合成生物学相关文章
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当前共找到 2992 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-08-07 |
Chemistry of nucleic acids: impacts in multiple fields
2011-Jul-07, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c1cc11021g
PMID:21483917
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review | 本文综述了过去十年中核酸研究在多个科学和技术领域的重要进展，特别强调了化学在这些发展中的作用和影响。 | NA | NA | 探讨化学在核酸研究中的影响及其在生物学、化学、生物技术、合成生物学、纳米结构和光学材料等领域的发展。 | DNA和RNA研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2382 | 2024-08-07 |
Introduction of customized inserts for s-treamlined assembly and optimization of BioBrick synthetic genetic circuits
2010-Dec-20, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-4-17
PMID:21172029
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定制插入物快速生成合成生物电路的技术，并在大肠杆菌中展示了其应用 | 该技术使用了一种新型BioBrick部件（BioScaffold），可以在克隆载体中插入和切除，从而在克隆载体中留下一个间隙，用于放置其他DNA元素 | 标准组装过程不允许对已组装的生物电路进行修改，添加蛋白质标签到现有的BioBrick部件，或添加非BioBrick部件到组装中 | 简化并加速迭代设计-构建-测试过程，允许将不兼容BioBrick组装的序列整合到BioBrick电路中 | 合成生物电路的快速生成和优化 | 合成生物学 | NA | Type IIB限制酶 | NA | DNA序列 | 在大肠杆菌中进行了实验，表达绿色荧光蛋白（GFP）并添加N端标签 |
| 2383 | 2024-08-07 |
Engineered microorganisms: A new direction in kidney stone prevention and treatment
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.02.005
PMID:38510204
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造微生物在预防和治疗肾结石中的研究现状 | 利用合成生物学方法使益生菌获得新的表型或异源蛋白表达能力，通过直接降解促进结石生成的代谢物或间接调节菌群稳态来有效抑制肾结石的发展 | 目前存在的天然益生菌有局限性 | 提供预防和治疗肾结石的新有效思路 | 肠道和尿路中的微生物 | 合成生物学 | 肾结石 | 微生物工程 | NA | NA | NA |
| 2384 | 2024-08-07 |
Empowering Protein Engineering through Recombination of Beneficial Substitutions
2024-Mar-15, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202303889
PMID:38288640
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综述 | 本文综述了通过重组有益替换来增强蛋白质工程潜力的实验和计算机辅助方法 | 强调了集成和机器学习引导策略在生成具有更好多样性、覆盖范围和大小的筛选库中的作用 | NA | 探讨如何通过重组方法实现单个有益替换的潜在增强 | 蛋白质工程中的重组方法 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2385 | 2024-08-07 |
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering
2024-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011929
PMID:38457467
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研究论文 | 本文介绍了一个名为teemi的开源计算机辅助设计和分析平台，该平台采用文学编程用户界面，支持生物工程中的迭代设计-构建-测试-学习循环。 | teemi平台遵循FAIR原则，支持用户友好的模拟、组织和指导，以及机器学习在代谢途径设计中的应用。 | NA | 开发一个支持生物工程迭代设计-构建-测试-学习循环的开源平台。 | 生物工程中的设计、模拟、数据集成和分析，以及代谢途径的机器学习设计。 | 生物工程 | NA | 机器学习 | NA | 多变量数据集 | NA |
| 2386 | 2024-08-07 |
Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44988-8
PMID:38316765
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研究论文 | 本文描述了一种基于条件性稳定必需蛋白质的遗传编码生物遏制系统 | 该系统基于条件性蛋白质稳定性，机制上与先前报道的遗传生物遏制系统正交 | NA | 开发一种遗传编码的生物遏制系统，以确保工程微生物在开放环境应用中的安全性 | 酵母菌的遗传生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码生物遏制系统 | NA | 基因数据 | 775个必需基因 |
| 2387 | 2024-08-07 |
Flapjack: Data Management and Analysis for Genetic Circuit Characterization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_23
PMID:38468101
