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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
|
综述 | 本文综述了活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜力与应用 | 整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学,提出活体生物治疗剂作为下一代癌症治疗策略的创新方向 | 安全性、生产制造、监管和个性化方面仍存在挑战 | 探讨活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜在应用及未来发展方向 | 天然和工程化活体生物治疗剂(细菌和病毒) | 合成生物学 | 癌症(结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌等) | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 102 | 2026-06-09 |
Leveraging the bacteria for enhanced cancer immunotherapy: from a perspective of synthetic biology
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2683171
PMID:42240055
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review | 综述了合成生物学在细菌介导的癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍工程细菌如何激活免疫系统及实现肿瘤靶向的策略 | 系统总结了利用合成生物学改造细菌以表达免疫治疗剂、增强肿瘤靶向性及直接递送治疗载荷的创新策略,并探讨了缺氧响应启动子、细菌群集运动和细胞外囊泡等前沿技术 | 未提及该领域的未来挑战或当前研究的局限性 | 回顾合成生物学在细菌癌症免疫治疗中的研究进展,聚焦免疫激活机制与工程策略 | 工程化细菌作为癌症免疫治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 表达免疫治疗剂的合成回路、缺氧响应启动子、细菌群集运动工程 | 医学 |
| 103 | 2026-06-09 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
|
review | 综述细菌接合在合成生物学中的应用,包括基因回路传递、代谢工程、微生物底盘识别和生物修复等 | 系统阐述了接合机制在合成生物学中的重新利用,以及结合多种合成生物学策略扩展研究空间的新方法 | 未讨论接合传递的效率限制及潜在的生物安全问题 | 总结细菌接合在合成生物学中的最新进展,并为研究人员提供利用接合传递的实用指南 | 细菌接合系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | 接合系统 | 多种微生物(供体菌和靶标菌) | 遗传回路、代谢通路 | 生物技术, 环境修复, 微生物工程 |
| 104 | 2026-06-09 |
Random mutagenesis platform for accelerated genome evolution (RAMPAGE) of Pichia pastoris
2026-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100269
PMID:42256413
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研究论文 | 开发了一种用于毕赤酵母的随机诱变加速基因组进化平台RAMPAGE | 首次建立适用于毕赤酵母的连续全基因组进化平台,实现高效表型进化并揭示耐受性相关基因 | NA | 开发加速毕赤酵母基因组进化的随机诱变平台,提升其在极端工业条件下的适应性 | 毕赤酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 全基因组重测序 | NA | 基因组序列 | 经进化筛选的毕赤酵母菌株 | 随机诱变 | 毕赤酵母 | 连续基因组进化系统 | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-06-09 |
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10316-8
PMID:42257753
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综述 | 该综述整合了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的机制、多组学和酶工程研究进展 | 通过分析宿主与肠道微生物的协同作用,提出了昆虫幼虫中塑料降解的多步骤模型,并总结了酶工程与合成生物学策略的潜在应用 | 多组学数据主要提供相关性证据,特定酶功能的直接实验验证仍然有限 | 理解昆虫-微生物组系统中塑料降解的复杂机制,并指导酶基可持续塑料废物管理策略的开发 | 昆虫幼虫(如蜡螟)及其肠道微生物组 | 环境科学、合成生物学 | NA | 多组学(宏基因组学、宏转录组学、代谢组学)、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | 昆虫幼虫(蜡螟科等) | 多步降解通路(包括机械破碎、氧化修饰、微生物解聚和中间代谢处理) | 环境、工业生物技术 |
| 106 | 2026-06-09 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Jun-06, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
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综述 | 系统综述了代谢工程和合成生物学策略在神经活性后生元微生物合成中的最新进展,涵盖途径优化、调控元件调谐和辅因子平衡等方法 | 首次整合技术就绪水平评估神经活性后生元生产系统的转化和工业潜力,并强调利用可持续富含蛋白质原料和农工副产品作为经济前体来源 | 工业规模生产率仍受限于低微生物生产力、途径瓶颈和过程不稳定性 | 评估和促进神经活性后生元在功能食品、营养保健品和神经治疗学中的应用发展 | 神经活性后生元(如GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺和吲哚衍生物)的微生物生产系统 | 代谢工程 | 神经疾病 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 医学, 工业生物技术 |
| 107 | 2026-06-09 |
Insights into the Fucoidan and Mannitol Biosynthetic Pathways in the Brown Seaweed Padina Tetrastromatica Based on Draft Genome and Transcriptome Analysis
2026-Jun-04, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10649-8
PMID:42240916
|
研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析揭示了褐藻Padina tetrastromatica中岩藻多糖和甘露醇生物合成途径 | 首次对P. tetrastromatica进行互补基因组和转录组组装,鉴定了参与岩藻多糖和甘露醇生物合成的关键酶编码基因,为褐藻功能性糖类代谢提供了分子框架 | 基因组覆盖度不足20%,限制了完整基因组的获取 | 阐明褐藻中岩藻多糖和甘露醇的生物合成分子机制,为未来代谢工程和合成生物学应用奠定基础 | 褐藻Padina tetrastromatica | 生物信息学 | NA | NGS, 转录组测序, 基因组组装 | NA | 基因组序列, 转录本序列 | 单个褐藻样本(Padina tetrastromatica) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 108 | 2026-06-09 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Jun, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
|
综述 | 探讨生物刺激素与组学驱动创新在提升植物非生物胁迫适应性中的作用 | 整合生物刺激素技术、小RNA、肽和激素作为新兴分子调节因子,以及AI驱动的早期预警系统,为合理设计生物刺激素提供路线图 | 未明确讨论生物刺激素在实际应用中的规模化挑战或潜在生态影响 | 阐明生物刺激素增强植物非生物胁迫耐受性的机制,并构建气候适应性农业的路线图 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等胁迫的响应 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物刺激素代谢途径设计 | 农业 |
| 109 | 2026-06-09 |
A yeast-based platform for etoposide production via yatein bioconversion
2026-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2026.e00280
PMID:42255528
|
研究论文 | 建立基于酵母的依托泊苷生产平台,通过亚铁素生物转化实现可持续生产 | 首次在酵母中重构完整的亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源途径,结合途径重构、基因拷贝数优化和辅酶匹配性改造,并成功将生物生产与下游半合成转化衔接 | 依赖植物资源提供前体亚铁素,且酵母生产效率和规模化仍需进一步优化 | 开发依托泊苷中间体的可持续生物制造路径,替代传统植物提取方法 | 酿酒酵母细胞工厂、鬼臼类植物中的亚铁素前体 | 合成生物学 | 固体肿瘤、血液恶性肿瘤 | 途径重构、基因拷贝数优化、辅酶匹配性改造、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源代谢途径 | 医药 |
| 110 | 2026-06-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
|
研究论文 | 开发一种温度响应的弹性蛋白原细胞模型,展示蛋白质凝聚驱动的主动力生成及力学放大机制 | 首次证明蛋白质凝聚物可以独立于ATP驱动马达产生主动力,并通过交联弹性蛋白膜放大皮牛级力量以实现大规模机械工作 | 未明确讨论模型在生物体内环境中的稳定性和长期应用潜力 | 探索蛋白质液-液相分离凝聚物作为主动力发生器的力学协调与缩放机制 | 温度响应的弹性蛋白原细胞模型中的蛋白质凝聚动力学 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离、弹性蛋白交联 | 数学模型 | 实验数据与模拟数据 | NA | NA | NA | 温度调控收缩性与力捕获的蛋白质凝聚回路 | 合成生物学、生物材料、下一代软体机器人 |
| 111 | 2026-06-09 |
Application of Biotechnology in Marine-Derived Fermented Foods: Technological Evolution and Future Prospects
2026-03, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70422
PMID:41693674
|
综述 | 综述现代生物技术在海洋源发酵食品中的应用,包括技术演进和未来展望 | 系统总结了微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术和智能发酵控制等现代生物技术在海洋发酵食品中的研究轨迹和应用进展,并比较了新型生物技术与传统发酵技术的差异 | 讨论了生物技术在海洋源发酵食品中应用的挑战和局限性 | 评估现代生物技术在海洋源发酵食品风味和品质精准调控、营养价值定向提升及安全性改善方面的关键作用 | 海洋源发酵食品(包括鱼类、甲壳类、贝类和大型藻类等海洋生物资源) | 机器学习 | NA | 微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术、智能发酵控制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 鱼类、甲壳类、贝类、大型藻类 | 代谢通路、生物传感器 | 食品、工业生物技术 |
| 112 | 2026-06-09 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
|
research paper | 开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的机器学习优化长单链DNA合成技术,实现了高纯度、均一性长ssDNA的高效生产,并应用于活细胞中的精准诊疗整合 | 通过机器学习指导参数优化,识别镁离子动态和热调节是酶效率的关键决定因素,并结合固相合成与自动化磁珠纯化系统,实现了高达15,000 nt长ssDNA的合成,产量提升4.73倍 | 固相合成的硫醇-金固定模板纯化回收率为86.38%,仍有提升空间;实验仅在宫颈癌细胞中验证,需在更广泛的生物系统中测试 | 克服当前长单链DNA合成技术在纯度和均一性方面的关键限制,推动DNA纳米技术从概念验证向标准化生物制造发展 | 长单链DNA合成技术及其在活细胞中的诊断治疗整合应用 | 合成生物学、纳米医学、分子数据存储 | 宫颈癌 | NEAR平台、phi29 DNA聚合酶、Nb.BbvCI切口酶、机器学习、固体合成、CRISPR | 机器学习优化模型 | NA | 宫颈癌细胞 | CRISPR-Cas9 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物,用于核仁靶向基因组编辑,结合GFP诊断与E7癌基因破坏 | 医学 |
| 113 | 2026-06-08 |
Recent advances and challenges in the biomanufacturing of L-homoserine as a versatile C4 platform chemical
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108880
PMID:41921584
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综述 | 综述L-高丝氨酸作为通用C4平台化学品在生物制造中的最新进展与挑战 | 系统整合了L-高丝氨酸细胞工厂的代谢工程策略,并总结了其高价值衍生物的生物合成途径,强调L-高丝氨酸多功能化平台的应用潜力 | 目前缺乏涵盖整合代谢工程策略的系统性综述 | 总结构建高效L-高丝氨酸细胞工厂的进展,讨论技术障碍与新兴机遇,为开发稳健的微生物制造平台提供战略路线图 | L-高丝氨酸及其下游衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | L-高丝氨酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-06-08 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
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综述 | 系统梳理了基于GPCR的酵母生物传感器从模块化工程到实际应用的研究进展 | 通过模块化框架分析传感、转导和输出核心模块的工程策略,并强调人工智能与合成生物学整合的未来方向 | 未明确讨论当前传感器在复杂环境中的稳定性和可重复性限制 | 总结GPCR酵母生物传感器的工程优化方法及应用扩展 | 基于GPCR的酵母生物传感器 | 合成生物学 | 不适用 | GPCR信号转导 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酿酒酵母 | 模块化传感器电路(传感模块-GPCRs、转导模块-酵母信号网络、输出模块-报告系统) | 医学、环境、农业、工业生物技术 |
| 115 | 2026-06-08 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
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综述 | 全面评述非食物原料的生物转化,涵盖原料特性、转化路径、废物升级及技术经济评估 | 系统梳理非食物原料特性与生物转化途径间的机制联系,并整合合成生物学和多组学驱动的前沿转化技术与废物升级策略 | 未详细讨论不同转化路线在工业放大中的具体工程障碍 | 阐明非食物原料生物转化的挑战与进展,为可持续生物炼制提供战略指导 | 非食物原料(如木质纤维素、有机废弃物等)及其生物转化系统 | 工业生物技术 | NA | 厌氧消化、堆肥、合成生物学驱动发酵、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 代谢途径工程、逻辑门、生物传感器 | 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 116 | 2026-06-08 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Jun-06, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
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综述 | 探讨利用自然界中其他生物操控植物代谢和发展的机制,为植物合成生物学提供新型工程策略 | 超越传统基因工程,从细菌、真菌和昆虫等生物操控植物代谢的自然机制中获取灵感,拓展植物工程的边界 | 未提及具体实验验证或技术局限性 | 通过研究自然界中生物操控植物的机制,为新型植物代谢工程方法提供思路 | 植物代谢系统及自然界的操控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 代谢通路操控 | 农业, 工业生物技术 |
| 117 | 2026-06-08 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jun-06, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 本文综述了人体微生物组作为新型生物活性天然产物来源的研究进展,涵盖其结构、生物活性及生物合成见解 | 系统总结了人体微生物组在不同解剖部位产生的天然产物多样性及其与宿主共进化关系,并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学方法,加速了生物合成基因簇和代谢物的发现 | 未明确提及具体研究限制,但综述性质决定了可能缺乏对特定代谢物深入的实验验证 | 概述人体微生物组来源的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性,并讨论其药物开发与人类健康的应用潜力 | 人体微生物组(包括肠道、口腔、皮肤、阴道等部位的微生物)及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 单细胞基因组学, 合成生物学, 整合组学 | NA | NA | NA | NA | 人体微生物组(肠道、口腔、皮肤、阴道等) | NA | 医学, 药物开发 |
| 118 | 2026-06-08 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
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研究论文 | 描述了一种基于合成Notch的受体(SNIPR),能检测PD-L1并触发巨噬细胞的可编程吞噬程序 | 将PD-L1从治疗终点靶点重新定义为可编程输入信号,实现了配体响应式巨噬细胞行为控制 | 目前仅在体外验证了THP-1来源巨噬细胞对SKOV-3卵巢癌细胞的吞噬增强效应 | 设计合成受体实现巨噬细胞对免疫调节配体的感知和条件性激活 | PD-L1配体及THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成Notch受体工程 | NA | NA | 体外细胞实验,涉及SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1巨噬细胞 | 合成生物学受体工程 | 人类细胞(THP-1单核细胞) | PD-L1感应合成Notch受体(SNIPR)电路,调控荧光报告基因或CV1-Fc效应器表达 | 医学 |
| 119 | 2026-06-08 |
A deep learning multi-attention Bi-GRU framework for kcat prediction with segmentation-based insights
2026-Jun-01, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110915
PMID:42250496
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习多注意力机制的双向门控循环单元框架KcatNeuroCortex,用于预测酶的催化效率kcat值 | 通过分割策略捕捉局部功能基序,并结合多注意力机制整合长程相互作用,实现可解释性和预测精度的提升,相比DLKcat将R²提高57% | 未明确提及模型的泛化能力验证或对极端序列条件的测试 | 开发可解释且准确的酶催化效率预测工具,支持代谢工程和合成生物学研究 | 酶的催化效率预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 双向门控循环单元(Bi-GRU)结合多注意力机制 | 酶序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 代谢工程, 合成生物学 |
| 120 | 2026-06-08 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-Apr-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法,用于从实验通量数据中推断细胞目标 | 首次结合凸通量平衡分析模块与误差最小化模块,通过隐式微分反向传播优化目标系数,实现细胞目标的直接推断 | 细胞目标存在显著的非可辨识性,预测精度更依赖于网络约束而非目标特异性 | 解决哺乳动物代谢模型因缺乏细胞内通量测量而难以指定优化目标的问题 | 中国仓鼠卵巢细胞系的生产者和非生产者细胞系及不同生长阶段 | 机器学习 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 多个中国仓鼠卵巢细胞系样本,涵盖不同细胞类型和生长阶段 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学、工业生物技术 |