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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-06 |
L-xylulose, a new versatile rare sugar: recent biosynthetic advances and challenges
2026-Jul-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119125
PMID:42083189
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综述 | 综述了稀有糖L-木酮糖的生物合成最新进展,分析六种酶促途径并识别两条竞争性路线,同时探讨底盘细胞构建和工业发酵的核心瓶颈 | 提出AI驱动高产菌株筛选、关键酶催化优化和靶产物高效胞外转运/分泌三大突破策略,并主张合成生物学与智能制造融合是未来发展关键方向 | 未详细对比化学合成与生物合成的成本效益,且对六种酶促途径的工业化适用性缺乏定量评估 | 系统梳理L-木酮糖生物合成进展,识别核心瓶颈并展望突破策略以推动其在食品和医药工业的应用 | L-木酮糖及其生物合成途径中的酶和底盘细胞 | 合成生物学 | NA | AI导向的高通量筛选技术、关键酶催化优化技术、胞外转运工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品工业、制药工业、化学工业 |
| 2 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用,涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明,但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶,包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 3 | 2026-04-27 |
Multilayer microbial framework of aerobic granule microecosystems: Integrating community ecology, genetic networks, and enhancement strategies
2026-Jul, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134569
PMID:41950970
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综述 | 提出好氧颗粒污泥微生态系统的多层微生物框架,整合群落生态学、遗传网络和强化策略 | 提出功能性状驱动的自组织过程而非简单细胞聚集的概念框架,揭示群体感应系统与代谢协同和功能分区强化的关联机制 | 缺乏定量跨尺度耦合模型,当前强化策略存在局限性,工程普遍性和可设计性尚需验证 | 统一解释好氧颗粒污泥形成与稳定性的微生物学机制 | 好氧颗粒污泥微生态系统 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 好氧颗粒污泥中的微生物群落 | 群体感应调控回路(luxI/luxR通路) | 废水处理, 环境工程 |
| 4 | 2026-04-16 |
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2026.114886
PMID:41881186
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研究论文 | 本文通过基因组测序和注释,揭示了药用植物Dodonaea viscosa中二类二萜环化酶的发现与生化特性,为合成生物学规模化生产生物活性二萜类化合物提供了基础 | 首次报道了Dodonaea viscosa的核基因组草图及完整叶绿体和线粒体基因组序列,并鉴定出两个新的二类二萜环化酶DvCPS和DvKPS,催化形成labdane和clerodane二萜类生物活性化合物的前体 | NA | 阐明Dodonaea viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径,以支持通过合成生物学实现规模化生产 | 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组序列和二萜环化酶 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生化表征 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 5 | 2026-04-11 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
|
综述 | 本文综述了黄曲霉作为食品安全威胁与生物技术资源的双重角色,重点探讨了其多样化的次级代谢产物及其调控机制 | 将黄曲霉重新定义为具有双重用途的生物体,既关注其生物安全风险,又强调其作为可开发化学多样性资源的潜力 | NA | 综合当前对黄曲霉多样化次级代谢组的认识,并探讨其在生物技术中的应用前景 | 黄曲霉及其次级代谢产物 | NA | NA | 真菌基因组学、代谢组学、基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学平台 | NA | NA | 医药, 农业 |
| 6 | 2026-04-11 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了工程化大肠杆菌用于高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的关键进展,并强调了增强其作为可持续生物塑料生产底盘潜力的新兴策略 | 总结了通过优化前体供应、增强还原力、微调途径表达等合成生物学和代谢工程策略,显著提升PHB产量的最新进展 | NA | 工程化大肠杆菌以实现高水平PHB生产,支持可持续生物塑料需求 | 大肠杆菌作为微生物底盘,用于生产聚(3-羟基丁酸酯) | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 代谢途径优化,包括糖酵解途径工程、引入还原甘氨酸和苏氨酸旁路途径、删除竞争途径、phasin表达、启动子优化和辅因子再生策略 | 工业生物技术, 环境 |
| 7 | 2026-04-11 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
|
综述 | 本文对用于酶固定的蛋白质基支架进行了结构化综述,涵盖从天然生物聚合物到工程化蛋白质支架,再到细菌微区室等新兴平台 | 采用分层视角系统梳理了酶固定化支架的发展历程,特别强调了细菌微区室在空间精度、选择性渗透性和多酶途径封装方面的独特优势,并指出合成生物学最新进展对其设计潜力的提升 | 作为一篇综述文章,主要总结现有研究进展,未提出新的实验数据或具体技术方案 | 探讨用于酶固定的蛋白质基支架的结构与功能多样性,以指导未来支架设计并拓宽生物催化的应用范围 | 酶固定化支架,包括生物聚合物、有机基质、无机载体、工程化蛋白质支架及细菌微区室 | 合成生物学 | NA | 酶固定化技术、蛋白质工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | 正交外壳工程、模块化货物招募 | 细菌 | 多酶级联反应、合成代谢途径、无细胞系统 | 工业生物技术、医药 |
| 8 | 2026-04-11 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
|
综述 | 本文系统评述了用于琥珀酸生物制造的微生物细胞工厂的工程化策略、挑战与前景 | 提供了关于菌株开发和生物过程整合的多学科视角,为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸的商业化提供了战略框架 | NA | 评估和推进用于生物基琥珀酸生产的微生物细胞工厂的设计与商业化 | 用于琥珀酸生产的微生物平台(包括一些细菌和酵母) | 合成生物学 | NA | 系统生物学、代谢建模、过程工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径的理性设计 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-11 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
|
综述 | 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白(CU)途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 | 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略,提炼出定义工程可塑性的保守设计原则,并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 | NA | 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌 | 细菌表面展示平台 | 生物技术 |
| 10 | 2026-04-11 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
|
综述 | 本文综述了合成生物学在精准免疫疗法中的应用,重点讨论了如何通过工程化细胞系统来克服现有免疫治疗的局限性 | 利用合成生物学设计可编程的细胞系统,实现逻辑门控激活和反馈控制的细胞因子分泌等上下文依赖的免疫功能,从而增强治疗的特异性和可调性 | NA | 探讨合成生物学如何推动精准免疫疗法的发展,以治疗癌症和免疫疾病 | 合成生物学工程化的免疫疗法,特别是可编程的细胞系统 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成免疫回路,包括设计的受体、模块化信号通路和逻辑门控激活、反馈控制的细胞因子分泌等 | 医学 |
| 11 | 2026-04-11 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
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综述 | 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器,强调了它们在基因表达控制中的工程应用 | 提出了一个面向工程师的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点,整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可能在其他原核生物中的适用性有限 | 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 | 原核生物(如细菌)中的RNA调控器 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术,包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | NA | NA | NA | CRISPR, 核糖开关, 核酶 | 大肠杆菌 | 顺式和反式RNA调控器,用于构建复杂和响应性细菌系统,如逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-11 |
Engineering synthetic biology sensors with artificial intelligence: From programmable circuits to next-generation biosensing
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108874
PMID:41881285
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综述 | 本文系统综述了人工智能如何推动合成生物学传感器从理性设计向AI驱动预测的转变,并提出了一个连接AI算法与DBTL周期的框架 | 首次建立了AI算法与DBTL周期的系统性框架,并提出了AI驱动工作流的三个核心前沿:AI引导的传感器元件设计、AI辅助的信号处理以及AI驱动的闭环优化 | 存在“现实差距”和“小数据困境”等未解决的障碍 | 探讨人工智能在合成生物学传感器设计与优化中的应用,推动其向稳健、可部署的智能传感系统发展 | 合成生物学传感器 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 生物传感器、逻辑门、振荡器 | 环境、医学、食品安全、工业生物技术 |
| 13 | 2026-03-09 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在组织稳态中的核心作用,重点探讨其表型转换对细胞外基质结构的重塑及其作为治疗靶点的潜力 | 整合多组学分析、合成生物学和AI辅助生物材料,开发能动态调控巨噬细胞功能的‘智能’疗法 | 在实现时空精准调控和平衡促修复与促纤维化结果方面仍面临挑战 | 深入理解巨噬细胞生物学,探索其在疾病治疗中的转化潜力 | 巨噬细胞的发育起源、表型异质性及其在细胞外基质重塑、免疫监视和器官稳态中的作用 | NA | NA | 多组学分析、合成生物学、AI辅助生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |