合成生物学相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点（SynORI）质粒，实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点，实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点，以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点（SynORI），包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-03-21 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用酵母转化相关重组技术开发了一个伪狂犬病病毒基因组组装平台，成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病病毒基因组，并结合CRISPR/Cas9进行体外编辑，实现了快速灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株，且在小鼠中仍能引起致死性感染 | 开发伪狂犬病病毒的基因组编辑平台，以促进减毒疫苗研发和基础研究 | 伪狂犬病病毒PRV-GX-2011株及其合成拯救病毒PRV-GX-Syn1 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9编辑、斑块纯化 | NA | 基因组序列、病毒表型数据 | 使用Vero细胞进行病毒拯救，并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TALEN | 酿酒酵母、Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间非编码区插入egfp基因的合成病毒基因组 | 医学 |
| 3 | 2026-03-17 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统（AEGIS）的核碱基，扩展了三链体形成寡核苷酸（TFOs）对双链DNA的识别能力，实现了在中性pH下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 | 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合，识别出至少12种新的模块化三联体，可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | NA | 扩展三链体形成寡核苷酸的识别空间，以增强对双链DNA的序列特异性识别能力 | 三链体形成寡核苷酸（TFOs）及其与双链DNA的相互作用 | 合成生物学 | NA | 人工扩展遗传信息系统（AEGIS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 核酸纳米技术 |
| 4 | 2026-03-16 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026-Feb-21, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 本文综述了黄曲霉作为食品安全威胁与生物技术资源双重角色的最新研究进展 | 将黄曲霉重新定义为具有双重用途的生物体，既关注其生物安全风险，又挖掘其作为可利用化学多样性资源的潜力 | NA | 系统梳理黄曲霉次级代谢产物的多样性、调控机制及其在生态、致病和生物技术中的应用 | 黄曲霉及其次级代谢产物 | NA | NA | 真菌基因组学、代谢组学、基因组挖掘、CRISPR技术、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学平台 | NA | NA | 医药, 农业 |
| 5 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力，并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性，提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌，可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响，并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台，通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序，实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台，将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合，实现了可编程的翻译调控，突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平，未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具，用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 7 | 2026-03-14 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文是一篇叙述性综述，探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 | 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”，用于靶向调控肠道-心脏轴，并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 | 存在显著的转化障碍，包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力，探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢）及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索（PubMed, Scopus, Web of Science），叙述性综合分析 | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-03-13 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb-19, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 本文系统综述了虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新兴控制策略，以应对其在全球变化背景下的公共卫生挑战 | 整合了基因组分析、元流行病学综合和预测建模，并重点评估了CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预和RNAi抗病毒药物等新型控制策略的潜力 | 纳入的研究数量有限（仅12篇），且涉及基因编辑和微生物干预的伦理、生态和监管问题仍需审慎考量 | 理解虫媒病毒的进化机制、传播动力学并评估新兴控制策略，以有效缓解疾病负担 | 登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒和西尼罗河病毒等虫媒病毒及其传播媒介（如蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-03-13 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了进行ENGRAM实验和分析数据的逐步协议，并讨论了该系统的设计考虑、优势、局限性和应用 | 利用prime editing介导的插入实现多路复用信号记录，并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要基本的分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析技能，实验周期为5-6周 | 开发用于测量生物学时间动态的分子记录系统 | 顺式调控元件（CREs）的活性记录 | 合成生物学 | NA | DNA测序，prime editing | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9（prime editing） | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路（ENGRAM），可将瞬时CRE活性转换为稳定的基因组记录 | 医学，工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-03-10 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架，用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 结合了结构感知的TASEP模拟与机器学习抛光模型，无需表达数据或基因组背景，在多种细胞类型中实现高保真预测 | NA | 开发一种工具，用于从RNA序列预测核糖体位置分布，以支持合成生物学中的mRNA序列理性设计 | mRNA序列及其对应的核糖体位置分布 | 机器学习 | NA | 核糖体分析（Ribo-seq）、RNA-seq | 混合框架（结构感知TASEP与抛光模型） | 序列数据 | 多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 12 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS，并调控其细胞内固有代谢途径，实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点，为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台，用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料，以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白（NP）、量子点（QD） | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 13 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架，并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型，为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台，实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用，特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器（ADC）模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |
| 14 | 2026-03-09 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略，包括内源MEP途径操作、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵过程优化 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解，并为有价值的类胡萝卜素和类胡萝卜素衍生物的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-胡萝卜素生物合成途径，包括内源MEP途径和引入的杂合MVA途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 15 | 2026-03-09 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
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综述 | 本文综述了超越传统CRISPR技术的下一代精准工程工具，用于增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果 | 探讨了超越DSB依赖型CRISPR-Cas9的下一代工具（如碱基编辑器、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路）的协同整合，以解决CAR-NK细胞临床转化中的关键挑战 | NA | 开发能够持久、强效且安全地对抗血液肿瘤和实体瘤的下一代CAR-NK细胞疗法 | CAR-NK（嵌合抗原受体自然杀伤）细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 表观遗传编辑器, CRISPR相关转座酶 | NK细胞 | 逻辑门控靶向、免疫调节载荷、双特异性衔接器、合成/表观遗传回路 | 医学 |
| 16 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统（DFDR），用于同时区分多个核酸序列，并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化，单单元可同时解析18个核酸靶标，比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力，支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统，用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列（包括16S rRNA混合物）和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统（DFDR），基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |
| 17 | 2026-03-08 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired treatments for atopic dermatitis
2026-02-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
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综述 | 本文综述了针对特应性皮炎（AD）的皮肤微生物组靶向治疗方法，包括微生物移植、益生元、益生菌和后生元，并展望了利用合成生物学工程化皮肤细菌作为下一代益生菌的潜力 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为活体生物治疗产品的创新视角，以按需产生AD治疗药物 | NA | 探讨通过调节皮肤微生物组来减少AD感染和炎症的治疗策略 | 特应性皮炎（AD）及其相关的皮肤微生物组，特别是金黄色葡萄球菌 | NA | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 皮肤微生物组中的细菌 | 能够感知皮肤信号（如免疫信号）和环境因素，并按需产生AD治疗药物的合成生物电路 | 医学 |
| 18 | 2026-03-08 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
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综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南，旨在将脂质生物学融入主流细胞生物学实验 | 系统性地将脂质生物学工具整合到分子细胞生物学家熟悉的实验框架中，包括荧光成像、药理学调控、合成生物学平台和光遗传学系统 | 部分方法仍存在技术难度，且作为综述文章未提出原始实验数据 | 为细胞生物学家提供检测和调控膜磷脂的实用工具与方法 | 细胞膜磷脂 | 细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | 可诱导脂质生成或降解的合成生物学平台 | 基础生物学研究 |
| 19 | 2026-03-08 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶（GK）的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义，并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因到翻译后修饰的调控机制，并强调了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域，同时分析了GK作为疾病靶点的抑制剂开发挑战与策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献总结，可能受限于当前研究进展的覆盖范围 | 探讨GK在代谢途径中的关键作用及其与疾病的关联，并评估GK抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 甘油激酶（GK）及其在细胞代谢和疾病中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-03-07 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Feb-28, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 本文综述了利用RNA折纸纳米管构建人工细胞骨架的新兴领域，探讨了其设计策略、功能优势及在合成生物学与纳米技术中的应用前景 | 系统性地提出了利用RNA折纸技术构建可编程仿生细胞骨架网络的创新概念，突出了RNA在共转录折叠、复杂三级结构形成及与细胞机器接口方面的独特优势 | 存在体内稳定性不足和递送效率低等挑战 | 探索RNA折纸纳米管在构建人工细胞骨架中的应用，推动合成细胞工程与RNA纳米技术的发展 | RNA折纸纳米管及其仿生的微管与肌动蛋白丝结构 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生细胞骨架网络（模拟微管与肌动蛋白丝） | 纳米技术, 合成生物学, 医疗 |