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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-08-17 |
A high-throughput heterologous expression platform for plant synthetic biology based on Arabidopsis suspension cells
2026-Jul-10, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf545
PMID:41432110
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研究论文 | 本文建立了一种基于拟南芥悬浮细胞的高通量异源表达平台,用于植物合成生物学中复杂多基因途径的工程化。 | 该平台无需特殊设备或耗材,兼容多种细胞系,可在两周内快速生成100克转基因细胞,并支持单构建体中至少六个基因的堆叠表达。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高效、可扩展的异源表达平台,以加速植物合成生物学的设计-构建-测试循环,并应对生物固氮等重大生物技术挑战。 | 拟南芥悬浮细胞,以及固氮酶铁钼辅因子成熟酶NifB的同源物。 | 合成生物学 | NA | 植物细胞包浸润转化,瞬态和稳定转化 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量,涉及多个细胞系和NifB同源物文库。 | NA | 拟南芥(悬浮细胞) | 多基因堆叠表达系统,包含氮酶模块成分NifU, NifS, FdxN和NifB。 | 农业,工业生物技术 |
| 42 | 2026-08-16 |
Fructans and Fructooligosaccharides in Plants and Fruits: Metabolism, Functional Roles, and Emerging Biotechnological Opportunities
2026-Jul-30, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31152656
PMID:42588504
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综述 | 本文综述了植物和水果中果聚糖和低聚果糖的代谢、功能作用及新兴生物技术机遇 | 重点关注水果中果聚糖的未充分探索领域,并整合了最新的生物技术策略如代谢工程和合成生物学 | 未提及 | 提供果聚糖和低聚果糖代谢的更新概述,并探讨其在植物生理和人类营养中的双重作用及生物技术应用机会 | 植物和水果中的果聚糖和低聚果糖 | 植物生物学、代谢工程 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 植物 | 果聚糖生物合成途径 | 食品、营养保健品、农业 |
| 43 | 2026-08-16 |
Mechanism of Terpene Formation in Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang Revealed by Metabolome and Transcriptome Analysis
2026-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156836
PMID:42589492
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研究论文 | 通过代谢组和转录组分析揭示了荆广藿香不同组织中萜类化合物的形成机制,特别是根中多环倍半萜的积累和生物合成调控 | 首次系统研究了广藿香地下部分(根)中倍半萜的生物合成,整合代谢组和转录组数据,并揭示了根特异积累的多环倍半萜及其调控网络 | 未提及 | 阐明荆广藿香不同组织中萜类化合物的生物合成机制,特别是根中多环倍半萜的积累和调控网络 | 荆广藿香(Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang)的根、茎、叶、花和腺毛 | 植物代谢组学与转录组学 | NA | GC-MS, 转录组测序, 生物信息学分析, 共表达网络分析 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | 未明确样本数量,涉及根、茎、叶、花和腺毛五种组织 | NA | 荆广藿香(Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang) | NA | 医药, 香料, 生物燃料 |
| 44 | 2026-08-16 |
Cyanobacterial Circadian Clock: Molecular Mechanisms and Physiological Outputs
2026-Jul-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15152293
PMID:42588797
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综述 | 本文综述了蓝藻生物钟的分子机制、生理输出及其在进化上的意义 | 挑战了原核生物仅被动响应环境信号的假设,展示了不依赖转录-翻译反馈的蛋白质振荡器,并提供了对生物钟进化逻辑的独特见解 | 未明确提及具体局限性,但指出了包括振荡器与细胞周期耦合、生态型功能分化和群落水平作用等未解问题 | 总结蓝藻生物钟研究进展,阐明其分子基础、输入输出网络及生理协调机制,为合成生物学和生物计时原理提供基础 | 蓝藻的生物钟系统,特别是KaiA、KaiB和KaiC蛋白振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | KaiABC蛋白振荡器 | 合成生物学, 生物技术 |
| 45 | 2026-08-16 |
Genome-Wide Identification and Functional Verification of Core Berberine Bridge-like Enzyme Genes for Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis in Corydalis saxicola Bunting
2026-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156708
PMID:42589364
