合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-04-30
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews IF:4.9Q1
review 综述了小沟四联体(MGTs)作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 揭示了MGT能稳定i-motif结构,使其在中性pH下折叠,并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型,同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 合成生物学 NA 荧光光谱、化学修饰(2'-氟取代、荧光胞苷类似物) NA NA NA NA NA i-motif纳米结构(含MGT封盖) 生物传感, 纳米技术, 合成生物学
2 2026-04-26
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
综述 系统调查并分类印度开展的噬菌体研究,重点关注其对人类健康的影响 首次系统梳理印度噬菌体研究现状,识别关键差距:缺乏监管框架、临床试验、药代动力学-药效学研究、合成生物学方法和一体化健康监测体系 纳入研究以实验室研究为主,临床与转化研究极少;缺乏人体试验和临床试验设计 评估印度噬菌体研究对人类健康的意义,并指出未来发展方向 印度环境下的噬菌体或噬菌体疗法研究(涉及人类、动物或环境样本) 机器学习 传染病 NA NA 文献数据 111篇研究文献 NA NA NA 医学
3 2026-04-19
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Feb-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
综述 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物光呼吸旁路,以克服光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调通过重编程乙醇酸代谢生产高价值代谢物的策略 NA 克服C3植物光呼吸的碳损失限制,提高光合效率 植物光呼吸旁路 合成生物学 NA NA NA NA NA 合成生物学 植物 光呼吸旁路,包括叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路 农业
4 2026-04-19
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法,将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合,以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 NA 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 大肠杆菌中的启动子序列设计,特别是以LacI为例的转录因子调控机制 合成生物学 NA 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 热力学框架模型 序列数据、实验测量数据 NA NA 大肠杆菌 可调控启动子设计,涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 工业生物技术
5 2026-04-17
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites IF:3.4Q2
综述 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制,并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 系统总结了宿主来源的化学信号(如根系分泌物和氧脂素)作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇(BGCs)的主要触发因素,并批判性地评估了空间代谢组学(如MALDI-MSI)在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 本文是一篇综述,未报告原始实验数据,其结论基于对过去十年文献的系统调查,可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制,并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 药用植物及其相关的内生真菌 NA NA 空间代谢组学(MALDI-MSI)、共培养模型、植物体内模型、结构解析 NA NA NA NA 药用植物,内生真菌 NA 医药,工业生物技术
6 2026-04-13
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过将数字数据编码为氨基酸序列并整合到胶原样蛋白模板中,利用大肠杆菌表达非天然蛋白质进行数据存储,并通过胰蛋白酶消化和LC-MS/MS分析实现数据检索 开发了一种基于非天然蛋白质的数据存储和检索框架,利用胶原样蛋白模板和选择性氨基酸与精氨酸间隔实现高稳定性数据存储,并支持随机访问和加密数据保护 未提及具体的数据存储容量限制或表达效率的量化分析 建立基于蛋白质的数据存储和检索系统 非天然蛋白质和数据存储技术 合成生物学 NA LC-MS/MS分析、胰蛋白酶消化 NA 数字数据编码的氨基酸序列 NA 大肠杆菌表达系统 大肠杆菌 胶原样蛋白模板用于数据编码 数据存储、合成生物学、蛋白质工程
7 2026-04-10
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文利用RNA纳米技术在E. coli中设计并表达非天然的无膜细胞器,通过分支RNA基序的共转录组装实现正交、非混合的凝聚体,并嵌入蛋白质结合适体实现选择性蛋白质招募 采用RNA纳米技术设计合成生物分子凝聚体,实现算法控制相互作用、客户亲和力及凝聚体微结构,相比基于肽构建块或重复RNA序列的现有方案更具创新性 NA 设计合成生物分子凝聚体以模拟天然无膜细胞器功能,并应用于细胞和代谢工程 E. coli中的合成无膜细胞器 合成生物学 NA RNA纳米技术 NA NA NA NA E. coli 基于分支RNA基序通过碱基配对相互作用组装的无膜细胞器,具有蛋白质结合适体嵌入功能 工业生物技术
8 2026-04-09
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2
综述 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面,探讨了其工业应用及合成生物学进展 整合了CO2利用、生物技术和数字创新,提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 面临技术和经济挑战,具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略,以实现温室气体减排和可持续生物制造 微生物(细菌)在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 合成生物学 NA 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly 细菌(具体种类未指定) 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 环境, 工业生物技术
9 2026-04-09
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,并建立了变异模型以指导实验设计 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析,并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响,建立减少变异性的实验设计框架 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 合成生物学 NA 农杆菌浸润瞬时表达技术 变异统计模型 植物基因表达数据 1915株植物(三年纵向数据) 农杆菌介导的基因递送 本氏烟草 瞬时基因表达系统 农业, 工业生物技术
10 2026-04-06
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre IF:2.9Q1
综述 本文综述了生物膜与合成生物学交叉领域的最新进展,探讨了利用合成生物学工具调控生物膜行为以应对生物技术挑战的策略 系统整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物群落设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰及抗菌肽涂层表面等多种前沿策略,实现对生物膜结构、组成和代谢产物的精确操控 仍面临生物安全性、异质性、可扩展性及法规合规性等挑战 探索合成生物学工具在生物膜工程中的应用,以推动其在生物技术领域的转化 生物膜(微生物群落)及其工程化调控 合成生物学 NA 噬菌体疗法、电遗传系统、群体感应调控、遗传电路工程、胞外聚合物修饰 NA NA NA 遗传电路 微生物群落 逻辑门、生物传感器等遗传电路用于调控生物膜行为 环境, 能源, 工业生物技术
11 2026-03-29
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略,涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别,包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂,并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 作为综述文章,未提供原始实验数据,且可能未涵盖所有最新研究进展 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略,以开发可持续的抗微生物控制工具 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子(如AHLs、寡肽、AI-2) NA NA 合成生物学、CRISPR技术 NA NA NA CRISPR NA 工程化群体感应电路 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理
12 2026-03-29
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica IF:4.3Q2
研究论文 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术,开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台,成功拯救并表征了功能性病毒 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组,并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因,实现了快速、灵活的基因组修饰 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株,且在小鼠中仍能引起致死性感染,表明毒力未完全减弱 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台,以促进基础研究和疫苗载体开发 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 合成生物学 伪狂犬病 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 基因组序列 使用Vero细胞进行病毒拯救,并在BALB/c小鼠中进行感染实验 CRISPR-Cas9, TAR 酵母, Vero细胞 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 医学
13 2026-03-25
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析,总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角,系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素,并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 NA 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 合成生物学 NA 异源表达、基因组工程、组合生物合成 NA 文献数据 超过450项同行评议研究 合成生物学工具 链霉菌 生物合成基因簇表达平台 药物发现
14 2026-03-25
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展,强调计算工具与合成生物学方法的整合 提出将计算建模(如同源建模、分子对接、分子动力学模拟)和深度学习策略与传统技术相结合,加速定制化天然产物类似物的发现与组装 NA 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径,以发现和设计新型天然产物 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 合成生物学 NA 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 深度学习模型 NA NA NA NA NA 医药
15 2026-03-25
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够高效整合大于50 kb的大片段DNA,并实现100%的正确靶向富集 NA 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 人类多能干细胞 合成生物学 NA 分子生物学、标准细胞培养技术 NA NA NA Bxb1整合酶,Cre重组酶 人类多能干细胞 基因整合平台,包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 医学,药物发现
16 2026-03-21
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 NA 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 质粒复制起点和合成RNA调节器 合成生物学 NA 合成生物学工程 NA NA NA Gibson Assembly, BioBrick E. coli 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 工业生物技术
17 2026-03-17
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
研究论文 本文通过使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基,扩展了三链体形成寡核苷酸(TFOs)对双链DNA的识别能力,实现了在中性pH下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种新的模块化三联体,可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA NA 扩展三链体形成寡核苷酸的识别空间,以增强对双链DNA的序列特异性识别能力 三链体形成寡核苷酸(TFOs)及其与双链DNA的相互作用 合成生物学 NA 人工扩展遗传信息系统(AEGIS) NA NA NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 核酸纳米技术
18 2026-03-16
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 自然微生物和合成遗传电路 合成生物学 NA 遗传电路设计 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 细菌 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 环境, 工业生物技术
19 2026-03-14
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台,通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序,实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台,将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合,实现了可编程的翻译调控,突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 观察到可测量的基础移码水平,未来可能需要额外策略进行进一步优化 开发可编程的翻译调控工具,用于遗传电路设计和合成生物学应用 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 合成生物学 NA 蛋白质诱导的核糖体移码 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 大肠杆菌 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 生物传感、生物治疗
20 2026-03-14
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
综述 本文是一篇叙述性综述,探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”,用于靶向调控肠道-心脏轴,并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 存在显著的转化障碍,包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力,探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 肠道微生物代谢物(如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢)及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 NA 心血管疾病 系统文献检索(PubMed, Scopus, Web of Science),叙述性综合分析 NA 文本(文献数据) NA 合成生物学 NA NA 医学
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