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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2361 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and Transport in Synthetic Vesicles
2016, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2016.00019
PMID:26973834
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综述 | 本文综述了合成囊泡在合成生物学中的应用,特别是简单和嵌套人工囊泡在多隔室生物反应器中的使用 | 本文探讨了将膜转运蛋白整合到简单和嵌套人工囊泡中,以实现子隔间之间特定物质交换的潜力 | 目前大多数隔室化生物反应器依赖于非特异性底物和产物的交换,这限制了其进一步的应用 | 探讨合成囊泡在合成生物学中的应用,特别是如何通过技术进步实现膜蛋白的重构 | 简单和嵌套人工囊泡,以及多隔室生物反应器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2362 | 2024-08-07 |
Genome-Editing Technologies for Enhancing Plant Disease Resistance
2016, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2016.01813
PMID:27990151
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研究论文 | 本文探讨了利用基因编辑技术提高植物病害抗性的策略和目标 | 提出了通过重写效应子-目标序列和修改效应子-目标启动子来增强目标基因表达的策略,以及通过基因编辑技术获得合成基因的方法 | NA | 提高植物病害抗性,促进可持续农业发展 | 植物基因编辑技术和植物免疫系统 | 生物技术 | NA | 基因编辑技术 | NA | 基因序列 | NA |
2363 | 2024-08-07 |
Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants
2015, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2015.1071762
PMID:26176266
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,系统地研究了不同转录区域对基因表达的影响,特别是在酵母中对病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体的理性设计和分析。 | 发现了转录本中先前未探索区域的新因果效应,以及翻译调控与ORF不同部分折叠强度选择之间的关系。 | 研究主要集中在5'UTR和ORF下游120个核苷酸内的区域,对更远区域的探索有限。 | 揭示RNA转录特征与蛋白质表达谱之间的通用因果关系。 | 病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体在酵母中的表达。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录本 | 383个基因变体 |
2364 | 2024-08-07 |
Salinity tolerance in plants. Quantitative approach to ion transport starting from halophytes and stepping to genetic and protein engineering for manipulating ion fluxes
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00873
PMID:26579140
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综述 | 本文从盐生植物和盐敏感植物之间的离子运输差异出发,重点讨论了通过遗传和蛋白质工程操纵离子通量以提高植物耐盐性的方法 | 本文介绍了通过过表达或敲除离子转运蛋白来改变耐盐性的成功尝试,并探讨了通过单点突变修改离子通道和转运蛋白以及合成生物学方法创建新的调控网络以提高耐盐性的潜在方向 | NA | 提高植物的耐盐性 | 植物的离子运输机制和相关蛋白质 | NA | NA | 遗传和蛋白质工程 | NA | 离子通量数据 | NA |
2365 | 2024-08-07 |
Synthetic Peptides as Protein Mimics
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00211
PMID:26835447
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综述 | 本文综述了使用合成肽作为蛋白质模拟物以调节蛋白质功能和为合成生物学提供构建块的最新进展 | 合成肽可以精确复制蛋白质片段,并通过多种化学修饰(包括非蛋白质氨基酸的引入和肽骨架的修饰)来扩展其化学和结构多样性,从而提高其蛋白酶稳定性 | NA | 探索和调节蛋白质功能,通过控制分子间相互作用的干扰 | 合成肽作为蛋白质模拟物 | NA | NA | 合成肽技术 | NA | NA | NA |
2366 | 2024-08-07 |
Construction of synthetic nucleoli and what it tells us about propagation of sub-nuclear domains through cell division
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/15384101.2014.949124
PMID:25486191
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研究论文 | 本文通过合成生物学原理构建人工核仁,探讨亚核域在细胞分裂中的传播机制 | 利用合成生物学方法成功构建人工核仁,揭示了核仁在细胞周期传播中的关键机制 | NA | 深入理解核体在细胞周期中的继承机制 | 细胞核中的核体及其在细胞分裂中的传播 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2367 | 2024-08-07 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-Mar-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
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研究论文 | 本文使用RNA折纸技术开发了一种名为“Traptamer”的RNA机器人设备,该设备能够机械地捕获并释放荧光适配体iSpinach | 首次展示了RNA机器人设备能够作为布尔AND门,并通过可逆控制荧光适配体的荧光来实现对分子过程的增强控制 | NA | 开发先进的RNA机器人设备,用于在医学和合成生物学中的应用 | RNA折纸机器人设备Traptamer及其对荧光适配体iSpinach的捕获和释放机制 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | RNA | NA |
