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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2281 | 2024-08-07 |
Optimizing Rhizobium-legume symbioses by simultaneous measurement of rhizobial competitiveness and N2 fixation in nodules
2020-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921225117
PMID:32317381
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发了报告质粒,实现了在单个根瘤中同时高通量测量根瘤菌竞争力和氮固定效率 | 利用绿色荧光蛋白(GFP)和下一代测序(NGS)技术,实现了对根瘤菌竞争力和氮固定效率的同时高通量测量 | NA | 优化根瘤菌-豆科植物共生关系,提高农业产量 | 根瘤菌的竞争力和氮固定效率 | NA | NA | 下一代测序(NGS) | NA | NA | 在农业土壤中同时监测了84种不同的根瘤菌株 |
2282 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology for kelp forest conservation1
2019-Aug, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.12888
PMID:31152453
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学在海藻林保护中的潜在直接和间接应用 | 合成生物学作为快速发展和变革性的科学领域,提供了前所未有的解决方案来应对当前和新兴的环境问题 | 技术进步已经超过了对其使用的社会、伦理和实际考虑 | 探讨合成生物学在遏制或逆转全球海藻损失中的作用,并讨论挑战和研究路径 | 合成生物学在海藻林保护中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2283 | 2024-08-07 |
Algal Photobiology: A Rich Source of Unusual Light Sensitive Proteins for Synthetic Biology and Optogenetics
2016, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-3512-3_3
PMID:26965114
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研究论文 | 本文探讨了真核微藻中的光吸收系统,特别是高度敏感的光感受器,并讨论了其在合成生物学和光遗传学中的应用潜力 | 本文提出通过识别新的光敏感模块和现有模块的小型变体,以扩展光遗传学工具的来源,并促进细胞信号研究中基于光的新策略的发展 | NA | 旨在发现新的光敏感模块,以扩展光遗传学工具的材料来源,并促进细胞信号研究中基于光的新策略的发展 | 真核微藻中的光吸收系统和光感受器 | 合成生物学 | NA | 基因组和转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
2284 | 2024-08-07 |
Arabidopsis thaliana and Pisum sativum models demonstrate that root colonization is an intrinsic trait of Burkholderia cepacia complex bacteria
2014-Feb, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.074351-0
PMID:24327425
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研究论文 | 研究了26种不同种类的Burkholderia cepacia复合体(Bcc)细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | 发现Bcc细菌具有固有的根部定殖能力,不受其物种或来源的影响,且其第三染色体复制子不是根部定殖所必需的 | NA | 探究Bcc细菌在不同植物模型中的根部定殖能力及其与物种和来源的关系 | 26种Bcc细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | NA | NA | 扫描电子显微镜和生物发光成像 | NA | 图像 | 26种Bcc细菌 |
2285 | 2024-08-07 |
Exploiting diversity and synthetic biology for the production of algal biofuels
2012-Aug-16, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature11479
PMID:22895338
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研究论文 | 本文探讨了利用多样性和合成生物学方法生产藻类生物燃料的可能性 | 提出了一种更可持续的生物燃料替代方案,特别是从不需要使用宝贵耕地的藻类中获取 | NA | 研究如何使藻类生物燃料在实际应用中更加可行和经济上可行 | 藻类生物燃料的生产 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2286 | 2024-08-07 |
Tailored bacteria tackling with environmental mercury: Inspired by natural mercuric detoxification operons
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.123016
PMID:38008253
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综述 | 本文综述了基于mer操纵子的细菌在检测、吸收、生物积累和解毒环境汞中的作用 | 利用mer操纵子的四个组成部分(MerR调节因子、mer启动子、解毒因子MerA和MerB)构建合成细菌,以处理污染物汞 | NA | 探讨基于mer操纵子的设计细菌在环境汞生物修复中的潜力 | 环境中的汞及其对生态系统和人类健康的影响 | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程和代谢工程 | NA | NA | NA |
2287 | 2024-08-07 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了生产无细胞壁的L型细菌及其在激活感染革兰氏阳性宿主物种的合成噬菌体基因组中的应用 | 本文开发了新型无标记基因组编辑方法,用于改进治疗性噬菌体,并详细介绍了合成生物学在体外组装改良噬菌体基因组的应用 | 在难以转化的革兰氏阳性细菌中激活合成噬菌体基因组可能具有挑战性 | 研究替代抗菌剂,特别是噬菌体,以治疗抗生素耐药性病原体感染 | L型细菌和合成噬菌体基因组 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
