合成生物学相关文章
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当前共找到 4715 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-21 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、生物合成途径、代谢工程及微生物生产策略的研究进展与前景 | 系统总结了开链黄酮类化合物这一结构独特亚类的最新研究进展，并整合了代谢组学、结构酶学和合成生物学等多学科交叉成果 | NA | 阐明开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征，并展望其未来研究与生物技术应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、结构酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、生物技术 |
| 182 | 2026-03-21 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 本文通过重构双组分系统（TCSs），系统性地探索了响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK）作为浓度依赖性激活剂和抑制剂的功能特性，以优化基因表达调控和细菌传感性能 | 通过解耦HK表达与原生反馈回路，设计了具有可调检测阈值的超灵敏TCS传感器；利用RR作为转导器，结合单组分系统（OCS）和TCS创建了具有低检测限和高动态范围的协同传感系统（SSS）；并证明RR可作为生物低噪声放大器（LNA），显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及具体限制，但暗示TCS的可编程性先前未充分探索，可能限制了合成生物学中的广泛应用 | 探索TCS的可塑性和可编程性，以定制合成电路中的基因表达调控，并提供生物传感器优化的模块化工具包 | 双组分系统（TCSs），包括响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK），以及单组分系统（OCS） | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（如大肠杆菌） | 双组分系统传感器、协同传感系统（SSS）、生物低噪声放大器（LNA） | 工业生物技术、环境监测 |
| 183 | 2026-03-21 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 本文综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织、酶学功能和多层次调控机制，重点以恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1为例 | 整合了ped基因簇的功能与调控特征，提出了将其作为应用微生物学模块化平台的参考框架，并通过跨属比较揭示了基因簇的保守性与适应性差异 | 部分开放阅读框（如PP_2683、PP_2684、PP_2685）功能尚未明确，调控网络细节仍需进一步机制研究验证 | 阐明假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能及调控逻辑，为酒精氧化研究提供基础 | 假单胞菌属（重点为恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1）的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学 | NA | 比较基因组分析 | NA | 基因组数据与文献资料 | 假单胞菌属多个物种（以KT2440和PAO1为代表） | NA | Pseudomonas species（包括P. putida KT2440和P. aeruginosa PAO1） | 酒精氧化代谢通路（含PQQ依赖性脱氢酶、电子传递链及调控组件如YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶） | 环境微生物学, 生物修复, 生物生产, 工业生物技术 |
| 184 | 2026-03-21 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP，同时提升生物浸出效率和重金属抗性，克服了传统基因工程单次仅修饰单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率和砷耐受性，以促进可持续金属生产 | Acidithiobacillus ferrooxidans（一种模型生物浸出微生物） | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因（如S-222、S-306、S-651）调控c-di-GMP水平，以编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 185 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程，用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路，并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路，利用数学模型推断动态原理，并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路，可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择，评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路（逆变器） | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路（逆变器）、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 186 | 2026-03-21 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Mar-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 本文综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物胁迫适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控方面的见解，突出了BAHD酰基转移酶在植物适应中的核心作用及其在可持续农业和生物技术中的转化机遇 | 讨论了功能冗余、底物混杂性和生物安全性考虑相关的挑战 | 探讨BAHD酰基转移酶基因家族的进化、功能及其在植物胁迫适应和生物技术中的应用 | BAHD酰基转移酶基因家族 | NA | NA | 比较基因组分析、结构研究、生化研究、组学调查 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业、生物技术 |
| 187 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势，即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢，为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解，并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 188 | 2026-03-21 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Mar-04, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 本研究提出了一种结合机制模型与机器学习的方法，用于解决合成生物学中资源竞争导致的基因电路意外行为问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过共享损失的双神经网络架构实现机制模型与机器学习的无缝融合 | 未明确说明模型在更复杂生物系统或实际实验数据中的验证程度 | 开发能够同时保持物理一致性和数据驱动优势的混合建模方法 | 合成生物学中受资源竞争影响的基因网络模型 | 机器学习 | NA | 物理信息神经网络（PINNs） | 神经网络（ePINNs） | 模拟数据 | NA | NA | 活细胞 | 基因网络（受资源竞争影响） | 工业生物技术 |
| 189 | 2026-03-21 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统，用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌，以促进非豆科植物的生物固氮 | 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统，首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 | NA | 增强非豆科植物的生物固氮能力，减少对合成肥料的依赖 | 根瘤菌和非根瘤菌微生物 | 合成生物学 | NA | 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 | nod基因报告系统，包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 | 农业, 环境 |
| 190 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点（SynORI）质粒，实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点，实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点，以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点（SynORI），包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 191 | 2026-03-21 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 本文探讨了一种受光合作用启发的跨物种可植入ATP电池技术，旨在通过光能驱动在受损人体细胞内自主再生ATP，以治疗多种疾病 | 提出了一种模仿自然光合作用的人工光合系统，能够在细胞水平上实现光驱动的持续ATP合成，并将合成生物学、材料科学和靶向递送策略整合到一个治疗平台中 | NA | 探索跨物种可植入ATP电池在疾病治疗中的应用潜力，旨在通过恢复细胞生物能量学来治疗疾病 | 人工光合系统及其在缺氧肿瘤微环境、代谢受损组织再生和能量缺陷神经元等病理环境中的应用 | NA | 多种疾病（包括肿瘤、组织损伤、神经元疾病等） | 人工光合作用技术 | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统，包括光氧化模块（将光能转化为电化学质子梯度）、光磷酸化模块（利用梯度驱动ATP合成）和封装系统（用于空间组织、功能完整性和靶向细胞递送） | 医学 |
| 192 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶，显著提升了其催化活性和热稳定性，并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程，通过改造底物结合腔和优化相互作用，大幅提升了酶活性和热稳定性，并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性，也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略，实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体，以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 193 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2，它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰，揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶，能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构，以及多种氧化修饰，通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物，特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 194 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫（如干旱、盐分和极端温度）对种子萌发抑制的生理生化机制，并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图，旨在实现活性成分的靶向、按需释放，以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力，以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 195 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力，并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力，探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine（一种细菌来源的胞外保护化合物） | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 196 | 2026-03-20 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文是一篇关于微生物系统生态学（MSE）框架如何帮助理解微生物组中交叉喂养的迷你综述 | 提出了一个结合自上而下和自下而上方法的微生物系统生态学框架，用于解析微生物群落组装的确定性过程，特别适用于合成生物学和微生物组工程 | NA | 探讨微生物系统生态学框架在理解微生物交叉喂养和群落组装机制方面的应用 | 微生物群落及其交叉喂养相互作用 | 微生物生态学 | NA | 基因组尺度代谢网络重建、整合组学数据 | 代谢建模 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物组工程 |
| 197 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
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综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台，并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系，支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术，以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 198 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点，提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据，主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |
| 199 | 2026-03-19 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Mar-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 本文综述了基于纳米颗粒膜包覆的凝聚层体系，重点介绍了其界面组装机制、理化性质改善及在仿生应用中的潜力 | 系统归纳了纳米颗粒膜包覆凝聚层的三种主要组装驱动力（界面能驱动、静电作用主导、多机制协同），并阐明该技术如何突破无膜结构的动态不稳定性限制 | 当前纳米颗粒包覆凝聚层微滴的设计与调控仍存在局限性，如膜结构的精确动态控制与功能集成度有待提升 | 通过纳米颗粒膜包覆技术增强凝聚层的结构稳定性和功能可编程性，推动其在合成生物学和仿生材料领域的应用 | 由液-液相分离形成的凝聚层及其纳米颗粒包覆复合体系 | 合成生物学 | NA | 界面自组装技术、纳米颗粒包覆技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生功能模块（细胞代谢模拟、吞噬作用、运动性、信号转导） | 材料, 工业生物技术 |
| 200 | 2026-03-19 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 本文提出了一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计框架，用于在酿酒酵母中重编程转录网络 | 开发了首个用于启动子-转录因子结合位点重组的神经网络工具，实现了无需实验表征的高效启动子工程 | NA | 通过合成启动子设计实现真核生物转录网络的重编程 | 酿酒酵母的启动子和转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络 | ANN | 启动子序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母 | TetR和Mig1转录因子结合位点的启动子工程 | 工业生物技术 |