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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-01 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 整合PANoptosis的分子架构与临床转化,提出以细胞死亡架构为基础的药物发现框架 | 首次提出PANoptosis作为药物发现框架,集成细胞死亡架构与临床试验转化,并引入临床极性与时序模型指导PANoptosis的诱导或抑制 | PANoptosis的分子机制尚未完全阐明,临床转换中组织特异性调控和长期安全性数据仍有限 | 综述PANoptosis的分子架构、调节机制及药物干预策略,推动其在感染、炎症、癌症和神经退行性疾病中的临床转化 | PANoptosis通路及其相关蛋白(ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins)和临床疾病模型 | 机器学 | 癌症,感染性疾病,炎症性疾病,神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 42 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)与半理性筛选(基于L-岩藻糖响应生物传感器),首次获得五重突变体M5,实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性,也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P) | 工业生物技术、食品 |
| 43 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块(官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化),并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据,缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制,并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路(包括棉酚活性酶的功能模块) | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 44 | 2026-04-30 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Apr-29, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
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研究论文 | 利用蛋白质工程和合成生物学设计丝绸-淀粉样蛋白-贻贝杂合蛋白,制备可溶解回收的高性能蛋白基材料 | 通过合理平衡非晶域与结晶域的相互作用,实现高强度、韧性、低超收缩及完全可回收性的蛋白基材料设计 | NA | 开发可溶解回收、高性能且可持续的蛋白基材料 | 丝绸-淀粉样蛋白-贻贝(SAM)杂合蛋白及其纤维和水凝胶 | 材料科学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学、可持续材料 |
| 45 | 2026-04-30 |
Chemical and synthetic biology tools to interrogate and control cell-cell interactions in vivo
2026-Apr-27, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102688
PMID:42048798
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综述 | 本篇综述讨论了利用化学和合成生物学工具在体内探究和控制细胞-细胞相互作用的最新进展 | 专注于体内研究进展,强调在天然环境中保持细胞动态、组织结构和环境线索,从而揭示复杂生物系统中细胞相互作用的通用原理 | NA | 探讨用于研究和控制体内细胞间相互作用的化学与合成生物学工具的发展与应用 | 细胞-细胞相互作用、蛋白质介导的通讯 | 合成生物学 | NA | 化学工具、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 多细胞生物(体内) | NA | 基础生物学研究 |
| 46 | 2026-04-30 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Apr-22, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 在嗜盐菌Salinivibrio中开发了高效的碱基编辑平台,并应用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌Salinivibrio中建立腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器,并开发了新型融合蛋白PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI实现双碱基同时编辑 | 未提及 | 开发高效的碱基编辑工具以推动嗜盐菌的合成生物学和工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑器(ABE、CBE、双碱基编辑器)和代谢通路(乙酸代谢及聚3-羟基丁酸生物合成) | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-04-30 |
Co-Immobilization of SpyTag-Cyclized Enzymes on a γPFD-SpyCatcher Hydrogel to Address Broad Specificity
2026-Apr-21, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels12040348
PMID:42042186
|
研究论文 | 开发了一种基于自组装γPFD-SpyCatcher水凝胶的可编程蛋白质支架,用于体内共固定SpyTag环化级联酶,以解决酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | 通过SpyTag环化酶与γPFD-SpyCatcher水凝胶的共固定策略,实现级联酶的空间有序组织,显著提高产物产量 | 未明确提及,但可能包括体内支架稳定性或适用酶类型的限制 | 解决工程代谢途径中酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | SpyTag环化酶和γPFD-SpyCatcher水凝胶空间组织方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 工程微生物(未具体说明,可能是大肠杆菌或酵母) | 基于γPFD-SpyCatcher水凝胶的级联酶共固定支架 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 48 | 2026-04-30 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Apr-21, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
|
综述 | 综述浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机中的作用 | 系统阐述了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和太空生命支持系统等多领域的应用潜力,并通过生命周期和技术经济评估验证其环境与经济可行性 | 未明确讨论浮萍大规模商业化生产中的具体挑战或潜在风险 | 全面评估浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力 | 浮萍(水生植物) | 合成生物学 | NA | 生命周期评估、技术经济评估 | NA | 文本 | NA | 合成生物学底盘 | 浮萍 | NA | 农业, 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 49 | 2026-04-30 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-Apr-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
|
研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的基于质粒的CRISPR/Cas9系统,用于在海洋硅藻中实现多基因同时编辑,以降低其蛋白质的岩藻糖基化水平 | 首次在硅藻中建立了基于Csy4核糖核酸内切酶处理多向导RNA的CRISPR/Cas9多重编辑系统,实现了三个岩藻糖基化基因的同时编辑 | 未提及在非靶标位点的脱靶效应评估,以及编辑效率的定量比较分析 | 为硅藻基因组工程提供一种可靠的多位点CRISPR/Cas9编辑工具,并推动其糖基化途径的人源化改造 | 海洋硅藻Phaeodactylum tricornutum | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸内切酶 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9 | Phaeodactylum tricornutum | 基于Csy4的多向导RNA处理系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 50 | 2026-04-30 |
Metabolic Engineering of Rhodotorula toruloides for Biosynthesis of Retinal
2026-Apr-02, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12040258
PMID:42042353
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研究论文 | 通过代谢工程改造圆红冬孢酵母NP11以生产视黄醛 | 首次在圆红冬孢酵母中引入并优化多种来源的β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因,并结合多基因过表达和发酵条件优化,实现了视黄醛的高效生物合成 | 未进行详细的代谢流分析或基因调控网络优化,产量仍有提升空间 | 实现视黄醛的微生物合成,为萜类化合物的生物制造提供细胞工厂 | 圆红冬孢酵母NP11 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 发酵优化 | NA | 浓度数据 | 工程菌株Rt13及多种基因改造菌株 | NA | 圆红冬孢酵母 | 视黄醛合成途径:包含β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因以及IDI1、BTS1、CARRP、CARB过表达 | 医药, 食品, 化妆品 |
| 51 | 2026-04-30 |
Functional Diversity of Probiotic Effector Molecules: Insights into Their Role in Improving Gut Health
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
|
综述 | 本文综述了益生菌效应分子的功能多样性及其在改善肠道健康中的作用 | 系统总结了益生菌效应分子的主要类别和作用机制,并提出了高通量鉴定和合成生物学等新兴方法在解锁其治疗潜力方面的应用 | 益生菌效应分子的高通量鉴定和体内验证及有效剂量确定仍面临挑战 | 阐明益生菌效应分子的多样性及其功能,以促进靶向益生菌疗法和功能性食品的设计 | 益生菌效应分子,包括细菌多糖聚合物、表面蛋白、分泌肽和酶、细胞外囊泡及小分子代谢物 | 肠道微生物组与益生菌研究 | 肠道健康相关疾病 | 比较基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学、食品 |
| 52 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
|
综述 | 综述合成生物学在减少真菌毒素污染和增强食品系统可持续性方面的应用 | 整合人工智能与多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 | NA | 探讨合成生物学在真菌毒素控制和食品副产物可持续利用中的解决方案 | 产毒真菌、真菌毒素、食品及加工副产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 微生物细胞工厂、生物传感器 | 农业, 食品, 环境 |
| 53 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
|
综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构,并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性,从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略,探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径,包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |
| 54 | 2026-04-29 |
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3688058
PMID:42043999
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研究论文 | 提出GAN-GA混合框架,结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 | 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合,在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段,克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 | 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果,论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 | 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法,生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 | 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列生成 | Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 55 | 2026-04-29 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Apr-27, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
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综述 | 综述光周期通过生长素流调控树木次生生长的机制及其潜在应用 | 提出生长素流作为光周期调控次生生长的关键机制,并探讨合成生物学方法调控光周期-生长素流关系以优化树木性能 | 现有证据尚不充分,部分分子机制(如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子)的作用未完全明确 | 阐述光周期通过生长素流调控次生生长的机制,并探索利用该机制增强树木生长和干旱抗性的策略 | 温带森林树木(尤其杨树)的次生生长过程 | 植物生物学、森林科学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 杨树(Populus) | 设计光周期不敏感的生长素生物合成回路 | 环境(碳封存)、农业(林木优化)、工业生物技术 |
| 56 | 2026-04-29 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
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研究论文 | 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法,调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 | 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查,揭示了约80%的基因簇编码未知产物,并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 仅涉及82种真菌,样品量有限,且主要关注生物合成基因簇与分子的关联,未能覆盖所有潜在生物活性化合物 | 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力,为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌物种 | 异源表达 | NA | 生物合成基因簇 | 农业 |
| 57 | 2026-04-28 |
Mechanistic Insight into Conformational Control of Enzyme Activity by Genetically Encoded Metal-Responsive Switches
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70349
PMID:42033023
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研究论文 | 探究基于遗传编码金属响应开关的酶活性构象控制机制 | 揭示双吡啶丙氨酸金属螯合残基通过局部构象变化调控酶活性的分子机制 | 仅针对两种酶中的一种进行机理验证,通用性需进一步验证 | 阐明金属响应系统中连接基团控制构象变化驱动酶活性调节的机理 | 激烈火球菌脯氨酸寡肽酶(Pfu POP) | 合成生物学 | NA | 荧光金属竞争实验、分子动力学模拟、F核磁共振波谱 | NA | 分子结构数据、荧光信号 | NA | NA | NA | 金属响应开关 | 合成生物学、生物传感、可编程催化 |
| 58 | 2026-04-28 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-Apr-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
|
综述 | 通过整合合成转录系统推动下一代精准治疗的发展 | 综述了合成启动子和合成转录因子的协调整合,结合人工智能从经验性发现转向理性预测设计,实现动态、时空精确调控,提升治疗精准度并减少脱靶效应 | 文中未明确讨论系统的潜在局限性 | 总结工程化和整合系统的进展,强调动态调控策略及其治疗应用 | 合成启动子与合成转录因子构成的整合系统 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈环路、可调系统 | 医学 |
| 59 | 2026-04-28 |
Sustainable insect pest management using bioactive compounds derived from marine macroalgae: A comprehensive review
2026-Apr-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134672
PMID:42035956
|
综述 | 系统总结了海洋大型藻类中生物活性化合物在可持续害虫管理中的应用潜力、生化机制及面临的挑战 | 首次全面整合绿藻、褐藻和红藻中多种生物活性化合物(多糖、多酚、萜类等)的杀虫、拒食、生长调节特性,并系统阐述其在综合害虫管理中的生态友好型生物制剂作用机制 | 实际应用受限于代谢物含量的季节变异性和地域影响,大规模生物质生产成本高,提取和制剂工艺不成熟,缺乏田间验证数据,以及相关监管政策不完善 | 评估海洋大型藻类生物活性化合物作为可持续害虫管理生物农药的潜力,并提出未来发展方向 | 海洋大型藻类(绿藻、褐藻、红藻)及其衍生的生物活性化合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 60 | 2026-04-28 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
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研究论文 | 提供使用抗生素标记快速多重改造大肠杆菌的全面教程 | 整合15种抗生素抗性盒实现10-15个基因组修饰在3周内完成,并提供详细设计指南 | 不适用于需要无疤痕修饰的场景,且主要针对易操作微生物 | 建立一种快速、高效的多重基因组工程方法 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 重组工程 | NA | 实验方法 | NA | 重组工程,抗生素标记 | 大肠杆菌 | 多重基因组修饰 | 工业生物技术 |