2288 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学技术开发新型分子生物学方法,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 介绍了两种成功用于遗传工程噬菌体基因组的策略:噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | 开发新型分子生物学技术,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 噬菌体及其在病原体控制、检测、靶向药物递送和新材料组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | NA | NA |
2289 | 2024-08-07 |
Characterization and optimization of 5´ untranslated region containing poly-adenine tracts in Kluyveromyces marxianus using machine-learning model
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02271-3
PMID:38172836
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研究论文 | 本文研究了Kluyveromyces marxianus中含多聚腺苷酸(poly(A))的5´非翻译区(5´ UTR)对蛋白质生产的影响,并利用机器学习模型对其进行优化 | 首次构建了包含5´ UTR poly(A)特征的机器学习模型,用于预测蛋白质产量 | 删除或减少poly(A)对mRNA水平的影响不一致,表明其对蛋白质生产的抑制作用可能与mRNA水平无关 | 构建机器学习模型,研究5´ UTR poly(A)对蛋白质生产的影响并进行优化 | Kluyveromyces marxianus中的5´ UTR poly(A)及其对蛋白质生产的影响 | 机器学习 | NA | 机器学习模型 | 多层感知器神经网络(MLP-NN) | 序列数据 | 207个含poly(A)的5´ UTR和34个不含poly(A)的5´ UTR |
2290 | 2024-08-07 |
Heterologous production of 3-hydroxypropionic acid in Methylorubrum extorquens by introducing the mcr gene via a multi-round chromosomal integration system based on cre-lox71/lox66 and transposon
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02275-z
PMID:38172868
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研究论文 | 本研究通过构建基于cre-lox71/lox66和转座子的多轮染色体整合系统,在Methylorubrum extorquens中异源生产3-羟基丙酸(3-HP)。 | 本研究开发了一种新的遗传工具,通过多轮染色体整合系统,实现了在M. extorquens中异源基因的高效表达。 | NA | 本研究旨在通过整合现有技术,如转座子介导的染色体整合和cre-lox介导的重组,实现目标基因在M. extorquens AM1中的多样化表达。 | Methylorubrum extorquens AM1 | 合成生物学 | NA | 转座子介导的染色体整合,cre-lox介导的重组 | NA | 基因表达 | 两个染色体整合拷贝 |
2291 | 2024-08-07 |
CO2-based production of phytase from highly stable expression plasmids in Cupriavidus necator H16
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02280-2
PMID:38172920
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研究论文 | 本研究介绍了一种新型表达质粒,通过电穿孔技术在Cupriavidus necator H16中高效生产源自大肠杆菌的AppA植酸酶。 | 该研究引入了一种新型表达质粒,包含分区系统以提高分离稳定性,无需选择压力,并成功在C. necator H16中生产了植酸酶。 | NA | 建立稳定的、高拷贝数质粒,支持利用C. necator从CO2生产单细胞蛋白,并探索其在饲料工业中利用CO2的潜力。 | Cupriavidus necator H16中的植酸酶生产。 | 合成生物学 | NA | 电穿孔技术 | NA | 蛋白质 | 在1升分批补料气体发酵系统中进行了放大实验。 |
2292 | 2024-08-07 |
Enhancing the production of recombinant adeno-associated virus in synthetic cell lines through systematic characterization
2024-01, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28562
PMID:37749931
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研究论文 | 本文通过系统性表征病毒生产动力学,优化了合成细胞系中重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 采用合成生物学方法生成稳定细胞系,通过条件表达基因和优化诱导条件,提高了rAAV的生产效率 | NA | 提高合成细胞系中rAAV的生产效率 | 重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
2293 | 2024-08-07 |
EMT transcription factors activated circuits: A novel tool to study EMT dynamics and its therapeutic implications
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.010
PMID:38173810
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研究论文 | 本研究介绍了响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | 首次引入响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | NA | 开发新的工具来研究EMT动态过程及其在治疗上的应用 | EMT过程中的细胞命运和靶向治疗 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学电路 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和上皮癌细胞 |
2294 | 2024-08-07 |
Dual Engineering of Olivetolic Acid Cyclase and Tetraketide Synthase for the Formation of Longer Alkyl-Chain Olivetolic Acid Analogs and Their Antibacterial Activities
2024, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c23-00692
PMID:38171898
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综述 | 本文综述了通过双工程化橄榄酸环化酶和四酮合成酶来形成更长烷基链的橄榄酸类似物及其抗菌活性的研究 | 通过混合不同生物合成途径的基因或工程化次级代谢酶以扩展底物和产物特异性,理论上可以生成新的非天然化合物 | NA | 探讨通过工程化酶来扩展非天然大麻素中C-3烷基部分的可能性,以开发具有治疗效益的大麻素 | 橄榄酸环化酶和四酮合成酶的结构基础双工程化及其对橄榄酸类似物抗菌活性的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2295 | 2024-08-07 |
Overexpression of REDUCED WALL ACETYLATION C increases xylan acetylation and biomass recalcitrance in Populus
2023-Dec-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad377
PMID:37399189
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研究论文 | 研究显示,过表达PtRWA-C基因增加了木聚糖的乙酰化水平和木质素含量,从而降低了杨树木质生物质的糖化效率 | 首次揭示了PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化中的功能作用,并发现了AP2家族转录因子HRD对其表达的调控机制 | NA | 探讨PtRWA-C基因在木聚糖乙酰化和生物质糖化效率中的作用及其调控机制 | 杨树(Populus trichocarpa)的PtRWA-C基因及其在生物质转化中的作用 | NA | NA | 基因共表达网络分析,表达数量性状位点(eQTL)分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
2296 | 2024-08-07 |
Postbiotic production: harnessing the power of microbial metabolites for health applications
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1306192
PMID:38169918
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综述 | 本文全面分析了后生物生产的多个方面,包括不同后生物类别的广泛检查,揭示了它们复杂的机制和未来可能显著影响人类健康的应用 | 强调了后生物生产领域的创新,包括从传统发酵到尖端酶转化和合成生物学方法的应用 | 指出了后生物生产中存在的问题,如提高产量、增强稳定性和确保安全性 | 探讨后生物在治疗干预和功能性食品成分生产中的应用潜力 | 后生物及其生产机制 | 微生物组科学 | NA | 发酵、酶转化、合成生物学 | NA | NA | NA |
2297 | 2024-08-07 |
Overcoming Leak Sensitivity in CRISPRi Circuits Using Antisense RNA Sequestration and Regulatory Feedback
2022-Sep-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00155
PMID:36017994
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研究论文 | 本文介绍了一种通过使用反义RNA(asRNA)捕获gRNA转录本以及CRISPRi反馈来自我调节asRNA生产的机制,以抑制CRISPRi的不必要抑制并提高基因电路功能 | 利用asRNA和CRISPRi反馈机制,有效减少了CRISPRi电路中的泄漏敏感性和反向效应,特别是在静态表达期间 | NA | 改进CRISPRi逆变器在复杂遗传电路中的应用,同时保持dCas蛋白的可编程性和正交性 | CRISPRi电路的性能和逻辑功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 基因表达数据 | NA |
2298 | 2024-08-07 |
Utilizing RNA origami scaffolds in Saccharomyces cerevisiae for dCas9-mediated transcriptional control
2022-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac470
PMID:35648481
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研究论文 | 研究利用RNA折纸支架在酵母中通过dCas9介导的转录调控 | 首次探讨了单引导RNA与RNA折纸支架融合体(sgRNAO)在酵母中调控基因表达的能力,并展示了不同适配子位置和支架方向对转录激活的影响 | 尚未完全理解支架上多个适配子的定位及其方向对功能特性的影响 | 研究RNA折纸支架在酵母中的应用,特别是通过CRISPR-dCas9系统进行基因表达调控 | RNA折纸支架、单引导RNA、酵母 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | CRISPR-dCas9 | RNA | NA |
2299 | 2024-08-07 |
Design of Multiplexing CRISPR/Cas9 Constructs for Plant Genome Engineering Using the GoldenBraid DNA Assembly Standard
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1791-5_2
PMID:35188654
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研究论文 | 本文介绍了如何使用GoldenBraid DNA组装系统设计多重CRISPR/Cas9构建体,用于植物基因组工程 | 首次展示了使用GoldenBraid系统进行多重CRISPR/Cas9构建体的设计和应用 | NA | 探索CRISPR/Cas9技术在植物基因组工程中的应用 | 植物基因组 | 基因组工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 涉及烟草(Nicotiana benthamiana)叶片样本 |
2300 | 2024-08-07 |
A Novel and Efficient Genome Editing Tool Assisted by CRISPR-Cas12a/Cpf1 for Pichia pastoris
2021-Nov-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00172
PMID:34644057
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cpf1系统的新型高效基因编辑工具,用于Pichia pastoris的基因组编辑 | 首次实现了使用CRISPR-Cpf1系统删除20kb的大DNA片段和一步整合多个基因 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具,用于Pichia pastoris的代谢工程和基因组进化 | Pichia pastoris | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1 | NA | DNA | NA |