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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-07-21 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征,重点讨论了内共生体和宿主在进化过程中的分子变化 | 讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征,并探讨了实验室工程化内共生的研究进展 | 未提及具体的研究数据或实验结果的局限性 | 探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用 | 线粒体和叶绿体等内共生细胞器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
82 | 2025-07-21 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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research paper | 该研究通过PADDLE预测器系统性地鉴定了植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域 | 首次在全基因组范围内探索非转录因子蛋白中的激活域,并验证了这些域在转录调控中的作用 | 研究仅针对两种模式真核生物(植物和酵母),结果可能不适用于其他生物 | 系统鉴定非转录因子蛋白中的转录激活域并探索其功能 | 植物和酵母中的非转录因子蛋白 | 合成生物学 | NA | PADDLE预测器 | NA | 蛋白质序列数据 | >800个非转录因子基因的18,000个片段 |
83 | 2025-07-21 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
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综述 | 本文探讨了人工智能在检测、治疗和理解传染病中的应用及其进展 | 强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解及诊断加速中的快速进展 | 未具体说明人工智能技术在特定传染病案例中的应用限制 | 探讨人工智能如何助力控制传染病爆发和大流行 | 传染病及其防控 | 人工智能 | 传染病 | 人工智能 | NA | NA | NA |
84 | 2025-07-20 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 揭示了RNA可以序列依赖性地选择性结合脂质膜,为工程化RNA传感器和调控元件提供了新思路 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的基础化学原理及其在合成生物学和细胞调控中的应用 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
85 | 2025-07-20 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过元分析研究炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),发现与克罗恩病(CD)相关的两种梭菌衍生BGCs及其产物 | 首次鉴定了与克罗恩病相关的特定微生物小分子,并揭示了这些分子通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究结果主要基于小鼠模型,在人体中的直接作用机制仍需进一步验证 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组及其代谢产物 | 微生物组学 | 炎症性肠病(包括克罗恩病) | 元分析、合成生物学、质谱分析 | NA | 宏基因组数据、代谢组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
86 | 2025-07-20 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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research paper | 该研究开发了一种名为hDIRECT的平台,利用人类来源的蛋白质控制细胞因子活性,以支持基于细胞的疗法 | 使用人类来源的蛋白质构建正交化合成电路,避免了非人类来源蛋白质的免疫原性风险 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行大规模临床应用验证 | 开发能够控制细胞因子活性的合成生物学平台,支持细胞疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂,以及工程化细胞因子(IL-2、IL-6和IL-10) | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
87 | 2025-07-20 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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review | 本文回顾了疫苗学的历史创新和最新进展,探讨了未来疫苗发展的潜力 | 强调了mRNA疫苗、反向疫苗学、合成生物学和结构设计等技术革命对疫苗开发的深远影响 | 未提及具体实验数据或样本规模的详细信息 | 探讨疫苗学领域的技术进步和未来发展方向 | 疫苗开发技术和人类免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19, 脑膜炎球菌B, 呼吸道合胞病毒(RSV) | mRNA疫苗, 反向疫苗学, 合成生物学, 结构设计 | NA | NA | NA |
88 | 2025-07-20 |
Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists
2024-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49626-x
PMID:38926339
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研究论文 | 提出一个跨尺度的合成生物学培训框架,旨在为学生提供整合跨学科概念的工具 | 通过解构生物技术在不同尺度(分子、电路/网络、细胞/无细胞系统、生物群落和社会)的应用,提供了一个全面的培训框架 | 未提及具体实施中的挑战或学生反馈的局限性 | 开发一个跨学科的合成生物学培训框架,以促进生物技术的负责任创新 | 合成生物学学生和教育者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
89 | 2025-07-20 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究探讨了水通道蛋白Aquaporin-1(Aqp1)作为磁共振成像遗传报告基因的安全性和有效性 | 证明Aqp1过表达不会影响细胞活力或形态,且不引起ER应激,消除了其作为深度组织报告基因的安全顾虑 | 研究仅在小鼠和人类多种细胞系中进行,尚未在完整生物体内验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的应用安全性 | 小鼠和人类多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系(未明确数量) |
90 | 2025-07-20 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 该研究从自然微生物筛选到外源宿主中实现持续的几丁质酶活性 | 通过筛选海洋水样发现具有几丁质酶活性的微生物,优化转化方法并在异源宿主中实现持续几丁质酶活性 | 几丁质酶在异源宿主中表达可能产生毒性副作用 | 实现持续的几丁质酶活性以应用于工业 | 海洋微生物及几丁质酶基因 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序与分析、异源表达 | NA | 基因组数据 | 海洋水样中的微生物 |
91 | 2025-07-20 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
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研究论文 | 本研究描述了由内质网(ER)膜大量扩展形成的细胞内膜结构的特征 | 揭示了胞质面寡聚化结构域对ER衍生膜区室形成的关键作用,并展示了如何通过改变ER膜中的多蛋白特性来调控最终区室的形态 | 研究主要局限于烟草和拟南芥植物,未在其他生物系统中验证 | 探究ER膜扩展形成的膜结构的特性及其在植物合成生物学中的应用潜力 | 烟草和拟南芥植物中的ER衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术(FRAP)、定量图像分析 | NA | 图像数据 | 转基因烟草和拟南芥植物 |
92 | 2025-07-20 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法在实体瘤中的应用 | 讨论了合成生物学和细胞工程在实体瘤CAR-T疗法中的新应用 | 面临CAR-T细胞运输的物理和分子障碍、免疫抑制性肿瘤微环境以及寻找细胞表面靶抗原的困难等挑战 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的临床应用和挑战 | 实体瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤(包括头颈部癌、肺癌、中枢神经系统肿瘤、肉瘤、泌尿生殖系统肿瘤、乳腺癌和卵巢癌等) | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA |
93 | 2025-07-20 |
Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00372
PMID:37793076
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研究论文 | 本研究通过蒙特卡洛扩散模拟分析了水通道蛋白作为报告基因在分子成像中的定量影响 | 开发了一种基于两种扩散时间信号差分的成像方法,能够明确区分水通道蛋白信号与组织背景 | 水通道蛋白信号的区分仍受细胞大小和堆积密度等结构因素的影响 | 建立水通道蛋白作为报告基因在分子成像中的定量分析框架 | 水通道蛋白表达细胞 | 生物医学成像 | NA | 蒙特卡洛模拟 | 蒙特卡洛模型 | 模拟数据 | NA |
94 | 2025-07-20 |
Synthetic Biology in the Engineering of CAR-T and CAR-NK Cell Therapies: Facts and Hopes
2023-04-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1491
PMID:36454122
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综述 | 本文探讨了合成生物学在CAR-T和CAR-NK细胞疗法工程中的应用及其前景 | 综述了合成生物学工具在抗癌免疫疗法中的最新应用,特别是CAR-T和CAR-NK细胞疗法的发展 | 主要关注T细胞和NK细胞疗法面临的挑战,如抗原逃逸和免疫抑制性肿瘤微环境,但未涉及其他潜在细胞疗法 | 探讨合成生物学在改进CAR-T和CAR-NK细胞疗法中的应用及其临床转化的机会与挑战 | CAR-T和CAR-NK细胞疗法 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
95 | 2025-07-20 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
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综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展,包括组蛋白修饰的建立与维持机制、亲本组蛋白伴侣的功能以及合成生物学方法在表观遗传研究中的应用 | 总结了亲本组蛋白回收过程对异染色质介导的转录沉默遗传的潜在影响,并介绍了用于分析表观遗传组分的新型合成生物学方法 | 主要基于真菌模型的研究发现,在哺乳动物系统中的验证可能有限 | 探讨染色质结构中介导的表观遗传记忆机制及其遗传方式 | 组蛋白翻译后修饰(PTMs)和亲本组蛋白回收过程 | 表观遗传学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
96 | 2025-07-20 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本文探讨了在培养细胞和果蝇中使用短肽标签单拷贝进行蛋白质操作的方法 | 开发了使用单拷贝短标签进行活细胞内蛋白质结合和操作的新工具 | NA | 开发更直接的蛋白质相互作用分析方法 | 培养细胞和果蝇中的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | NA |
97 | 2025-07-19 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Nov-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
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研究论文 | 开发并应用了一种高特异性的全细胞生物传感器,用于环境样品中超硫化物的检测 | 首次报道了使用Agrobacterium tumefaciens的超硫化物感应抑制子BigR(AtBigR)开发的全细胞生物传感器,具有对超硫化物的高选择性 | 未提及具体的技术限制或样本限制 | 开发一种高特异性、高灵敏度的超硫化物检测方法,以促进对超硫化物在生物学、环境和锂硫电池中作用的理解 | 超硫化物(如元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物) | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | NA | 环境样品数据(如海洋沉积物和锂硫电池电解质) | 多种海底地形的海洋沉积物样品和锂硫电池电解质样品 |
98 | 2025-07-19 |
Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae
2025-Oct, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2025.106751
PMID:40451315
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术,研究了苦木科植物中角鲨烯合酶(SQS)的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用 | 首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS,克隆了AaSQS并鉴定了其功能及关键催化残基 | 研究仅针对苦木科植物中的SQS,未涉及其他植物家族中的SQS比较 | 研究苦木科植物中角鲨烯合酶的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用 | 苦木科植物中的角鲨烯合酶(SQS) | 生物信息学 | NA | 转录组分析、分子克隆、分子对接、突变分析 | NA | 序列数据 | 6种苦木科植物的SQS(AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS) |
99 | 2025-07-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
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研究论文 | 本研究提出了一种基于酶的高效DNA origami二聚体自复制方法 | 使用耐热T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤,实现了更快的循环时间和更高的扩增效率 | 未明确说明系统在复杂环境中的稳定性和长期运行效果 | 探索DNA origami二聚体的高效自复制系统及其在合成生物学和智能材料中的应用 | DNA origami二聚体 | 合成生物学 | NA | T4 DNA连接酶催化 | NA | 分子结构数据 | NA |
100 | 2025-07-19 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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研究论文 | 该研究提出了一种高效的体外组装方法,用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 首次实现了百kb级别的人类功能性IGHV基因片段的体外无痕组装 | 仅针对IGHV基因片段,未验证其他复杂基因组区域的适用性 | 开发大规模人类基因组体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | NA |