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当前共找到 189 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-07 |
Beyond the parasite: reframing cutaneous leishmaniasis as a host-microbiome-vector ecosystem
2026-Jul-31, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127250
PMID:42537823
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综述 | 本文综述了皮肤利什曼病的治疗策略，将其从单一感染模型转变为宿主-微生物-寄生虫-媒介生态系统模型，并探讨了工程学、合成生物学和人工智能框架在该领域的应用。 | 将皮肤利什曼病重新定义为宿主-微生物组-媒介生态系统，并整合工程学、合成生物学和人工智能方法提出多靶点治疗策略。 | 未详细说明具体实验数据或临床验证，仅基于文献综述和理论框架。 | 提出一种系统级策略，通过整合工程学、合成生物学和人工智能方法开发下一代皮肤利什曼病疗法，以减轻全球疾病负担。 | 皮肤利什曼病，涉及宿主、利什曼原虫、宿主和沙蝇微生物组及其相互作用。 | 生物医学工程, 微生物组, 合成生物学 | 皮肤利什曼病 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 人类宿主和沙蝇媒介 | NA | 医学 |
| 2 | 2026-08-07 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Jul-10, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 本研究利用整合多组学方法揭示了微小病原体微小支原体在pH变化下的代谢和翻译适应性切换机制 | 首次构建了系统级pH适应模型，揭示了缺乏典型转录调控系统的微小细菌通过激活预先存在的功能模块和表观转录组动态重组来实现适应性可塑性 | 研究未涉及体内或临床条件下的pH适应性验证，可能限制结果的广泛适用性 | 构建微小支原体对pH适应的系统级模型，理解基因组减少生物的适应性机制 | 微小支原体（Ureaplasma parvum） | 微生物学 | 泌尿生殖道感染 | 蛋白质组学、代谢组学、RNA修饰分析 | NA | 组学数据（蛋白质、代谢物、RNA） | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 3 | 2026-08-06 |
Gram-scale production of forskolin in yeast through biosynthetic network elucidation and pathway optimization
2026-Jul-31, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135538
PMID:42537937
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研究论文 | 本研究通过阐明佛司可林生物合成网络并优化代谢途径，在酵母中实现了克级规模的佛司可林生产，最终在5升生物反应器中达到2.7克/升的最高产量。 | 首次阐明了佛司可林生物合成中三个细胞色素P450介导的多位点氧化网络，并基于此构建了高效的酵母合成途径，通过多维工程策略优化，实现了迄今报道的最高产量。 | 摘要未提及明确的局限性。 | 在酵母中实现佛司可林的可持续、高效生产，并阐明其生物合成网络。 | 佛司可林生物合成途径及其在酵母中的异源表达。 | 合成生物学 | 骨质疏松、心血管疾病、代谢综合征 | 代谢工程 | 不适用 | 生物化学数据 | 不适用 | 不适用 | 酵母 | 佛司可林生物合成途径 | 医药、营养保健品、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-06 |
Efficient rDNA-mediated multi-copy integration of gene clusters in Aureobasidium melanogenum
2026-Jul-30, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.07.010
PMID:42532222
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研究论文 | 本研究开发了一种基于核糖体DNA（rDNA）介导的多拷贝基因簇整合策略，成功在Aureobasidium melanogenum中实现大片段基因的高效稳定整合，显著提高了黑色素产量。 | 首次在A. melanogenum中利用高重复rDNA序列作为同源重组位点，实现大型基因簇（如11.0 kb）的多拷贝整合，并系统比较了不同rDNA区域的整合效率，为非常规酵母底盘细胞提供了新的代谢工程工具。 | 未提及具体局限性，但可能存在整合位点偏好性和长期遗传稳定性需进一步验证的问题。 | 开发一种高效的多拷贝基因整合方法，以促进A. melanogenum底盘细胞的代谢重编程。 | Aureobasidium melanogenum菌株及其rDNA序列、绿色荧光蛋白基因（gfp）、聚酮合酶基因（pks）和黑色素生物合成基因簇。 | 合成生物学 | NA | 同源重组、聚合酶链反应、亚克隆、实时荧光定量PCR | NA | 基因序列数据、拷贝数数据、表达稳定性数据、黑色素产量数据 | 涉及3个不同rDNA区域（rDNA1, rDNA2, rDNA3），两个异源基因（gfp和pks）和一个11.0 kb基因簇；未明确样本数量。 | CRISPR-Cas9 | Aureobasidium melanogenum | 核糖体DNA介导的多拷贝基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-08-05 |
Protein modification: convergence of artificial intelligence, synthetic biology, and nano-assembly
2026-Jul-31, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.150606
PMID:42546624
