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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-01 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本文报道了来源于ϕC31和TG1整合酶的大型丝氨酸整合酶杂合体的体外活性，这些杂合酶能高效重组杂合attP×attB底物，并保留与同源重组方向性因子（RDF）的相互作用 | 构建了ϕC31和TG1整合酶的杂合体，通过TG1来源的卷曲螺旋结构域保留与RDF的相互作用，实现了对杂合att位点的特异性重组并保持方向性控制 | 研究仅限于体外实验，尚未在细胞内或体内验证杂合整合酶的功能；对DNA结合结构域-att位点识别基序决定特异性的机制理解仍需深入 | 探究杂合丝氨酸整合酶的体外重组活性、位点特异性和方向性控制，为工程化可编程丝氨酸整合酶提供模块化框架 | 来源于ϕC31和TG1噬菌体的丝氨酸整合酶杂合体及其杂合attP、attB、attL、attR底物 | 合成生物学 | NA | 体外DNA重组实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-10-30 |
Trace elements and tumors: homeostatic networks, molecular mechanisms and new horizons for precision intervention
2026-Jul-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02754-y
PMID:42934669
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综述 | 系统阐述铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素在生理和肿瘤条件下的稳态网络、分子机制及精准干预新策略 | 提出肿瘤细胞通过元素成瘾机制劫持微量元素调控网络；系统整合铁死亡和铜死亡等新型细胞死亡方式；将锰定位为cGAS-STING激动剂；提出元素代谢增敏与纳米平台、合成生物学工程化免疫细胞等跨学科干预策略 | 大多数治疗证据来自临床前模型，缺乏临床转化验证；当前认识存在知识空白，需在系统生物学框架下开展假设驱动的深入研究 | 阐明微量元素稳态网络与肿瘤发生发展的关系，总结分子机制，并为肿瘤精准干预提供新方向 | 铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素及其在肿瘤细胞、肿瘤免疫微环境、血管生成和转移中的作用 | 肿瘤生物学, 系统生物学, 精准医学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-10-30 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
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研究方法 | 本文提供了一套详细的设计与构建合成小调控RNA的方案，用于在细菌中实现高效基因敲低 | 系统总结了合成sRNA设计的关键原则和优化因素，包括支架选择、靶mRNA结合亲和力、靶mRNA二级结构和Hfq表达水平 | 文中未明确提及具体局限性 | 为合成sRNA的设计与构建提供详细方案，以实现细菌中高效基因敲低 | 合成小调控RNA（sRNA） | 合成生物学与代谢工程 | NA | 合成sRNA设计与构建 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成sRNA介导的基因敲低系统 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 4 | 2026-10-27 |
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-07-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75973-y
PMID:42660886
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研究论文 | 本文开发了一个基于内源2μ质粒的酵母质粒拷贝数（PCN）可编程调控平台，可实现从1到约70拷贝的动态调控，并应用于多种代谢产物生产和tRNA表型分析 | 首次在真核系统（酿酒酵母）中实现了可编程的质粒拷贝数动态调控，通过p2μ-Cir系统、CEN元件和Leu2d筛选实现了从1到38拷贝的可切换调控以及约70拷贝的高拷贝数，表达水平提升达110倍，并解决了多拷贝不稳定性问题 | 研究仅针对酿酒酵母（S. cerevisiae）的内源2μ质粒系统，尚未验证在其他真核宿主中的适用性 | 在真核系统中建立可编程的质粒拷贝数调控平台，实现基因剂量在DNA、RNA和蛋白质水平的精确控制 | 酿酒酵母（S. cerevisiae）及基于内源2μ质粒的PCN调控系统 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、2μ质粒改造、CEN元件整合、Leu2d筛选 | NA | NA | NA | CEN元件, Leu2d筛选标记 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 基于内源2μ质粒的PCN调控平台（p2μ-Cir系统），结合CEN元件实现拷贝数可切换调控和Leu2d筛选提高拷贝数 | 医药, 工业生物技术, 食品 |
| 5 | 2026-10-24 |
AI-guided design and biomaterial integration for next-generation extracellular vesicle therapeutics: an evidence-weighted translational framework
2026-Jul-25, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04831-2
PMID:42902374
