合成生物学相关文章
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当前共找到 158 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-07-13 |
An advanced genome engineering platform for Komagataella phaffii enabling versatile in vivo DNA assembly and multiplex integration
2026-Jul-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00731-z
PMID:42436509
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研究论文 | 开发了一种用于Komagataella phaffii的高级基因组工程平台，实现了高效的多基因体内组装和多重整合 | 通过协同删除Ku70和过表达RAD52构建了HR增强型底盘dKR，显著提高了CRISPR/Cas9介导的基因组编辑效率和可靠性 | 未提及具体局限性，但可能涉及对非模式生物中DNA修复途径的依赖及规模化应用的潜在挑战 | 加速基于甲醇的生物制造的DBTL循环，提升Komagataella phaffii作为C1合成生物学底盘的能力 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 体内多片段组装, tRNA-核酶CRISPR系统 | NA | 基因组编辑效率数据, 代谢产物产量数据 | 多个基因组编辑实验和代谢通路验证，包括九片段组装和三位点整合 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 类胡萝卜素生物合成途径（β-胡萝卜素生产） | 合成生物学, 代谢工程, 生物制造, 工业生物技术 |
| 82 | 2026-07-13 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Jul-08, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
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研究论文 | 该研究发现一种高产合成抗生素的链霉菌LJ1018在进入水源后，不仅存活下来，还能持续产生抗生素，并通过饮用水处理系统传播，增加抗生素耐药性风险 | 首次揭示了高产合成抗生素细菌在完整饮用水供应系统（从水源到水龙头）中的命运，提出“移动抗生素工厂”的概念，颠覆了传统水安全认知 | NA | 评估高产合成抗生素细菌在饮用水供应系统中的存活、抗生素持续生产及其对耐药性传播的影响 | 高产合成抗生素的链霉菌LJ1018及其在饮用水处理系统中的行为 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 实验数据 | NA | NA | 链霉菌 | 高产抗生素合成途径 | 环境安全 |
| 83 | 2026-07-12 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Jul-10, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示微小病原体解脲支原体在无典型转录调控系统下依赖pH驱动的代谢与翻译适应机制 | 首次提出最小基因组细菌通过预先存在的功能模块差异激活实现表型可塑性，并揭示表观转录组（RNA修饰）在pH适应中的动态重组作用，挑战了传统认为细菌适应必须依赖转录调控的观点 | 未明确pH信号直接感知机制，且研究仅限于体外条件，未在宿主微环境验证模型 | 构建解脲支原体在pH波动条件下的系统级适应模型，解释最小基因组微生物的适应性可塑性机制 | 解脲支原体（Ureaplasma parvum） | 微生物学, 系统生物学 | 泌尿生殖道感染 | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰分析（表观转录组学） | NA | 蛋白质丰度, 代谢物浓度, RNA修饰谱 | NA（未提供具体样本量） | NA | 解脲支原体（天然宿主为人类泌尿生殖道） | NA | 医学, 合成生物学 |
| 84 | 2026-07-12 |
Engineering extracellular vesicle biogenesis for therapeutic gene delivery: emerging genetic programming strategies and translational prospects
2026-Jul-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12320-w
PMID:42429865
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综述 | 本文综述了利用遗传工程策略改造细胞外囊泡生物发生过程，以实现治疗性基因递送的最新进展和转化前景 | 整合了细胞外囊泡生物发生知识与新兴遗传工程技术，包括CRISPR-Cas9基因组编辑和合成生物学工具，以实现可编程基因递送系统的构建 | 面临囊泡异质性、大规模生产和临床转化等关键挑战 | 探讨将细胞外囊泡转化为可编程基因递送系统的策略及其在精准医学中的应用前景 | 细胞外囊泡及其在基因治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 可编程基因递送系统 | 医学 |
| 85 | 2026-07-12 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 系统综述了disorazole家族的结构、生物活性、全合成和异源生物合成，阐述了从化学合成迈向工程化生物合成的范式转变 | 阐明了从传统全合成挑战（如通过大环内酯化或环二聚化合成A1、C1、Z1）转向可编程生物合成工程（F和Z系列）的范式转变，并重点展示了异源表达、基于Red/ET重组工程的途径重构和模块化聚酮合酶工程等关键技术如何革新了这些分子的生产和多样化 | NA | 对disorazole家族进行全面系统分析，弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距，并提出整合生物合成可扩展性与合成化学精度的未来转化策略 | Disorazole家族天然产物（包括A/C系列和Z-F家族） | 天然产物化学，合成生物学 | 癌症 | 异源表达，Red/ET重组工程，模块化聚酮合酶工程，全合成（通过大环内酯化或环二聚化） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Red/ET重组工程 | Sorangium cellulosum | 异源生物合成途径重构和模块化聚酮合酶工程，用于生产disorazole及其类似物 | 医学 |
| 86 | 2026-07-12 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 开发了BINND模型，通过深度学习预测非正交DNA-DNA相互作用，并展示了其在超连网络工程中的应用 | 提出从回避弱或非特异性相互作用转向利用完整序列空间的新范式，结合超高通量平台和深度学习模型，实现快速准确的预测 | 未提及模型在复杂生物系统或临床环境中的验证，也未讨论潜在的非特异性交叉干扰问题 | 开发能够准确快速预测非正交DNA-DNA相互作用的模型，以扩展合成生物学的序列空间利用 | DNA-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 神经网络（BINND） | DNA相互作用数据 | 数百万个相互作用测量 | NA | NA | 超连网络 | 医学, 生物工程, DNA折纸 |
| 87 | 2026-07-12 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
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综述 | 本文综述了从自然途径到可编程生物系统的二氧化碳固定技术驱动革命 | 创新性在于集成分析了从自然途径优化到人工系统构建的范式转变，强调了代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料的深度融合，并引入人工智能辅助设计 | 综述主要聚焦于微生物系统，可能未涵盖其他潜在的二氧化碳固定技术如化学或物理方法，且对实际应用中的经济可行性讨论有限 | 总结并分析二氧化碳固定技术的进展，推动精准、高效和碳负性的生物制造 | 二氧化碳固定途径和微生物转化系统 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 微生物电合成, 半人工光合系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 合成途径（如rGly, CETCH, THETA循环） | 环境, 工业生物技术 |
| 88 | 2026-07-12 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 合成生物学设计的免疫疗法通过精确控制免疫反应，为癌症和免疫疾病提供新策略 | 利用合成生物学设计模块化信号回路和逻辑门控激活，实现免疫行为的上下文依赖和反馈控制，提升治疗特异性和可调性 | 未提及具体临床试验数据和长期安全性评估 | 综述合成生物学在精准免疫治疗中的转化潜力 | 合成免疫回路、逻辑门控激活、反馈控制细胞因子分泌 | NA | 肿瘤, 免疫疾病 | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 哺乳动物细胞 | 逻辑门控激活回路、反馈控制细胞因子分泌回路 | 医学 |
| 89 | 2026-07-12 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
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研究论文 | 扩展了鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，实现了组成型荧光表达，用于功能性微生物组研究 | 通过直接质粒克隆和测试在植物乳杆菌中验证过的遗传元件，首次在鼠李糖乳杆菌GR-1中实现组成型荧光蛋白（mCherry、mScarlet3和sfGFP）表达，并表征了启动子的热响应性和稳定性 | 遗传工具仍有限，仅验证了部分启动子和荧光蛋白，未涉及更复杂的合成生物学应用 | 扩展鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，推动功能性微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 直接质粒克隆 | NA | NA | 两个鼠李糖乳杆菌菌株（GR-1和GG）及一个金黄色葡萄球菌菌株 | NA | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光蛋白表达系统 | 医学、工业生物技术 |
| 90 | 2026-07-10 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
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综述 | 总结了通过工程微生物生产二萜类化合物的最新进展，并展望了未来方向 | 系统综述了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略，强调了工业规模应用的潜力 | 未提供具体的实验数据或定量比较，可能缺乏对特定挑战的深入分析 | 探讨二萜类化合物微生物合成的进展、挑战和未来前景 | 二萜类化合物的生物合成途径和工程微生物菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品添加剂, 工业生物技术 |
| 91 | 2026-07-10 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
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研究论文 | 本研究提出了一种利用尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无疤痕基因组组装平台，用于高效构建工程噬菌体 | 无需长同源臂、限制性酶切位点、Cas系统或同源重组，通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化基因组组装，并减少二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的噬菌体基因组组装和编辑方法 | T7噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | T7噬菌体 | NanoLuc荧光素酶报告基因整合入T7基因组 | 医学、环境监测、工业生物技术 |
| 92 | 2026-07-10 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文系统回顾了天然存在的机械互锁肽和化学合成肽基互锁分子，旨在建立统一命名法并促进跨学科研究 | 首次统一天然与人工合成机械互锁肽的命名体系，通过比较两者的化学特性架起分子生物学与超分子化学的桥梁 | 未详细讨论机械互锁肽在合成生物学中的具体工程化应用案例 | 建立机械互锁肽的统一分类命名体系，促进跨学科研究合作 | 天然存在的机械互锁肽和化学合成的肽基机械互锁分子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机械互锁肽（包括串联环、链甲结构等拓扑结构） | 合成生物学基础研究 |
| 93 | 2026-07-10 |
The structural chemistry and biosynthesis of chlorophylls
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00082g
PMID:42370298
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研究论文 | 综述叶绿素的结构化学与生物合成途径，涵盖从原卟啉IX到叶绿素a的七步反应及多种叶绿素和细菌叶绿素的合成机制，并利用AlphaFold 3建模预测酶结构 | 利用AlphaFold 3建模完整叶绿素生物合成酶体系，揭示亚基关联、辅因子排列及催化机制，提出底物结合与产物转移新模型，为合成生物学构建杂合途径扩展光谱范围提供见解 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 阐明叶绿素和细菌叶绿素的生物合成途径及结构化学特征，探索利用合成生物学扩展太阳光谱利用范围的潜力 | 叶绿素a、b、c、d、f以及细菌叶绿素a、b、e等 | 结构生物学 | NA | AlphaFold 3 | AlphaFold 3 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 杂合叶绿素和细菌叶绿素合成途径 | 能源、农业 |
| 94 | 2026-07-10 |
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.71406
PMID:42417505
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研究论文 | 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器，具备广泛的pH和盐浓度耐受性 | 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中，设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴，实现高效催化和多功能应用 | 未提及具体局限性 | 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器，用于增强化学反应效率 | 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 凝聚液滴微反应器 | 合成生物学，前生物化学 |
| 95 | 2026-07-10 |
Protein Turnover in Plants - Cost of Synthesis, Repair and Crop Engineering Opportunities
2026-Jul-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
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综述 | 本文探讨植物蛋白质周转的代价，包括合成、修复及作物工程机会 | 强调化学损伤作为蛋白质周转的重要原因，并系统分析其呼吸成本对作物产量的影响，提出利用修复机制改善作物性能的新策略 | 未详细讨论不同植物物种中蛋白质修复机制的差异，以及实际田间应用面临的挑战 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果及修复机制，为提高作物产量提供工程策略 | 植物中的蛋白质周转过程，包括损伤、修复和合成 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 蛋白质修复机制及代谢途径优化 | 农业 |
| 96 | 2026-07-10 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 总结工程化活体生物治疗产品（eLBPs）在多种疾病中的应用进展 | 提出了下一代eLBPs理性设计的框架，综合了底盘选择、DNA递送、治疗表达调控和生物遏制系统的进展 | 在实现可预测定植、持久治疗活性和体内稳健生物遏制方面仍存在挑战 | 综述工程共生微生物在宿主健康中的应用，并推动eLBPs从实验系统向临床应用的转化 | 工程化活体生物治疗产品（eLBPs）及其在炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病中的应用 | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 共生微生物 | 感知和响应宿主生理信号的微生物疗法 | 医学 |
| 97 | 2026-07-10 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 提出了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE，用于革兰氏阴性菌中可编程、可调谐的多重翻译抑制 | 该系统不依赖宿主Hfq或RNase因子，能在不同细菌物种中稳健运行，同时实现单启动子多重敲低和一步法组装多达九个引导序列 | NA | 开发一种紧凑、正交且可移植的多重翻译抑制系统，以解决合成生物学中精准调控的挑战 | 革兰氏阴性菌中的翻译抑制 | 合成生物学 | NA | Cas6f系统 | NA | NA | NA | Cas6f | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 多重翻译抑制系统MORTISE | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 98 | 2026-07-10 |
A Minimal Four-Enzyme Suite Enables Biosynthesis of the C20 Diterpenoid Alkaloid Atisinium
2026-Jul-08, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究揭示了一种由四个酶组成的紧凑模块，能够将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium，阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小分子基础 | 首次定义了由三个细胞色素P450单加氧酶和一个新功能化短链脱氢酶/还原酶组成的最小四酶模块，实现了二萜生物碱核心骨架的完整合成途径解析，并在烟草和酵母中异源重建 | NA | 阐明二萜生物碱核心骨架组装的分子机制，并为合成生物学途径重建提供基础 | 毛茛科植物露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成途径相关酶 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默, 异源表达, 酶活性分析 | NA | NA | NA | NA | 烟草, 酵母 | 二萜生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 99 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 100 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |