合成生物学相关文章
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当前共找到 125 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-06 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit（CTK），一个基于Golden Gate的模块化克隆系统，扩展了Yeast Toolkit用于大肠杆菌的遗传电路构建 | 通过将启动子细分为子部件（启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点），增强了对转录和翻译的灵活控制，并提供预组装的NOT门基本部件以加快大型遗传电路的克隆 | 未明确讨论该工具包在大规模复杂电路设计中的潜在挑战或与其他系统的直接性能比较 | 为大肠杆菌提供一个快速高效的遗传电路组装模块化工具包，填补细菌合成生物学基础设施的关键空白 | 大肠杆菌中的遗传电路 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | 校准模型 | 表征数据 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 遗传电路，NOT门，可诱导和组成型启动子 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 42 | 2026-06-05 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 系统总结了定点敲入技术在基因编辑中的最新进展 | 整合了位点特异性重组酶（如Bxb1整合酶）和可编程核酸酶系统（如CRISPR/Cas9）的最新进展，并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 实际应用中仍受脱靶活性和低效率的限制 | 提高基因敲入的精确性和效率，推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统和可编程核酸酶系统 | 基因编辑 | NA | 位点特异性重组酶系统（Bxb1整合酶）、CRISPR/Cas9、Cas9-Bxb1整合酶系统、twinPE+Bxb1、PASTE | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 精准医学、合成生物学 |
| 43 | 2026-06-03 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 通过多层次的宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译活性 | 首次结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主改造，实现了CrPV IRES介导翻译活性数量级的提升 | 仅建立了概念验证框架，未具体量化各改造步骤对翻译效率的独立贡献，且可能存在工程菌株生长适应性代价 | 通过宿主工程策略提高CrPV IRES在酿酒酵母中的翻译效率，以扩展其在合成生物学中的RNA调控应用 | 酿酒酵母宿主菌株及CrPV IRES报告系统 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、基因工程改造 | NA | 报告基因表达数据 | 多个改造菌株（具体数量未明示） | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CrPV IRES介导的非经典翻译调控元件 | 合成生物学 |
| 44 | 2026-06-03 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 综述利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落的最新进展 | 系统总结了利用噬菌体递送各种CRISPR-Cas效应器进行精准基因组编辑和原位扰动的方法 | 部署的系统发育广度仍存在挑战 | 讨论利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落 | 微生物群落和噬菌体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体工程 | 细菌, 宿主环境 | CRISPR有效载荷, 精准基因组编辑 | 医学, 食品, 农业 |
| 45 | 2026-05-26 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 系统综述虫媒病毒在气候变化背景下的进化动态、宿主-媒介互作及新型防控策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模的多学科框架，系统阐述CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预及mRNA疫苗等新型防控策略 | 伦理、生态和监管问题（如基因编辑和微生物干预）需进一步考量 | 理解虫媒病毒进化机制、宿主-媒介互作及新型控制策略以有效缓解疾病 | 登革病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等虫媒病毒及其媒介（蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | 文献数据 | 从16320篇初始文献中筛选出12项高质量同行评审研究 | CRISPR基因驱动 | 蚊、蜱 | 基因驱动回路、基于RNAi的抗病毒回路 | 医学 |
| 46 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
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综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展，重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略，实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用，以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能，并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 47 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体（MGTs）作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构，使其在中性pH下折叠，并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型，同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰（2'-氟取代、荧光胞苷类似物） | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构（含MGT封盖） | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 48 | 2026-04-19 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法，结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 | 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法，将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合，以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计，特别是以LacI为例的转录因子调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 | 热力学框架模型 | 序列数据、实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计，涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 | 工业生物技术 |
| 49 | 2026-04-17 |
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16030164
PMID:41893315
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制，并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 | 系统总结了宿主来源的化学信号（如根系分泌物和氧脂素）作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇（BGCs）的主要触发因素，并批判性地评估了空间代谢组学（如MALDI-MSI）在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 | 本文是一篇综述，未报告原始实验数据，其结论基于对过去十年文献的系统调查，可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 | 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制，并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 | 药用植物及其相关的内生真菌 | NA | NA | 空间代谢组学（MALDI-MSI）、共培养模型、植物体内模型、结构解析 | NA | NA | NA | NA | 药用植物，内生真菌 | NA | 医药，工业生物技术 |
| 50 | 2026-04-10 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在E. coli中设计并表达非天然的无膜细胞器，通过分支RNA基序的共转录组装实现正交、非混合的凝聚体，并嵌入蛋白质结合适体实现选择性蛋白质招募 | 采用RNA纳米技术设计合成生物分子凝聚体，实现算法控制相互作用、客户亲和力及凝聚体微结构，相比基于肽构建块或重复RNA序列的现有方案更具创新性 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以模拟天然无膜细胞器功能，并应用于细胞和代谢工程 | E. coli中的合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | E. coli | 基于分支RNA基序通过碱基配对相互作用组装的无膜细胞器，具有蛋白质结合适体嵌入功能 | 工业生物技术 |
| 51 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源，并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析，并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统，结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响，建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana）农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物（三年纵向数据） | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 52 | 2026-03-29 |
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04610-x
PMID:41627464
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综述 | 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略，涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 | 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别，包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂，并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且可能未涵盖所有最新研究进展 | 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略，以开发可持续的抗微生物控制工具 | 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子（如AHLs、寡肽、AI-2） | NA | NA | 合成生物学、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 工程化群体感应电路 | 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理 |
| 53 | 2026-03-29 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术，开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台，成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组，并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因，实现了快速、灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株，且在小鼠中仍能引起致死性感染，表明毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台，以促进基础研究和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组序列 | 使用Vero细胞进行病毒拯救，并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酵母, Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 | 医学 |
| 54 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析，总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角，系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素，并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |
| 55 | 2026-03-25 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展，强调计算工具与合成生物学方法的整合 | 提出将计算建模（如同源建模、分子对接、分子动力学模拟）和深度学习策略与传统技术相结合，加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 56 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台，用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台，能够高效整合大于50 kb的大片段DNA，并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶，Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台，包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学，药物发现 |
| 57 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台，通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序，实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台，将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合，实现了可编程的翻译调控，突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平，未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具，用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 58 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 59 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS，并调控其细胞内固有代谢途径，实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点，为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台，用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料，以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白（NP）、量子点（QD） | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 60 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架，并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型，为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台，实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用，特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器（ADC）模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |