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当前共找到 5142 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-10 |
The impact of fertilization on the health of paddy soil: pathways and prospects for fertility regulation based on microbial communities
2026-Jun-09, Crop health
DOI:10.1007/s44297-026-00078-3
PMID:42262665
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综述 | 本文综述了施肥对水稻土健康的影响，并从微生物群落角度探讨了培育肥力的途径与前景 | 揭示了水稻土厌氧环境下有机质周转缓慢及土壤有机碳稳定的独特机制，并提出了基于合成生物学、材料工程和数据驱动智能决策系统的未来研究方向 | 缺乏对施肥阈值与微生物群落动态关系的定量分析，且未涵盖不同水稻种植系统的实证数据 | 探讨施肥对水稻土肥力和微生物群落的影响，以及通过微生物介导的碳固存机制实现智能绿色高产水稻种植的途径 | 水稻土中的微生物群落及土壤有机碳动态 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学， 材料工程， 智能决策系统 | 水稻 | NA | 农业， 环境 |
| 82 | 2026-06-10 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-Jun-08, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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综述 | 综述微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解，提出解决塑料污染问题的框架 | 整合微生物分类学、酶学解聚与多组学功能分析，提出连接微生物特性与塑料降解四阶段的系统框架，并讨论生物强化策略与转化瓶颈 | 降解度量指标的变异性和可比性不足，实验室结果向实际应用的转化受限 | 弥合实验室发现与实用生物降解策略之间的差距，推动微生物塑料修复研究 | 塑料降解微生物及其降解机制 | 微生物学、环境科学 | NA | 多组学分析、酶工程、基因修饰 | NA | 综述数据 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程, 合成微生物群落设计 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 83 | 2026-06-10 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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research paper | 提出Nullsettes评估框架，测试基因组语言模型（gLMs）对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力，发现模型依赖进化模式匹配而非机制理解 | 首创Nullsettes框架，通过进化上不可信的合成序列评估gLMs对DNA功能的理解，揭示模型在工程遗传构建体泛化能力上的根本局限 | 仅测试特定合成表达盒，未涵盖更广泛的基因组功能区域；未探究增强模型功能理解的改进策略 | 评估基因组语言模型是否真正理解DNA序列功能 | 合成表达盒中功能丧失突变序列 | natural language processing | NA | 基因组语言模型 | Transformer-based语言模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | 合成表达盒 | synthetic biology, medicine |
| 84 | 2026-06-10 |
Chassis Selection and Metabolic Fine-Tuning Enable Efficient in planta Betalain Production
2026-Jun-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag337
PMID:42261105
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研究论文 | 通过底盘选择和代谢微调，在三种植物中高效生产甜菜红碱色素 | 首次系统比较拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘用于甜菜红碱生产，并设计推拉策略优化代谢平衡，发现大豆对工程化路径耐受性更强 | 强启动子驱动的推拉设计在拟南芥和烟草中导致矮化，影响植物生长 | 优化植物底盘选择和代谢调控，实现甜菜红碱高效生产而不损害植物生长 | 拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢数据 | 三种植物（拟南芥、烟草和大豆）的多个转基因株系 | NA | 拟南芥, 烟草, 大豆 | 推拉代谢路径（含DODA酶推和酪氨酸前体供应拉） | 食品工业, 农业 |
| 85 | 2026-06-10 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-Jun-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
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研究论文 | 提出一种基于DNA环形支架的模块化组装策略，利用DNA纳米管砖块构建高阶纳米结构 | 首次将DNA环形支架与短DNA基序结合，实现具有高稳定性和可编程性的模块化组装，组装效率超过99%，并成功构建布尔逻辑门电路 | 高阶结构模块化潜力尚未完全实现，现有DNA组装策略的模块化能力有限 | 开发一种整合DNA砖块和DNA折纸优点的组装策略，克服高阶结构制造限制 | DNA纳米管砖块及其环形支架结构 | 纳米技术 | NA | DNA纳米管组装、DNA折纸 | NA | NA | NA | DNA环形支架、分支连接基序 | NA | 布尔逻辑门和逻辑电路 | 医药 |
| 86 | 2026-06-10 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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研究论文 | 该论文报道了通过共同递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸（dsNHO），在莱茵衣藻中提高基因敲除效率高达100倍的现象，并探讨其机制 | 首次发现非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，能显著提升CRISPR/Cas介导的基因敲除效率，并揭示其通过KU70/80异二聚体介导、改变DNA修复途径从经典非同源末端连接向微同源介导末端连接转变的机制 | 研究主要局限于莱茵衣藻模型，dsNHO的长度、结构和化学修饰对增强效果有显著影响，其在不同物种中的普适性尚需进一步验证 | 提高CRISPR/Cas介导的基因敲除效率，以促进莱茵衣藻在合成生物学中的通路工程和功能基因组学研究 | 莱茵衣藻细胞及其CRISPR/Cas基因敲除过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑, 寡脱氧核苷酸递送 | NA | 基因敲除效率数据, DNA修复通路分析数据 | 涉及莱茵衣藻多个基因位点和细胞株系的实验样本 | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 农业 |
| 87 | 2026-06-10 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-May-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 该综述总结了二萜类化合物的生物活性与应用，构建了二萜合酶功能数据库，并探讨了其在合成生物学和代谢工程中的应用前景 | 首次系统整合562个功能表征的二萜合酶并建立综合功能数据库，通过整合生物信息学分析阐明不同功能类别的二萜合酶的催化机制、产物多样性和系统发育分布 | 未提及具体局限性 | 总结二萜合酶在二萜类化合物生物合成中的门控作用，为合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供资源 | 二萜合酶和代表性二萜类化合物 | 合成生物学 | 不适用 | 生物信息学分析 | 不适用 | 数据库 | 562个功能表征的二萜合酶 | 合成生物学、代谢工程 | 微生物细胞工厂（如大肠杆菌、酿酒酵母） | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品工业 |
| 88 | 2026-06-10 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 探讨工程改造细菌作为活体传感器直接检测肿瘤DNA的最新进展 | 利用自然感受态和水平基因转移结合CRISPR-Cas工具，使工程菌能区分肿瘤与野生型DNA并产生可观测的报道输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度限制等问题 | 开发用于临床癌症诊断的工程细菌生物传感器及其与治疗递送系统的整合 | 肿瘤DNA、KRAS突变、工程改造细菌（多种细菌物种）、结直肠癌和胃肠癌等实体肿瘤 | 合成生物学 | 癌症（结直肠癌、胃肠癌等） | CRISPR-Cas系统、同源重组、多重CRISPR系统、安全回路 | NA | DNA序列 | 包括体外检测、类器官模型、小鼠模型和非侵入性粪便样本 | CRISPR-Cas9, TALEN | 多种细菌物种（如大肠杆菌等） | 遗传回路、逻辑门、生物传感器、安全回路 | 医学 |
| 89 | 2026-06-10 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
|
综述 | 从系统层面对植物免疫网络进行整合性概述，涵盖受体激活、基因调控回路、蛋白互作中心和染色质动力学如何共同影响免疫结果 | 整合了单细胞和空间组学揭示的免疫激活异质性，并讨论了系统和合成生物学方法在作物持久广谱抗病工程中的应用前景 | 未提及具体的实验验证或技术局限性 | 综合理解植物免疫网络中的受体激活、基因调控、蛋白互作和染色质动力学如何影响免疫结果 | 植物免疫网络中的传感器NLR、帮助者NLR、PRIMER细胞、旁观者细胞等 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞组学、空间组学、蛋白质组学、互作组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组、染色质数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 90 | 2026-06-10 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
|
综述 | 探讨超级增强子在植物基因簇转录调控中的核心作用 | 揭示了超级增强子通过拓扑关联域协调同源基因簇和生物合成基因簇中基因共表达的机制，并指出其可通过染色质可及性数据预测 | 主要基于拟南芥研究，对其他植物物种的普遍性仍需验证 | 阐明植物中超级增强子调控基因簇共表达的机制及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 植物同源基因簇和生物合成基因簇中的基因表达调控 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas, T-DNA插入, 染色质可及性测序 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9, T-DNA插入 | 拟南芥 | 超级增强子调控的基因簇共表达回路 | 合成生物学, 代谢工程, 作物改良 |
| 91 | 2026-06-10 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917通过消耗支链氨基酸抑制结直肠肿瘤发生 | 利用合成生物学方法工程化益生菌，通过靶向支链氨基酸分解代谢来抑制结直肠癌进展，提供了一种新的癌症治疗策略 | 研究仅在AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型和氨基酸饮食条件下进行，缺乏在人体中的验证 | 探究工程化益生菌通过消耗肠道支链氨基酸抑制结直肠癌的作用机制 | 工程化的大肠杆菌Nissle 1917菌株（ECN-Deg和ECN-Tra）以及AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | 使用AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型，具体样本数量未提及 | NA | 大肠杆菌 Nissle 1917 | 支链氨基酸分解代谢通路 | 医学 |
| 92 | 2026-06-10 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 系统总结了利用绿色生物合成方法生产萜类来源的香精香料化合物的最新进展与战略前景 | 聚焦低成本底物和微生物细胞工厂的宿主选择，并系统论述酶改造、动态途径调控、细胞区室化和提高萜类耐受性等关键工程策略 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导方针 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物（多种宿主菌株） | 微生物细胞工厂中的萜类生物合成途径 | 食品,日化用品 |
| 93 | 2026-06-10 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 开发了一套名为BOTany Methods的自动化方法，利用Opentrons OT-2机器人简化植物合成生物学中的分子生物学流程 | 提供基于表格输入的模块化协议，用户无需编程经验即可运行复杂实验，实现从引物稀释到质粒提取的端到端自动化 | 依赖特定硬件Opentrons OT-2机器人，可能不适用于所有实验室；协议验证仅限于常见分子生物学方法 | 提高植物合成生物学实验中液体处理和分子克隆的自动化程度与可重复性 | 植物分子生物学实验流程，包括引物稀释、PCR设置、植物模块化克隆、细菌转化和质粒提取 | 合成生物学 | NA | PCR, 分子克隆, 细菌转化, 质粒提取 | NA | NA | NA | Opentrons OT-2机器人, 3D打印 | 大肠杆菌（用于细菌转化和质粒提取） | 植物模块化克隆（MoClo） | 农业, 生物技术 |
| 94 | 2026-06-10 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路设计方法，通过整合多个RAS传感器实现对RAS驱动癌症的选择性靶向治疗 | 首次将多个RAS传感器组合构建基因电路，实现了对突变RAS细胞前所未有的选择性输出蛋白表达，通过模块化设计和模型驱动优化提高了电路适应性和治疗潜力 | 当前电路仍局限于特定KRAS突变，且可能存在耐药性风险 | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS突变癌细胞系 | 合成生物学 | RAS驱动癌症 | 合成基因电路设计 | 电路组件建模 | NA | 多种RAS驱动癌细胞系 | 合成基因电路 | 哺乳动物细胞 | RAS传感基因电路，整合多个RAS传感器实现选择性蛋白表达 | 医学 |
| 95 | 2026-06-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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review | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，重点介绍在生物元件、电路和基因组设计中的创新应用 | 系统性地总结了生成式AI在合成生物学中从分子工具到系统架构的转变，提出了数据驱动的新型生物设计范式 | 未涉及具体实验验证或定量性能比较 | 分析生成式AI在合成生物学中的机遇与挑战，并提出发展路线图 | 生物元件、遗传电路、基因组 | 机器学学习 | NA | NA | 生成式AI模型 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | 遗传电路、基因组 | 合成生物学 |
| 96 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
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综述 | 综述了活体生物治疗产品在微生物疗法中的新兴趋势和未来方向 | 系统阐述了活体生物治疗产品从单一菌株到工程化微生物群落和天然配方的多样性发展，以及其在精准医学中的整合潜力 | 临床开发面临菌株筛选、复杂生产、活性问题及合并症患者安全性等关键挑战 | 概述当前活体生物治疗产品的种类、作用机制、临床应用及监管框架，并展望其未来方向 | 活体生物治疗产品 | NA | 代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化微生物群落 | 医学 |
| 97 | 2026-06-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
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综述 | 综述重组活体生物治疗药物的最新技术进展及其在人类健康中的应用 | 综合了合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法在重组活体生物治疗药物设计中的应用，强调了从基础研究到临床转化的创新策略 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 总结重组活体生物治疗药物的开发进展，并指出其作为下一代治疗剂的机遇与障碍 | 基因和代谢工程改造的微生物物种 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 基因工程, 多组学, 人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 98 | 2026-06-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
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综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物新来源的潜力 | 提出了将生殖道微生物组特别是阴道微生物作为下一代活体生物治疗药物候选来源的新视角 | 未提供具体实验数据或临床验证结果，仅为文献综述 | 探索人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物候选来源的应用潜力 | 人类生殖道微生物组，特别是女性阴道微生物群落 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道 | NA | 医学 |
| 99 | 2026-06-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
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综述 | 综述微生物医学在预防和治疗心血管疾病方面的最新进展，重点关注肠道微生物组的作用 | 提出微生物医学整合到心血管护理中，推动精准、整体和个性化治疗范式转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战 | 探索微生物医学在心血管疾病管理中的创新治疗干预措施及其影响 | 肠道微生物组及其代谢产物如短链脂肪酸、三甲胺N-氧化物和吲哚衍生物 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类肠道微生物组 | 肠道微生物代谢通路 | 医学 |
| 100 | 2026-06-10 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
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综述 | 本文综述了重组活体生物治疗药物及其合成生物学的最新进展和前景 | 系统性地总结了合成生物学在精准改造微生物以调控宿主-微生物组相互作用、疾病通路和免疫反应方面的关键作用 | 未提供具体的实验数据或对比分析，可能缺乏对临床转化风险的深入探讨 | 阐述重组活体生物治疗药物的原理、宿主相互作用、递送机制及应用前景 | 重组活体生物治疗药物及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 代谢性疾病、炎症性肠病、癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物遏制策略 | 医学 |