合成生物学相关文章
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当前共找到 3015 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2024-08-07 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
|
综述 | 本文综述了利用核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的最新进展 | 探讨了非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽的共同结构特征，并强调了通过核糖体途径工程模拟非核糖体肽的合成生物学策略 | NA | 旨在概述这一新兴研究领域的最新进展 | 非核糖体肽和核糖体合成及翻译后修饰肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2002 | 2024-08-07 |
Interfacing non-enzymatic catalysis with living microorganisms
2021-Aug-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d1cb00072a
PMID:34458824
|
综述 | 本文综述了非酶催化与细胞代谢界面的新兴方法，用于生产高价值小分子和聚合物 | 该领域结合了合成化学和合成生物学，为可持续化学工业提供了广阔潜力 | NA | 探讨非酶催化与微生物代谢的界面，以及其在高价值分子生产中的应用 | 非酶催化与细胞代谢的界面，以及其在生物聚合物和分子生产中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2003 | 2024-08-07 |
Arabinose-Induced Catabolite Repression as a Mechanism for Pentose Hierarchy Control in Clostridium acetobutylicum ATCC 824
2018 Sep-Oct, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00064-18
PMID:30374459
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研究论文 | 本研究探讨了Clostridium acetobutylicum ATCC 824中阿拉伯糖诱导的分解代谢物阻遏作为戊糖利用层次控制机制的特性 | 揭示了通过预测的Crh进行转录调控的新机制，该机制控制碳水化合物利用的层次，对指导化学品生产的稳健遗传工程策略至关重要 | NA | 研究Clostridium acetobutylicum中戊糖利用层次的转录调控机制 | Clostridium acetobutylicum ATCC 824中的戊糖利用层次 | 生物工程 | NA | 转录组测序（RNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 2004 | 2024-08-07 |
Integration of transcriptional inputs at promoters of the arabinose catabolic pathway
2010-Jun-02, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-75
PMID:20525212
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发了一种能够在活体内实时测量转录因子活性的报告系统，并利用该系统研究了阿拉伯糖分解代谢途径中四个启动子的转录输入整合规则 | 本文采用合成生物学方法，开发了一种新的报告系统来测量活体内的转录因子活性，避免了传统方法中对细胞内浓度、结合亲和力和反应速率的测量需求 | NA | 研究转录因子在活体内的活性以及不同启动子如何整合共同的转录输入 | 阿拉伯糖分解代谢途径中的四个启动子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | 简单模型 | 转录因子活性数据 | NA |
| 2005 | 2024-08-07 |
[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230539
PMID:38658161
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research paper | 本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发 | 该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用，旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力 | NA | 旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力 | 研究生 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2006 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering strategies for de novo biosynthesis of sterols and steroids in yeast
2021-Nov-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-021-00460-9
PMID:38650187
|
综述 | 本文综述了基于调控机制的代谢工程策略，用于提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成 | 介绍了酵母中一些典型甾醇和甾体化合物的最新从头合成进展 | 讨论了当前面临的挑战和未来展望 | 提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成效率 | 甾醇和甾体化合物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 2007 | 2024-08-07 |
Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47592-y
PMID:38632224
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研究论文 | 本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用 | CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构，以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统，实现了在不修改转录因子或启动子的情况下，减少泄漏表达同时保持高表达 | NA | 设计并验证一种新的合成基因电路，用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达 | 合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | 合成基因电路 | 基因表达数据 | NA |
| 2008 | 2024-08-07 |
CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae062
PMID:38346683
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研究论文 | 开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台，用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点 | 利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索，快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点 | NA | 解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题 | CRISPR/Cas系统的中性整合位点 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | ScaNN | 基因组数据 | 涉及三种不同物种：酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞 |
| 2009 | 2024-08-07 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
|
研究论文 | 本文利用γ-修饰的肽核酸（γPNAs）促进靶向特异性DNA入侵，并使用T7核酸内切酶I（T7EI）识别并切割γPNA入侵的DNA，实现双链DNA断裂（DSBs）的引入。 | 开发了一种新的PNA引导的T7EI（PG-T7EI）技术，该技术能够作为可编程核酸酶，在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs，并具有在大型基因组操作中应用的潜力。 | NA | 探索和扩展DNA操作技术，包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。 | γ-修饰的肽核酸（γPNAs）和T7核酸内切酶I（T7EI）在DNA操作中的应用。 | 生物技术 | NA | 肽核酸（PNA）和T7核酸内切酶I（T7EI） | NA | DNA | NA |
| 2010 | 2024-08-07 |
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-Apr-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522
PMID:38460515
|
研究论文 | 本文介绍了ExoGRU机器学习模型，用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率，并通过实验验证了其性能 | 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术，揭示了小RNA分泌的cis和trans因子，包括已知和新发现的RNA结合蛋白 | NA | 揭示小RNA分泌的生物学机制，并探索其在治疗和合成生物学中的应用 | 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | ExoGRU | RNA序列 | NA |
| 2011 | 2024-08-07 |
Self-assembly of stabilized droplets from liquid-liquid phase separation for higher-order structures and functions
2024-Apr-09, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01168-5
PMID:38594355
|
综述 | 本文综述了通过液-液相分离产生的动态微尺度液滴的稳定化策略及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 探讨了如何通过自组装使稳定化的液滴形成更高阶结构，展示协同功能，以充分发挥其在自下而上合成生物学和生物医学应用中的潜力 | NA | 探讨液滴稳定化及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 液-液相分离产生的动态微尺度液滴 | NA | NA | 液-液相分离 (LLPS) | NA | NA | NA |
| 2012 | 2024-08-07 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色的光控制微升尺度水溶液pH值的系统 | 该系统利用两种光驱动质子泵——细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12，在脂质膜中方向相反地排列，将不同颜色的光转化为特定的pH变化 | NA | 开发一种在微升尺度上控制pH值的方法，适用于研究、医学和工业应用 | 工程化蛋白脂质体和光驱动质子泵 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵 | NA | 溶液pH值 | NA |
| 2013 | 2024-08-07 |
To be or not to be a cytochrome: electrical characterizations are inconsistent with Geobacter cytochrome 'nanowires'
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1397124
PMID:38633696
|
研究论文 | 本文通过电学特性分析，对Geobacter细胞色素'纳米线'的身份进行了探讨 | 结合先前的结构计算和动力学分析，提出了至少需要约7条细胞色素'纳米线'来承载细胞的呼吸通量 | 文章指出先前的电学和光谱结构表征可能因实验伪影和样品杂质而不适用于已知的细胞色素纤维 | 阐明生理金属-微生物相互作用的机制，并推进合成生物学努力以优化这些相互作用 | Geobacter细胞色素的'纳米线' | 生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 电学和光谱数据 | NA |
| 2014 | 2024-08-07 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-Oct-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
|
研究论文 | 本文报道了在非固氮宿主大肠杆菌中异源合成氮酶P-和M-簇核心的成功 | 首次通过生化和光谱分析证明了在非固氮宿主中成功合成P-和L-簇 | NA | 研究氮酶的异源表达及其生物合成机制 | 氮酶的P-和M-簇核心 | 生物化学 | NA | 电子顺磁共振(EPR)、X射线吸收光谱(XAS)/扩展X射线吸收精细结构(EXAFS) | NA | 生化数据 | NA |
| 2015 | 2024-08-07 |
Research progress of multi-enzyme complexes based on the design of scaffold protein
2023-Oct-23, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00695-8
PMID:38647916
|
综述 | 本文综述了基于支架蛋白设计的多酶复合体在分子酶工程中的设计策略和应用进展 | NA | NA | 探讨多酶复合体的设计策略及其在合成生物学中的应用 | 多酶复合体及其在酶级联反应中的应用 | 分子酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2016 | 2024-08-07 |
De novo synthesis of nervonic acid and optimization of metabolic regulation by Yarrowia lipolytica
2023-Oct-06, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00689-6
PMID:38647797
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在Yarrowia lipolytica中构建了nervonic酸的从头合成途径，并通过代谢工程和发酵优化进一步提高了nervonic酸的产量 | 成功表达和评估了来自不同生物的异源延长酶和脱饱和酶，用于在Y. lipolytica中生产nervonic酸，并分析了添加菜籽油作为辅助碳源对nervonic酸生产的潜力 | NA | 开发一种高效的生产nervonic酸的方法，以替代传统的天然提取或化学合成方法 | nervonic酸的合成及其在Yarrowia lipolytica中的代谢调控 | 合成生物学 | 脑神经系统疾病 | 代谢工程 | NA | NA | 最高浓度达到185.0 mg/L |
| 2017 | 2024-08-07 |
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac733
PMID:36100255
|
研究论文 | 本文通过新的结构和生化数据，提出了一种新的Tn3解离酶复合体（synaptosome）的详细模型，并讨论了其如何利用DNA拓扑结构来调节重组酶的酶活性 | 本文提出了一个新的、详细的Tn3解离酶复合体模型，该模型基于新的结构和生化数据，解决了之前模型与实验数据不一致的问题 | NA | 研究Tn3解离酶如何通过DNA拓扑结构来调节其酶活性 | Tn3解离酶及其复合体（synaptosome） | NA | NA | NA | NA | 结构和生化数据 | NA |
| 2018 | 2024-08-07 |
Construction of the genetic switches in response to mannitol based on artificial MtlR box
2023-Jan-30, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-023-00634-7
PMID:38647829
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠的工作流程，用于设计两种类型的遗传元件：基于MtlR盒的开关元件和基于catabolite control protein A (CcpA)盒的转录调控元件，这些元件能够响应甘露醇进行ON/OFF状态的选择。 | 本研究通过理性设计MtlR盒和CcpA盒，实现了对遗传开关的灵活调控，显著提高了开关对诱导物的敏感性，并大幅降低了OFF状态的值。 | 由于对特定转录因子与其目标基因相互作用的分子机制理解不足，遗传开关的理性设计进展有限。 | 设计新型的遗传开关，以在合成生物学中实现代谢途径的精确控制。 | 基于MtlR盒和CcpA盒的遗传开关元件。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传元件 | NA |
| 2019 | 2024-08-07 |
Minimization and optimization of α-amylase terminator for heterologous protein production in Bacillus licheniformis
2022-Oct-10, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00597-1
PMID:38647575
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研究论文 | 本研究对芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1进行了特性分析和优化，以提高其在异源蛋白生产中的终止效率 | 通过多方面优化策略，成功提高了终止子T1的终止效率，并验证了其在蛋白表达中的通用性 | NA | 解决芽孢杆菌中缺乏可用和通用终止子的问题，扩展合成生物学工具箱 | 芽孢杆菌中的α-淀粉酶终止子T1及其优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2020 | 2024-08-07 |
Towards green biomanufacturing of high-value recombinant proteins using promising cell factory: Chlamydomonas reinhardtii chloroplast
2022-Aug-13, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-022-00568-6
PMID:38647750
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综述 | 本文综述了利用Chlamydomonas reinhardtii叶绿体作为绿色工厂生产重组蛋白的最新技术进展及其影响因素 | 探讨了Chlamydomonas reinhardtii叶绿体作为合成生物学平台的巨大潜力，并介绍了新的遗传工具和策略 | 需要开发更多针对叶绿体的技术和工具包以实现高效的标记无编辑，并探索影响蛋白表达的新遗传元素和选择标记 | 探讨如何利用Chlamydomonas reinhardtii叶绿体高效生产重组蛋白 | Chlamydomonas reinhardtii叶绿体及其在重组蛋白生产中的应用 | NA | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |