本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-11 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-05-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
|
综述 | 综述了爆炸物与微生物相互作用中的降解动力学,涵盖降解途径、关键酶及最新研究进展 | 将传统降解动力学与合成生物学工具(如CRISPR/Cas系统)结合,提出通过工程化微生物菌株提升降解活性 | 未详细讨论工程菌株的实际应用效果及环境影响评估 | 提供爆炸物降解动力学的研究现状概述 | 微生物(细菌和真菌)与爆炸物(如硝胺、硝基取代芳香族化合物、苦味酸、TETRYL、HEXYL、RDX等)的相互作用 | 环境科学 | NA | 降解动力学分析、生物组学(Bio-omics)、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 微生物(细菌、真菌) | NA | 环境科学 |
| 62 | 2026-06-11 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
|
综述 | 综述人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测、环境监测和抗菌素耐药性分析 | 首次系统整合AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍及监管考虑,涵盖深度学习(如CNN)和集成模型在多传感器数据集中的应用 | 未提供具体实验数据或性能比较,缺乏对混合系统长期稳定性和临床验证的深入讨论 | 分析AI-微生物混合生物传感器作为下一代病原体检测和适应性生物监测平台的关键方面 | AI-微生物混合生物传感器系统 | 机器学习, 数字病理学 | 感染性疾病(病原体相关) | 卷积神经网络, 集成模型, 电化学阻抗谱, 拉曼光谱, 高光谱显微镜 | CNN, 集成模型 | 多传感器数据集(电化学阻抗、拉曼光谱、高光谱显微镜图像) | NA | CRISPR(CRISPR介导的传感) | 微生物(未具体指定) | 生物传感器电路(合成生物学相关) | 医学, 环境监测 |
| 63 | 2026-06-11 |
From fundamental understanding to engineering of carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
|
综述 | 本文综述了羧基体的分子机制及其在合成生物学和生物工程中的应用潜力 | 强调了羧基体作为可编程模块在提高碳固定效率和改造为多功能纳米材料方面的创新应用 | 精确控制壳通透性、高效封装货物及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 总结羧基体结构与功能的理解,并探索其工程化改造用于生物技术应用 | 羧基体及其组分Rubisco和碳酸酐酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 64 | 2026-06-11 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
|
综述 | 综述了核碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用,涵盖其催化原理、三种主要工作模式及未来发展方向 | 系统总结了核碱基编辑酶在生物传感和成像中的三种应用模式(碱基转换、修饰/去修饰、碱基擦除),并强调其高特异性、高效扩增和生理兼容性 | 讨论该领域面临的挑战,包括酶工程、递送策略和多回路集成的改进需求 | 概述核碱基编辑酶作为可编程分子工具在生物传感和生物成像中的应用现状与前景 | 核碱基编辑酶,包括脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶和DNA糖基化酶 | 数字病理学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器, 分子回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 65 | 2026-06-11 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
|
综述 | 该文章综述了超声响应工程细菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制和应用 | 聚焦超声与工程细菌结合用于肿瘤治疗,提供更智能精准的疗法 | 未详细讨论临床应用中的安全性和有效性验证问题 | 总结工程细菌在肿瘤治疗中的改造方法、作用机制及应用策略,阐述超声与工程细菌结合的形式和交互机制 | 工程细菌和超声技术 | 微生物治疗 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 工程细菌 | 超声响应调控回路 | 医学, 生物医学 |
| 66 | 2026-06-11 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
|
综述 | 文章综合了PANoptosis分子架构的最新进展,并提出了将细胞死亡机制与临床转化相结合的药物发现框架 | 提出了临床极性与时间模型,区分了诱导或抑制PANoptosis的不同疾病情境,并探索了从共价GSDMD拮抗剂到合成生物学方法的药物发现前沿 | 未明确说明 | 将PANoptosis作为治疗靶点和辅助框架,通过选择性调控改善感染、炎症、肿瘤和神经退行性疾病的治疗 | PANoptosis相关的细胞死亡机制、药物干预策略及生物标志物 | 机器学习 | 感染性疾病、炎症性疾病、肿瘤、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 67 | 2026-06-11 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
|
综述 | 综述真菌聚酮合酶在异源表达和工程化改造中的关键方面,包括宿主选择和工程策略 | 系统总结了真菌PKS工程化的两个关键设计原则(宿主选择和工程策略),并展望了结合计算工具的未来方向 | 未详细讨论具体实验数据和定量比较不同工程策略的优劣 | 总结真菌聚酮合酶工程化的当前进展和未来方向 | 真菌聚酮合酶(PKS)及其异源表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 68 | 2026-06-11 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
|
综述 | 综述了利用代谢工程和合成生物学策略实现己二酸微生物合成的现状与未来方向 | 综述了己二酸生物合成的代谢工程和合成生物学策略,包括先进的代谢工程工具和途径设计,以克服原料利用率低、菌株转化效率低、发酵过程复杂、下游分离成本高等挑战 | 产业化可行的己二酸生物合成技术仍受限于原料利用率、转化效率、发酵工艺和分离成本等问题 | 综述己二酸微生物合成的研究现状,为商业化可用的生物基己二酸生产提供研究方向和指导 | 己二酸生物合成途径、代谢工程策略、细胞工厂构建、发酵工艺和下游分离技术 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 代谢工程工具 | 微生物 | 己二酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 69 | 2026-06-11 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
|
研究论文 | 通过重新定位前体肽中的前导序列,研究graspetide生物合成中的底物选择性修饰和嵌合RiPP产物的生成 | 将graspetide前体肽的N端前导序列重新定位至C端,并证明修饰酶ThfB仍能保留底物选择性,同时利用双前导序列(N端和C端)生成同时受lasso肽和graspetide家族酶修饰的嵌合RiPP产物,扩展了RiPP的结构多样性 | 重新定位前导序列后,酶促修饰速率降低约2倍,可能影响整体效率 | 探索前导序列重新定位对RiPP生物合成中酶修饰的影响,并生成具有新翻译后修饰的机械互锁肽产物 | fuscimiditide前体肽及其修饰酶ThfB | 合成生物学 | NA | RiPP生物合成、前导序列重新定位、嵌合酶修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | 双前导序列引导的嵌合RiPP生物合成通路 | 合成生物学、生物技术 |
| 70 | 2026-06-11 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
|
综述 | 综述了产ATP人工细胞的仿生构建策略及其在合成生物学等领域的应用进展 | 系统整合了三种构建策略(膜蛋白重建、完整细胞器封装和非经典系统),并评估其在仿生应用中的催化效率和分子封存能力 | 未详细讨论各策略的长期稳定性、成本效益及体内应用面临的挑战 | 推进人工细胞从基础研究向实际应用转化 | 产ATP人工细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成回路,包含质子泵和ATP酶,或通过封装完整线粒体、类囊体或构建精氨酸降解途径 | 合成生物学, 药物递送, 再生医学, 生物混合能量转换装置 |
| 71 | 2026-06-11 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
|
综述 | 全面分析鸟氨酸脂质及其他酰氧基酰基氨基脂质的最新研究进展,包括其合成途径、功能修饰及在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析编码鸟氨酸脂质合成酶的基因在细菌中的分类分布,并总结了新型OL合成酶、修饰酶及其结构的发现,以及真核生物对OL等氨基脂质的感知机制 | 未提供具体实验数据验证预测的基因分布,部分机制如OL与TLR4相互作用的详细分子机制尚不明确 | 综述鸟氨酸脂质及其类似物在细菌中的合成、功能、修饰及在合成生物学中的应用前景 | 鸟氨酸脂质及其类似酰氧基酰基氨基脂质 | 分子生物学 | NA | 基因序列分析, 生物信息学 | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 72 | 2026-06-11 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
|
研究论文 | 通过多维确定性筛选设计,优化低成本的细胞无细胞基因表达试剂配方,实现高产且可重复的蛋白质生产 | 首次采用多维确定性筛选设计从1231种配方中优选出仅含12种成分的简化试剂配方,大幅降低成本并提高产量,同时验证了配方在不同条件下的稳健性 | 未明确说明,但可能包括对特定蛋白质类型的适用性限制或大规模生产时的稳定性挑战 | 优化细胞无细胞基因表达系统的试剂配方,降低成本和复杂性,提高可重复性和产量 | 细胞无细胞基因表达系统中的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 细胞无细胞基因表达 | NA | 配方组成数据及蛋白产量数据 | 1,231种不同试剂配方,以及超过20种不同蛋白质的合成测试 | NA | 大肠杆菌细胞裂解液 | 无细胞基因表达系统(用于蛋白质合成) | 生物技术,合成生物学,蛋白质生产 |
| 73 | 2026-06-11 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
|
综述 | 该文章综述了通过工程化酵母可持续生产色氨酸衍生芳香族化合物的最新进展 | 系统总结了利用酵母细胞工厂生产色氨酸衍生物的最新策略与合成生物学工具 | 讨论了实现高效、可扩展和经济可行的酵母生物合成所面临的挑战 | 推动酵母在可持续生物生产中替代传统化学合成以应对气候变化和资源枯竭 | 酵母细胞工厂和色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 酵母 | 色氨酸代谢通路 | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药工业 |
| 74 | 2026-06-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
|
研究论文 | 表征具有末端冗余基因组的噬菌体AbpL及其对耐药鲍曼不动杆菌感染的治疗潜力 | 首次分离并全面表征了具有400 bp末端冗余的噬菌体AbpL,评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌的体内外疗效,并作为合成生物学工程候选平台 | 主要依赖小鼠模型,未涉及人体临床试验或长期安全性评估 | 评估噬菌体AbpL作为替代抗生素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌感染的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)和噬菌体AbpL | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 实验数据(形态、生长特性、基因组、治疗结果) | 52%的临床MDR-AB分离株和40只小鼠(脓毒症模型) | NA | NA | NA | 医学 |
| 75 | 2026-06-10 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
|
综述 | 综述了人工智能驱动的多组学与表型组学整合闭环框架,用于系统性的抗逆作物工程 | 提出从边缘到云的闭环框架,融合多组学、实时表型组学和合成生物学,利用Transformer和图神经网络解码基因型-环境-管理互作的非线性动力学,并从被动预测转向主动设计,通过生成式AI加速设计-构建-测试-学习循环 | 未明确讨论具体实施中的计算资源需求、数据整合标准缺失以及实地验证的潜在挑战 | 系统性地将作物改良转变为可预测的工程学科,以应对气候变化下的粮食安全挑战 | 作物基因型、表型及环境互作系统 | 机器学习 | NA | NA | Transformer架构、图神经网络、生成式AI、基础模型 | 多组学数据、表型组学数据 | NA | 合成生物学、基因电路设计 | 作物 | 抗逆蛋白和基因电路 | 农业 |
| 76 | 2026-06-10 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 综述巨噬细胞通过表型转换重塑细胞外基质结构及其作为治疗靶点的潜力 | 系统整合了巨噬细胞发育起源、组织特异性表型异质性及其在细胞外基质重塑中的作用,并提出了基于合成生物学和AI辅助生物材料的智能治疗策略 | 在实现时空精确调控和平衡修复与纤维化结局方面仍存在挑战 | 探讨巨噬细胞通过表型转换在组织稳态维持中的作用机制及治疗潜力 | 巨噬细胞及其在组织稳态、细胞外基质重塑、免疫监视中的作用 | 机器学, 合成生物学 | 纤维化疾病, 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 巨噬细胞 | 智能治疗回路 | 医学 |
| 77 | 2026-06-10 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
|
综述 | 系统综述了黄曲霉的次生代谢组多样性及其在食品安全威胁与生物技术资源中的双重角色 | 将黄曲霉重新定义为兼具生物安全风险与可开发化学多样性储库的双重用途生物,并整合基因组挖掘与合成生物学策略揭示其隐蔽代谢途径 | 未详细讨论黄曲霉毒素替代检测方法的发展现状 | 整合黄曲霉次生代谢物多样性与调控机制的知识,探索其在生物技术中的应用潜力 | 黄曲霉(Aspergillus flavus)及其次生代谢物(如黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、震颤素等) | 机器学习的其他应用 | 肝癌 | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇(BGCs)激活 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 78 | 2026-06-10 |
Microalgae-Based Semiartificial Photosynthesis: Strategies, Applications, and Future Prospects
2026-Jun-09, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c01166
PMID:42203637
|
综述 | 综述微藻基半人工光合作用系统的策略、应用与未来前景 | 通过将活体藻细胞与工程化非生物组件结合,无需体外重建光合作用,系统性地优化光子利用、电子传递、二氧化碳浓度和环境鲁棒性 | 生物-非生物界面的能量耦合、缺乏标准化性能指标、长期稳定性不足以及纳米材料的可持续性问题 | 探讨微藻基半人工光合系统在太阳能燃料生产、生物制造、环境修复和生物混合微机器人等领域的应用及未来发展方向 | 微藻光合作用与半人工光合系统 | 数字生物学 | NA | 半人工光合作用 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 79 | 2026-06-10 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
|
综述 | 综述转录因子作为第三代核心传感元件在开发低成本、现场快速检测食品污染物技术中的应用 | 提出邻近诱变策略和人工智能辅助分析相结合的方法,优化转录因子及其DNA结合位点 | 没有明确指出具体局限性 | 探索转录因子在食品安全监测中的传感应用 | 转录因子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 生物传感器 | 食品安全 |
| 80 | 2026-06-10 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-09, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
|
综述 | 综述了利用小分子工程化蛋白质稳定性的ecDHFR不稳定结构域系统 | 系统总结了ecDHFR-DD系统在多种生物体中的机制、性能优化及与DNA/RNA调控方法的比较,并探讨了其在害虫和媒介管理中的新应用 | NA | 全面梳理ecDHFR-DD系统的机制、性能和优化方法,评估其优缺点,并展望应用前景 | ecDHFR不稳定结构域系统在不同生物体(酵母、无脊椎动物模型、哺乳动物细胞)中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母, 无脊椎动物, 哺乳动物细胞 | 蛋白质稳定性条件控制系统 | 功能基因组学, 合成生物学, 生物医学研究, 害虫管理 |