合成生物学相关文章
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当前共找到 3015 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Heterologous Synthesis Paving Way for Future Green-Modular Bioindustries: A Review With Special Reference to Isoflavonoids
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.673270
PMID:34277582
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综述 | 本文综述了异源合成在促进未来绿色模块化生物工业中的最新进展，特别关注了异黄酮类化合物 | 随着代谢工程的进步和先进合成生物学工具的可用性，预计将很快设计出高度高效的异源宿主以满足不断增长的市场需求 | 目前的生产方法受限于缓慢的酶动力学和传统的繁琐遗传工程方法，需要进一步优化和发展以满足商业应用所需的滴定度、反应速率和产量 | 探讨异源合成在生物工业中的应用，特别是异黄酮类化合物的合成 | 异黄酮类化合物的生物合成途径及其在植物和动物中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | 已鉴定出超过2,400种异黄酮类化合物，主要来自豆科植物 |
| 2142 | 2024-08-07 |
Bioelectronics communication: encoding yeast regulatory responses using nanostructured gallium nitride thin films
2018-Jun-21, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c8nr03684e
PMID:29888776
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研究论文 | 研究展示了如何利用纳米结构的氮化镓薄膜编码酿酒酵母的生理反应 | 首次展示了氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | NA | 探索氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | 酿酒酵母的生理反应 | 生物电子学 | NA | 光电流测量、原子力显微镜和开尔文探针力显微镜 | NA | 纳米结构薄膜 | NA |
| 2143 | 2024-08-07 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/Cas9介导的单倍体化方法，用于在酵母中高效组装和传递大型DNA，从而增强宿主的生物合成能力 | 开发了一种名为HAnDy的新方法，无需复杂的体外操作即可实现大型DNA的高效组装和传递 | NA | 开发一种新方法，用于在酵母中高效组装和传递大型DNA，以扩展和解读复杂的生物功能 | 设计了一个1.024 Mb的合成辅助染色体（synAC），编码542个外源基因，并将其传递到六种不同系统发育的酵母中 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 六种不同系统发育的酵母 |
| 2144 | 2024-08-07 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-Mar-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 本文展示了两种高效克隆117 kb的Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组的方法 | 开发了两种新的叶绿体基因组克隆方法，效率高达90%至100%，并可稳定维持和传播于大肠杆菌中 | 方法可能仅适用于具有相似叶绿体基因组大小和结构的物种 | 开发新的叶绿体基因组克隆技术，以扩展合成生物学底盘的选择 | Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | PCR扩增、酵母重组 | NA | DNA | 至少10个酵母菌落 |
| 2145 | 2024-08-07 |
GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes
2024-Mar-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05746-1
PMID:38549073
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM，用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K | GraphKM结合了图神经网络（GNN）、全连接层和梯度提升框架，通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶，以构建模型输入 | 现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶，如少数酶或野生型酶 | 提高酶动力学研究的步伐，通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量 | 野生型和突变酶的Michaelis常数K | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络（GNN）、全连接层、梯度提升框架 | 分子图、文本 | 独立K数据集HXKm |
| 2146 | 2024-08-07 |
Virus Eradication and Synthetic Biology: Changes with SARS-CoV-2?
2021-03-28, Viruses
DOI:10.3390/v13040569
PMID:33800626
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在病毒消除中的作用，特别是针对SARS-CoV-2的影响 | 强调了合成生物学在快速响应和疫苗开发中的潜力 | NA | 研究合成生物学在病毒消除中的长期可持续性和对公共健康的影响 | SARS-CoV-2病毒及其疫苗开发 | 生物技术 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2147 | 2024-08-07 |
Stability and Robustness of Unbalanced Genetic Toggle Switches in the Presence of Scarce Resources
2021-Mar-24, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11040271
PMID:33805212
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研究论文 | 本文研究了在资源稀缺条件下，不平衡遗传触发开关的稳定性和鲁棒性 | 揭示了资源竞争对触发开关动态特性的不利影响，并提出了通过优化资源竞争来减轻这些影响的方法 | 文章未明确提及研究的具体限制 | 探讨资源稀缺对遗传触发开关性能的影响，并提供优化设计指南 | 遗传触发开关在资源稀缺条件下的动态行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2148 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Scaffold-Mediated Microcompartment Assembly and Size Control
2021-03-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.0c05715
PMID:33683101
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研究论文 | 本文通过理论和计算研究，探讨了蛋白质壳在多种货物分子和长而灵活的支架分子组成的复合体周围的动态组装过程 | 研究预测了壳体大小、封装货物量及组装路径对支架特性（如长度和支架-货物相互作用的价数）的敏感依赖性，并揭示了蛋白质壳的自组装能力与其自发曲率半径和弹性长度尺度的关系 | NA | 研究细菌微隔间的组装及其大小控制的机制 | 蛋白质壳、货物分子、支架分子 | NA | NA | 理论和计算模拟 | NA | NA | NA |
| 2149 | 2024-08-07 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetases for use in synthetic biology
2020, The Enzymes
DOI:10.1016/bs.enz.2020.06.004
PMID:33837709
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研究论文 | 本文讨论了在合成生物学领域中，通过遗传密码扩展技术利用工程化的氨酰-tRNA合成酶（aaRSs）来扩展蛋白质氨基酸集合的方法 | 本文介绍了如何通过实验室技术创建设计型的aaRSs和tRNAs，并强调了正交性在遗传密码扩展中的重要性 | NA | 探索和优化遗传密码扩展技术，以在治疗学、生物修复和生物催化等领域中应用 | 工程化的氨酰-tRNA合成酶及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA |
| 2150 | 2024-08-07 |
A Modular, Dynamic, DNA-Based Platform for Regulating Cargo Distribution and Transport between Lipid Domains
2021-04-14, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.0c04867
PMID:33733783
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research paper | 本文介绍了一种模块化方法，用于在共存的脂质域中编程两亲性DNA纳米结构的分配 | 利用不同疏水“锚”在不同相中富集的倾向，通过合理组合疏水物质以及改变纳米结构的大小和拓扑结构来调节设备的横向分布 | NA | 复制人工细胞系统中的生命功能，如信号传导和运输 | 两亲性DNA纳米结构在脂质域中的分配和运输 | synthetic biology | NA | DNA nanostructure | NA | lipid domains | NA |
| 2151 | 2024-08-07 |
Creating enzymes and self-sufficient cells for biosynthesis of the non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
2021-04-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22357-z
PMID:33837188
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研究论文 | 本文通过重新编程烟酸单核苷酸腺苷酰转移酶的底物结合口袋，创造了一种名为NCD合成酶（NcdS）的酶，促进了细胞内非天然辅因子尼克酰胺胞嘧啶二核苷酸（NCD）的合成 | 开发了一种新的酶NCD合成酶（NcdS），并通过其过表达在模型宿主大肠杆菌中实现了NCD的内源性生产 | NA | 研究非天然辅因子NCD的生物合成及其在细胞内的自给自足 | NCD合成酶（NcdS）及其在细胞内的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 在大肠杆菌模型宿主中进行了实验，NCD水平可达5.0 mM |
| 2152 | 2024-08-07 |
Guanidine Biosensors Enable Comparison of Cellular Turn-on Kinetics of Riboswitch-Based Biosensor and Reporter
2021-03-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00583
PMID:33646758
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研究论文 | 本研究开发了基于RNA的荧光（RBF）生物传感器，用于检测常见的 chaotropic 试剂胍，并比较了基于核糖开关的生物传感器与报告基因的激活动力学。 | 首次系统地比较了同一配体下基于核糖开关的生物传感器与报告基因的性能，并展示了RBF生物传感器在监测细胞生物学、生物技术和合成生物学中动态过程的优势。 | NA | 开发和优化基于RNA的荧光生物传感器，用于监测胍的细胞内激活动力学。 | 基于RNA的荧光生物传感器和报告基因。 | 生物技术 | NA | RNA-based fluorescent (RBF) biosensors | NA | 荧光信号 | NA |
| 2153 | 2024-08-07 |
A computational workflow for the expansion of heterologous biosynthetic pathways to natural product derivatives
2021-03-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22022-5
PMID:33741955
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研究论文 | 本文介绍了一种计算工作流程，用于系统筛选生物合成途径的生物化学邻近区域，以发现可通过衍生化途径中间体生产的药物化合物 | 该工作流程能够识别新的生物合成途径和酶候选物，用于生产已知的药物和新的衍生化合物 | NA | 探索和生产新的植物天然产物（PNP）衍生药物 | 植物天然产物及其衍生药物的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 计算筛选 | NA | 生物合成途径 | NA |
| 2154 | 2024-08-07 |
Biotechnological Activities and Applications of Bacterial Pigments Violacein and Prodigiosin
2021-Mar-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-021-00262-9
PMID:33706806
|
综述 | 本文综述了两种色素的生物技术活动和应用，即紫色素和血色素 | 尽管这两种化合物在七十年前就被发现，但过去二十年中对它们的生物应用兴趣显著增加，尤其是它们的抗菌和抗癌特性 | NA | 探讨紫色素和血色素的生物活性及其在生物技术中的应用 | 紫色素和血色素 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 2155 | 2024-08-07 |
Recent developments in microfluidic synthesis of artificial cell-like polymersomes and liposomes for functional bioreactors
2021-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0048441
PMID:33833845
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综述 | 本文综述了利用微流控技术合成类似细胞的人工聚合物囊泡和脂质体的方法及其在功能生物反应器中的应用 | 介绍了微流控技术在制造多功能囊泡方面的最新进展，这些囊泡能够模拟细胞膜结构并实现多种生物反应 | 讨论了当前设计和应用人工细胞样囊泡作为功能生物反应器所面临的问题 | 总结微流控合成聚合物囊泡和脂质体的方法，并探讨其在功能生物反应器中的应用及未来展望 | 人工细胞样囊泡，包括聚合物囊泡和脂质体 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 囊泡 | NA |
| 2156 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in the clinic: engineering vaccines, diagnostics, and therapeutics
2021-02-18, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.017
PMID:33571426
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研究论文 | 本文重点介绍了合成生物学在疫苗开发、分子诊断和基于细胞的治疗方法中的应用 | 强调了合成生物学领域的成熟度及其在临床应用中的潜力 | NA | 探讨合成生物学在生物医学领域的应用及其未来发展 | 疫苗、分子诊断和细胞治疗 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 2157 | 2024-08-07 |
A synthetic mechanogenetic gene circuit for autonomous drug delivery in engineered tissues
2021-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd9858
PMID:33571125
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研究论文 | 本文利用合成生物学和组织工程技术，开发了一种机械响应性生物人工组织，该组织在机械加载下能够产生预编程的抗炎生物药物 | 通过解构由机械敏感离子通道TRPV4激活引起的信号网络，创建了TRPV4响应性合成遗传电路，并将其工程化到软骨细胞中，使其在机械加载下产生抗炎生物药物 | NA | 开发一种基于生理相关加载的长期自主调节药物递送的机械遗传系统 | 软骨细胞和生物人工组织 | 组织工程 | NA | 合成生物学 | 遗传电路 | 细胞 | NA |
| 2158 | 2024-08-07 |
Development of Cadmium Multiple-Signal Biosensing and Bioadsorption Systems Based on Artificial Cad Operons
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.585617
PMID:33644011
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研究论文 | 本研究开发了基于人工改造的镉抗性操纵子的单、双和三信号输出镉(II)生物传感器，并首次结合生物吸附功能 | 首次实现了基于重金属抗性操纵子的多信号输出和生物吸附功能，为环境中有毒金属的生物检测和去除提供了一种潜在策略 | 镉(II)和汞(II)的检测范围不重叠，限制了其在某些环境监测中的应用 | 开发新型镉(II)生物传感器和生物吸附系统，以促进生物修复机制和动态的研究 | 镉(II)和汞(II)的生物传感器及其在环境中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工操纵子技术 | NA | 生物信号 | NA |
| 2159 | 2024-08-07 |
An endoribonuclease-based feedforward controller for decoupling resource-limited genetic modules in mammalian cells
2020-11-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19126-9
PMID:33173034
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research paper | 本文研究了在哺乳动物细胞中，由于转录和翻译资源的加载导致的遗传模块耦合问题，并开发了一种基于内切酶的前馈控制器来适应这种资源加载，实现基因表达水平的精确调控 | 开发了一种新型的基于内切酶的前馈控制器，能够在哺乳动物细胞中实现对基因表达水平的精确调控，且设计可跨细胞系移植 | NA | 解决合成生物学中遗传设备因资源限制导致的模块性缺失问题，实现基因表达的可预测、鲁棒和上下文无关控制 | 哺乳动物细胞中的遗传系统 | 生物技术 | NA | 内切酶 | 前馈控制器 | 基因表达数据 | NA |
| 2160 | 2024-08-07 |
Ultra-high throughput functional enrichment of large monoamine oxidase (MAO-N) libraries by fluorescence activated cell sorting
2018-Sep-24, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00851e
PMID:30199078
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的方法，用于在单个大肠杆菌细胞中敏感检测氧化酶活性，使用来自黑曲霉的单胺氧化酶MAO-N作为模型系统，并通过荧光激活细胞分选（FACS）对大型MAO-N库进行功能富集 | 首次展示了适用于大肠杆菌中FAD依赖氧化酶定向进化的超高吞吐量筛选方法 | 目前的方法涉及视觉、比色、菌落为基础的筛选，不适合非常大的库，并且不能量化变体的相对适应性 | 开发一种适用于大规模筛选氧化酶变体的新方法，以提高酶的特定应用性能 | 单胺氧化酶MAO-N及其在大肠杆菌中的活性 | 生物技术 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | 超过106个变体每天 |