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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-28 |
The Mevalonate Pathway: Innovations, Applications, and Challenges in Biotechnology with Emphasis on Fungal Biology
2026-Jul-07, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12070497
PMID:42506259
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综述 | 全面综述甲羟戊酸(MVA)途径,重点关注真菌生物学中的创新、应用和挑战 | 对MVA途径在真菌中的酶学调控、结构生物学、代谢工程及合成生物学的最新进展进行全面梳理,强调真菌作为工程宿主在异戊二烯可持续生产中的潜力 | 未提及 | 综述MVA途径的分布、进化、代谢组织、酶学特性及在真菌合成生物学中的应用 | 甲羟戊酸途径、真菌、异戊二烯前体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | MVA途径、麦角固醇生物合成、蛋白质异戊二烯化、次生代谢产物合成 | 工业生物技术、医学、农业 |
| 62 | 2026-07-28 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 探讨通过可控环境农业加速植物科学基础研究向农业应用的转化 | 提出可控环境农业作为连接基础发现与作物实际应用的桥梁,整合育种、基因组学和合成生物学工具,实现作物设计的重新构想 | 指出了在整合过程中仍存在的挑战 | 综述可控环境农业在加速植物科学转化中的进展和潜力 | 植物科学突破和作物设计 | 机器视觉 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 生物传感器、代谢通路 | 农业, 环境 |
| 63 | 2026-07-28 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
|
综述 | 综述了植物基因组中精准DNA插入的构建设计原则与策略 | 系统评估了短片段、大片段及多片段插入等不同应用场景下的敲入方法,并探讨了非植物先进技术提升植物敲入效率与精度的潜力 | 实际指导有限,且主要基于现有方法综述,缺乏实验验证 | 促进植物敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,降低脱靶效应 | 植物基因组中的精准DNA插入技术 | 合成生物学 | NA | DNA插入(敲入)技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 64 | 2026-07-27 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
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综述 | 总结了自下而上重构模型膜系统的最新进展,重点介绍了支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs)的制备与应用 | 系统回顾了SLBs和GUVs在膜相关蛋白组装、膜曲率感应与重塑、渗透性及细胞骨架组织中的关键作用,并强调了新兴方向如悬浮膜、膜-凝聚相相互作用及GUV作为合成生物学底盘的应用 | 未提及具体技术限制或算法缺陷,可能受限于综述篇幅而对某些细节讨论不充分 | 探讨自下而上重构膜系统在理解膜组织与功能方面的物理原理及其在生物医学中的应用潜力 | 支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 65 | 2026-07-27 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 报告了一种基于真菌的活体材料平台,通过低能耗工艺制备宏观粘合薄膜,保持菌丝代谢活性,用于工程化活体纺织品 | 将宏观结构组装与持续细胞活力和可编程功能无缝整合,通过模块化设计解耦结构制备与基因功能化,采用低能耗工艺实现环境响应和表面更新 | 未明确提及,但可能涉及工程化微生物伙伴的长期稳定性和实际应用中的环境适应性 | 开发可扩展且可持续的真菌基活体材料平台,弥合结构完整性与生物可编程性之间的关键差距 | 真菌菌丝体及其工程化微生物伙伴(产色素细菌和黑色素化细菌) | 合成生物学 | NA | 低能耗工艺 | NA | 文本 | NA | NA | 真菌菌丝体 | 模块化平台,用于共培养和原位图案化及紫外屏蔽 | 材料, 环境 |
| 66 | 2026-07-27 |
Advances in Betalain Biosynthesis and Metabolic Engineering for Sustainable Natural Pigment Production
2026-Jul-19, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15030056
PMID:42496572
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综述 | 本文综述了甜菜红素生物合成及代谢工程的最新进展,旨在推动可持续天然色素的生产 | 重点比较植物、植物细胞、酵母和细菌生产系统,并涵盖合成生物学、诱导方法、组学途径鉴定和纳米生物技术等新方法 | 甜菜红素在工业应用中仍面临天然含量低、对环境敏感及制造和储存中不稳定的限制 | 优化甜菜红素生产并克服商业化瓶颈,实现可持续天然色素替代人工色素 | 甜菜红素生物合成途径及代谢工程系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、组学分析、纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | 植物, 植物细胞, 酵母, 细菌 | 甜菜红素生物合成途径的工程化改造 | 食品, 工业生物技术 |
| 67 | 2026-07-27 |
Bioinspired organic materials for seamless neurohybrid interfaces: from material design to living electronics
2026-Jul-18, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00280c
PMID:42468887
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研究论文 | 本文探讨了基于生物启发的有机材料,用于无缝神经混合接口,从材料设计到活体电子学的进展 | 提出了利用有机混合离子-电子导体、先进聚合物化学和软材料实现神经组织无缝整合的新方法,并探索了原位聚合和合成生物学在活体神经电子学中的潜力 | 未明确说明具体局限,但可能包括活体整合的长期稳定性和生物相容性挑战 | 研究神经混合接口的无缝整合,以实现神经组织双向通信,用于理解和治疗神经疾病 | 神经电子设备和神经混合接口 | 神经科学、生物工程、临床医学 | 神经疾病 | 原位聚合、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 神经混合接口 | 医学 |
| 68 | 2026-07-27 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
|
综述 | 综述了利用工程微生物高效合成二萜类化合物的最新进展和未来展望 | 系统总结了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略 | 未对具体工程策略的优劣进行量化比较,也未涵盖所有微生物底盘 | 探讨微生物高效合成二萜类化合物的研究进展、关键挑战及未来方向,以促进工业应用 | 大肠杆菌、酿酒酵母、解脂耶氏酵母和圆红冬孢酵母等工程微生物底盘 | 合成生物学 | 不适用 | 代谢工程, 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 化妆品, 食品添加剂, 制药 |
| 69 | 2026-07-27 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
|
研究论文 | 通过直接整合人工呼吸链提高无细胞代谢效率 | 开发了定制化的人工呼吸链,能够在一氧化碳固定的16酶催化循环中维持快速电子传递,并利用电子流合成三磷酸腺苷,同时展示了该链可多样化以接受多个电子入口并与其他生物功能耦合 | 构建自维持/自供能的人工类生命系统仍面临挑战,能源守恒机制的整合存在困难和未充分解决的问题 | 从零开始重建能量守恒机制并将其与生物功能整合,以构建具有生命特性的复杂无细胞代谢网络 | 人工呼吸链及一氧化碳固定的16酶催化循环(巴豆酰辅酶A/乙基丙二酰辅酶A/羟基丁酰辅酶A循环) | 合成生物学 | 不适用 | 无细胞代谢工程、电子传递重建、三磷酸腺苷合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人工呼吸链、无细胞转录-翻译网络 | 工业生物技术 |
| 70 | 2026-07-27 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 本研究构建了一个53 kb的环状DNA,称为RCR模块基因组,编码所有26种RCR蛋白,可在体外利用PURE系统实现自我复制 | 首次实现了由遗传信息生成功能性染色体复制系统,构建了可自我复制的体外人工模块基因组,实现了超过28次递归自我复制 | NA | 构建能够自我复制的体外人工基因组,推动自下而上合成生物学中人造细胞的构建 | RCR模块基因组(53 kb环状DNA,编码26种RCR蛋白) | 合成生物学 | NA | 体外重组、蛋白质合成、DNA复制 | NA | NA | NA | NA | Escherichia coli(大肠杆菌) | RCR模块基因组(包含复制循环反应的基因回路) | 合成生物学、基础研究 |
| 71 | 2026-07-27 |
Single-residue engineering of Klenow fragment enables broad acceptance of chemically modified nucleotides
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag697
PMID:42454372
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研究论文 | 报道了Klenow片段的一个单残基突变体F762A,能够在生理条件下高效合成多种化学修饰核酸(XNA) | 首次通过单点突变实现中温聚合酶对多种修饰核苷酸的广泛接纳,在37°C下高效合成DNA、RNA、2'-F-RNA、FANA等,并具备逆转录活性和自复制能力 | 未提及在更复杂的生物环境或体内应用中的表现,长期稳定性及诱变率在长期扩增中的影响尚需进一步验证 | 开发能在生理条件下高效合成XNA的中温聚合酶,拓展XNA在合成生物学和生物技术中的应用 | Klenow片段F762A突变体及其与多种修饰核苷酸的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、酶学表征、核苷酸合成 | NA | 序列数据、生化实验数据 | NA | 定点突变 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、生物技术、医药 |
| 72 | 2026-07-27 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 本文报道了一种名为“风滚草”的人工受控蛋白质马达,该马达通过模块化设计策略构建,能在DNA轨道上沿指定方向进行16纳米步进的定向运动 | 首次实现了基于蛋白质的人工分子马达,采用模块化设计整合配体门控DNA结合域,实现了对外部输入的可控定向步进运动 | NA | 构建并验证一种人工蛋白质马达,实现沿DNA轨道的可控步进运动 | Tumbleweed蛋白质马达及其与DNA轨道的相互作用 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测,微流控装置 | NA | 单分子荧光图像 | NA | NA | NA | 蛋白质马达(风滚草)由三个包含配体门控DNA结合域的“腿”组成 | 纳米技术, 合成生物学 |
| 73 | 2026-07-27 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的分子机制、组学见解、应用及生物安全考量 | 系统整合了蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、多组学分析进展及合成生物学应用前景 | 田间应用受环境变异性与制剂稳定性限制,实验室成果向大田推广存在挑战 | 为开发环保可持续的作物真菌病害防控方案提供理论依据和未来方向 | 蓝细菌产生的抗真菌代谢物及其对作物真菌病害的抑制作用 | 机器学习 | 作物真菌病害 | 多组学分析、全基因组挖掘 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物传感器、代谢通路工程 | 农业 |
| 74 | 2026-07-27 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
|
研究论文 | 通过扩展遗传工具箱,实现了鼠李糖乳杆菌的组成型荧光标记,以支持功能微生物组研究 | 首次在鼠李糖乳杆菌GR-1和GG中实现了直接质粒克隆和一组之前在植物乳杆菌中验证的遗传元件测试,并构建了组成型荧光菌株 | 未提及研究的局限性,可能包括荧光稳定性或体内适用性需进一步验证 | 扩充鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱,开发组成型荧光菌株用于功能微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、荧光蛋白标记 | NA | 荧光图像数据 | 两个鼠李糖乳杆菌菌株(GR-1和GG)和一个金黄色葡萄球菌致病菌株 | 组成型启动子、荧光蛋白(mCherry, mScarlet3, sfGFP) | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 75 | 2026-07-27 |
An Experimentally Verified Mechanistic Model for Predicting Quorum Sensing-Based Switches
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70408
PMID:42444116
|
研究论文 | 开发了一个预测基于群体感应的EsaI/EsaR开关的机理模型并用实验验证 | 提出了一个能够区分转录因子和合酶表达水平对双向启动子响应影响的数学模型,强调了转录因子在调控电路中的关键作用 | 未说明,推测模型可能受限于特定系统或实验条件 | 开发一个数学预测模型以加速群体感应基因电路的调控过程 | EsaI/EsaR群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 实验数据 | 构建了菌株文库 | NA | NA | 群体感应开关 | 合成生物学 |
| 76 | 2026-07-27 |
Functional Engineering of Bioactive Peptides: Chemical Modifications and Synthetic Biology Approaches
2026-Jul-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135939
PMID:42450206
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综述 | 系统总结了生物活性肽的合成生物学和化学修饰策略,并讨论了当前挑战与未来趋势 | 首次全面整合合成生物学(氨基酸替换、序列截短与杂合等)和化学修饰(末端修饰、环化、聚合物缀合等)两大类策略,并基于122篇系统文献检索结果提供理论指导 | 未深入研究具体修饰策略的实际应用效果比较,且综述性质限制了实验验证 | 梳理生物活性肽的工程改造方法,为克服其天然局限性提供理论指导与创新思路 | 生物活性肽(BPs) | NA | NA | 氨基酸替换、序列截短、杂合、侧链功能化、主链/侧链整合、末端修饰、环化、主链修饰、聚合物缀合、脂化、糖基化 | NA | 文献数据 | 122篇系统文献 | NA | NA | NA | 食品、医药、生物材料 |
| 77 | 2026-07-27 |
Synthetic Biology of Sclareol: From the Plant Biosynthetic Pathway to Engineered Microbial and Photosynthetic Chassis
2026-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70285
PMID:42489835
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综述 | 综述了植物合成通路及工程微生物和光合底盘生产香紫苏醇的研究进展 | 系统总结了香紫苏醇在异源宿主中的生物合成途径重建策略,并介绍了新兴的光合和植物基平台作为互补的绿色生产系统 | 涉及生产挑战和未来展望的讨论可能不够深入,且对具体工程策略的定量比较有限 | 综述香紫苏醇生物合成途径的解析和异源宿主中的工程化生产策略 | 香紫苏醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂, 光合底盘, 植物基平台 | 香紫苏醇生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 78 | 2026-07-20 |
State-of-the-art lignin depolymerization and its routes to microbial valorization
2026-Jul-18, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135444
PMID:42471147
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综述 | 系统评估木质素解聚的先进策略及其与下游微生物转化相结合的途径 | 提出从解聚到增值一体化设计的概念转变,强调化学与生物解聚途径与微生物细胞工厂构建的协同整合 | 物理方法通常需与其他方法联用才能实现有效键断裂,生物解聚在反应速率、底物异质性和可扩展性方面仍存在挑战 | 探索木质素高效解聚并实现微生物增值转化的集成策略,支撑循环生物经济发展 | 木质素及其解聚产生的酚类单体和低聚物,以及用于增值转化的微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 物理解聚、化学解聚、生物解聚、途径工程、合成生物学、系统代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 木质素降解与微生物碳漏斗途径及产物选择性生物合成代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 79 | 2026-07-24 |
Penetrating the cell wall: a review on delivering exogenous materials into plant and fungal cells via micro/nanoinjection
2026-Jul-23, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6nr00509h
PMID:42301729
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综述 | 系统总结了利用微纳注射技术向植物和真菌细胞递送外源物质的研究进展 | 首次系统梳理了微纳注射技术在探针设计与制备、自动化控制、力反馈策略及细胞壁穿透机制方面的最新进展 | 技术标准化不足,集成系统缺乏,细胞存活率有待提高 | 全面总结微纳注射技术在有壁细胞(植物和真菌)中递送外源物质的研究现状,并提出未来发展方向 | 植物和真菌细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳注射技术 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞,真菌细胞 | NA | 植物科学,微生物学,合成生物学 |
| 80 | 2026-07-24 |
Beyond direct pathway engineering: reprogramming Fusarium fujikuroi from a GA3 producer into a GA4+7 factory
2026-Jul-17, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135439
PMID:42468703
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研究论文 | 通过双重干预范式将藤仓镰刀菌从赤霉酸生产者重编程为高效生产GA4+7的细胞工厂 | 提出非传统途径工程的间接代谢重编程方法,利用拟南芥转运蛋白创造热力学陷阱和Sfp型磷酸泛酰巯基乙胺转移酶介导的转录后沉默机制,实现了赤霉素生产的定向转换和高产 | 未明确提及局限性,但可能涉及宿主菌株的遗传稳定性或大规模发酵的可行性 | 通过非直接通路工程方法重编程藤仓镰刀菌,使其从默认的赤霉酸生产者转变为高效生产高价值赤霉素GA4+7的工厂 | 藤仓镰刀菌Fusarium fujikuroi | 合成生物学 | NA | 代谢工程、膜转运蛋白异源表达、转录后基因沉默 | NA | 代谢物浓度、mRNA表达水平 | 未明确提及样本数量,涉及亲本菌株和工程菌株的多个构建体 | NA | 藤仓镰刀菌 | 热力学陷阱通路(由Sweet1转运蛋白驱动)和Sfp型Ppt1介导的转录后沉默机制 | 工业生物技术、农业 |