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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2025-10-05 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 | 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究,并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 | 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型数据 | NA | NA | 植物、微生物 | NA | 农业 |
| 1982 | 2025-10-05 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 提出通过微生物组工程构建合成微生物群落以增强农业气候韧性的综合框架 | 提出可编程全息生物体概念,整合微生物生态学、合成生物学和计算建模构建具有动态反馈和生态记忆的植物-微生物共生系统 | NA | 开发气候韧性农业的工程化微生物组解决方案 | 植物全息生物体(植物宿主及其微生物组) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物、微生物 | 生物传感器电路、群体感应模块、可编程微生物功能 | 农业 |
| 1983 | 2025-10-05 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴样细胞(ILCs)在免疫调节和疾病中的作用,并探讨了其作为生物标志物和免疫治疗新策略的潜力 | 系统阐述了ILCs作为新型免疫治疗蓝图的转化潜力,包括CAR-ILC工程、细胞扩增技术和多组学方法的应用 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床应用的障碍 | 探讨ILCs在自身免疫疾病和癌症中作为预测、诊断和治疗靶点的作用 | 先天淋巴样细胞(ILCs)及其亚群(ILC1s、ILC2s、ILC3s、LTi细胞) | 免疫学 | 自身免疫疾病,癌症 | 多组学技术、单细胞图谱、合成生物学方法 | NA | NA | NA | CAR工程 | 脐带血、多能干细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)工程 | 医学 |
| 1984 | 2025-10-05 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
|
综述 | 本文回顾疫苗学发展历程并展望未来技术变革,重点介绍mRNA疫苗等突破性技术对疫苗领域的革新作用 | 系统梳理疫苗学关键技术演进,强调反向疫苗学、合成生物学和mRNA平台等革命性技术如何将失败转化为成功疫苗 | 未涉及具体实验数据或临床研究,主要基于历史视角和技术展望 | 探讨疫苗学技术发展历程及未来变革方向 | 疫苗技术发展历程及免疫机制研究 | 疫苗学 | 传染病(脑膜炎B型、呼吸道合胞病毒等) | 反向疫苗学、合成生物学、结构设计、mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1985 | 2025-10-05 |
Integrating kinetic models, gene circuits, and biofilm dynamics for enhanced exopolysaccharide production in nitrifying bacterial consortia
2025-Oct, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107237
PMID:40850333
|
研究论文 | 本研究通过动力学模型和合成生物学方法优化硝化细菌群落胞外多糖生产和氮去除性能 | 整合动力学模型与基因电路设计来优化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除效率 | NA | 优化硝化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除性能 | 从生活废水中富集的细菌群落 | 合成生物学 | NA | 动力学模型, 基因电路设计, 扫描电子显微镜, PCR | Monod模型, Verhulst模型 | 生物量浓度, 多糖产量, 氮浓度数据, 显微镜图像 | 生活废水中富集的细菌群落 | 基因电路设计 | 硝化细菌群落 | BUFFER门逻辑基因电路用于控制琥珀聚糖生产 | 环境, 废水处理 |
| 1986 | 2025-10-05 |
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc03618f
PMID:40891348
|
综述 | 系统阐述工程化微生物在癌症治疗中的设计策略、功能优化及生物医学应用 | 整合合成生物学与纳米技术实现微生物的精准药物递送和时空调控功能 | 临床转化面临挑战,需要跨学科整合 | 开发基于工程微生物的下一代癌症治疗方法 | 工程化微生物及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、表面修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 药物释放系统、免疫调节回路 | 医学 |
| 1987 | 2025-10-05 |
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00959
PMID:40888536
|
综述 | 探讨益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 | 系统整合了益生菌作为生物杂交药物载体的多种工程化策略(包括细菌幽灵、外膜囊泡等),并重点探讨了与纳米颗粒系统的整合方法 | NA | 分析益生菌在靶向药物递送领域的最新进展和未来发展方向 | 益生菌及其工程化衍生物(细菌幽灵、外膜囊泡、孢子等) | 合成生物学 | 癌症, 胃肠道疾病 | 基因工程, 纳米技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | 质粒表达, 基因组整合 | 益生菌 | 靶向治疗系统, 免疫调节系统, 刺激响应机制 | 医药 |
| 1988 | 2025-10-05 |
Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy
2025-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70122
PMID:40970823
|
