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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-07-29 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
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research paper | 使用工程化细菌表达CXCL13以增强膀胱癌免疫治疗在小鼠模型中的效果 | 首次利用工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917表达CXCL13,通过触发生发中心反应来增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断联合改善膀胱癌治疗效果 | 研究仅基于原位小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨工程化细菌是否能够通过增强体液免疫来提升免疫检查点阻断疗法的抗癌效果 | 原位膀胱癌小鼠模型 | machine learning | bladder cancer | NA | NA | NA | 使用多个原位膀胱癌小鼠模型,具体样本数量未说明 | CRISPR-Cas9 | E. coli Nissle 1917 | 表达人CXCL13的合成基因回路 | medicine |
| 102 | 2026-07-29 |
Multi-level precise regulation of gene transcription in the yeast Saccharomyces cerevisiae based on light-sensitive CRISPR/Cas systems
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag719
PMID:42507484
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研究论文 | 本研究基于光敏CRISPR/Cas系统在酿酒酵母中实现多层次的基因转录精准调控 | 整合翻译和翻译后水平的光遗传调控模式,实现dCas9蛋白的多层次精密调控,从而灵活调节目标基因转录水平 | 调控敏感度仍有待提高,且主要基于荧光蛋白验证,实际应用效果有待进一步评估 | 构建基于光敏CRISPR/Cas系统的多层次基因转录调控方法,提升调控灵活性和灵敏度 | 酿酒酵母中的基因转录及dCas9蛋白调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统,光遗传学 | NA | 荧光强度数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 光遗传调控的CRISPR基因转录回路 | 合成生物学, 基因调控网络研究 |
| 103 | 2026-07-29 |
Programmable Nucleic Acid Sensing in Human Cells Using Circularizable ssDNA
2026-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73990-5
PMID:42248894
|
研究论文 | 开发了一种名为SONAR的平台,利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中检测目标核酸序列并触发可控基因表达 | 首次利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中实现程序化核酸感知,并通过细胞连接酶依赖的环化驱动基因表达 | 未提及明显的局限性 | 开发能够在活细胞中感知核酸信号并触发细胞功能的可编程技术 | 人类细胞中的DNA和RNA序列 | 合成生物学 | NA | 可环化单链DNA传感器、反义寡核苷酸、逆转录 | NA | 核酸序列 | NA | NA | 人类细胞 | 核酸传感器电路,通过可环化单链DNA与互补核酸杂交后经细胞连接酶环化驱动基因表达 | 医学, 诊断, 治疗, 合成生物学 |
| 104 | 2026-07-29 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌的理论发展,探讨其分子基础、工程策略、生物安全及生态影响 | 系统总结了镜像生物学体系在分子倒置手性下的构建前景,强调了手性层次结构与立体化学约束,并分析了从理论到实验可行性的关键挑战 | 镜像细菌仍停留在理论阶段,尚未实现自我复制的镜像细胞系统,且缺乏实验验证 | 评估镜像细菌的理论可行性及相关生物安全与生态风险 | 镜像细菌及镜像生物分子(镜像蛋白质和镜像核酸) | 合成生物学 | NA | 化学合成(镜像蛋白质和镜像核酸) | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统(手性倒置的生化框架) | 生物安全、生态评估 |
| 105 | 2026-07-29 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
|
研究论文 | 研究碱基修饰对合成RNA折纸结构及天然核酶三维结构与功能的影响 | 首次揭示5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等碱基修饰通过改变碱基堆积能量而非碱基配对,重塑RNA折叠景观和结构-功能关系 | 未详细说明修饰碱基在不同RNA序列背景下的普适性影响,以及体内环境中的长期稳定性 | 探究碱基修饰对RNA三级结构折叠与功能的影响 | 合成RNA折纸纳米结构和四膜虫核酶 | 分子生物学, 合成生物学 | NA | cryo-EM, FRET, 生化实验 | NA | 结构数据, 生化实验数据 | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构 | 合成生物学, 治疗药物, 生物技术 |
| 106 | 2026-07-29 |
Effector Triggered Susceptibility and Immunity in Bacterial Diseases of Leaf Blight and Streak in Rice
2026-Feb-27, Rice (New York, N.Y.)
DOI:10.1186/s12284-026-00885-w
PMID:41758451
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综述 | 本文综述了水稻细菌性叶片枯病和条斑病中的效应蛋白触发的感病性和免疫机制 | 整合了最新研究成果,详细介绍了TAL效应子和Xops的结构与功能多样性及其宿主靶标,并讨论了利用CRISPR基因编辑、效应子引导育种和合成生物学策略培育广谱持久抗性的新兴方法 | 未解决的关键问题被指出,但未提供具体实验验证 | 总结水稻细菌性叶片枯病和条斑病中效应蛋白触发的感病性和免疫分子机制,并探索可持续病害管理策略 | 水稻及病原菌黄单胞菌(Xoo和Xoc) | 分子植物病理学 | 水稻细菌性叶片枯病、水稻细菌性条斑病 | CRISPR基因编辑 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业 |
| 107 | 2026-07-29 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
|
研究论文 | 利用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对的研究 | 首次利用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)中的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,发现了至少12种新的模块化三联体,能在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及实际应用中的潜在脱靶效应或体内验证,且仅针对体外酶组装的双链构建体进行验证 | 开发使用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸以实现对双链DNA的序列特异性识别 | 双链DNA中的非标准碱基对,包括标准、损伤和合成碱基对 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对 | NA | 实验数据 | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 108 | 2026-07-28 |
Fuel-Driven Coacervates: Design Principles, Dissipative Dynamics, and Life-like Functions
2026-Jul-27, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c02653
PMID:42504573
|
综述 | 综述燃料驱动的凝聚液滴的设计原理、耗散动力学及类生命功能 | 系统总结了不同燃料类别如何直接或间接调控凝聚液滴的形成、演化和解组装,并揭示了其在非平衡条件下展现的类生命功能 | 未提及 | 总结燃料调控凝聚液滴系统的最新进展,探讨其耗散暂态性质如何引发类生命功能并概述应用前景 | 燃料驱动的凝聚液滴系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 递送、生物催化、共价催化、信号放大 |
| 109 | 2026-07-28 |
Photocatalytic and Biotechnological Strategies for Remediation of Persistent Organic Pollutants: Mechanisms, Toxicity, and Antimicrobial Perspectives
2026-Jul-27, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.70172
PMID:42504676
|
综述 | 评估用于持久性有机污染物修复的光催化和生物技术策略,关注其机制、性能及环境影响 | 整合材料科学、环境毒理学和微生物生态学,强调组学技术、合成生物学和数字化优化等新兴工具,推动风险知情和可持续的修复策略 | 转化产物的毒性、对抗微生物耐药性的影响以及混合系统的可扩展性方面仍存在关键空白 | 评估光催化和生物技术用于持久性有机污染物修复的策略 | 持久性有机污染物 | 环境科学 | NA | 光催化、生物技术、组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 110 | 2026-07-28 |
Ortho-alkyl phenylalkenoyl natural products: structural diversity, bioactivities and biosynthesis
2026-Jul-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00053c
PMID:42507473
|
综述 | 系统总结了邻烷基苯基烯酰基天然产物的结构多样性、生物活性和生物合成机制 | 首次系统对比含非核糖体肽骨架的CCNPs与不含NRPS的APAs两类代谢物的生物合成差异,揭示异构化和6π电环化等新机制及多功能酶作为生物催化剂的潜力 | NA | 总结邻烷基苯基烯酰基天然产物的化学多样性、生物活性谱和生物合成途径,并评估其作为先导化合物来源的前景 | 含肉桂酰基的非核糖体肽(CCNPs)和邻烷基苯基烯酸(APAs)两类细菌天然产物 | 天然产物化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 111 | 2026-07-28 |
Synthetic biomanufacturing of triterpenoids: From laboratory to industry
2026-Jul-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108992
PMID:42503341
|
综述 | 综述了三萜类化合物的合成生物制造从实验室到工业化的进展 | 系统总结了微生物合成三萜类化合物的关键策略,包括酶优化、途径优化、区室化工程和系统生物学方法,并分析了从实验室规模到工业规模放大的挑战与解决方案 | 传统天然提取和化学合成方法受限于生产效率、环境负担和产品多样性 | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略实现三萜类化合物高效、可持续的异源生物合成,推动工业化应用 | 三萜类化合物及其微生物合成途径和宿主 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 异源生物合成途径优化、区室化工程 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 112 | 2026-07-28 |
Metabolic engineering of cereal lipids: from omega-3 fatty acids to wax esters and pheromones
2026-Jul-24, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00124-9
PMID:42496959
|
综述 | 综述了通过代谢工程改造谷物脂质以生产高价值脂质化合物(如omega-3脂肪酸、蜡酯和信息素)的最新进展 | 从天然来源到工程植物系统的转变,利用合成生物学和基因组编辑工具定制合成高价值脂质 | 未明确提及具体局限性 | 探讨谷物作为可持续平台用于高价值脂质生产的潜力 | 主要谷物(如水稻、玉米、小麦)种子中的脂质代谢 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 遗传转化 | 谷物(如水稻、玉米、小麦) | 种子脂质代谢通路改造,合成二十碳五烯酸、二十二碳六烯酸、蜡酯、昆虫性信息素 | 农业, 营养, 生物经济 |
| 113 | 2026-07-28 |
Construction and evaluation of an inside-out lysis system based on T4 lysozyme
2026-Jul-23, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106983
PMID:42492745
|
研究论文 | 基于T4溶菌酶构建了一种由内而外的裂解系统,并评估其裂解大肠杆菌的效果 | 通过融合不同的分泌信号肽(PelB、NapA和HybA)与T4溶菌酶,实现了从细胞内部启动的裂解系统,其中NapA-T4溶菌酶表现出最高的细胞内蛋白质泄漏水平 | 未提及具体局限性 | 开发一种由内而外的裂解系统,用于程序性细胞破坏,以支持合成生物学应用 | 大肠杆菌细胞和T4溶菌酶融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 融合蛋白表达与化学诱导裂解 | NA | 实验数据 | 未明确提及样本数量,涉及多种信号肽融合蛋白和化学处理条件 | NA | 大肠杆菌 | 由内而外的裂解系统 | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-07-28 |
A Programmable mRNA Platform for miRNA Detection via miRNA-mRNA2 Triplex-Mediated Ribosomal Frameshifting
2026-Jul-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00883
PMID:42464604
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研究论文 | 开发了一种基于mRNA的可编程平台,通过miRNA-mRNA三链体介导的核糖体移码来检测特定成熟miRNA | 首次利用mRNA-miRNA-mRNA三链体形成触发程序性-1核糖体移码,实现miRNA到蛋白质输出的可量化转换 | 基于细胞外翻译系统验证,尚未在体内环境中测试;主要针对富含嘌呤的miRNA,对其它序列的通用性有待验证 | 开发一种可编程的mRNA平台,用于检测特定成熟miRNA并将其转化为可量化的蛋白质输出 | 成熟microRNA(miRNA/miR) | 合成生物学 | NA | 双荧光素酶翻译系统、生物层干涉测量、荧光结合研究 | NA | 结合亲和力数据、翻译效率数据 | NA | NA | 无细胞翻译系统 | 三链体形成mRNA(TF-mRNA)平台作为分子开关,通过miRNA触发核糖体移码来控制蛋白质输出 | 医学诊断, 合成生物学 |
| 115 | 2026-07-28 |
Engineering 2,4-Diacetylphloroglucinol-Hyper-Tolerant Escherichia coli via Adaptive Evolution for Efficient Biosynthesis and an Organic Solvent-Free Downstream Process
2026-Jul-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00194
PMID:42429219
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研究论文 | 通过适应性实验室进化工程化2,4-二乙酰基间苯三酚高耐受性大肠杆菌,实现高效生物合成及无有机溶剂下游工艺 | 首次结合适应性进化与无有机溶剂提取方法,显著提升DAPG产量并简化下游处理,同时通过基因组重测序鉴定了关键耐受性突变 | 未提及 | 解决DAPG生物合成中宿主毒性和低效下游处理的关键瓶颈 | 大肠杆菌菌株Bdt03及精确构建的菌株Bb03 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、基因组重测序 | NA | NA | 多个进化和构建的大肠杆菌菌株 | NA | 大肠杆菌 | DAPG响应性遗传电路 | 农业 |
| 116 | 2026-07-28 |
The Mevalonate Pathway: Innovations, Applications, and Challenges in Biotechnology with Emphasis on Fungal Biology
2026-Jul-07, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12070497
PMID:42506259
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综述 | 全面综述甲羟戊酸(MVA)途径,重点关注真菌生物学中的创新、应用和挑战 | 对MVA途径在真菌中的酶学调控、结构生物学、代谢工程及合成生物学的最新进展进行全面梳理,强调真菌作为工程宿主在异戊二烯可持续生产中的潜力 | 未提及 | 综述MVA途径的分布、进化、代谢组织、酶学特性及在真菌合成生物学中的应用 | 甲羟戊酸途径、真菌、异戊二烯前体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | MVA途径、麦角固醇生物合成、蛋白质异戊二烯化、次生代谢产物合成 | 工业生物技术、医学、农业 |
| 117 | 2026-07-28 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 探讨通过可控环境农业加速植物科学基础研究向农业应用的转化 | 提出可控环境农业作为连接基础发现与作物实际应用的桥梁,整合育种、基因组学和合成生物学工具,实现作物设计的重新构想 | 指出了在整合过程中仍存在的挑战 | 综述可控环境农业在加速植物科学转化中的进展和潜力 | 植物科学突破和作物设计 | 机器视觉 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 生物传感器、代谢通路 | 农业, 环境 |
| 118 | 2026-07-28 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 综述了植物基因组中精准DNA插入的构建设计原则与策略 | 系统评估了短片段、大片段及多片段插入等不同应用场景下的敲入方法,并探讨了非植物先进技术提升植物敲入效率与精度的潜力 | 实际指导有限,且主要基于现有方法综述,缺乏实验验证 | 促进植物敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,降低脱靶效应 | 植物基因组中的精准DNA插入技术 | 合成生物学 | NA | DNA插入(敲入)技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 119 | 2026-07-28 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
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研究论文 | 在酵母中构建人工紫杉醇生物合成途径,通过三步酶促反应将巴卡亭III转化为紫杉醇 | 首次在酵母中构建人工紫杉醇合成途径,利用非天然底物(3-苯异丝氨酸)实现三步酶促转化,并展示了β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广泛底物范围 | 研究仅关注从巴卡亭III到紫杉醇的后期步骤,未涉及上游复杂途径;人工途径的产量和效率可能仍低于天然系统,尚未进行大规模生产验证 | 开发可持续的紫杉醇生产方法,克服传统半合成途径的局限 | 紫杉醇生物合成途径中的关键酶(PCL、BAPT)和酵母宿主 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程、结构-活性分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 人工代谢途径(紫杉醇合成途径) | 医学, 工业生物技术 |
| 120 | 2026-07-28 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 提出一种结合机器学习和结构感知模拟的框架seq2ribo,仅从RNA序列预测核糖体A位点位置分布 | 首次仅从序列数据实现与观测核糖体图谱有意义的位点相关性,引入结构感知TASEP模型整合RNA二级结构特征,通过抛光器模型修正模拟分布提升预测保真度 | NA | 开发仅依赖mRNA序列预测核糖体定位图谱的方法,为合成生物学中mRNA序列设计提供工具 | 多种细胞类型的核糖体A位点位置分布及翻译效率 | 机器学习 | NA | Ribo-seq, RNA-seq | 神经网络抛光器, TASEP模拟 | 测序数据 | 跨四种细胞类型(iPSC, HEK293, LCL, RPE-1)的核糖体图谱数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发 |