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综述 | 本文提出一个证据加权的转化框架，将人工智能、生物材料、合成生物学和先进验证系统整合用于下一代细胞外囊泡（EV）治疗的设计与开发 | 将AI引导设计、生物材料整合、合成生物学与先进验证系统统一为一个证据加权的转化议程，并明确区分已证实系统与远期概念 | 各使能技术的证据不均衡：AI多为回顾性分类而缺乏前瞻性治疗设计验证，生物材料在EV完整性和剂量标准化方面报告不一致，可编程EV系统多处于临床前阶段，且目前尚无FDA批准的EV疗法 | 构建下一代EV治疗的证据加权转化框架，推动AI引导设计、生物材料整合与可验证制造和 potency 检测的协同发展 | 细胞外囊泡（EV）治疗与诊断平台及其相关使能技术 | 机器学习, 数字病理学, 生物医学工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-10-23 |
Dissecting the functional and spatial roles of peroxiredoxins as H2O2 scavengers and redox transducers
2026-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06356-1
PMID:42897284
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研究论文 | 本文通过合成生物学策略将Tpx1的过氧化物酶清除功能与氧化还原信号转导功能分离，研究其在亚细胞区室中的作用 | 采用合成生物学策略在不同亚细胞区室中表达Tpx1或过氧化氢酶Ctt1，成功分离了Prx的过氧化物酶清除功能与信号转导功能 | 研究仅使用裂殖酵母模型，未涉及哺乳动物或其他高等生物的Prx功能验证 | 解析过氧化物还原蛋白作为H2O2清除剂和氧化还原传感器的功能与空间角色 | 裂殖酵母中的主要过氧化物还原蛋白Tpx1及过氧化氢酶Ctt1 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、亚细胞定位表达、H2O2生物传感器 | NA | NA | NA | NA | 裂殖酵母（Schizosaccharomyces pombe） | 亚细胞区室靶向表达系统（线粒体靶向、核靶向的Tpx1或Ctt1） | 医学 |
| 7 | 2026-10-18 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
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综述 | 该综述全面概述了超过25种成熟的植物特异性Golden Gate克隆试剂盒，深入探讨了其模块的兼容性，并提出了提高系统协调性的关键方法 | 系统梳理了植物特异性Golden Gate克隆试剂盒的兼容性与互操作性，提出了包括驯化策略、甲基化酶辅助的分级DNA组装以及多克隆位点在内的系统协调化方法 | 作为综述文章，未提供新的实验数据验证所提出的协调化策略 | 改善植物合成生物学中Golden Gate克隆试剂盒之间的兼容性与互操作性，简化克隆工作流程并降低新技术门槛 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | 文本 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒 | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块和转录单元的标准化组装 | 农业 |
| 8 | 2026-10-16 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
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研究论文 | 该研究在Komagataeibacter rhaeticus中系统评估了信号肽介导的蛋白质转运机制，建立了单底盘细菌纳米纤维素原位功能化的合成生物学框架 | 首次在K. rhaeticus中全基因组鉴定Sec转运系统并系统性基准测试信号肽介导的蛋白质转运，实现了单底盘同时合成细菌纳米纤维素和原位功能化，开发了渗透休克释放策略将酶活性提高30% | 重组蛋白被滞留在周质空间中，限制了其胞外可用性，影响了功能化效率 | 建立单底盘系统实现细菌纳米纤维素合成与原位功能化的同步进行，推动可编程生物工程活材料的发展 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株及其产生的细菌纳米纤维素 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、SignalP 5.0预测、荧光成像 | NA | 蛋白质组数据、荧光图像 | NA | NA | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽介导的蛋白质转运通路 | 材料、医学 |
| 9 | 2026-10-16 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 本文对大麻色烯（CBC）的生物合成、药理作用、治疗潜力及转化前景进行了全面综述 | 系统性整合了CBC在生物合成途径、独特受体作用谱（如TRPV通道激动及内源性大麻素再摄取抑制）及治疗应用方面的最新进展，并首次提出将纳米递送、合成生物学与多组学整合作为推动CBC临床转化的关键方向 | 缺乏临床试验数据，制剂局限性明显，监管体系碎片化，且现有研究多为临床前证据 | 全面梳理CBC的生物合成、药理特性、治疗潜力及转化挑战，明确其作为高潜力但研究不足的植物大麻素的地位 | 大麻色烯（CBC）及其生物合成途径、药理靶点、临床前疗效与转化应用 | 药理学与治疗学 | 炎症性疾病, 疼痛, 感染性疾病, 癌症, 神经退行性疾病, 抑郁症, 皮肤病 | 文献综述, 生物合成途径分析, 药代动力学分析, 分子药理学评估 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 10 | 2026-10-12 |
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.738993
PMID:42539253
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研究论文 | 本文介绍了一个名为“咖啡因大肠杆菌”的教育模块，该模块通过合成生物学实验教学，引导高中生探究基因工程菌株，用于测量液体中的咖啡因浓度 | 将合成生物学与探究式学习结合，开发了符合NGSS标准的五周教学模块，并通过工程化大肠杆菌作为咖啡因生物传感器，让学生在实践中学习基因工程和定量分析 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 将合成生物学和基因工程研究引入高中课堂，激发学生对科学研究的兴趣，并培养其动手实验和数据分析能力 | 高中生、教师以及工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学教育 | NA | 基因工程、生物测定 | NA | 实验数据 | 在8所德克萨斯州高中实施，涉及学生和教师，具体人数未提及 | NA | 大肠杆菌 | NA | 教育 |
