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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-29 |
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11858-z
PMID:42033527
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综述 | 总结肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控作用及其作为临床干预靶点的潜力 | 系统阐述了肿瘤内微生物群调控肿瘤微环境的多重机制,并提出整合空间多组学、合成生物学和纳米技术的精准治疗新范式 | 肿瘤内微生物群时空动态解析不足,与宿主细胞相互作用机制未明确,临床转化安全性和有效性仍存挑战 | 探索肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控机制及临床干预策略 | 肿瘤内微生物群、肿瘤微环境中的免疫细胞(如CD8+T细胞、Tregs、MDSCs)和信号通路(如PI3K-AKT、NF-κB) | 数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年病 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌、噬菌体疗法、细菌胞外囊泡 | NA | NA | 医学 |
| 42 | 2026-06-29 |
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04975-1
PMID:42033624
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综述 | 本文综述了稀有糖类的生理功能、应用及微生物细胞工厂生物合成策略的进展 | 系统整合了代谢工程、酶工程、生物催化和发酵过程优化等多层次工程策略,以提升稀有糖类的生产效率和工业可行性 | 未提供具体实验数据或定量比较,主要依赖文献总结,可能受限于综述时点的研究进展 | 总结稀有糖类在微生物细胞工厂中的生物合成进展,并提出未来发展方向 | 稀有糖类(包括D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖) | 合成生物学,代谢工程 | NA | 代谢工程,酶工程,生物催化,发酵工艺优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物(如大肠杆菌、酵母等) | 生物合成途径(如稀有糖代谢通路) | 食品,医药,健康相关产业 |
| 43 | 2026-06-29 |
From lab to law: emerging applications, potential benefits, evolving regulatory framework and challenges for engineered probiotics
2026-Apr-13, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-02997-w
PMID:41975425
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综述 | 探讨工程益生菌从实验室到法律监管的转变,包括其新兴应用、潜在益处、不断演变的监管框架及挑战 | 提出一个整合经典毒理学测试与构建特异性水平基因转移评估的统一安全评估框架,强调根据修改的生物学性质而非一刀切模式进行评价 | 未具体说明局限,但可能涉及工程益生菌在转化过程中安全评估的复杂性及监管一致性挑战 | 综述工程益生菌在人类健康中的应用,并分析其监管框架的异质性,提出统一安全评估方法 | 工程益生菌 | 合成生物学 | 代谢性疾病、感染性疾病、炎症性疾病 | 全基因组测序、qPCR | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌 | 治疗蛋白表达、黏膜疫苗平台、肿瘤靶向免疫治疗载体、系统性和脑定向递送策略 | 医学 |
| 44 | 2026-06-29 |
Advances, opportunities, and challenges in microbial community construction: from environmental remediation to biomanufacturing
2026-Apr-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04867-w
PMID:41944847
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综述 | 该文章综述了人工微生物群落构建在环境修复和生物制造中的进展、机遇与挑战 | 提出将设计-构建-测试-学习框架与先进分析工具及人工智能驱动的动态建模相结合,以优化群落性能的创新跨学科方法 | 缺乏具体实验验证和定量评估,未深入讨论自动化设备和安全框架的实际部署细节 | 探讨人工微生物群落构建以克服单培养和自然群落的局限性,推动环境修复和生物制造可持续发展 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学、系统生物学、多组学技术 | 人工智能动态模型 | 多组学数据 | 不适用 | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 不适用 | 合成生物电路或代谢路径(如生物传感器、代谢途径) | 环境修复, 生物制造, 工业生物技术 |
