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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
|
综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就,弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述,突出其优势和应用前景,并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 1122 | 2026-05-12 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 综述麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 总结了麦角硫因生物合成和分解代谢途径中关键酶的发现与鉴定进展,以及代谢工程策略的最新成果,并介绍了化学酶促级联合成路径实现最高产量 | 未明确提及研究限制,但可能包括异源生产中的代谢负担和产量优化挑战 | 探讨麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 麦角硫因及其关键酶 | 机器学 | NA | 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 化妆品, 医药 |
| 1123 | 2026-05-12 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK 4软件套件,用于核酸结构、装置和系统的分析与设计 | NUPACK 4在物理模型、计算速度、可扩展性、材料混合和序列约束方面实现了全面升级 | NA | 为核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域提供计算工具 | 核酸结构和装置 | 分子编程 | NA | NUPACK算法,核酸设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应通路,结构工程(含假结) | 合成生物学,纳米技术 |
| 1124 | 2026-05-12 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-04-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
|
综述 | 本文综述了植物-微生物共进化在约4.5亿年间的历程,并提出了一个基于共进化原理的工程框架,用于可持续农业发展 | 该文创新性地构建了一个基于深层时间、三支柱框架(细胞器发生、根系进化和免疫门控)的植物-微生物共进化整合框架,并提出了从共进化原则转化为功能蓝图的预测性、进化知情的策略 | NA | 将植物-微生物共进化原理转化为可持续农业的工程策略,以改善作物性能 | 植物-微生物互作关系及其共进化机制 | 机器学习,合成生物学,基因组编辑 | NA | 基因组编辑,合成生物学,AI,微生物组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,基因组编辑工具 | 植物,微生物 | 合成微生物群落,免疫受体工程,代谢开关 | 农业,可持续农业 |
| 1125 | 2026-05-12 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-03-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、分类、生物合成途径及催化机制,并探讨了代谢工程和微生物生产策略的研究进展与未来展望 | 系统总结了开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征,并强调了新兴的代谢工程和合成生物学方法在该领域的应用 | 未提及具体实验验证或定量分析结果,对开链黄酮类化合物的药理活性及应用潜力仅作简要提及 | 总结开链黄酮类化合物的生物合成研究进展,并展望其未来在代谢工程和生物技术中的应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径中的酶与调控元件 | NA | NA | 代谢组学、结构酶学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发、生物技术 |
| 1126 | 2026-05-12 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-01-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
|
综述 | 总结了CRISPR-Cas工具箱及其在非模式微生物工程中的应用,重点讨论生物制造和生物治疗领域的创新 | 强调了CRISPR系统对传统难以改造的非模式微生物(如C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌)的适应性,并提出了基因组编辑、合成生物学和系统方法整合的新方向 | 讨论了当前限制,如非模式微生物中CRISPR工具效率不足、宿主依赖性问题及未来改进机会 | 综述CRISPR在非模式微生物工程中的应用,推动可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗的发展 | 非模式微生物,包括C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌 | 微生物工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,CRISPR-Cas12,CRISPR-Cas13,CRISPRi,CRISPRa | C1-气体固定醋杆菌,抗生素链霉菌,肠道共生菌 | 代谢途径工程,天然产物合成回路,活体生物治疗回路 | 生物制造,天然产物发现,生物治疗 |
| 1127 | 2026-05-12 |
Living materials for gas therapy
2026-01, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
|
综述 | 综述了基于活体材料的气体疗法在肿瘤、炎症和组织再生中的最新进展 | 提出了利用活体材料的生物活性(如疾病趋向性、免疫调节和动态响应性)实现智能气体生成和控释的创新范式 | 活体材料的生物安全性和规模化生产是主要挑战 | 系统总结基于活体材料的气体疗法进展,强调工程化设计原理与治疗效果 | 基于生物实体(如细菌、细胞、藻类)及其仿生衍生物构建的活体材料 | 生物医学工程 | 癌症、炎症性疾病、组织再生 | 基因编程、混合架构设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌、细胞、藻类 | 基因回路用于自主气体生产,刺激响应释放架构 | 医学 |
| 1128 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
|
研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程,为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证,仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞,涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块(formin介导的细胞骨架重排途径) | 农业, 合成生物学 |
| 1129 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
|
研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体,实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性,能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径,而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能,且研究仅在单一种植物(番茄)中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 1130 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法,探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性,发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白,还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性,并发现其修饰范围远超MAPK家族,包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色,需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞(被感染细胞) | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 1131 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1132 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
