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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2201 | 2024-08-07 |
A Multiplex MoClo Toolkit for Extensive and Flexible Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00423
PMID:37930278
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研究论文 | 本文介绍了一种新的多重MoClo工具包——多重酵母工具包(MYT),该工具包扩展了MoClo酵母工具包(YTK)的能力,并解决了酵母菌株工程的局限性 | MYT工具包提供了新的整合载体和选择性标记,增加了装配盒以增加多基因构建体中的转录单元数量,并引入了CRISPR-Cas9工具和三种正交且可诱导的启动子系统 | YTK工具包在创建新酵母菌株的广度和灵活性方面存在局限 | 扩展酵母合成生物学工具包的能力,以实现更广泛和灵活的酵母工程 | 酵母菌株的工程化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
2202 | 2024-08-07 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本文介绍了一种名为INSPIRE-seq的方法,利用纳米抗体库和下一代测序技术,在复杂的肿瘤微环境中并行富集免疫细胞结合的纳米抗体 | INSPIRE-seq提供了一种无偏见的方法来研究复杂的微环境,并辅助纳米抗体的开发 | NA | 开发一种新技术来发现治疗性生物制剂的靶向分子 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及肿瘤、淋巴结和脾脏中的免疫细胞亚型 |
2203 | 2024-08-07 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-Jan, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本文设计了一种基于PYR1的正交CID模块,具有可重编程的配体结合特异性,用于植物和真核生物合成生物学中的多通道CID系统。 | 本文设计的正交模块通过X射线晶体学、生化和体内分析证实其正交性,并能创建具有纳摩尔敏感性的PYR1*/HAB1*系统。 | NA | 扩展PYR1系统的功能,实现可重编程的配体结合特异性。 | 植物中的化学诱导二聚化(CID)模块,包括PYR1受体和HAB1磷酸酶。 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 生物化学数据 | 在拟南芥和酿酒酵母中进行了实验 |
2204 | 2024-08-07 |
The technology, opportunities, and challenges of Synthetic Biological Intelligence
2023-11, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108233
PMID:37558186
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综述 | 本文综述了合成生物智能(SBI)的发展及其潜在应用,并探讨了相关的伦理问题 | 首次详细探讨了合成生物智能技术的伦理机会与挑战 | 尚未深入探索合成生物智能技术背后的具体技术细节 | 提供一个坚实的框架来构建伦理考量,确保SBI技术能够负责任地进行研究和应用 | 合成生物智能技术及其伦理影响 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
2205 | 2024-08-07 |
Compact Programmable Control of Protein Secretion in Mammalian Cells
2023-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.04.560774
PMID:37873144
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Compact RELEASE的新型合成生物学平台,用于在哺乳动物细胞中控制蛋白质分泌 | 通过利用内源性14-3-3蛋白的招募和拮抗行为,创建了RELEASE-NOT系统,结合RELEASE和RELEASE-NOT,形成了一套名为Compact RELEASE的蛋白质水平处理和输出模块,实现了单一输入蛋白酶的逻辑处理和模拟信号过滤 | NA | 开发一种新型的合成生物学平台,用于精确控制哺乳动物细胞中的蛋白质分泌,以应用于生物医学领域 | 哺乳动物细胞中的蛋白质分泌控制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 蛋白质 | NA |
2206 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria detect tumor DNA
2023-08-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf3974
PMID:37561843
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,设计了一种能够检测结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中供体DNA的天然感受态细菌 | 开发了一种新型的细胞检测方法,能够检测特定的胞外DNA序列和突变 | NA | 开发一种能够检测特定胞外DNA序列和突变的细胞生物传感器 | 结直肠癌(CRC)细胞、类器官和肿瘤中的供体DNA | 合成生物学 | 结直肠癌 | CRISPR-discriminated horizontal gene transfer (CATCH) | NA | DNA | 在携带结直肠肿瘤的小鼠中进行了体内验证 |
2207 | 2024-08-07 |
Unigems: plasmids and parts to facilitate teaching on assembly, gene expression control and logic in E. coli
2023, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000596.v3
PMID:37841098
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研究论文 | 开发了一套名为unigems的十种质粒,用于在课堂上研究基因表达控制和生物逻辑门,以促进合成生物学和遗传工程的教学 | unigems基于高拷贝质粒骨架,易于扩展,通过通用引物集促进Gibson组装,包括两种报告基因和单质粒AND逻辑门实现 | NA | 开发教育资源,促进合成生物学和遗传工程的教学 | 基因表达控制和生物逻辑门 | 合成生物学 | NA | Gibson组装 | NA | 质粒 | 十种质粒 |
2208 | 2024-08-07 |
Engineering Cancer Selective Virotherapies: Are the Pieces of the Puzzle Falling into Place?
2022-11, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2022.178
PMID:36178346
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综述 | 本文综述了利用病毒载体针对人类癌症的基因治疗策略,包括新型衣壳、合成启动子和治疗载荷的开发 | 结合新型衣壳和启动子以及基于免疫疗法的载荷,旨在开发创新的癌症基因治疗方法 | NA | 探讨如何通过精确工程化的病毒靶向肿瘤细胞生物学的不同方面,同时不损害正常组织和器官功能 | 病毒载体在细胞外在和内在水平的癌症选择性工程化 | NA | 癌症 | 基因治疗、合成生物学、癌症基因组学 | NA | 细胞模型、器官模型 | 使用患者来源的细胞培养和类器官进行疾病相关模型的快速筛选和分类 |
2209 | 2024-08-07 |
Peptide mimic for influenza vaccination using nonnatural combinatorial chemistry
2018-04-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI91512
PMID:29528337
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研究论文 | 本文开发了一种基于D-氨基酸组合化学的平台,用于设计一种完全人工的CD8+ T细胞激动剂,该激动剂模拟了流感病毒天然表位的免疫原性特征 | 使用非天然组合化学生成了高度稳定的抗原“模拟物”,这些模拟物在人体血清和胃酸中表现出高稳定性,并能刺激和扩展人类流感病毒特异性CD8+ T细胞 | NA | 探索合成生物学在疫苗设计和治疗递送方面的应用 | 开发一种新型的流感疫苗 | 合成生物学 | 流感 | D-氨基酸组合化学 | NA | NA | 在体外和体内实验中使用了人类和小鼠模型 |
2210 | 2024-08-07 |
EMMA: An Extensible Mammalian Modular Assembly Toolkit for the Rapid Design and Production of Diverse Expression Vectors
2017-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00016
PMID:28418644
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研究论文 | 开发了一种名为EMMA的可扩展哺乳动物模块化组装工具包,用于快速设计和生产多样化的表达载体 | EMMA工具包通过一管一步的金门克隆反应,实现了哺乳动物表达载体的快速和高效模块化组装 | NA | 解决传统克隆方法在设计和组装载体过程中的耗时、复杂、昂贵和易错问题 | 哺乳动物表达载体的设计和生产 | 生物技术 | NA | 金门克隆 | NA | NA | 多种代表性载体,如瞬时和稳定表达载体、靶向载体、诱导系统、多顺反子表达盒、融合蛋白和荧光报告基因 |
2211 | 2024-08-07 |
Mammalian Synthetic Biology: Time for Big MACs
2016-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00074
PMID:27076218
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综述 | 本文综述了合成生物学在哺乳动物细胞工程中的应用及其面临的挑战,特别是通过改进哺乳动物人工染色体(MACs)来克服这些挑战 | 介绍了哺乳动物人工染色体(MACs)作为基因表达载体的新应用,能够独立于宿主基因组,并能容纳多个基因表达盒,理论上DNA大小不受限制 | 随机整合大型转基因存在插入突变风险、无法控制转基因拷贝数和位置特异性效应等问题 | 探讨合成生物学在哺乳动物细胞工程中的应用及如何通过改进MACs来克服相关挑战 | 哺乳动物细胞及其在再生医学、生物传感细胞系开发、治疗性蛋白质生产和合成遗传调控电路生成等领域的应用 | 合成生物学 | NA | DNA合成与组装 | 哺乳动物人工染色体(MACs) | DNA | NA |
2212 | 2024-08-07 |
STAR: a simple TAL effector assembly reaction using isothermal assembly
2016-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep33209
PMID:27615025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAR的简单TAL效应子组装反应,利用等温组装技术快速生成多个TAL效应子 | STAR方法简化了TAL效应子的构建过程,提高了效率和可扩展性,无需逐步中间质粒生产 | NA | 开发一种简便、快速且成本效益高的TAL效应子组装方法 | TAL效应子及其在基因调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 等温组装(Gibson assembly) | NA | DNA序列 | 使用了68个片段的小型库,能够在8小时内生成特定的TAL重复序列 |
2213 | 2024-08-07 |
Shape remodeling and blebbing of active cytoskeletal vesicles
2016-Apr, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.1500465
PMID:27152328
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,设计并重建了肌动蛋白-肌球蛋白囊泡,以精确控制细胞形态变化的参数,并展示了这些囊泡的形态变化与活细胞的形态适应相似 | 本文首次通过合成生物学方法,使用纯化的构建模块组装成类似细胞的模型,精确控制细胞形态变化的所有相关参数 | NA | 探索细胞适应机制的物理机制 | 肌动蛋白-肌球蛋白囊泡的形态变化 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 囊泡 | NA |
2214 | 2024-08-07 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过RNA测序的转录组分析,在模式蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了长期酸性胁迫和酸性冲击处理下的差异表达基因,并通过基因敲除和表型分析验证了这些基因在酸耐受性中的作用。 | 成功鉴定了六个与酸性胁迫响应相关的基因,并通过单独过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性。 | NA | 研究蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942的酸耐受性机制,以提高其作为光合底盘的生产力。 | 蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942中的酸性胁迫响应基因。 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
2215 | 2024-08-07 |
Increasing cellulosic ethanol production by enhancing phenolic tolerance of Zymomonas mobilis in adaptive evolution
2021-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2021.124926
PMID:33684841
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研究论文 | 本研究通过实验室适应性进化方法,提高了Zymomonas mobilis 8b在玉米秸秆水解液中的酚醛耐受性和乙醇发酵能力 | 通过198天的适应性进化,获得了显著提高的酚醛耐受性和乙醇发酵能力的Zymomonas mobilis Z198,并发现ZMO3_RS07160基因的过表达是关键因素 | NA | 提高Zymomonas mobilis的酚醛耐受性和纤维素乙醇生产能力 | Zymomonas mobilis 8b在玉米秸秆水解液中的酚醛耐受性和乙醇发酵能力 | 生物技术 | NA | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 198天的适应性进化实验 |
2216 | 2024-08-07 |
Nucleoside modification-based flexizymes with versatile activity for tRNA aminoacylation
2024-Feb-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d3cc05673b
PMID:38230513
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研究论文 | 本文介绍了一种基于核苷酸修饰的柔性酶(flexizyme)策略,用于制备具有独特和多样化活性的tRNA氨基酸化酶变体 | 该策略通过2'-OMe、2'-F和2'-MOE修饰,实现了对tRNA广泛的底物充电能力 | NA | 探索基因密码重编程的新方法 | 柔性酶及其在tRNA氨基酸化中的应用 | 合成生物学 | NA | 核苷酸修饰 | NA | NA | NA |
2217 | 2024-08-07 |
Glycosylation of cellulase: a novel strategy for improving cellulase
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2022.2144117
PMID:36592990
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研究论文 | 本文讨论了糖基化在纤维素酶的特性和功能中的潜在作用 | 提出了一种通过控制糖基化途径来合理调控纤维素酶糖基化的新策略 | NA | 探讨糖基化对纤维素酶特性和功能的影响,并探索其在合成生物学中的应用 | 纤维素酶的糖基化 | 生物技术 | NA | 糖基化工程 | NA | 蛋白质 | NA |
2218 | 2024-08-07 |
Engineering extracellular electron transfer pathways of electroactive microorganisms by synthetic biology for energy and chemicals production
2024-Feb-05, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00537b
PMID:38117181
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略改造电活性微生物的外部电子传递途径,以提高生物电化学系统中能源和化学品的生产效率 | 介绍了多种合成生物学策略,如基因编辑工具的进步、代谢途径的编程和生物电子电路的重构,以增强微生物的电子传递能力 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法提高生物电化学系统中电活性微生物的电子传递速率,从而促进能源和化学品的可持续生产 | 电活性微生物及其在生物电化学系统中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2219 | 2024-08-07 |
Next-generation chimeric antigen receptors for T- and natural killer-cell therapies against cancer
2023-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13255
PMID:37548050
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综述 | 本文综述了利用嵌合抗原受体(CAR)T细胞和自然杀伤(NK)细胞进行肿瘤治疗的最新策略 | 介绍了通过合成生物学和遗传工程技术重新编程免疫效应细胞,以提高其对肿瘤的选择性,从而减轻靶向非肿瘤组织的副作用 | 目前CAR T细胞疗法在髓系恶性肿瘤和实体癌中的广泛应用受到目标抗原表达不足和异质性的限制 | 探讨提高CAR对肿瘤细胞选择性的当前策略,并关注这些策略在临床转化中的进展 | CAR T细胞和NK细胞 | NA | 癌症 | 合成生物学和遗传工程 | NA | NA | NA |
2220 | 2024-08-07 |
Modularly engineering Rhodotorula toruloides for α-terpineol production
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1310069
PMID:38312511
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研究论文 | 本文通过模块化工程策略改造红酵母Rhodotorula toruloides,以直接生物合成α-松油醇 | 采用模块化工程策略,包括增强前体供应、阻断下游途径和破坏竞争途径,以提高α-松油醇的产量 | NA | 研究目的是通过工程化红酵母直接生物合成α-松油醇 | 红酵母Rhodotorula toruloides和α-松油醇的生物合成 | 合成生物学 | NA | 模块化工程 | NA | NA | 工程化菌株5L6HE5达到最高产品滴度1.5 mg/L |