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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-21 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-Jan-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
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综述 | 本文综述了基于CRISPR-Cas系统在非模式细菌工程化中的应用,以开发生物生产和生物治疗产品 | 强调利用CRISPR效应蛋白相对独立于宿主辅助因子的特性,克服物种特异性障碍,实现对难以工程化的非模式微生物(如C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌)的精确基因操作,从而拓展其独特的代谢和生物合成潜力 | 文中提及当前工具在非模式微生物中的应用仍存在局限性,但未具体说明是哪些技术或生物学障碍 | 探讨如何利用CRISPR-Cas系统扩展微生物工程的范围,以开发可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗剂 | 非模式细菌,特别是C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非模式细菌,包括C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌、肠道共生菌 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 122 | 2026-01-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Jan-20, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中内切-β-甘露聚糖酶(MAN2和MAN5)在维持半纤维素生物合成中的作用,揭示了它们通过切割不溶性β-甘露聚糖聚合物来促进亲水性对应物生成的新机制 | 发现了内切-β-甘露聚糖酶在细胞内(高尔基体)的新功能,即通过切割不溶性β-甘露聚糖聚合物来维持半纤维素生物合成,这挑战了传统上认为这些酶仅参与种子萌发过程中细胞壁多糖降解的观点 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性;对MAN酶与CSLA相互作用的分子机制细节仍需进一步探索 | 研究植物细胞壁β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在调控因子 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的内切-β-甘露聚糖酶(MAN2和MAN5)以及纤维素合成酶类似物A(CSLA) | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学、基因过表达、突变体分析 | NA | NA | 拟南芥突变体(man2 man5双突变体)及相关转基因株系 | 酵母合成生物学 | 酵母(用于合成生物学研究) | NA | 农业 |
| 123 | 2026-01-21 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析由两性霉素B与麦角固醇相互作用引起的纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C的效果 | 首次开发了通过浓度依赖性释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂活性的分析系统,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 分析脂质体膜上纳米孔形成的特性,并开发用于筛选膜活性化合物的实用系统 | 脂质体膜上的纳米孔形成,涉及两性霉素B、麦角固醇和shodoamide C的相互作用 | NA | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 124 | 2026-01-21 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jan-19, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
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研究论文 | 本研究在区间二型T-S模糊框架下,对不确定时滞基因调控网络进行扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕捉基因调控网络的复杂动态和参数不确定性,并通过构建新型Lyapunov-Krasovskii泛函获得最大允许时滞界限的显式推导 | NA | 为基因调控网络开发鲁棒控制策略的理论理解和实际设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | 区间二型T-S模糊框架,Lyapunov-Krasovskii泛函方法 | T-S模糊模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 125 | 2026-01-21 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Jan-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台,结合长读和短读测序技术,用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱 | CLASSIC平台首次将长读和短读NGS结合,实现对多kb长度基因电路设计的超高通量映射,揭示遗传部件组合规则 | NA | 加速合成生物学,通过筛选基因电路设计并学习'组成到功能'映射,揭示遗传部件组合规则 | 人类细胞中的基因电路设计 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序(NGS) | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10个基因电路设计(长度5-20 kb) | NA | 人类细胞 | 基因电路设计,包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 126 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
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综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用,特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用,以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化,并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术(阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜) | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 127 | 2026-01-20 |
A review of phage therapy for drug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections
2026-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128417
PMID:41412007
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综述 | 本文系统总结了噬菌体疗法在治疗耐药铜绿假单胞菌感染方面的最新进展,涵盖体外杀菌活性、生物膜降解、与抗生素的协同作用、动物模型证据及临床应用案例 | 全面整合了从基础研究到临床应用的噬菌体疗法证据,并强调了工程化噬菌体与个体化治疗策略的发展前景 | 存在转化障碍,如需要精确宿主匹配、存在免疫中和风险、缺乏标准化监管框架和GMP级生产体系 | 评估噬菌体疗法作为耐药铜绿假单胞菌感染替代治疗策略的潜力与挑战 | 耐药铜绿假单胞菌及其引起的感染(如慢性呼吸道感染、烧伤伤口感染、尿路感染、器械相关感染) | NA | 铜绿假单胞菌感染 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 128 | 2026-01-20 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 本文综述了叶际微生物组作为地球上最大微生物栖息地之一,在可持续农业和环境健康中的关键作用及其应用潜力 | 系统阐述了叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中未被充分探索的前沿领域,并提出了通过组学技术、微生物群落工程和纳米递送系统等新方法克服应用限制的策略 | 叶际微生物的实际应用仍面临环境不稳定性、田间持久性差、功能表征不完整以及叶面微气候多变等挑战 | 探索叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中的应用潜力 | 植物叶际(地上部分表面)的微生物群落,包括细菌、真菌和酵母 | NA | NA | 组学技术、微生物群落工程、纳米递送系统 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 129 | 2026-01-20 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-Jan-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 本研究对1994年至2024年全球植物基因工程领域的文献进行了文献计量分析,以揭示其发展趋势、国际合作网络和技术演进 | 通过文献计量学方法系统揭示了全球植物基因工程研究的双核合作结构(中国和美国),并识别了技术生命周期的三个阶段及未来技术轨迹 | NA | 系统考察全球植物基因工程的发展趋势、合作网络和技术演进 | 全球植物基因工程领域的科学文献 | NA | NA | Agrobacterium介导的转化、RNA干扰(RNAi)、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 烟草植物 | NA | 农业 |
| 130 | 2026-01-20 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 本文综述了干细胞在器官发生和再生中的作用,涵盖干细胞类型、关键信号通路、器官形成机制、再生医学应用以及新兴技术 | 系统整合了胚胎干细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞在器官发生与再生中的不同作用,并探讨了CRISPR、3D生物打印和合成生物学等先进技术的应用前景 | NA | 全面概述干细胞生物学及其在器官发生、组织再生和临床转化中的潜力 | 干细胞(胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞)、类器官、信号通路 | NA | NA | CRISPR、3D生物打印、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 131 | 2026-01-20 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
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研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌单基因和多基因调控的高效体内进化系统,通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器和进化模板设计,成功优化了碱性蛋白酶活性和血红素产量 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID的体内进化系统,首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控,并通过扩展sgRNA策略优化进化效率 | NA | 开发一种高效的体内进化系统,用于调控枯草芽孢杆菌中的单基因和多基因,以优化细胞工厂的构建 | 枯草芽孢杆菌及其基因(如碱性蛋白酶基因和血红素代谢网络关键基因) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑、下一代测序、分批补料发酵 | NA | 测序数据、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 碱基编辑器(Cas9n与AID融合表达)、进化模板(含可编辑RBS序列) | 工业生物技术 |
| 132 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略,用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合,构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘,并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力,尚未进行人体临床试验;尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘,用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株(NZ9000-Δ)及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis) | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |
| 133 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
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综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用,并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略,并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物(如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥)中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径,以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶(如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶),以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径(涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路) | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 134 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
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综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架,用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践,构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架,并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题,提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 135 | 2026-01-20 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌(Serratia plymuthica)菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用,重点关注紧密结合的胞外聚合物物质的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物物质(尤其是蛋白质组分)在铜生物吸附中的关键作用,并展示了该菌株在强酸性真实电镀废水中仍能实现高效铜去除的潜力 | 研究未在真实工业废水条件下进行规模化验证,未来需要通过合成生物学方法改进铜螯合能力并提升技术成熟度 | 开发高效的重金属生物去除系统,探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌(Serratia plymuthica)菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物物质 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附、生物膜培养、废水处理实验 | NA | 实验数据、吸附效率数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统和浮游细胞系统进行实验,具体样本数量未明确说明 | 合成生物学方法(未来研究方向) | 沙雷氏菌(Serratia plymuthica) | NA | 环境、工业生物技术 |
| 136 | 2026-01-20 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Jan-12, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 本研究构建了一个合成基因电路,将生化信号转换为电信号,用于工程化感官细菌的电化学生物传感 | 设计了一个集成合成基因电路,结合一氧化氮响应模块和PCA合成模块,增强了电信号输出,实现了单细胞水平的高灵敏度检测 | NA | 开发基于工程化电活性微生物的电化学生物传感器,用于细胞内一氧化氮的原位分析 | 工程化的大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 电化学量化 | NA | 电信号 | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌 | 集成合成基因电路,包括一氧化氮响应模块和苯二胺-1-羧酸合成模块,用于间接电子传递和信号转换 | 医学 |
| 137 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
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综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体(CAR)的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用,探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞,并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战,如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍,并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计,使用单链可变片段(scFv)识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 138 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
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综述 | 本文探讨了合成生物学中物理(机器人)和认知(智能代理)自动化的进展与前景,并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架:一个用于设计-构建-测试-学习(DBTL)周期的完全自动化,另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 139 | 2026-01-20 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架,用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 首次利用基于DNA可及性数据训练的生成式AI框架设计调控元件,生成的200碱基对合成元件能重现内源性转录因子结合模式并增强细胞类型特异性 | NA | 开发用于精确基因表达控制的合成调控元件设计方法 | 调控元件设计、基因表达控制 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq、EXTRA-seq、DNA可及性数据 | 生成式AI、DNA-Diffusion | DNA序列数据、基因表达数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 合成调控元件设计 | 医学、基因治疗 |
| 140 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
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研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统(AUCS),用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物,旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏,并最小化诱导异质性,仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出,显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台,以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统,包括蛋白质(如卵清蛋白)、酶(如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶)和次级代谢物(如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇) | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统,包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达,用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |