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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2121 | 2024-08-07 |
Design and assembly of DNA molecules using multi-objective optimization
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab026
PMID:34676304
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研究论文 | 本文开发了一种新的开源算法,用于DNA工程的多目标优化设计与组装 | 提出了一种新的多目标优化算法,用于DNA设计和组装,能够平衡设计要求和制造约束 | NA | 解决生物系统工程中制造约束与设计过程整合不足的问题 | DNA分子从基因到基因组的设计与组装 | 合成生物学 | NA | 多目标优化算法 | NA | NA | NA |
2122 | 2024-08-07 |
paraSBOLv: a foundation for standard-compliant genetic design visualization tools
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab022
PMID:34712845
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研究论文 | 本文介绍了一个名为paraSBOLv的Python包,该包通过使用机器可读的参数化符号定义,使SBOLv符号的完整套件可访问,从而简化了图形的渲染过程并允许对生成的图形进行广泛的自定义 | paraSBOLv通过使用机器可读的参数化符号定义,简化了符号渲染过程,并支持高度专业化的生物设计可视化工具的开发 | NA | 加速高度专业化的生物设计可视化工具的开发,并为更复杂的软件提供基础 | 开发支持SBOLv标准的遗传设计可视化工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2123 | 2024-08-07 |
A short review on cell-based biosensing: challenges and breakthroughs in biomedical analysis
2020-Dec-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.34.20200128
PMID:33888671
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综述 | 本文综述了基于细胞的生物传感器的最新进展,重点介绍了其在生物医学分析中的挑战和突破 | 介绍了基于细胞的生物传感器在生物医学分析中的新概念和合成生物学工具箱的应用,以及如何开发具有定制性能的生物传感平台 | NA | 旨在激发对基于细胞的生物传感器的兴趣,并提高其接受度和应用 | 基于细胞的生物传感器及其在生物医学分析中的应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2124 | 2024-08-07 |
Engineered dCas9 with reduced toxicity in bacteria: implications for genetic circuit design
2018-11-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky884
PMID:30289463
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研究论文 | 本文通过消除dCas9的PAM结合位点并恢复其DNA结合能力,构建了一种在细菌中低毒性的dCas9变体,用于遗传电路设计。 | 引入了一种非毒性的dCas9变体dCas9*_PhlF,通过R1335K突变消除PAM结合,并与PhlF抑制因子融合,从而在Escherichia coli中显著降低毒性。 | 同时使用多个sgRNA会导致抑制效果单调下降,当同时表达15个sgRNA时,动态范围小于10倍。 | 开发一种在细菌中低毒性的dCas9变体,以促进其在代谢工程和合成生物学中的应用。 | dCas9的毒性及其在遗传电路设计中的应用。 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | dCas9*_PhlF | 基因表达数据 | 30个正交sgRNA-启动子对 |
2125 | 2024-08-07 |
Bayesian Phylogeography and Pathogenic Characterization of Smallpox Based on HA, ATI, and CrmB Genes
2018-11-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msy153
PMID:30099520
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研究论文 | 本研究利用HA、ATI和CrmB基因进行贝叶斯离散特征系统地理学分析,以探索天花病毒的系统发育特征和历史国际传播情况 | 本研究展示了多基因模型在区分VARV Major和VARV Minor亚支中的应用,并提供了历史国际VARV传播的实证 | 当全基因组测序不可用时,基于HA、ATI和CrmB的系统地理学模型提供的传播估计可能存在不确定性 | 探索在全基因组测序不可用的情况下,使用HA、ATI和CrmB基因进行系统发育和系统地理学分析的可行性,以支持天花疫情响应 | 天花病毒的系统发育和系统地理学特征 | NA | 天花 | 贝叶斯离散特征系统地理学 | 多基因模型 | 基因序列 | 51个全基因组序列和20个部分序列的天花病毒分离株 |
2126 | 2024-08-07 |
A synthetic biology-based device prevents liver injury in mice
2016-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2016.03.020
PMID:27067456
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的装置,该装置通过检测血清胆酸水平并产生治疗性肝细胞生长因子,保护小鼠免受药物诱导的急性肝衰竭 | 本文创新性地设计了一个闭环合成信号网络,通过激活外源表达的TGR5与人工启动子控制的肝细胞生长因子转录相连接,实现了对肝损伤相关血清胆酸水平的自我调节和剂量依赖性响应 | NA | 开发一种新的预防、急性及慢性医疗保健的方法 | 小鼠的肝脏损伤 | 合成生物学 | 肝病 | 基因工程 | 合成基因电路 | NA | 小鼠 |
2127 | 2024-08-07 |
Functional characterization of four mono-terpene synthases (TPSs) provided insight into the biosynthesis of volatile monoterpenes in the medicinal herb Blumea balsamifera
2023-Apr, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-023-01306-8
PMID:37187774
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研究论文 | 本研究通过转录组测序结合代谢组学分析,筛选并克隆了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶基因,并通过异源表达和体外酶活性测定验证了其功能 | 首次鉴定并功能验证了Blumea balsamifera中的四种单萜合酶,揭示了其挥发性单萜的生物合成途径 | NA | 旨在通过生物工程手段缓解Blumea balsamifera资源短缺问题,并提高其活性成分的产量 | Blumea balsamifera中的单萜合酶基因及其编码的酶 | 生物工程 | NA | 转录组测序,代谢组学分析,异源表达,体外酶活性测定 | NA | 基因序列,代谢物 | 根、茎、叶中的基因和代谢物 |
2128 | 2024-08-07 |
Optimized cDICE for Efficient Reconstitution of Biological Systems in Giant Unilamellar Vesicles
2021-07-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00068
PMID:34185516
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研究论文 | 本文展示了通过优化连续液滴界面交叉封装(cDICE)方法,生成含有复杂生物化学系统的无缺陷巨型单层囊泡(GUVs) | 通过严格控制环境条件和调整脂质-油分散体,显著提高了高质量GUV形成的可重复性和封装效率 | NA | 提高巨型单层囊泡中生物系统的封装效率和质量 | 巨型单层囊泡及其在生物系统中的应用 | 生物物理学 | NA | 连续液滴界面交叉封装(cDICE) | NA | 囊泡 | 多种生物系统,包括最小肌动蛋白细胞骨架、膜锚定DNA纳米结构和功能性PURE系统 |
2129 | 2024-08-07 |
Integrating Systems and Synthetic Biology to Understand and Engineer Microbiomes
2021-07-13, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学理解及工程化微生物组的方法 | 讨论了多组学和建模方法的集成,以解决微生物组工程中的关键知识和技术的空白 | NA | 探讨如何利用系统生物学和合成生物学工具理解微生物组并设计工程化微生物组 | 微生物组的组成和功能及其在农业、医学和生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 多组学技术 | 计算模型 | 微生物组数据 | NA |
2130 | 2024-08-07 |
Present and future prospects for wheat improvement through genome editing and advanced technologies
2021-07-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2021.100211
PMID:34327324
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综述 | 本文综述了通过基因编辑和其他先进技术改善小麦的研究现状和未来前景 | 介绍了基因编辑技术在小麦功能基因组学和遗传改良中的应用,并讨论了其他技术如GWAS、高通量基因型和表型分析、快速育种和合成生物学在小麦研究中的应用 | 小麦的六倍体基因组和基因冗余复杂化了遗传研究和精确基因修饰的进展 | 探讨如何通过尖端技术提高小麦生产的韧性,同时减少环境污染,确保全球粮食和生态系统安全 | 小麦 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
2131 | 2024-08-07 |
Realities and hopes in the application of microbial tools in agriculture
2021-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13866
PMID:34156754
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研究论文 | 本文探讨了微生物工具在农业中的应用现状与前景 | 提出了通过现场微生物群落操作方法,如使用含有合成微生物群落和新型益生元的产品,来克服当前限制的潜力 | 微生物工具在田间条件下的低效力和性能不一致是需要解决的主要限制 | 探讨微生物工具在可持续提高农业生产中的应用及其对其他可持续发展目标的贡献 | 微生物工具在农业中的应用及其市场发展 | NA | NA | 合成生物学和纳米生物技术 | NA | NA | NA |
2132 | 2024-08-07 |
Increasing MinD's Membrane Affinity Yields Standing Wave Oscillations and Functional Gradients on Flat Membranes
2021-05-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00604
PMID:33881306
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研究论文 | 本文通过调节MinD蛋白的膜亲和性,实现了在平坦脂质膜上的驻波振荡和功能梯度的形成 | 通过理性引导的突变延长MinD的膜定位序列,实现了不同于常见的行波或静态模式的驻波振荡 | NA | 探索通过分子自组织形成大规模模式的基本原理,并应用于合成生物学中的蛋白质模式和梯度的工程化 | 细菌MinDE蛋白系统中的MinD和MinE蛋白在脂质膜上的自组织行为 | 合成生物学 | NA | 理性引导的突变 | NA | 蛋白质模式 | NA |
2133 | 2024-08-07 |
Synthetic living machines: A new window on life
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102505
PMID:34041452
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综述 | 本文综述了合成形态发生领域的最新进展,重点介绍了通过生物工程创造新型多细胞生物体的研究 | 该研究通过创建新型合成生物形式,扩展了现有的模型系统,超越了进化的植物和动物谱系 | NA | 旨在通过工程方法解决我们对形态发生中尺度规则理解上的空白,并推动合成生物学的发展 | 合成生物学中的新型多细胞生物体及其在医学和生物学基础问题理解上的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2134 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of Nature-Inspired Unnatural Cannabinoids
2021-May-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26102914
PMID:34068935
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综述 | 本文综述了天然大麻素的生物合成途径及其在异源宿主中的合成生物学研究 | 通过合成生物学和代谢工程,可以在异源宿主中高效合成低产量的稀有大麻素,并探索新型衍生化合物的生物活性 | NA | 探讨大麻素的生物合成途径及其作为治疗剂的潜力 | 大麻素及其衍生物的生物合成和生物活性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA |
2135 | 2024-08-07 |
Novel synthetic biology approaches for developmental systems
2021-05-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.04.007
PMID:33979593
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学工具在研究和发展系统中的应用,特别是在干细胞器官模型、胚胎模式形成和非发育系统的模式形成与形态发生中的应用。 | 介绍了合成生物学工具在三个特定领域的应用,包括干细胞器官模型、用户定义的扰动研究胚胎模式形成以及使用合成遗传电路的非发育系统模式形成与形态发生模型。 | NA | 研究和发展系统中的自组织能力及其控制。 | 干细胞器官模型、胚胎模式形成、非发育系统的模式形成与形态发生。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | 合成遗传电路 | NA | NA |
2136 | 2024-08-07 |
Microbial methionine transporters and biotechnological applications
2021-May, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-021-11307-w
PMID:33929594
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综述 | 本文综述了微生物甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其在生物技术应用中的研究进展 | 探讨了甲硫氨酸转运蛋白在发酵生产和合成生物学系统中的应用潜力 | NA | 总结甲硫氨酸转运蛋白的当前知识,并探讨其在生物技术和合成生物学中的应用 | 甲硫氨酸转运蛋白的四个家族及其功能、基因调控和生物技术应用 | 生物技术 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
2137 | 2024-08-07 |
Developments in Nano-materials and Analysing its role in Fighting COVID-19
2021, Materials today. Proceedings
DOI:10.1016/j.matpr.2021.05.020
PMID:33996513
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研究论文 | 本文探讨了纳米材料在抗击新冠病毒中的应用及其发展,包括其在疫苗和抗病毒药物开发中的作用 | 介绍了纳米材料在制造特殊口罩、细菌捕捉技术和手消毒剂中的创新应用 | NA | 分析和讨论纳米材料在抗击和预防新冠病毒传播中的有效性 | 纳米材料,包括银、铁、陶瓷、石墨烯碳纳米管等 | NA | 新冠病毒 | 纳米材料 | NA | NA | NA |
2138 | 2024-08-07 |
Producing molecular biology reagents without purification
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0252507
PMID:34061896
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研究论文 | 本文介绍了一种简化方法,用于制备细胞性试剂,即通过低温干燥过度表达目标蛋白的细菌,以替代商业纯酶在典型诊断和分子生物学反应中的应用 | 开发了一种简化的细胞性试剂制备方法,仅需要常见的细菌培养箱和廉价的化学干燥剂,使得该技术更易于广泛访问和本地生产 | NA | 旨在简化细胞性试剂的制备过程,使其更易于本地生产和广泛应用 | 细胞性试剂的制备方法及其在分子和合成生物学过程中的应用 | 分子生物学 | NA | PCR, qPCR, 反向转录, 等温扩增, Golden Gate DNA组装 | NA | NA | 在英国、喀麦隆和加纳等多个国家成功实施了该简化程序并制备了细胞性试剂 |
2139 | 2024-08-07 |
Further Biochemical Profiling of Hypholoma fasciculare Metabolome Reveals Its Chemogenetic Diversity
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.567384
PMID:34109161
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研究论文 | 本研究进一步分析了Hypholoma fasciculare的代谢组,揭示了其化学遗传多样性 | 利用现代真菌分子和合成生物学工具,探索蘑菇真菌作为新型治疗药物的潜力 | NA | 研究九种担子菌的次级代谢产物,筛选其生物和化学特性,并调查与其生产相关的遗传途径 | 九种担子菌的次级代谢产物及其生物和化学特性 | NA | NA | 基因组比较和色谱研究 | NA | 基因组数据 | 九种担子菌 |
2140 | 2024-08-07 |
Altering Compositional Properties of Viral Genomes to Design Live-Attenuated Vaccines
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.676582
PMID:34276608
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研究论文 | 本文讨论了通过修改病毒基因组的组成特性来设计新型减毒活疫苗的不同方法 | 利用合成生物学技术和对病毒基因组组成特性的深入理解,探索了通过理性遗传设计实现病毒减毒的新策略 | NA | 开发新型减毒活疫苗 | 病毒基因组的组成特性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因组 | NA |