|
研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网,而3HSD和P5R2定位在细胞质,并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶(CYP11A1)的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达,未在毛地黄原生细胞中验证;仅覆盖三种已知酶,途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织,为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶(P450、3HSD、P5R2) | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 1133 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
|
研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂,用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料,整合了生物感应、报告和依克多因生产功能,并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌,用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料(膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统) | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |
| 1134 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
|
研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性,用于工程化气候智能、高产量作物,超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 1135 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体(宿主及其微生物群组成的复杂群落)中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域,整合全生物研究与合成生物学,并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用,推动生物技术新前沿 | 全生物体(宿主与微生物群)及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |
| 1136 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
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综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染,以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复,超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 1137 | 2026-05-09 |
BPP Bioportide™-mediated (genetic) transformation in cyanobacteria: a rapid and simplified approach for efficient molecular translocation and genome modification
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1812316
PMID:42100039
|
研究论文 | 本文系统评估了一种基于蛋白质的DNA递送系统BPP Bioportide™在多种蓝藻菌株中的转化效率,并优化了关键因素 | 首次将BPP Bioportide™蛋白递送系统应用于蓝藻基因工程,实现低DNA输入量(10 ng)下的高效转化,并成功改造了非模式菌株 | DNA摄取窗口较窄,且转化效率受DNA类型、宿主倍性和筛选条件等多因素影响 | 开发一种快速、简化且广谱的蓝藻遗传转化方法 | 蓝藻菌株包括集胞藻PCC 6803、聚球藻PCC 7942和蓝丝藻UTEX 3153 | 合成生物学 | NA | BPP Bioportide™介导的DNA递送、同源重组、菌落PCR | NA | NA | 三种蓝藻菌株 | BPP Bioportide™蛋白递送系统 | 集胞藻PCC 6803, 聚球藻PCC 7942, 蓝丝藻UTEX 3153 | NA | 工业生物技术, 碳中和生物技术 |
| 1138 | 2026-05-09 |
Plant microbiome engineering: from inoculation to genome editing
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1781381
PMID:42100688
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综述 | 整合分子遗传学、微生物生态学和系统级微生物组设计,将植物及其微生物组视为可工程化的全生物,并探讨从接种到基因组编辑的微生物组工程策略 | 首次在一个统一的概念框架内整合CRISPR介导的植物-微生物工程、微生物组的生态稳定性以及气候适应性农业应用,并提出AI辅助决策框架和全生物工程化视角 | 生态稳定性、性状权衡、生物安全和监管挑战限制了大规模部署 | 提出一个从经验性接种向预测性、可持续和社会责任性农业生物技术转变的整合框架 | 植物相关微生物组及其与植物的相互作用 | 机器学习, 数字农业 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, RNA干扰, 合成微生物群落设计, 多组学分析, 机器学习和生态建模 | 机器学习模型, 生态模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, RNA干扰 | 植物, 微生物 | NA | 农业 |
| 1139 | 2026-05-08 |
A bacterial-derived quorum-sensing platform enables dynamic metabolic control in yeast
2026-May-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.007
PMID:42091429
|
研究论文 | 在酿酒酵母中建立基于细菌的群体感应平台,实现对代谢途径的动态调控 | 通过改造非经典的RpaI/RpaR系统,克服了细菌群体感应在真核生物中功能化的代谢障碍,构建了低泄漏、高灵敏度、宽动态范围的工程回路,并结合CRISPR干扰模块实现了自主转录激活和抑制的双功能级联系统 | 未明确说明局限性 | 在真核微生物中建立功能性细菌群体感应系统,用于动态代谢调控以优化微生物生产 | 酿酒酵母中的代谢途径和生产菌株 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 群体感应回路、双功能级联系统(包含信号放大和CRISPR干扰模块) | 工业生物技术 |
| 1140 | 2026-05-08 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
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研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的新策略,将促消退脂质介质装载到细胞外囊泡中,以减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法选择性装载促消退脂质介质(如resolvin D和E系列)到细胞外囊泡中,通过共表达三种生物合成酶(COX-2、5-LOX、15-LOX)实现 | 未明确提及,但可能存在规模化生产及体内递送效率的挑战 | 开发一种可扩展的装载促消退脂质介质的细胞外囊泡平台,用于治疗急性肺损伤等炎症性疾病 | 人胚胎肾293T细胞、THP-1来源的巨噬细胞、脂多糖处理的小鼠 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体、细胞外囊泡装载技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 多基因表达载体 | 人胚胎肾293T细胞 | 共表达环氧化酶2、5-脂氧合酶和15-脂氧合酶的代谢通路,用于合成resolvin系列脂质介质 | 医学 |