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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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观点文章 | 提出纳米流体学作为自下而上无细胞分子系统合成生物学的变革性平台 | 利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装,构建有序时空结构 | 纳米流体技术构建下一代单分子分辨率无细胞分子系统仍面临关键挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学发展 | 无细胞分子系统的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学 |
| 42 | 2026-07-19 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 回顾了将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合,推动植物组织培养中次生代谢产物生产的进展 | 将植物组织培养从试错实践转变为预测性系统工程领域,整合代谢组学作为决策层,连接代谢表型与理性途径设计 | 仍面临分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性等挑战 | 探索代谢组学引导下植物组织培养中代谢产物生产的综合策略 | 植物组织培养体系中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成启动子, 模块化基因电路 | 植物细胞 | 代谢途径编辑, 异源表达系统, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 43 | 2026-07-19 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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研究论文 | 本研究报道了SARGE,一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台,通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计,无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合循环,并采用双荧光报告系统实现裸眼菌落筛选 | 未明确说明局限性 | 开发一种高效、可扩展的迭代基因组整合平台,简化大肠杆菌的基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组整合过程 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统(sfGFP和mKate) | 合成生物学, 基因组工程 |
| 44 | 2026-07-19 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结了通过微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展,并探讨了生产聚乙醇酸生物塑料的策略 | 全面综述了乙醇酸生物合成的多种途径、底盘生物及代谢工程策略,并整合了系统代谢工程与AI辅助设计及过程优化的未来方向 | 未详细讨论具体实验验证数据,仅基于文献综述,可能缺乏实际工业应用中的技术细节和成本分析 | 探索通过微生物发酵可持续生产乙醇酸的途径和策略,以支持聚乙醇酸生物塑料的工业化和循环生物经济 | 微生物细胞工厂、乙醇酸生物合成途径、微生物底盘生物、基于乙醇酸的生物塑料 | 合成生物学, 代谢工程, 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本和综述数据 | NA | NA | 微生物, 例如大肠杆菌、酵母等 | 乙醛酸旁路、C5-糖裂解途径、新型生物合成途径 | 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 45 | 2026-07-19 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
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观点文章 | 探讨微流控技术与分子自组装协同构建人工细胞系统的工程策略 | 提出微流控不应仅替代生物调控,而应作为提供外在物理边界条件的平台,引导和放大分子自组装的潜力 | 仅停留在概念框架层面,未提供具体实验验证或量化分析 | 构建功能化、可规模化的人工细胞系统 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 46 | 2026-07-19 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 在最快生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立基于胞苷脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合蛋白(MutaT7)的体内超突变系统,实现蛋白质的快速连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7系统(VnMutaT7),利用其极快生长速度(倍增时间仅为大肠杆菌一半),在36小时内实现TEM-1蛋白质对头孢他啶的高水平抗性进化 | 未明确说明系统的脱靶效应、突变谱局限性或对宿主基因组的潜在影响 | 在Vibrio natriegens中建立快速连续定向进化平台,加速蛋白质工程 | MutaT7系统、Vibrio natriegens宿主菌、TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统、定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | MutaT7系统(胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白) | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-07-19 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 综合阐述液-液相分离如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调控等机制影响反应动力学,并总结其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗及人工细胞构建等领域的应用 | 首次系统整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离,深入解析其对反应动力学的精确调控机制,并提供理性设计下一代合成生物学应用的设计指南 | 当前对液-液相分离如何精确调控反应动力学尚缺乏完整的机制理解,阻碍了基于相分离的应用的理性设计和优化 | 填补液-液相分离在反应动力学调控机制方面的知识空白,为合成生物学应用提供设计原理 | 液-液相分离系统及其对生物反应过程的调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建, 生命起源研究 |
