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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-07-24 |
From fundamental understanding to engineering of carboxysomes for biotechnological applications
2026-07-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
|
综述 | 综述了从基本原理到工程化羧酶体用于生物技术的应用 | 强调羧酶体作为合成生物学和生物工程中的强大模型,提供增加碳同化和解锁新型生物技术功能的前所未有的机会 | 面临精确控制壳渗透性、高效货物封装和将羧酶体整合到异源宿主中的关键挑战 | 总结对羧酶体结构、组装和功能的分子机制的理解,并概述工程化羧酶体作为增强CO₂固定引擎和多功能纳米材料的未来策略 | 羧酶体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 82 | 2026-07-24 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
|
研究论文 | 构建了一种具有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器,用于模拟和扩展自然细胞系统的功能复杂性 | 首次在巨型单层囊泡膜上整合两种动态DNA基孔(光响应小孔和自排列可密封大孔),实现高时空精度的顺序按需分子递送 | NA | 重建细胞复杂性和动态膜组件相互作用,开发仿生纳米技术平台 | 双颈合成细胞微反应器(DCM)及其膜上的动态DNA基孔 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、光响应系统 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUV) | DNA基孔设计 | 无 | 信号通路介导的膜动力学调控:光响应小孔与自排列可密封大孔相互作用 | 生物技术、纳米技术 |
| 83 | 2026-07-23 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
|
综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析和合成生物学方法的研究进展 | 系统总结了近期在单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱等主要类别中的途径解析突破,并重点讨论了立体化学控制、关键环化和特异性修饰酶催化等挑战,提出了长途径解码的创新方法 | 未涉及动物来源生物碱,且可能因文献覆盖范围限制,对某些新兴类别或技术细节的讨论深度有限 | 激发植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新的研究,促进植物学、化学、生物学和药学跨学科合作 | 代表性植物生物碱,包括单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱及其他类型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径、代谢通路 | 医药, 可持续生产 |
| 84 | 2026-07-23 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jul-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
|
综述 | 本文综述了用于人工光合作用的生物-非生物杂化系统的最新进展 | 结合合成生物学、计算和可视化技术以及高分辨率表征手段,深入理解界面并改善电子传递过程和设计架构 | 未明确提及 | 探讨人工光合作用和生物-非生物杂化系统的发展,以实现光诱导能量或燃料生产 | 天然光合蛋白质、无机光催化剂和先进生物杂化材料 | NA | NA | 合成生物学、计算技术、可视化技术、高分辨率表征 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可再生能源、人工光合作用 |
| 85 | 2026-07-23 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
|
综述 | 该综述全面介绍了超过25种植物特异性Golden Gate克隆工具包,并深入探讨了其模块兼容性,旨在提高系统互操作性并简化克隆工作流程 | 首次系统评估多种植物Golden Gate克隆工具包的兼容性,并提出包括驯化策略、甲基化酶辅助分层DNA组装和多克隆位点在内的系统协调方法 | 未提供实证比较数据或工具包效率的定量分析,且兼容性评估可能受限于已有公开模块的可用性 | 提升植物合成生物学中Golden Gate克隆工具包的互操作性与标准化,降低技术门槛 | 植物特异性Golden Gate克隆工具包及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块与转录单元的标准组装 | 农业,工业生物技术 |
| 86 | 2026-07-23 |
Biotransformation-Driven Structural Remodeling of Natural Products by Ganoderma lucidum Fermentation: Mechanisms and Enhanced Bioactivities
2026-Jul-14, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
综述 | 本文系统综述了灵芝发酵驱动的天然产物结构重塑机制及其生物活性增强作用 | 首次系统阐明灵芝发酵通过酶水解、微生物代谢重塑和底物-微生物互作精确调控天然产物化学谱和生物活性的机制,并强调整合多组学和合成生物学对实现精准控制的重要性 | 未提供具体的实验数据验证或比较不同发酵条件的效应 | 阐明灵芝发酵驱动天然产物结构修饰的机制及其在功能食品和药物发现中的应用前景 | 灵芝发酵过程中多糖、皂苷、三萜类、黄酮类和蛋白质等关键化合物的结构修饰 | 机器学习和数字病理学以外的其他领域 | NA | 发酵、多组学、合成生物学 | NA | 综述性文字 | NA | NA | 灵芝 | NA | 食品、药物发现 |
| 87 | 2026-07-22 |
Discovery of novel bio-resources from the hidden biodiversity of marine mangrove ecosystems
2026-Jul-13, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-026-03325-2
PMID:42440035
|
综述 | 综合现有知识,探讨红树林相关微生物及生物群落的生物活性及其代谢产物,强调其在生物技术中的潜力 | 强调通过基因组引导的多组学和宏基因组方法发现不可培养微生物的新型生物合成途径,推动生物活性化合物发现和合成生物学应用 | 未明确讨论,可能包括生态复杂性对化合物发现的影响及验证策略的完整性挑战 | 综合红树林生态系统中生物活性化合物知识,促进可持续生物技术创新 | 红树林相关微生物及生物(细菌、真菌、藻类、无脊椎动物)及其生物活性代谢产物 | 生物技术 | NA | 色谱技术、LC-MS/NMR分析、计算机模拟工具、多组学、宏基因组学 | NA | 代谢组学数据、基因组数据、宏基因组数据 | NA | 合成生物学 | 红树林微生物(不可培养微生物为主) | 新型生物合成途径 | 医药、环境管理、工业生物技术 |
| 88 | 2026-07-21 |
Bioactive Peptides for Oral Diseases: Biomaterial-Assisted Therapeutics and Translational Applications
2026-Jul-20, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00571
PMID:42411007
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综述 | 综述生物活性肽在口腔疾病中的生物材料辅助治疗策略及转化应用 | 整合生物活性肽与生物材料平台(纳米颗粒、水凝胶、涂层、黏膜黏附系统)的设计与功能修饰,提出基于人工智能和合成生物学的下一代口腔治疗框架 | 临床转化受限于酶不稳定性、短停留时间、口腔微环境中渗透有限以及递送效率低 | 总结生物活性肽在口腔疾病中的研究进展,强调生物材料辅助治疗策略并讨论转化挑战 | 生物活性肽及生物材料递送系统 | 机器学习, 自然语言处理 | 牙龈疾病、牙周炎、口腔黏膜炎症、种植体周围感染、口腔组织缺损 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物材料 |
| 89 | 2026-07-20 |
Artificial Intelligence and Protein Design: A retrospective study on 20-year emerging trends and core research areas from bibliometric perspectives
2026-Jul-18, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11131-6
PMID:42470596
|
回顾性研究 | 对人工智能与蛋白质设计领域二十年来研究趋势与核心领域进行文献计量分析 | 通过文献计量方法系统揭示AI驱动蛋白质设计的发展轨迹、国家影响力差异及三大知识聚类,并指出未被充分讨论的局限性 | 模型对稳定可结晶结构的依赖性、静态预测忽略构象动态变化、计算机模拟置信度与湿实验结果脱节,且需要双向耦合高通量实验反馈 | 从文献计量视角分析AI与蛋白质设计交叉领域的发展趋势和核心研究方向 | 2006-2025年间Web of Science数据库中的蛋白质设计相关文献 | 人工智能,文献计量学 | NA | 文献计量分析 | 深度学习模型(如AlphaFold2, RoseTTAFold, ProteinMPNN, RFdiffusion) | 文献元数据(引用、共被引、关键词等) | Web of Science数据集(2006-2025年) | NA | NA | NA | 合成生物学,药物发现,生物工程 |
| 90 | 2026-07-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
|
观点文章 | 提出纳米流体学作为自下而上无细胞分子系统合成生物学的变革性平台 | 利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装,构建有序时空结构 | 纳米流体技术构建下一代单分子分辨率无细胞分子系统仍面临关键挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学发展 | 无细胞分子系统的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学 |
| 91 | 2026-07-19 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
|
综述 | 回顾了将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合,推动植物组织培养中次生代谢产物生产的进展 | 将植物组织培养从试错实践转变为预测性系统工程领域,整合代谢组学作为决策层,连接代谢表型与理性途径设计 | 仍面临分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性等挑战 | 探索代谢组学引导下植物组织培养中代谢产物生产的综合策略 | 植物组织培养体系中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成启动子, 模块化基因电路 | 植物细胞 | 代谢途径编辑, 异源表达系统, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 92 | 2026-07-19 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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研究论文 | 本研究报道了SARGE,一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台,通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计,无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合循环,并采用双荧光报告系统实现裸眼菌落筛选 | 未明确说明局限性 | 开发一种高效、可扩展的迭代基因组整合平台,简化大肠杆菌的基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组整合过程 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统(sfGFP和mKate) | 合成生物学, 基因组工程 |
| 93 | 2026-07-19 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结了通过微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展,并探讨了生产聚乙醇酸生物塑料的策略 | 全面综述了乙醇酸生物合成的多种途径、底盘生物及代谢工程策略,并整合了系统代谢工程与AI辅助设计及过程优化的未来方向 | 未详细讨论具体实验验证数据,仅基于文献综述,可能缺乏实际工业应用中的技术细节和成本分析 | 探索通过微生物发酵可持续生产乙醇酸的途径和策略,以支持聚乙醇酸生物塑料的工业化和循环生物经济 | 微生物细胞工厂、乙醇酸生物合成途径、微生物底盘生物、基于乙醇酸的生物塑料 | 合成生物学, 代谢工程, 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本和综述数据 | NA | NA | 微生物, 例如大肠杆菌、酵母等 | 乙醛酸旁路、C5-糖裂解途径、新型生物合成途径 | 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 94 | 2026-07-19 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
|
观点文章 | 探讨微流控技术与分子自组装协同构建人工细胞系统的工程策略 | 提出微流控不应仅替代生物调控,而应作为提供外在物理边界条件的平台,引导和放大分子自组装的潜力 | 仅停留在概念框架层面,未提供具体实验验证或量化分析 | 构建功能化、可规模化的人工细胞系统 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 95 | 2026-07-19 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 在最快生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立基于胞苷脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合蛋白(MutaT7)的体内超突变系统,实现蛋白质的快速连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7系统(VnMutaT7),利用其极快生长速度(倍增时间仅为大肠杆菌一半),在36小时内实现TEM-1蛋白质对头孢他啶的高水平抗性进化 | 未明确说明系统的脱靶效应、突变谱局限性或对宿主基因组的潜在影响 | 在Vibrio natriegens中建立快速连续定向进化平台,加速蛋白质工程 | MutaT7系统、Vibrio natriegens宿主菌、TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统、定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | MutaT7系统(胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白) | 工业生物技术 |
| 96 | 2026-07-19 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 综合阐述液-液相分离如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调控等机制影响反应动力学,并总结其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗及人工细胞构建等领域的应用 | 首次系统整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离,深入解析其对反应动力学的精确调控机制,并提供理性设计下一代合成生物学应用的设计指南 | 当前对液-液相分离如何精确调控反应动力学尚缺乏完整的机制理解,阻碍了基于相分离的应用的理性设计和优化 | 填补液-液相分离在反应动力学调控机制方面的知识空白,为合成生物学应用提供设计原理 | 液-液相分离系统及其对生物反应过程的调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建, 生命起源研究 |
| 97 | 2026-07-19 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
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研究论文 | 本研究通过信号肽引导的蛋白质转运策略,在Komagataeibacter rhaeticus中实现细菌纳米纤维素的原位功能化,建立了一个单底盘合成生物学框架 | 首次在K. rhaeticus中系统评估信号肽介导的蛋白质转运,建立了单个底盘细胞同时进行生物聚合物合成和原位功能化的合成生物学框架 | 重组蛋白被滞留于周质空间,限制了胞外可用性;通过渗透压休克后处理可使酶活性提高30%,但仍需优化以实现高效胞外释放 | 建立K. rhaeticus作为单底盘平台用于功能性生物工程活材料的合成生物学框架 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱法, SignalP 5.0预测 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | 信号肽介导的蛋白质转运 | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽−蛋白转运回路 | 材料科学, 生物技术 |
| 98 | 2026-07-18 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
|
研究论文 | 通过多层级代谢工程改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917,实现无抗生素生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并实现了益生菌EcN生产β-丙氨酸的最高产量 | 未提及明确局限,但可能涉及发酵过程的规模化挑战或长期稳定性 | 开发益生菌EcN作为微生物细胞工厂,实现β-丙氨酸的无抗生素高效生产 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA(涉及5升生物反应器中的发酵过程) | NA(多层级代谢工程策略,包括异源酶引入、通路强化等) | 大肠杆菌Nissle 1917 | β-丙氨酸生物合成途径,包括前体L-天冬氨酸供应双通路强化、竞争通路动态调控、中枢代谢重编程和转运系统工程化 | 工业生物技术 |
| 99 | 2026-07-18 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 提出一种利用缓步动物来源的CAHS蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥下稳定的方法 | 首次利用缓步动物来源的CAHS蛋白作为单一添加剂,无需其他成分即可在低成本室温干燥条件下保护无细胞表达系统的蛋白合成活性 | 未明确说明CAHS蛋白对其他类型无细胞系统或更复杂生物过程的保护效果,以及长期储存稳定性 | 开发低成本的室温储存方法,提高无细胞表达系统的可及性和便携性 | 无细胞表达系统以及缓步动物来源的胞质丰富热溶性(CAHS)蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 100 | 2026-07-18 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 全面综述大麻色烯(CBC)的生物合成、药理学、治疗潜力及转化前景 | 系统整合了CBC的生物合成途径、独特的受体相互作用谱(如TRP通道激动剂)及非精神活性优势,并提出纳米递送系统、合成生物学等未来方向 | 缺乏临床试验数据,口服生物利用度低,监管碎片化,且现有证据仅基于临床前研究 | 评估CBC作为治疗候选分子的现状,并识别转化研究中的关键挑战 | 大麻色烯(CBC)及其前体大麻色烯酸(CBCA) | 药物化学 | 炎症、疼痛、癌症、神经退行性疾病、抑郁症、皮肤病 | 高效液相色谱、质谱、酶活性测定、分子生物学 | NA | 生物化学数据、药理学数据、毒理学数据 | NA | NA | 大麻(Cannabis sativa L.) | 大麻素生物合成途径(聚酮/甲羟戊酸/MEP途径) | 医学 |