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综述 | 本研究批判性地审视了生物合成蛋白质功能增强的最新进展，强调计算设计、人工智能引导的蛋白质工程和遗传密码扩展等新兴策略，以及化学、酶和物理场辅助修饰技术与宏观自组装和纳米制造相结合的综合修饰方法 | 创新性地整合了人工智能、合成生物学和纳米组装三个领域，提出闭环AI引导的蛋白质设计路径，并强调多策略协同作用对蛋白质功能的显著提升 | 未提供具体实验数据或详细案例，缺乏对实际应用中的挑战和局限性的深入讨论 | 探讨通过综合修饰策略增强生物合成蛋白质功能，以克服其在先进食品系统中的功能缺陷，推动可持续高性能蛋白质配料的发展 | 生物合成蛋白质 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-08-04 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Jul-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
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观点文章 | 提出一个受交响乐启发的系统工程框架，用于多微生物合成生物学，将群落设计组织在四个协调层面，并提供一个模块化工程蓝图，以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化。 | 将多微生物工程重新定位为协调系统设计而非孤立的遗传控制问题，提出模块化而非规定性的框架，允许根据应用需求和环境复杂性部署不同的协调层。 | 讨论了代谢物运输、群体漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束，但具体解决方案未详细展开。 | 为多微生物合成生物学提供结构化的系统工程框架，促进合成微生物群落在工业、环境和治疗领域的应用。 | 合成微生物群落（微生物聚生体）。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 协调层包括通信、时间调控、生态结构和预测建模，设计涉及振荡控制、合成生态学等 | 工业、环境、医学 |
| 7 | 2026-08-04 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类代谢工程中的应用，包括途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别 | 未详细讨论具体菌株和技术的实验验证细节 | 探讨微生物生产萜类化合物的代谢工程策略，并强调计算方法的整合以优化菌株 | 微生物菌株及萜类生物合成途径 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 基因工程、人工智能、机器学习 | AI/ML模型（未具体指定） | 基因组学、系统生物学数据 | NA | 基因编辑工具（未具体指定） | 微生物宿主（如大肠杆菌、酵母等，未具体列出） | 萜类生物合成途径的异源重构和代谢通量重定向 | 医药、营养保健品、化妆品、农业、香料、生物燃料 |
| 8 | 2026-08-04 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
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研究论文 | 本文提供了一个设计合成小调节RNA（sRNAs）的详细指南，以实现细菌中高效基因敲低 | 提出了综合的sRNA设计原则和关键优化因素，包括支架选择、目标mRNA结合亲和力、目标mRNA二级结构和Hfq表达水平，并强调跨物种适用性 | 文中未提及具体实验数据或验证，可能缺乏实际应用中的性能评估 | 提供一套详细的协议，用于设计和构建合成sRNA，以在细菌中实现高效基因敲低 | 合成小调节RNA（sRNAs）及目标基因mRNA | 机器学习 | NA | 合成生物学设计 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成小调节RNA（sRNA）基因敲低系统 | 合成生物学、代谢工程 |
| 9 | 2026-08-03 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Jul-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
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综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂（PDAs）在分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼以及应用方面的最新进展 | 整合合成生物学、绿色纯化和纳米递送策略，以克服植物源抗氧化剂的工业挑战并提出精准设计和多功能应用的新见解 | 未提及具体局限性，可能面临天然丰度低、杂质复杂、稳定性差及提取中的污染和变质等挑战 | 总结植物源抗氧化剂的生物合成、精炼和功能性应用，以替代合成抗氧化剂并预防慢性疾病 | 植物源抗氧化剂如多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷 | 合成生物学 | 神经退行性疾病、心血管疾病、糖尿病、癌症 | 合成生物学、绿色纯化、纳米递送 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 食品工业、医疗保健 |
| 10 | 2026-08-03 |
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.738993
PMID:42539253
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研究论文 | 介绍“Caffeinated Coli”教育模块，通过工程化大肠杆菌进行生物测定实验，向高中学生传授合成生物学和遗传工程知识 | 将合成生物学引入高中课堂，利用仅能在咖啡因上生长的大肠杆菌作为教学工具，结合NGSS标准设计灵活模块，支持不同水平学生 | 模块已在8所德克萨斯高中实施，但未提及长期效果或推广到其他地区的可行性 | 通过实践学习激发学生对科学、技术、工程和数学的兴趣，并普及合成生物学教育 | 高中学生和教师，以及一种经基因工程改造以依赖咖啡因生长的大肠杆菌菌株 | 教育、合成生物学 | NA | 生物测定实验 | NA | 实验数据、教育反馈 | 8所德克萨斯高中，具体学生和教师数量未提及 | NA | 大肠杆菌 | 生物传感器（大肠杆菌依赖咖啡因生长） | 教育、生物技术 |
| 11 | 2026-08-03 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本文研究了源自ϕC31和TG1整合酶的杂交丝氨酸整合酶的体外活性，这些酶能高效重组混合attP × attB底物，同时保留对同源重组方向性因子的相互作用和方向性控制。 | 提出了一种模块化框架，通过利用TG1衍生的卷曲螺旋结构域保留与同源RDF的相互作用，并保持方向性控制，从而能够工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶。 | 研究仅限于体外活性分析，尚需通过结构预测工具和扩展的LSR发现与表征来进一步验证体内应用和定制基因组位点的理性设计。 | 开发一种模块化方法，用于工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶，以用于基因组工程和合成生物学。 | ϕC31和TG1整合酶产生的杂交丝氨酸整合酶及其对混合attP × attB底物的重组活性。 | 合成生物学 | NA | 体外重组活性分析，结构预测工具 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | 重组系统，具有方向性控制 | 医学, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-03 |
Controlled assembly of exogenous DNA-based materials in living cells
2026-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.12.009
PMID:42539686
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综述 | 本文综述了外源DNA基材料在活细胞内的受控组装，涵盖多种刺激条件下的组装机制及其在生物医学和合成生物学中的应用。 | 系统总结了外源DNA材料在细胞内不同刺激条件下的动态组装，并重点阐述了其在改变细胞环境、干扰亚细胞结构和癌症诊疗中的三大应用。 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于当前技术对细胞内组装过程的精确控制和体内应用的临床转化挑战。 | 全面综述外源DNA基材料在活细胞内的受控组装机制及其生物学效应，展望该领域的未来研究方向。 | 外源DNA基材料及其在活细胞内的组装体和功能模块。 | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | 生物传感器、逻辑门、药物递送系统 | 医学、生物技术 |
| 13 | 2026-08-01 |
Exploring halophilic microorganisms for novel antimicrobial discovery: molecular mechanisms and computational approaches
2026-Jul-31, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01568-1
PMID:42533221
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综述 | 本文综述了嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源的潜力，涵盖其生态适应性、抗菌机制及组学和计算学发现方法 | 将生态适应性、非经典抗菌机制和现代组学及计算学发现流程整合为统一的抗菌物质发现框架 | 大多数已报道的化合物仍停留在体外阶段，体内验证进展有限 | 探索嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源，以应对抗生素耐药性危机 | 嗜盐微生物及其产生的生物活性代谢物 | 微生物学 | 多重耐药菌感染 | 多组学、计算学发现流程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 嗜盐微生物 | 沉默生物合成通路激活 | 医学、工业生物技术 |
| 14 | 2026-08-01 |
De Novo Autogenic Engineered Living Functional Materials
2026-Jul-31, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.74312
PMID:42536049
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研究论文 | 本文介绍了一个基于蛋白质挖掘、计算建模和合成生物学的通用平台，用于从头设计自主工程活体功能材料（ELMs），实现了从非模式细菌中生物合成CsgA样ELMs，并展示了增强的机械性能、UV-C防护和可编程功能 | 通过分析33,564个CsgA样同源物，结合AlphaFold2和分子动力学模拟，实现从头设计自主功能ELMs，并从非模式细菌中生物合成分子量增加至9倍、β-折叠重复单元扩展的CsgA样蛋白，同时实现了3D打印性和选择性结合纳米颗粒及抗体的可编程功能 | 未明确说明局限性，但可能包括对非模式细菌中ELM合成的效率和生产规模限制 | 开发一个通用平台，用于发现、设计和利用天然生物分子系统，以推进下一代自主工程活体材料 | 大肠杆菌curli机器和CsgA样同源蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2, 分子动力学模拟, 合成生物学 | AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | 33,564个CsgA样同源物 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | curli分泌途径重编程 | 材料科学, 生物技术 |
| 15 | 2026-08-01 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Jul-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文评述了合成生物学中质量设计、人工智能和自动化生物铸造的融合，探讨了如何将设计-构建-测试-学习循环从研究工具转变为工业发展框架，并分析了扩大规模、监管和社会瓶颈，以推动循环生物制造。 | 强调质量设计、人工智能和生物铸造自动化的三者融合是当前领域发展的关键，而不仅仅是单一技术；并对比了欧盟和美国的监管框架对技术采用的影响。 | 未提及具体技术细节或数据，缺乏实证分析，可能受益于更具体的数据支持。 | 探讨合成生物学从实验室创新到工业规模循环生物制造的路径，并确定未来十年需满足的要求以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品（包括微生物、植物和动物系统）和设计-构建-测试-学习循环。 | 合成生物学 | 不适用 | 人工智能辅助生物设计，生物铸造自动化 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 微生物、植物、动物系统 | 设计-构建-测试-学习循环 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-01 |