| 48 | 2026-07-19 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
|
综述 | 该文章综述了益生菌从一般健康增强剂向精准医疗中靶向疗法的转变过程 | 该文整合了精神生物学、下一代益生菌、改良菌株、人工智能和合成生物学技术,重新定义了益生菌在个性化医疗中的作用 | NA | 探讨益生菌从一般健康促进到精准医疗时代靶向疗法的转变及其机制 | 益生菌及其在精准医疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医疗 |
| 49 | 2026-07-19 |
Protein engineering: Status report
2026-Jul-17, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzag020
PMID:42466865
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综述 | 提供蛋白质工程领域的及时概览,涵盖核心方法和主要应用领域 | 强调机器学习与人工智能方法的日益增长的影响,并指出蛋白质工程正迅速发展的黄金时代 | 尽管进展迅速,但设计、筛选和实际应用方面仍面临重大挑战 | 概述蛋白质工程领域的最新进展与未来方向 | 通过对蛋白质进行工程改造以创建新型或改进的蛋白质 | NA | NA | 计算生物学、分子生物学、结构引导、进化与合成方法 | 机器学习与人工智能模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 制药、分子成像、诊断、塑料回收、工业化学 |
| 50 | 2026-07-19 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
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综述 | 综述γ-类碳酸酐酶的进化、结构、机制及其在微生物生理和生物技术中的应用 | 强调了γ-类碳酸酐酶作为最古老碳酸酐酶谱系的地位,揭示了其催化可塑性和在工业CO₂捕获及合成生物学中的新应用 | 关于CamH亚类催化机制和催化混杂性的未解决问题仍然存在 | 系统总结γ-类碳酸酐酶的结构、机制和功能知识,勾勒未来研究方向 | γ-类碳酸酐酶及其在古菌和细菌中的生理功能 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物(如古菌、霍乱弧菌等) | CO₂水合酶系统 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 51 | 2026-07-19 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
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研究论文 | 本研究通过信号肽引导的蛋白质转运策略,在Komagataeibacter rhaeticus中实现细菌纳米纤维素的原位功能化,建立了一个单底盘合成生物学框架 | 首次在K. rhaeticus中系统评估信号肽介导的蛋白质转运,建立了单个底盘细胞同时进行生物聚合物合成和原位功能化的合成生物学框架 | 重组蛋白被滞留于周质空间,限制了胞外可用性;通过渗透压休克后处理可使酶活性提高30%,但仍需优化以实现高效胞外释放 | 建立K. rhaeticus作为单底盘平台用于功能性生物工程活材料的合成生物学框架 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱法, SignalP 5.0预测 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | 信号肽介导的蛋白质转运 | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽−蛋白转运回路 | 材料科学, 生物技术 |
| 52 | 2026-07-19 |
Programmable CRISPRtune dissects the transcriptional repressive activity of MeCP2
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.08.737375
PMID:42465491
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研究论文 | 介绍CRISPRtune——一种将MeCP2融合到催化失活的dCas9上的合成工具,可调低人类细胞内源基因的转录水平 | 通过利用MeCP2的温和抑制活性,实现了对基因转录的精细调节,克服了现有工具只能实现完全基因失活或完全转录抑制的局限性 | 未明确说明局限性 | 开发一种可编程的转录调节方法,用于剖析MeCP2的转录抑制活性,并提供一个正交平台来研究染色质调节因子的机制功能 | 人类细胞中的内源基因 | 合成生物学 | Rett综合征 | CRISPR | NA | 基因表达数据 | 通过全基因组CRISPR筛选调节了数千个内源基因的表达 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | CRISPRtune融合蛋白 | 医学 |
| 53 | 2026-07-19 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 报道了一种名为Tumbleweed (TW)的人工蛋白质马达,通过模块化设计在DNA轨道上进行定向时钟步进 | 首次实现了人工蛋白质马达的构建,采用模块化设计策略将特性明确的蛋白质组合以产生马达功能和方向性,并通过可控的配体输入实现精确的时间和方向控制 | NA | 开发一种人工蛋白质马达,实现沿DNA轨道的定向步进运动,为工程化动态且复杂的蛋白质基纳米机器提供平台 | 设计的人工蛋白质马达Tumbleweed (TW),包含三个腿部,每个腿部带有配体门控的DNA结合域 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光分析,可编程微流控装置 | NA | 荧光图像 | NA | 模块化蛋白设计 | NA | 人工蛋白质马达,含配体门控DNA结合域的三腿部结构与DNA轨道相互作用 | 纳米技术,合成生物学 |
| 54 | 2026-07-18 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
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综述 | 总结自下而上重构模型膜系统的最新进展,重点介绍支撑脂双层和巨单层囊泡的制备与应用 | 系统总结了近年来微米尺度膜系统在蛋白质组装、膜曲率感知与重塑、通透性及细胞骨架组织等方面的关键见解,并突出了悬浮膜、膜-凝聚物相互作用及巨单层囊泡在合成生物学中的应用等新兴方向 | 未详细讨论其他类型的模型膜系统(如平面膜片、纳米级囊泡),且受篇幅限制未能深入分析具体实验细节 | 综述自下而上重构模型膜系统在研究膜组织与功能物理原理方面的进展 | 支撑脂双层和巨单层囊泡等模型膜系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 55 | 2026-07-18 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过多层级代谢工程改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917,实现无抗生素生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并实现了益生菌EcN生产β-丙氨酸的最高产量 | 未提及明确局限,但可能涉及发酵过程的规模化挑战或长期稳定性 | 开发益生菌EcN作为微生物细胞工厂,实现β-丙氨酸的无抗生素高效生产 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA(涉及5升生物反应器中的发酵过程) | NA(多层级代谢工程策略,包括异源酶引入、通路强化等) | 大肠杆菌Nissle 1917 | β-丙氨酸生物合成途径,包括前体L-天冬氨酸供应双通路强化、竞争通路动态调控、中枢代谢重编程和转运系统工程化 | 工业生物技术 |
| 56 | 2026-07-18 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
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研究论文 | 提出一种利用缓步动物来源的CAHS蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥下稳定的方法 | 首次利用缓步动物来源的CAHS蛋白作为单一添加剂,无需其他成分即可在低成本室温干燥条件下保护无细胞表达系统的蛋白合成活性 | 未明确说明CAHS蛋白对其他类型无细胞系统或更复杂生物过程的保护效果,以及长期储存稳定性 | 开发低成本的室温储存方法,提高无细胞表达系统的可及性和便携性 | 无细胞表达系统以及缓步动物来源的胞质丰富热溶性(CAHS)蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 57 | 2026-07-18 |
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05611-y
PMID:42467272
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综述 | 系统综述细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略和多模式生物混合系统 | 提出下一代智能、可控、临床可转化的细菌衍生活体抗肿瘤系统的合理设计策略 | 临床转化仍受制于生物安全性控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化制造和监管指南 | 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展、挑战和未来展望 | 工程化细菌及基于细菌的生物混合系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 厌氧菌、兼性厌氧菌 | 环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗 | 医学 |
| 58 | 2026-07-18 |
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00110-26
PMID:42461011
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综述 | 对Komagataella phaffii代谢工程用于提高异源蛋白和小分子产量的关键策略和未来方向进行综述 | 系统总结了代谢工程在Komagataella phaffii中的应用,涵盖代谢流控制、动态控制、系统建模等多个核心优化策略 | 未提供具体实验数据,作为综述存在局限 | 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展和未来方向 | Komagataella phaffii的代谢工程策略 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术 |
| 59 | 2026-07-18 |
Light-directed biofilm formation reveals the functional contributions of periplasmic cytochromes to the electrochemical activity of Shewanella oneidensis
2026-Jul-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01264-26
PMID:42461042
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研究论文 | 利用光诱导生物膜形成方法,揭示了周质细胞色素对希瓦氏菌电化学活性的功能贡献 | 结合靶向基因敲除与光诱导生物膜图案化技术,克服了周质细胞色素网络复杂性和原生生物膜变异性带来的挑战,实现了对周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中不同功能的区分 | 未明确提及但可能包括:仅使用单一突变体组合、未在非电极环境验证、长期稳定性未评估 | 阐明希瓦氏菌周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中的具体功能角色 | 希瓦氏菌MR-1的周质细胞色素突变体 | 合成生物学, 微生物电化学 | NA | 光诱导生物膜图案化, 伏安法测量, 电化学栅控测量 | NA | 电化学信号, 生物膜图像 | 多种周质细胞色素基因敲除菌株的图案化生物膜,具体数量未给出 | 靶向基因敲除, 光诱导图案化 | 希瓦氏菌 MR-1 | 光诱导生物膜形成系统(可能基于光敏蛋白调控) | 生物能源, 环境修复 |
| 60 | 2026-07-18 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 全面综述大麻色烯(CBC)的生物合成、药理学、治疗潜力及转化前景 | 系统整合了CBC的生物合成途径、独特的受体相互作用谱(如TRP通道激动剂)及非精神活性优势,并提出纳米递送系统、合成生物学等未来方向 | 缺乏临床试验数据,口服生物利用度低,监管碎片化,且现有证据仅基于临床前研究 | 评估CBC作为治疗候选分子的现状,并识别转化研究中的关键挑战 | 大麻色烯(CBC)及其前体大麻色烯酸(CBCA) | 药物化学 | 炎症、疼痛、癌症、神经退行性疾病、抑郁症、皮肤病 | 高效液相色谱、质谱、酶活性测定、分子生物学 | NA | 生物化学数据、药理学数据、毒理学数据 | NA | NA | 大麻(Cannabis sativa L.) | 大麻素生物合成途径(聚酮/甲羟戊酸/MEP途径) | 医学 |