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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-04-16 |
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-Apr-15, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00726
PMID:41919686
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研究论文 | 本文介绍了一种基于滚环扩增技术的仿生囊泡平台,可在巨型囊泡内构建DNA网络以增强结构稳定性 | 首次在合成囊泡中通过滚环扩增构建类细胞骨架的DNA网络,实现分子尺度生化活动与介观尺度机械行为的耦合 | NA | 开发具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞 | 巨型囊泡和DNA网络结构 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增技术 | NA | NA | NA | DNA折纸术 | NA | DNA网络结构(类细胞骨架) | 合成生物学、生物制造、仿生材料 |
| 122 | 2026-04-16 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了利用酵母(如酿酒酵母、毕赤酵母和粟酒裂殖酵母)通过减轻细胞内天然产物积累的代谢负担来增强天然产物(特别是萜类)合成的近期进展 | 聚焦于通过减轻代谢负担来提升酵母中天然产物合成的策略,包括转运蛋白过表达与工程化、膜结构改变和提取方法,总结了未来研究方向 | NA | 增强微生物细胞工厂中天然产物的合成效率,通过减轻代谢负担策略 | 酵母物种(酿酒酵母、毕赤酵母、粟酒裂殖酵母)及其在天然产物(尤其是萜类)合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 粟酒裂殖酵母 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 123 | 2026-04-16 |
Stomata as a Defence Nexus: Integrating Drought and Pathogen Stress Signalling
2026-Apr-14, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70542
PMID:41982084
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综述 | 本文综述了植物气孔在协调病原体入侵和干旱胁迫响应中的双重防御角色,强调了在复合压力下气孔动态的协同与拮抗机制 | 将气孔视为防御中枢,整合干旱和病原体胁迫信号,揭示了复杂的信号网络交叉对话,并探讨了工程化优化气孔响应以增强作物抗逆性的前沿方向 | 未解决防御与生长之间的权衡、信号通路干扰以及组织特异性功能冗余等关键问题 | 研究气孔在整合干旱和病原体胁迫信号中的防御作用,以增强作物对气候变化的复合胁迫抗性 | 植物气孔及其在胁迫响应中的功能 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 124 | 2026-04-16 |
TargetGAN: A generative AI framework for designing plant core promoters with targeted activity
2026-Apr-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 本研究提出了一个名为TargetGAN的深度学习框架,用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将生成对抗网络与预训练活性预测器相结合,实现了用户自定义活性的植物核心启动子从头设计,并成功生成了超越天然启动子活性的合成启动子 | 预测活性与实验活性之间仅呈现中等相关性(PCC=0.6435),且仅对部分合成启动子进行了功能验证 | 开发一个能够设计具有目标活性植物核心启动子的生成式人工智能框架 | 植物核心启动子 | 合成生物学 | NA | STARR-seq、荧光素酶报告基因检测 | GAN | 基因序列数据 | 76,851个天然启动子用于训练,55,296个合成启动子生成,其中5,250个用于高通量验证,2,909个成功表征 | NA | 植物系统 | 具有目标活性的合成启动子设计 | 农业、工业生物技术 |
| 125 | 2026-04-16 |
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70350
PMID:41968466
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综述 | 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用、工程化策略及面临的挑战 | 系统总结了利用分子与合成生物学技术(如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术)对bEVs进行定向生物工程改造的最新进展,以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化bEVs | 指出bEVs技术转化仍面临可扩展性、安全性、标准化和监管框架等关键挑战 | 探讨细菌胞外囊泡在生物医学领域的应用潜力及临床转化前景 | 细菌胞外囊泡 | NA | NA | 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 126 | 2026-04-16 |
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70329
PMID:41973552
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研究论文 | 本研究开发了一种细胞-机器接口系统(Segregostat),用于在工业生物反应器扰动条件下可靠控制微生物的应激响应 | 首次在工业生物反应器典型扰动条件下评估并验证了Segregostat系统对微生物应激响应的鲁棒控制能力 | 研究仅针对大肠杆菌和酿酒酵母两种模式生物,未在更广泛的工业菌株或复杂共培养体系中验证 | 开发在工业生物过程扰动条件下可靠控制微生物应激响应的细胞-机器接口系统 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的通用应激响应 | 合成生物学 | NA | 规模缩小生物反应器实验、自动化流式细胞术 | NA | 流式细胞术数据、生物过程参数 | NA | 细胞-机器接口 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 应激响应控制系统(Segregostat) | 工业生物技术 |
| 127 | 2026-04-15 |
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151715
PMID:41911994
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研究论文 | 本研究开发了一种基于农杆菌的瞬时表达系统,用于快速评估地钱中的遗传元件,并系统性地比较了多种启动子、终止子和信号肽的性能 | 开发了首个用于地钱的高通量瞬时表达系统,可在8天内完成实验,显著提高了遗传元件表征的效率,并发现了一个截短的CaMV35S启动子变体,其活性比标准版本提高了409倍 | NA | 开发并验证一种快速高效的瞬时表达系统,以扩展地钱的遗传工具包并提高蛋白质表达水平 | 地钱(Marchantia polymorpha)中的遗传元件,包括启动子、终止子和信号肽 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达系统 | NA | 蛋白质表达数据 | 21个启动子、15个终止子和7个信号肽 | 农杆菌介导的转化 | 地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业 |
| 128 | 2026-04-14 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Apr-11, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
|
综述 | 本文综述了基于进化原理的非核糖体肽和聚酮工程的有效策略,以提升新型抗生素的生物合成产量 | 从单纯依赖结构数据转向结合进化原则和数据集指导工程策略,优化重组边界选择并平衡高通量与准确性 | 重组组装线普遍存在产量降低问题,且尚无单一工程策略能显著最小化产量损失 | 实现高效高产的非核糖体肽和聚酮工程,以生产新型抗生素和其他生物活性分子 | 非核糖体肽合成酶(NRPS)和聚酮合酶(PKS)组装线 | 合成生物学 | NA | 进化分析、重组工程、高通量方法 | NA | 结构数据、进化数据集 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 129 | 2026-04-13 |
A synthetic angiotensin II/ACE2-based hormone shunt controlling experimental hypertension
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71796-z
PMID:41965354
|
研究论文 | 本文设计了一种基于合成生物学的抗高血压基因回路ARCH,用于监测和控制血管紧张素II依赖的高血压 | 创新点在于开发了一种完全人源化的、可逆且闭环的基因回路,通过合成启动子协调表达工程化可溶性ACE2,以降解血管紧张素II并恢复正常血压 | 研究仅在雄性高血压小鼠模型中进行,未涉及雌性动物或长期安全性评估 | 研究目的是开发一种自主调节慢性高血压的合成生物学方法,以精确控制RAS驱动的高血压 | 研究对象是血管紧张素II依赖的高血压,使用转基因人细胞植入小鼠模型 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 合成生物学工程方法,包括基因回路设计和细胞微囊化 | NA | NA | 涉及雄性高血压小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 | 合成生物学工程方法,包括基因回路设计和细胞工程 | 转基因人细胞 | 设计了一种名为ARCH的基因回路,包括ATR受体监测Ang-II水平,并通过合成启动子协调表达工程化可溶性ACE2,以降解Ang-II并恢复血压 | 医学 |
| 130 | 2026-04-13 |
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27900
PMID:41966398
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综述 | 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 | 强调了利用酵母发酵,特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母,将乳制品废物转化为增值产品的策略,并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 | 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 | 旨在减少乳制品食物废物,回收营养物质,降低温室气体排放,并支持乳制品行业的循环经济 | 乳制品食物废物,特别是奶酪乳清及其衍生物 | NA | NA | 酵母发酵,菌株工程,适应性进化,合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母,包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 | NA | 农业,环境,工业生物技术 |
| 131 | 2026-04-13 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展,包括修饰方法、合成策略、结构-活性关系及对下一代治疗的影响 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度,如环状RNA、分支结构和合成套索架构,以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 | NA | 探索mRNA的化学和拓扑工程,以优化其治疗应用 | mRNA分子,包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤、遗传病 | 化学合成、合成生物学、RNA结构设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 132 | 2026-04-13 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Apr-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
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综述 | 本文综述了细菌接合在合成生物学中的应用,包括其作为工具递送遗传电路和代谢途径,以及在不同生物技术领域如微生物底盘识别、联合体监测、生物修复和选择性杀灭中的扩展应用 | 通过整合接合与合成生物学策略,扩展了研究空间,提出了实用指南,以促进研究人员利用接合转移 | NA | 探讨细菌接合在合成生物学中的部署,以促进多样化的生物技术应用 | 细菌接合系统、遗传电路、代谢途径、微生物群落 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 切换开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢途径 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 133 | 2026-04-13 |
Synthetic biology development of microbial strains for liquid biofuel production
2026-Apr-06, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108891
PMID:41950978
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发用于生产液体生物燃料的微生物菌株的最新进展 | 从底盘菌株选择、合成生物学工具开发及菌株代谢调控工具三个角度系统总结了合成生物学在生物燃料生产中的应用进展,并展示了重要生物燃料菌株开发的实例 | NA | 为生物燃料生产菌株的开发提供有价值的参考,促进生物燃料技术的进一步发展和应用 | 用于生产液体生物燃料的微生物菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 代谢通路优化 | 能源, 工业生物技术 |
| 134 | 2026-04-13 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应型工程菌在靶向癌症治疗中的策略、机制与应用进展 | 聚焦于将外源性响应调控因子(如超声)与微生物疗法相结合,为肿瘤治疗提供更智能、精准和有前景的策略 | NA | 总结工程菌在肿瘤治疗中的核心修饰方法、作用机制、主要应用策略,并重点阐述超声与工程菌结合的形式及相互作用机制 | 工程菌及其与超声结合的系统 | 合成生物学 | 癌症 | 生物与物理化学方法的功能修饰与工程化 | NA | NA | NA | NA | 多种来源的细菌 | 超声响应型智能药物递送系统 | 医学 |
| 135 | 2026-04-12 |
Gallium in liquid state shows nuclease-mimicking activity
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71346-7
PMID:41963312
|
研究论文 | 本文发现液态镓具有类似核酸酶的活性,能够选择性切割DNA,其机制涉及核苷酸偏向性吸附和羟基自由基辅助的磷酸二酯水解 | 液态镓首次被证明可作为无配体和辅因子的仿生核酸酶平台,其独特的氧化物层用于底物吸附,金属核心提供电子作为切割活性中心,活性可通过合成参数和外部刺激调控 | NA | 探索非生物材料模拟酶活性的最小化方法,以扩展仿生酶系统的设计空间 | 液态镓及其模拟的核酸酶活性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 生物材料 |
| 136 | 2026-04-12 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Apr-10, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 本文综述了溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)在体内追踪的策略,包括光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因和纳米平台,并探讨了其在临床转化中的应用 | 批判性评估了当前和新兴的体内追踪策略,强调了合成生物学报告基因、AI驱动的图像分析、生物传感器和液体活检等新兴技术,为患者特异性追踪提供了可扩展的解决方案 | 存在基因组容量有限、免疫介导的清除和信号穿透性不足等持续挑战 | 评估溶瘤呼肠孤病毒的体内追踪策略,以优化其临床转化和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)及其在癌症治疗中的应用 | 医学影像学 | 癌症 | 光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因、纳米技术平台、CRISPR驱动电路、病毒条形码 | NA | 图像、分子数据 | NA | CRISPR | NA | CRISPR驱动电路 | 医学 |
| 137 | 2026-04-12 |
Dynamic, autonomous gene expression system for self-adaptation and self-regulation in microbial production
2026-Apr-05, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108889
PMID:41942052
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综述 | 本文综述了微生物生产中用于自我适应和自我调节的动态自主基因表达系统的最新进展 | 总结了单细胞和群体水平的自主调控策略,包括代谢物响应、细胞负担响应、群体感应响应和pH响应系统,并强调反馈和前馈控制架构以实现稳定性和预测性适应 | NA | 开发能够自主优化在波动生物加工条件下性能的下一代细胞工厂 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 动态电路,包括传感、反馈和控制模块,用于维持稳态和优化代谢通量 | 工业生物技术 |
| 138 | 2026-04-11 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 本文综述了1,4-丁二醇生物合成途径工程的最新进展、面临的挑战及未来方向 | 系统评估了三种主要的体内生物合成途径(CoA依赖途径、木质纤维素衍生糖分解途径和氨基酸分解途径)的理性优化策略,以及体外全细胞转化和酶级联反应两种生物转化系统的建立 | 工业规模化生产仍受限于未解决的细胞内分解代谢、宿主耐受性限制以及次优的经济可行性 | 实现1,4-丁二醇的可持续生物基生产 | 1,4-丁二醇的生物合成途径与工程化微生物 | 合成生物学 | NA | 酶工程、动态代谢调控策略、多组学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | CoA依赖途径、木质纤维素衍生糖分解途径、氨基酸分解途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 139 | 2026-04-11 |
Prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal hypoxia responses in plants
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71366-3
PMID:41957032
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在拟南芥中构建了一个三组分系统,实现了依赖氧气的蛋白质降解,以探索植物与动物对缺氧响应的相同机制 | 首次在植物中构建了基于脯氨酰羟化酶的氧气依赖性蛋白质降解系统,并证明其能部分恢复缺氧不敏感突变体的缺氧响应能力 | 合成系统仅能部分恢复缺氧响应,且在实际应用(如作物改良)中的效果仍需进一步验证 | 探索植物与动物对缺氧响应的共同机制,并开发用于作物胁迫条件改良的工具 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 三组分氧气依赖性蛋白质降解系统 | 农业 |
| 140 | 2026-04-11 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
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综述 | 本文综述了基于群体感应的细菌与真菌间通讯机制,分析了其在微生物网络组装和生态系统功能中的作用,并探讨了通过合成生物学策略重新编程这些相互作用的工程化前景 | 首次系统性地总结和分析了细菌与真菌间基于群体感应的跨物种通讯机制,并对比了自然范式与合成生物学设计策略,为模块化控制微生物群落提供了蓝图 | 该领域现有认识仍较为零散,缺乏系统性总结,且对某些特定环境或物种组合的相互作用机制理解尚不深入 | 全面分析和工程化改造基于群体感应的细菌与真菌间通讯,以促进对复杂微生物相互作用的解析并增强工程化微生物群落的能力 | 细菌与真菌间的群体感应通讯系统及其介导的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 启动子工程, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 群体感应系统, 生物传感器 | 工业生物技术, 环境, 医药 |