合成生物学相关文章
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当前共找到 1376 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-07-28 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
|
评论 | 讨论恶臭假单胞菌KT2440因分类学重新命名引发的争议，呼吁保留传统名称以维护科学实践和社区共识 | 首次系统评估微生物分类学重新命名对长期研究实践的负面影响，强调命名应兼顾实用性和社区认同 | 未提供具体的替代命名方案或量化分析命名变更对研究成果的直接影响 | 探讨微生物命名中分类学严谨性与科学实践连续性之间的平衡问题 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株的命名争议 | 微生物学 | NA | 系统发育分析 | NA | 文本数据 | 单一菌株KT2440 | NA | 恶臭假单胞菌 | NA | 环境微生物学、生物技术、合成生物学 |
| 122 | 2026-07-28 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 提出了一种名为OAFI的新方法，用于在抗生素抗性基因中创建合成重叠基因对，从而稳定基因系统 | 首次提出OAFI方法，通过将内部基因插入外部基因的柔性区域，实现重叠基因对的简单构建，并展示了限制抗生素抗性基因水平转移的能力 | 内部基因翻译效率受其在外基因中重叠位置的影响，部分重设计可能在功能保留上有局限性 | 开发合成重叠基因的方法，用于基因稳定和生物遏制 | 抗生素抗性基因、细菌毒素、遗传报告基因 | 合成生物学 | NA | OAFI | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 合成重叠基因对，包括遗传报告基因和细菌毒素的嵌入 | 基因稳定、生物遏制 |
| 123 | 2026-07-28 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
|
综述 | 系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用，包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与传统疗法的协同作用 | 全面梳理了合成生物学改造细菌作为精准活体治疗手段的进展，重点分析了细菌疗法与化疗、放疗及免疫治疗的协同增效策略 | 未提供临床试验的具体数据或定量分析，对临床转化的安全性和生产挑战仅作定性讨论 | 为开发更安全有效的细菌介导抗癌策略提供基础性视角 | 工程化细菌、肿瘤微环境、肠道菌群 | 数字病理学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 活体治疗回路（局部药物递送、靶向免疫调节、肿瘤微环境重塑） | 医学 |
| 124 | 2026-07-27 |
X-ray crystal structures of the cannabinoid synthases CBCAS, CBDAS and THCAS
2026-Dec, Current research in structural biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.crstbi.2026.100197
PMID:42502799
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研究论文 | 解析了大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS的X射线晶体结构，揭示了它们活性位点的差异 | 首次报道了CBCAS和CBDAS的晶体结构，并获得了比已知结构更高分辨率的THCAS结构，揭示了决定底物特异性的活性位点差异 | 未提供 | 解析大麻素合酶的结构基础，为合理工程化改造这些酶的化学选择性提供平台 | 大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 三种酶的晶体结构 | NA | NA | NA | 药物合成、合成生物学 |
| 125 | 2026-07-27 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
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综述 | 总结了自下而上重构模型膜系统的最新进展，重点介绍了支持脂质双层（SLBs）和巨单层囊泡（GUVs）的制备与应用 | 系统回顾了SLBs和GUVs在膜相关蛋白组装、膜曲率感应与重塑、渗透性及细胞骨架组织中的关键作用，并强调了新兴方向如悬浮膜、膜-凝聚相相互作用及GUV作为合成生物学底盘的应用 | 未提及具体技术限制或算法缺陷，可能受限于综述篇幅而对某些细节讨论不充分 | 探讨自下而上重构膜系统在理解膜组织与功能方面的物理原理及其在生物医学中的应用潜力 | 支持脂质双层（SLBs）和巨单层囊泡（GUVs） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 126 | 2026-07-27 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 报告了一种基于真菌的活体材料平台，通过低能耗工艺制备宏观粘合薄膜，保持菌丝代谢活性，用于工程化活体纺织品 | 将宏观结构组装与持续细胞活力和可编程功能无缝整合，通过模块化设计解耦结构制备与基因功能化，采用低能耗工艺实现环境响应和表面更新 | 未明确提及，但可能涉及工程化微生物伙伴的长期稳定性和实际应用中的环境适应性 | 开发可扩展且可持续的真菌基活体材料平台，弥合结构完整性与生物可编程性之间的关键差距 | 真菌菌丝体及其工程化微生物伙伴（产色素细菌和黑色素化细菌） | 合成生物学 | NA | 低能耗工艺 | NA | 文本 | NA | NA | 真菌菌丝体 | 模块化平台，用于共培养和原位图案化及紫外屏蔽 | 材料, 环境 |
