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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物-CCUS框架下细菌利用CO2合成生物表面活性剂的代谢与工程进展,重点关注厌氧和富CO2体系。 | 揭示了厌氧生物表面活性剂合成与CO代谢的关联,提出合成生物学、通路模块化、系统建模及人工智能整合优化CO2固定与生物表面活性剂合成的潜力。 | 仍面临技术和经济挑战,尚未实现高效规模化应用。 | 探讨微生物碳捕获与生物表面活性剂合成的结合策略,以实现温室气体减排和可持续生物制造。 | 微生物(细菌)的CO2代谢和生物表面活性剂合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统建模、人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 碳固定模块与生物表面活性剂合成通路的耦合设计 | 环境、工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-21 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
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研究论文 | 该研究设计并构建了生物传感器驱动的封装系统,通过自主控制Nissle 1917的荚膜多糖表达来改善细菌癌症治疗的药代动力学特征。 | 首次将生物传感器驱动的荚膜多糖自主调控系统与双态药代动力学模型相结合,实现了对活体治疗药物在体内行为的定量模拟;相比诱导型系统,生物传感器驱动系统能更有效地控制活体药物。 | 双态药代动力学模型仅是捕捉这类新型治疗药物自主特性的第一步,模型参数仍需进一步验证和完善,尚未进行临床转化。 | 设计生物传感器驱动的封装系统以实现细菌癌症治疗的全身递送,并建立药代动力学模型模拟其自主控制行为。 | Nissle 1917大肠杆菌(工程化细菌) | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因电路设计、药代动力学建模 | 双态药代动力学模型 | 模拟数据 | NA | NA | Nissle 1917大肠杆菌 | 基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动基因电路,用于自主控制荚膜多糖的表达 | 医学 |
| 3 | 2026-09-21 |
Navigating the next frontier in biomedicine: breakthroughs and insights in nucleic acid therapeutics
2026-Feb-18, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06966a
PMID:41635917
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综述 | 本文综述了核酸治疗药物(包括反义寡核苷酸、siRNA、miRNA、mRNA和适配体)的最新进展,重点关注其作用机制、化学修饰和递送工程,并讨论了挑战与未来方向 | 系统总结了核酸治疗关键平台的最新进展,并全面概述了化学修饰和递送工程策略(如骨架和糖修饰、GalNAc偶联、脂质纳米颗粒),同时展望了CRISPR基因编辑、合成生物学等未来方向 | 未涉及具体实验数据,仅基于文献综述;未深入讨论某些平台的具体临床转化障碍 | 总结核酸治疗药物的研究进展,分析关键平台、化学修饰和递送系统,并探讨未来发展方向,为核酸药物的开发和临床转化提供战略见解 | 核酸治疗药物,包括反义寡核苷酸、siRNA、miRNA、mRNA和适配体 | 生物医学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-09-21 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸的三链识别空间,实现了对标准、损伤或合成碱基对的中性pH纳摩尔亲和力识别 | 利用AEGIS核碱基扩展了三链识别密码,通过系统评估120种碱基三联体组合,鉴定出至少12种新的模块化三联体,可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向标准、损伤或合成碱基对 | 摘要未明确提及研究限制 | 扩展三链形成寡核苷酸的识别范围,以克服天然核碱基对靶标序列的限制和酸性pH稳定性要求 | 双链DNA,包括含有标准、损伤或合成碱基对的靶标 | 合成生物学 | NA | 三链形成寡核苷酸,人工扩展遗传信息系统 | NA | NA | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学,核酸纳米技术 |
| 5 | 2026-09-21 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-02-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
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综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的构效关系、应用挑战及前沿技术突破,涵盖提取、质量控制、结构修饰和纳米递送等方面的策略 | 系统整合了人工智能、合成生物学和材料科学三大前沿技术在药食同源黄酮类化合物研究中的应用前景,提出了精准营养和个性化医疗的发展方向 | 未涉及具体实验验证数据,缺乏对各项技术策略的定量比较和成本效益分析 | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声辅助提取,微波辅助提取,超临界CO2萃取,UHPLC-MS,指纹图谱,糖基化结构修饰,脂质纳米粒,聚合物纳米粒,微胶囊化技术 | NA | text | NA | NA | NA | NA | 医学,食品 |
| 6 | 2026-09-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 该研究重新设计了pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并开发了合成RNA调节因子控制的兼容性合成复制起点。 | 通过修改天然pMB1复制起点,实现了质粒拷贝数的可调性,并创建了由合成RNA调节因子控制的独立拷贝数控制的兼容性复制起点,展示了合成复制起点模块化响应多种信号的能力,以及多重复制报告的潜力。 | 合成复制起点质粒在E. coli中共同维持了一周,但长期稳定性未评估。 | 设计合成复制起点质粒,以增强质粒的可调性、兼容性和模块化,用于合成生物学。 | 质粒,特别是pMB1复制起点,以及合成RNA调节因子。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 6种兼容性合成复制起点质粒 | NA | E. coli | 合成复制起点 | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-21 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文通过评估分子通路、治疗选择和转化障碍,客观审视了肠道微生物代谢物对心脏保护作用的潜力 | 提出了免疫工程化框架,系统整合了微生物代谢物在心力衰竭和缺血后重构中的心脏保护机制,并探讨了后生元制剂、新型递送系统和合成生物学等创新干预策略 | 存在药代动力学、监管和微生物群异质性等重大转化障碍,缺乏临床验证和监管标准化 | 评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力,分析其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物(包括短链脂肪酸、尿石素、吲哚类、氧化三甲胺和硫化氢等)及其对心血管系统的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-09-20 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part Two
2026-Feb-25, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00524-5
PMID:42183020
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综述 | 本文是两部分文章的第二部分,提出了一种基于心智主义概念(如智能、认知、意向性)的框架来理解生物学及其他领域中的目标导向性 | 强调经验可检验性、发现新能力的丰富性、通过概念和实证工具包操作化术语,以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性,主张放弃生物学中对心智主义概念的还原论排斥 | 文章未提供具体实验数据或案例研究的详细结果,主要侧重于理论框架的阐述和哲学论证 | 探讨如何将目标导向性、智能、认知和意向性等目的论和心智主义术语应用于进化、工程或混合系统,并提供一个可测试的框架来理解生物学中的目标导向性 | 生物系统中的目标导向性,包括进化、工程和混合系统,以及单细胞生物和人类认知 | 生物哲学与理论生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物工程 |
| 9 | 2026-09-20 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或模块化蛋白质域设计的自组装蛋白质纳米笼的工程策略、功能化及其定制化应用前景 | 系统总结了模块化蛋白质设计、相互作用表面的计算设计以及基于机器学习的生成式蛋白质设计等新概念如何革新蛋白质笼的设计,并强调了蛋白质笼组装与解组装可通过化学、生物和物理信号调控 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献的归纳总结,缺乏对具体设计策略的实验验证 | 综述基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白质域设计蛋白质笼的工程策略、功能化方法及定制化工程蛋白质笼的应用机会 | 自组装蛋白质纳米笼及其设计策略 | 合成生物学 | NA | 模块化蛋白质设计、计算蛋白质设计、机器学习生成式蛋白质设计 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-09-18 |
pH-Responsive Biomineralized Probiotic for Self-Amplifying Mucosal Vaccination: Gut-Engineered Antigen Factories Drive Targeted Cervical Tumor Regression
2026-02, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202510404
PMID:41482692
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研究论文 | 本文设计了一种pH响应性生物矿化枯草芽孢杆菌口服生物杂交疫苗(B-BS/E7@M),在肠道中构建抗原工厂持续产生HPV16 E7抗原,用于靶向治疗宫颈癌。 | 首次将合成生物学与刺激响应性生物材料相结合,构建了可自我复制的活体生物治疗系统;利用磷酸钙矿化涂层赋予益生菌胃酸抗性,并通过益生菌-黏膜相互作用延长肠道滞留时间,实现持续抗原暴露和自放大黏膜免疫。 | 研究主要在TC-1小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性;长期口服益生菌疫苗的潜在副作用和免疫耐受问题需进一步评估。 | 开发一种口服生物杂交疫苗,通过肠道工程化抗原工厂实现持续HPV16 E7抗原生产,从而诱导强效黏膜和全身免疫应答,靶向治疗宫颈癌。 | 宫颈癌(HPV16 E7阳性肿瘤),使用TC-1小鼠肿瘤模型和枯草芽孢杆菌作为疫苗载体。 | 机器学习, 数字病理学 | 宫颈癌 | 合成生物学, 生物矿化, 口服疫苗工程, 免疫组化, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | TC-1小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 枯草芽孢杆菌 | pH响应性生物矿化益生菌抗原工厂(B-BS/E7@M),通过磷酸钙矿化涂层和益生菌-黏膜相互作用实现持续抗原生产 | 医学 |
| 11 | 2026-09-14 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-02, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 该研究对Cellvibrio japonicus中参与甘露聚糖代谢后期阶段的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA)进行了生理学和生物化学表征 | 首次对C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段的Mgp130A和EpiA进行了功能突变分析和生化测定,构建了新质粒pJKN5用于互补分析,并发现了缺乏epiA基因的菌株中半乳糖取代的甘露寡糖具有意外的毒性效应 | 研究主要聚焦于C. japonicus这一特定菌株,未验证这些酶在其他细菌中的普适性,且对毒性效应的分子机制未深入探讨 | 阐明C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶的生理重要性和生化活性 | Cellvibrio japonicus中的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) | 合成生物学 | NA | 功能突变分析,生化酶活测定,质粒互补分析 | NA | NA | NA | NA | Cellvibrio japonicus | NA | 医药,工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-14 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 该文章通过范围综述系统梳理了印度噬菌体研究的现状,并重点分析了其对人类健康的意义 | 首次对印度噬菌体研究进行系统性的范围综述,按照应用领域、研究类型和结局进行分类,并明确指出了印度在噬菌体研究转化领域的关键缺口 | 纳入研究大多来自实验室环境,临床和转化研究极少,缺乏临床试验、药代动力学-药效动力学研究、合成生物学方法以及One Health综合监测系统 | 系统调查和分类印度开展的噬菌体研究,重点评估其对人类健康的影响 | 在印度环境中开展的噬菌体或噬菌体治疗相关原创研究,涵盖人类、动物和环境 | 医学 | 抗菌药物耐药性感染 | NA | NA | 文本 | 111项研究(来自5个数据库共4756篇文献筛选后纳入) | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-09 |
The emerging impact of CRISPR and gene editing on global crop improvement
2026-02-14, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-026-00484-x
PMID:41688767
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综述 | 本文综述了CRISPR基因编辑技术在全球作物改良中的应用,涵盖其机制、应用、挑战及未来潜力。 | 系统性地总结CRISPR技术从基因敲除到碱基编辑、引导编辑和表观基因组编辑的扩展应用,并探讨与合成生物学、人工智能和高通量表型分析的整合。 | 面临脱靶效应、监管障碍、伦理问题和公众接受度等挑战,需进一步解决。 | 评估CRISPR技术在提升作物产量、抗逆性、抗病性、营养含量和采后品质方面的作用,并展望其在可持续农业中的前景。 | 全球作物改良中的CRISPR技术应用。 | 农业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9、碱基编辑、引导编辑、表观基因组编辑 | NA | 文本(综述内容) | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9 | 植物 | 基因敲除、碱基编辑、引导编辑、表观基因组编辑 | 农业 |
| 14 | 2026-08-28 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2026-02-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的产量和大小分布的影响,发现带电磷脂能显著提高产量,为优化最小细胞模型制备提供指导。 | 首次系统研究脂质组成对反相乳液法中脂质体产量和大小分布的影响,揭示了带电磷脂和小头基脂质在提升产量方面的作用 | 研究仅限于特定磷脂类型(基于蛋PC),未涵盖其他脂质种类,且离心方法可能掩盖某些脂质效应 | 评估不同磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的数量和大小分布的影响,以优化最小细胞模型的制备方案 | 由蛋PC及部分替代的磷脂形成的脂质体 | 合成生物学 | NA | 反相乳液法 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-08-07 |
