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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-07-26 |
Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: metabolic diversity, eco-physiology and biotechnological opportunities
2025-Jul-25, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf314
PMID:40707021
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综述 | 本文全面评估了不同微藻类群中异戊二烯类化合物的生物合成与调控,并探讨了其生理生态意义和生物技术潜力 | 系统比较了叶绿体定位的MEP途径和胞质MVA途径的差异,揭示了藻类特有的酶适应和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶 | 对异戊二烯类生态功能的认识仍存在未解决的问题 | 阐明微藻中内源性异戊二烯类生物合成及其调控网络 | 真核浮游植物(微藻)中的异戊二烯类代谢 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2025-07-26 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Jul-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法全面调查了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成,并开发了高效生产大黄素葡萄糖苷的策略 | 评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶(EUGTs),并开发了一种全细胞催化系统,实现了78.9%的高转化率 | 植物源蛋白在丝状真菌中的表达存在挑战,进一步优化受到阻碍 | 开发高效生产大黄素葡萄糖苷的策略 | 大黄素-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | 十种EUGTs |
3 | 2025-07-26 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用 | 揭示了c-di-GMP通过调控多血红素细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因表达,影响整个胞外电子传递过程 | c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚 | 探究c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌 | 微生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据 | 三种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L) |
4 | 2025-07-26 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
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研究论文 | 本文设计了一种遗传'过期日期'电路,用于控制合成细菌的寿命,以实现安全的生物修复 | 通过前馈激活网络设计可调节寿命的遗传电路,结合合成小调控RNA和基于asd的辅助营养系统优化电路,降低基因表达泄漏 | NA | 开发一种生物控制策略,安全部署合成细菌于实际应用中 | 合成酚清除大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计,合成小调控RNA | NA | NA | NA |
5 | 2025-07-26 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 该研究设计了一种名为EPDA的合成受体平台,用于实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信 | 开发了EPDA受体平台,通过肽配体二聚化实现可逆的细胞响应,并利用新型计算算法PETEI筛选最优单抗体 | 研究中仅测试了30种基于预测结合亲和力的单抗体,可能未涵盖所有潜在有效受体 | 桥接合成生物学和生物材料领域,开发能够感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体 | 哺乳动物细胞和3D生物材料 | 合成生物学 | NA | 硫醇-降冰片烯化学,PETEI计算算法 | EPDA受体平台 | 荧光信号(GFP) | 超过2000种候选单抗体,最终测试了30种 |
6 | 2025-07-26 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of Polyhydroxyalkanoates
2025-Jul-17, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
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研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和高通量筛选技术,探索海洋环境中生产聚羟基脂肪酸酯(PHA)的微生物资源 | 结合宏基因组预测和荧光定量技术,有效解决了荧光筛选中的假阳性问题,并成功分离出高效PHA生产菌株 | 研究仅针对海洋环境,未涉及其他生态系统的PHA生产者 | 开发可持续生产生物降解材料PHA的微生物资源和技术平台 | 海洋环境中的微生物群落及其PHA合成潜力 | 生物技术 | NA | 宏基因组分析、气相色谱(GC)、高通量筛选 | NA | 宏基因组数据、荧光定量数据 | 从不同海洋生境中分离出102株PHA生产菌株 |
7 | 2025-07-26 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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research paper | 探讨细菌疗法作为低成本替代方案在癌症治疗中的应用及其潜力 | 提出利用合成生物学和人工智能开发下一代细菌疗法,显著降低成本并提高安全性 | 未提及细菌疗法在临床试验中的具体效果和潜在副作用 | 解决癌症治疗中高昂费用的问题,探索低成本替代方案 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学, 人工智能 | NA | NA | NA |
8 | 2025-07-26 |
Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology
2025-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios15070434
PMID:40710084
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综述 | 本文综述了提高ELISA敏感性的策略,包括表面修饰、混合与洗涤效率提升、信号生成与放大技术的最新进展,以及合成生物学在其中的新兴作用 | 强调了无细胞合成生物学在提升ELISA敏感性中的新兴作用,介绍了如表达免疫分析、CRISPR联免分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联免传感分析(TLISA)等新技术 | NA | 提高ELISA的敏感性,以改善体外诊断(IVD)的准确性 | ELISA技术及其敏感性提升策略 | 生物技术 | NA | ELISA, 合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶 | NA | NA | NA |
9 | 2025-07-26 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
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研究论文 | 本研究鉴定了Melia azedarach L.中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶,参与三萜类化合物的生物合成 | 揭示了CYP88A亚家族酶在五环三萜和柠檬苦素类化合物生物合成中的双重功能,支持了结构保守驱动的功能趋同范式 | NA | 阐明Melia azedarach L.中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制 | Melia azedarach L.中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因 | 植物分子生物学 | NA | 转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 三个CYP88A亚家族基因(MaCYP88A108, MaCYP88A164, MaCYP88A222)和一个氧化角鲨烯环化酶(MaβAS1) |
10 | 2025-07-26 |
Core biological principles and tools stemming from basic Arabidopsis research
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf141
PMID:40479512
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综述 | 本文探讨了拟南芥在植物生物学研究中的核心作用及其对基础生物学过程的贡献 | 展示了拟南芥研究在免疫机制、基因组变异性、合成生物学和生物生产等领域的突破性进展 | 主要聚焦于拟南芥的研究,可能未涵盖其他模型生物的最新进展 | 探讨拟南芥在基础生物学研究中的贡献及其对更广泛生物领域的启示 | 拟南芥及其在免疫机制、基因组学、合成生物学等领域的应用 | 植物生物学 | 弗里德赖希共济失调 | 泛基因组学、重复扩增研究、合成生物学、生长素诱导降解技术 | NA | NA | NA |
11 | 2025-07-26 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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research paper | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,以增强其激活和扩展Vγ9Vδ2 T细胞的能力,从而提高抗结核疫苗的效果 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提高疫苗效力,利用HMBPP感知的自我-非自我识别机制 | 虽然过表达GcpE成功诱导了Vγ9Vδ2 T细胞的扩展,但通过合成MEP位点过表达多个基因并未增强效果,表明该途径可能存在反馈抑制 | 开发更有效的抗结核疫苗 | BCG疫苗和Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学方法,基因工程 | NA | 基因序列数据,细胞实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 |
12 | 2025-07-26 |
Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X2550051X
PMID:40626404
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间发表的具有潜在抗高血压活性的植物源天然产物,探讨了它们通过靶向氧化应激、炎症、血管重塑和神经激素途径来预防高血压发展的机制 | 系统分类了70种独特的天然产物,并强调了具有双重抗氧化/抗炎特性的天然产物在临床实验中的优先研究价值 | 未涉及天然产物在人体内的具体药效学及药代动力学研究 | 探讨植物源天然产物作为抗高血压药物的潜力及其作用机制 | 70种植物源天然产物(包括黄酮类、萜类、生物碱类和植物提取物) | 药理学 | 心血管疾病 | 文献综述 | NA | 文献数据 | 70种独特的天然产物 |
13 | 2025-07-26 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 该研究展示了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 开发了一种基于无细胞表达系统封装的方法,成功在合成细胞膜中重构膜蛋白 | 仅针对细菌谷氨酸受体(GluR0)进行了验证,未测试其他膜蛋白 | 开发合成细胞中膜蛋白重构的方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE),巨型单层囊泡(GUVs) | NA | NA | NA |
14 | 2025-07-26 |
Synthetic Circuit-Driven Expression of Heterologous Enzymes for Disease Detection
2021-09-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00133
PMID:34464083
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研究论文 | 本文介绍了一种结合纳米技术和合成生物学的工程生物传感器,用于放大疾病状态的检测信号 | 设计了一种AND门基因电路,响应癌症相关转录失调,表达异源酶生物标志物,并通过纳米粒子传感器放大检测信号 | 目前仅在卵巢癌小鼠模型中进行了概念验证,尚未在人类或其他疾病模型中测试 | 开发新型工程生物传感器,用于疾病检测 | 卵巢癌细胞和小鼠模型 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 基因电路设计和纳米粒子传感器技术 | AND门基因电路 | 生物分子信号 | 小鼠模型中的卵巢癌细胞 |
15 | 2025-07-26 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 本文探讨了合成生物学在病毒学领域的应用前景及其对改善人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成病毒学作为解锁全球病毒基因库和应对耐药微生物威胁的未来策略 | NA | 探讨合成病毒学在理解微生物生态系统和应对全球健康挑战中的应用 | 病毒及其在微生物生态系统中的作用 | 合成生物学 | 耐药微生物感染 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
16 | 2025-07-26 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
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research paper | 该研究探讨了语言工具,特别是隐喻,在微生物和微生物组研究中的重要性及其对科学思维的影响 | 揭示了隐喻在合成生物学和微生物组研究中对科学思维和实验设计的潜在影响 | 未具体说明研究方法或数据来源,可能缺乏实证支持 | 探讨语言工具如何塑造微生物研究的思维方式和实验设计 | 微生物和微生物组研究中的语言工具 | 自然语言处理 | NA | NA | NA | text | NA |
17 | 2025-07-26 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
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评论 | 探讨如何利用系统生物学和合成生物学等工具重新设计微生物组工程以应对未来的可持续性挑战 | 整合系统生物学、合成生物学、自动化和机器学习来加速微生物组工程 | 传统基于选择的方法无法实现对微生物组的精确操控 | 解锁微生物组在可持续性应用中的全部潜力 | 微生物组及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA |
18 | 2025-07-26 |
Metrics for regulated biochemical pathway systems
2019-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty942
PMID:30428007
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research paper | 该论文提出了适用于静态网络和动态系统的调整后指标,用于量化生化途径系统中调控的重要性 | 引入了考虑调控信号的调整后指标,弥补了传统图指标忽略调控信号的不足 | NA | 开发适用于生化途径系统分析的定量指标 | 生化途径系统 | 生物网络分析 | NA | NA | NA | 网络数据 | NA |
19 | 2025-07-26 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过基因可用性的可编程时序控制来优化生物传感器电路性能的方法 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制基因可用性,显著减少了生物传感器电路的基底泄漏并提高了动态范围 | 未提及具体的技术实施难点或适用范围限制 | 优化合成生物学中基因电路的稳健部署 | 多基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
20 | 2025-07-25 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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review | 本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势,重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用 | 讨论了新兴的蛋白酶工程策略,如抗体-蛋白酶融合实现邻近催化,以及外源蛋白-蛋白相互作用驱动的蛋白酶底物特异性转换 | NA | 探索蛋白酶工程的方法和策略,以实现对蛋白酶活性和特异性的精确控制 | 蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化, 高通量策略 | NA | NA | NA |