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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-02-16 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究通过分析本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,建立了变异模型并提出了减少变异性的实验设计指南 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行了全面建模分析,并基于三年纵向数据提出了量化实验设计指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不直接适用于其他植物瞬时表达系统 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源并建立减少变异性的实验设计方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异模型、功效分析 | 实验数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 瞬时表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 82 | 2026-02-16 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的NEAR平台,通过酶工程与计算优化相结合,实现了长单链DNA的高纯度合成,并应用于活细胞的高精度诊疗一体化 | 结合phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶于甲酸盐缓冲液中,显著提升了ssDNA的合成长度(达15000 nt)和产率(提升4.73倍),并利用机器学习优化了镁离子动态和热调制等关键参数 | NA | 解决当前DNA纳米技术在合成长单链DNA时面临的高纯度与均质性不足的挑战 | 长单链DNA(ssDNA)的合成技术及其在活细胞诊疗一体化中的应用 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 切口酶辅助复制(NEAR)、固相合成、机器学习优化 | NA | NA | NA | CRISPR | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物,用于核仁素靶向的基因组编辑 | 医学 |
| 83 | 2026-02-16 |
LINC00973/DTX3L Axis Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Serves as a Therapeutic Target
2026-Feb, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70029
PMID:41684454
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA LINC00973在非小细胞肺癌中通过稳定DTX3L蛋白并激活AKT信号通路促进肿瘤进展的机制,并开发了基于外泌体递送siRNA的靶向治疗策略 | 首次发现LINC00973/DTX3L轴在非小细胞肺癌中的致癌作用,并创新性地采用RGD修饰外泌体和合成生物学策略实现靶向治疗 | 未明确LINC00973在肺癌亚型中的特异性表达差异,临床前模型的长期安全性尚未验证 | 探究LINC00973在非小细胞肺癌中的生物学功能及治疗靶点价值 | 非小细胞肺癌组织样本、肺癌细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 高通量测序、功能获得/缺失实验、外泌体递送技术、合成生物学 | NA | RNA测序数据、临床病理数据、体内外实验数据 | 配对的NSCLC肿瘤组织与癌旁组织样本(具体数量未说明) | 合成生物学技术 | 小鼠模型、肝脏细胞(用于外泌体生产) | 基于肝脏生产携带靶向siRNA外泌体的合成生物学系统 | 医学 |
| 84 | 2026-02-15 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在细菌中设计和表达非天然的膜无细胞器 | 采用分支RNA基序通过碱基配对相互作用共转录组装,实现正交、非混合的凝聚体,并嵌入蛋白质结合适配体实现选择性蛋白质招募 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以研究其自然对应物的功能,并用于细胞和代谢工程 | 大肠杆菌中的合成膜无细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成膜无细胞器(凝聚体),具有可逆溶解和重组装特性 | 生物技术 |
| 85 | 2026-02-15 |
The emerging impact of CRISPR and gene editing on global crop improvement
2026-Feb-14, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-026-00484-x
PMID:41688767
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综述 | 本文全面评述了CRISPR基因编辑技术对全球作物改良的影响、机制、应用及未来潜力 | 系统总结了CRISPR技术从基础机制到多样化编辑工具(如碱基编辑、先导编辑、表观基因组编辑)的发展,并探讨了其与合成生物学、人工智能等前沿技术融合的前景 | 存在脱靶效应、监管障碍、伦理问题及公众接受度等挑战 | 探讨CRISPR基因编辑技术在全球作物改良中的应用与影响 | 植物(作物) | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 古菌, 植物 | NA | 农业 |
| 86 | 2026-02-15 |
Design and engineering of photorespiration bypasses in plants
2026-Feb-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物中的光呼吸旁路,以克服C3植物光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 | 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调了一些将乙醇酸代谢导向高价值代谢物生产的策略 | NA | 克服C3植物光呼吸的固有局限性,提高光合效率 | 植物中的光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光呼吸旁路,包括碳释放、碳中性和碳正性旁路,以及乙醇酸代谢重编程 | 农业 |
| 87 | 2026-02-14 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
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综述 | 本文提出并详细阐述了“生命是程序的集合”这一理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 将生命系统抽象为多层次程序集合的理论框架,整合了哲学思想与多学科科学证据,为理解生命本质提供了新的跨学科范式 | 面临“意识难题”等哲学挑战以及合成生物学应用中的伦理争议 | 构建一个统一的理论框架来解释生命的本质、结构与运作机制 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等组成部分) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 88 | 2026-02-13 |
Synthetic germ granules reveal a direct role of Vasa/DDX4 in RNA localization and translational activation
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.01.703065
PMID:41676510
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研究论文 | 本研究通过合成方法从头生成生殖颗粒,揭示了Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用 | 开发了一种合成方法从头生成生殖颗粒,首次证明Vasa/DDX4是连接RNA招募与局部翻译激活的核心因子,且其他DEAD-box解旋酶无法替代 | NA | 探究生殖颗粒中RNA定位和翻译激活的分子机制 | 生殖颗粒、Vasa/DDX4蛋白、内源性生殖颗粒mRNA(如Nanos) | 合成生物学 | NA | 合成方法、正交RNA锚定方法、急性耗竭实验 | NA | NA | NA | PopTag-based scaffold、Gibson Assembly | Caulobacter(衍生)、活体生物 | 合成生殖颗粒、基于Oskar的RNA结合域与Vasa解旋酶的两组分模块 | 医学、基础生物学研究 |
| 89 | 2026-02-13 |
Synthetic biology for phytohormone production
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文批判性地评估了合成生物学方法在植物激素生产中的应用,重点关注生长素、赤霉素和水杨酸这三种对农业至关重要的化合物 | 利用合成生物学方法为植物激素生产提供可持续的替代方案,克服传统生产中的优化和提取难题 | NA | 探索合成生物学在植物激素可持续生产中的应用,以替代农用化学品 | 植物激素,特别是生长素、赤霉素和水杨酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 90 | 2026-02-13 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路工程,探讨了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了CRISPR关联的miRNA响应系统和iFFL架构等最新创新,将应用从被动传感转向治疗干预 | 存在泄漏、细胞资源限制和递送挑战等局限性 | 工程化基于miRNA的合成基因电路,用于传感和解释内源性miRNA水平 | microRNA及其在合成生物学中的工程应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、分层调控策略、iFFL架构 | 医学 |
| 91 | 2026-02-13 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 本研究开发了一种用于Shouchella clausii的高效、无标记、可迭代基因组编辑工具,并验证了其在枯草芽孢杆菌中的适用性 | 开发了首个针对Shouchella clausii的温度敏感型穿梭载体系统,结合Golden Gate组装和两步整合策略,实现了超过60%成功率的无标记基因编辑 | 研究主要针对模式菌株DSM 8716,在其他Shouchella clausii菌株中的适用性尚未验证 | 克服Shouchella clausii的遗传操作障碍,建立高效的基因组编辑平台 | Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、电穿孔转化、Golden Gate组装 | NA | NA | 使用Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168两种细菌菌株 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型E. coli-S. clausii穿梭载体系统,包含抗性标记和荧光报告基因 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 92 | 2026-02-12 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 本文系统总结了位点特异性敲入基因编辑技术的最新进展,包括重组酶和核酸酶系统,并讨论了其在疾病建模和基因治疗中的应用 | 综述了Cas9-Bxb1整合酶系统在实现大片段DNA靶向整合方面的突破,并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 当前技术仍存在脱靶活性和编辑效率低的问题,且跨物种基因组安全港数据库尚未完善 | 提高基因靶向敲入技术的精确性和效率,以推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统(如Bxb1整合酶)和可编程核酸酶系统(如CRISPR/Cas9) | NA | NA | 位点特异性重组酶系统,可编程核酸酶系统,CRISPR/Cas9,多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Bxb1整合酶 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 93 | 2026-02-12 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 本文系统总结了益生菌应激耐受性的分子机制,并评估了包括菌株筛选、适应性进化、基因工程和封装技术在内的现有增强策略 | 强调了基于CRISPR的基因组编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴方法作为克服转化瓶颈的有前景的解决方案 | 与监管批准和大规模制造相关的挑战仍有待解决 | 增强益生菌的应激耐受性,以提高其在生产、储存和应用过程中的存活率和功效 | 益生菌 | NA | NA | CRISPR-based genome editing, synthetic biology, nanomaterial-assisted delivery | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌(未指定具体物种) | NA | 食品, 制药, 农业 |
| 94 | 2026-02-12 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物的分类、药理特性及其生物活性成分的应用 | 探讨了利用合成生物学生产薄荷醇以应对资源环境限制和市场需求的创新方向 | NA | 综述薄荷属植物的生物活性成分及其在食品、医药和现代农业等领域的应用 | 薄荷属植物及其生物活性成分,如薄荷醇和类黄酮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 95 | 2026-02-12 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 本研究功能表征了榕树中的八个氧化角鲨烯环化酶,揭示了它们在生成八种不同三萜醇骨架中的作用,并鉴定了一个罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶及关键残基差异 | 首次在桑科植物中鉴定出罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶,揭示了染色体连锁基因对在羽扇豆烷型衍生物合成中的顺序作用,并发现CYP716A亚家族酶具有保守的催化多功能性 | NA | 阐明榕树中三萜类化合物生物合成的关键酶和基因对 | 榕树中的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 96 | 2026-02-12 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-Feb-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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研究论文 | 本文提出了一种受发育启发的合成肾脏工程策略,利用合成生物学和空间模式工具指导体外多尺度组织结构形成 | 提出'发育工程'新范式,将胚胎肾脏发育的时空线索应用于体外组织构建,通过引导和组织基序的链式组装实现可扩展的工程化组织 | 策略仍处于概念阶段,临床转化面临功能成熟度、细胞类型缺失和可扩展性等挑战 | 开发可用于临床移植的肾脏替代组织 | 干细胞衍生的肾脏组织 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 合成生物学、空间模式控制、组织微环境调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞 | 组织基序引导与链式组装系统 | 医学 |
| 97 | 2026-02-12 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-Feb, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了一种结合丝氨酸/酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够实现>50 kb大片段DNA的精准整合,并通过选择标记优化实现100%的靶向效率 | 平台建立后仍需1.5-3个月完成整个流程,且需要研究人员具备分子生物学和标准细胞培养技能 | 解决哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的技术难题 | 人类多能干细胞(hPS细胞) | 合成生物学 | NA | Bxb1整合酶介导的位点特异性整合,Cre重组酶介导的辅助序列切除 | NA | NA | NA | Bxb1, Cre recombinase | 人类多能干细胞 | 包含选择标记表达条件的基因回路设计,用于确保供体质粒的正确靶向 | 医学, 药物发现 |
| 98 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 99 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 100 | 2026-02-10 |
[Design and synthesis of molecularly imprinted polymers and their applications in medical diagnosis and biocatalysis]
2026-Feb-08, Se pu = Chinese journal of chromatography
DOI:10.3724/SP.J.1123.2025.06013
PMID:41641521
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综述 | 本文综述了分子印迹聚合物(MIPs)的理性设计、功能化制备及其在生物传感、生物催化和生物医学诊疗等领域的跨学科应用 | 提出了三维策略(高通量单体筛选、分子识别机制阐明和功能单元定向组装),开发了具有刺激响应特性的智能MIPs,并建立了从体外传感到体内精准干预的集成智能诊疗平台前沿方向 | 指出了MIPs在印迹层不均匀、模板残留、大分子印迹水相容性有限、工业可扩展性、识别机制不明确以及与微流控和人工智能等新兴领域融合不足等方面的挑战 | 推进分子印迹技术(MIT),开发高性能MIPs,并拓展其在生物医学诊断、生物催化等领域的应用 | 分子印迹聚合物(MIPs) | NA | 心力衰竭、癌症 | 分子印迹技术(MIT)、高通量单体筛选、分子动力学模拟、固相表面印迹法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、环境、制药 |