| 11 | 2026-10-08 |
An advanced genome engineering platform for Komagataella phaffii enabling versatile in vivo DNA assembly and multiplex integration
2026-Jul-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00731-z
PMID:42436509
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研究论文 | 该研究报告了一个增强同源重组的Komagataella phaffii底盘（dKR），通过删除Ku70并过表达RAD52，实现了高效的CRISPR/Cas9基因组编辑、无载体多片段组装、多重位点整合以及体内质粒组装，并利用类胡萝卜素途径进行了功能验证。 | 通过协同删除Ku70和过表达RAD52构建了HR增强型底盘，显著提高了短同源臂下的整合效率；实现了九个线性DNA片段的无载体组装（86.5%效率）、三个位点的多重整合（44.6%效率）以及十个片段的体内质粒组装（44.8%效率），绕过了大肠杆菌克隆步骤。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 开发一个先进的基因组工程平台，以加速基于甲醇的生物制造的设计-构建-测试-学习循环，推动K. phaffii从蛋白质表达宿主转变为广泛适用的生物工程底盘。 | Komagataella phaffii（毕赤酵母）及其基因组工程改造。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑, tRNA-核酶CRISPR系统, 同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 类胡萝卜素生物合成途径 | 医药, 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 12 | 2026-10-04 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 本文综述了工程化活体生物治疗产品（eLBP）在多种疾病适应症中的最新进展，涵盖底盘选择、DNA递送方法、治疗表达调控及生物防护系统等关键设计因素 | 系统整合了微生物组科学与合成生物学的最新进展，提出了下一代eLBP理性设计的框架，强调从实验系统向临床应用的可预测转化 | 早期临床研究虽显示良好的安全性，但在体内实现可预测的定植、持久的治疗活性以及稳健的生物防护仍面临挑战 | 总结eLBP在不同疾病中的开发进展，并提出下一代eLBP理性设计的框架 | 工程化活体生物治疗产品（eLBPs），包括工程化细菌 | 合成生物学 | 炎症性疾病, 代谢紊乱, 癌症, 感染性疾病 | 合成生物学, 微生物组工程 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 生物传感器, 治疗分子递送系统, 生物防护遗传系统 | 医学 |
| 13 | 2026-10-01 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 该文章提出了一种基于特征协同模型和GO纯中心性的新型必需蛋白质预测方法FSM | 提出了特征协同模型来整合GO纯中心性和进化保守分数，并设计了新的中心性度量GO纯中心性 | 未明确提及 | 提高必需蛋白质的预测识别率 | 酵母蛋白质 | 机器学习 | NA | NA | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位数据、直系同源蛋白质数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-09-27 |
De Novo Synthesis in Cancer Immunotherapy: Applications and Prospects
2026-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70847
PMID:42444981
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综述 | 本文综述了从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的应用，包括免疫检查点调控、细胞因子工程、细胞治疗和信号通路重塑等方面 | 系统整合了理性设计原则（特异性、模块性和适应性）与从头蛋白质设计技术，用于癌症免疫治疗，并强调计算工具和合成生物学技术在优化免疫调节蛋白和细胞免疫治疗中的应用 | 领域内仍存在关键局限性尚未完全解决 | 探讨从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的应用前景和最新进展 | 从头设计的蛋白质及其在癌症免疫治疗中的应用 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 从头蛋白质设计, 计算工具, 合成生物学技术 | NA | 文本 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）构造, 双特异性抗体 | 医学 |
| 15 | 2026-09-25 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
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综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 整合了细菌降解芳香酯的遗传、代谢和进化机制与合成生物学方法，并提出了生态生理特性与合成生物学相结合以增强原位降解的新视角 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且主要聚焦于细菌降解，可能未全面涵盖真菌或其他微生物的降解途径 | 探讨芳香酯类污染物在农业生态系统中的细菌降解途径及生物修复策略 | 芳香酯类污染物（芳香酸酯和芳香醇酯）及其降解细菌 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境, 农业 |
| 16 | 2026-09-24 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 该论文报道了一种基于真菌菌丝体的工程活材料平台，通过低能耗工艺制备保持代谢活性的宏观凝聚膜，实现环境响应、原位图案化和紫外线防护等功能 | 将菌丝体的代谢活性保留在宏观凝聚膜中，实现结构组装与细胞活力的统一；模块化设计将结构制备与遗传功能化解耦；与产色素菌和黑化菌共培养实现原位图案化和内置紫外线屏蔽；41天内近完全形态降解 | 未明确说明可扩展性、长期稳定性以及遗传改造的效率和范围 | 开发一种可编程的真菌基活材料平台，解决工程活材料中宏观结构组装与持续细胞活力及可编程功能的无缝集成挑战 | 真菌菌丝体（mycelia）、产色素微生物、黑化微生物 | 合成生物学、工程活材料 | NA | 共培养、低能耗薄膜制备工艺 | NA | NA | NA | NA | 真菌（菌丝体） | 模块化共培养系统（结构菌丝体与功能微生物共培养） | 材料、医学（紫外线防护） |
| 17 | 2026-09-24 |
The Expanding Reactivity of Cobamide-Containing Proteins: From Mechanistic Understanding to Non-native Biocatalysis
2026-Jul-03, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.6c03394
PMID:42577960
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综述 | 本文综述了含钴胺酰胺蛋白质的反应机制及其在天然与非天然生物催化中的应用前景。 | 系统总结了含钴胺酰胺蛋白质的机制理解，并提出了将其拓展至非天然生物催化反应的新兴策略。 | 含钴胺酰胺依赖型酶的天然反应性在生物催化中尚未被充分利用，其作为非天然反应催化剂的研究仍处于起步阶段。 | 总结含钴胺酰胺蛋白质功能的关键机制，并探讨利用其进行非天然生物催化的策略。 | 含钴胺酰胺蛋白质，包括异构酶、甲基转移酶和还原性脱卤酶。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 18 | 2026-09-24 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 提出seq2ribo框架，结合结构感知的TASEP模拟与机器学习，仅从mRNA序列预测核糖体A位点分布 | 首个仅从序列实现与观测核糖体图谱有意义位置相关性的方法，引入结构感知TASEP（sTASEP）建模密码子等待时间及局部角度、碱基配对等结构特征，并用polisher模型精炼模拟分布 | 未明确说明 | 在不依赖核糖体印迹、RNA-seq图谱或完整基因组背景的情况下，从mRNA序列直接预测核糖体位置分布，助力mRNA疫苗等从头序列设计 | mRNA序列及其对应的核糖体A位点分布，涉及iPSC、HEK293、LCL、RPE-1等多种细胞类型 | 机器学习 | NA | 核糖体印迹（Ribo-seq）、RNA-seq | 结构感知TASEP（sTASEP）模拟、polisher精炼模型、机器学习 | 序列、核糖体图谱数据 | 涉及iPSC、HEK293、LCL、RPE-1等多种细胞类型的数据 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 19 | 2026-09-23 |
The Emergence of Life in the Light of Evolution
2026-Jul-12, ArXiv
PMID:42389247
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综述 | 该文章主张生命起源研究应从化学问题扩展到进化问题，综合比较基因组学、系统发育学、生物化学和地球科学证据，强调LUCA已是复杂细胞群体，并突出群体遗传学、生态学和合成生物学在约束生命起源场景中的作用 | 提出生命起源研究必须纳入群体遗传学视角，从仅关注生命如何开始扩展到探索其如何从生物前系统进化而来，并整合多学科证据构建进化驱动的研究议程 | 文章为综述性论述，未提供新的实验数据，所提出的进化驱动假设仍需理论和实验室实验验证 | 重新定位生命起源研究，从化学问题扩展到进化问题，利用群体遗传学、生态学和合成生物学约束生命起源场景 | 生命起源过程、LUCA、前LUCA进化历史、原代谢自催化网络、原始细胞、翻译和DNA基因组的出现 | 进化生物学 | NA | 比较基因组学, 系统发育学, 生物化学, 地球科学, 群体遗传学, 生态学, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-09-23 |
Programmable CRISPRtune dissects the transcriptional repressive activity of MeCP2
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.08.737375
PMID:42465491
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研究论文 | 本文介绍了CRISPRtune，一种将MeCP2与催化失活的dCas9融合的可编程转录抑制工具，用于在人类细胞中精细调控内源基因表达 | 利用MeCP2的温和抑制活性实现中间水平的转录调控，而非完全基因失活或完全转录抑制；通过全基因组CRISPR筛选定义了CRISPRtune的靶向规则；揭示了MeCP2在基因启动子处诱导的直接表观遗传变化及其遗传依赖伙伴；发现Rett综合征相关MeCP2突变因无法重塑靶基因局部表观遗传景观而导致转录抑制缺陷 | 未明确提及 | 开发一种可编程工具，在哺乳动物细胞中实现内源基因转录的中间水平调控，并利用该平台解析染色质调控因子在活细胞中的机制功能 | 人类细胞中的内源基因、MeCP2蛋白及其Rett综合征相关突变体 | 合成生物学 | Rett综合征 | CRISPR筛选、表观遗传学分析 | dCas9-MeCP2融合蛋白 | 基因组规模筛选数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | dCas9-MeCP2转录抑制系统 | 医学 |