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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2026-03-23 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | 介绍GENETTA软件工具,该工具利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作 | 通过图论方法将复杂合成生物学设计表示为网络,支持动态可视化定制和多数据库数据整合 | NA | 开发用于分析和操作复杂合成生物学设计的网络工具 | 合成生物学设计 | 合成生物学 | NA | 图论 | NA | 设计数据 | NA | NA | NA | 交互网络和部件层次结构 | 工业生物技术 |
| 2042 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发,系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果,并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物(多糖、萜类、多酚、生物碱)及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2043 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 2044 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 2045 | 2026-03-22 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-08, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文综述了21世纪农业中合成生物学的前景,重点介绍了植物合成生物学在增强粮食安全、应对气候变化和促进可持续农业方面的创新应用 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,精准修饰植物基因组以提升产量、胁迫耐受性和养分利用效率,并结合人工智能优化设计 | 面临监管审批和公众接受度方面的挑战,且需要严格的多领域测试以确保可重复性 | 探讨合成生物学在农业中的应用潜力,以解决全球粮食安全和环境可持续性问题 | 植物基因组及其在光合效率、固氮、耐旱、病原抗性、养分利用效率、生物强化、气候韧性等关键农业性状的工程化改造 | NA | NA | 合成生物学、遗传工程、计算建模、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 合成植物基因组、生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 农业 |
| 2046 | 2026-03-22 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-03, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米氮素吸收、同化和再动员的遗传与分子调控机制,旨在提高氮素利用效率 | 整合了根际微生物组对氮素利用效率的影响以及植物-微生物互作机制,并倡导利用遗传多样性和合成生物学进行综合研究 | NA | 提高玉米氮素利用效率,促进可持续农业发展 | 玉米 | NA | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 2047 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能,包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环(还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环),并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设,实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能,以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径,包括天然和人工循环,如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径,包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 2048 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用,通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物,从而维持高尔基体中的半纤维素生产,这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者,以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥(Arabidopsis)的MAN2和MAN5酶,以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 2049 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程,用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路,并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路,利用数学模型推断动态原理,并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路,可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择,评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路(逆变器) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路(逆变器)、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 2050 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势,即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢,为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解,并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 2051 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶,显著提升了其催化活性和热稳定性,并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程,通过改造底物结合腔和优化相互作用,大幅提升了酶活性和热稳定性,并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性,也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略,实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体,以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 2052 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 2053 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力,并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力,探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine(一种细菌来源的胞外保护化合物) | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 2054 | 2026-03-20 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文是一篇关于微生物系统生态学(MSE)框架如何帮助理解微生物组中交叉喂养的迷你综述 | 提出了一个结合自上而下和自下而上方法的微生物系统生态学框架,用于解析微生物群落组装的确定性过程,特别适用于合成生物学和微生物组工程 | NA | 探讨微生物系统生态学框架在理解微生物交叉喂养和群落组装机制方面的应用 | 微生物群落及其交叉喂养相互作用 | 微生物生态学 | NA | 基因组尺度代谢网络重建、整合组学数据 | 代谢建模 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物组工程 |
| 2055 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
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综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台,并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系,支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术,以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 2056 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 2057 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR)在信号传导架构上的差异,并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异,并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略,以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效,通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 2058 | 2026-03-19 |
The Role of Bacterial Outer Membrane Vesicles in Tumor Development: Facts, Potential Applications and Future Perspectives
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S582600
PMID:41847176
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡在肿瘤发展中的作用,包括其促进或抑制肿瘤的机制,以及作为工程化纳米疫苗和免疫治疗剂的转化潜力 | 系统性地将OMVs的作用与癌症的14个标志对齐,并探讨了其作为可编程纳米平台的工程化应用前景 | NA | 探讨细菌外膜囊泡在肿瘤生物学中的角色及其在癌症预防、诊断和治疗中的潜在应用 | 细菌外膜囊泡及其在肿瘤发展中的机制 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌 | 可编程囊泡设计 | 医学 |
| 2059 | 2026-03-19 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文通过单分子力谱技术结合微流控增强光阱和粗粒度模拟,研究了toehold介导的链置换过程的单分子动力学 | 首次在单分子水平上实时观察TMSD过程,实现了微秒和纳米级分辨率,并揭示了序列效应在链置换中的重要性 | NA | 探究toehold介导的链置换在单分子层面的动力学特性 | DNA和RNA链的toehold介导链置换过程 | NA | NA | 单分子力谱、微流控增强光阱、粗粒度模拟 | NA | 力谱数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 核酸纳米技术、合成生物学 |
| 2060 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
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综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术,探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制,并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物(包括古菌、细菌和真核生物)及其酶(极端酶) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑,基因组尺度代谢模型,比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术,环境 |