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当前共找到 165 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-19 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
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综述 | 本文综述了齐墩果烷型五环三萜类化合物（OPTs）从基因发掘到合成生物学的最新研究进展，涵盖关键酶解析、转录及转录后调控、多组学与人工智能辅助的基因发现，以及微生物和植物异源表达平台和基因组编辑等合成生物学策略。 | 系统整合了多组学与人工智能/机器学习在OPTs生物合成基因簇发掘、关键酶理性改造和通路优化中的应用，提出从经验试错向预测性优化转变的新范式，并全面总结了微生物与植物异源表达及基因组编辑克服OPTs生产瓶颈的前沿策略。 | 作为综述性文章，未提供新的原始实验数据；OPTs天然丰度低、生物合成途径复杂且调控机制繁琐，现有异源表达和基因组编辑策略在产量、稳定性和规模化应用方面仍面临瓶颈，AI/ML预测方法的实际应用仍需实验验证。 | 总结OPTs生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的最新进展，探讨实现OPTs可持续、可规模化高产的未来机遇。 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物（OPTs）及其生物合成途径、关键酶、转录因子、microRNA和异源表达体系。 | 合成生物学 | 癌症, 炎症性疾病, 糖尿病 | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 基因组编辑 | 人工智能, 机器学习 | 文本 | NA | 基因组编辑技术 | 微生物, 植物 | OPTs生物合成代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-16 |
Tutorial: biomembranes in hybrid living bioelectronics
2026-Jul-15, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01382-6
PMID:42458075
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综述 | 本文是一篇教程综述，探讨了在混合活体生物电子学中生物膜与电子设备的集成，涵盖聚合物半导体、微纳加工方法、表面改性、生物膜形成与测量技术及其在药物发现、诊断和神经形态计算中的应用 | 系统性地整合了材料科学、纳米技术和合成生物学技术，利用聚合物基半导体和微纳加工方法将生物相关细胞膜模型与芯片器件集成，增强了细胞-器件耦合，并探索了在神经形态计算等领域的应用 | 现有技术依赖简化的合成模型，缺乏生物复杂性，且细胞膜与电子器件的稳定集成仍面临挑战 | 探讨生物膜与电子接口的集成方法，增强细胞与器件的耦合，并推动在药物发现、诊断和神经形态计算中的应用 | 生物膜、细胞膜模型、芯片基器件、聚合物基半导体 | 生物电子学 | NA | 电阻抗测量、微纳加工、表面改性、结构功能化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 神经形态计算 |
| 3 | 2026-09-11 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
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研究论文 | 该研究通过工程化益生菌Nissle 1917表达CXCL13，增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的疗效 | 利用合成生物学工程化细菌递送CXCL13至肿瘤微环境，促进生发中心形成和肿瘤特异性抗体应答，从而增强PD-1阻断免疫疗法 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性 | 探索工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的抗肿瘤效果 | 膀胱癌原位小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Nissle 1917 | 表达CXCL13的工程化细菌 | 医学 |
| 4 | 2026-09-09 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 本文提出了seq2ribo，一种结合机器学习和模拟的混合框架，仅利用mRNA序列预测核糖体A位点位置，并通过结构感知的TASEP模型和抛光模型实现高保真预测。 | 首次仅从序列出发实现与实验核糖体图谱的有意义位置相关性，采用结构感知的TASEP模型和深度学习抛光器，显著优于基线方法。 | 未明确提及，但可能受限于训练数据的细胞类型多样性和模拟参数拟合的复杂性。 | 开发一种仅基于mRNA序列即可预测核糖体位置分布的计算方法，以支持从头序列设计。 | 多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1）中的mRNA翻译过程。 | 机器学习 | NA | 模拟与机器学习结合（sTASEP + 深度学习抛光） | 混合模型（TASEP模拟 + 深度学习抛光器） | RNA序列 | 未明确样本数量，涉及多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | 哺乳动物细胞（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | 合成生物学、医学 |
| 5 | 2026-09-05 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品系统中农药降解的工程化生物催化策略，从催化性能到实际应用进行了全面概述。 | 强调工程策略提升酶性能与稳定性，并探讨人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法。 | 实际应用中存在酶催化效率有限、稳定性不足、可重复使用性差、规模化受限以及监管不确定性等障碍。 | 为食品系统中农药酶促降解提供应用导向的综述，重点介绍工程化策略并分析转化瓶颈。 | 食品系统中的农药残留及降解用酶（天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统）。 | 合成生物学 | NA | 人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统、纳米酶和混合级联系统 | 食品加工、食品保鲜、食品安全 |
| 6 | 2026-09-05 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 本文从临床视角探讨细菌疗法在转化医学中的瓶颈，提出“肿瘤可及性”概念，并系统总结细菌表面工程策略及联合治疗应用。 | 首次提出“肿瘤可及性”概念，指出其不足是当前细菌疗法临床应用的关键瓶颈，并借鉴抗体药物偶联物精确递送经验，提出“精准活体治疗”新范式。 | 摘要未明确提及具体局限性，但从全文推断可能包括缺乏临床数据支持、技术转化难度大等。 | 从临床导向角度分析细菌疗法转化鸿沟，强调表面工程在提升肿瘤可及性、免疫逃逸和治疗效果中的作用，并提出未来应注重系统可及性。 | 表面工程细菌，包括化学偶联（如SpyTag/SpyCatcher）、物理包被（如细胞膜封装）、生物策略（如基因调控表面结构）。 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 细菌 | 细菌表面工程 | 医学 |
| 7 | 2026-09-03 |
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76203-1
PMID:42669721
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研究论文 | 本文开发了基于内质网相关降解（ERAD）的基因开关，用于诱导型、可调型和可逆型蛋白分泌，并通过AAV介导实现体内远程调控的基因治疗 | 首次利用ERAD-中心策略设计条件性降解子标签，实现对治疗性蛋白分泌的快速、可逆调控，无需复杂基因电路，且与AAV基因传递系统兼容 | 未明确提及，可能包括需要进一步验证临床安全性和长期效果 | 开发可快速响应、远程控制的基因开关，以按需调控治疗性蛋白分泌，用于基因治疗，特别是心血管疾病和慢性疼痛 | 治疗性蛋白，雄性小鼠，AAV载体，心血管疾病和慢性疼痛 | 基因治疗 | 心血管疾病，慢性疼痛 | AAV介导的基因传递，内质网相关降解（ERAD），条件性降解子系统 | NA | 实验数据（包括体内小鼠数据） | NA（未具体说明） | NA | 小鼠（体内） | 条件性降解子标签结合ERAD的基因开关 | 医学 |
| 8 | 2026-09-02 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 本文综述了工程化活体生物治疗产品（eLBPs）在多种疾病适应症中的最新进展，包括炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病，并讨论了底盘选择、DNA递送方法、治疗表达调控和生物遏制等关键设计因素，提出了下一代eLBPs的理性设计框架 | 提出了一个将eLBP设计的关键因素整合并用于指导下一代产品开发的框架，涵盖底盘选择、DNA递送、表达调控和生物遏制等多个方面 | 早期临床研究显示安全性前景良好，但在实现可预测的定植、持久的治疗活性和体内稳健的生物遏制方面仍存在挑战 | 总结工程化活体生物治疗产品（eLBPs）的发展进展，并提供一个理性设计框架，以促进其从实验系统向临床应用的转化 | 工程化共生微生物（如细菌）作为活体生物治疗产品（eLBPs） | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 共生微生物（如细菌） | 生物传感器、治疗表达系统、生物遏制系统 | 医学 |
| 9 | 2026-08-31 |
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-Jul-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75973-y
PMID:42660886
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研究论文 | 开发了一种基于内源2μ质粒的可编程质粒拷贝数控制平台，用于酵母中基因剂量调控 | 首次在真核生物中实现动态质粒拷贝数调控，通过添加CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数可切换，并构建了定量工具包 | 未提及具体局限性，但可能受限于酵母宿主和特定应用场景 | 建立酵母中可调节质粒拷贝数的合成生物学工具，实现基因剂量控制 | 酿酒酵母（S. cerevisiae）及其内源2μ质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、基因表达分析、代谢产物定量 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA（具体样本数量未给出） | NA（未明确提及，但可能涉及分子克隆工具） | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | p2μ-Cir系统，结合CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数调控 | 工业生物技术、医学（GLP-1前体）、食品（2-苯乙醇、β-胡萝卜素、麦角硫因生产） |
| 10 | 2026-08-30 |
Next-Generation Probiotics in Poultry: From Conventional Strains to Engineered and Synbiotic Approaches
2026-Jul-31, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081680
PMID:42655025
|
综述 | 本文全面综述了下一代益生菌在家禽生产中的作用机制、技术进展及其在改善生产性能和健康方面的应用，并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 系统整合了多组学驱动的菌株鉴定、工程化微生物系统、合成生物学、微胶囊化和合生元配方等先进技术，提出下一代益生菌相比传统益生菌具有更优的肠道定植、靶向抗菌和宿主免疫调节能力 | 存在菌株特异性差异、监管限制和现场验证不足等挑战，且目前缺乏大规模实际应用数据 | 评估下一代益生菌作为抗生素生长促进剂替代品的潜力，以维持家禽生产效率、动物健康和食品安全 | 家禽及其肠道微生物群，涉及传统益生菌和下一代益生菌菌株 | 微生物学 | 肠道感染性疾病 | 多组学、合成生物学、微胶囊化 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 家禽 | 工程化微生物系统 | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-30 |
Microbiome Engineering in Dairy Cattle: A Critical Review of Strategies for Disease Resistance, Productivity, and Sustainable Farming
2026-Jul-31, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13080766
PMID:42655786
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综述 | 本文评估了益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和基于CRISPR的合成生物学在奶牛微生物组工程中的应用，并利用技术就绪水平框架评估其转化成熟度 | 采用技术就绪水平1-9框架系统评估奶牛微生物组工程策略的转化成熟度，并强调从群体水平向精准个体化给药转变的关键转化缺口 | 干预失败主要源于宿主-微生物组错配而非微生物产品设计，且缺乏标准化数据基础设施和监管框架 | 解决奶牛生产中的抗微生物耐药性、全球食品需求和减少肠道甲烷排放的监管要求三大挑战 | 奶牛微生物组工程策略，包括益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和CRISPR合成生物学 | 微生物组工程 | 抗微生物耐药性 | 宏基因组、CRISPR | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 奶牛 | 工程化瘤胃细菌 | 农业、环境 |
| 12 | 2026-08-30 |
Engineering Plant-Associated Soil Microbiomes for Sustainable and Climate-Resilient Agriculture: Mechanisms, Technologies, and Applications
2026-Jul-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081648
PMID:42654994
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综述 | 本文全面综述了植物相关土壤微生物组在可持续和气候适应性农业中的机制、技术及应用，包括微生物组组装、功能、植物-微生物互作、胁迫抗性以及多种工程策略。 | 整合了多组学技术、系统生物学和人工智能在微生物组工程中的应用，强调了精准微生物组工程和合成生物学方法的前景。 | 大规模实施仍面临田间变异性、定殖稳定性、生物安全、监管框架和数据集成等挑战。 | 探讨植物相关土壤微生物组的工程策略及其在可持续和气候适应性农业中的应用，以提升作物生产、养分管理和生物防治。 | 植物相关土壤微生物组及其在农业生态系统中的功能和互动。 | 微生物组学，人工智能 | NA | 高通量测序、多组学技术（包括宏基因组学、代谢组学、宏转录组学）、系统生物学、人工智能 | 机器学习 | 多组学数据（基因组、转录组、代谢组） | NA | 合成生物学 | 植物相关土壤微生物 | 合成微生物群落（SynComs），微生物接种剂，微生物组移植，根际引导，合成生物学干预 | 农业、环境 |
| 13 | 2026-08-29 |
AI-Assisted Spatial Metabolic Engineering in Plants: Integrating Flux Design, Spatial Omics, and Synthetic Biology
2026-Jul-23, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16080519
PMID:42646258
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综述 | 本文综述了机器学习方法与植物代谢工程在空间工程四个层面的融合，并讨论了空间组学作为验证层的作用及未来自动化工作流的发展方向 | 提出了将预测性机器学习与空间工程整合以设计复杂生物合成途径的策略，并分类评估了各技术的证据水平 | 植物特异性训练数据集不完整、组织异质性和体内验证有限，限制了AI生成设计的转化 | 探讨机器学习与植物空间代谢工程融合的现状与未来方向 | 植物合成生物学中的空间工程层级（亚细胞、细胞/组织/器官、发育或诱导、基因组水平） | 机器学习 | NA | 空间组学 | 机器学习模型（如生成算法、约束型代谢模型） | 空间组学数据 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径设计 | 农业, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-08-27 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
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综述 | 本文综述了益生菌从一般健康促进剂向精准医学中个性化靶向疗法的转变，涵盖其作用机制及与新技术结合的应用前景。 | 将益生菌与心理生物学、下一代益生菌、改造菌株、人工智能和合成生物学技术相结合，提出个性化益生菌疗法的概念。 | 未提供具体的临床试验数据或实证研究结果，主要基于理论综述。 | 探讨益生菌在精准医学中的应用潜力，强调个性化治疗的必要性。 | 益生菌及其在宿主生理中的作用机制，以及与新兴技术的结合。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-08-26 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
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评述 | 本文探讨了宏基因组学、人工智能和合成生物学融合如何推动食品酶学进入新时代，实现从传统生物催化剂到定制化新型酶的转变。 | 强调宏基因组发现与AI驱动的生物催化剂设计的整合，将酶工程从经验性过程转变为预测性学科。 | 未提供实验验证或具体案例，仅基于前瞻性视角讨论。 | 探讨宏基因组学、AI和合成生物学在开发定制化生物催化剂用于可持续、精准的下一代食品加工中的应用。 | 食品酶学生物催化剂 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、多组学、蛋白质结构预测、de novo蛋白设计 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 16 | 2026-08-26 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本研究报道了来源于ϕC31和TG1整合酶的杂合整合酶的体外活性，这些酶能高效重组杂合attP×attB底物，同时通过TG1衍生的卷曲螺旋结构域保留与同源重组方向性因子（RDF）的相互作用 | 提出了一种模块化框架，通过混合ϕC31和TG1整合酶来工程化具有定制特异性的丝氨酸整合酶，并验证了DNA结合域与att位点识别基序在决定特异性中的关键作用 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用或靶向自定义基因组位点的实际验证 | 开发可编程的丝氨酸整合酶，以扩展其靶向特定基因组位点的应用范围 | ϕC31和TG1整合酶及其杂合变体 | 合成生物学 | NA | 体外重组分析 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 杂合整合酶系统，涉及attP和attB底物重组及attL×attR重组 | 基因组工程, 合成生物学 |
| 17 | 2026-08-25 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
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综述 | 本文综述了人类肝脏发育过程及当前用于体外生成肝脏类器官的模型，并探讨了如何整合合成生物学和计算分析来提升类器官的成熟度和复杂性 | 提出将合成生物学与计算分析相结合，以促进血管化、建立分区、优化命运特化和增强对外部信号的响应，从而推动下一代多细胞人类干细胞来源系统的开发 | 当前模型在重现性和成人水平成熟度方面存在挑战 | 探讨如何利用发育工程原理和合成生物学手段改进肝脏类器官模型，以用于疾病建模和再生医学 | 人类胚胎肝脏发育过程及体外肝脏类器官模型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类多能干细胞 | NA | 医学、再生医学 |
| 18 | 2026-08-24 |
Programmable CRISPRtune dissects the transcriptional repressive activity of MeCP2
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.08.737375
PMID:42465491
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CRISPRtune的合成生物学工具，通过将MeCP2与失活的dCas9融合，实现人类内源基因转录水平的中等程度下调，并用于解析MeCP2的转录抑制功能 | 首次利用MeCP2的温和抑制活性实现基因转录的精细调节，而非完全失活，并提供了基因组规模的靶向规则和表观遗传机制解析平台 | 未提及具体局限性，可能包括对基因表达调节的精度或脱靶效应的讨论 | 开发一种可编程的转录调节工具，用于人类细胞中基因表达的中等程度下调，并研究MeCP2的转录抑制机制 | 人类内源基因及MeCP2蛋白及其Rett综合征相关突变体 | 合成生物学 | Rett综合征 | CRISPR筛选 | NA | 基因组规模筛选数据 | 数千个人类内源基因 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 合成融合蛋白CRISPRtune（MeCP2-dCas9）用于转录调节 | 医学 |
| 19 | 2026-08-24 |
BxbI-mediated insertion of a 77kb human RET sensitive haplotype into the mouse genome to generate a humanized model of Hirschsprung disease
2026-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.05.736620
PMID:42465522
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研究论文 | 通过BxbI介导将77kb的人类RET敏感单倍型插入小鼠基因组，构建Hirschsprung病的人源化小鼠模型，并验证非编码变异对疾病发病机制的影响。 | 利用“大DNA”合成生物学和Bxb1重组将完整的人类RET基因座（包含所有外显子、内含子和上游调控元件）插入小鼠安全港位点，并通过CRISPR/Cas9恢复Sox10结合位点以提高基因表达 | 初始敏感单倍型表达水平仅为野生型的21%，不足以在删除内源小鼠RET基因时挽救生存能力 | 研究人类RET基因调控变异如何导致Hirschsprung病的肠神经节细胞缺失 | 人类RET基因座及其调控变异、小鼠模型 | 分子生物学 | Hirschsprung病 | 纳米孔测序、短读长测序、CRISPR/Cas9 | NA | 基因序列数据 | 未明确小鼠样本数量 | Bxb1重组、CRISPR-Cas9 | 小鼠 | 人源化基因座插入 | 医学 |
| 20 | 2026-08-23 |
Scanning the horizon: deep mutational scanning approaches in virology
2026-Jul-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01784-25
PMID:42267826
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综述 | 本文综述了深度突变扫描（DMS）技术在病毒学中的最新进展，包括技术方法、应用及其对理解病毒进化的贡献。 | 系统总结了DMS技术在病毒学中的最新应用，特别是跨宿主物种、组织环境和免疫压力下的突变效应测量，并探讨了合成生物学在突变文库构建中的新作用。 | 文中未明确指出局限性，但作为综述，可能受限于现有文献的覆盖范围和技术的当前状态。 | 总结DMS技术在病毒学中的最新技术和概念进展，探讨其应用和未来研究方向。 | DMS技术及其在病毒学和病毒进化中的应用。 | 病毒学 | NA | 深度突变扫描（DMS），高通量突变生成，深度测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学（未具体指定工具） | 病毒 | 突变文库构建（未具体指定电路） | 医学，工业生物技术 |