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当前共找到 1812 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性，并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节，仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 1122 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，显著提升其催化活性，并构建了最小功能化突变体s149FvPolX，拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化，缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶，克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 1123 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展，为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 1124 | 2026-06-15 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
|
综述 | 系统综述沙棘作为未来食品的生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合合成生物学（CRISPR/Cas9代谢工程与精密发酵）、纳米递送技术和个性化营养策略，构建沙棘从传统药用到未来智能食品的转化框架 | 未涉及具体实验验证数据，缺乏不同递送系统效率的定量比较，未讨论沙棘全产业链的技术经济可行性 | 探索沙棘生物活性成分的应用潜力，提出合成生物与食品工程相结合的产业化路径 | 沙棘中的黄酮类、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖等生物活性成分 | 合成生物学, 食品工程 | NA | CRISPR/Cas9介导代谢工程, 精密发酵, 纳米封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（用于精密发酵的工程菌株） | 代谢工程通路优化、营养递送系统（封装、黏膜黏附平台） | 食品, 医药 |
| 1125 | 2026-06-15 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 该论文系统综述了通过仿生构建策略生产三磷酸腺苷的人工细胞的三种方法及其在生物医学和能源领域的应用 | 创新性地系统整合了三种构建能量自给人工细胞的策略，包括基于质子泵和ATP酶的组装、直接封装细胞器以及非经典系统，并探讨了其催化效率和生物分子封装能力 | 未明确提及当前构建策略在稳定性、可扩展性和成本效益方面的具体挑战 | 探索人工细胞中三磷酸腺苷合成的三种构建策略的最新进展，并推动从基础研究向实际应用的转化 | 人工细胞中的三磷酸腺苷合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成途径模拟 | 医学, 环境, 材料 |
| 1126 | 2026-06-15 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法，用于实现植物合成生物学常见实验操作的自动化 | 通过表格化输入无需编程经验即可操作，降低了自动化门槛，并提供了从简单到复杂操作的端到端分子克隆流程 | 依赖于Opentrons OT-2机器人平台，且验证方案可能仍需针对特定实验条件进行微调 | 提高植物合成生物学实验中自动化技术的可及性和易用性 | 植物分子生物学和合成生物学相关的实验流程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1127 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
|
研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM，用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束，使模型仅从同义选项中预测掩码密码子，从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义，捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型，推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1128 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
|
研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型，用于设计原核生物顺式调控元件（CREs），无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs，从17000个原核生物基因组预训练，零样本预测启动子强度相关性显著提升（平均Spearman相关从0.27提高到0.50），参数减少10^3倍，并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台，用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件（CREs） | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |
| 1129 | 2026-06-15 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
|
综述 | 系统综述精准发酵技术用于生产新型食品及其可持续应用的研究进展 | 首次在统一框架内整合微生物菌株设计、生物过程工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度，填补了以往产品导向或生物体导向综述的空白 | 存在高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度低及监管不确定性等挑战 | 系统分析精准发酵在可持续食品生产中的进展与挑战 | 精准发酵生产新型食品的相关研究和案例 | NA | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | 37项研究纳入综述 | 代谢途径工程 | 微生物 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 1130 | 2026-06-15 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-01-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
|
综述 | 综述机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展 | 系统总结了基于机器学习的全局和局部模型在酶动力学参数预测中的应用，并提出了利用高通量数据生成和半监督学习来克服数据稀缺问题的新机遇 | 数据稀缺仍然是这些模型的主要限制 | 为利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围提供路线图 | 酶动力学参数（kcat、Km、kcat/Km等） | 机器学习 | NA | NA | 机器学习模型（全局模型和局部模型） | 酶序列和动力学参数数据 | NA | NA | NA | NA | 酶工程、代谢建模、合成生物学 |
| 1131 | 2026-06-14 |
Tailoring polyhydroxybutyrate by molecular weight regulation: Green synthesis, food-grade performance and innovative ketogenic applications
2026-Sep-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119525
PMID:42270240
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review | 本文系统综述了通过分子量调控定制聚羟基丁酸酯（PHB）的技术，包括绿色合成、食品安全性能及创新生酮应用 | 创新点在于系统比较了生物合成调控、化学/酶修饰调控和AI辅助合成生物学修饰三种核心技术，并建立了从技术比较到应用瓶颈、解决方案及未来趋势的综合逻辑框架 | 文中未提及具体实验数据验证，缺乏定量分析或案例研究支持，且对AI辅助方法的实际应用效果探讨有限 | 探讨PHB分子量精确调控技术在食品工业中的高价值应用，推动标准化和规模化应用，促进绿色可持续发展 | 聚羟基丁酸酯（PHB）及其与聚乳酸（PLA）、聚丁二酸丁二醇酯（PBS）等主流生物降解材料的比较 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 遗传开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 食品, 工业生物技术, 环境 |
| 1132 | 2026-06-14 |
Exploiting conformational changes in a caffeine aptamer to engineer synthetic RNA devices
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag584
PMID:42273912
|
研究论文 | 通过选择咖啡因结合适体并工程改造为合成RNA装置，克服了传统筛选方法在构象转换适体上的局限性 | 采用RNA Capture-SELEX和体内筛选选择了咖啡因结合适体，并通过新型光流控筛选和直接嫁接方法，实现了该适体在核糖开关、核酶和荧光适体传感器中的模块化整合 | 在哺乳动物细胞中，核酶筛选仍面临通量和序列-功能挑战 | 拓展构象转换适体的可用性，推动RNA装置在合成生物学中的应用 | 咖啡因结合适体及其在RNA装置中的模块化整合 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 体内筛选, 光流控筛选 | NA | RNA序列 | 多个咖啡因结合适体候选分子 | NA | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞 | 核糖开关, 核酶, 荧光iSpinach适体传感器 | 合成生物学, 分子传感, 细胞调控 |
| 1133 | 2026-06-14 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
|
研究论文 | 开发了一个结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型的深度学习框架，用于提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心回避密码子优化策略，通过深度学习引导的反向翻译显著提升异源蛋白的可溶性表达 | NA | 设计DNA序列以保证高可溶性表达，并理解DNA序列与蛋白质表达之间的关系 | α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶两种工业酶 | 机器学习 | NA | 深度学习、基因表达预测 | SCG模型、GELP模型 | 基因组数据、基因表达数据 | 两种酶各进行多次实验（αGP 3次，IA 4次） | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1134 | 2026-06-14 |
The Promise of Synthetic Biology for Redesigning Plant Architecture
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114876
PMID:42278408
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综述 | 探讨利用合成生物学重新设计植物结构以实现作物改良的潜力 | 整合自然多样性、发育生物学和合成调控工程，提出理性重新设计植物结构的框架，强调合成生物学与育种及建模框架的整合 | NA | 探索通过合成生物学重塑植物结构以增强作物适应气候变化的能力 | 植物结构及相关发育过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based regulatory systems, synthetic gene circuits, orthogonal signalling pathways, plant artificial chromosomes | NA | NA | NA | CRISPR, 人工染色体 | 植物（作物） | 可编程转录因子、合成基因电路、正交信号通路 | 农业 |
| 1135 | 2026-06-13 |
Engineering of β-glucosidase for rare ginsenoside biosynthesis via distal conformational fine-tuning and sequential degradation control
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134967
PMID:42184941
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研究论文 | 通过计算重设计β-葡萄糖苷酶实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造 | 发现远端突变通过长程别构效应重塑活性位点，将底物结合转变为精确的“分子镊子”模式，并揭示顺序降解机制控制区域选择性 | 未提及临床或体内验证，且仅针对单一突变体组合进行详细分析 | 实现稀有人参皂苷F的高效生物合成并建立通用酶工程框架 | β-葡萄糖苷酶BglPp及其突变体 | 合成生物学 | NA | 计算重设计、定点突变、生物催化、发酵工程 | NA | 蛋白质序列、突变体活性和结构数据 | 5升生物反应器中的一个工程菌株 | NA | 大肠杆菌（推测） | 稀有人参皂苷F的生物合成途径（通过β-葡萄糖苷酶降解人参皂苷Rb1） | 工业生物技术、医药 |
| 1136 | 2026-06-04 |
Heterologous expression of anaerobic reductive dehalogenases: host nanoarchitectonics and synthetic biology optimization
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135019
PMID:42217801
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综述 | 综述了异源表达厌氧还原脱卤酶的研究进展，提出了宿主纳米结构与合成生物学优化策略 | 提出了宿主-酶-环境评估框架，强调辅因子供应、应激耐受性和环境适应性在异源表达中的关键作用 | 当前异源表达面临外源钴胺素依赖性和氧化折叠路径等挑战，且新宿主系统尚未充分开发 | 克服有机卤化物呼吸细菌在生物修复应用中的生长缓慢、氧敏感性和底物特异性限制 | 还原脱卤酶及其在异源宿主（如大肠杆菌和巨大芽孢杆菌）中的表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、钴胺素补救系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、巨大芽孢杆菌 | NA | 环境修复、工业生物技术 |
| 1137 | 2026-06-13 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Aug, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
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综述 | 本文综述了人工智能和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送系统中的应用 | 首次系统探讨AI和合成生物学协同设计下一代活体药物递送系统，重点揭示序列到功能和组成到功能的设计原理 | 未提供具体实验数据验证所讨论技术的有效性，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 探讨人工智能和合成生物学在工程化活体药物递送系统中的机遇 | 人类细胞和细菌作为活体药物递送载体 | 合成生物学，人工智能 | NA | 合成生物学，人工智能模型 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞，细菌 | 合成受体，信号处理网络，基因回路 | 医学 |
| 1138 | 2026-06-13 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
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综述 | 系统评估微生物细胞工厂用于琥珀酸生物制造的挑战与前景 | 整合系统生物学、代谢建模和过程工程的多学科视角，提出提升碳通量优化、氧化还原平衡和工业规模的战略性框架 | 未提供具体实验数据，可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 | 为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸商业化提供战略框架 | 微生物平台（包括细菌和酵母） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1139 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进，以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用，并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制，并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 1140 | 2026-06-13 |
Small but Mighty: The Surprising Metabolic Range of a Bacterial Microcompartment
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730297
PMID:42282558
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中异源表达丙二醇利用操纵子，研究细菌微区室的代谢多功能性，并展示其在底物利用和生物技术中的应用潜力 | 首次证实异源表达的Pdu细菌微区室具有底物杂泛性，可处理C2至C5的二醇和三醇，并通过酶工程将底物范围扩展至1,2-戊二醇，为塑料回收和高价值化合物合成提供新途径 | 氧气抑制1,2-丙二醇利用，虽在微氧条件下缓解，但可能限制某些需氧应用；目前主要在模式菌株大肠杆菌中验证，其他宿主适用性未评估 | 研究细菌微区室的代谢多功能性及其在合成生物学中的调控潜力 | 大肠杆菌中异源表达的Pdu细菌微区室 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 分子动力学模拟，染色体整合，同源重组，诱变 | NA | 代谢数据，分子动力学模拟数据 | 单个大肠杆菌工程菌株及多种底物测试 | CRISPR-Cas9，同源重组 | 大肠杆菌 | Pdu细菌微区室代谢模块 | 工业生物技术，塑料回收 |