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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
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综述 | 本文提出并定义了跨界肽(TKPs)的概念,总结了其在植物与微生物相互作用中的功能,并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽(TKPs)作为跨物种生物活性肽的新概念,整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 182 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式:基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法,并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测,以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2026-03-11 |
PrimeRoot: a cutting-edge technology designed to achieve precise and targeted large DNA insertion in plants
2026-Apr, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04723-0
PMID:41804348
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综述 | 本文综述了PrimeRoot技术,一种用于在植物中实现精确、靶向大DNA插入的尖端技术 | PrimeRoot编辑器通过整合增强的PegRNA设计、改进的植物prime editor系统和先进重组酶,实现了高达11.1 kb DNA片段的精确插入,第三代编辑器进一步提高了不同基因递送系统下的转化精度和效率 | NA | 开发并推广PrimeRoot技术,以支持合成生物学和植物育种中大型DNA插入的染色体整合需求 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | PrimeRoot技术,包括CRISPR、prime editing guide RNA (PegRNA)设计和重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR, PrimeRoot editors | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 184 | 2026-03-10 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学开发的工程微生物作为癌症治疗剂的潜力 | 探讨了工程微生物作为靶向疾病治疗的新兴应用,特别是在癌症治疗中检测疾病标志物并精确递送治疗载荷的能力 | 存在个体间变异性、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用潜力 | 工程微生物及其在癌症治疗中的作用 | 合成生物学 | 胰腺癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 185 | 2026-03-09 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化益生菌和微生物系统作为自调节活体疗法中的应用,以应对代谢性疾病 | 利用合成生物学策略开发工程化微生物作为可持续、自适应的活体疗法,整合精准治疗与生物基生产 | NA | 评估合成生物学如何使工程化益生菌和微生物系统成为代谢性疾病的自我调节活体疗法 | 代谢性疾病(如2型糖尿病、肥胖、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎) | NA | 代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 微生物系统 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢通路 | 医学 |
| 186 | 2026-03-09 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造微生物以将C2原料转化为高价值化学品和材料的最新进展 | 重点介绍了非天然和计算设计的途径、合成生物学与人工智能驱动的设计整合,以及构建下一代电气化和数字化引导的C2生物精炼厂 | NA | 总结并推动基于C2原料的生物制造技术,以支持低碳化学生产 | 微生物(如大肠杆菌、假单胞菌属、光合宿主)及其代谢途径 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块、C1-to-C2平台策略 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 187 | 2026-03-09 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 本文综述了沙棘生物活性成分的作用机制、合成生物学在提升其功能成分产量中的应用,以及基于纳米技术的精准递送系统,旨在推动沙棘在未来食品系统中的大规模应用 | 整合了合成生物学(如CRISPR/Cas9介导的代谢工程)与纳米技术递送系统,为提升沙棘生物活性成分的产量、功能性和生物利用度提供了创新框架 | NA | 探讨沙棘作为功能性食品的开发潜力,并推动其在未来食品系统中的大规模应用 | 沙棘(Hippophae rhamnoides)及其生物活性成分(类黄酮、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖) | NA | NA | CRISPR/Cas9介导的代谢工程、精准发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 188 | 2026-03-09 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
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综述 | 本文综述了利用甲醇作为一碳原料生产生物燃料的工程微生物研究进展 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制,并探讨了代谢通路重构、区室化和适应性进化等工程策略以提升甲醇利用和耐受性 | NA | 推动可持续甲醇生物制造的发展 | 天然和合成甲基营养菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 甲基营养菌 | 代谢通路重构 | 能源 |
| 189 | 2026-03-09 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物工程将细胞编程为生物传感器,以在复杂环境中转换环境信息为可检测信号的最新进展 | 整合生物分子设计、微生物组工程和合成生物学的新兴技术,开发了基于电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出的生物传感器,并利用宏基因组数据挖掘和蛋白质开关设计加速传感组件多样化 | 现有生物传感器在土壤、沉积物和废水等难以成像环境中的应用仍存在严重限制,且需要负责任的发展和现代化监管框架 | 探索和开发微生物作为生物传感器,用于在复杂环境中监测和转换环境信息 | 微生物细胞和群落,特别是未驯化的微生物,作为生物传感器的底盘 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序、宏基因组数据挖掘 | NA | 环境理化信息、生化信号 | NA | 生物分子设计、微生物组工程、合成生物学 | 微生物细胞和群落 | 生物传感器,包括转录调节器和变构蛋白质开关,用于直接调节报告输出 | 环境 |
| 190 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 191 | 2026-03-03 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导抗旱作物工程化中的应用,重点探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等前沿技术的整合,旨在构建一个面向气候智能型农业的转化框架 | 强调将代谢组学从诊断工具发展为预测性和规范性平台,并系统整合了单细胞/空间代谢组学、生态代谢组学及AI驱动建模等新兴前沿方向,以连接实验室发现与田间应用 | NA | 构建一个整合多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能的转化框架,以培育抗旱作物,应对全球粮食安全威胁 | 作物(特别是面临干旱胁迫的作物)及其在干旱响应中的代谢物 | NA | NA | 代谢组学,多组学整合,CRISPR基因编辑,通路工程,合成生物学,人工智能 | AI驱动的预测模型 | 代谢组学数据,多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物(植物) | 通路工程 | 农业 |
| 192 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
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综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略,包括表面靶向修饰、先进装载技术(如远程装载、刺激响应系统)以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体(作为药物和基因递送载体) | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9,远程装载,刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器(通过表面配体、抗体或肽实现靶向),刺激响应递送系统 | 医学 |
| 193 | 2026-02-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2026-Apr, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定并表征了掌叶大黄中负责大黄素糖基化的UGT酶家族,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在完整植物体系或代谢工程宿主中验证这些酶的体内功能,酶学特性研究局限于体外生化实验 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点突变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 194 | 2026-01-25 |
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Apr-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118371
PMID:41512477
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研究论文 | 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化基于转录因子的羧酸生物传感器的框架 | 通过整合控制转录因子可用性和启动子序列,建立了在无细胞系统中理性构建高性能生物传感器的模块化方法 | NA | 优化无细胞系统中的生物传感器性能,以支持合成生物学和代谢工程应用 | 基于转录因子的羧酸生物传感器,特别是衣康酸响应型生物传感器 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统,启动子工程 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 生物传感器(衣康酸响应型,3-羟基丙酸响应型) | 工业生物技术 |
| 195 | 2026-01-20 |
A review of phage therapy for drug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections
2026-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128417
PMID:41412007
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综述 | 本文系统总结了噬菌体疗法在治疗耐药铜绿假单胞菌感染方面的最新进展,涵盖体外杀菌活性、生物膜降解、与抗生素的协同作用、动物模型证据及临床应用案例 | 全面整合了从基础研究到临床应用的噬菌体疗法证据,并强调了工程化噬菌体与个体化治疗策略的发展前景 | 存在转化障碍,如需要精确宿主匹配、存在免疫中和风险、缺乏标准化监管框架和GMP级生产体系 | 评估噬菌体疗法作为耐药铜绿假单胞菌感染替代治疗策略的潜力与挑战 | 耐药铜绿假单胞菌及其引起的感染(如慢性呼吸道感染、烧伤伤口感染、尿路感染、器械相关感染) | NA | 铜绿假单胞菌感染 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 196 | 2025-12-06 |
Microbial-mycotoxin interactions in food: A review of ecotoxicological implications and omics approaches for understanding detoxification mechanisms
2026-Apr, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2025.104955
PMID:41344758
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综述 | 本文综述了食品中微生物与霉菌毒素的相互作用,重点关注其生态毒理学影响以及利用组学方法阐明微生物解毒机制 | 系统整合了微生物解毒机制(吸附与酶促降解)与多组学技术(宏基因组学、基因组学、转录组学)的应用,并展望了合成生物学、CRISPR基因编辑和机器学习辅助生物信息学等未来方向 | 微生物解毒效率存在可变性、作用机制尚不明确、面临监管障碍,以及在复杂食品基质中检测掩蔽型霉菌毒素存在挑战 | 探讨食品系统中微生物与霉菌毒素的相互作用,以开发可持续的解毒策略,保障食品安全并降低生态毒理学影响 | 霉菌毒素(如黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮)及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 宏基因组学、基因组学、转录组学、多组学整合分析 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | 食品、农业、环境 |