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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-29 |
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04610-x
PMID:41627464
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综述 | 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略,涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 | 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别,包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂,并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且可能未涵盖所有最新研究进展 | 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略,以开发可持续的抗微生物控制工具 | 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子(如AHLs、寡肽、AI-2) | NA | NA | 合成生物学、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 工程化群体感应电路 | 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理 |
| 102 | 2026-03-29 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术,开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台,成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组,并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因,实现了快速、灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株,且在小鼠中仍能引起致死性感染,表明毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台,以促进基础研究和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组序列 | 使用Vero细胞进行病毒拯救,并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酵母, Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 | 医学 |
| 103 | 2026-03-29 |
De novo chemoenzymatic construction of lipid membranes
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.013
PMID:41895902
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研究论文 | 本文提出了一种化学酶促策略,在水溶液中从头构建磷脂和膜 | 开发了一种模块化方法,通过天然化学连接将脂肪酸合成与磷脂组装结合,实现无预存双层的膜构建 | NA | 为自下而上的合成生物学和生命起源研究提供从头构建膜的平台 | 磷脂和膜 | 合成生物学 | NA | 化学酶促合成,天然化学连接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生命起源研究 |
| 104 | 2026-03-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种基于细胞自由表达系统封装的方法,在巨型单层囊泡中重构细菌谷氨酸受体通道 | 提出了一种新方法,通过封装和孵育细胞自由表达反应,成功在合成细胞模型中重构膜蛋白,并探索了信号肽替换对蛋白共翻译易位的影响 | NA | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 细胞自由表达系统、共翻译易位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-03-29 |
Drivers of metabolic diversification: how dynamic genomic neighbourhoods generate new biosynthetic pathways in the Brassicaceae
2020-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.16338
PMID:31769874
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研究论文 | 本研究通过分析十字花科植物基因组,探讨了基因组动态邻域如何通过基因重排驱动三萜类生物合成途径的多样化进化 | 揭示了植物基因组通过动态基因组邻域重组核心酶基因库来产生新生物合成途径的进化机制,为植物代谢多样化提供了基因组学解释 | 研究仅基于13个已测序的十字花科基因组,功能验证仅针对三个代表性基因簇,可能未涵盖该家族的全部代谢多样性 | 探究植物新生物合成途径的进化机制,特别是三萜类代谢途径的多样化过程 | 十字花科植物的三萜类生物合成基因簇及其基因组邻域 | 植物基因组学与代谢工程 | NA | 基因组测序、系统发育分析、功能验证 | NA | 基因组序列数据 | 13个已测序的十字花科植物基因组,包含163个OSC基因 | NA | 十字花科植物 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 106 | 2026-03-29 |
Consensus architecture of promoters and transcription units in Escherichia coli: design principles for synthetic biology
2017-Mar-28, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c6mb00789a
PMID:28256660
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研究论文 | 本文通过分析大肠杆菌K-12 MG1655中的实验描述和预测遗传元件,定义了转录单元的全面架构组织,以揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 提出了大肠杆菌启动子和转录单元的共识架构,为合成生物学提供了设计原则 | NA | 揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 大肠杆菌K-12 MG1655中的遗传元件和转录单元 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传信息数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 转录单元架构设计 | 工业生物技术 |
| 107 | 2026-03-29 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 本文提出了一种通过可编程基因可用性定时在生物传感器电路中实现数字切换的方法,以改善合成生物学中基因电路的稳健性 | 利用位点特异性重组酶通过可编程定时控制基因可用性,显著减少电路泄漏并提高动态范围,为基因电路设计提供了新的时间控制策略 | NA | 研究如何通过时间控制基因可用性来优化合成生物学中多基因电路的性能,特别是在生物传感器应用中的稳健性 | 内源性microRNA(miRNA)的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 比例传感器电路,涉及基因可用性的可编程定时控制以减少泄漏并提高动态范围 | 医学 |
| 108 | 2026-03-28 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
|
研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中构建了配体诱导型合成回路,以激活内源性花青素通路,并利用高光谱成像技术实现非破坏性远程检测 | 首次在单子叶植物中成功适配配体诱导型传感器来操纵内源性色素通路,并开发了结合高光谱成像与判别性目标表征方法的近远程检测系统 | 研究主要基于模式植物狗尾草,尚未在主要粮食作物中进行验证;配体吸收的物理屏障问题仅部分通过筛选高效诱导剂解决 | 开发适用于单子叶植物的可诱导合成生物学系统,实现植物对环境污染或有害化学物质的传感报告功能 | 狗尾草(Setaria viridis)的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 遗传回路设计、配体诱导表达系统、高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 高光谱图像、植物表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及原生质体和整株植物实验 | 配体诱导型传感器、合成遗传回路 | 狗尾草(Setaria viridis) | 配体诱导型传感器回路,可激活内源性花青素生物合成通路 | 农业,环境 |
| 109 | 2026-03-28 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本文提出了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习优化,实现了对扩增效率的连续精确调控,并在DNA数据存储和临床诊断中展示了应用潜力 | 通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦,实现了高分辨率(33% vs 81%)的可编程扩增;利用机器学习模型将预测精度从R²=0.62提升至0.86 | 未明确说明方法在单细胞测序和空间转录组学中的具体验证结果,临床验证样本规模未详细说明 | 开发可动态调控扩增效率的技术,用于分子诊断和DNA数据存储 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 可编程核酸扩增技术、机器学习建模 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 实验数据(2483个数据点)、RNA序列数据 | 2483个实验数据点,临床验证中涉及宫颈癌RNA样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | 医学诊断、数据存储 |
| 110 | 2026-03-28 |
Advances in Biomolecular Condensates: From Disease Therapy to Synthetic Biology
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500931
PMID:41889100
|
综述 | 本文综述了生物分子凝聚体的最新突破、技术挑战和未来方向,重点关注其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 将生物分子凝聚体作为创新靶点,用于新药研发、疾病治疗、生物反应器构建和智能生物材料开发,为不可成药靶点提供新的干预策略 | NA | 探讨生物分子凝聚体在生物医学和工程生物学中的应用潜力 | 生物分子凝聚体(BMCs),包括蛋白质和核酸等生物分子 | 合成生物学 | NA | 液体-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 111 | 2026-03-28 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Mar-26, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 本研究评估了一种来自海洋海绵的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)的功能,发现其可将类胡萝卜素转化为高价值的藏花素前体,并在番茄果实中成功实现了藏花素的生物合成 | 首次发现海绵来源的CCD酶具有将类胡萝卜素转化为藏花素前体的意外功能,揭示了CCD酶在跨界的酶学可塑性,并成功在植物中重编程类胡萝卜素代谢途径 | 研究主要基于异源表达系统(大肠杆菌和番茄),在天然海绵宿主中的生理功能仍需进一步验证 | 探究海洋动物中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能,并开发其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、显微图像 | 使用大肠杆菌和番茄(Solanum lycopersicum)作为异源表达系统 | 异源表达 | 大肠杆菌, 番茄 | 将海绵CCD酶引入植物类胡萝卜素代谢途径,重编程为藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 112 | 2026-03-28 |
Metabolic engineering of microbial pathways for 5-aminolevulinic acid biosynthesis: Recent advances and biotechnological applications
2026-Mar-23, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.03.012
PMID:41881187
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综述 | 本文综述了5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)微生物生物合成途径的代谢工程最新进展及其生物技术应用 | 整合了代谢工程与合成生物学策略,如优化前体供应、改造C4和C5途径、设计生物传感器动态调控,以提升5-ALA生产的效率和可持续性 | NA | 探讨微生物生产5-ALA的代谢工程策略,以替代传统化学方法,实现高效、可持续的生物合成 | 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)及其在农业、医药、化妆品和饲料等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis) | C4和C5生物合成途径、生物传感器动态调控系统、代谢通路优化 | 农业、医药、化妆品、动物饲料、工业生物技术 |
| 113 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 114 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 115 | 2026-03-28 |
The secret life of RNA and lipids
2025-12, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用,包括其化学基础及其对合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学的影响 | 综述了RNA与脂质相互作用的新兴领域,提出了利用这些相互作用设计合成系统中RNA传感器和调控元件的可能性 | NA | 探索RNA与脂质相互作用,以推动合成生物学、RNA治疗和细胞调控研究 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和调控元件 | 医学, 工业生物技术 |
| 116 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
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研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包,扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化,具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包,以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 117 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略,用于区分近似的DNA和RNA序列,以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略,通过谨慎交换密码子实现,对酵母生理影响最小,并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印,结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型,水印策略对Gpm1基因有轻微影响,且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略,以区分合成与天然基因副本,支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的13个糖利用途径基因,包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株,涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径,通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 118 | 2026-03-27 |
Advances in vehicles for in situ delivery: From classical vectors to biologically inspired structures
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.013
PMID:41884229
|
综述 | 本文系统总结了蛋白质和核酸递送系统的最新进展,包括病毒载体、非病毒载体及新型递送工具 | 全面比较了从经典载体到生物启发结构(如Arc、PNMA2、SEND、PVC和凝聚层系统)的递送工具,并评估了其作用机制与应用前景 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要基于现有文献进行归纳分析 | 为合成生物学和基因治疗领域的技术发展与理论研究提供参考 | 蛋白质和核酸的递送系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 119 | 2026-03-27 |
Recent advances on fermentation of mustard plant (Brassica juncea L.): microbial community, fermentation processing and sensorial quality: a review
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1784857
PMID:41883800
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综述 | 本文系统总结了芥菜发酵的最新进展,重点关注微生物群落、发酵工艺参数、感官品质形成机制及潜在风险控制 | 整合了多地区、多发酵阶段的微生物群落动态与功能分析,并提出了结合组学与合成生物学技术的未来研究方向 | NA | 综述芥菜发酵过程中微生物群落、加工参数、风味形成及风险控制的研究进展,以支持产业可持续发展 | 芥菜(Brassica juncea L.)及其发酵产品 | NA | NA | 组学技术,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 120 | 2026-03-27 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
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研究论文 | 本研究确定了毛地黄中地高辛生物合成途径中三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中关键酶(P450、3HSD和P5R2)的亚细胞定位,并发现毛地黄P450定位于内质网,与哺乳动物线粒体定位的CYP11A1形成对比 | 研究仅关注三种已知酶,地高辛生物合成途径的其他步骤和调控机制尚未完全阐明 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织特征 | 毛地黄(Digitalis lanata)中地高辛生物合成途径的三种酶:细胞色素P450甾醇侧链裂解酶(P450)、3-羟基类固醇脱氢酶(3HSD)和孕酮-5-还原酶2(P5R2) | NA | 心力衰竭、心房颤动 | 荧光标记蛋白表达、亚细胞定位分析 | NA | 荧光显微图像 | 烟草叶片瞬时表达系统 | NA | 烟草(瞬时表达系统)、毛地黄(酶来源) | NA | 医药 |