合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 155 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-21 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
|
research paper | 分析遗传变异在种族间分布，驳斥基因生物武器迫在眉睫的说法 | 从自然遗传变异角度系统评估基因目标武器可行性，对比病原体和药物反应变异的种族分布差异 | 仅分析149个已验证的感染相关变异和136个药物反应相关变异，未覆盖全基因组范围 | 验证基因生物武器叙事的真实性基础，评估种族目标武器的可行性 | 人类种族间遗传变异分布数据 | machine learning | NA | 遗传变异分析 | NA | 遗传变异数据 | 149个感染相关变异和136个药物反应相关变异 | NA | NA | NA | medicine |
| 82 | 2026-05-16 |
Probiotics and the Human Microbiome: Classical Functions, Emerging Systemic Roles, and Future Therapeutic Frontiers
2026-Apr-23, Biology
DOI:10.3390/biology15090665
PMID:42117804
|
综述 | 系统综合益生菌在维持肠道稳态、免疫调节、感染预防等经典功能及肠脑轴、肠皮轴等新兴系统作用方面的证据 | 采用系统级框架关联益生菌作用与共享机制（如微生物代谢物信号、病原体竞争排斥、屏障强化及免疫神经内分泌调节），并整合翻译进展（靶向递送平台、工程化菌株、后生元策略）及未来方向（精准微生物组干预、合成生物学、AI辅助多组学分析） | 未提及具体研究的样本量或实验验证，且作为综述依赖现有文献证据，可能忽略特定菌株或宿主环境的异质性 | 系统综述益生菌的经典功能与新兴系统作用，并提出未来治疗前沿方向 | 益生菌与人体微生物组互作网络 | 微生物组学 | NA | NA | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 83 | 2026-05-16 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
|
综述 | 全面综述微生物和酶法在聚羟基脂肪酸酯生物塑料生产中的代谢途径、结构特性及技术创新 | 整合生化、结构与生物加工见解，强调工程酶和无细胞系统在生物塑料可扩展、可定制生产中的应用 | 未讨论具体技术经济挑战和监管框架的详细解决方案 | 为酶法生物塑料作为可循环生物经济中的可持续替代品提供战略方向 | 聚羟基脂肪酸酯类生物塑料及其微生物和酶法合成路径 | 合成生物学 | NA | PHA合成酶、无细胞代谢工程、酶固定化、表面展示 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 细菌 | 聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、体外酶促聚合系统 | 环境、工业生物技术 |
| 84 | 2026-05-15 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
|
研究论文 | 提出一种基于立足点介导链反应的无复位DNA逻辑电路，用于实时输入处理和记忆存储 | 首次实现无需复位操作的DNA逻辑电路，通过连续可逆链迁移机制支持实时数据处理和记忆功能，并基于DNA折纸平台构建多种组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位DNA逻辑电路，实现实时输入处理和记忆功能 | DNA逻辑电路元件（逻辑门、触发器、寄存器） | 合成生物学 | NA | 立足点介导链反应（TCR）、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 组合逻辑门（AND、OR）、置位复位触发器、数据锁存器、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 85 | 2026-05-12 |
Leveraging pre-trained AI models for robust promoter sequence design in synthetic biology
2026-Apr-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240033
PMID:42109830
|
研究论文 | 利用预训练AI模型实现合成生物学中稳健启动子序列的设计 | 首次将预训练模型概念应用于启动子序列分析，通过创新的预训练与微调范式，结合基础突变模型，实现高效筛选高表达且抗突变的启动子 | 依赖预训练模型（如DNABERT）的性能，可能受限于训练数据质量和模型泛化能力 | 探索预训练AI模型在合成生物学启动子设计中的应用，减少对传统实验方法的依赖 | 酵母启动子序列及其表达水平 | 机器学习 | NA | DNABERT预训练模型，基础突变模拟 | DNABERT, Pymaker | 序列数据 | 多种数据集规模下的启动子样本 | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物制药 |
| 86 | 2026-05-12 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
|
研究论文 | 介绍了一种针对荚膜红细菌的合成生物学工具箱Rhodo-Box，旨在促进其代谢工程改造 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架，开发了首个针对荚膜红细菌的标准化基因元件工具集，包括多种复制起点、启动子、诱导系统、核糖体结合位点和转录终止子，并引入了半自动化的克隆方法 | 未对工具在复杂代谢途径中的应用效果进行验证，也未评估长期稳定性 | 开发标准化遗传工具以推进荚膜红细菌在可持续生物制造中的应用 | 荚膜红细菌及其遗传元件 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆框架、半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts模块化克隆框架 | 荚膜红细菌 | 基因表达调控线路（启动子、RBS、终止子等） | 工业生物技术 |
| 87 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
|
综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就，弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述，突出其优势和应用前景，并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 88 | 2026-05-12 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
|
综述 | 综述麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 总结了麦角硫因生物合成和分解代谢途径中关键酶的发现与鉴定进展，以及代谢工程策略的最新成果，并介绍了化学酶促级联合成路径实现最高产量 | 未明确提及研究限制，但可能包括异源生产中的代谢负担和产量优化挑战 | 探讨麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 麦角硫因及其关键酶 | 机器学 | NA | 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 化妆品, 医药 |
| 89 | 2026-05-12 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
|
研究论文 | 介绍NUPACK 4软件套件，用于核酸结构、装置和系统的分析与设计 | NUPACK 4在物理模型、计算速度、可扩展性、材料混合和序列约束方面实现了全面升级 | NA | 为核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域提供计算工具 | 核酸结构和装置 | 分子编程 | NA | NUPACK算法，核酸设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应通路，结构工程（含假结） | 合成生物学，纳米技术 |
| 90 | 2026-05-12 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-04-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
|
综述 | 本文综述了植物-微生物共进化在约4.5亿年间的历程，并提出了一个基于共进化原理的工程框架，用于可持续农业发展 | 该文创新性地构建了一个基于深层时间、三支柱框架（细胞器发生、根系进化和免疫门控）的植物-微生物共进化整合框架，并提出了从共进化原则转化为功能蓝图的预测性、进化知情的策略 | NA | 将植物-微生物共进化原理转化为可持续农业的工程策略，以改善作物性能 | 植物-微生物互作关系及其共进化机制 | 机器学习,合成生物学,基因组编辑 | NA | 基因组编辑,合成生物学,AI,微生物组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,基因组编辑工具 | 植物,微生物 | 合成微生物群落,免疫受体工程,代谢开关 | 农业,可持续农业 |
| 91 | 2026-05-08 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
|
research paper | 首次鉴定并表征了蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1，揭示其多产物特性和关键氨基酸残基对骨架多样性的调控机制 | 首次报道蛇足石杉中的微生物样萜类合酶，通过结构导向的诱变研究揭示了酶功能多样性的分子基础，并发现S224A突变使特定二萜产量提升11.6倍 | 未明确说明该酶的底物特异性和体内代谢网络，以及突变体对其他底物和产物的影响未全面评估 | 探究蛇足石杉中微生物样二萜合酶的存在及其功能，并验证突变工程对产物产量的调控潜力 | 蛇足石杉（Huperzia serrata）中的微生物样二萜合酶MTPSL1及其诱变突变体 | 植物功能基因组学、酶工程、天然产物生物合成 | NA | 转录组分析、异源表达、分子克隆、定点诱变、质谱分析、核磁共振 | NA | 转录组数据、化合物结构数据 | 1个MTPSL1酶及其S224A突变体 | 定点诱变、异源表达 | 大肠杆菌（E. coli） | 二萜生物合成途径（针对spatane、prenylkelsoene型和biflorane三类骨架） | 天然产物生物合成、蛋白质工程、合成生物学 |
| 92 | 2026-05-08 |
Identification and characterization of two novel Acinetobacter species capable of degrading polyester
2026-Apr-09, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02491-25
PMID:41954411
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了两株能够降解多种聚酯塑料的新型不动杆菌菌株 | 发现并描述了两个新型不动杆菌分类单元（新种CAAS 2-6和新亚种CAAS 2-13），它们能利用五种主要商品聚酯作为唯一碳源，并鉴定了关键解聚酶多铜氧化酶和烷烃羟化酶 | NA | 鉴定和表征具有聚酯降解能力的新型不动杆菌菌株，扩展其降解塑料的代谢能力并提供生物修复候选菌 | 两株从垃圾渗滤液和草莓农田分离的不动杆菌菌株CAAS 2-6和CAAS 2-13 | 微生物学 | NA | 系统发育分析,基因组比较,酶解聚合实验 | NA | 基因组序列数据 | 两株细菌菌株 | NA | 不动杆菌 | NA | 环境生物修复,工业生物技术 |
| 93 | 2026-05-08 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
|
研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物狗尾草中构建了配体诱导合成电路，通过远程传感技术检测内源性色素生成 | 首次在单子叶植物中实现配体诱导的内源性花青素通路激活，并结合高光谱成像与判别性目标表征方法进行非破坏性远程检测 | 尚未在更大范围单子叶作物或田间环境中验证系统稳定性和普适性，配体渗透效率可能受物理屏障影响 | 探索单子叶植物中诱导型合成电路的应用，实现内源性色素生成的可控诱导与远程传感 | 狗尾草（Setaria viridis）原生质体及整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像，判别性目标表征 | NA | 高光谱图像 | 狗尾草原生质体及整株植物样本 | 传感器电路构建 | 狗尾草（Setaria viridis） | 配体诱导型传感器电路，激活内源性花青素通路 | 农业 |
| 94 | 2026-05-08 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-04, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
|
研究论文 | 工程化细菌外膜囊泡用于增强光免疫治疗 | 结合合成生物学与生物正交化学，双重改造细菌外膜囊泡，同时实现基因工程表达IL-2、载光敏剂ICG及生物正交靶向，形成协同抗肿瘤免疫平台 | 未提及长期安全性评估、大规模制备工艺及临床转化可行性验证 | 开发兼具免疫激活、光热治疗与精准肿瘤靶向的多功能OMV纳米载体，用于增强乳腺癌的光免疫治疗 | 细菌外膜囊泡（OMVs） | 合成生物学 | 乳腺癌 | 电穿孔、代谢糖工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物正交化学 | 细菌 | IL-2表达模块、N3/DBCO生物正交标记系统 | 医学 |
| 95 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
|
研究论文 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在人诱导多能干细胞中高效同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台，实现一周内同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合，并支持近无疤痕载荷整合和组件循环利用 | NA | 开发高效的双基因整合平台，加速干细胞中合成生物学的设计-构建-测试循环 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的神经元、运动神经元和内皮细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人诱导多能干细胞, 神经元, 运动神经元, 内皮细胞 | 四环素诱导型控制与格拉佐普瑞韦诱导型合成基因开关 | 医学, 生物技术 |
| 96 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
|
综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展，重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题，需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 97 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 98 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
|
研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 99 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
|
研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 100 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
|
研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶，实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计（结构、进化和稳定性预测）与半理性筛选（基于L-岩藻糖响应生物传感器），首次获得五重突变体M5，实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性，也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器（FcsR-P） | 工业生物技术、食品 |