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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-04-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
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综述 | 本文综述了基于进化原理的害虫管理策略,并结合人工智能和合成生物学技术,以柑橘黄龙病为例,探讨了可持续农业解决方案 | 提出了进化信息害虫管理(EIPM)框架,将进化原理与人工智能、合成生物学相结合,用于设计持久的生物防治工具 | NA | 开发可持续的农业害虫管理策略,特别是针对柑橘黄龙病 | 柑橘黄龙病(HLB)及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 162 | 2026-04-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
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研究论文 | 本研究系统性地鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点,并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因的整合与表达 | 首次系统性地鉴定并表征了S. islandicus中的8个染色体整合位点,利用CRISPR-COPIES流程和多组学计算工作流程开发了13个人工CRISPR RNAs,并利用内源性CRISPR-Cas系统实现了基因整合 | 研究中发现整合位点存在显著的位置效应,可能影响外源基因的表达效率 | 扩展S. islandicus的遗传工具,推动其作为古菌合成生物学和工业生物技术平台的潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-COPIES流程、多组学计算工作流程、β-半乳糖苷酶测定 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas | Sulfolobus islandicus | 基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 163 | 2026-04-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
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研究论文 | 本文提出了一种基于实验价格指数(EPI)和机器人辅助模块(RAM)的标准化方法,用于评估和优化生物铸造厂中的自动化工作流程,以提高微生物菌株开发的经济效率 | 引入了实验价格指数(EPI)作为结合时间和成本的标准化指标来量化自动化工作流程效率,并提出了机器人辅助模块(RAM)作为即插即用单元来构建工作流程 | 未明确说明该方法在不同类型生物技术应用中的普适性验证程度,也未详细讨论实际部署中可能遇到的技术或操作挑战 | 开发一种标准化方法来评估和优化生物铸造厂中自动化工作流程的经济效率,以加速微生物菌株开发 | 生物铸造厂中的自动化工作流程,特别是用于微生物菌株开发的四个工作流程:gRNA克隆、基因组编辑、DNA组装和样品分析 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)工作流程、机器人辅助自动化 | NA | 实验时间和成本数据 | NA | CRISPR-Cas9(用于基因组编辑)、DNA组装技术 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 工业生物技术 |
| 164 | 2026-04-04 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
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综述 | 本文综述了通过分子途径和合成生物学方法增加植物根系碳储存以应对温室气体问题的策略 | 探讨利用合成生物学工程化作物根系以增强地下碳储存的创新分子途径 | 增加根系碳分配可能面临产量降低的挑战,且根系碳储存效果需进一步测试验证 | 研究如何通过分子和合成生物学方法提高植物根系碳含量,以促进碳封存 | 植物根系,特别是作物植物 | 合成生物学 | NA | 分子途径工程,合成生物学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 作物植物 | NA | 环境,农业 |
| 165 | 2026-04-04 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆的小分子开关自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子控制的基因表达开关,并整合多重调控模块实现独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 可编程RNA基因电路,包含多重调控模块如去稳定化结构域、RNA结合蛋白、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序 | 医学 |
| 166 | 2026-04-04 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
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综述 | 本文全面综述了通过微生物和酶法生产生物塑料(特别是聚羟基脂肪酸酯)的代谢途径、结构特性及新兴技术创新 | 重点探讨了体外酶法合成PHA的最新进展,包括PHA合酶工程、无细胞代谢工程平台、酶固定化和表面展示策略,以实现完全可编程和模块化的聚合 | NA | 为在循环生物经济框架内实现可扩展、可定制且环境友好的酶法生物塑料提供战略方向 | 生物塑料,特别是聚羟基脂肪酸酯(PHA) | NA | NA | 体外酶法合成、无细胞代谢工程、酶固定化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌 | PHA生物合成途径 | 环境, 工业生物技术 |
| 167 | 2026-04-04 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
|
综述 | 本文系统综述了已解析的pentatricopeptide repeat (PPR)蛋白晶体结构,分析了其结晶学特性、结构特征及其对理解PPR功能的作用 | 首次对PPR蛋白的所有晶体结构进行全面编目和综合分析,揭示了PPR识别密码、RNA结合时的构象变化以及模块化结构基础 | NA | 系统整理和分析PPR蛋白的晶体结构数据,以促进对其结构和功能的理解 | PPR蛋白的晶体结构(包括天然和设计蛋白) | 结构生物学 | NA | 晶体学、冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 113个PPR蛋白结构(30个PPR和83个核糖体PPR结构) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 168 | 2026-04-03 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于检测肿瘤DNA的最新进展 | 将基因工程细菌作为活体检测器,结合CRISPR-Cas工具和天然基因转移能力,实现肿瘤DNA的原位检测 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度方面的限制 | 开发用于癌症诊断的工程细菌生物传感器 | 肿瘤DNA,特别是KRAS突变 | 合成生物学 | 结直肠癌和胃肠道癌 | CRISPR-Cas工具,基因工程,水平基因转移 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 生物传感器,基因回路,同源重组,多重CRISPR系统,安全回路 | 医学 |
| 169 | 2026-04-03 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Apr-02, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在仿生细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA的可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建具有多刺激响应性和可编程生化微环境的人工凝聚物,并展望了与光遗传学、单分子技术和机器学习结合的智能多组分系统 | 时空控制有限、易受核酸酶降解和免疫原性等问题,限制了其在活体系统中的转化应用 | 探讨DNA凝聚物的构建方法及其在合成生物学和精准医学中的生物应用 | DNA凝聚物及其在细胞环境中的功能模拟与应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 170 | 2026-04-03 |
Peimine: A comprehensive review of its botanical distribution, biosynthesis, pharmacological effects and pharmacokinetics
2026-Apr, Fitoterapia
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.fitote.2026.107140
PMID:41692275
|
综述 | 本文全面综述了贝母素(PM)的植物分布、生物合成途径、药理作用及药代动力学研究进展 | 系统整合了PM的物种特异性分布规律与多靶点药理机制,并指出合成生物学在PM生产中的应用前景 | PM的口服生物利用度较低且药代动力学特征尚未完全明确,限制了其临床转化潜力 | 总结PM的最新研究进展,为其合理开发与利用提供科学依据 | 贝母属植物(如浙贝母、平贝母、湖北贝母)中提取的甾体生物碱贝母素(PM) | NA | 呼吸系统疾病、癌症 | 基因组学、酶学表征、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 171 | 2026-04-03 |
Constructing cellulosomes to enhance lignocellulose degradation and biotechnological applications: A review
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151467
PMID:41856184
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综述 | 本文综述了天然和工程化纤维素小体的最新进展,强调其结构多样性、协同机制及工业应用,以增强木质纤维素降解和生物技术应用 | 介绍了'设计者纤维素小体'作为模块化平台,通过合成支架设计、宿主优化和操作子工程,提升催化协同性、热稳定性及整合生物加工,并探索了双对接模块、三方对接相互作用和糖基化增强稳定性等新概念 | NA | 开发高效木质纤维素生物加工策略,以促进可持续和可再生能源来源 | 纤维素小体,包括天然来源(如梭菌属、瘤胃球菌属和拟杆菌属)和工程化系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成支架设计, 操作子工程 | 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 马克斯克鲁维酵母 | 设计者纤维素小体作为模块化平台,整合酶复合物以增强降解效率 | 能源, 工业生物技术 |
| 172 | 2026-04-02 |
Advances in Ene-Reductase Engineering: Dynamic Structure, Catalytic System Innovation, and Green Application Prospects
2026-Apr-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14585
PMID:41873156
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综述 | 本文综述了烯还原酶(ERs)的动态结构调控、定向进化、固定化技术及其在药物合成和环境修复中的应用 | 重点阐述了构象变化对催化选择性的影响、光酶协同系统以及AI辅助设计,并展望了低成本固定化、连续流工艺和多场耦合催化系统等新兴方向 | NA | 总结烯还原酶的研究进展,并为未来研究提供理论参考 | 烯还原酶(ERs) | 合成生物学 | NA | 定向进化、固定化技术、AI辅助设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物合成, 环境修复 |
| 173 | 2026-04-02 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法治疗实体瘤的生物学基础、临床应用、组合疗法、新一代病毒平台的发展以及临床转化面临的主要障碍和应对策略 | 系统性地概述了溶瘤病毒疗法的最新临床进展、新兴组合策略以及基于合成生物学和免疫肿瘤学发展的下一代病毒平台,并指出了克服临床转化障碍的新兴策略 | NA | 总结溶瘤病毒疗法在实体瘤治疗中的现状、挑战与未来发展方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 174 | 2026-03-28 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中构建了配体诱导型合成回路,以激活内源性花青素通路,并利用高光谱成像技术实现非破坏性远程检测 | 首次在单子叶植物中成功适配配体诱导型传感器来操纵内源性色素通路,并开发了结合高光谱成像与判别性目标表征方法的近远程检测系统 | 研究主要基于模式植物狗尾草,尚未在主要粮食作物中进行验证;配体吸收的物理屏障问题仅部分通过筛选高效诱导剂解决 | 开发适用于单子叶植物的可诱导合成生物学系统,实现植物对环境污染或有害化学物质的传感报告功能 | 狗尾草(Setaria viridis)的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 遗传回路设计、配体诱导表达系统、高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 高光谱图像、植物表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及原生质体和整株植物实验 | 配体诱导型传感器、合成遗传回路 | 狗尾草(Setaria viridis) | 配体诱导型传感器回路,可激活内源性花青素生物合成通路 | 农业,环境 |
| 175 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
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综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展,重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产,包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产,以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物(羟基哌啶酸) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 176 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用,通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物,从而维持高尔基体中的半纤维素生产,这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者,以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥(Arabidopsis)的MAN2和MAN5酶,以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 177 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
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综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用,并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识,并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 178 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
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综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物,影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架,将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来,并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物(如植物化学物质、多糖、复方草药)、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 179 | 2026-03-14 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 本文综述了通过单细胞和空间组学技术系统理解植物免疫网络的进展,包括受体激活、基因调控回路、蛋白质互作中心和染色质动态如何共同影响免疫结果 | 整合单细胞和空间组学揭示植物免疫异质性,识别了专门的“PRIMER”细胞和“旁观者”细胞,并探讨了系统与合成生物学方法在作物抗病工程中的应用 | NA | 系统理解植物免疫网络,以指导作物更持久和广谱的抗病性工程 | 植物免疫系统,包括PTI、ETI、SAR层,以及NLR受体、PRIMER细胞和旁观者细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间组学、结构分析、蛋白质组学、互作组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 180 | 2026-03-14 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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研究论文 | 本文探讨了植物基因组中超级增强子如何调控基因簇(特别是生物合成基因簇)的转录,以协调基因的共表达,从而影响特化代谢物的产生 | 揭示了超级增强子在植物生物合成基因簇共表达中的核心作用,并展示了通过CRISPR/Cas技术破坏超级增强子可以改变整个基因簇的表达 | NA | 研究超级增强子介导的基因簇转录调控机制,以促进合成生物学、代谢工程和作物改良 | 植物基因组中的基因簇,包括同源基因簇和生物合成基因簇,特别以拟南芥为例 | 合成生物学 | NA | T-DNA插入、CRISPR/Cas诱导删除、组织特异性染色质可及性数据集分析 | NA | 基因组数据、染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | NA | 农业, 工业生物技术 |