综述 | 本文系统评述三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用 | 首次全面评估三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制,并探讨合成生物学和精准医疗等创新策略 | 存在化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战,相关代谢物的生物活性知识仍存在空白 | 探讨三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用 | 三尖杉属植物及其生物活性代谢物(特别是高三尖杉酯碱) | NA | 白血病, 实体瘤 | 合成生物学, 先进药物递送系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1989 | 2025-10-05 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
|
研究论文 | 本文介绍利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 | 采用农杆菌介导的瞬时表达技术实现萜类生物合成的亚细胞区室化 | NA | 开发快速构建萜类化合物合成通路并实现区室化生产的方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物合成通路 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达技术 | NA | NA | NA | 农杆菌介导的转化 | 本氏烟草 | 萜类化合物合成通路的区室化设计(质体、细胞质、脂滴表面) | 工业生物技术 |
| 1990 | 2025-10-05 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
|
综述 | 探讨工程化生物系统中空间计算实现的原理与应用 | 提出超越传统单细胞逻辑系统的空间分布式计算框架,模拟形态发生梯度等自然现象 | NA | 研究如何通过空间和适应性计算解决复杂计算挑战 | 工程化生物计算系统 | 合成生物学 | NA | 空间计算框架 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间计算系统、形态发生梯度模拟、细胞区室化 | 医疗,环境,诊断 |
| 1991 | 2025-10-05 |
Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation
2025-Sep, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-345
PMID:40962472
|
综述 | 系统探讨发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景 | 首次系统梳理发育调控因子在克服遗传转化技术瓶颈中的多重作用机制 | NA | 探讨发育调控因子如何提升作物遗传转化技术的效率和应用范围 | 主要农作物及其遗传转化技术体系 | 农业生物技术 | NA | 农杆菌介导转化、基因枪技术 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 1992 | 2025-10-05 |
Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies
2022-04-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023
PMID:35427499
|
研究论文 | 本研究通过模块化工程设计开发了合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs),用于编程治疗性细胞的基因调控 | 采用临床驱动设计流程构建受体,展示了系统模块化工程可生成具有可调传感和转录反应能力的受体平台 | NA | 开发用于治疗性细胞程序化基因调控的合成受体 | 合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)和人类原代T细胞 | 合成生物学 | NA | 调节性跨膜蛋白水解技术 | NA | NA | NA | 模块化工程 | 人类原代T细胞 | 合成跨膜蛋白水解受体,具有多抗原识别和剂量控制生物活性载荷产生能力 | 医学 |
| 1993 | 2025-10-05 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
|
研究论文 | 本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的完整生物合成途径重构 | 首次在酿酒酵母中采用模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径,包括UDP-阿拉伯糖原位生物合成和多个糖基化步骤 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-阿拉伯糖供应可能是主要限速因素 | 开发可持续生产Asperosaponin VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的微生物平台 | Asperosaponin VI(ASA VI)三萜皂苷及其生物合成中间体 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 异源基因表达、多拷贝表达 | 酿酒酵母 | 完整生物合成途径包括:UDP-阿拉伯糖原位生物合成、三萜骨架生成(齐墩果酸生产)、下游修饰(C-23羟基化、C-28逐步葡萄糖基化、C-3阿拉伯糖基化) | 医药 |
| 1994 | 2025-10-05 |
Microreactors derived from water-in-water pickering emulsions for Bacillus amyloliquefaciens proliferation and synthesis of 4-methyl-5-thiazoleethanol
2025-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133231
PMID:40882929
|
研究论文 | 开发了一种基于水包水Pickering乳液微反应器,用于提高枯草芽孢杆菌增殖和4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成效率 | 结合合成生物学与胶体组装技术构建新型微反应器平台,通过工程化硫胺素酶II突变体和界面屏障优化酶-底物相互作用 | NA | 解决4-甲基-5-噻唑乙醇生物合成中产率低和挥发性损失的问题 | 枯草芽孢杆菌及其工程化硫胺素酶II突变体 | 合成生物学 | NA | 水包水Pickering乳液、甲基纤维素/羟丙基甲基纤维素水相分离、液体发酵 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 枯草芽孢杆菌 | 硫胺素酶II突变体(A82Y/Y113A/T163K/F169L)的代谢工程改造 | 食品工业,香料工业 |
