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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2061 | 2024-08-07 |
Adhesion of Active Cytoskeletal Vesicles
2018-12-18, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2018.10.013
PMID:30455042
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计了一个最小实验模型,用于理解形状重塑在粘附过程中的作用,特别是通过调整细胞骨架囊泡的大小、体积和细胞骨架收缩性来实现强粘附。 | 首次展示了细胞骨架囊泡在主动重塑肌动蛋白皮质的情况下能够维持与固体基质的强粘附,并揭示了变形性和粘附强度之间的平衡是实现粘附的关键。 | NA | 理解形状重塑在粘附过程中的作用 | 细胞骨架囊泡的粘附机制 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 囊泡 | 有限数量的构建块 |
2062 | 2024-08-07 |
Biosafety and biosecurity: treading China's synbio tightrope
2024-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.014
PMID:37957090
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research paper | 本文分析了中国在合成生物学领域如何在促进创新与实施严格监管之间进行复杂平衡 | NA | NA | 探讨如何在中国合成生物学领域增强生物安全和生物安保,以及提升公众信任 | 中国合成生物学领域的创新与监管平衡 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2063 | 2024-08-07 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-Apr, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本文报道了使用生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装合成基于酶促聚合物的人工细胞,这些人工细胞能够表达蛋白质 | 利用生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装技术,合成了能够表达蛋白质的人工细胞,这些细胞能够模拟细菌的微观反应隔室,并在诱导下表达遗传信息 | NA | 开发一种新型的基于酶促聚合物的人工细胞,以模拟自然细胞的功能并应用于分子系统工程和合成生物学途径 | 人工细胞的合成及其在表达蛋白质和生物矿化中的应用 | 合成生物学 | NA | 生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | 微粒 | 包括酶、纳米颗粒、微粒、质粒和细胞裂解物在内的多种货物被封装在人工细胞中 |
2064 | 2024-08-07 |
Design of a Biohybrid Materials Circuit with Binary Decoder Functionality
2024-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202308092
PMID:38118057
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研究论文 | 本文设计了一种基于蛋白酶的生物混合材料电路,具有二进制解码功能 | 开发了一组可通过诱导或抑制其生物活性来调控的蛋白酶基生物混合模块,并将其应用于材料中进行信息处理 | NA | 将合成生物学中的计算功能转移到材料系统中,实现高级信息处理电路的实现 | 蛋白酶基生物混合模块及其在材料中的应用 | 生物技术 | NA | 生物工程 | NA | 生物分子 | 2输入/4输出二进制解码器 |
2065 | 2024-08-07 |
Multiplex Functional Characterization of Protein Variant Libraries in Mammalian Cells with Single-Copy Genomic Integration and High-Throughput DNA Sequencing
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_10
PMID:38441763
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研究论文 | 本文开发了一种利用Bxb1噬菌体DNA重组酶在细胞基因组中预设的“着陆垫”位点插入单个无启动子质粒的哺乳动物合成生物学平台,以实现大规模并行遗传分析 | 该平台通过基因组整合的启动子确保每个细胞只表达一个转基因,保持严格的基因型-表型联系,并能对选定的细胞进行测序以赋予每个变体表型评分 | NA | 开发一种新的方法来同时表征编码数千种独特蛋白质变体的库的基因型-表型关系 | 蛋白质变体库在哺乳动物细胞中的功能表征 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序 | NA | DNA序列 | 数千种独特蛋白质变体 |
2066 | 2024-08-07 |
A Unifying Mathematical Framework for Genetic Robustness, Environmental Robustness, Network Robustness and their Trade-offs on Phenotype Robustness in Biological Networks. Part III: Synthetic Gene Networks in Synthetic Biology
2013, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.4137/EBO.S10686
PMID:23515190
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研究论文 | 本文提出了一种统一的数学框架,用于研究合成生物学中合成基因网络的鲁棒稳定性和环境干扰抑制原理 | 提出了一个统一的数学框架,用于分析合成基因网络中的鲁棒性和环境干扰抑制,并定义了表型鲁棒性的标准 | NA | 研究生物网络中的鲁棒稳定性和环境干扰抑制,并探讨其在合成生物学中的应用 | 合成生物学中的合成基因网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2067 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体(TERMs)的神经网络模型,提出了一种新的蛋白质设计方法,通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合,提出两种神经网络架构(TERMinator和COORDinator),用于生成序列空间的Potts模型,并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能,如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA |
2068 | 2024-08-07 |
The genome sequence of Propionibacterium acidipropionici provides insights into its biotechnological and industrial potential
2012-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/1471-2164-13-562
PMID:23083487
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研究论文 | 本文分析了产丙酸菌Propionibacterium acidipropionici的基因组,探讨其在生物技术和工业应用中的潜力 | 发现了P. acidipropionici基因组中编码蛋白基因数量增加,涉及基因组完整性维护的基因增多,以及存在与碳代谢调控相关的基因 | 未发现磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶编码基因,但确认了丙酮酸羧化酶基因及其酶的存在 | 研究P. acidipropionici的基因组特征,评估其在化学品生产中的应用潜力 | Propionibacterium acidipropionici的基因组及其生物学功能 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单个微生物样本Propionibacterium acidipropionici (ATCC 4875) |
2069 | 2024-08-07 |
CRISPRi-induced transcriptional regulation of IAH1 gene and its influence on volatile compounds profile in Kluyveromyces marxianus DU3
2024-Mar-05, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-023-03811-0
PMID:38441729
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研究论文 | 本研究利用CRISPR干扰技术下调Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因表达,并分析其对挥发性化合物代谢谱的影响 | 首次在Kluyveromyces marxianus中应用CRISPRi技术进行基因表达的靶向调控,为代谢工程和合成生物学策略提供了新途径 | NA | 研究IAH1基因下调对Kluyveromyces marxianus中挥发性化合物代谢谱的影响 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因及其编码的酯酶 | 代谢工程 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 基因表达数据 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株 |
2070 | 2024-08-07 |
Fast-growing cyanobacterial chassis for synthetic biology application
2024-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2166455
PMID:36842999
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综述 | 本文综述了快速生长的蓝细菌作为合成生物学应用底盘的研究进展 | 介绍了近年来快速生长的蓝细菌新品种及其在将二氧化碳转化为化学品中的应用,以及为这些新蓝细菌底盘开发的遗传工具箱 | 当前蓝细菌底盘的生长速度慢和生物量积累低,导致大多数产品的生产率仍低于大规模商业应用所需的阈值 | 探讨开发具有快速生长和/或更高生物量积累能力的高效蓝细菌底盘 | 快速生长的蓝细菌底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2071 | 2024-08-07 |
The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018
PMID:38572104
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落,探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用,以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。 | 强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。 | NA | 深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用,并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。 | 肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2072 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel,用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统,独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能,并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究,并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 |
2073 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全,旨在保护人类隐私、自主权和安全,与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险,并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法,以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA |
2074 | 2024-08-07 |
Engineering Cyborg Bacteria Through Intracellular Hydrogelation
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204175
PMID:36628538
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research paper | 本文首次创建了名为Cyborg Cells的混合材料-细胞实体,通过在每个细菌内部组装合成聚合物网络,使其失去分裂能力,同时保留了细胞代谢、运动、蛋白质合成等基本功能,并获得了抵抗压力因素的新能力,还展示了其对癌细胞的侵入治疗潜力。 | 首次创建了Cyborg Cells,结合了细胞内人造聚合物与活细胞蛋白质网络的相互作用,为细胞生物工程建立了新的范式。 | NA | 探索细胞生物工程的新方法,通过创建Cyborg Cells来实现更可控的生物医学应用。 | Cyborg Cells及其在生物医学应用中的潜力。 | synthetic biology | NA | intracellular hydrogelation | NA | NA | NA |
2075 | 2024-08-07 |
Engineering CAR T cells for enhanced efficacy and safety
2022-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0073746
PMID:35071966
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法优化嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的最新进展,旨在提高其对实体瘤的疗效和安全性 | 讨论了CAR和其他非CAR分子的改进策略,以及可由环境信号和/或外部刺激控制的诱导型CAR T细胞的开发 | NA | 提高CAR T细胞疗法的疗效和安全性,特别是针对实体瘤 | CAR T细胞疗法的优化策略 | 生物技术 | 血液恶性肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2076 | 2024-08-07 |
Temporal signaling, population control, and information processing through chromatin-mediated gene regulation
2022-02-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2021.110977
PMID:34919934
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研究论文 | 本文构建了一个数学框架,用于分析含有染色质调节因子的遗传电路对哺乳动物细胞群体中时间信号的响应 | 展示了染色质介导的基因控制能够实现复杂的细胞群体对时间信号的响应,并且能够传输比先前测量在基因调节中更高的信息水平 | NA | 研究染色质调节在细胞对时间刺激响应中的作用,并探索其在合成生物学应用中的潜力 | 染色质调节因子在遗传电路中的作用及其对时间信号的响应 | 合成生物学 | NA | 数学建模 | NA | 时间序列数据 | 哺乳动物细胞群体 |
2077 | 2024-08-07 |
Lipid membranes modulate the activity of RNA through sequence-dependent interactions
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119235119
PMID:35042820
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研究论文 | 本文研究了脂质膜如何通过序列依赖性相互作用调节RNA的活性 | 首次展示了脂质膜作为RNA组织平台的机制,并介绍了RNA-脂质相互作用作为开发合成核糖开关和基于RNA的脂质生物传感器的新工具 | NA | 阐明RNA生物活性的控制机制,以及其在生理角色和合成生物学中的潜在应用 | RNA与脂质膜的相互作用及其对RNA活性的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2078 | 2024-08-07 |
Making Sense of "Nonsense" and More: Challenges and Opportunities in the Genetic Code Expansion, in the World of tRNA Modifications
2022-Jan-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020938
PMID:35055121
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展(GCE)在增强蛋白质结构特性和功能方面的最新进展,并讨论了tRNA修饰和代谢在蛋白质设计中的新兴影响 | 遗传密码扩展通过引入非规范氨基酸(ncAAs),增强了蛋白质的功能性和结构特性,为生物化学、生物物理和细胞研究提供了广泛的应用潜力 | 不同的中介因素降低了非规范氨基酸在合成蛋白质中的掺入产量和效率 | 探讨遗传密码扩展在提高非规范氨基酸掺入效率中的相关性和系统生物学的作用 | 遗传密码扩展技术及其在蛋白质设计和合成蛋白治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
2079 | 2024-08-07 |
The Systems and Synthetic Biology of Auxin
2022-01-04, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a040071
PMID:34127446
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研究论文 | 本文综述了生长素生物学领域在解析植物生长网络结构、动态和控制方面的进展,强调了系统生物学和合成生物学方法的结合 | 通过结合系统生物学和合成生物学的互补方法,推动了对生长素控制植物生长、发育和生理的理解和工程化 | NA | 探讨生长素生物学领域的发展,并强调系统生物学和合成生物学方法的结合 | 生长素的生物学机制及其在植物生长和发育中的作用 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2080 | 2024-08-07 |
Advances in the design and development of SARS-CoV-2 vaccines
2021-12-16, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-021-00360-1
PMID:34911569
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综述 | 本文综述了针对COVID-19的预防性和治疗性疫苗设计的最新进展 | 介绍了基于病毒载体、纳米科学和合成生物学的新型疫苗 | 临床试验中仍存在许多挑战 | 探讨SARS-CoV-2疫苗的设计与开发 | COVID-19疫苗 | NA | 冠状病毒病 | NA | NA | NA | NA |