合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
81 2026-04-30
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-Apr, Annual review of food science and technology IF:10.6Q1
综述 综述合成生物学在减少真菌毒素污染和增强食品系统可持续性方面的应用 整合人工智能与多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 NA 探讨合成生物学在真菌毒素控制和食品副产物可持续利用中的解决方案 产毒真菌、真菌毒素、食品及加工副产物 NA NA NA NA NA NA CRISPR-Cas9 微生物细胞 微生物细胞工厂、生物传感器 农业, 食品, 环境
82 2026-04-29
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
综述 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构,并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性,从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 未明确提及现有研究的局限性 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略,探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 合成生物学 NA 合成生物学、代谢工程 NA NA NA NA 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) 古菌脂质生物合成途径,包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 工业生物技术、医药
83 2026-04-29
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出GAN-GA混合框架,结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合,在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段,克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果,论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法,生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 机器学习 NA 蛋白质序列生成 Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 蛋白质序列 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
84 2026-04-29
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Apr-27, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
综述 综述光周期通过生长素流调控树木次生生长的机制及其潜在应用 提出生长素流作为光周期调控次生生长的关键机制,并探讨合成生物学方法调控光周期-生长素流关系以优化树木性能 现有证据尚不充分,部分分子机制(如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子)的作用未完全明确 阐述光周期通过生长素流调控次生生长的机制,并探索利用该机制增强树木生长和干旱抗性的策略 温带森林树木(尤其杨树)的次生生长过程 植物生物学、森林科学、合成生物学 NA NA NA NA NA 合成生物学方法 杨树(Populus) 设计光周期不敏感的生长素生物合成回路 环境(碳封存)、农业(林木优化)、工业生物技术
85 2026-04-29
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology IF:12.9Q1
研究论文 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法,调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查,揭示了约80%的基因簇编码未知产物,并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 仅涉及82种真菌,样品量有限,且主要关注生物合成基因簇与分子的关联,未能覆盖所有潜在生物活性化合物 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力,为可持续农业害虫防治奠定基础 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 数字病理学 NA 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 NA 基因组数据, 代谢组数据 82种真菌物种 异源表达 NA 生物合成基因簇 农业
86 2026-04-28
Mechanistic Insight into Conformational Control of Enzyme Activity by Genetically Encoded Metal-Responsive Switches
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
研究论文 探究基于遗传编码金属响应开关的酶活性构象控制机制 揭示双吡啶丙氨酸金属螯合残基通过局部构象变化调控酶活性的分子机制 仅针对两种酶中的一种进行机理验证,通用性需进一步验证 阐明金属响应系统中连接基团控制构象变化驱动酶活性调节的机理 激烈火球菌脯氨酸寡肽酶(Pfu POP) 合成生物学 NA 荧光金属竞争实验、分子动力学模拟、F核磁共振波谱 NA 分子结构数据、荧光信号 NA NA NA 金属响应开关 合成生物学、生物传感、可编程催化
87 2026-04-28
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 提供使用抗生素标记快速多重改造大肠杆菌的全面教程 整合15种抗生素抗性盒实现10-15个基因组修饰在3周内完成,并提供详细设计指南 不适用于需要无疤痕修饰的场景,且主要针对易操作微生物 建立一种快速、高效的多重基因组工程方法 大肠杆菌 合成生物学 NA 重组工程 NA 实验方法 NA 重组工程,抗生素标记 大肠杆菌 多重基因组修饰 工业生物技术
88 2026-04-28
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种基于自包含RNA单元(SCRU)的模块化深度学习框架,用于直接设计RNA序列 通过构建包含超过61,000个自包含RNA单元(SCRU)的SCRU-DB数据库,将RNA分解为结构自主的模块,突破了传统方法依赖高分辨率3D结构数据的瓶颈,并实现了直接O(1)预测和高效扩散采样 未提及具体局限性,但可能依赖于SCRU数据库的完整性和结构聚类准确性 开发可扩展且物理合理的RNA序列设计方法 RNA序列及其自包含结构单元 合成生物学, 深度学习 不适用 深度学习, 3D结构聚类, GNN 图神经网络(GNN), 扩散模型 序列, 3D结构数据 超过61,000个自包含RNA单元(SCRU),涵盖8,200多个独特结构簇 不适用 不适用 不适用 合成生物学
89 2026-04-28
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Apr, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
综述 介绍基于纳米颗粒膜包覆凝聚液滴的形成机制、理化性质及仿生应用 系统分类纳米颗粒膜形成的主要驱动力(界面能驱动自组装、静电相互作用主导组装、协同多机制组装),并强调膜包覆显著提升凝聚液滴的结构完整性和选择性分子渗透性 当前在纳米颗粒包覆凝聚液滴的设计和调控方面存在局限性 通过概述纳米颗粒基膜包覆凝聚液滴的研究进展,推动其在合成生物学和仿生材料领域的进一步研究和应用 凝聚液滴和基于纳米颗粒的膜包覆系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 合成生物学, 仿生材料
90 2026-04-27
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
研究论文 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制,实现合成细胞内的动态重构 首次利用镁离子作为可逆调控因子,通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构,克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应,也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制,模拟活细胞子区室的空间重组 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡,分别作为合成细胞底盘和子区室模型 数字病理学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学、工业生物技术
91 2026-04-27
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文综述了免疫受体的膜基组装和相互作用,探讨了其在脂质双层中的分子原理和结构基序 系统总结了跨膜结构域(TMD)在免疫受体组装和信号传导中的关键作用,并揭示了膜内与膜间的分子相互作用对受体结构和功能的重复性解决方案 NA 理解免疫受体在脂质双层中的组装和调控机制,以及它们在合成生物学应用中的潜力 免疫受体,特别是单跨膜蛋白组成的受体复合物 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 合成生物学
92 2026-04-27
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell IF:13.6Q1
综述 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 系统整合了合成生物学调控回路设计(感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征)与多种治疗模态的联合策略 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 合成生物学 癌症 NA NA NA NA CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 细菌(如溶瘤细菌) 诱导型/自主调控回路(包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子),产物释放模块(前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段) 医学
93 2026-04-25
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2
综述 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物,并总结其功能多样性 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物,并整合其作用机制与结构-功能关系 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性,以及体内特定化合物因果归因的挑战 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 微生物学 NA 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 NA 化学结构数据、代谢物数据 NA 合成生物学 芽孢杆菌 NA 农业, 食品, 医药
94 2026-04-15
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
95 2026-04-24
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal IF:3.2Q2
研究论文 本文使用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其作为无蛋白质融合剂的精细特性 首次在细胞大小的膜上系统量化钙离子介导的融合效率,并发现融合依赖于狭窄的参数空间,澄清了不同尺寸囊泡实验间的长期矛盾 研究仅限于特定脂质成分和钙浓度,未涵盖生理条件下其他离子或蛋白质的影响 阐明钙离子在无蛋白质条件下促使细胞大小膜融合的机制及其应用潜力 巨型单层囊泡 合成生物学 NA NA NA 图像 数百个单个囊泡 NA NA NA 合成生物学, 膜重构研究
96 2026-04-23
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 NA 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 NA NA 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 NA NA NA NA NA NA 医药、保健、化妆品
97 2026-04-23
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台,并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 作为综述文章,未提出新的实验数据或具体技术方案,主要基于现有文献进行整合分析 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) 结构生物学与合成生物学 NA 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold NA 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 NA 理性设计工程 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断
98 2026-04-23
From Xylose to Biobased High-Value Chemicals: Advances in Microbial Xylose Utilization for Industrial Biotechnology
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了微生物利用木糖生产高价值化学品的最新研究进展,重点关注木糖代谢途径、代谢工程策略以及相关挑战与未来机遇 系统总结了利用代谢工程和合成生物学技术提升微生物木糖利用效率的最新策略,并提出了从木质纤维素中高效提取木糖、葡萄糖与木糖共利用等关键挑战的解决方案 NA 提高木质纤维素生物质中木糖的利用效率,以生产高价值化学品并促进工业生物技术发展 微生物的木糖代谢途径及利用木糖生产高价值化学品的生物过程 工业生物技术 NA 代谢工程,合成生物学 NA NA NA NA NA NA 能源,工业生物技术
99 2026-04-23
Living Microbial Drugs
2026-Apr-22, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
综述 本文综述了活微生物治疗剂作为新型药物类别的发展,从传统益生菌到先进的合成生物学工程微生物,探讨了其设计原则、应用领域及面临的挑战 将合成生物学应用于微生物工程,使其具备检测宿主信号、原位递送治疗药物的能力,实现动态、自调节的个性化治疗 存在生物安全性、生物控制、监管审批和患者接受度等障碍 探讨活微生物治疗剂作为新型药物的发展、设计原则及其在疾病治疗中的应用 工程化微生物(包括细菌、酵母、噬菌体和古菌)作为治疗平台 合成生物学 传染病、代谢疾病、炎症性疾病、癌症 合成生物学、遗传逻辑电路、群体感应调控、合成记忆设备 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly 细菌、酵母、噬菌体、古菌 遗传逻辑电路、群体感应调控系统、合成记忆设备,用于实现上下文依赖和自我调节的治疗能力 医学
100 2026-04-23
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-21, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文提出了一种利用N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰调控toehold介导的链置换反应的方法,实现了对DNA分子电路的可编程动力学控制,并应用于microRNA检测 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入toehold结构域,实现了对链置换反应动力学的可逆、精确调控,突破了传统方法依赖固定toehold稳定性的限制 未明确说明该技术在其他类型核酸电路或更复杂生物环境中的普适性及长期稳定性 开发一种可编程调控分子电路动力学的新方法,并提高microRNA检测的灵敏度与特异性 toehold介导的DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 合成生物学 癌症 单碱基N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰、脱甲基酶FTO调控、细胞内成像 NA 实验数据与理论分析 NA NA NA 表观遗传调控的toehold介导链置换系统、催化发夹组装电路 生物传感、分子计算、合成生物学
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