2368 | 2024-08-07 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理,开发了一种名为pREF的多组学控制标准,可作为下一代测序和质谱方法的通用分子标准 | pREF序列编码21个合成基因,可体外转录为插入mRNA控制,并体外翻译生成匹配的蛋白质控制,提供了DNA、RNA和肽检测的定性和定量准确性控制 | NA | 开发一种跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法的集成基因表达测量标准 | DNA、mRNA和蛋白质表达的控制标准 | 基因组学 | NA | 下一代测序、质谱 | NA | DNA、RNA、蛋白质 | 21个合成基因 |
2369 | 2024-08-07 |
HEx: A heterologous expression platform for the discovery of fungal natural products
2018-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aar5459
PMID:29651464
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEx的异源表达平台,用于快速发现真菌天然产物 | HEx平台能够快速、可扩展地表达真菌生物合成基因及其编码的代谢物,特别是对于难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | NA | 克服天然产物发现中的瓶颈,特别是针对难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | 真菌生物合成基因簇及其编码的代谢物 | 合成生物学 | NA | DNA测序 | NA | 基因组数据 | 41个来自世界各地不同真菌物种的生物合成基因簇,其中22个产生了可检测的化合物 |
2370 | 2024-08-07 |
Analysis of the leakage of gene repression by an artificial TetR-regulated promoter in cyanobacteria
2015-Sep-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-015-1425-0
PMID:26387086
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研究论文 | 研究分析了在蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 通过理论模拟DNA呼吸动力学和表面等离子体共振(SPR)生物传感器技术分析DNA-蛋白质相互作用的动态速率常数,揭示了L09启动子泄漏问题的原因 | 研究仅限于L09启动子与其他点突变启动子(L10、L11、L12)的比较,未涉及其他类型的启动子 | 识别和分析蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 蓝细菌Synechocystis PCC 6803中的TetR调控启动子L09 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体共振(SPR)生物传感器技术 | 非线性Peyrard-Bishop-Dauxois介观模型 | DNA | 涉及L09、L10、L11、L12四个启动子 |
2371 | 2024-08-07 |
Transcriptome analysis of 20 taxonomically related benzylisoquinoline alkaloid-producing plants
2015-Sep-18, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-015-0596-0
PMID:26384972
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研究论文 | 本研究对20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物进行了转录组分析 | 首次对非模式植物中的苯并异喹啉生物碱生物合成基因进行了全面挖掘和功能分析 | NA | 探索和发现苯并异喹啉生物碱代谢中的功能同源物和全新催化剂 | 20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物 | 植物生物化学 | NA | 转录组测序 | NA | RNA | 20种植物样本 |
2372 | 2024-08-07 |
Xylonucleic acid: synthesis, structure, and orthogonal pairing properties
2015-Sep-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkv719
PMID:26175047
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研究论文 | 本文首次报道了含有木糖(一种可能的原始木糖)的木糖核酸(XyloNA)的合成及其寡核苷酸的组装,并通过热UV熔解、圆二色谱和溶液态NMR光谱研究了其配对和结构特性。 | XyloNA被证明是一种正交自配对系统,采用略微右旋的扩展螺旋几何结构,为合成生物学中的应用提供了潜在的正交遗传系统。 | 尽管XyloNA显示出正交自配对的特性,但其结构-功能(配对)特性相对于DNA/RNA较差,限制了其在原始环境中的信息聚合物选择。 | 研究木糖核酸(XyloNA)的合成、结构及其在合成生物学和生命起源领域的配对特性。 | 木糖核酸(XyloNA)及其寡核苷酸的合成与结构特性。 | 合成生物学 | NA | 热UV熔解、圆二色谱、溶液态NMR光谱 | NA | NA | 四个XyloNA核苷酸构建块及其寡核苷酸 |
2373 | 2024-08-07 |
Towards a behavioral-matching based compilation of synthetic biology functions
2015-Sep, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-015-9265-9
PMID:26141968
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research paper | 本文探讨了合成生物学领域中基于行为匹配的编译合成生物学功能的高级语言设计问题 | 提出了Gubs语言,这是一种用于描述预期行为的规范语言,并通过编译器选择合适的组件以确保合成生物学功能的行为符合编程要求 | NA | 开发一个在计算机辅助设计环境中用于安全设计可靠新生物功能的工程框架 | 合成生物学中的高级语言设计 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
2374 | 2024-08-07 |
Jump-starting life? Fundamental aspects of synthetic biology
2015-Aug-31, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.201506125
PMID:26323686
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research paper | 本文探讨了生命起源的基本问题以及合成生物学与定量科学结合可能提供的新概念和工具 | 提出合成生物学与定量科学结合可能为生命起源问题提供新的解决方案 | NA | 探讨生命起源问题 | 生命的起源及其最小单位——细胞 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
2375 | 2024-08-07 |
Emerging concepts promising new horizons for marine biodiscovery and synthetic biology
2015-May-13, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md13052924
PMID:25984990
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综述 | 本文综述了海洋生物活性肽的发现及其功能潜力,特别是lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等,并探讨了其在细胞间通信中的作用及如何利用这些特性发现新的生物活性 | 结合生物信息学和合成生物学的最新进展,通过遗传和生化特性分析,为下一代社会解决方案的开发提供潜在途径 | NA | 探讨海洋生物活性肽的发现及其在生物技术和制药领域的应用潜力 | 海洋生物活性肽,包括lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等 | 合成生物学 | NA | 生物信息学 | NA | 生物活性化合物 | NA |
2376 | 2024-08-07 |
Assembly of RNA nanostructures on supported lipid bilayers
2015-Jan-14, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c4nr05968a
PMID:25417592
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研究论文 | 研究在流动脂质双层上自组装RNA构建块形成三维RNA结构的过程 | 首次探索了利用横向移动的脂质双层在表面控制RNA三维纳米结构形成的方法 | NA | 研究RNA纳米结构在脂质双层上的自组装过程及其调控机制 | RNA纳米结构在流动脂质双层上的自组装 | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
2377 | 2024-08-07 |
Cartoons on bacterial balloons: scientists' opinion on the popularization of synthetic biology
2014-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-014-9155-5
PMID:26396656
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研究论文 | 本文通过研究一组关于合成生物学的漫画,探讨科学家对合成生物学媒体覆盖的看法 | 通过漫画分类和国际调查,评估合成生物学研究群体对科学传播的看法 | 调查样本数量有限,可能影响结果的普遍性 | 了解科学家对合成生物学媒体传播的感知 | 合成生物学研究群体的科学传播看法 | NA | NA | NA | NA | NA | 101份回复 |
2378 | 2024-08-07 |
New opportunities by synthetic biology for biopharmaceutical production in Pichia pastoris
2013-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2013.02.024
PMID:23522654
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综述 | 本文讨论了利用合成生物学工具改造甲基营养酵母毕赤酵母(Pichia pastoris)以用于生物制药生产的现状和新兴方法 | 引入了合成启动子以避免甲醇诱导和精细调节蛋白质生产,以及新的平台菌株和分子克隆工具,以及体内糖基工程以生产人源化糖型 | NA | 探讨如何通过合成生物学改进毕赤酵母作为生物制药生产宿主的性能 | 甲基营养酵母毕赤酵母(Pichia pastoris)及其在生物制药生产中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2379 | 2024-08-07 |
Microbial production of lactate-containing polyesters
2013-Nov, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.12066
PMID:23718266
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综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产含乳酸聚酯的策略及其优化方法 | 介绍了系统代谢工程整合传统代谢工程与系统生物学、合成生物学等技术,实现微生物高效生产天然及非天然产品的创新方法 | 讨论了进一步提高含乳酸聚酯生产的主要问题 | 探讨微生物代谢工程在体内生物合成含乳酸聚酯的策略及整体细胞代谢优化 | 微生物作为生物催化剂,用于高效生产目标生物产品 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2380 | 2024-08-07 |
Construction of a prophage-free variant of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 for use as a platform strain for basic research and industrial biotechnology
2013-Oct, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/AEM.01634-13
PMID:23892752
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研究论文 | 本文介绍了构建无原噬菌体变种MB001的过程,该变种基于工业氨基酸生产菌株Corynebacterium glutamicum ATCC 13032,其基因组减少了6% | MB001表现出更好的生长和适应性,特别是在SOS反应诱导条件下,并且具有更高的转化效率和异源模型蛋白eYFP的产量 | NA | 构建一种新的平台菌株,用于代谢工程和合成生物学 | Corynebacterium glutamicum ATCC 13032的无原噬菌体变种MB001 | 工业生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |