合成生物学相关文章
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当前共找到 5139 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-13 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 系统梳理生长因子在再生医学、肿瘤学及代谢调控领域的应用进展与临床转化挑战 | 综合分析了生长因子临床转化的多重瓶颈（药代动力学缺陷、脱靶效应、安全性问题），并系统总结了蛋白工程优化、智能响应递送系统（如细胞外囊泡平台）及多因子时序释放技术等解决方案 | 高通量大规模生产工艺成本高、体内微环境复杂性限制转化广度，未来需聚焦可扩展递送平台开发及合成生物学降本 | 为加速下一代生长因子疗法开发提供路线图和技术参考 | 生长因子在神经退行性疾病、骨再生、代谢紊乱中的临床应用案例 | 数字病理学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | 蛋白工程, 化学修饰, 智能响应递送系统, 细胞外囊泡平台, 多因子时序释放技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-06-13 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
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研究论文 | 鉴定了一株耐高温的出芽短梗霉DA22，并发现膜相关转录因子Spt23是高温聚苹果酸发酵的关键转录调控因子 | 首次从野生型出芽短梗霉菌株中鉴定出天然耐高温菌株DA22，并通过过表达膜相关转录因子Spt23显著提高细胞生长和苹果酸产量，提供了一种构建耐高温微生物细胞工厂的合成生物学策略 | 研究仅针对特定菌株DA22和高温条件（35°C），未探讨其他菌株或更高温度下的表现；Spt23的调控机制主要通过转录和生理指标分析，缺乏直接的分子互作证据 | 构建耐高温的聚苹果酸生产微生物细胞工厂，解决工业有机酸发酵中热胁迫的限制 | 出芽短梗霉DA22菌株及其转录因子Spt23 | 工业生物技术 | NA | RT-qPCR、基因过表达与敲除 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 120株野生型出芽短梗霉菌株（用于筛选），以及DA22菌株的多个工程改造菌株 | 基因过表达、基因敲除 | 出芽短梗霉DA22（Aureobasidium melanogenum DA22） | 过表达膜相关转录因子Spt23的基因回路，用于耐高温聚苹果酸合成 | 工业生物技术、医药 |
| 3 | 2026-06-13 |
Engineering of β-glucosidase for rare ginsenoside biosynthesis via distal conformational fine-tuning and sequential degradation control
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134967
PMID:42184941
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研究论文 | 通过计算重设计β-葡萄糖苷酶实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造 | 发现远端突变通过长程别构效应重塑活性位点，将底物结合转变为精确的“分子镊子”模式，并揭示顺序降解机制控制区域选择性 | 未提及临床或体内验证，且仅针对单一突变体组合进行详细分析 | 实现稀有人参皂苷F的高效生物合成并建立通用酶工程框架 | β-葡萄糖苷酶BglPp及其突变体 | 合成生物学 | NA | 计算重设计、定点突变、生物催化、发酵工程 | NA | 蛋白质序列、突变体活性和结构数据 | 5升生物反应器中的一个工程菌株 | NA | 大肠杆菌（推测） | 稀有人参皂苷F的生物合成途径（通过β-葡萄糖苷酶降解人参皂苷Rb1） | 工业生物技术、医药 |
| 4 | 2026-06-04 |
Heterologous expression of anaerobic reductive dehalogenases: host nanoarchitectonics and synthetic biology optimization
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135019
PMID:42217801
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综述 | 综述了异源表达厌氧还原脱卤酶的研究进展，提出了宿主纳米结构与合成生物学优化策略 | 提出了宿主-酶-环境评估框架，强调辅因子供应、应激耐受性和环境适应性在异源表达中的关键作用 | 当前异源表达面临外源钴胺素依赖性和氧化折叠路径等挑战，且新宿主系统尚未充分开发 | 克服有机卤化物呼吸细菌在生物修复应用中的生长缓慢、氧敏感性和底物特异性限制 | 还原脱卤酶及其在异源宿主（如大肠杆菌和巨大芽孢杆菌）中的表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、钴胺素补救系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、巨大芽孢杆菌 | NA | 环境修复、工业生物技术 |
| 5 | 2026-06-13 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Aug, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
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综述 | 本文综述了人工智能和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送系统中的应用 | 首次系统探讨AI和合成生物学协同设计下一代活体药物递送系统，重点揭示序列到功能和组成到功能的设计原理 | 未提供具体实验数据验证所讨论技术的有效性，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 探讨人工智能和合成生物学在工程化活体药物递送系统中的机遇 | 人类细胞和细菌作为活体药物递送载体 | 合成生物学，人工智能 | NA | 合成生物学，人工智能模型 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞，细菌 | 合成受体，信号处理网络，基因回路 | 医学 |
| 6 | 2026-06-13 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
|
综述 | 系统评估微生物细胞工厂用于琥珀酸生物制造的挑战与前景 | 整合系统生物学、代谢建模和过程工程的多学科视角，提出提升碳通量优化、氧化还原平衡和工业规模的战略性框架 | 未提供具体实验数据，可能缺乏对某些新兴技术的深入讨论 | 为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸商业化提供战略框架 | 微生物平台（包括细菌和酵母） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-06-13 |
Gene Expression in Synthetic Biology: Going with the Light
2026-Jun-11, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
|
综述 | 综述光遗传学在合成生物学中调控基因表达的应用，涵盖光响应启动子、光调控转录因子和光笼诱导剂等关键元件 | 系统阐述了光作为调控信号在基因表达中的优势（高时空精度），并探讨了逻辑门与基因表达电路的结合 | 主要聚焦原核生物系统，对真核生物系统的讨论相对简略 | 探究光遗传学与合成生物学的交叉融合，推动光诱导基因表达技术的发展 | 光诱导基因表达系统（光响应启动子、光调控转录因子、光笼诱导剂）及逻辑门电路 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 光诱导基因表达电路, 逻辑门 | 生物技术 |
| 8 | 2026-06-13 |
In Silico Identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-Derived Pediococcus pentosaceus
2026-Jun-11, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 通过计算分析鉴定源自蟑螂肠道的戊糖片球菌中潜在的联苯降解机制 | 首次在戊糖片球菌中发现并表征了疑似通过水平基因转移获得的bphC基因，且基因组中存在IS30家族插入序列，为合成生物学改造以构建完整PCB降解能力提供了机会 | PPBPHCIII对配体的结合亲和力弱于功能验证的1EIR复合物，主要因氢键形成较少；菌株缺乏独立的PCB矿化能力 | 鉴定并表征戊糖片球菌中潜在的联苯降解能力，以开发作为PCB解毒益生菌饲料添加剂 | 蟑螂肠道来源的戊糖片球菌QS-GN03_1 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 1株细菌 | NA | 戊糖片球菌 | 假设的联苯降解途径（bphC基因及可能相关的Bph操纵子） | 农业, 环境 |
| 9 | 2026-06-13 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Jun-10, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
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综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器用于生物催化的研究进展 | 提出了利用自组装多酶系统（细菌区室和生物凝聚体）作为新一代生物催化剂，促进可持续有机合成与合成生物学的交叉融合 | 仅概述了现有研究，未提供实验数据或定量比较不同系统的性能 | 探索工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用潜力 | 工程化细菌区室和生物凝聚体等自组装多酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器 | 可持续化学, 有机合成 |
| 10 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
|
综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进，以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用，并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制，并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 11 | 2026-06-13 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
|
研究论文 | 通过工程化改造酿酒酵母的过氧化物酶体辅因子系统，实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化过氧化物酶体的辅因子平衡，结合细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略，显著提高α-葎草烯产量 | 未提及在大规模发酵或工业环境下的稳定性和成本效益 | 在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个工程化酵母菌株（LM07, LM27等） | NA | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径靶向过氧化物酶体，过氧化物酶体辅因子系统（乙酰辅酶A供应、NADH可用性、CoA代谢循环），细胞质-过氧化物酶体双区室工程 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-06-13 |
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag548
PMID:42258532
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研究论文 | 在大肠杆菌中评估所有唯一Cas9原型间隔子的功能，揭示普遍的功能性和gRNA设计规则 | 首次全面评估大肠杆菌K12 MG1655基因组中463,000个唯一gRNA的活性，发现93%以上具有功能性，仅0.3%无功能，并识别出无功能gRNA的间隔自相互作用特征 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655菌株，可能不适用于其他细菌或真核系统 | 解决大肠杆菌社区中关于gRNA失活率的矛盾，提供功能性gRNA的设计规则和实验方法 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的唯一gRNA | 合成生物学 | NA | Cas9核酸酶 | NA | gRNA序列数据 | 463,000个唯一gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 微生物合成生物学 |
| 13 | 2026-06-13 |
Small but Mighty: The Surprising Metabolic Range of a Bacterial Microcompartment
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730297
PMID:42282558
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中异源表达丙二醇利用操纵子，研究细菌微区室的代谢多功能性，并展示其在底物利用和生物技术中的应用潜力 | 首次证实异源表达的Pdu细菌微区室具有底物杂泛性，可处理C2至C5的二醇和三醇，并通过酶工程将底物范围扩展至1,2-戊二醇，为塑料回收和高价值化合物合成提供新途径 | 氧气抑制1,2-丙二醇利用，虽在微氧条件下缓解，但可能限制某些需氧应用；目前主要在模式菌株大肠杆菌中验证，其他宿主适用性未评估 | 研究细菌微区室的代谢多功能性及其在合成生物学中的调控潜力 | 大肠杆菌中异源表达的Pdu细菌微区室 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 分子动力学模拟，染色体整合，同源重组，诱变 | NA | 代谢数据，分子动力学模拟数据 | 单个大肠杆菌工程菌株及多种底物测试 | CRISPR-Cas9，同源重组 | 大肠杆菌 | Pdu细菌微区室代谢模块 | 工业生物技术，塑料回收 |
| 14 | 2026-06-13 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
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综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产保健品的合成生物学工具和代谢工程策略 | 全面比较了不同工程策略的局限性并强调其在保健品生物合成中的应用 | 当前挑战包括生产效率和经济性仍需提升 | 开发枯草芽孢杆菌作为高效生产保健品的底盘细胞 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径 | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-06-13 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
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研究论文 | 开发了一个集成深度学习框架，结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型，以提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心避让密码子优化策略，并利用深度学习模型同时优化密码子使用模式和上下文，显著提高可溶性蛋白表达量 | 文中未明确提及，但可能受限于仅在大肠杆菌中验证且仅针对两种工业酶 | 设计DNA序列以增强异源蛋白在底盘微生物中的可溶性表达 | 大肠杆菌中表达的异源蛋白，具体为α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 同义密码子生成模型（SCG）和基因表达水平预测模型（GELP） | 基因组数据、基因表达数据 | 两种工业酶，每种酶多个重复（αGP: n=3, IA: n=4） | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-06-13 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 整合多组学技术与合成生物学方法，系统阐述了内生真菌中生物活性次生代谢物的发现与产量优化策略 | 低产量、沉默基因簇和大规模生产困难等挑战仍待解决 | 探索内生真菌作为生物工厂生产治疗药物的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的生物活性次生代谢物 | 数字病理学 | NA | OSMAC、共培养、表观遗传修饰、基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 药用植物内生真菌 | 生物合成基因簇、代谢途径 | 医学、药物 |
| 17 | 2026-06-13 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
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研究论文 | 利用自上而下的方法理性组装具有几丁质酶活性的合成海洋生物膜群落 | 首次采用自上而下的组装策略，利用天然海洋细菌设计多功能生物膜群落，实现目标功能几丁质酶的产生，并展示了多物种生物膜在入侵挑战中的集体韧性 | 研究局限于实验室条件下的短期观察（7天），未探讨更长时间尺度下的群落稳定性；仅评估了一种目标功能（几丁质酶），其他潜在功能未涉及 | 设计具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜，利用天然海洋细菌实现目标功能工程化 | 17种初始分离的海洋细菌及其组装形成的多物种生物膜 | 合成生物学，微生物组工程 | NA | 自上而下的群落组装，几丁质酶活性检测 | NA | 生物膜组成数据，酶活性数据 | 17种初始海洋细菌分离株，14种成员组成的最终群落 | NA | 天然海洋细菌 | 几丁质酶生产功能电路 | 海洋微生物组工程，生物技术 |
| 18 | 2026-06-13 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
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研究论文 | 提出一种结合基因编码的氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光传感平台，用于工业酵母系统中细胞内活性氧和耗氧率的并行、非侵入性定量测定 | 首次将细胞内氧化还原生物传感器与胞外氧气传感集成，实现对酵母氧化应激的动态监测，并识别出不同酵母的独特氧化还原-呼吸表型 | NA | 开发一种定量评估细胞氧化应激的方法，通过同时测量细胞内氧化还原状态和胞外呼吸活性 | 两种工业酵母菌株（Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母） | 合成生物学 | NA | 双荧光传感、基因编码生物传感器、光学氧传感 | NA | 荧光强度、氧气消耗率 | 两种酵母菌株（具体数目未提及） | NA | 酿酒酵母（Crabtree阳性酵母）、专性呼吸酵母 | NA | 生物制造、合成生物学 |
| 19 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合，提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束，引入嵌入式物理信息神经网络方法，无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设，机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |
| 20 | 2026-06-13 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 综述细胞色素P450酶催化二酮哌嗪生物碱结构多样化的研究进展 | 强调P450酶除羟基化外的催化多样性，包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化，并探讨工程化P450变体在可持续生物合成中的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同P450变体的催化效率 | 总结P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用，并探索合成生物学驱动的创新策略 | 细胞色素P450酶及其催化的二酮哌嗪生物碱 | 合成生物学 | NA | P450酶催化、工程化P450变体 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | 二酮哌嗪生物合成途径 | 药物发现 |