合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2261	2024-08-07	Two neglected but valuable genetic tools for Escherichia coli and other bacteria: In vivo cosmid packaging and inducible plasmid replication 2023-12, Molecular microbiology IF:2.6Q3 DOI:10.1111/mmi.15171 PMID:37770255	研究论文	本文介绍了两种被忽视但有价值的遗传工具：大肠杆菌和其他细菌中的体内cosmid包装和可诱导质粒复制	通过操纵包装噬菌体和宿主，解决了体内cosmid包装效率低和污染问题，实现了仅包含cosmid DNA的颗粒	质粒难以从细胞中去除，但可诱导复制质粒提供了一种“治愈”质粒的方法	探索在生理学和合成生物学中，如何高效且无损地将基因引入细菌宿主	大肠杆菌和其他细菌	合成生物学	NA	体内cosmid包装，可诱导质粒复制	NA	DNA	NA
2262	2024-08-07	Synthetic biology: understanding biological design from synthetic circuits 2009-Dec, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/nrg2697 PMID:19898500	研究论文	本文通过合成生物学中的基因和蛋白质电路设计，探讨了自然生物系统设计原则的理解	通过合成生物器件，直观地理解简单生物电路的行为范围，并控制自然过程	NA	揭示自然生物系统的设计原则	合成启动子、细胞间相互作用的控制等生物系统工程过程	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
2263	2024-08-07	Environment and synthetic biology 2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.016 PMID:38616974	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
2264	2024-08-07	Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo 2024-Apr, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600 PMID:38548126	综述	本文综述了基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在人类神经退行性疾病研究中的应用	光遗传学和化学遗传学技术为研究人类神经退行性疾病提供了新的机会，能够在细胞水平上模拟多种病理状态	NA	探讨光遗传学和化学遗传学在模拟人类神经退行性疾病中的应用及未来发展方向	人类神经退行性疾病，包括与年龄相关的痴呆、阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、癫痫和共济失调等	NA	神经退行性疾病	光遗传学和化学遗传学	NA	NA	NA
2265	2024-08-07	Phaeodactylum tricornutum: An established model species for diatom molecular research and an emerging chassis for algal synthetic biology 2023-12, Journal of phycology IF:2.8Q2 DOI:10.1111/jpy.13400 PMID:37975560	研究论文	本文综述了Phaeodactylum tricornutum作为硅藻分子研究和藻类合成生物学新兴底盘的贡献	Phaeodactylum tricornutum作为一种非典型硅藻，因其易于实验室培养和基因表达操作工具的增加，已成为硅藻分子研究的重要模型，并逐渐成为藻类过程工程和合成生物学的新工具	NA	探讨Phaeodactylum tricornutum在硅藻生物学研究和藻类合成生物学中的应用	Phaeodactylum tricornutum	分子生物学	NA	基因表达操作	NA	基因组信息	NA
2266	2024-08-07	Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability 2023-08-17, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes14081635 PMID:37628687	研究论文	本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现	本文证实了在多细胞群体形成时，集体层面的遗传性不仅存在，而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性	NA	探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现	多细胞生物的性状遗传性	NA	NA	分析模型、合成生物学、生物学模拟	NA	NA	NA
2267	2024-08-07	Rapid screening of engineered microbial therapies in a 3D multicellular model 2019-04-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.1820824116 PMID:30996123	研究论文	本文介绍了一种细菌-球状体共培养（BSCC）平台，用于在多细胞球状体中同时测试宿主物种、治疗有效载荷和工程细菌的合成基因回路，并在几周的时间尺度上进行长期监测。	该平台能够高吞吐量地筛选工程微生物疗法，并动态分析多种微生物物种及其在不同宿主细胞类型中的作用。	NA	加速合成生物学在临床应用中的发展，并深入理解疾病部位的宿主-微生物相互作用。	工程细菌的宿主物种、治疗有效载荷和合成基因回路。	合成生物学	炎症、感染、代谢紊乱、癌症	NA	NA	多细胞球状体	多种微生物物种和宿主细胞类型
