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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2201 | 2024-08-07 |
Modular cell-free expression plasmids to accelerate biological design in cells
2020, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa019
PMID:33344777
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研究论文 | 本文开发了一种模块化载体系统,用于细胞外表达所需的酶,并直接通过Golden Gate组装到表达载体中 | 该系统允许T7表达所需的酶,并可通过Golden Gate组装直接进入表达载体,简化了生物合成途径的测试过程 | NA | 加速细胞设计的生物技术 | 非模式生物的代谢途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | DNA | NA |
2202 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering Strategies of Industrial Hemp (Cannabis sativa L.): A Brief Review of the Advances and Challenges
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.580621
PMID:33363552
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综述 | 本文综述了工业大麻(Cannabis sativa L.)代谢工程的最新进展和挑战 | 介绍了合成生物学新工具,特别是CRISPR/Cas系统,用于环境友好的代谢工程,以增加所需大麻素类化合物的生产并消除精神活性化合物 | 尽管大麻代谢工程对科学和工业领域有明显影响,但相关报道仍然较少 | 探讨加速大麻植物化学物质产量的三种不同方法,并强调转基因和瞬时基因传递系统在成功进行大麻代谢工程中的关键作用 | 工业大麻的代谢工程及其对大麻素类化合物生产的影响 | NA | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
2203 | 2024-08-07 |
Systematic Engineering for Improved Carbon Economy in the Biosynthesis of Polyhydroxyalkanoates and Isoprenoids
2018-Jul-24, Materials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ma11081271
PMID:30042344
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程提高生物合成聚羟基烷酸酯和异戊二烯的碳经济性的系统工程策略 | 介绍了构建非天然碳途径的最新技术,这些技术显示出比天然途径更高的碳经济性 | NA | 探讨如何通过系统工程策略提高生物合成过程中的碳经济性,从而降低单位成本和资本投资 | 聚羟基烷酸酯和异戊二烯的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2204 | 2024-08-07 |
The development of synthetic biology: a patent analysis
2013-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-013-9121-7
PMID:24255694
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研究论文 | 本研究通过专利分析探讨了合成生物学在生物技术领域的研究与开发进展及其商业化潜力 | 展示了合成生物学相关专利申请的增加趋势,并分析了这些专利在医疗、能源和工业领域的应用潜力 | 研究主要基于专利分析,未涉及实际商业化产品的市场表现 | 分析合成生物学的专利申请趋势及其在不同行业的应用潜力 | 合成生物学相关的专利及其在医疗、能源和工业领域的应用 | 生物技术 | NA | 专利分析 | NA | 专利数据 | 涉及多个国家和机构的专利申请 |
2205 | 2024-08-07 |
The ten grand challenges of synthetic life
2011-Jun, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-011-9084-5
PMID:21949672
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research paper | 本文探讨了合成生物学时代构建人工生命的十大科学挑战 | 文章提出了构建第一个人工细胞的现实可能性,并探讨了其广泛的应用前景 | 文章指出,实现人工细胞的目标面临几个主要问题 | 探讨合成生物学中构建人工生命的挑战 | 人工细胞的构建及其应用 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
2206 | 2024-08-07 |
Playing God in Frankenstein's Footsteps: Synthetic Biology and the Meaning of Life
2009-Dec, Nanoethics
IF:1.1Q2
DOI:10.1007/s11569-009-0079-6
PMID:20234875
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研究论文 | 本文分析了合成生物学这一新兴科学在社会辩论中的争议及其从业者的回应方式 | 探讨了合成生物学中'扮演上帝'主题与弗兰肯斯坦情节之间的关系,并考察了'扮演上帝'论点的教义地位 | 主要关注于合成生物学在微生物层面的应用,未直接涉及对人类生命的影响 | 分析合成生物学引发的伦理和社会辩论,并探讨其对生命意义的挑战 | 合成生物学及其在生命定义和存在意义方面的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2207 | 2024-08-07 |
Structure of the intact tail machine of Anabaena myophage A-1(L)
2024-Mar-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47006-z
PMID:38531972
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研究论文 | 本文报道了Anabaena噬菌体A-1(L)完整尾部机器的高分辨率冷冻电镜结构,包括颈部、尾部及其附着的纤维。 | 首次揭示了A-1(L)噬菌体尾部机器的详细结构,包括其独特的颈部结构和尾部纤维的排列方式。 | NA | 解析Anabaena噬菌体A-1(L)的完整尾部机器结构,以促进其在合成生物学中的应用。 | Anabaena噬菌体A-1(L)的尾部机器结构。 | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |
2208 | 2024-08-07 |
[Construction of synthetic microbial community and its application in polyhydroxyalkanoate biosynthesis]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230483
PMID:38545973
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综述 | 本文综述了合成微生物群落的设计原则、构建方法及其在聚羟基脂肪酸酯(PHA)生物合成中的应用 | 合成微生物群落是合成生态学的核心研究方向和合成生物学的新兴前沿,需要设计微生物相互作用、空间组织、鲁棒性维护和生物遏制等策略 | NA | 探讨合成微生物群落在PHA生物合成中的应用,旨在降低PHA生产成本 | 合成微生物群落及其在PHA生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2209 | 2024-08-07 |
[Advances in fermentative production of L-tryptophan: a review]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230404
PMID:38545968
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综述 | 本文综述了L-色氨酸的发酵生产及其生物合成代谢和调控机制的最新进展 | 介绍了通过实验室适应性进化等非理性设计方法改进L-色氨酸生产菌株性能的研究 | L-色氨酸在微生物细胞中的代谢途径长且调控机制复杂不明确,导致生产效率和菌株稳健性低 | 总结L-色氨酸生物合成代谢及其调控、生产菌株的构建与优化以及发酵生产的最新进展,并展望未来发展方向 | L-色氨酸及其生产菌株 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
2210 | 2024-08-07 |
[Reflections on the safety regulation of commercialization of synthetic biology products]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230320
PMID:38545975
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评论 | 本文总结了合成生物产品在食品、医疗、农业、环境、能源和材料领域的应用情况,分析了其存在的安全风险,并梳理了欧美及中国在监管方面的现状,提出了加强安全监管的建议 | 提出了针对合成生物产品安全风险的全过程监管措施,包括分类审批、产品分类标识以及市场主体准入前的严格筛选和审批,以及入市后的安全监管和应急处理及事故责任调查 | NA | 探讨合成生物产品商业化过程中的安全监管问题 | 合成生物产品在多个领域的应用及其安全风险 | NA | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
2211 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-Mar-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
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综述 | 本文综述了合成生物学工具如何精确控制CRAC通道途径及其对免疫反应下游信号事件的影响 | 介绍了合成生物学在精确控制分子接近度和下游信号过程中的应用 | NA | 总结合成生物学工具在控制CRAC通道途径及其对免疫反应影响方面的应用 | CRAC通道及其在免疫反应中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2212 | 2024-08-07 |
Machine Learning to Predict Enzyme-Substrate Interactions in Elucidation of Synthesis Pathways: A Review
2024-Mar-07, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14030154
PMID:38535315
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综述 | 本文综述了利用机器学习方法预测酶-底物相互作用以阐明合成途径的研究进展 | 采用基于人工智能的方法,如支持向量机、神经网络和决策树,显著减少了计算时间并覆盖了广泛的搜索空间 | 这些方法在处理大规模搜索空间时仍存在计算速度较慢的问题 | 探讨机器学习在预测酶-底物相互作用中的应用,以加速合成途径的阐明 | 酶-底物相互作用及其在合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 支持向量机、神经网络、决策树 | NA | NA | NA |
2213 | 2024-08-07 |
A systems framework for investigating the roles of multiple transporters and their impact on drug resistance
2024-Jan-23, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyae007
PMID:38537223
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研究论文 | 本文开发了一个系统框架,用于研究多种转运蛋白在药物抗性中的作用及其相互作用 | 创新性地创建了一个结构化的系统框架,用于评估多种转运蛋白对药物外排和药物抗性的影响 | NA | 旨在深入理解转运蛋白在药物抗性中的系统级功能和作用 | 多种转运蛋白及其与药物的相互作用和调控机制 | 生物医学工程 | NA | 计算和分析方法 | 系统框架 | NA | NA |
2214 | 2024-08-07 |
CRISPR base editing and prime editing: DSB and template-free editing systems for bacteria and plants
2020-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2020.08.003
PMID:32954022
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综述 | 本文综述了CRISPR系统中的非双链断裂和模板自由基因编辑技术,即碱基编辑(BE)和前体编辑(PE),在细菌和植物中的应用 | 介绍了碱基编辑和前体编辑这两种非DSB和模板自由的基因编辑技术,并探讨了它们在合成生物学、作物改良等领域的应用前景 | 讨论了BE/PE在PAM特异性、编辑效率、脱靶效应、序列特异性及编辑窗口等方面的挑战 | 探讨CRISPR系统中的碱基编辑和前体编辑技术在细菌和植物中的应用及其未来发展 | 细菌和植物 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
2215 | 2024-08-07 |
Applications of phage-derived RNA-based technologies in synthetic biology
2020-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2020.09.003
PMID:33083579
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综述 | 本文综述了噬菌体衍生的基于RNA的技术在合成生物学中的应用 | 探讨了噬菌体衍生的基于RNA的技术在合成生物学中的重要性,以及对理解生命起源早期阶段的贡献 | NA | 探讨噬菌体衍生的基于RNA的技术在合成生物学中的应用及其对生物进化的影响 | 噬菌体及其衍生的基于RNA的技术 | 合成生物学 | NA | 基于RNA的技术 | NA | NA | NA |
2216 | 2024-08-07 |
A deep learning approach to programmable RNA switches
2020-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18677-1
PMID:33028812
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研究论文 | 本研究使用深度神经网络(DNN)预测合成生物学中的脚趾开关功能 | DNN在核苷酸序列训练上表现优于以往的先进热力学和动力学模型,并能生成人类可理解的注意力可视化 | NA | 探索深度学习在RNA合成生物学中功能预测和洞察生成的能力 | 脚趾开关功能预测 | 机器学习 | NA | 深度神经网络(DNN) | DNN | 核苷酸序列 | 91,534个脚趾开关,涵盖23种病毒基因组和906个人类转录因子 |
2217 | 2024-08-07 |
Sequence-to-function deep learning frameworks for engineered riboregulators
2020-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18676-2
PMID:33028819
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研究论文 | 本文介绍了两种深度学习架构STORM和NuSpeak,用于优化和设计可编程核酸传感器——趾开关 | 提出了一种基于序列的趾开关优化和重新设计模型STORM和NuSpeak,通过计算机视觉和自然语言处理技术进行优化 | NA | 开发序列到功能的深度学习框架,用于趾开关的选择和设计 | 可编程核酸传感器——趾开关 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | NA |
2218 | 2024-08-07 |
A machine learning Automated Recommendation Tool for synthetic biology
2020-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18008-4
PMID:32978379
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研究论文 | 本文介绍了一种利用机器学习和概率建模技术指导合成生物学系统化发展的自动化推荐工具(ART) | ART工具无需对生物系统进行完全的机制理解,通过基于采样的优化方法提供推荐菌株及其生产水平的概率预测 | 讨论了该方法的局限性及底层假设失败时的实际后果 | 开发一种新的工具以加速合成生物学中的工程开发过程 | 合成生物学中的菌株推荐和生产水平预测 | 机器学习 | NA | 机器学习,概率建模 | NA | 模拟数据,实验数据 | 涉及多个代谢工程项目,包括生产可再生生物燃料、无啤酒花的啤酒、脂肪酸和色氨酸的项目 |
2219 | 2024-08-07 |
Mechanism-Driven Metabolic Engineering for Bio-Based Production of Free R-Lipoic Acid in Saccharomyces cerevisiae Mitochondria
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00965
PMID:32974306
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研究论文 | 研究通过代谢工程改造酵母细胞,实现生物基R-硫辛酸的生产 | 首次报道了在酵母细胞中生物合成自由R-硫辛酸的方法 | NA | 开发基于合成生物学的方法,实现可持续的R-硫辛酸生产 | 酵母细胞中的硫辛酸生物合成机制及蛋白质脂酰化过程 | 生物工程 | 癌症 | LC-MS/MS | NA | 蛋白质 | NA |
2220 | 2024-08-07 |
Genomics-enabled analysis of specialized metabolism in bioenergy crops: current progress and challenges
2020, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa005
PMID:32995549
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综述 | 本文综述了利用基因组学技术分析生物能源作物中特殊代谢的当前进展与挑战 | 介绍了DNA合成和合成生物学工具在加速植物特殊代谢中基因、酶和途径功能发现方面的应用 | 由于许多植物对遗传方法的抗性和缺乏研究特殊代谢中多样酶类的'用户友好'生化工具,使用系统性数据解码基因和酶功能的效率仍然有限 | 旨在阐述在生物能源作物中应用DNA合成和合成生物学工具加速植物特殊代谢中基因、酶和途径功能发现的当前进展与挑战 | 以生物能源作物中的萜类代谢为例,探讨植物特殊代谢的研究 | 基因组学 | NA | 基因组学技术 | NA | 基因组数据 | 涉及多种生态和经济上重要的植物物种 |