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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-07-21 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2025-Jul-20, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达技术在Nicotiana benthamiana中实现了复杂甾体生物碱和皂苷的多样化工程合成 | 发现了一种新的番茄糖基转移酶SlGAME2-NEW,并成功在异源宿主中重建了20种甾体终产物的生物合成途径 | 研究仅在模式植物N. benthamiana中进行验证,尚未在商业化作物中测试 | 开发合成生物学平台生产高价值甾体代谢产物 | 茄科植物甾体糖生物碱(SGAs)和甾体皂苷 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达技术 | NA | 代谢组数据 | 涉及9-15个基因组合表达 |
62 | 2025-07-21 |
De novo designed protein guiding targeted protein degradation
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62050-z
PMID:40676011
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研究论文 | 开发了一种名为GPlad的引导蛋白质标记和降解系统,用于精确降解多种蛋白质 | 使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶(McsB)实现精确蛋白质降解,无需预先融合降解标签或化学降解剂 | 目前仅在Escherichia coli中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发一种可调谐、即插即用的蛋白质降解策略,用于合成生物学和代谢工程 | 荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质等多种蛋白质 | 合成生物学 | NA | 从头蛋白质设计 | NA | 蛋白质数据 | 多种蛋白质(包括荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质) |
63 | 2025-07-21 |
Efficient, cell-type-specific production of flavonols by multiplexed CRISPR activation of a suite of metabolic enzymes
2025-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61742-w
PMID:40670339
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的CRISPR激活系统,能够在稳定细胞系中以细胞类型特异性方式驱动基因表达,并应用于植物代谢途径的重编程 | 开发了首个能够在稳定植物细胞系中实现细胞类型特异性基因激活的CRISPR系统,突破了现有技术只能实现瞬时或泛在表达的局限 | 需要依赖荧光报告基因系在细胞水平评估表达效果,可能增加实验复杂度 | 开发植物合成生物学工具以实现细胞类型特异性的多基因协同调控 | 植物根系组织(内皮层和表皮层) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因激活系统 | NA | 荧光成像数据 | 使用myb12突变体作为研究模型 |
64 | 2025-07-21 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 该研究探讨了2'-脱氧鸟苷感应mRNA元件在基因开关调控中的关键作用 | 揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录中间体阶段的调控机制,而非简单的二元开关 | 研究仅针对特定核糖开关(dGsw),可能不适用于其他类型的核糖开关 | 阐明核糖开关在基因表达调控中的分子机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关(dGsw) | 分子生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 生物化学数据 | NA |
65 | 2025-07-21 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文研究了一种酒精依赖的半萜途径在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的广泛特异性 | 揭示了ADH模块的第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了ADH模块和异戊二烯基转移酶的组合特异性足以在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | NA | 探索半萜途径在合成生物学中扩展化学空间的潜力 | 酒精依赖的半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
66 | 2025-07-21 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征,重点讨论了内共生体和宿主在进化过程中的分子变化 | 讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征,并探讨了实验室工程化内共生的研究进展 | 未提及具体的研究数据或实验结果的局限性 | 探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用 | 线粒体和叶绿体等内共生细胞器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
67 | 2025-07-21 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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research paper | 该研究通过PADDLE预测器系统性地鉴定了植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域 | 首次在全基因组范围内探索非转录因子蛋白中的激活域,并验证了这些域在转录调控中的作用 | 研究仅针对两种模式真核生物(植物和酵母),结果可能不适用于其他生物 | 系统鉴定非转录因子蛋白中的转录激活域并探索其功能 | 植物和酵母中的非转录因子蛋白 | 合成生物学 | NA | PADDLE预测器 | NA | 蛋白质序列数据 | >800个非转录因子基因的18,000个片段 |
68 | 2025-07-21 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
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综述 | 本文探讨了人工智能在检测、治疗和理解传染病中的应用及其进展 | 强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解及诊断加速中的快速进展 | 未具体说明人工智能技术在特定传染病案例中的应用限制 | 探讨人工智能如何助力控制传染病爆发和大流行 | 传染病及其防控 | 人工智能 | 传染病 | 人工智能 | NA | NA | NA |
69 | 2025-07-20 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 揭示了RNA可以序列依赖性地选择性结合脂质膜,为工程化RNA传感器和调控元件提供了新思路 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的基础化学原理及其在合成生物学和细胞调控中的应用 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
70 | 2025-07-20 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过元分析研究炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),发现与克罗恩病(CD)相关的两种梭菌衍生BGCs及其产物 | 首次鉴定了与克罗恩病相关的特定微生物小分子,并揭示了这些分子通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究结果主要基于小鼠模型,在人体中的直接作用机制仍需进一步验证 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组及其代谢产物 | 微生物组学 | 炎症性肠病(包括克罗恩病) | 元分析、合成生物学、质谱分析 | NA | 宏基因组数据、代谢组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
71 | 2025-07-20 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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research paper | 该研究开发了一种名为hDIRECT的平台,利用人类来源的蛋白质控制细胞因子活性,以支持基于细胞的疗法 | 使用人类来源的蛋白质构建正交化合成电路,避免了非人类来源蛋白质的免疫原性风险 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行大规模临床应用验证 | 开发能够控制细胞因子活性的合成生物学平台,支持细胞疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂,以及工程化细胞因子(IL-2、IL-6和IL-10) | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
72 | 2025-07-20 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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review | 本文回顾了疫苗学的历史创新和最新进展,探讨了未来疫苗发展的潜力 | 强调了mRNA疫苗、反向疫苗学、合成生物学和结构设计等技术革命对疫苗开发的深远影响 | 未提及具体实验数据或样本规模的详细信息 | 探讨疫苗学领域的技术进步和未来发展方向 | 疫苗开发技术和人类免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19, 脑膜炎球菌B, 呼吸道合胞病毒(RSV) | mRNA疫苗, 反向疫苗学, 合成生物学, 结构设计 | NA | NA | NA |
73 | 2025-07-20 |
Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists
2024-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49626-x
PMID:38926339
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研究论文 | 提出一个跨尺度的合成生物学培训框架,旨在为学生提供整合跨学科概念的工具 | 通过解构生物技术在不同尺度(分子、电路/网络、细胞/无细胞系统、生物群落和社会)的应用,提供了一个全面的培训框架 | 未提及具体实施中的挑战或学生反馈的局限性 | 开发一个跨学科的合成生物学培训框架,以促进生物技术的负责任创新 | 合成生物学学生和教育者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
74 | 2025-07-20 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究探讨了水通道蛋白Aquaporin-1(Aqp1)作为磁共振成像遗传报告基因的安全性和有效性 | 证明Aqp1过表达不会影响细胞活力或形态,且不引起ER应激,消除了其作为深度组织报告基因的安全顾虑 | 研究仅在小鼠和人类多种细胞系中进行,尚未在完整生物体内验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的应用安全性 | 小鼠和人类多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系(未明确数量) |
75 | 2025-07-20 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 该研究从自然微生物筛选到外源宿主中实现持续的几丁质酶活性 | 通过筛选海洋水样发现具有几丁质酶活性的微生物,优化转化方法并在异源宿主中实现持续几丁质酶活性 | 几丁质酶在异源宿主中表达可能产生毒性副作用 | 实现持续的几丁质酶活性以应用于工业 | 海洋微生物及几丁质酶基因 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序与分析、异源表达 | NA | 基因组数据 | 海洋水样中的微生物 |
76 | 2025-07-20 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种在合成细胞中重建细菌谷氨酸受体通道的方法 | 提出了一种基于无细胞表达系统封装的方法,成功在合成细胞中重建膜蛋白 | 该方法目前仅针对细菌谷氨酸受体进行了验证,尚未广泛适用于其他膜蛋白 | 开发在合成细胞中重建膜蛋白的有效方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA |
77 | 2025-07-20 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
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研究论文 | 本研究描述了由内质网(ER)膜大量扩展形成的细胞内膜结构的特征 | 揭示了胞质面寡聚化结构域对ER衍生膜区室形成的关键作用,并展示了如何通过改变ER膜中的多蛋白特性来调控最终区室的形态 | 研究主要局限于烟草和拟南芥植物,未在其他生物系统中验证 | 探究ER膜扩展形成的膜结构的特性及其在植物合成生物学中的应用潜力 | 烟草和拟南芥植物中的ER衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术(FRAP)、定量图像分析 | NA | 图像数据 | 转基因烟草和拟南芥植物 |
78 | 2025-07-20 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法在实体瘤中的应用 | 讨论了合成生物学和细胞工程在实体瘤CAR-T疗法中的新应用 | 面临CAR-T细胞运输的物理和分子障碍、免疫抑制性肿瘤微环境以及寻找细胞表面靶抗原的困难等挑战 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的临床应用和挑战 | 实体瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤(包括头颈部癌、肺癌、中枢神经系统肿瘤、肉瘤、泌尿生殖系统肿瘤、乳腺癌和卵巢癌等) | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA |
79 | 2025-07-20 |
Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00372
PMID:37793076
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研究论文 | 本研究通过蒙特卡洛扩散模拟分析了水通道蛋白作为报告基因在分子成像中的定量影响 | 开发了一种基于两种扩散时间信号差分的成像方法,能够明确区分水通道蛋白信号与组织背景 | 水通道蛋白信号的区分仍受细胞大小和堆积密度等结构因素的影响 | 建立水通道蛋白作为报告基因在分子成像中的定量分析框架 | 水通道蛋白表达细胞 | 生物医学成像 | NA | 蒙特卡洛模拟 | 蒙特卡洛模型 | 模拟数据 | NA |
80 | 2025-07-20 |
Synthetic Biology in the Engineering of CAR-T and CAR-NK Cell Therapies: Facts and Hopes
2023-04-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1491
PMID:36454122
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综述 | 本文探讨了合成生物学在CAR-T和CAR-NK细胞疗法工程中的应用及其前景 | 综述了合成生物学工具在抗癌免疫疗法中的最新应用,特别是CAR-T和CAR-NK细胞疗法的发展 | 主要关注T细胞和NK细胞疗法面临的挑战,如抗原逃逸和免疫抑制性肿瘤微环境,但未涉及其他潜在细胞疗法 | 探讨合成生物学在改进CAR-T和CAR-NK细胞疗法中的应用及其临床转化的机会与挑战 | CAR-T和CAR-NK细胞疗法 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |