbiome Dependency Continuum in Drug Discovery: A Unified Pharmacology Framework Linking Clinical Drugs, Natural Products, and Engineered Microbial Therapeutics
2026-Jun-10, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15020043
PMID:42346015
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综述 | 提出肠道微生物组依赖性连续谱框架,整合临床药物、天然产物和工程微生物疗法,揭示微生物组在药理学中的关键作用 | 首次提出四层肠道微生物组依赖性连续谱框架,将微生物组从被动调节剂重新定义为可编程治疗平台,系统整合药物发现中的微生物组依赖性层次 | NA | 构建统一药理学框架,阐述肠道微生物组在药物发现和治疗功能中不同深度依赖性,推动微生物组感知的药物发现和精准工程微生物疗法开发 | 肠道微生物组及其与药物的相互作用(包括粪便微生物移植、微生态制剂、代谢调节药物、天然产物和工程微生物疗法) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 肠道微生物组 | 可编程微生物系统、工程益生菌、微生物组响应药物递送系统、合成微生物群落 | 医学 |
| 1047 | 2026-06-26 |
Advances in UDP-Glycosyltransferases from Medicinal Plants: Discovery, Catalytic Mechanism, Engineering and Biosynthetic Application
2026-Jun-10, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060402
PMID:42346382
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综述 | 系统总结了药用植物UDP-糖基转移酶的最新全球研究进展,涵盖发现、催化机制、工程改造及生物合成应用 | 首次系统整合多组学、人工智能辅助基因挖掘与蛋白质工程优化策略,构建了包括体外多酶级联、微生物细胞工厂和植物悬浮细胞培养的全谱生物制造体系框架 | 工业化放大、监管合规和临床转化是核心挑战 | 为药用植物UDP-糖基转移酶的工程应用提供完整技术框架,支持稀有天然治疗性糖苷的绿色规模化生产 | 药用植物UDP-糖基转移酶 | 机器学习 | NA | 多组学, 人工智能, 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物悬浮细胞 | 体外多酶级联、微生物细胞工厂、植物悬浮细胞培养系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 1048 | 2026-06-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘,在链霉菌细胞工厂中鉴定参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化产量 | 首次利用转录组引导策略在链霉菌中鉴定参与褪黑素合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高褪黑素产量 | 未提及具体局限性 | 实现微生物中褪黑素的高效生物合成 | 工程链霉菌白色亚种菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组测序、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除、基因过表达 | 链霉菌白色亚种 | 褪黑素从头合成途径 | 医药,工业生物技术 |
| 1049 | 2026-06-26 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 总结CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强型CAR和基于合成生物学的异体系统以提高CAR-T疗法的疗效和可及性 | 未明确说明具体局限性,但指出抗原逃逸、T细胞耗竭及在急性髓系白血病和T细胞白血病中疗效有限等问题仍存在 | 总结2015年以来的人类试验成果,重点关注近两年创新,探讨克服耐药性策略及提升安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、合成生物学异体系统 | 医学 |
| 1050 | 2026-06-26 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 研究RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制,揭示其模拟DNA操纵子位点识别,并指导新型适配体设计 | 首次解析SELEX衍生适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构,发现RNA适配体与蛋白的相互作用高度模仿DNA-蛋白识别模式,并基于结构信息设计出靶向同源蛋白NagR的新型适配体 | 未明确提及在更广泛的阻遏蛋白家族中的适用性验证,适配体设计策略的普适性有待进一步探索 | 阐释RNA适配体与细菌阻遏蛋白的分子识别机制,推动合成生物学中新型适配体-蛋白互作对的设计 | RNA适配体Dap1及其突变体Dap1m1、GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR和NagR | 合成生物学 | NA | 晶体结构解析、SELEX、定点突变 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | SELEX | 细菌(未明确具体菌种) | 基因表达调控回路(基于适配体诱导的阻遏蛋白去抑制) | 合成生物学、生物技术 |
| 1051 | 2026-06-26 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 探讨噬菌体作为抗生素替代疗法在应对抗菌素耐药性中的应用 | 结合基因组学、合成生物学和靶向医学进展,系统阐述噬菌体治疗的多机制作用(如裂解酶)和基因工程新技术(如CRISPR-Cas、噬菌体重组工程和合成基因组重启) | 未详细讨论噬菌体治疗在临床推广中面临的具体监管障碍和规模化生产挑战 | 综述噬菌体生物学、多样性及其在治疗多重耐药菌感染中的应用潜力 | 噬菌体(特别是感染和破坏细菌的病毒) | 机器学习 | 抗菌素耐药性相关感染 | CRISPR-Cas, 噬菌体重组工程, 合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 食品, 工业生物技术 |
| 1052 | 2026-06-26 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在多种医学、食品和环境领域的最新进展,重点关注人类疾病和生物医学科学中的应用 | 重点介绍了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成果,以及进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程当前面临的挑战和伦理考虑 | 综述蛋白质工程在人类疾病治疗,特别是癌症治疗中的转化潜力 | 蛋白质工程及其在疾病治疗中的应用 | 机器学习和合成生物学 | 人类疾病,特别是癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas系统、高通量数据 | NA | 高通量数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学、食品、环境 |
| 1053 | 2026-06-26 |
Microbial Ecology at the Nexus of Food Safety and Biotechnology With Ecological Mechanisms, Risks, and Emerging Innovations
2026, International journal of food science
IF:2.7Q3
DOI:10.1155/ijfo/6618960
PMID:42344006
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综述 | 综述了微生物生态学在食品安全与生物技术交叉领域的作用、生态机制、风险及新兴创新 | 将微生物生态学作为整合框架,系统连接食品安全和生物技术,并强调生态机制在两者中的应用 | 由于微生物复杂性、数据整合限制和安全考虑,将生态见解转化为可靠的工业和监管实践仍面临挑战 | 综合当前关于微生物生态学在食品安全与食品生物技术交叉领域的文献,并识别关键研究空白和未来方向 | 食品安全和食品生物技术中的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序, 全基因组测序, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 生物技术 |
| 1054 | 2026-06-25 |
Synthetic biology of oncolytic bacteria: Comparative microbial chassis and precise killing strategies
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102292
PMID:42339179
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综述 | 综述利用合成生物学工程改造溶瘤细菌的最新进展,包括不同微生物底盘及精确杀灭策略 | 系统比较了多种微生物底盘(沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、梭菌、双歧杆菌、酵母等)在癌症治疗中的应用,并总结了CRISPR/Cas9基因编辑、遗传逻辑电路和自杀开关等合成生物学技术增强安全性和特异性的方法 | NA | 为开发具有精确靶向能力和增强治疗稳定性的溶瘤细菌提供合成生物学视角 | 溶瘤细菌及其微生物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 沙门氏菌, 李斯特菌, 大肠杆菌, 梭菌, 双歧杆菌, 酵母 | 遗传逻辑电路, 自杀开关 | 医学 |
| 1055 | 2026-06-25 |
Haplotype-resolved T2T genome and population resequencing provide insights into the domestication and mogroside biosynthesis of Siraitia grosvenorii (Cucurbitaceae)
2026-Jul, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag103
PMID:42338566
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研究论文 | 通过单倍型解析的T2T基因组和群体重测序,揭示了罗汉果的驯化历史及其罗汉果甜苷生物合成机制 | 首次构建了罗汉果单倍型解析的端粒到端粒无缺口基因组,并结合群体基因组分析阐明了驯化瓶颈和选择性清除对基因组结构的影响 | 未明确提及,但可能受限于样本量(173个重测序基因组)和功能验证实验的缺失 | 解析罗汉果的驯化过程及罗汉果甜苷V的生物合成机制,为分子育种和合成生物学提供基因组基础 | 罗汉果(Siraitia grosvenorii)及其基因组、群体和转录组数据 | 基因组学 | NA | T2T基因组组装、群体重测序、比较基因组学、转录组分析 | NA | 基因组序列、重测序数据、转录组数据 | 单倍型基因组(2个单倍型)及173个重测序基因组 | NA | NA | NA | 农业、食品 |
| 1056 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 1057 | 2026-06-25 |
Expanding the genetic toolset: using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jan-08, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
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研究论文 | 本论文展示了联合使用顺式抑制子(CR)与丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE)技术,将核糖调控元件整合到工业相关微生物底盘中的方法。 | 创新点在于实现了两种合成生物学工具(顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程)的联合应用,成功将核糖调控元件高效整合到多种工业微生物中,并验证了其在不同遗传背景下的高度可移植性。 | 限制因素可能包括对更多微生物宿主的适用性需进一步验证,以及顺式抑制子调控效果的绝对范围可能受限于特定宿主基因表达环境。 | 旨在扩展生物制造中工业微生物的基因操作工具集,实现多种宿主简便的基因组操作和精确基因表达调控。 | 工业相关微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌和富养罗尔斯通氏菌。 | 合成生物学 | NA | 顺式抑制子、丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | NA | 荧光报告基因表达数据 | 三种微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌,每种宿主整合多种顺式抑制子,但未明确样本数量 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | 恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌 | 顺式抑制子(CR)核糖调控元件整合至染色体 | 工业生物技术、生物制造 |
| 1058 | 2026-06-24 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
|
综述 | 系统总结了12种代表性天然甜味剂的代谢途径和微生物合成方法 | 通过代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂,为天然甜味剂的高效可持续生产提供了创新途径,并系统分析了不同合成方案的优缺点和核心技术瓶颈 | 仅总结了当前生产过程中的核心技术瓶颈,并未深入探讨大规模工业化的具体挑战 | 为天然甜味剂的工业化优化和生产提供理论支持和技术参考 | 12种代表性天然甜味剂(包括甜蛋白、萜类苷、黄酮类、多元醇和单糖) | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物(微生物细胞工厂) | 代谢途径 | 食品, 医药 |
| 1059 | 2026-06-24 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
|
综述 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用,重点关注生物屏障和递送系统的进展 | 系统总结了基于纳米颗粒、外泌体和细胞载体的递送平台如何克服脑肿瘤免疫治疗中细胞因子面临的生物屏障、半衰期短和毒性等挑战 | 缺乏具体的临床试验数据支持,多数讨论仍基于体外和动物模型结果,临床转化前景尚不明确 | 研究常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力和递送策略 | 常见γ链细胞因子(如IL-2、IL-7、IL-15等)以及脑肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1060 | 2026-06-24 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
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综述 | 本文全面综述了人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测和环境监测 | 首次系统整合了AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍和监管考量,并强调了合成生物学、CRISPR传感和边缘计算等新兴方向 | 领域仍分散,缺乏统一的理论框架,且临床转化和监管方面存在挑战 | 全面分析和总结AI-微生物混合生物传感器在实时病原体检测和自适应生物监测中的应用现状与未来方向 | AI-微生物混合生物传感器的设计原理、集成方法、性能指标及关键挑战 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 人工智能, 机器学习, 深度神经网络 | CNN, 集成模型 | 电化学阻抗数据, 拉曼光谱数据, 高光谱显微图像 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 微生物 | 生物传感器 | 医学, 环境 |