合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1386 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
|
综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术，探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制，并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物（包括古菌、细菌和真核生物）及其酶（极端酶） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑，基因组尺度代谢模型，比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术，环境 |
| 1082 | 2026-03-18 |
A protein-fragment complementation assay to quantify synthetic protein scaffold efficiency
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag003
PMID:41836103
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于二氢叶酸还原酶蛋白质片段互补分析（DHFR PCA）的方法，用于量化合成蛋白质支架在酵母中的效率 | 首次将DHFR PCA应用于酵母中蛋白质支架效率的定量研究，并识别了影响支架效率的关键因素，如PBD-肽相互作用强度和结合可用性 | 研究主要聚焦于酵母模型，可能不直接适用于其他生物系统，且支架表征依赖于生长速率耦合，可能受其他因素影响 | 探索和量化合成蛋白质支架在酵母中的效率，以优化支架设计工具 | 肽结合域（PBD）和肽的相互作用、支架架构和表达水平 | 合成生物学 | NA | 蛋白质片段互补分析（DHFR PCA） | NA | 生长速率数据 | NA | 蛋白质支架设计 | 酵母 | 蛋白质支架，用于诱导酶的空间接近性 | 工业生物技术 |
| 1083 | 2026-03-17 |
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31050845
PMID:41828832
|
研究论文 | 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性，以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 | 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性，并识别出多个稳定且可溶的候选碱基，为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 | 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估，未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 | 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基，以支持DNA类似聚合物的设计 | 14种商业可得的替代核碱基 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱（H和C NMR） | NA | 光谱数据 | 14种化合物，在98%和81%浓硫酸中孵育3周 | NA | NA | NA | 天体生物学、行星科学、合成生物学 |
| 1084 | 2026-03-17 |
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15050843
PMID:41829116
|
研究论文 | 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶，以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 | 构建了突变酶142P-242K，将果寡糖转化效率从29%提升至52%，并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 | 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) | 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 | 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 | 合成生物学 | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 制药 |
| 1085 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
|
综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用，并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识，并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 1086 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
|
综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具（如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学）来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识，促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序（NGS）、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 1087 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
|
综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力，并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性，提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌，可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响，并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 1088 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
|
综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）的致癌机制，并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物（如病毒microRNAs）与下一代治疗策略（包括基因编辑和合成生物学方法），强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制，且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗，临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制，并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）及其相关的癌症，如卡波西肉瘤（KS）、原发性渗出性淋巴瘤（PEL）和多中心性Castleman病（MCD） | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 1089 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
|
综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物，影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架，将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来，并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物（如植物化学物质、多糖、复方草药）、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1090 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略，用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化，系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题，并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统，未在真核宿主中验证；酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量，以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶（CtSS）及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶（CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS） | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 1091 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台，通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序，实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台，将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合，实现了可编程的翻译调控，突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平，未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具，用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 1092 | 2026-03-14 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
|
综述 | 本文是一篇叙述性综述，探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 | 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”，用于靶向调控肠道-心脏轴，并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 | 存在显著的转化障碍，包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力，探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢）及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索（PubMed, Scopus, Web of Science），叙述性综合分析 | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 1093 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
|
综述 | 本文提出并定义了跨界肽（TKPs）的概念，总结了其在植物与微生物相互作用中的功能，并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽（TKPs）作为跨物种生物活性肽的新概念，整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 1094 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
|
综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测，以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1095 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
|
综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战，重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术，提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据，对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观，缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 1096 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，概述了现有策略及其局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌（E. coli）、酿酒酵母（S. cerevisiae）、枯草芽孢杆菌（B. subtilis）、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 1097 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
|
综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架，用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能，并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架，该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能，并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述，未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架，提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习， 多组学， 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1098 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 1099 | 2026-03-11 |
PrimeRoot: a cutting-edge technology designed to achieve precise and targeted large DNA insertion in plants
2026-Apr, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04723-0
PMID:41804348
|
综述 | 本文综述了PrimeRoot技术，一种用于在植物中实现精确、靶向大DNA插入的尖端技术 | PrimeRoot编辑器通过整合增强的PegRNA设计、改进的植物prime editor系统和先进重组酶，实现了高达11.1 kb DNA片段的精确插入，第三代编辑器进一步提高了不同基因递送系统下的转化精度和效率 | NA | 开发并推广PrimeRoot技术，以支持合成生物学和植物育种中大型DNA插入的染色体整合需求 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | PrimeRoot技术，包括CRISPR、prime editing guide RNA (PegRNA)设计和重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR, PrimeRoot editors | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 1100 | 2026-03-11 |
CRISPR/dCas9-Mediated BRL3 Activation Enhances Growth and Metabolic Resilience Under Osmotic Stress in Nicotiana tabacum
2026 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70816
PMID:41804827
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR/dCas9转录激活系统上调烟草中的BR受体NtBRL3，并评估其对渗透胁迫耐受性的影响 | 首次在烟草中利用CRISPR/dCas9系统激活BRL3受体，并发现其能通过协调生物量恢复、氧化应激缓解、渗透调节物稳态和组织重塑来增强渗透胁迫耐受性 | 研究采用瞬时转化系统，未进行稳定遗传转化；功能验证主要在烟草中进行，在其他作物中的普适性有待验证 | 探究BR受体BRL3在渗透胁迫下的功能，并开发增强作物胁迫耐受性的合成生物学方法 | 烟草（Nicotiana tabacum）及其BR受体NtBRL3 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9转录激活系统（CRISPRa）、Loop Assembly、RT-qPCR、组织学分割 | NA | 基因表达数据、生物量数据、生化指标数据、组织学图像 | 烟草叶片（通过农杆菌介导的瞬时转化） | CRISPR-Cas9, Loop Assembly | 烟草（Nicotiana tabacum） | 由组成型（CaMV35S）或ABA诱导型（SlAREB）启动子驱动的dCas9-6TAL-VP128模块，与靶向NtBRL3启动子的双sgRNA配对 | 农业 |