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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
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综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展,重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产,包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产,以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物(羟基哌啶酸) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 2 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用,通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物,从而维持高尔基体中的半纤维素生产,这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者,以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥(Arabidopsis)的MAN2和MAN5酶,以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-03-16 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于原位检测肿瘤DNA(特别是KRAS突变)的最新进展 | 将基因工程细菌作为活体检测器,结合CRISPR-Cas工具和水平基因转移,实现对肿瘤DNA的特异性识别和可视化报告输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度方面的限制 | 开发基于工程细菌的肿瘤DNA检测方法,以革新癌症诊断和管理 | 肿瘤生成的DNA,特别是驱动多种癌症的KRAS突变 | 合成生物学 | 结直肠癌和胃肠道癌症,以及其他实体肿瘤 | CRISPR-Cas工具、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 独特的遗传电路、多重CRISPR系统、安全电路,用于提高特异性、灵敏度和生物安全性 | 医学 |
| 4 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
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综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用,并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识,并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 5 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
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综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物,影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架,将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来,并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物(如植物化学物质、多糖、复方草药)、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-03-14 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 本文综述了通过单细胞和空间组学技术系统理解植物免疫网络的进展,包括受体激活、基因调控回路、蛋白质互作中心和染色质动态如何共同影响免疫结果 | 整合单细胞和空间组学揭示植物免疫异质性,识别了专门的“PRIMER”细胞和“旁观者”细胞,并探讨了系统与合成生物学方法在作物抗病工程中的应用 | NA | 系统理解植物免疫网络,以指导作物更持久和广谱的抗病性工程 | 植物免疫系统,包括PTI、ETI、SAR层,以及NLR受体、PRIMER细胞和旁观者细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间组学、结构分析、蛋白质组学、互作组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 7 | 2026-03-14 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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研究论文 | 本文探讨了植物基因组中超级增强子如何调控基因簇(特别是生物合成基因簇)的转录,以协调基因的共表达,从而影响特化代谢物的产生 | 揭示了超级增强子在植物生物合成基因簇共表达中的核心作用,并展示了通过CRISPR/Cas技术破坏超级增强子可以改变整个基因簇的表达 | NA | 研究超级增强子介导的基因簇转录调控机制,以促进合成生物学、代谢工程和作物改良 | 植物基因组中的基因簇,包括同源基因簇和生物合成基因簇,特别以拟南芥为例 | 合成生物学 | NA | T-DNA插入、CRISPR/Cas诱导删除、组织特异性染色质可及性数据集分析 | NA | 基因组数据、染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
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综述 | 本文提出并定义了跨界肽(TKPs)的概念,总结了其在植物与微生物相互作用中的功能,并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽(TKPs)作为跨物种生物活性肽的新概念,整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 9 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式:基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法,并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测,以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-03-11 |
PrimeRoot: a cutting-edge technology designed to achieve precise and targeted large DNA insertion in plants
2026-Apr, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04723-0
PMID:41804348
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综述 | 本文综述了PrimeRoot技术,一种用于在植物中实现精确、靶向大DNA插入的尖端技术 | PrimeRoot编辑器通过整合增强的PegRNA设计、改进的植物prime editor系统和先进重组酶,实现了高达11.1 kb DNA片段的精确插入,第三代编辑器进一步提高了不同基因递送系统下的转化精度和效率 | NA | 开发并推广PrimeRoot技术,以支持合成生物学和植物育种中大型DNA插入的染色体整合需求 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | PrimeRoot技术,包括CRISPR、prime editing guide RNA (PegRNA)设计和重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR, PrimeRoot editors | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 11 | 2026-03-10 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学开发的工程微生物作为癌症治疗剂的潜力 | 探讨了工程微生物作为靶向疾病治疗的新兴应用,特别是在癌症治疗中检测疾病标志物并精确递送治疗载荷的能力 | 存在个体间变异性、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用潜力 | 工程微生物及其在癌症治疗中的作用 | 合成生物学 | 胰腺癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 12 | 2026-03-09 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化益生菌和微生物系统作为自调节活体疗法中的应用,以应对代谢性疾病 | 利用合成生物学策略开发工程化微生物作为可持续、自适应的活体疗法,整合精准治疗与生物基生产 | NA | 评估合成生物学如何使工程化益生菌和微生物系统成为代谢性疾病的自我调节活体疗法 | 代谢性疾病(如2型糖尿病、肥胖、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎) | NA | 代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 微生物系统 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢通路 | 医学 |
| 13 | 2026-03-09 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程方法重新推动生物脱硫技术发展的最新进展,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌野生型性能、调控机制、系统生物学和基因工程的最新进展,以及革兰氏阴性菌平台中操纵子重构和底盘设计与工艺限制的融合 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法克服传统加氢脱硫技术对持久性有机硫化合物处理不足的问题 | 中馏分燃料中的持久性有机硫化合物及其生物脱硫途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操纵子重构、底盘设计、染色体整合 | 红球菌、假单胞菌 | 4S脱硫途径、调控逻辑(硫源抑制、遗传调控因子)、操纵子架构(基因顺序、翻译调控) | 能源、工业生物技术 |
| 14 | 2026-03-09 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造微生物以将C2原料转化为高价值化学品和材料的最新进展 | 重点介绍了非天然和计算设计的途径、合成生物学与人工智能驱动的设计整合,以及构建下一代电气化和数字化引导的C2生物精炼厂 | NA | 总结并推动基于C2原料的生物制造技术,以支持低碳化学生产 | 微生物(如大肠杆菌、假单胞菌属、光合宿主)及其代谢途径 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块、C1-to-C2平台策略 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 15 | 2026-03-09 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 本文综述了沙棘生物活性成分的作用机制、合成生物学在提升其功能成分产量中的应用,以及基于纳米技术的精准递送系统,旨在推动沙棘在未来食品系统中的大规模应用 | 整合了合成生物学(如CRISPR/Cas9介导的代谢工程)与纳米技术递送系统,为提升沙棘生物活性成分的产量、功能性和生物利用度提供了创新框架 | NA | 探讨沙棘作为功能性食品的开发潜力,并推动其在未来食品系统中的大规模应用 | 沙棘(Hippophae rhamnoides)及其生物活性成分(类黄酮、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖) | NA | NA | CRISPR/Cas9介导的代谢工程、精准发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-03-09 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
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综述 | 本文综述了利用甲醇作为一碳原料生产生物燃料的工程微生物研究进展 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制,并探讨了代谢通路重构、区室化和适应性进化等工程策略以提升甲醇利用和耐受性 | NA | 推动可持续甲醇生物制造的发展 | 天然和合成甲基营养菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 甲基营养菌 | 代谢通路重构 | 能源 |
| 17 | 2026-03-09 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物工程将细胞编程为生物传感器,以在复杂环境中转换环境信息为可检测信号的最新进展 | 整合生物分子设计、微生物组工程和合成生物学的新兴技术,开发了基于电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出的生物传感器,并利用宏基因组数据挖掘和蛋白质开关设计加速传感组件多样化 | 现有生物传感器在土壤、沉积物和废水等难以成像环境中的应用仍存在严重限制,且需要负责任的发展和现代化监管框架 | 探索和开发微生物作为生物传感器,用于在复杂环境中监测和转换环境信息 | 微生物细胞和群落,特别是未驯化的微生物,作为生物传感器的底盘 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序、宏基因组数据挖掘 | NA | 环境理化信息、生化信号 | NA | 生物分子设计、微生物组工程、合成生物学 | 微生物细胞和群落 | 生物传感器,包括转录调节器和变构蛋白质开关,用于直接调节报告输出 | 环境 |
| 18 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 19 | 2026-03-03 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导抗旱作物工程化中的应用,重点探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等前沿技术的整合,旨在构建一个面向气候智能型农业的转化框架 | 强调将代谢组学从诊断工具发展为预测性和规范性平台,并系统整合了单细胞/空间代谢组学、生态代谢组学及AI驱动建模等新兴前沿方向,以连接实验室发现与田间应用 | NA | 构建一个整合多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能的转化框架,以培育抗旱作物,应对全球粮食安全威胁 | 作物(特别是面临干旱胁迫的作物)及其在干旱响应中的代谢物 | NA | NA | 代谢组学,多组学整合,CRISPR基因编辑,通路工程,合成生物学,人工智能 | AI驱动的预测模型 | 代谢组学数据,多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物(植物) | 通路工程 | 农业 |
| 20 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
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综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略,包括表面靶向修饰、先进装载技术(如远程装载、刺激响应系统)以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体(作为药物和基因递送载体) | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9,远程装载,刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器(通过表面配体、抗体或肽实现靶向),刺激响应递送系统 | 医学 |