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当前共找到 156 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-04 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用微生物作为生物传感器将环境信息转化为可检测信号的创新技术 | 通过整合电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等新型读取方法，以及利用宏基因组数据挖掘和变构蛋白开关设计来扩展传感组件 | 大部分生物传感器在难以成像的环境（如土壤、沉积物和废水）中应用存在严重限制 | 探讨如何编程微生物细胞和群落作为传感器，以在复杂环境中实现环境信息的转化和读取 | 微生物细胞和群落的生物传感器系统 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, mammalian cells, plants | 生物传感器、环境响应电路 | 环境监测, 农业, 工业生物技术 |
| 42 | 2026-06-01 |
A highly limited amino acid library from asteroid Bennu yields wide-ranging protein folds
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71509-6
PMID:41932940
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研究论文 | 使用AI蛋白质设计软件探索小行星贝努来源的有限氨基酸库能否产生多样的蛋白质折叠结构 | 首次证明仅由6种氨基酸（贝努小行星上最丰富的氨基酸）组成的极小库能重现所有关键蛋白质折叠，包括代谢酶、氧化还原蛋白和核糖体蛋白等 | 未在实验室实际合成验证这些设计的蛋白质，仅依赖计算预测和AlphaFold2结构模拟 | 探究早期地球有限的氨基酸库能否产生多样化的蛋白质折叠结构 | 原始氨基酸库（基于贝努小行星数据、米勒-尤里实验和默奇森陨石数据） | 计算生物学 | NA | AlphaFold2, 模板建模评分 | NA | 蛋白质序列, 蛋白质结构 | 测试了4个不同大小的原始氨基酸库（6、7、8种氨基酸），以及一个补充半胱氨酸的6氨基酸库 | NA | NA | NA | 起源生物学, 合成生物学, 医学 |
| 43 | 2026-06-01 |
Synthetic budding morphogenesis by optogenetic receptor tyrosine kinase signaling
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715459
PMID:41959406
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研究论文 | 本研究利用光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET，实现合成萌芽形态发生 | 开发了不依赖配体的光遗传学RET受体（optoRET），通过蓝光介导的聚集实现信号传导，并能在空间上控制人肾类器官的萌芽方向 | 未提及具体局限性 | 建立发育学指导的控制类器官萌芽的策略 | 小鼠胚胎肾和人干细胞来源的肾类器官 | 合成生物学 | 肾疾病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠胚胎肾和人干细胞来源的肾类器官样本 | NA | 人, 小鼠 | 光遗传学RET受体（optoRET）信号通路 | 医学 |
| 44 | 2026-05-30 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
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综述 | 综述了微藻CO₂固定的工程与生物机制，涵盖从分子调控到系统优化的多尺度整合 | 全面整合了多尺度视角，从气液传质、CO₂同化途径、关键酶系统到代谢调控和工程策略，并提出了合成生物学、人工智能与系统工程融合的未来路线图 | 未提供定量比较或实验验证，仅基于文献总结，可能缺乏具体数据支持 | 为开发高效、智能和可持续的微藻CO₂固定系统提供理论框架和前瞻视角 | 微藻的CO₂固定机制，包括碳浓缩机制、Rubisco和碳酸酐酶系统等 | 机器学习 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | CO₂固定途径、碳浓缩机制 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 45 | 2026-05-29 |
Marine Polysaccharides Modulating the Gut Microbiota-Immune Axis in Digestive Tract Tumors: An Update
2026-Apr-23, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md24050148
PMID:42188283
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综述 | 系统综述了海洋多糖通过调节肠道菌群-免疫轴影响消化道肿瘤的最新研究进展 | 从多糖结构、菌群调节、免疫激活、肿瘤抑制和递送优化的逻辑框架出发，系统阐述了海洋多糖对肠道菌群-免疫轴的调控作用及机制，并整合多组学、合成生物学和纳米递送策略提出未来研究方向 | 海洋多糖的结构-活性关系仍不明确，口服生物利用度较低 | 总结海洋多糖调节消化道肿瘤中肠道菌群-免疫轴的研究，并促进其临床转化 | 海洋多糖（来自藻类、动物和微生物来源） | 机器学习 | 消化道肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 46 | 2026-05-28 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 本文综述了噬菌体在抗生素耐药时代作为抗菌替代疗法的生物学基础、治疗应用及挑战 | 整合了噬菌体生物学、基因工程进展（如CRISPR-Cas系统、重组工程和合成基因组重启）及多领域应用（临床治疗、食品安全、环境消毒和生物膜控制），并系统讨论了监管框架和宿主抗性动态等关键问题 | 未提供具体实验数据或案例研究的量化结果，主要基于现有文献的理论总结 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的潜力和可持续性，应对全球抗菌耐药性危机 | 噬菌体及其在细菌感染治疗、生物控制中的应用 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体重组工程、合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | NA | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 47 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法，应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现了低重组率和最小基础活性，并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 48 | 2026-05-22 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 提出一种结合AI引导设计与基础化学原理的分层框架，将脆弱的α-螺旋结构域转化为超稳定支架 | 首次将AI工具（如AlphaFold3）与化学原理（盐桥、金属配位）系统结合，实现多层级稳定化设计，使α-螺旋蛋白在热、机械和化学应力下具有前所未有的多轴稳定性 | 未说明 | 设计在同时热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 蛋白质工程 | NA | AI引导设计、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计被筛选至最小候选集，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 49 | 2026-05-21 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 综述了路径工程在1,4-丁二醇生物合成中的最新进展 | 系统总结了三条从头合成路径的设计和动态代谢调控策略，并评估了体外酶级联与全细胞转化体系的建立 | 工业放大受限于细胞内源性分解代谢、宿主耐受性不足和经济可行性欠佳 | 实现1,4-丁二醇的可持续生物合成并解决商业化瓶颈 | 微生物合成途径、酶工程和代谢调控策略 | NA | NA | 多组学、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | CoA依赖路径、木质纤维素糖代谢路径、氨基酸分解代谢路径、体外酶级联、全细胞转化 | 工业生物技术 |
| 50 | 2026-05-21 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
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research paper | 分析遗传变异在种族间分布，驳斥基因生物武器迫在眉睫的说法 | 从自然遗传变异角度系统评估基因目标武器可行性，对比病原体和药物反应变异的种族分布差异 | 仅分析149个已验证的感染相关变异和136个药物反应相关变异，未覆盖全基因组范围 | 验证基因生物武器叙事的真实性基础，评估种族目标武器的可行性 | 人类种族间遗传变异分布数据 | machine learning | NA | 遗传变异分析 | NA | 遗传变异数据 | 149个感染相关变异和136个药物反应相关变异 | NA | NA | NA | medicine |
| 51 | 2026-05-20 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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research paper | 通过计算设计和合成生物学探索构建基于19种氨基酸的细胞，验证异亮氨酸的可替代性并生成稳定细胞 | 首次通过蛋白质语言模型和结构模型协同设计，系统性替换核糖体中所有382个异亮氨酸残基，创建了首个19种氨基酸的活细胞 | 未详细说明模型在非必需蛋白或复杂多细胞生物中的适用性，且细胞稳定性仅基于短期进化实验 | 探索生命在简化氨基酸字母表下的可行性，构建19种氨基酸的细胞 | 大肠杆菌中的必需蛋白质和核糖体 | machine learning、computational biology | NA | 计算机辅助设计、合成生物学 | 蛋白质语言模型、结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 核糖体中382个异亮氨酸残基改造，涉及21个重新设计的亚基 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | NA | 生物技术、基础生物学 |
| 52 | 2026-05-16 |
Probiotics and the Human Microbiome: Classical Functions, Emerging Systemic Roles, and Future Therapeutic Frontiers
2026-Apr-23, Biology
DOI:10.3390/biology15090665
PMID:42117804
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综述 | 系统综合益生菌在维持肠道稳态、免疫调节、感染预防等经典功能及肠脑轴、肠皮轴等新兴系统作用方面的证据 | 采用系统级框架关联益生菌作用与共享机制（如微生物代谢物信号、病原体竞争排斥、屏障强化及免疫神经内分泌调节），并整合翻译进展（靶向递送平台、工程化菌株、后生元策略）及未来方向（精准微生物组干预、合成生物学、AI辅助多组学分析） | 未提及具体研究的样本量或实验验证，且作为综述依赖现有文献证据，可能忽略特定菌株或宿主环境的异质性 | 系统综述益生菌的经典功能与新兴系统作用，并提出未来治疗前沿方向 | 益生菌与人体微生物组互作网络 | 微生物组学 | NA | NA | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 53 | 2026-05-16 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
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综述 | 全面综述微生物和酶法在聚羟基脂肪酸酯生物塑料生产中的代谢途径、结构特性及技术创新 | 整合生化、结构与生物加工见解，强调工程酶和无细胞系统在生物塑料可扩展、可定制生产中的应用 | 未讨论具体技术经济挑战和监管框架的详细解决方案 | 为酶法生物塑料作为可循环生物经济中的可持续替代品提供战略方向 | 聚羟基脂肪酸酯类生物塑料及其微生物和酶法合成路径 | 合成生物学 | NA | PHA合成酶、无细胞代谢工程、酶固定化、表面展示 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 细菌 | 聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、体外酶促聚合系统 | 环境、工业生物技术 |
| 54 | 2026-05-15 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
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研究论文 | 提出一种基于立足点介导链反应的无复位DNA逻辑电路，用于实时输入处理和记忆存储 | 首次实现无需复位操作的DNA逻辑电路，通过连续可逆链迁移机制支持实时数据处理和记忆功能，并基于DNA折纸平台构建多种组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位DNA逻辑电路，实现实时输入处理和记忆功能 | DNA逻辑电路元件（逻辑门、触发器、寄存器） | 合成生物学 | NA | 立足点介导链反应（TCR）、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 组合逻辑门（AND、OR）、置位复位触发器、数据锁存器、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 55 | 2026-05-12 |
Leveraging pre-trained AI models for robust promoter sequence design in synthetic biology
2026-Apr-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240033
PMID:42109830
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研究论文 | 利用预训练AI模型实现合成生物学中稳健启动子序列的设计 | 首次将预训练模型概念应用于启动子序列分析，通过创新的预训练与微调范式，结合基础突变模型，实现高效筛选高表达且抗突变的启动子 | 依赖预训练模型（如DNABERT）的性能，可能受限于训练数据质量和模型泛化能力 | 探索预训练AI模型在合成生物学启动子设计中的应用，减少对传统实验方法的依赖 | 酵母启动子序列及其表达水平 | 机器学习 | NA | DNABERT预训练模型，基础突变模拟 | DNABERT, Pymaker | 序列数据 | 多种数据集规模下的启动子样本 | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物制药 |
| 56 | 2026-05-12 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 介绍了一种针对荚膜红细菌的合成生物学工具箱Rhodo-Box，旨在促进其代谢工程改造 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架，开发了首个针对荚膜红细菌的标准化基因元件工具集，包括多种复制起点、启动子、诱导系统、核糖体结合位点和转录终止子，并引入了半自动化的克隆方法 | 未对工具在复杂代谢途径中的应用效果进行验证，也未评估长期稳定性 | 开发标准化遗传工具以推进荚膜红细菌在可持续生物制造中的应用 | 荚膜红细菌及其遗传元件 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆框架、半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts模块化克隆框架 | 荚膜红细菌 | 基因表达调控线路（启动子、RBS、终止子等） | 工业生物技术 |
| 57 | 2026-05-12 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 介绍VAST（真空与超声辅助瞬时转化）方法，显著增强单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率与通用性 | 通过系统优化植物生长条件并结合真空渗透和超声预处理，在减少组织损伤的同时大幅提升瞬时基因表达效率，成功转化番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等多种重要作物 | 未明确说明，但可能需进一步验证在大规模或更复杂植物体系中的适用性及长期效果 | 开发高效、通用且简单的植物瞬时转化方法，以支持功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶与双子叶植物幼苗（如拟南芥、番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等） | 分子生物学 | NA | 真空渗透与超声处理辅助的瞬时转化 | NA | 基因表达数据 | 多种植物幼苗样本，具体数量未明确说明 | NA | 植物（番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等） | 硝酸盐响应基因表达分析（跨物种比较） | 农业、生物技术 |
| 58 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就，弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述，突出其优势和应用前景，并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 59 | 2026-05-12 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 综述麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 总结了麦角硫因生物合成和分解代谢途径中关键酶的发现与鉴定进展，以及代谢工程策略的最新成果，并介绍了化学酶促级联合成路径实现最高产量 | 未明确提及研究限制，但可能包括异源生产中的代谢负担和产量优化挑战 | 探讨麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 麦角硫因及其关键酶 | 机器学 | NA | 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 化妆品, 医药 |
| 60 | 2026-05-12 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK 4软件套件，用于核酸结构、装置和系统的分析与设计 | NUPACK 4在物理模型、计算速度、可扩展性、材料混合和序列约束方面实现了全面升级 | NA | 为核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域提供计算工具 | 核酸结构和装置 | 分子编程 | NA | NUPACK算法，核酸设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应通路，结构工程（含假结） | 合成生物学，纳米技术 |