| 127 | 2026-07-27 |
Reimagining Lignin Valorization: Synthetic Biology-Enabled Sustainable Aromatic Carbon Biomanufacturing
2026-Jul-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76698
PMID:42474033
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综述 | 提出将合成生物学驱动的调控策略作为整合木质素解聚、转化和代谢调控的统一框架，实现可持续芳香碳生物制造 | 主张从孤立催化步骤转向协同控制框架，强调全局调控（而非路径完整性）是提高木质素生物转化效率、鲁棒性和可扩展性的关键，并引入光酶催化、化学生物杂合体等新兴技术扩大设计空间 | 未具体说明当前方法的实际应用挑战（如规模化成本、工程化瓶颈）或未来需解决的调控机制细节 | 提出通过合成生物学实现木质素可持续生物转化的路线图，强调调控作为统一原则 | 木质素（可再生芳香碳库）及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 光酶催化、化学生物杂合体、动态生物传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物细胞工厂 | 动态调控回路、生长-生产解耦系统、模块化代谢通路 | 可持续生物制造、工业生物技术 |
| 128 | 2026-07-27 |
Advances in Betalain Biosynthesis and Metabolic Engineering for Sustainable Natural Pigment Production
2026-Jul-19, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15030056
PMID:42496572
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综述 | 本文综述了甜菜红素生物合成及代谢工程的最新进展，旨在推动可持续天然色素的生产 | 重点比较植物、植物细胞、酵母和细菌生产系统，并涵盖合成生物学、诱导方法、组学途径鉴定和纳米生物技术等新方法 | 甜菜红素在工业应用中仍面临天然含量低、对环境敏感及制造和储存中不稳定的限制 | 优化甜菜红素生产并克服商业化瓶颈，实现可持续天然色素替代人工色素 | 甜菜红素生物合成途径及代谢工程系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、组学分析、纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | 植物, 植物细胞, 酵母, 细菌 | 甜菜红素生物合成途径的工程化改造 | 食品, 工业生物技术 |
| 129 | 2026-07-27 |
Bioinspired organic materials for seamless neurohybrid interfaces: from material design to living electronics
2026-Jul-18, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00280c
PMID:42468887
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研究论文 | 本文探讨了基于生物启发的有机材料，用于无缝神经混合接口，从材料设计到活体电子学的进展 | 提出了利用有机混合离子-电子导体、先进聚合物化学和软材料实现神经组织无缝整合的新方法，并探索了原位聚合和合成生物学在活体神经电子学中的潜力 | 未明确说明具体局限，但可能包括活体整合的长期稳定性和生物相容性挑战 | 研究神经混合接口的无缝整合，以实现神经组织双向通信，用于理解和治疗神经疾病 | 神经电子设备和神经混合接口 | 神经科学、生物工程、临床医学 | 神经疾病 | 原位聚合、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 神经混合接口 | 医学 |
| 130 | 2026-07-27 |
Programmable CRISPRtune dissects the transcriptional repressive activity of MeCP2
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.08.737375
PMID:42465491
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研究论文 | 开发名为CRISPRtune的可编程转录调控工具，通过将MeCP2与失活dCas9融合，实现对人类内源基因转录水平的中等程度下调，并解析MeCP2的转录抑制机制 | 首次将MeCP2与dCas9融合实现可编程的转录中等程度调控，利用全基因组CRISPR筛选建立靶向规则，并揭示MeCP2诱导的局部表观遗传变化及其遗传依赖伙伴 | 文中未明确提及局限性 | 开发可编程的转录调控工具并解析MeCP2在活细胞中的转录抑制机制 | 人类细胞内源基因的转录调控及MeCP2蛋白功能 | 合成生物学 | Rett综合征 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 全基因组规模的数千个内源基因 | CRISPR-dCas9 | 人类细胞 | CRISPRtune融合蛋白（MeCP2-dCas9）实现转录调谐 | 医学 |
| 131 | 2026-07-27 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
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综述 | 综述了利用工程微生物高效合成二萜类化合物的最新进展和未来展望 | 系统总结了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略 | 未对具体工程策略的优劣进行量化比较，也未涵盖所有微生物底盘 | 探讨微生物高效合成二萜类化合物的研究进展、关键挑战及未来方向，以促进工业应用 | 大肠杆菌、酿酒酵母、解脂耶氏酵母和圆红冬孢酵母等工程微生物底盘 | 合成生物学 | 不适用 | 代谢工程, 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 化妆品, 食品添加剂, 制药 |
| 132 | 2026-07-27 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
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研究论文 | 通过直接整合人工呼吸链提高无细胞代谢效率 | 开发了定制化的人工呼吸链，能够在一氧化碳固定的16酶催化循环中维持快速电子传递，并利用电子流合成三磷酸腺苷，同时展示了该链可多样化以接受多个电子入口并与其他生物功能耦合 | 构建自维持/自供能的人工类生命系统仍面临挑战，能源守恒机制的整合存在困难和未充分解决的问题 | 从零开始重建能量守恒机制并将其与生物功能整合，以构建具有生命特性的复杂无细胞代谢网络 | 人工呼吸链及一氧化碳固定的16酶催化循环（巴豆酰辅酶A/乙基丙二酰辅酶A/羟基丁酰辅酶A循环） | 合成生物学 | 不适用 | 无细胞代谢工程、电子传递重建、三磷酸腺苷合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人工呼吸链、无细胞转录-翻译网络 | 工业生物技术 |
| 133 | 2026-07-27 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 本研究构建了一个53 kb的环状DNA，称为RCR模块基因组，编码所有26种RCR蛋白，可在体外利用PURE系统实现自我复制 | 首次实现了由遗传信息生成功能性染色体复制系统，构建了可自我复制的体外人工模块基因组，实现了超过28次递归自我复制 | NA | 构建能够自我复制的体外人工基因组，推动自下而上合成生物学中人造细胞的构建 | RCR模块基因组（53 kb环状DNA，编码26种RCR蛋白） | 合成生物学 | NA | 体外重组、蛋白质合成、DNA复制 | NA | NA | NA | NA | Escherichia coli（大肠杆菌） | RCR模块基因组（包含复制循环反应的基因回路） | 合成生物学、基础研究 |
| 134 | 2026-07-27 |
Single-residue engineering of Klenow fragment enables broad acceptance of chemically modified nucleotides
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag697
PMID:42454372
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研究论文 | 报道了Klenow片段的一个单残基突变体F762A，能够在生理条件下高效合成多种化学修饰核酸（XNA） | 首次通过单点突变实现中温聚合酶对多种修饰核苷酸的广泛接纳，在37°C下高效合成DNA、RNA、2'-F-RNA、FANA等，并具备逆转录活性和自复制能力 | 未提及在更复杂的生物环境或体内应用中的表现，长期稳定性及诱变率在长期扩增中的影响尚需进一步验证 | 开发能在生理条件下高效合成XNA的中温聚合酶，拓展XNA在合成生物学和生物技术中的应用 | Klenow片段F762A突变体及其与多种修饰核苷酸的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、酶学表征、核苷酸合成 | NA | 序列数据、生化实验数据 | NA | 定点突变 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、生物技术、医药 |
| 135 | 2026-07-27 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 本文报道了一种名为“风滚草”的人工受控蛋白质马达，该马达通过模块化设计策略构建，能在DNA轨道上沿指定方向进行16纳米步进的定向运动 | 首次实现了基于蛋白质的人工分子马达，采用模块化设计整合配体门控DNA结合域，实现了对外部输入的可控定向步进运动 | NA | 构建并验证一种人工蛋白质马达，实现沿DNA轨道的可控步进运动 | Tumbleweed蛋白质马达及其与DNA轨道的相互作用 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测，微流控装置 | NA | 单分子荧光图像 | NA | NA | NA | 蛋白质马达（风滚草）由三个包含配体门控DNA结合域的“腿”组成 | 纳米技术, 合成生物学 |
| 136 | 2026-07-27 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 提出一种混合模拟与机器学习的框架seq2ribo，仅从RNA序列预测核糖体位置分布 | 首次仅从序列数据实现与实验核糖体图谱有意义的位点相关性，结合结构感知TASEP模拟与机器学习抛光模型 | 未明确说明局限性 | 开发一种无需表达数据或基因组背景即可预测核糖体分布的新方法，用于mRNA序列的理性设计和优化 | 核糖体A位点位置分布、翻译效率、蛋白质表达量 | 机器学习, 合成生物学 | NA | Ribo-seq, RNA-seq, 核糖体图谱分析 | 结构感知TASEP模拟, 抛光模型（机器学习） | RNA序列数据 | 多种细胞类型（iPSC, HEK293, LCL, RPE-1） | NA | 人类细胞（iPSC, HEK293, LCL, RPE-1） | NA | 医学, 合成生物学, mRNA疫苗设计 |
| 137 | 2026-07-27 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的分子机制、组学见解、应用及生物安全考量 | 系统整合了蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、多组学分析进展及合成生物学应用前景 | 田间应用受环境变异性与制剂稳定性限制，实验室成果向大田推广存在挑战 | 为开发环保可持续的作物真菌病害防控方案提供理论依据和未来方向 | 蓝细菌产生的抗真菌代谢物及其对作物真菌病害的抑制作用 | 机器学习 | 作物真菌病害 | 多组学分析、全基因组挖掘 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物传感器、代谢通路工程 | 农业 |
| 138 | 2026-07-27 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
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研究论文 | 通过扩展遗传工具箱，实现了鼠李糖乳杆菌的组成型荧光标记，以支持功能微生物组研究 | 首次在鼠李糖乳杆菌GR-1和GG中实现了直接质粒克隆和一组之前在植物乳杆菌中验证的遗传元件测试，并构建了组成型荧光菌株 | 未提及研究的局限性，可能包括荧光稳定性或体内适用性需进一步验证 | 扩充鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，开发组成型荧光菌株用于功能微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、荧光蛋白标记 | NA | 荧光图像数据 | 两个鼠李糖乳杆菌菌株（GR-1和GG）和一个金黄色葡萄球菌致病菌株 | 组成型启动子、荧光蛋白（mCherry， mScarlet3， sfGFP） | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 139 | 2026-07-27 |
An Experimentally Verified Mechanistic Model for Predicting Quorum Sensing-Based Switches
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70408
PMID:42444116
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研究论文 | 开发了一个预测基于群体感应的EsaI/EsaR开关的机理模型并用实验验证 | 提出了一个能够区分转录因子和合酶表达水平对双向启动子响应影响的数学模型，强调了转录因子在调控电路中的关键作用 | 未说明，推测模型可能受限于特定系统或实验条件 | 开发一个数学预测模型以加速群体感应基因电路的调控过程 | EsaI/EsaR群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 实验数据 | 构建了菌株文库 | NA | NA | 群体感应开关 | 合成生物学 |
| 140 | 2026-07-27 |
Functional Engineering of Bioactive Peptides: Chemical Modifications and Synthetic Biology Approaches
2026-Jul-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135939
PMID:42450206
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综述 | 系统总结了生物活性肽的合成生物学和化学修饰策略，并讨论了当前挑战与未来趋势 | 首次全面整合合成生物学（氨基酸替换、序列截短与杂合等）和化学修饰（末端修饰、环化、聚合物缀合等）两大类策略，并基于122篇系统文献检索结果提供理论指导 | 未深入研究具体修饰策略的实际应用效果比较，且综述性质限制了实验验证 | 梳理生物活性肽的工程改造方法，为克服其天然局限性提供理论指导与创新思路 | 生物活性肽（BPs） | NA | NA | 氨基酸替换、序列截短、杂合、侧链功能化、主链/侧链整合、末端修饰、环化、主链修饰、聚合物缀合、脂化、糖基化 | NA | 文献数据 | 122篇系统文献 | NA | NA | NA | 食品、医药、生物材料 |