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071561
PMID:42514066
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综述 | 该综述整合了海洋和环境原核生物中小调控RNA的计算预测、宏组学发现和合成生物学应用，提供了从识别到功能和工程应用的多层次视角 | 区别于以往侧重模式生物的综述，本文聚焦海洋和环境原核生物，整合了计算预测、宏组学发现和合成生物学应用，并批判性评估了sRNA识别工具，强调了减少假阳性预测的策略 | 未明确说明 | 全面综述原核生物sRNA生物学，强调其在环境适应和生物技术应用中的关键作用，并为菌株工程提供资源 | 海洋和环境原核生物中的小调控RNA（sRNA） | 生物信息学 | NA | 计算预测、宏基因组学、宏转录组学 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 未明确说明 | 合成RNA工程 | 未明确说明 | 合成sRNA调控元件 | 工业生物技术、环境科学 |
| 17 | 2026-08-01 |
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071550
PMID:42514055
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研究论文 | 通过文献计量和科学计量方法，分析2014至2025年间全球关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物及其在生物基包装中应用的研究趋势。 | 采用Scopus数据库结合Bibliometrix和VOSviewer工具，揭示研究主题从基础生理和分类学向代谢工程、合成生物学及量子建模等新兴方向的转变，并识别关键的技术空白。 | 研究存在下游加工挑战、混合微生物群落管理困难以及资金不足等限制，影响PHAs的商业可扩展性和可持续性。 | 评估全球PHA产生微生物研究的产出、合作网络及主题演变，并指出未来研究重点以克服经济和技术的瓶颈。 | 关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物的研究文献及其在生物基包装中的应用。 | 机器学习 | 不适用 | 文献计量分析 | 不适用 | 文献数据 | 2014-2025年间发表的学术论文 | CRISPR-Cas9 | 不适用 | 不适用 | 环境, 材料 |
| 18 | 2026-08-01 |
The Genetic Transformation Mechanism and Application of Plant Hairy Roots
2026-Jul-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15142160
PMID:42514528
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研究论文 | 本文综述了植物毛状根遗传转化的分子机制、递送系统开发、诱导与再生平台构建及其在遗传育种和次生代谢物提取中的应用 | 强调毛状根系统相比传统农杆菌介导方法在单步产生转基因纯合子和广泛适应性方面的优势，并系统梳理其分子机制与平台构建 | 未明确提及具体限制 | 总结毛状根遗传转化机制及其在植物育种和合成生物学中的应用，以加速基因编辑和快速驯化等前沿技术的发展 | 植物毛状根 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌介导转化 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 毛状根诱导与再生系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-08-01 |
The Emergence of Life in the Light of Evolution
2026-Jul-12, ArXiv
PMID:42389247
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研究论文 | 本文从进化视角探讨生命起源，认为生命起源不仅是化学问题，还需考虑进化机制，并整合地质化学、分子生物学等多学科证据，提出生命起源研究应扩展至前生物系统的进化过程 | 将种群遗传学视角引入生命起源研究，强调LUCA之前的深层进化历史，并提出通过理论、实验室实验和合成生物学验证的进化驱动假说 | 信息不足，无法明确说明本文的局限性 | 提出一个涵盖前代谢自催化网络、原始细胞、翻译和DNA基因组转变的进化研究议程，以约束生命起源场景 | 生命起源过程、最后一个普遍共同祖先（LUCA）、前生物系统（如原始细胞、自催化网络） | 进化生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献综述与理论分析 | NA | 合成生物学（涉及合成细胞实验） | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 20 | 2026-08-01 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 本文对disorazole家族进行了全面系统的分析，涵盖其结构、生物活性、全合成方法以及异源生物合成途径 | 该综述提出了disorazole研究的范式转变，即从传统的全化学合成转向利用可编程的生物合成工程，并整合了异源表达、Red/ET重组工程和模块化聚酮合酶工程等关键技术 | 未明确提及局限性 | 旨在弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距，提供对disorazole家族的全面系统分析，并展望未来整合生物合成可扩展性与化学合成精确性的临床转化策略 | disorazole家族天然产物及其相关生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 异源表达、Red/ET重组工程、聚酮合酶工程、全合成 | NA | 文本 | NA | Red/ET重组工程 | 粘细菌（Sorangium cellulosum） | NA | 医学 |