| 1995 | 2025-10-05 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组和代谢组分析,探索钩吻中钩吻素甲生物合成途径及相关酶基因 | 首次完成钩吻基因组测序组装,结合多组学数据鉴定出20个钩吻素甲生物合成候选基因,并对其中两个基因进行了功能验证 | 仅对两个候选基因进行了初步功能验证,完整的生物合成途径仍需进一步研究 | 解析钩吻中钩吻素甲生物合成途径,挖掘相关酶基因 | 钩吻植物及其生物活性成分钩吻素甲 | 合成生物学 | 炎症和焦虑症 | PacBio测序, 液相色谱-质谱联用技术 | NA | 基因组, 转录组, 代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 | NA | 钩吻植物 | 钩吻素甲生物合成途径 | 医药 |
| 1996 | 2025-10-05 |
Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins
2025-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70284
PMID:40944421
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研究论文 | 开发了能够准确预测无序蛋白质热响应相行为的残基分辨率模型Mpipi-T | 通过整合原子尺度溶剂化自由能数据和实验浊点测量,参数化了短程非键相互作用,同时解析地标度长程静电相互作用随温度的变化 | NA | 定量预测蛋白质的LCST型相变行为 | 无序蛋白质的热响应相行为 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 原子尺度溶剂化自由能计算,实验浊点测量 | 残基分辨率模型Mpipi-T | 蛋白质序列数据,相变实验数据 | 三个关键蛋白质:hTau40、Pab1、ELF3 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1997 | 2025-10-05 |
Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01976-25
PMID:40824035
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造恶臭假单胞菌,使其能够通过还原甘氨酸途径利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源和能源 | 首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸营养和甲醇营养,通过途径重连和适应性实验室进化实现高效C1同化 | NA | 扩展微生物宿主范围以实现高效C1原料利用,开发碳效率生物制造工艺 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化(ALE),代谢工程,途径工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 质粒整合, 转座子模块 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 还原甘氨酸途径,甲酸脱氢酶途径,甲醇脱氢酶途径 | 工业生物技术, 环境 |
| 1998 | 2025-10-05 |
Engineering chimeric polyhydroxyalkanoate synthases for enhanced copolymerization of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate): A promising biotechnological approach
2025-Sep-10, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133307
PMID:40939657
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研究论文 | 通过交换PHA合酶的N端结构域构建嵌合酶,提高聚羟基脂肪酸酯共聚物中3-羟基己酸酯的掺入效率并优化颗粒形态 | 通过结构域交换构建嵌合PHA合酶,解决了传统嵌合酶设计中的β链干扰问题,实现了3HHx掺入量和颗粒形态的同步优化 | NA | 开发高性能生物可降解塑料的合成生物学策略 | 聚羟基脂肪酸酯合酶(PhaCs) | 合成生物学 | NA | 结构预测、嵌合酶构建 | NA | NA | NA | 结构域交换 | NA | 嵌合酶设计 | 材料, 工业生物技术 |
| 1999 | 2025-10-05 |
DNA Vaccines in the Post-mRNA Era: Engineering, Applications, and Emerging Innovations
2025-Sep-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178716
PMID:40943636
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综述 | 本文全面探讨DNA疫苗在mRNA疫苗时代的技术进展、工程原理、临床应用及创新方向 | 系统阐述DNA疫苗通过合成基因电路、自扩增DNA和DNA编码单克隆抗体等技术实现的免疫原性突破 | NA | 评估DNA疫苗在精准免疫治疗中的技术优势和发展路线 | DNA疫苗技术平台及其临床应用 | 合成生物学 | 传染病、癌症、免疫介导疾病 | 合成基因电路、自扩增DNA、DNA编码单克隆抗体、电穿孔、冻干技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 合成基因电路、自扩增DNA系统、DNA编码单克隆抗体表达系统 | 医学 |
| 2000 | 2025-10-05 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
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综述 | 系统回顾沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性和抗菌潜力 | 聚焦沙特独特生态系统(极端环境等)中放线菌的抗菌潜力,结合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术 | 稀有菌株培养困难、基因组表征有限、生产成本高 | 探索新型抗菌剂以应对抗菌素耐药性 | 沙特阿拉伯不同环境来源的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 放线菌 | NA | 医学, 农业 |