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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境修复中的应用 | 采用宏基因组方法系统探索微生物金属抗性基因的功能多样性和作用机制 | NA | 研究微生物金属抗性基因的机制及其环境应用价值 | 微生物金属抗性基因及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境 |
| 202 | 2025-10-05 |
Vibrational imaging of metabolites for improved microbial cell strains
2024-06, Journal of biomedical optics
IF:3.0Q2
DOI:10.1117/1.JBO.29.S2.S22711
PMID:38952688
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综述 | 本文介绍了无标记振动光谱显微镜在微生物代谢物成像中的应用及其对生物制造的潜在影响 | 提出将无标记振动光谱显微镜作为传统分析筛选工具的替代方案,用于非破坏性高通量代谢物筛选 | NA | 改进工业微生物细胞株开发中的代谢物筛选技术 | 微生物细胞和代谢物 | 合成生物学 | NA | 拉曼散射成像、红外吸收成像、振动光谱显微镜 | NA | 化学成像数据 | NA | NA | 微生物系统 | 代谢通路 | 农业,能源,食品,材料,制药 |
| 203 | 2025-10-05 |
Illuminating protein space with a programmable generative model
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06728-8
PMID:37968394
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研究论文 | 介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型,用于直接采样新颖的蛋白质结构和序列 | 开发了尊重聚合物系综构象统计的扩散过程、支持长程推理的亚二次缩放神经架构、从残基间几何合成三维结构的层,以及扩散模型的低温采样算法 | NA | 探索蛋白质空间的潜力,通过生成模型加速蛋白质设计 | 蛋白质分子和蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 扩散模型,生成模型 | 生成模型,扩散模型 | 蛋白质结构,蛋白质序列 | 310个蛋白质的实验表征,其中两个设计蛋白质的晶体结构解析 | NA | NA | NA | 医学,材料科学,合成生物学 |
| 204 | 2025-10-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
|
综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖在免疫调节中的关键作用及其治疗潜力 | 重点关注肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖,提出了通过合成生物学设计下一代免疫疗法的路线图 | 存在结构-功能知识空白,在连接特定结构基序与可预测免疫结果方面存在挑战,规模化生产方法仍需改进 | 探讨细菌胞外多糖的免疫调节功能及其在肠道微生物组时代的治疗应用 | 肠道共生菌和益生菌产生的微生物胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 肠道共生菌, 益生菌 | 定制化胞外多糖原位生产系统 | 医学 |
| 205 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 206 | 2025-10-05 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-Sep-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
|
研究论文 | 开发了一种通过电激活微滴组装实现按需纳升级试剂输送的平台 | 将电传感、触发式液滴融合和被动分选集成在单一连续流中,实现基于阻抗检测的选择性液滴融合 | NA | 开发高精度纳升级试剂输送平台 | 微滴和细菌样品 | 微流控技术 | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学分选 | NA | 电信号数据 | 每分钟超过6000个事件 | NA | 细菌 | NA | 药物发现,合成生物学,单细胞分析 |
| 207 | 2025-10-05 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Sep-12, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
|
研究论文 | 本研究通过构建群体感应启动子库和新型混合启动子,扩展了合成生物学工具箱并实现了动态遗传电路的精确调控 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库,并设计了一种需要两种自诱导物激活的新型混合启动子 | NA | 扩展群体感应工具箱,实现遗传电路的动态调控和精确调谐 | 群体感应系统、遗传电路、启动子工程 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、遗传电路设计 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli | 多阶段遗传开关、混合启动子电路、需要3-氧代-己酰基和3-氧代-十二酰基-高丝氨酸内酯两种自诱导物激活的逻辑门 | 工业生物技术 |
| 208 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
|
综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |
| 209 | 2025-10-05 |
Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00260
PMID:39312753
|
研究论文 | 本研究构建了用于检测油砂工艺影响水中环烷酸的全细胞细菌生物传感器 | 首次利用合成生物学方法构建针对环烷酸检测的生物传感器,并采用尾矿池分离的细菌作为宿主 | 检测限在1.5-15 mg/L之间,灵敏度有待进一步提高 | 开发替代性环境监测技术用于油砂采矿废水中的环烷酸检测 | 环烷酸及其混合物、油砂工艺影响水样品 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、转录报告系统 | NA | 基因表达数据、环境水样 | 多种环烷酸混合物和OSPW样品 | 质粒克隆、转录报告系统 | 尾矿池分离的细菌物种 | 基于环烷酸降解操纵子、抗性基因和假设基因启动子的生物传感器 | 环境监测 |
| 210 | 2025-10-05 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
|
综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞治疗方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 探讨了合成生物学在基因工程改造细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎方面的应用前景 | NA | 总结当前软骨缺损再生的细胞治疗方法并探讨其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨、软骨缺损、骨关节炎 | 再生医学 | 骨关节炎 | 细胞治疗、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 211 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology for advancing RNA therapeutics and vaccine design
2023-11-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00323-3
PMID:38036580
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过优化抗原设计、治疗构建体、治疗活性和递送载体来增强RNA疫苗和疗法的功能与疗效 | 系统阐述合成生物学工具在优化RNA疫苗抗原设计、治疗构建体、活性调控及递送载体方面的创新应用 | NA | 推动RNA疗法和疫苗设计的创新发展 | RNA疫苗和治疗方法 | 合成生物学 | 传染病(以COVID-19为例) | mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 212 | 2025-10-05 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
|
研究论文 | 本研究通过设计合成B细胞特异性启动子并结合深度学习模型,解析免疫球蛋白基因转录调控机制 | 首次大规模设计合成23,640个B细胞特异性启动子,并构建能直接从序列预测转录强度的深度学习模型 | NA | 解析B细胞特异性转录调控机制并开发合成启动子工具 | B细胞特异性启动子和免疫球蛋白V基因启动子 | 合成生物学 | NA | MPRA(大规模平行报告基因检测), 深度学习 | 深度学习模型 | DNA序列数据 | 23,640个合成B细胞特异性启动子 | 合成生物学方法 | B细胞 | B细胞特异性启动子设计 | 医学, 生物技术 |
| 213 | 2025-10-05 |
Design of a sorbitol-activated nitrogen metabolism-dependent regulatory system for redirection of carbon metabolism flow in Bacillus licheniformis
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad859
PMID:37850640
|
研究论文 | 开发了一种基于氮代谢的合成调控系统,用于重定向地衣芽孢杆菌中的碳代谢流 | 首次利用氮代谢信号构建调控系统,通过改造GlnR转录因子和添加山梨醇响应元件实现碳代谢流重定向 | NA | 开发基于氮代谢的合成调控工具以改善微生物细胞工厂性能 | 地衣芽孢杆菌的碳氮代谢调控 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录因子工程 | NA | NA | NA | 转录因子工程 | 地衣芽孢杆菌 | 山梨醇激活的氮代谢依赖型调控系统,包含工程化GlnR转录因子和山梨醇响应元件 | 工业生物技术 |
| 214 | 2025-10-05 |
Integrative strategies against multidrug-resistant bacteria: Synthesizing novel antimicrobial frontiers for global health
2025-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108018
PMID:40914328
|
综述 | 本文综述了对抗多重耐药菌的综合策略,包括新型抗菌方法的研究进展和协同治疗潜力 | 提出了结合病原体靶向和宿主导向策略的多层次治疗范式,探讨了多种新型抗菌方法的协同应用 | 存在生产规模化、监管审批、安全性和临床疗效验证等方面的挑战 | 评估各种治疗方法对抗多重耐药菌的协同潜力,重新思考未来抗菌药物管理 | 多重耐药细菌及其感染治疗策略 | NA | 传染病 | CRISPR-Cas系统、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 215 | 2025-10-05 |
Recent advances in microbially derived chlorinated antiparasitic compounds
2025-Oct, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11018-0
PMID:39476277
|
综述 | 系统回顾微生物来源的氯化抗寄生虫化合物研究进展及其药物开发潜力 | 首次对1963年至今微生物来源的氯化抗寄生虫化合物进行全面梳理,发现28种具有明确抗寄生虫活性的氯化化合物 | 微生物来源的氯化抗寄生虫化合物相关文献资料有限 | 开发更安全、选择性更高、环境友好且疗效增强的抗寄生虫药物 | 微生物来源的氯化天然代谢产物 | 药物化学与合成生物学 | 寄生虫病 | PKS、NRPS、PKS-NRPS生物合成途径 | NA | 文献数据 | 28种氯化化合物 | 合成生物学、组合化学、有机合成 | 微生物 | NA | 医药 |
| 216 | 2025-10-05 |
Microbial mineralization for remediating heavy metal-contaminated groundwater: mechanisms, applications, advances, and perspectives
2025-Sep-23, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-025-02753-w
PMID:40986195
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综述 | 本文系统综述了微生物矿化修复重金属污染地下水的机制、应用、进展与前景 | 结合文献计量学分析与工程案例,阐明了碳酸盐、硫化物和磷酸盐矿物形成驱动重金属固定的机制,并识别了当前研究前沿 | 极端环境中微生物活性受抑制,复杂污染系统处理效率低,矿化产物长期稳定性监测不足 | 探讨微生物矿化修复重金属污染地下水的机制与应用 | 重金属污染地下水及参与矿化修复的微生物 | 环境生物技术 | NA | 微生物矿化,文献计量分析 | NA | 文献数据,工程案例 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 217 | 2025-10-05 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-Sep-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
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研究论文 | 提出一种基于DNA纳米笼的模块化策略,用于构建稳定且具有自适应反馈调控的人工细胞器网络 | 首次利用四面体DNA框架和回文杂交链式反应在细胞外囊泡表面构建机械强化的仿生DNA纳米笼,并集成逻辑门控DNA元件实现环境响应性空间重构 | 未明确说明该系统的长期稳定性及在复杂生物环境中的实际应用效果 | 开发具有自适应反馈调控能力的人工细胞器网络构建平台 | 细胞外囊泡和DNA纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA纳米组装 | 细胞外囊泡 | 逻辑门控DNA元件、自适应信号传导网络 | 合成生物学, 生物医学应用, 智能材料设计 |
| 218 | 2025-10-05 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
|
研究论文 | 介绍CloneFast指南,一种简化的质粒设计构建方法 | 采用可重复使用的修饰寡核苷酸(CompetePCR)和快速碘介导切割技术实现高效质粒组装 | NA | 开发简单高效的质粒构建方法 | 质粒设计和构建流程 | 合成生物学 | NA | CompetePCR, 碘介导切割 | NA | NA | NA | CloneFast | NA | 质粒组装 | 工业生物技术 |
| 219 | 2025-10-05 |
Protocol for fabricating a reusable plate-well insert with a 3D-printed mounter and hydrogel scaffolds for 3D cell culture and functional assays
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104014
PMID:40782348
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研究论文 | 介绍了一种用于标准24孔板的可重复使用插入件的制造方案,包含3D打印支架和水凝胶支架 | 开发了结合3D打印支架和水凝胶支架的可重复使用插入件系统,简化水凝胶制备过程并减少批次差异 | NA | 为3D细胞培养和功能分析提供标准化、可重复使用的实验平台 | 细胞培养插入件和水凝胶支架 | 组织工程 | NA | 3D打印、水凝胶合成、冻干、qPCR | NA | NA | NA | 3D打印 | NA | NA | 医学研究、合成生物学 |
| 220 | 2025-10-05 |
Creating a designer cyanobacterial ecosystem for the sustainable production of biomass rich in sun-protecting compounds: mycosporine-like amino acids and scytonemin
2025-Sep-04, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04450-9
PMID:40906293
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综述 | 探讨通过合成生物学方法构建特殊蓝藻生态系统以可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的研究 | 提出通过基因和代谢工程优化蓝藻代谢途径的创新生物技术策略,提高紫外线防护化合物的产量 | 蓝藻中有益代谢物浓度通常很低,工业化生产经济可行性不足 | 开发可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的蓝藻生态系统 | 蓝藻及其产生的甾醇霉素和类菌孢素氨基酸 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 代谢途径优化 | 工业生物技术,材料,医药 |