CyanoConstruct: simple platform for cyanobacterial expression construct assembly and translational tuning
2026-02-16, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-01098-7
PMID:41699564
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CyanoConstruct的一锅式DNA构建组装系统,用于在单次Golden Gate反应中生成多基因表达质粒,并可通过选择核糖体结合位点元件独立调控每个基因的翻译效率,应用于蓝细菌工程。 | 提出了一个简单的一锅式组装系统,结合自定义在线工具,允许用户独立调节每个目标基因的核糖体结合位点,从而实现翻译调控,且组装效率和特异性高。 | 没有明确指出局限性。 | 简化蓝细菌中表达构建组装过程,使翻译调控更易用于表达优化。 | 蓝细菌(具体为集胞藻PCC 6803)中的多基因表达构建。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 序列数据 | NA | Golden Gate Assembly | 集胞藻PCC 6803 | 多基因表达构建(基于操纵子) | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-07-30 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
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研究论文 | 本研究探索异源核酸(XNAs)在银离子介导的双链体形成和银纳米团簇稳定化中的应用 | 首次证明XNAs能够形成银离子介导的双链体结构,并发现其骨架化学可调控银纳米团簇的光谱特性,为合成生物学和纳米材料提供了新工具 | 未提及具体实验条件优化或长期稳定性分析 | 研究XNAs在金属介导的相互作用和纳米材料形成中的潜力 | 多种骨架组成的异源核酸(XNAs)和DNA对照 | 合成生物学 | NA | 圆二色光谱法、质谱法 | NA | 光谱数据、质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米材料 |
| 17 | 2026-07-29 |
Effector Triggered Susceptibility and Immunity in Bacterial Diseases of Leaf Blight and Streak in Rice
2026-Feb-27, Rice (New York, N.Y.)
DOI:10.1186/s12284-026-00885-w
PMID:41758451
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综述 | 本文综述了水稻细菌性叶片枯病和条斑病中的效应蛋白触发的感病性和免疫机制 | 整合了最新研究成果,详细介绍了TAL效应子和Xops的结构与功能多样性及其宿主靶标,并讨论了利用CRISPR基因编辑、效应子引导育种和合成生物学策略培育广谱持久抗性的新兴方法 | 未解决的关键问题被指出,但未提供具体实验验证 | 总结水稻细菌性叶片枯病和条斑病中效应蛋白触发的感病性和免疫分子机制,并探索可持续病害管理策略 | 水稻及病原菌黄单胞菌(Xoo和Xoc) | 分子植物病理学 | 水稻细菌性叶片枯病、水稻细菌性条斑病 | CRISPR基因编辑 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业 |
| 18 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合,聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用,提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |
| 19 | 2026-07-09 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 介绍一种合成基因回路,能够选择性靶向RAS驱动型癌症 | 通过组合多个RAS传感器构建基因回路,实现了前所未有的高选择性输出蛋白表达 | 暂无明确限制说明 | 开发一种高选择性的合成基因回路,用于靶向RAS突变驱动的癌症治疗 | RAS突变型癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成基因回路 | NA | RAS靶向基因回路,包含多个RAS传感器和一个输出蛋白表达模块 | 医学 |
| 20 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术,实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用,实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成,并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数,以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法,显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性,但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术,用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |