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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够高效整合大于50 kb的大片段DNA,并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶,Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台,包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学,药物发现 |
| 42 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 43 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 44 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台,通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序,实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台,将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合,实现了可编程的翻译调控,突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平,未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具,用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 45 | 2026-03-14 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文是一篇叙述性综述,探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 | 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”,用于靶向调控肠道-心脏轴,并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 | 存在显著的转化障碍,包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力,探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物(如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢)及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索(PubMed, Scopus, Web of Science),叙述性综合分析 | NA | 文本(文献数据) | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 46 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台,结合长读和短读测序技术,用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱,以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术,实现了对超过10^6个基因电路设计(长度5-20 kb)在单次实验中的定量评估,揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学,通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射,以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计,包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序(NGS) | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计,长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路,包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS,并调控其细胞内固有代谢途径,实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点,为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台,用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料,以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白(NP)、量子点(QD) | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 48 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架,并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型,为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台,实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用,特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器(ADC)模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |
| 49 | 2026-03-09 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略,包括内源MEP途径操作、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵过程优化 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解,并为有价值的类胡萝卜素和类胡萝卜素衍生物的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-胡萝卜素生物合成途径,包括内源MEP途径和引入的杂合MVA途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 50 | 2026-03-09 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
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综述 | 本文综述了超越传统CRISPR技术的下一代精准工程工具,用于增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果 | 探讨了超越DSB依赖型CRISPR-Cas9的下一代工具(如碱基编辑器、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路)的协同整合,以解决CAR-NK细胞临床转化中的关键挑战 | NA | 开发能够持久、强效且安全地对抗血液肿瘤和实体瘤的下一代CAR-NK细胞疗法 | CAR-NK(嵌合抗原受体自然杀伤)细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 表观遗传编辑器, CRISPR相关转座酶 | NK细胞 | 逻辑门控靶向、免疫调节载荷、双特异性衔接器、合成/表观遗传回路 | 医学 |
| 51 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统(DFDR),用于同时区分多个核酸序列,并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化,单单元可同时解析18个核酸靶标,比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力,支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统,用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列(包括16S rRNA混合物)和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统(DFDR),基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |
| 52 | 2026-03-08 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired treatments for atopic dermatitis
2026-02-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
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综述 | 本文综述了针对特应性皮炎(AD)的皮肤微生物组靶向治疗方法,包括微生物移植、益生元、益生菌和后生元,并展望了利用合成生物学工程化皮肤细菌作为下一代益生菌的潜力 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为活体生物治疗产品的创新视角,以按需产生AD治疗药物 | NA | 探讨通过调节皮肤微生物组来减少AD感染和炎症的治疗策略 | 特应性皮炎(AD)及其相关的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | NA | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 皮肤微生物组中的细菌 | 能够感知皮肤信号(如免疫信号)和环境因素,并按需产生AD治疗药物的合成生物电路 | 医学 |
| 53 | 2026-03-08 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
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综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南,旨在将脂质生物学融入主流细胞生物学实验 | 系统性地将脂质生物学工具整合到分子细胞生物学家熟悉的实验框架中,包括荧光成像、药理学调控、合成生物学平台和光遗传学系统 | 部分方法仍存在技术难度,且作为综述文章未提出原始实验数据 | 为细胞生物学家提供检测和调控膜磷脂的实用工具与方法 | 细胞膜磷脂 | 细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | 可诱导脂质生成或降解的合成生物学平台 | 基础生物学研究 |
| 54 | 2026-03-08 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶(GK)的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义,并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因到翻译后修饰的调控机制,并强调了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域,同时分析了GK作为疾病靶点的抑制剂开发挑战与策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能受限于当前研究进展的覆盖范围 | 探讨GK在代谢途径中的关键作用及其与疾病的关联,并评估GK抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 甘油激酶(GK)及其在细胞代谢和疾病中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 55 | 2026-03-07 |
SSB-mediated enhancement of argonaute activity triggers SOS filamentation in bacteria
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag175
PMID:41736547
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研究论文 | 本研究揭示了嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)在细菌中过表达会通过破坏细胞分裂检查点,引发暂时的细菌丝状化现象 | 首次发现SSB蛋白与TtAgo相互作用,将其招募到复制叉,增强其DNA结合活性,从而调控细菌细胞周期和DNA修复途径 | 研究主要基于模式细菌(嗜热栖热菌和大肠杆菌),在其他细菌中的普适性尚未验证 | 探究原核Argonaute蛋白在细菌生理学中的作用及其调控机制 | 嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)及其与SSB蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 扫描电子显微镜、核DNA染色、截短蛋白变体分析 | NA | 显微图像、分子相互作用数据 | 嗜热栖热菌和大肠杆菌两种细菌模型 | NA | 嗜热栖热菌, 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 56 | 2026-03-07 |
Harnessing Endophytic Fungi as a Sustainable Source of Novel Anticancer Agents: Opportunities, Challenges, and Future Directions
2026-Feb-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040693
PMID:41752469
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综述 | 本文综述了内生真菌作为可持续抗癌药物新来源的潜力、挑战及未来方向 | 强调内生真菌作为结构多样抗癌代谢物的未充分开发来源,并探讨了OSMAC、共培养、表观遗传激活等增强发现和产量的策略 | NA | 探索内生真菌作为可持续、低毒性抗癌药物的来源,以克服现有疗法的局限性 | 内生真菌及其产生的抗癌代谢物(如生物碱、萜类、聚酮化合物和肽类) | NA | 癌症 | OSMAC、微生物共培养、表观遗传激活、基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 57 | 2026-03-07 |
CRISPR-Mediated Silkworm: The Oncoming Agricultural Revolutions and a Rising Model Organism
2026-Feb-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17020230
PMID:41751614
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综述 | 本文综述了CRISPR基因组编辑技术在蚕中的应用,强调了其在蚕的疾病抗性、产量提升和新材料开发方面的突破,并探讨了CRISPR、泛基因组学和人工智能交叉领域的新方向 | 将CRISPR技术从简单基因敲除扩展到大规模全基因组筛选,并结合人工智能预测CRISPR结果,为蚕的分子育种和合成生物学提供新方法 | NA | 总结蚕基因组编辑的进展,探讨CRISPR技术在蚕农业和生物制造中的应用前景 | 蚕(家蚕) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蚕(家蚕) | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 58 | 2026-03-02 |
Artificial Intelligence and the Discovery of Antibiotics: Reinventing with Opportunities, Challenges, and Clinical Translation
2026-Feb-23, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15020233
PMID:41750530
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综述 | 本文综述了人工智能在加速和优化抗生素发现过程中的作用,包括虚拟筛选、新分子设计和早期测试等环节 | 系统性地探讨了人工智能与合成生物学、纳米技术和多组学数据的协同作用,作为下一代抗菌方法的核心组成部分 | 存在数据缺乏、算法偏见以及研究与临床应用之间的转化鸿沟等问题 | 探讨人工智能在应对抗菌素耐药性威胁、加速新型抗生素发现中的应用与挑战 | 小分子抗生素和抗菌肽 | 机器学习 | NA | 机器学习、深度学习、自然语言处理、生成模型 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 59 | 2026-03-02 |
Preclinical Evaluation of Synthetic Biology-Driven Engineered Escherichia coli Nissle 1917 as a Living Therapeutic for Sustained L-DOPA Delivery
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00786
PMID:41628253
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法开发了一种基于益生菌的活体生物治疗系统,用于持续稳定地递送L-DOPA,以缓解帕金森病的运动症状 | 首次构建了基于质粒的L-DOPA表达型大肠杆菌Nissle 1917益生菌株,实现了在体内持续稳定地递送L-DOPA,相比传统口服给药方式具有更好的治疗效果 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验;工程菌株的长期安全性和稳定性需要进一步评估 | 开发一种用于帕金森病治疗的、基于工程化益生菌的活体生物治疗系统 | 帕金森病小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | 合成生物学方法 | NA | NA | 小鼠模型 | 质粒工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | L-DOPA表达系统 | 医学 |
| 60 | 2026-03-02 |
From Waste to Worth: The Role of Fermentation in a Sustainable Future
2026-Feb-12, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040664
PMID:41750856
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综述 | 本文综述了发酵技术在可持续生物技术中的作用,重点介绍了其如何将农业和食品废弃物转化为高附加值产品,并探讨了其在循环生物经济、健康调节以及未来可持续食品系统中的潜力 | 系统阐述了发酵技术如何整合环境、营养和经济挑战,并强调了精准发酵和合成生物学在无动物、非传统农业方式生产特定食品成分方面的突破性进展 | 指出了限制该技术规模化应用的关键技术和监管障碍 | 探讨发酵技术在可持续未来中的作用,特别是其在废弃物资源化、循环生物经济及健康促进方面的应用 | 发酵过程、有机废弃物(农业和食品残留物)、高附加值产品(生物活性化合物、有机酸、生物燃料、酶、蛋白质)以及相关微生物 | NA | NA | 发酵技术、精准发酵、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 食品, 医疗保健, 环境, 能源, 工业生物技术 |