合成生物学相关文章

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当前共找到 1806 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
121 2026-10-27
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-08-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为PUREdrop的自动化微流控平台,用于在皮升级合成细胞中表达和筛选蛋白质文库,并定量分析其表达动力学和涌现功能 开发了PUREdrop平台,能够将蛋白质文库封装在数千个皮升级合成细胞中并分配到96孔板的预定孔中进行延时成像,实现表达动力学和涌现功能的并行定量,弥补了传统筛选方法在时空分辨率和细胞样限制方面的不足 摘要中未明确提及研究的局限性 解决自下而上合成生物学中筛选复杂功能蛋白质文库的挑战,加速功能性蛋白质工程的设计-构建-测试-学习循环 细菌细胞分裂蛋白FtsZ的计算重设计变体以及FtsZ的通用蛋白质调节因子 合成生物学 NA 微流控技术,延时成像 NA 图像 每个构建体数千个皮升级合成细胞,分布在96孔板中 NA NA NA 医学,工业生物技术
122 2026-10-27
Host-aware Identification of Intrinsic Gene Expression Biopart Parameters using Combinatorial Libraries
2026-08-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章提出了一个宿主感知框架,利用质粒组合文库和数字孪生模型定量表征生物元件的内禀参数。 将大肠杆菌数字孪生与模型在环参数辨识相结合,从宿主效应中分离出生物元件相关的可迁移内禀参数,并定义了翻译起始能力。 揭示了模块化在局部序列上下文中的失效,参数化可能受限于所测试的质粒系统和生理条件范围。 实现合成生物学中生物元件的宿主感知定量表征与预测性设计。 质粒复制起点、启动子和核糖体结合位点等生物元件。 合成生物学 NA 组合文库构建、生长速率测量、模型在环参数辨识 数字孪生模型 生长速率和基因表达数据 NA NA 大肠杆菌 组成型表达构建体 工业生物技术
123 2026-10-27
Microbial lipases: advances in metagenomics and artificial intelligence for enzyme discovery and engineering
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发掘与工程改造中的最新进展,并概述了脂肪酶的来源、结构特征、理化性质及工业应用 强调宏基因组学与人工智能技术之间的协同作用,将广泛的序列数据库与预测性计算建模工具相结合,用于酶的鉴定与理性设计 仍存在异源表达水平低、高质量信息缺乏以及工业规模验证有限等挑战 总结微生物脂肪酶发掘与工程改造领域的最新进展,并展望未来发展方向 微生物脂肪酶 机器学习 NA 宏基因组学,人工智能 蛋白质语言模型,生成式人工智能 序列 NA NA NA NA 工业生物技术,医药
124 2026-10-27
Regulation of Escherichia coli fermentation processes: from molecular mechanisms to smart industrial practice
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 系统阐述大肠杆菌发酵调控从经验性调整向跨尺度智能控制框架的范式转变,涵盖分子机制、动态合成生物学回路、模型预测控制与数字孪生 提出跨尺度深度耦合的智能控制框架,将过程级模型预测控制与动态合成生物学回路(群体感应、代谢物响应反馈、光遗传开关)整合,并强调多尺度建模与数字孪生(CFD耦合基因组尺度代谢模型)使发酵黑箱透明化 作为综述未提供原始实验数据验证所提出的智能控制框架,跨尺度耦合与数字孪生的工业落地仍面临空间异质性、底物混合延迟等实际挑战 阐明大肠杆菌发酵调控的当代范式转变,为从实验室代谢成功向百吨级稳健制造转化提供跨尺度智能控制策略 大肠杆菌发酵过程及其跨尺度调控网络 工业生物技术, 合成生物学, 过程控制 NA NA 模型预测控制, 计算流体动力学, 基因组尺度代谢模型, 数字孪生 文献 NA NA 大肠杆菌 群体感应介导的生长-生产解耦回路, 代谢物响应反馈回路, 光遗传开关 工业生物技术, 医药, 绿色生物制造
125 2026-10-27
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-07-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了一个基于内源2μ质粒的酵母质粒拷贝数(PCN)可编程调控平台,可实现从1到约70拷贝的动态调控,并应用于多种代谢产物生产和tRNA表型分析 首次在真核系统(酿酒酵母)中实现了可编程的质粒拷贝数动态调控,通过p2μ-Cir系统、CEN元件和Leu2d筛选实现了从1到38拷贝的可切换调控以及约70拷贝的高拷贝数,表达水平提升达110倍,并解决了多拷贝不稳定性问题 研究仅针对酿酒酵母(S. cerevisiae)的内源2μ质粒系统,尚未验证在其他真核宿主中的适用性 在真核系统中建立可编程的质粒拷贝数调控平台,实现基因剂量在DNA、RNA和蛋白质水平的精确控制 酿酒酵母(S. cerevisiae)及基于内源2μ质粒的PCN调控系统 合成生物学 NA 质粒工程、2μ质粒改造、CEN元件整合、Leu2d筛选 NA NA NA CEN元件, Leu2d筛选标记 酿酒酵母(S. cerevisiae) 基于内源2μ质粒的PCN调控平台(p2μ-Cir系统),结合CEN元件实现拷贝数可切换调控和Leu2d筛选提高拷贝数 医药, 工业生物技术, 食品
126 2026-10-26
Unveiling the Molecular Secrets of Seaweeds: A Comprehensive Review of Bioinformatics Applications in Algal Research
2026-Dec, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
综述 综述海藻研究中生物信息学应用,涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组和功能基因组学及多组学整合、基因编辑、人工智能和合成生物学等新兴策略 系统整合海藻多组学与生物信息学工具数据库,并聚焦人工智能、机器学习、基因编辑和合成生物学等新兴策略对海藻研究的重塑作用 基因组资源不完整、数据标准化不足,且计算预测缺乏实验验证 概述生物信息学在海藻研究中的应用,推动海藻生物学的系统层面理解及其向可持续生物技术和海洋生物经济应用的转化 海藻 生物信息学 NA 高通量测序, 生物信息学, 多组学, 基因组编辑, 人工智能, 机器学习, 合成生物学 NA 组学数据, 文本 NA 基因编辑 海藻 NA 医学, 农业, 能源, 食品, 工业生物技术
127 2026-10-26
Synthetic biology for heritable viral disease resistance in livestock
2026-Oct-24, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 综述合成生物学在牲畜可遗传抗病毒病策略中的最新进展,涵盖宿主因子编辑、合成抗病毒系统及使能平台 系统整合宿主因子工程、合成抗病毒回路与精准编辑工具,并讨论商业化、监管与公众接受度等挑战 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对商业化推广和公众接受度的讨论可能不够深入 总结并评估利用合成生物学实现牲畜可遗传病毒病抗性的策略与平台 猪、牛、鸡等牲畜及其病毒病(如PRRSV) 合成生物学 牲畜病毒病 基因编辑、碱基编辑、先导编辑、类器官与干细胞衍生细胞培养 NA 文本 NA 碱基编辑器, 先导编辑器 猪, 牛, 鸡 合成抗病毒回路 医学, 农业
128 2026-10-26
PrimeStack editors enable efficient and site-specific integration of large multigene cargos in plants
2026-Oct, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文提出PrimeStack平台,结合prime editing与定向大丝氨酸整合酶Bxb1,在水稻基因组安全港实现多基因大片段的高效定点整合 首次将prime editing与进化版Bxb1整合酶结合,构建不依赖双链断裂的定点大片段整合平台,整合效率高达45%,且整合不可逆 仅在水稻中验证,未在其他植物物种测试;长期遗传稳定性和脱靶效应未充分评估;仅测试一个基因安全港位点 开发高效、可编程的植物基因组大片段多基因定点整合平台,推动作物性状聚合与合成生物学应用 水稻(Oryza sativa)基因组及再生植株 合成生物学,植物基因工程 NA prime editing,Bxb1大丝氨酸整合酶介导重组,junction-specific PCR NA DNA序列,PCR分析数据,表型观察数据 再生水稻植株(具体数量未在摘要中说明) prime editing,Bxb1整合酶 水稻(Oryza sativa) attP着陆位点安装与Bxb1介导的不可逆定点整合通路(基因堆叠平台) 农业,合成生物学,植物生物制造
129 2026-10-26
Programmable Enhancement of IRES-Mediated Translation via RNA-Guided eIF4G Recruitment
2026-Sep-15, Biochemistry IF:2.9Q3
研究论文 本文提出了一种通过RNA引导的eIF4G招募来可编程增强IRES介导翻译的策略 利用工程化的RNA结合蛋白融合体招募截短的eIF4G支架,选择性增强EMCV IRES介导的翻译而不影响帽依赖表达,最高实现7.7倍增强,并可通过效应物剂量和连接子设计在宽动态范围内调节翻译输出 未明确说明 开发一种可编程策略来增强IRES依赖的翻译,扩展合成生物学中转录后基因调控的工具箱 IRES元件(特别是EMCV IRES)、eIF4G蛋白、λN融合蛋白、哺乳动物细胞系 合成生物学 NA RNA引导的翻译调控、蛋白质工程 计算模型 文本 多种哺乳动物细胞系及三顺反子构建体 NA 哺乳动物细胞 三顺反子构建体用于多顺反子表达的协调调控 医学, 工业生物技术
130 2026-10-25
CEM 2.0: Co-evolution-guided mining of superior extremophilic proteins via a curated proteome database and protein language model
2026-Dec, Engineering microbiology
研究论文 提出CEM 2.0框架,通过整合极端微生物蛋白质组数据库、基于ProteinBERT的多维评估器和交互式挖掘流程,实现不依赖模板的极端微生物蛋白质挖掘 不依赖预定义模板和领域知识,利用共进化引导和蛋白质语言模型实现全蛋白质宇宙的极端微生物蛋白质挖掘 仅通过湿实验和已发表研究的计算验证,未进行大规模实验筛选;数据库覆盖六种极端特征可能不全面 开发不依赖现有模板的极端微生物蛋白质挖掘方法,全面探索全蛋白质宇宙中的功能性极端微生物蛋白质 极端微生物蛋白质 机器学习 NA 蛋白质语言模型、共进化分析 ProteinBERT 蛋白质序列 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术, 合成生物学
131 2026-10-25
Microbial shaping of fermented dairy product quality: formation mechanisms and regulatory strategies for texture, flavor, and functionality
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 本文综述了微生物如何调控发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)的质构、风味和功能特性的形成机制,并探讨了基于基因编辑、合成生物学和AI驱动过程控制的调控策略 通过跨产品比较微生物作用机制,提出从经验实践向可预测、设计导向的发酵乳制品制造转型的框架 作为综述性文章,未提供原始实验数据验证所提出的调控策略 阐明微生物调控发酵乳制品质构、风味和功能代谢物合成的机制,并讨论合理设计微生物功能和精准发酵管理的新兴策略 发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)及其微生物代谢活动 食品微生物学 NA NA NA 文本 NA 基因编辑, 合成生物学 NA NA 食品, 医学
132 2026-10-25
From bioreactor to table: reinventing future protein supply through cellular agriculture
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述细胞培养肉和精密发酵两条细胞农业核心路径的技术进展、产业化挑战与未来前景 将细胞培养肉与精密发酵两条路径纳入统一分析框架,并强调智能化与自动化作为从菌株筛选到生物工艺优化的关键催化剂,同时深入考察感官特征、消费者心理与监管框架等市场社会因素 作为综述文章未提供原始实验数据,成本、技术与公众认知方面的挑战仍然存在,细胞农业目前定位为传统蛋白质系统的补充而非替代 系统审视细胞农业中细胞培养肉与精密发酵的技术进步、产业化瓶颈及未来发展方向 细胞培养肉、精密发酵及其生产的肉类、乳制品和蛋类等替代蛋白产品 细胞农业、食品生物技术、合成生物学 NA 细胞培养、精密发酵、合成生物学工程化细胞工厂 NA 文献 NA 合成生物学 NA 高效细胞工厂(代谢工程改造的微生物细胞工厂) 食品、工业生物技术
133 2026-10-25
Lactic acid bacteria bacteriocins: From antimicrobial mechanisms to next-generation applications in the food industry
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述乳酸菌细菌素的分类、作用机制及其在食品工业中的应用,并探讨基因组学、合成生物学和计算设计驱动的新一代发展方向 整合基因组挖掘工具(如antiSMASH)、CRISPR代谢工程、机器学习活性预测、生成式AI从头设计肽以及刺激响应材料等前沿技术,提出从发现到生产、设计到应用的完整发展路径 乳酸菌细菌素面临产量低、纯化成本高、抗菌谱窄以及在复杂食品基质中不稳定等商业化挑战 为乳酸菌细菌素从有前景的天然产物发展为多功能新一代食品保鲜工具提供指导 乳酸菌细菌素(核糖体合成的抗菌肽) 合成生物学, 食品科学, 计算生物学 NA 基因组挖掘, CRISPR, 机器学习, 生成式人工智能, 计算设计 机器学习, 生成式AI 文本 NA CRISPR-Cas9, antiSMASH 乳酸菌 NA 食品, 医药
134 2026-10-25
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Nov, Annales pharmaceutiques francaises IF:1.0Q4
综述 本文提出药-微动力学(PMD)框架,用于重新定义活体药物载体的剂量、暴露和控制,并探讨经典PK/PD在活体治疗中的局限性 提出了PMD这一量化递送科学框架,定义了功能暴露积分(F-AUC)、定植效率(CE)、停留时间加权活性(RTWA)、有效功能浓度(EFC)和遗传稳定性指数(GSI)等新指标,将暴露重新概念化为由种群动力学、功能输出动力学、空间药理学和进化动力学四个相互依赖的轴控制的生物过程 作为综述,未提供新的实验数据;PMD框架的实践验证和标准化仍需进一步研究 批判性审视经典PK/PD在建模活体药物载体方面的局限性,形式化PMD的核心原则,并通过三个定量案例研究加以说明 活体药物递送系统,包括益生菌、工程微生物治疗剂和活体生物治疗产品 机器学习, 数字病理学 苯丙酮尿症, 肿瘤, 复发性艰难梭菌感染 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
135 2026-10-25
A practical guide to investigating biomolecular condensates: a comment from the plant community
2026-Nov, Science China. Life sciences
评论 该文从植物学界视角出发,系统梳理研究植物生物分子凝聚物的方法学框架,涵盖计算预测、体外重构、分子动力学模拟、活细胞与超分辨成像、材料性质测量、膜相关凝聚物及合成凝聚物工程 针对植物细胞特有的刚性细胞壁、膨压、质体自发荧光、复杂内膜系统和急性环境响应等挑战,首次系统提出植物凝聚物研究的完整方法学框架与最佳实践 作为评论性文章,未提供原始实验数据,所提方法框架仍需在不同植物体系和凝聚物类型中进一步验证 为植物及更广泛领域的生物分子凝聚物研究建立严谨、可重复且概念一致的研究基础,并探讨其在作物遗传改良和合成生物学中的应用前景 植物细胞中的生物分子凝聚物 细胞生物学 NA 计算预测,体外重构,分子动力学模拟,活细胞成像,超分辨成像,材料性质测量,合成凝聚物工程 NA 文本 NA NA 植物 合成凝聚物工程 农业,合成生物学
136 2026-10-25
Reprogramming Plant Salt Tolerance: A Systems Biology Perspective on Algae-Derived Elicitors and Biostimulants
2026-11, Plant, cell & environment
综述 系统综述藻类及其提取物作为生物刺激素和诱导子通过调控离子稳态、渗透调节、ROS清除和激素信号等机制重编程植物耐盐性的多维互作,并探讨从分子机制到田间应用的转化瓶颈与未来方向 从系统生物学视角整合藻类诱导子与植物防御系统的多维互作,提出结合多组学整合、合成生物学、精准农业和纳米递送系统来充分利用藻类-植物共生体潜力的未来路线 从实验室受控条件到田间规模效力的转化仍是突出瓶颈,且缺乏多因子复合胁迫场景下的作物特异性效力数据 综合评估藻类衍生化合物如何编排植物耐盐性并重编程转录网络,比较其与其他生物刺激素类别的差异,并指明知识空白与未来研究方向 藻类及其生物活性提取物(多糖、植物激素、多元醇)与盐胁迫下的植物防御系统 植物科学 NA NA NA 文本 NA NA 植物 NA 农业
137 2026-10-25
Cordyceps as a multitarget therapeutic platform: biology, bioactive metabolites, and translational challenges
2026-Oct-23, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 系统综述冬虫夏草及相关真菌的生物学、活性代谢物、分子机制及转化应用挑战 将分类学、代谢物生物合成、分子机制与技术创新整合于转化框架中,提出冬虫夏草作为系统级多靶点治疗平台 缺乏充分的临床验证,存在物种鉴定、化学标准化、药代动力学限制、产品可重复性及安全性评估等问题 全面整合冬虫夏草的分类学、生态学、宿主互作、化学成分、生物合成途径、药理活性及转化前景 冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)、蛹虫草(Cordyceps militaris)、蝉花(Cordyceps cicadae)及相关分类群 微生物学, 药理学, 合成生物学 癌症, 炎症性疾病, 代谢性疾病, 神经退行性疾病 基因组学, 转录组学, 代谢组学, 生物合成基因簇分析, 合成生物学, 代谢工程, 精准发酵 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 食品, 工业生物技术
138 2026-10-25
T Cell Receptor-Engineered T Cell Therapy in Solid Tumors: Where We Stand and What's to Come
2026-Oct-23, Annual review of medicine IF:15.1Q1
综述 本文综述了TCR-T细胞疗法在实体瘤中的生物学原理、临床证据、安全性考量及耐药机制,并讨论了未来优化方向 系统总结了TCR-T细胞疗法在实体瘤中的最新临床进展(如afamitresgene autoleucel获批用于滑膜肉瘤),并整合了抗原选择、基因编辑和合成生物学等前沿技术对安全性和疗效的改进 TCR-T细胞疗法仍存在HLA限制、抗原异质性、on-target/off-tumor毒性以及抗原丢失和T细胞耗竭等耐药机制的限制 总结TCR-T细胞疗法在实体瘤中的研究现状并探讨未来优化其治疗潜力的方向 TCR-T细胞疗法及实体瘤患者 肿瘤免疫治疗 实体瘤(包括滑膜肉瘤) T细胞受体工程化T细胞疗法、基因编辑、合成生物学 NA 文本 NA 基因编辑 人类T细胞 NA 医学
139 2026-10-25
Innovative Microbial Chassis for Systems and Synthetic Biology
2026-Oct-22, Advances in biochemical engineering/biotechnology
综述 系统探讨了系统和合成生物学中广泛使用及新兴的微生物底盘系统,涵盖其核心生物学特性、遗传与代谢工程进展及工业应用 系统比较多种微生物底盘在关键性能指标上的差异,提出整合系统与合成生物学的理性底盘设计思路 作为综述章节,未提供原始实验数据,缺乏对具体底盘改造策略的定量验证 为高效、稳健、可放大的生物制造提供理性底盘设计的可操作见解 微生物底盘系统,包括大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌 合成生物学 NA 遗传工程, 代谢工程 NA 文本 NA NA 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 NA 医药, 能源, 工业生物技术
140 2026-10-25
Synthetic activation of gibberellin signalling reveals spatial coordination of root growth
2026-Oct-22, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 该研究开发了合成GA(sGA)与改造的GID1(mGID1)正交系统,用于在拟南芥中细胞特异性激活GA信号,揭示根内皮层和表皮中GA信号的协同作用对根伸长至关重要 开发了sGA-mGID1正交配体-受体系统,sGA与内源GID1结合能力极低,mGID1可选择性识别sGA,实现了体内细胞特异性激活GA信号,为植物激素信号的空间精确重编程提供了通用平台 研究主要基于拟南芥模型,sGA-mGID1系统在其他作物中的适用性和效率尚未验证;对GA运输分子机制的直接证据仍有限 探究GA信号在根不同细胞层中的空间协调作用,并开发可细胞特异性激活GA信号的合成生物学工具 拟南芥(Arabidopsis)根系,包括内皮层和表皮等细胞层 植物合成生物学 NA 化学遗传学正交配体-受体系统、遗传转化、荧光成像 NA 图像、荧光显微数据 NA NA 拟南芥(Arabidopsis thaliana) 正交配体-受体信号激活系统(sGA-mGID1),用于细胞特异性激活赤霉素信号通路 农业、植物合成生物学
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