2268	2024-08-07	XPORT ENTRAP: A droplet microfluidic platform for enhanced DNA transfer between microbial species 2024-Jul-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2024.02.003 PMID:38408724	研究论文	本文介绍了一种基于液滴微流控平台的DNA增强转移系统（DNA ENTRAP），用于提高微生物间DNA转移的效率	利用液滴微流控技术，通过细胞封装的水-油乳液滴作为皮升体积的生物反应器，实现了XPORT介导的遗传转移效率的提升	NA	解决合成生物学中DNA高效引入微生物的挑战	微生物间的DNA转移效率	生物技术	NA	液滴微流控技术	NA	微生物细胞	使用了两种不同的枯草芽孢杆菌（供体和受体）
2269	2024-08-07	Multiomics unravels potential molecular switches in the C3 to CAM transition of Mesembryanthemum crystallinum 2024-May-15, Journal of proteomics IF:2.8Q2 DOI:10.1016/j.jprot.2024.105145 PMID:38431086	研究论文	本研究利用转录组学、蛋白质组学和靶向代谢组学分析了Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用的分子变化	发现了新的发现，如转录本的昼夜节律调控比蛋白质更强，氧化磷酸化和肌醇甲基化可能在转变中起重要作用，V型H-ATP酶在质子泵送中的作用，以及蛋白磷酸酶2C在ABA信号通路中的潜在触发作用	NA	揭示Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用转变中的潜在分子开关	Mesembryanthemum crystallinum的分子变化	NA	NA	转录组学、蛋白质组学、靶向代谢组学	NA	转录组、蛋白质组、代谢组	NA
2270	2024-08-07	Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond 2024-May, The New phytologist DOI:10.1111/nph.19650 PMID:38426415	综述	本文综述了近期研究中展示的各种快速原型技术，这些技术克服了植物合成生物学中的一些瓶颈，加速了进展	探讨了将不同快速原型技术结合的可能性，以实现植物合成生物学的快速和可扩展部署	每种技术都有其局限性，限制了它们的广泛应用	实现植物合成生物学的全部潜力，阐明基因型与表型之间的关系，并应用这些见解来工程化性状	植物合成生物学中的快速原型技术	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2271	2024-08-07	Exploiting synthetic biology platforms for enhanced biosynthesis of natural products in Yarrowia lipolytica 2024-May, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2024.130614 PMID:38513925	综述	本文主要回顾了合成生物学技术在Yarrowia lipolytica中的发展，并总结了近期在Y. lipolytica中合成天然产品的研究进展	利用合成生物学平台设计、修改甚至从头合成微生物，赋予微生物非自然功能，促进功能产品的开发	NA	解决天然产品供应不足的关键问题，如低产量、长生产周期和繁琐的程序	Yarrowia lipolytica中的合成生物学技术和天然产品合成	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
2272	2024-08-07	Two Cytochrome P450 Enzymes Form the Tricyclic Nested Skeleton of Meroterpenoids by Sequential Oxidative Reactions 2024-Apr-11, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c01943 PMID:38602511	研究论文	本文研究了两种细胞色素P450酶在形成三环嵌套骨架过程中的氧化反应作用	首次发现并证明了ClaR和ClaT两种酶在clavilactone生物合成中的关键作用，特别是ClaR作为大环酶催化非萜类部分的氧化环化	NA	探索并阐明在clavilactone生物合成中形成10/5/3三环嵌套骨架的自然酶机制	clavilactone的生物合成机制及其在真菌中的基因簇	NA	NA	细胞色素P450单加氧酶	NA	基因簇	NA
2273	2024-08-07	Characterization of CYP82 genes involved in the biosynthesis of structurally diverse benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis yanhusuo 2024-Mar-07, Plant molecular biology IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s11103-023-01397-7 PMID:38453737	研究论文	本研究探讨了CYP82基因在Corydalis yanhusuo中苯并异喹啉生物碱（BIAs）生物合成中的催化功能	首次鉴定并表征了Corydalis yanhusuo中的CyCYP82基因，这些基因在BIAs的合成生物学中具有重要作用	NA	研究CYP82基因在苯并异喹啉生物碱生物合成中的作用	Corydalis yanhusuo中的CYP82基因及其在BIAs生物合成中的功能	生物化学	NA	基因克隆	NA	基因序列	20个CyCYP82编码基因
2274	2024-08-07	PCR amplification of DNA containing non-standard base pairs by variants of reverse transcriptase from Human Immunodeficiency Virus-1 2004, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkh241 PMID:14757837	研究论文	研究使用人类免疫缺陷病毒1型逆转录酶的变体来合成包含非标准碱基对的双链DNA	首次通过PCR扩增包含具有替代氢键模式的非标准碱基对的DNA	NA	探索使用HIV逆转录酶变体合成包含非标准碱基对的双链DNA的能力	HIV逆转录酶的变体及其合成非标准碱基对的能力	生物技术	NA	PCR	NA	DNA	NA
2275	2024-08-07	Engineering transcriptional regulation for cell-based therapies 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100121 PMID:38340892	综述	本文综述了利用合成生物学工具，特别是基于跨膜受体的转录调控平台，来开发细胞疗法的当前工程方法	探讨了将跨膜受体与转录激活平台结合的潜力，以及如何通过这些技术实现对基因调控的更精确控制	尚未完全实现跨膜受体与转录激活平台的全部潜力	探索和改进用于细胞疗法的转录调控技术，特别是在响应外部信号方面	哺乳动物细胞中的转录调控系统	合成生物学	NA	转录调控	NA	NA	NA
2276	2024-08-07	Experimental and biophysical modeling of transcription and translation dynamics in bacterial- and mammalian-based cell-free expression systems 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2022.02.001 PMID:35231628	研究论文	本文开发了一个基于常微分方程（ODE）的生物物理模型，用于模拟细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学	首次提出了一种适用于细菌和哺乳动物细胞自由表达系统的计算模型	NA	为基因回路定量研究提供一个标准的生物物理模型，以深入理解细胞自由表达系统的基本工作机制	细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学	合成生物学	NA	NA	ODE	实验数据	四个基因回路在E. coli和HeLa细胞自由表达系统中的测试
2277	2024-08-07	Recent advances of droplet-based microfluidics for engineering artificial cells 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2023.05.002 PMID:37245659	综述	本文总结了基于液滴的微流控技术在人工细胞合成方面的最新进展	介绍了多种基于液滴的微流控设备类型及其在多隔室囊泡和人工细胞形成中的应用	讨论了当前基于液滴的微流控方法在工程人工细胞方面的挑战和未来展望	构建具有最少部件和复杂性的活细胞	人工细胞的合成及其在基因表达、细胞间通信和机械生物学中的应用	微流控技术	NA	基于液滴的微流控技术	NA	NA	NA
2278	2024-08-07	TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007 PMID:37696493	研究论文	本文介绍并验证了TidyTron，一个用于清洁受DNA、E. coli和S. cerevisiae污染的微量移液管尖和微孔板的协议库，旨在通过自动化液体处理机器人实现单次使用塑料的清洁，以提高可持续性和降低生物研究的成本。	开发了开源、经过验证的协议，使用低成本实验室机器人进行塑料器皿的有效清洁，促进安全再利用。	NA	通过自动化单次使用塑料清洁，提高生物实验室的可持续性和降低成本。	微量移液管尖和微孔板，受DNA、E. coli和S. cerevisiae污染。	生物技术	NA	液体处理机器人	NA	NA	NA
2279	2024-08-07	Employing synthetic biology to expand antibiotic discovery 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100120 PMID:38340893	综述	本文综述了利用合成生物学在抗生素发现领域的最新进展	合成生物学被用作预测和诱导新型天然抗生素的关键策略，通过克隆和突变技术来识别和修改抗生素生物合成基因簇（BGCs），以产生更有效的抗生素	NA	探索和改进抗生素的生物合成途径，以对抗抗药性细菌	抗生素生物合成基因簇（BGCs）及其相关的非核糖体肽合成酶（NRPS）和聚酮合成酶（PKS）途径	合成生物学	抗药性细菌感染	克隆和突变技术	NA	基因序列	NA
2280	2024-08-07	Adhesion of Active Cytoskeletal Vesicles 2018-12-18, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2018.10.013 PMID:30455042	研究论文	研究通过合成生物学方法设计了一个最小实验模型，用于理解形状重塑在粘附过程中的作用，特别是通过调整细胞骨架囊泡的大小、体积和细胞骨架收缩性来实现强粘附。	首次展示了细胞骨架囊泡在主动重塑肌动蛋白皮质的情况下能够维持与固体基质的强粘附，并揭示了变形性和粘附强度之间的平衡是实现粘附的关键。	NA	理解形状重塑在粘附过程中的作用	细胞骨架囊泡的粘附机制	细胞生物学	NA	合成生物学	NA	囊泡	有限数量的构建块