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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-07-19 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶构建了一个高效的基因激活系统,能够实现近乎随机的全基因组插入,并通过四环素诱导启动子实现条件性基因激活 | 未提及系统的特异性或脱靶效应的详细评估 | 开发高效工具以进行细菌工程中的基因功能研究和表型优化 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶系统 | NA | 基因序列数据 | 未明确提及具体样本数量,但系统插入频率约为2.83×10 cfu/μg DNA |
102 | 2025-07-19 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
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研究论文 | 本研究通过随机诱变和理性设计,在非模式细菌Zymomonas mobilis中建立了一个可见的报告基因系统 | 通过随机诱变和理性设计增强eforRed色蛋白的光谱特性,成功在非模式细菌中建立了可见的报告基因系统 | 研究仅针对Zymomonas mobilis这一特定非模式细菌,可能不适用于其他微生物 | 开发适用于非模式微生物的可见报告基因系统,以促进生物制造和合成生物学的发展 | Zymomonas mobilis细菌和eforRed色蛋白 | 合成生物学 | NA | 随机错误倾向PCR和蛋白质理性设计 | NA | 蛋白质光学特性数据 | NA |
103 | 2025-07-19 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Jul-17, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
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综述 | 本文综述了富硒微生物,特别是细菌,作为牲畜营养中有机硒补充的新颖和可持续策略的潜力 | 探讨了通过基因工程和合成生物学开发的工程细菌菌株,能够增强硒的吸收、转化和积累,并生物合成多种生物可利用的硒化合物 | 关键挑战包括优化菌株选择、发酵过程、生物安全性、法规遵从性,以及通过长期饲养试验在不同条件下证明其有效性 | 探索富硒细菌在动物农业、生物医学和环境修复中的潜在应用 | 牲畜(家禽和反刍动物) | 生物技术 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
104 | 2025-07-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
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研究论文 | 本文开发了一种在解脂耶氏酵母中进行大规模基因组装和基因组整合的策略,显著提高了基因操作和代谢工程的能力 | 实现了超过30 kb的十多个基因的稳定组装和整合,构建了含有35个外源基因(总计93.5 kb)的底盘细胞 | 未提及具体的技术限制或应用范围限制 | 提升解脂耶氏酵母的基因操作和代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 大规模基因组装和基因组整合 | NA | NA | 构建了含有35个外源基因的底盘细胞,并在5 L生物反应器中进行了优化菌株的测试 |
105 | 2025-07-19 |
Synthetic biology-driven optoelectronic biosensor for rapid and highly sensitive norovirus detection in fecal samples
2025-Jul-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117787
PMID:40674850
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研究论文 | 介绍了一种基于合成生物学的光电生物传感器,用于快速、高灵敏度检测临床粪便样本中的人类诺如病毒 | 整合了诺如病毒样颗粒和高亲和力单链可变片段抗体作为生物受体,实现了无需核酸扩增的多重分析,检测灵敏度比传统比色生物传感器提高了10至100倍 | 研究样本量较小(20份人类粪便样本),可能需要更大规模的临床验证 | 开发一种快速、高灵敏度的诺如病毒检测平台 | 人类诺如病毒 | 生物传感器 | 诺如病毒感染 | 合成生物学、噬菌体展示、光电传感 | NA | 生物分子数据 | 20份人类粪便样本 |
106 | 2025-07-19 |
Advances in production and application technologies of minicells: A review
2025-Jul-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648
PMID:40669734
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review | 本文综述了微型细胞的生产和应用技术进展,包括其形成机制、分离方法、生产现状以及在合成生物学、农业和医学中的多样化应用 | 重点介绍了微型细胞在传统药物递送之外的四大功能:解毒与耐受、富集与微反应器、分子封装与递送以及原生结构表征 | 讨论了微型细胞在生物技术应用中面临的挑战和未来前景 | 综述微型细胞的生产技术及其在多个领域的应用 | 微型细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
107 | 2025-07-19 |
Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes
2025-Jul-04, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04325-8
PMID:40615742
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review | 本文综述了利用计算策略增强微生物维生素B12生物合成潜力的各种方法 | 讨论了CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据整合等最新进展 | 未提及具体实验验证或实际应用中的挑战 | 提高微生物维生素B12的生物合成以满足全球营养和治疗需求 | 微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、CRISPR-Cas9、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA |
108 | 2025-07-19 |
Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review
2025-Jul-01, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04386-0
PMID:40590991
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综述 | 本文全面分析了真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法及提高产量的策略 | 强调了合成生物学和AI驱动的代谢工程在可持续利用真菌生物多样性中的创新应用 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 探讨真菌次级代谢产物的调控机制及其在医药、农业和化妆品等领域的应用 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | OMICS技术、响应面方法、人工神经网络 | 人工神经网络 | NA | NA |
109 | 2025-07-19 |
Biodegradation of Neonicotinoid Insecticides Thiacloprid and Thiamethoxam by Microorganisms: Metabolic Process, Metabolic Enzymes and Toxicity Assessments of their Metabolites
2025-Jun-25, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04326-7
PMID:40555881
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综述 | 本文全面探讨了微生物降解新烟碱类杀虫剂噻虫啉和噻虫嗪的代谢途径、关键酶及其代谢产物的生态毒理学效应 | 重点分析了微生物群落通过互补代谢途径协同提升降解效率的潜力,并提倡整合多组学技术、计算生物学、合成生物学和代谢工程以推进微生物生物降解策略 | 对噻虫啉和噻虫嗪的降解机制理解仍不充分 | 研究微生物降解新烟碱类杀虫剂的代谢过程及其生态毒理学影响 | 噻虫啉(THI)和噻虫嗪(THIA)及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 多组学技术、计算生物学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
110 | 2025-07-19 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917进行基因工程改造,成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在天然肠道大肠杆菌中成功表达多种荧光报告基因和生物活性化合物,展示了其作为合成生物学平台的潜力 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株,结果可能无法推广到其他肠道菌株 | 开发基于天然肠道细菌的治疗应用平台 | 肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | CRAGE技术 | NA | 基因表达数据 | 2种大肠杆菌菌株 |
111 | 2025-07-19 |
Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1581971
PMID:40667443
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综述 | 本文综述了利用下一代益生菌和工程化细菌外膜囊泡(BEVs)进行骨质疏松精准治疗的潜力 | 提出结合工程化益生菌和BEV技术的新型治疗策略,通过靶向肠道-骨骼轴提供骨保护作用 | 标准化和安全性方面仍存在挑战 | 探索基于微生物组的干预措施在骨质疏松治疗中的应用 | 骨质疏松患者 | 精准医疗 | 骨质疏松症 | 合成生物学、工程化BEVs | NA | NA | NA |
112 | 2025-07-19 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子,实现细胞类型特异性,并通过实验验证和优化提高了增强子的特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系,可能不适用于其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
113 | 2025-07-18 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
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研究论文 | 本研究通过工程化改造硫解酶,开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物的新代谢途径 | 通过定向进化改造Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB),显著提高了其对glycolyl-CoA和acetyl-CoA的催化效率,并开发了可直接利用PET衍生的乙二醇的上游模块 | NA | 开发可持续的生物制造路线,将PET衍生的乙二醇转化为高价值的四碳化合物 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB) | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA |
114 | 2025-07-18 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
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研究论文 | 本研究开发了一种响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控微生物细胞工厂中中心代谢的代谢流分布,以提高有价值化合物的生产性能 | 建立了PdhR生物传感器系统,能够动态调控中心代谢的代谢流分布,并通过筛选多种PdhR同源物和计算分析优化了生物传感器性能 | 大多数遗传工具具有途径或中间体特异性,限制了其在合成生物学中的广泛应用,且其在平衡细胞生长和产物形成之间的代谢流潜力尚未充分探索 | 开发能够动态调控中心代谢的遗传调控工具,以提高微生物细胞工厂中有价值化合物的生产性能 | 微生物细胞工厂中的中心代谢 | 合成生物学 | NA | 生物传感器系统、定点诱变 | NA | NA | NA |
115 | 2025-07-18 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-Jul-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
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综述 | 本文综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 探讨了人工智能和机器学习在菌株设计和过程控制中的应用,以克服代谢瓶颈和扩大生产规模 | 面临代谢负担等挑战 | 推动化妆品行业向天然和可持续成分发展 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 遗传和代谢工程、途径模块化、发酵优化 | NA | NA | NA |
116 | 2025-07-18 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡(GUNs),作为合成细胞的稳健、经济平台 | 提出巨型单层囊泡(GUNs)作为新型合成细胞模型,具有优异的膜流动性和对小分子及质子的选择性通透性,无需嵌入转运蛋白 | 未提及长期稳定性或在复杂生物环境中的表现 | 开发一种更稳定、经济且具有优异膜特性的合成细胞模型 | 巨型单层囊泡(GUNs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
117 | 2025-07-18 |
Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy
2025-Jul-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023
PMID:40669653
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物策略从食物垃圾中生产聚羟基脂肪酸酯以支持循环生物经济的方法 | 强调了代谢工程和合成生物学在聚羟基脂肪酸酯生产中的应用 | 需要进一步深入研究微生物策略 | 探索食物垃圾的高效利用以支持循环生物经济 | 食物垃圾和聚羟基脂肪酸酯 | 生物工程 | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
118 | 2025-07-18 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学,揭示了聚合物吸附对脂质筏的诱导和稳定作用 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分,诱导并稳定单个脂质筏,同时聚合物受到动态限制,表现出独特的扩散行为 | 研究主要基于模拟和单分子追踪实验,可能无法完全反映真实细胞膜的复杂性 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用 | 线性聚合物和二元脂质膜 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟和单分子追踪实验 | Zimm模型和Saffman-Delbrück模型 | 模拟数据和实验数据 | 未明确说明具体样本数量 |
119 | 2025-07-18 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程,应用于细菌孤儿受体 | 通过生物信息学和结构分析预测PAS域,利用片段库筛选出三种能显著提高CU228热稳定性的配体,并采用多种技术验证其结合特性 | 研究仅针对CU228这一特定蛋白质,未验证其在更广泛PAS蛋白中的适用性 | 开发一种筛选小分子配体的方法,用于增强孤儿PAS蛋白的稳定性 | 细菌孤儿受体CU228(一种PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR | NA | 蛋白质结构数据、光谱数据 | 约760种化合物的片段库 |
120 | 2025-07-17 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究通过结合合成生物学与合成电化学,开发了一种环境友好的方法来合成吲哚咔唑类化合物,并扩展了其化学空间 | 首次将合成生物学与合成电化学结合,实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成,并发现了N-N同源二聚化的新结构 | 未明确提及实验规模或工业化应用的可行性 | 开发绿色合成方法以扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成化学 | NA | 合成生物学、合成电化学、酶促糖基化 | NA | 化学合成数据 | 17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试 |