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research paper | Flapjack平台为合成基因电路工程的DBTL循环中的设计、构建、测试和学习阶段提供了一个全面的数据管理和分析解决方案 | Flapjack平台通过其用户友好的界面和与外部软件的兼容性，为合成生物学研究提供了一个实用的工具 | NA | 解决合成基因电路工程DBTL循环中的挑战，促进基因电路的表征和优化 | 合成基因电路的表征和优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据和相关元数据 | NA |
| 2388 | 2024-08-07 |
Metaphors in search of a target: the curious case of epigenetics
2015-Apr-03, New genetics and society
IF:1.3Q4
DOI:10.1080/14636778.2015.1034849
PMID:26064079
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研究论文 | 本文探讨了在表观遗传学背景下隐喻的产生，通过收集科学和流行写作中的隐喻例子以及对英国两家大报中使用的隐喻进行系统分析 | 分析了表观遗传学中隐喻的来源域和目标域的不确定性，揭示了科学界和社会对表观遗传学理解的挣扎 | 难以确定隐喻的目标域，这可能反映了科学界和社会对表观遗传学意义的争议 | 探讨表观遗传学中隐喻的产生及其在科学和公众沟通中的应用 | 表观遗传学中的隐喻及其在科学和公众沟通中的使用 | NA | NA | NA | NA | 文本 | 涉及两份英国大报中的隐喻使用 |
| 2389 | 2024-08-07 |
Conformational Study of an Artificial Metal-Dependent Regulation Site for Use in Designer Proteins
2013-Jul, Zeitschrift fur anorganische und allgemeine Chemie
IF:1.1Q4
DOI:10.1002/zaac.201300131
PMID:25995524
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2390 | 2024-08-07 |
Cooperativity to increase Turing pattern space for synthetic biology
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500233u
PMID:25122550
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研究论文 | 本文通过建模反应扩散系统，探讨了如何在合成生物学中增加图灵模式的参数空间 | 研究预测了陡峭的剂量-反应函数（由协同作用产生）对于图灵模式是必要的，这种陡峭性增加了参数空间并减少了激活剂和抑制剂之间差异扩散的需求 | 本文主要探讨了线性场景在反应扩散系统中的局限性 | 旨在理解和工程化图灵模式网络，以应用于合成生物学 | 研究对象为反应扩散系统中的两种形态发生素 | 合成生物学 | NA | 反应扩散系统建模 | 反应扩散模型 | 参数空间分析 | NA |
| 2391 | 2024-08-07 |
Chassis organism from Corynebacterium glutamicum--a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters
2015-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201400041
PMID:25139579
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研究论文 | 本研究采用自上而下的方法，从谷氨酸棒杆菌ATCC 13032中构建底盘生物，旨在识别并删除与在定义培养基上快速生长无关的基因簇 | 研究引入了相关基因的新概念，并展示了构建适用于生物技术应用底盘的一般策略 | NA | 通过删除无关基因簇，减少谷氨酸棒杆菌的基因组大小，以构建适用于生物技术应用的底盘生物 | 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032的基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因敲除 | NA | 基因组数据 | 41个基因簇，其中36个成功删除，10个基因组减少的菌株显示出生长速率受损 |
| 2392 | 2024-08-07 |
Engineering living functional materials
2015-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500113b
PMID:25592034
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研究论文 | 本文提出并验证了通过合成生物学工具，将活细胞与无机组件结合，创造出具有新型功能的'活功能材料'和'活材料合成平台'的概念 | 本文首次展示了通过合成基因电路在E. coli生物膜中实现化学诱导响应的电开关，并动态组织生物-无机材料，模板化金纳米棒、金纳米线和金属/半导体异质结构，以及合成半导体纳米颗粒 | NA | 探索通过合成生物学工具创造新型活功能材料和活材料合成平台的可能性 | E. coli生物膜与无机材料的结合 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | 生物膜 | NA |
| 2393 | 2024-08-07 |
When plants produce not enough or at all: metabolic engineering of flavonoids in microbial hosts
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00007
PMID:25688249
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综述 | 本文综述了通过生物技术生产天然或非天然黄酮类化合物的合理方法，分析了异源生物中农业/医药化合物组合生物合成的意义 | 利用微生物细胞培养作为生物工厂，通过代谢工程方法强化自然代谢途径，发现新的天然和非天然植物黄酮类化合物的生产方式 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的代谢工程和合成生物学应用 | 化学生物工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2394 | 2024-08-07 |
Core concept: Synthetic biology-change, accelerated
2014-Dec-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1419688111
PMID:25468948
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2395 | 2024-08-07 |
Effective use of a horizontally-transferred pathway for dichloromethane catabolism requires post-transfer refinement
2014-Nov-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.04279
PMID:25418043
|
研究论文 | 研究通过实验室进化模拟水平基因转移和精炼过程，展示了引入的二氯甲烷降解途径的有效使用需要细菌宿主发生特定的突变 | 构建了一个携带降解途径和氯离子出口蛋白的合成移动遗传元件，直接促进了在多种Methylobacterium环境分离株中有效降解二氯甲烷 | NA | 探讨水平基因转移后精炼过程的重要性及其在生物修复和合成生物学中的应用 | 水平基因转移后的基因和途径在微生物中的功能及进化精炼 | NA | NA | 实验室进化 | NA | 遗传元件 | 两种自然降解二氯甲烷的菌株及多种Methylobacterium环境分离株 |
| 2396 | 2024-08-07 |
Synthetic biology outside the cell: linking computational tools to cell-free systems
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00066
PMID:25538941
|
综述 | 本文探讨了生物化学网络的体内外模型，特别关注可应用于无细胞表达系统构建的工具 | 本文强调了将数学模型与无细胞系统结合的新一代仿生系统的开发 | NA | 探索生物化学网络模型，并应用于无细胞表达系统的构建 | 生物化学网络的体内外模型及无细胞表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2397 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of phenotypic adaptation in vertebrates: the next frontier
2013-Jul, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/mst075
PMID:23603936
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法研究脊椎动物表型适应性的新前沿 | 提出通过合成和操纵“适当”的祖先表型来建立基因型与表型之间的关系，并通过研究适应性突变的化学作用来学习其功能 | 目前大多数正选择氨基酸位点的统计结果尚未经过实验验证 | 通过实验测试正选择氨基酸位点的统计结果，并建立基因型与表型之间的关系 | 脊椎动物的表型适应性及其与环境行为变化的关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2398 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to understanding cellular information processing
2012-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb300044r
PMID:23411668
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综述 | 本文综述了合成生物学在理解细胞信息处理中的应用和发展 | 合成生物学方法揭示了网络基序的新动态，如简单基序组合产生的自主动态和转录翻译噪声对基序动态的影响 | NA | 增加对细胞信息处理的理解 | 细胞网络的动态特性和网络基序的行为 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路构建与分析 | NA | NA | NA |
| 2399 | 2024-08-07 |
Targeting duplex DNA with chimeric α,β-triplex-forming oligonucleotides
2012-Sep, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gks410
PMID:22641847
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研究论文 | 研究设计了一系列短的嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs)，并研究了它们与荧光标记的二链发夹的相互作用 | 首次报道了嵌合TFOs能够识别双链DNA中的碱基对反转 | NA | 解决三链DNA识别严格受限于多嘌呤序列的问题 | 嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs)与荧光标记的二链发夹的相互作用 | NA | NA | 原生凝胶电泳、阵列热变性和荧光淬灭实验 | NA | DNA | NA |
| 2400 | 2024-08-07 |
Microfluidic technologies for synthetic biology
2011, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms12063576
PMID:21747695
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学中的最新应用，强调其在基因表达/调控动态分析、代谢物的高灵敏度芯片内外检测以及全细胞分析中的潜力 | 微流控技术能够提供前所未有的手段，加速合成生物学的发展，特别是在高分辨率动态基因表达/调控分析和代谢物的高灵敏度检测方面 | NA | 探讨微流控技术如何加速合成生物学的发展，并提供新的生物部件和系统 | 微流控技术在合成生物学中的应用，包括基因表达/调控的动态分析、代谢物的检测和全细胞分析 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 生物和生化样本 | NA |