合成生物学相关文章
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当前共找到 128 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-07 |
CyanoConstruct: simple platform for cyanobacterial expression construct assembly and translational tuning
2026-02-16, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-01098-7
PMID:41699564
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CyanoConstruct的一锅式DNA构建组装系统，用于在单次Golden Gate反应中生成多基因表达质粒，并可通过选择核糖体结合位点元件独立调控每个基因的翻译效率，应用于蓝细菌工程。 | 提出了一个简单的一锅式组装系统，结合自定义在线工具，允许用户独立调节每个目标基因的核糖体结合位点，从而实现翻译调控，且组装效率和特异性高。 | 没有明确指出局限性。 | 简化蓝细菌中表达构建组装过程，使翻译调控更易用于表达优化。 | 蓝细菌（具体为集胞藻PCC 6803）中的多基因表达构建。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 序列数据 | NA | Golden Gate Assembly | 集胞藻PCC 6803 | 多基因表达构建（基于操纵子） | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-08-06 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 对印度噬菌体研究进行范围综述，评估其对人类健康的影响，并识别研究空白。 | 首次系统性地梳理了印度噬菌体研究，涵盖人类、动物和环境领域，并指出了临床转化和监管方面的关键差距。 | 依赖现有文献，可能存在发表偏倚；纳入研究多为实验室和动物模型，临床转化数据有限。 | 系统调查和分类印度噬菌体研究，重点关注对人类健康的潜在影响。 | 印度背景下的噬菌体研究，包括人类、动物和环境样本。 | 微生物学 | 抗菌素耐药性相关感染 | NA | NA | 文献数据 | 111项研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-07-30 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
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研究论文 | 本研究探索异源核酸（XNAs）在银离子介导的双链体形成和银纳米团簇稳定化中的应用 | 首次证明XNAs能够形成银离子介导的双链体结构，并发现其骨架化学可调控银纳米团簇的光谱特性，为合成生物学和纳米材料提供了新工具 | 未提及具体实验条件优化或长期稳定性分析 | 研究XNAs在金属介导的相互作用和纳米材料形成中的潜力 | 多种骨架组成的异源核酸（XNAs）和DNA对照 | 合成生物学 | NA | 圆二色光谱法、质谱法 | NA | 光谱数据、质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米材料 |
| 4 | 2026-07-29 |
Effector Triggered Susceptibility and Immunity in Bacterial Diseases of Leaf Blight and Streak in Rice
2026-Feb-27, Rice (New York, N.Y.)
DOI:10.1186/s12284-026-00885-w
PMID:41758451
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综述 | 本文综述了水稻细菌性叶片枯病和条斑病中的效应蛋白触发的感病性和免疫机制 | 整合了最新研究成果，详细介绍了TAL效应子和Xops的结构与功能多样性及其宿主靶标，并讨论了利用CRISPR基因编辑、效应子引导育种和合成生物学策略培育广谱持久抗性的新兴方法 | 未解决的关键问题被指出，但未提供具体实验验证 | 总结水稻细菌性叶片枯病和条斑病中效应蛋白触发的感病性和免疫分子机制，并探索可持续病害管理策略 | 水稻及病原菌黄单胞菌（Xoo和Xoc） | 分子植物病理学 | 水稻细菌性叶片枯病、水稻细菌性条斑病 | CRISPR基因编辑 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-07-29 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 利用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对的研究 | 首次利用人工扩展遗传信息系统（AEGIS）中的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸（TFO）的识别空间，发现了至少12种新的模块化三联体，能在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及实际应用中的潜在脱靶效应或体内验证，且仅针对体外酶组装的双链构建体进行验证 | 开发使用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸以实现对双链DNA的序列特异性识别 | 双链DNA中的非标准碱基对，包括标准、损伤和合成碱基对 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对 | NA | 实验数据 | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 6 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用，提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |
| 7 | 2026-07-09 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 介绍一种合成基因回路，能够选择性靶向RAS驱动型癌症 | 通过组合多个RAS传感器构建基因回路，实现了前所未有的高选择性输出蛋白表达 | 暂无明确限制说明 | 开发一种高选择性的合成基因回路，用于靶向RAS突变驱动的癌症治疗 | RAS突变型癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成基因回路 | NA | RAS靶向基因回路，包含多个RAS传感器和一个输出蛋白表达模块 | 医学 |
| 8 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术，实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用，实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成，并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数，以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法，显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性，但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术，用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |
| 9 | 2026-07-06 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 通过大肠杆菌表达的人工随机序列蛋白质实现数据存储与检索 | 将数字数据编码为氨基酸序列并整合到类胶原蛋白模板中，利用大肠杆菌表达实现数据存储；通过胰蛋白酶消化结合LC-MS/MS分析实现完整数据恢复，并展示蛋白质比DNA更高的稳定性以及利用亲和标签实现随机访问和加密数据保护 | 文中未明确提及局限性 | 建立基于蛋白质的数据存储框架，实现高效、稳定的数据存储与检索 | 人工随机序列蛋白质、类胶原蛋白模板、大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 氨基酸序列、数字数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 10 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包，并构建了体内吸收不良生物传感器，以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包，包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式，并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证，对其他肠道环境变化（如pH、氧气）的监测能力尚未探索；小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具，利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型（泻药诱导渗透性腹泻） | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 11 | 2026-07-02 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 在酵母解脂耶氏酵母中成功重建两种植物半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体的生物合成 | 首次在微生物系统中实现了植物来源O-乙酰化半纤维素结构（包括β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖及其乙酰化变体）的从头合成，超越了天然存在的结构多样性 | 未明确讨论产量优化或大规模生产可行性，可能受限于微生物宿主中多糖合成效率及后修饰调控的复杂性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中重建植物半纤维素生物合成途径，生产具有定制化理化性质的功能化多糖 | β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖骨架及其O-乙酰化变体 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达, 乙酰转移酶表达, 寡糖质谱分析, 组成及糖苷键分析 | NA | 质谱数据, 组成分析数据 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 植物来源糖基转移酶及乙酰转移酶表达路径 | 生物材料, 医药, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-02 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 综述酵母在合成生物学改造中产生的应激响应及缓解策略 | 提出了应激感知设计原则，涵盖CRISPR电路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建及数据驱动菌株工程等新兴方法 | 未提及具体实验验证或定量比较不同缓解策略的效果 | 理解合成构建体与酵母应激通路相互作用，开发更稳健的酵母菌株 | 酿酒酵母作为底盘细胞的应激响应机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 应激响应调控回路 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-07-02 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 系统总结了益生菌应激耐受的分子机制及增强策略，并探讨了转化应用中的挑战 | 首次系统整合CRISPR基因编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴技术，提出克服益生菌应激耐受性转化瓶颈的解决方案 | 监管审批和大规模制造等挑战仍需进一步解决 | 阐释益生菌应激耐受机制并评估增强策略，推动其工业应用转化 | 益生菌（包括食品、制药和农业领域使用的菌株） | NA | NA | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米材料辅助递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌（如乳酸菌等） | 应激响应代谢通路、基因调控回路 | 食品, 制药, 农业 |
| 14 | 2026-07-02 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物中生物活性成分的分类、药理特性及其在食品、医药和现代农业等领域中的应用 | 重点探讨了利用合成生物学方法生产薄荷醇以应对传统生产方法的可持续性挑战 | 未具体说明研究方法的局限性，可能缺乏对现有研究不足的深入分析 | 总结薄荷属生物活性成分的分类、药理特性及其工业应用，并探讨合成生物学在解决资源约束方面的潜力 | 薄荷属植物及其生物活性成分（如薄荷醇和黄酮类） | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 15 | 2026-07-02 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 表征了榕树中八种氧化角鲨烯环化酶的功能，揭示了关键酶和一对基因在五环三萜生物合成中的作用 | 首次鉴定出桑科植物中罕见的多功能ψ-蒲公英甾醇合酶FmOSC1，并确定了区分FmOSC1与主要产生α-香树脂醇的FmOSC2的关键氨基酸残基，同时发现了具有广泛底物适应性的细胞色素P450酶FmCYP716A520 | 仅在一个植物物种中进行研究，未涉及体内验证或更广泛的进化分析 | 阐明榕树五环三萜生物合成的关键酶和分子机制，为合成生物学提供生物催化工具 | 榕树的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | 功能表征、酶活性分析 | NA | 序列数据、酶产物数据 | 8种氧化角鲨烯环化酶和1个细胞色素P450酶，以及5个其他植物物种的同源蛋白 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 16 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角，并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征，植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限，酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识，并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌（Glutamicibacter） | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 17 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM，用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束，使模型仅从同义选项中预测掩码密码子，从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义，捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型，推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 18 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
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研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型，用于设计原核生物顺式调控元件（CREs），无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs，从17000个原核生物基因组预训练，零样本预测启动子强度相关性显著提升（平均Spearman相关从0.27提高到0.50），参数减少10^3倍，并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台，用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件（CREs） | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |
| 19 | 2026-06-15 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 系统综述精准发酵技术用于生产新型食品及其可持续应用的研究进展 | 首次在统一框架内整合微生物菌株设计、生物过程工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度，填补了以往产品导向或生物体导向综述的空白 | 存在高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度低及监管不确定性等挑战 | 系统分析精准发酵在可持续食品生产中的进展与挑战 | 精准发酵生产新型食品的相关研究和案例 | NA | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | 37项研究纳入综述 | 代谢途径工程 | 微生物 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-06-08 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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research paper | 采用合成生物学方法设计最小遗传电路，在单细胞系统中实现习惯化、敏感化和间隔学习效应 | 首次通过合成基因回路在单细胞层面复现非联想学习行为，揭示基因调控网络与神经学习系统的时序动力学差异 | 目前仅基于理论模型和计算机模拟，缺乏实验验证数据 | 探索最小遗传电路实现单细胞非联想学习的可行性 | 合成基因回路中的调控元件（激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 合成生物学 | NA | 合成基因回路设计、计算机模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 单细胞生物 | 习惯化回路、敏感化回路、间隔学习效应回路（含激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 基础生物学、合成生物学 |