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研究论文 | 对岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心小檗碱桥酶样基因进行了全基因组鉴定与功能验证 | 首次对岩黄连的BBE基因家族进行全面的功能基因组学分析,并通过体外酶学实验证实了候选基因催化特定底物生成脱氢卡维丁和药根碱的氧化酶活性 | 未明确说明研究的局限性 | 鉴定和功能验证岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心BBE样基因,为种质保护和合成生物学改良奠定基础 | 岩黄连中的小檗碱桥酶样基因家族 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、系统发育分析、表达分析、蛋白质结构预测、分子对接、体外酶学实验 | NA | 基因组序列、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 从岩黄连基因组中鉴定出22个BBE家族成员 | NA | NA | NA | 医药 |
| 46 | 2026-08-12 |
Phosphorylation networks as regulatory hubs in plant stress signaling: kinase dynamics, crosstalk, and network plasticity
2026-Jul-24, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03917-3
PMID:42496748
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综述 | 本文综述了植物胁迫信号传导中磷酸化网络作为调控枢纽的作用,重点讨论了激酶动态、串扰和网络可塑性 | 强调了磷酸化在植物胁迫信号中的核心枢纽作用,并整合了磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱和系统生物学的最新进展,提出了利用磷酸化动态推进气候智能农业的策略 | 未明确说明局限性 | 总结并突出磷酸化网络在植物胁迫响应中的调控作用及其在气候智能农业中的转化潜力 | 模型植物和作物中的磷酸化网络及主要激酶家族 | 系统生物学 | NA | 磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱、多组学整合 | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 磷酸化调控网络 | 农业 |
| 47 | 2026-08-12 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
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综述 | 本文综述了γ-碳酸酐酶的结构、机制和功能,涵盖其古老起源、微生物生理作用及现代生物技术应用。 | 强调γ-CAs的金属灵活性和与太古宙缺氧富铁环境兼容的催化机制,并提出了其潜在硅酸酶活性及作为选择性抗菌药物靶点的可能性。 | 存在关于催化混杂性和CamH亚类机制的未解决问题,限制了对其功能的全面理解。 | 总结当前对γ-碳酸酐酶的结构、催化和功能知识,并指出未来研究方向以阐明其在酶进化和微生物生理学中的作用。 | γ-碳酸酐酶,包括Cam和CamH亚类,来自古菌(特别是产甲烷菌)及人类病原体如霍乱弧菌。 | 微生物学 | 细菌感染 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 48 | 2026-08-04 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类代谢工程中的应用,包括途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别 | 未详细讨论具体菌株和技术的实验验证细节 | 探讨微生物生产萜类化合物的代谢工程策略,并强调计算方法的整合以优化菌株 | 微生物菌株及萜类生物合成途径 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 基因工程、人工智能、机器学习 | AI/ML模型(未具体指定) | 基因组学、系统生物学数据 | NA | 基因编辑工具(未具体指定) | 微生物宿主(如大肠杆菌、酵母等,未具体列出) | 萜类生物合成途径的异源重构和代谢通量重定向 | 医药、营养保健品、化妆品、农业、香料、生物燃料 |
| 49 | 2026-08-03 |
Controlled assembly of exogenous DNA-based materials in living cells
2026-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.12.009
PMID:42539686
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综述 | 本文综述了外源DNA基材料在活细胞内的受控组装,涵盖多种刺激条件下的组装机制及其在生物医学和合成生物学中的应用。 | 系统总结了外源DNA材料在细胞内不同刺激条件下的动态组装,并重点阐述了其在改变细胞环境、干扰亚细胞结构和癌症诊疗中的三大应用。 | 未明确提及具体局限性,但可能受限于当前技术对细胞内组装过程的精确控制和体内应用的临床转化挑战。 | 全面综述外源DNA基材料在活细胞内的受控组装机制及其生物学效应,展望该领域的未来研究方向。 | 外源DNA基材料及其在活细胞内的组装体和功能模块。 | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | 生物传感器、逻辑门、药物递送系统 | 医学、生物技术 |
| 50 | 2026-08-01 |
Exploring halophilic microorganisms for novel antimicrobial discovery: molecular mechanisms and computational approaches
2026-Jul-31, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01568-1
PMID:42533221
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综述 | 本文综述了嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源的潜力,涵盖其生态适应性、抗菌机制及组学和计算学发现方法 | 将生态适应性、非经典抗菌机制和现代组学及计算学发现流程整合为统一的抗菌物质发现框架 | 大多数已报道的化合物仍停留在体外阶段,体内验证进展有限 | 探索嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源,以应对抗生素耐药性危机 | 嗜盐微生物及其产生的生物活性代谢物 | 微生物学 | 多重耐药菌感染 | 多组学、计算学发现流程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 嗜盐微生物 | 沉默生物合成通路激活 | 医学、工业生物技术 |
| 51 | 2026-08-01 |
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071561
PMID:42514066
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综述 | 该综述整合了海洋和环境原核生物中小调控RNA的计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,提供了从识别到功能和工程应用的多层次视角 | 区别于以往侧重模式生物的综述,本文聚焦海洋和环境原核生物,整合了计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,并批判性评估了sRNA识别工具,强调了减少假阳性预测的策略 | 未明确说明 | 全面综述原核生物sRNA生物学,强调其在环境适应和生物技术应用中的关键作用,并为菌株工程提供资源 | 海洋和环境原核生物中的小调控RNA(sRNA) | 生物信息学 | NA | 计算预测、宏基因组学、宏转录组学 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 未明确说明 | 合成RNA工程 | 未明确说明 | 合成sRNA调控元件 | 工业生物技术、环境科学 |
| 52 | 2026-08-01 |
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071550
PMID:42514055
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研究论文 | 通过文献计量和科学计量方法,分析2014至2025年间全球关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物及其在生物基包装中应用的研究趋势。 | 采用Scopus数据库结合Bibliometrix和VOSviewer工具,揭示研究主题从基础生理和分类学向代谢工程、合成生物学及量子建模等新兴方向的转变,并识别关键的技术空白。 | 研究存在下游加工挑战、混合微生物群落管理困难以及资金不足等限制,影响PHAs的商业可扩展性和可持续性。 | 评估全球PHA产生微生物研究的产出、合作网络及主题演变,并指出未来研究重点以克服经济和技术的瓶颈。 | 关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物的研究文献及其在生物基包装中的应用。 | 机器学习 | 不适用 | 文献计量分析 | 不适用 | 文献数据 | 2014-2025年间发表的学术论文 | CRISPR-Cas9 | 不适用 | 不适用 | 环境, 材料 |
| 53 | 2026-08-01 |
The Genetic Transformation Mechanism and Application of Plant Hairy Roots
2026-Jul-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15142160
PMID:42514528
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研究论文 | 本文综述了植物毛状根遗传转化的分子机制、递送系统开发、诱导与再生平台构建及其在遗传育种和次生代谢物提取中的应用 | 强调毛状根系统相比传统农杆菌介导方法在单步产生转基因纯合子和广泛适应性方面的优势,并系统梳理其分子机制与平台构建 | 未明确提及具体限制 | 总结毛状根遗传转化机制及其在植物育种和合成生物学中的应用,以加速基因编辑和快速驯化等前沿技术的发展 | 植物毛状根 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌介导转化 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 毛状根诱导与再生系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 54 | 2026-08-01 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 本文对disorazole家族进行了全面系统的分析,涵盖其结构、生物活性、全合成方法以及异源生物合成途径 | 该综述提出了disorazole研究的范式转变,即从传统的全化学合成转向利用可编程的生物合成工程,并整合了异源表达、Red/ET重组工程和模块化聚酮合酶工程等关键技术 | 未明确提及局限性 | 旨在弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距,提供对disorazole家族的全面系统分析,并展望未来整合生物合成可扩展性与化学合成精确性的临床转化策略 | disorazole家族天然产物及其相关生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 异源表达、Red/ET重组工程、聚酮合酶工程、全合成 | NA | 文本 | NA | Red/ET重组工程 | 粘细菌(Sorangium cellulosum) | NA | 医学 |
| 55 | 2026-07-31 |
Fast, Streamlined In Situ Genotyping of Bacterial Strains for Single-Cell and Subcellular Dynamics Profiling
2026-Jul-27, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00220
PMID:42529381
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研究论文 | 开发了一种快速、精简的原位基因分型方法,用于细菌菌株的单细胞和亚细胞动力学分析 | 通过表面修饰策略抑制微流控芯片中荧光探针的非特异性聚集,并结合条形码化拷贝数可调质粒,解耦活细胞成像与事后基因分型的冲突,实现了高通量、低扰动的细菌动态表型筛选 | 未明确提及,但从上下文推断可能涉及方法对特定细菌菌株的普适性或长期成像的稳定性挑战 | 克服现有技术在时间分辨率、单细胞信息与实验通量之间的权衡,实现大规模单细胞和亚细胞动力学表型筛选 | 细菌菌株(文库)中的单细胞动态表型及其对应基因型 | 机器学习和合成生物学 | NA | 活细胞延时成像、序贯荧光原位杂交、微流控芯片、基因分型 | NA | 显微图像 | NA | NA | 细菌 | 条形码化拷贝数可调质粒(用于基因分型标签) | 基础生物学, 合成生物学 |
| 56 | 2026-07-31 |
[Evaluation of the skin barrier repair function and anti-inflammatory activity of recombinant mussel mucin Mfp151]
2026-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250750
PMID:42522623
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研究论文 | 利用合成生物学技术高效生产重组贻贝粘蛋白Mfp151,并评估其抗炎和皮肤屏障修复功能 | 首次通过合成生物学方法高效获取重组贻贝粘蛋白Mfp151,并系统验证其在体外和体内的抗炎、抗氧化及皮肤修复活性 | 未提及重组蛋白的长期安全性评估及大规模生产工艺优化 | 评估重组贻贝粘蛋白Mfp151的皮肤屏障修复功能和抗炎活性 | 重组贻贝粘蛋白Mfp151 | 合成生物学 | 皮肤老化、炎症 | 合成生物学、CCK-8检测、qPCR、跨膜电阻测量、划痕实验、ELISA、自由基清除实验 | NA | 实验数据 | 体外模型:人永生化角质形成细胞(HaCaT)、人包皮成纤维细胞(HFF-1)、人单核细胞白血病细胞(THP-1);体内模型:斑马鱼晒伤模型 | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 57 | 2026-07-30 |
Silkworm synthetic biology: Toolkit development, chassis engineering, and biomanufacturing applications
2026-Jul-29, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70331
PMID:42522963
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综述 | 本文综述了家蚕合成生物学在底盘特征、工程工具包、代表性应用和未来前景方面的最新进展 | 系统总结了家蚕作为昆虫合成生物学底盘的潜力,涵盖了从工具开发到生物制造应用的完整流程,并提出了利用泛基因组学、多组学和人工智能辅助设计的未来方向 | 跨品系适应性有限、调控元件标准化不完整、整合与表达行为不确定性以及生物安全问题 | 介绍家蚕合成生物学的进展并讨论其在基础研究和生物技术中的应用前景 | 家蚕(Bombyx mori)及其丝腺 | 合成生物学 | NA | 稳定转基因、定点整合、可编程基因组编辑、时空基因调控、重组酶系统、基因沉默、启动子和增强子捕获 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, 重组酶系统 | 家蚕(Bombyx mori) | 组织特异性表达系统、诱导表达系统、重组酶系统、基因沉默系统 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 58 | 2026-07-30 |
Converting Food Waste into Value-Added Products: A Review on Current Technologies, Challenges, and Future Perspectives
2026-Jul-22, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15142577
PMID:42511323
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review | 综述了将食物废弃物转化为增值产品的当前技术、挑战与未来展望 | 综合评述了绿色提取技术、生物化学、热化学、酶和微生物方法,并探讨了生物精炼、人工智能、数字生物精炼、合成生物学和碳中和生产系统等新兴进展 | 原料异质性、工艺可扩展性、监管框架、经济可行性和可持续性评估等关键挑战 | 批判性分析食物废弃物转化为增值产品的策略,支持向弹性循环生物经济系统转型 | 主要农业食品副产品,如果渣、蔬菜残渣、油籽粕、乳制品副产品和农业工业废物 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | food, environment, industrial biotechnology |
| 59 | 2026-07-30 |
Microbial Lignin Valorization to Protocatechuic Acid and Catechol: Biofunneling Pathways and Metabolic Engineering Strategies
2026-Jul-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16070979
PMID:42509773
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综述 | 综述微生物木质素转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及代谢工程策略 | 系统总结微生物将木质素衍生物转化为原儿茶酸和儿茶酚的生物漏斗途径,并强调原儿茶酸脱羧酶作为关键酶桥的作用 | 许多微生物生产策略仅使用纯化的木质素衍生模型化合物,而非真实木质素原料,且面临木质素顽固性、解聚产物异质性、中间体毒性和酶效率有限等挑战 | 推动木质素生物转化为原儿茶酸和儿茶酚,以发展可持续的生物精炼和循环生物经济 | 微生物将木质素衍生芳香化合物转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及工程策略 | 合成生物学 | NA | 木质素解聚技术(热化学和生物方法)、代谢工程(基因删除、通路重连、转运蛋白工程、CRISPR调控) | NA | NA | NA | CRISPR | 微生物(未特指) | 生物漏斗途径(如O-去甲基化、羟基化、脱羧酶转化) | 工业生物技术、环境 |
| 60 | 2026-07-30 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
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研究论文 | 在细菌中工程化光遗传pH调节系统,实现胞外pH的可逆调控 | 首次将光遗传学与基因工程结合,在微生物中构建可动态调控胞外pH的合成系统,并实现长达14天的持续循环 | 系统对培养基成分、补料速率和光照模式等环境因素高度依赖,离实际应用仍有差距 | 构建无需人工干预即可在高低pH状态间切换的微生物系统 | 改造的细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 光诱导启动子控制重组脲酶表达,结合降解标签和环境优化 | 工业生物技术 |