| 45 | 2026-06-26 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 探讨噬菌体作为抗生素替代疗法在应对抗菌素耐药性中的应用 | 结合基因组学、合成生物学和靶向医学进展,系统阐述噬菌体治疗的多机制作用(如裂解酶)和基因工程新技术(如CRISPR-Cas、噬菌体重组工程和合成基因组重启) | 未详细讨论噬菌体治疗在临床推广中面临的具体监管障碍和规模化生产挑战 | 综述噬菌体生物学、多样性及其在治疗多重耐药菌感染中的应用潜力 | 噬菌体(特别是感染和破坏细菌的病毒) | 机器学习 | 抗菌素耐药性相关感染 | CRISPR-Cas, 噬菌体重组工程, 合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 食品, 工业生物技术 |
| 46 | 2026-06-23 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 提出通过逆转录和同源重组实现RNA模板化多样性生成的进化假说 | 首次系统提出逆转录酶介导的多样性生成机制,认为细胞或外源RNA通过逆转录和同源重组整合入基因组,从而利用模块化遗传信息偏向性地改变序列空间的探索分布 | 该机制目前仅为进化假说,缺乏直接实验证据支持,且逆转录活性的细胞调控频率尚不清楚 | 探讨RNA介导的多样性生成机制及其在基因组进化和遗传变异中的作用 | 多样性生成逆转录元件、逆转录转座子、端粒酶、体细胞高频突变等生物机制,以及转录假基因和重复序列 | 进化生物学 | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe方法 | NA | NA | 医学 |
| 47 | 2026-06-23 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 提出一种通过合成生物学控制植入工程肝组织原位生长的策略,以解决组织工程移植物的尺寸限制问题 | 首次将合成生物学与组织工程结合,通过YAP和生长因子信号通路实现植入后肝组织的按需扩展 | 研究尚处于概念验证阶段,需进一步评估长期安全性和临床应用可行性 | 开发一种基因策略,通过合成生物学触发实现工程肝组织在体内外可控扩增,以生成大型器官植入物 | 工程化肝组织 | 合成生物学、组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、组织工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞 | YAP与生长因子信号通路调控回路 | 医学 |
| 48 | 2026-06-18 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
|
综述 | 综述了工程化活菌在治疗肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用,涵盖从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了内部基因修饰和外部共价连接两种策略,并详述了胶囊、微囊和纳米制剂等新型剂量形式在活菌递送中的应用 | 未讨论工程化活菌在临床应用中的具体安全性评估和长期稳定性问题 | 探讨工程化活菌作为靶向肝脏和肠道疾病的新型治疗方法的潜力 | 工程化活菌菌株(如双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌)及其递送系统 | 微生物工程 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌 | 治疗性分子递送通路、内部基因修饰、外部共价连接 | 医学 |
| 49 | 2026-06-18 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
|
研究论文 | 通过成像方法揭示CRISPR质粒防御中分子动力学如何决定群体动态 | 首次将分子动力学、单细胞变异和空间结构多尺度结合,量化CRISPR-Cas系统对质粒传播的影响,并提出基于单细胞参数的预测模型 | 实验基于特定质粒RP4和CRISPR-Cascade系统,可能不适用于其他系统或环境 | 研究分子动力学如何决定细菌群体中CRISPR质粒防御的动态 | 结合质粒RP4和CRISPR-Cascade复合物的细菌群体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记、时序成像、单细胞追踪 | 基于智能体的空间模型 | 图像 | 未明确样本数量,涉及细菌群体、单细胞水平分析 | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade质粒防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 50 | 2026-06-16 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
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研究论文 | 利用体外合成生物学平台超快速高滴度生产海藻糖-6-磷酸 | 设计并验证了一条不含辅酶的新型最小酶途径,避免了对ATP或UDP等昂贵辅酶的依赖,实现了海藻糖-6-磷酸的高效生物制造 | 研究未涉及大规模工业应用的长期稳定性或经济可行性评估 | 开发一种可扩展且成本竞争力的体外生物制造方法用于海藻糖-6-磷酸的生产 | 海藻糖-6-磷酸的体外酶催化合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶学优化、生物反应器放大 | NA | 实验数据(产量、产率等) | NA | 体外合成生物学平台 | NA | 三酶级联途径(包含麦芽糖磷酸化酶、海藻糖-6-磷酸磷酸化酶和多磷酸葡萄糖激酶) | 农业 |
| 51 | 2026-06-16 |
Progress in cell-based immunotherapies for solid tumors
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05092-z
PMID:42033573
|
综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体肿瘤治疗中的进展,包括CAR-T、NK细胞和TCR-T等疗法 | 全面分析了多种细胞免疫疗法在实体瘤应用中面临的主要障碍和未来突破方向 | 未提供具体的实验数据或比较分析,仅为文献综述 | 总结细胞免疫疗法在实体瘤中的进展、挑战和未来方向 | 实体瘤的细胞免疫疗法 | 数字病理学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 52 | 2026-06-16 |
Gene Exchange Mechanisms in Natural and Engineered Probiotics Within the Human Gut Implications for Antibiotic Resistance and Metabolic Modulation
2026-Apr-22, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11029-3
PMID:42020676
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综述 | 批判性审视自然与工程益生菌在人体肠道内通过水平基因转移传播抗生素抗性及调节代谢的机制与意义 | 综合论述益生菌基因交换的双重性,既强调益生特性传递也警示抗性基因扩散风险,并提出基于情境的风险评估框架 | 未提供具体实验数据验证风险,主要基于文献综合分析 | 探讨人体肠道中自然与工程益生菌的基因交换机制及其对抗生素抗性传播和代谢调节的影响 | 人体肠道微生物组中的自然益生菌和工程益生菌 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 宏基因组学、微生物生态学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 染色体整合、自杀开关、营养缺陷型、正交电路设计 | 肠道微生物(未特指具体宿主) | 生物遏制电路(包括自杀开关、正交电路) | 医学、农业 |
| 53 | 2026-06-16 |
Marine Antimicrobial Peptides: From Ocean Biodiversity to Genome Mining, Multi-Omics Discovery, and Biotechnological Innovation in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2026-Apr-07, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10959-2
PMID:41944926
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综述 | 从海洋生物多样性到基因组挖掘、多组学发现和生物技术创新,全面探讨海洋抗菌肽在应对抗菌素耐药性中的应用 | 综合海洋生物多样性与现代生物技术工具(如组学发现、重组表达系统、肽工程和纳米递送平台)来开发海洋抗菌肽,并提出将海洋AMP应用于生物医药、水产养殖和工业生物技术等领域的创新策略 | 海洋AMP在稳定性、成本和递送方面仍存在挑战 | 综述海洋来源抗菌肽的多样性、类型、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的生物技术创新应用 | 海洋来源的抗菌肽(AMPs) | 数字病理学 | 抗菌素耐药性 | 多组学发现、重组表达系统、肽工程、纳米递送平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌 | 代谢通路 | 生物医药, 水产养殖, 工业生物技术 |
| 54 | 2026-06-15 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 系统综述沙棘作为未来食品的生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合合成生物学(CRISPR/Cas9代谢工程与精密发酵)、纳米递送技术和个性化营养策略,构建沙棘从传统药用到未来智能食品的转化框架 | 未涉及具体实验验证数据,缺乏不同递送系统效率的定量比较,未讨论沙棘全产业链的技术经济可行性 | 探索沙棘生物活性成分的应用潜力,提出合成生物与食品工程相结合的产业化路径 | 沙棘中的黄酮类、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖等生物活性成分 | 合成生物学, 食品工程 | NA | CRISPR/Cas9介导代谢工程, 精密发酵, 纳米封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(用于精密发酵的工程菌株) | 代谢工程通路优化、营养递送系统(封装、黏膜黏附平台) | 食品, 医药 |
| 55 | 2026-06-13 |
A synthetic angiotensin II/ACE2-based hormone shunt controlling experimental hypertension
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71796-z
PMID:41965354
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研究论文 | 设计一种名为ARCH的全人源抗高血压基因电路,通过合成生物学方法控制实验性高血压 | 提出一种基于合成生物学的闭合环路基因电路,利用天然血管紧张素受体监测血压生物标志物,并驱动可溶性ACE2表达以自我调节血压 | NA | 开发一种可逆、自给自足的闭环系统来精确监测和控制肾素-血管紧张素系统驱动的高血压 | 雄性高血压小鼠 | NA | 高血压 | 基因工程 | NA | NA | 雄性高血压小鼠,具体数量未提及 | 合成生物学基因电路 | 人源细胞 | 包含血管紧张素受体监测模块和可溶性ACE2治疗表达模块的自调节基因电路 | 医学 |
| 56 | 2026-06-13 |
Gallium in liquid state shows nuclease-mimicking activity
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71346-7
PMID:41963312
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研究论文 | 液态镓展现出类似核酸酶的活性,具有优先切割位点 | 首次发现液态镓具有类似核酸酶的活性,其氧化层用于底物吸附,金属核心作为裂解活性中心,构建无配体、无辅因子的人工核酸酶平台 | 未提及 | 探索非生物材料模仿酶活性的新方法 | 液态镓的核酸酶活性及其机制 | NA | NA | NA | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗应用, 合成生物学, 生物材料 |
| 57 | 2026-06-11 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 综述了核碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用,涵盖其催化原理、三种主要工作模式及未来发展方向 | 系统总结了核碱基编辑酶在生物传感和成像中的三种应用模式(碱基转换、修饰/去修饰、碱基擦除),并强调其高特异性、高效扩增和生理兼容性 | 讨论该领域面临的挑战,包括酶工程、递送策略和多回路集成的改进需求 | 概述核碱基编辑酶作为可编程分子工具在生物传感和生物成像中的应用现状与前景 | 核碱基编辑酶,包括脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶和DNA糖基化酶 | 数字病理学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器, 分子回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 58 | 2026-06-10 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 探讨工程改造细菌作为活体传感器直接检测肿瘤DNA的最新进展 | 利用自然感受态和水平基因转移结合CRISPR-Cas工具,使工程菌能区分肿瘤与野生型DNA并产生可观测的报道输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度限制等问题 | 开发用于临床癌症诊断的工程细菌生物传感器及其与治疗递送系统的整合 | 肿瘤DNA、KRAS突变、工程改造细菌(多种细菌物种)、结直肠癌和胃肠癌等实体肿瘤 | 合成生物学 | 癌症(结直肠癌、胃肠癌等) | CRISPR-Cas系统、同源重组、多重CRISPR系统、安全回路 | NA | DNA序列 | 包括体外检测、类器官模型、小鼠模型和非侵入性粪便样本 | CRISPR-Cas9, TALEN | 多种细菌物种(如大肠杆菌等) | 遗传回路、逻辑门、生物传感器、安全回路 | 医学 |
| 59 | 2026-06-10 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
|
综述 | 从系统层面对植物免疫网络进行整合性概述,涵盖受体激活、基因调控回路、蛋白互作中心和染色质动力学如何共同影响免疫结果 | 整合了单细胞和空间组学揭示的免疫激活异质性,并讨论了系统和合成生物学方法在作物持久广谱抗病工程中的应用前景 | 未提及具体的实验验证或技术局限性 | 综合理解植物免疫网络中的受体激活、基因调控、蛋白互作和染色质动力学如何影响免疫结果 | 植物免疫网络中的传感器NLR、帮助者NLR、PRIMER细胞、旁观者细胞等 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞组学、空间组学、蛋白质组学、互作组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组、染色质数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 60 | 2026-06-10 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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综述 | 探讨超级增强子在植物基因簇转录调控中的核心作用 | 揭示了超级增强子通过拓扑关联域协调同源基因簇和生物合成基因簇中基因共表达的机制,并指出其可通过染色质可及性数据预测 | 主要基于拟南芥研究,对其他植物物种的普遍性仍需验证 | 阐明植物中超级增强子调控基因簇共表达的机制及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 植物同源基因簇和生物合成基因簇中的基因表达调控 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas, T-DNA插入, 染色质可及性测序 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9, T-DNA插入 | 拟南芥 | 超级增强子调控的基因簇共表达回路 | 合成生物学, 代谢工程, 作物改良 |