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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2381 | 2024-08-07 |
Formation of subcellular compartments by condensation-prone protein OsJAZ2 in Oryza sativa and Nicotiana benthamiana leaf cells
2023-Feb, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-022-02955-x
PMID:36449075
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研究论文 | 本研究报道了OsJAZ2蛋白在Oryza sativa和Nicotiana benthamiana叶细胞中形成凝聚物的特性及其在构建人工细胞区室中的应用 | OsJAZ2蛋白通过多价相互作用形成凝聚物,可用于在植物细胞中构建人工区室 | NA | 探索OsJAZ2蛋白在植物细胞中形成凝聚物的机制及其在生物工程和合成生物学中的应用潜力 | OsJAZ2蛋白及其在植物细胞中的凝聚物形成 | 生物工程 | NA | 荧光恢复后漂白(FRAP)分析 | NA | 蛋白质 | 涉及Oryza sativa和Nicotiana benthamiana两种植物细胞 |
2382 | 2024-08-07 |
Synthetic genetic circuits to uncover and enforce the OCT4 trajectories of successful reprogramming of human fibroblasts
2023-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.25.525529
PMID:36747813
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研究论文 | 本文通过设计合成遗传电路来识别和强化人类成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞(iPSCs)过程中OCT4转录因子的成功轨迹 | 开发了一种合成遗传电路,能够精确控制OCT4的分布,提高重编程效率 | NA | 探索转录因子动态变化对重编程效率的影响,并设计遗传控制器来强化成功轨迹 | 人类成纤维细胞重编程为iPSCs过程中的OCT4转录因子轨迹 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | 遗传控制器 | 细胞图像 | NA |
2383 | 2024-08-07 |
Discovery, Structure, and Mechanism of a Class II Sesquiterpene Cyclase
2022-12-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09412
PMID:36416740
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研究论文 | 本文报道了从基因组挖掘中发现并结构表征了两类II型倍半萜环化酶(STCs),这些drimenyl二磷酸合酶(DMSs)是首次被证明具有β,γ-双域结构的STCs。 | 本研究首次揭示了II型倍半萜环化酶的结构和机制细节,特别是通过高分辨率X射线晶体结构展示了DMS与法呢基二磷酸和镁的复合物,揭示了一种前所未有的镁结合模式。 | NA | 研究目的是揭示II型倍半萜环化酶的结构和机制,为环化酶工程和合成生物学提供新的机制见解。 | 研究对象是两类II型倍半萜环化酶(STCs)及其结构和机制。 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 两类II型倍半萜环化酶(STCs) |
2384 | 2024-08-07 |
Detection and validation of cis-regulatory motifs in osmotic stress-inducible synthetic gene switches via computational and experimental approaches
2022-11, Functional plant biology : FPB
IF:2.6Q2
DOI:10.1071/FP21314
PMID:35940614
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研究论文 | 本文通过计算和实验方法,研究了在渗透胁迫诱导的合成基因开关中cis调控基序的检测和验证 | 发现了与已知cis元件相似但尚未涉及干旱响应的新型cis调控基序,并设计了合成启动子以提高作物对干旱胁迫的耐受性 | NA | 研究合成cis调控模块以加深对基因调控网络的理解,并提高作物对干旱胁迫的耐受性 | 大豆和拟南芥的干旱诱导基因及其cis调控基序 | 合成生物学 | NA | 结合使用计算工具(BEST)和实验方法 | NA | 基因序列 | 181个干旱诱导的不同表达大豆基因,以及转基因大豆幼苗和3周龄的转基因拟南芥植物 |
2385 | 2024-08-07 |
Construction of 5-aminolevulinic acid synthase variants by cysteine-targeted mutation to release heme inhibition
2022-Nov, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2022.07.019
PMID:36089467
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研究论文 | 本文通过半胱氨酸靶向突变构建了5-氨基乙酰丙酸合酶变体,以解除血红素抑制 | 通过半胱氨酸靶向突变策略,成功提高了5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除了血红素抑制 | NA | 研究如何通过突变提高5-氨基乙酰丙酸合酶的活性并解除血红素抑制 | 5-氨基乙酰丙酸合酶及其在生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症, 冠状病毒病2019 (COVID-19), 代谢疾病 | 半胱氨酸靶向突变 | NA | 酶活性数据 | 两种来源的5-氨基乙酰丙酸合酶及其八个变体 |
2386 | 2024-08-07 |
Synthetic biology-instructed transdermal microneedle patch for traceable photodynamic therapy
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33837-1
PMID:36266306
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法构建了一种透皮治疗诊断微针贴片,该贴片集成了5-氨基乙酰丙酸和过氧化氢酶共载的肿瘤酸度响应性铜掺杂磷酸钙纳米粒子,用于提高5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗效率。 | 通过合成生物学方法,实现了肿瘤内原卟啉IX的富集最大化,并通过过氧化氢酶在体内的持续氧气生成,逆转肿瘤缺氧,增强原卟啉IX的积累。 | NA | 优化5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的参数,实现对不同癌症的重复性光动力治疗。 | 5-氨基乙酰丙酸基光动力治疗的效果及肿瘤内原卟啉IX的代谢动力学。 | 生物技术 | NA | 光动力治疗 | NA | 荧光/光声双模态成像 | NA |
2387 | 2024-08-07 |
Natural variation meets synthetic biology: Promiscuous trichome-expressed acyltransferases from Nicotiana
2022-08-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiac192
PMID:35477794
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研究论文 | 本研究通过转录组学引导的酶发现和体内外分析,探索了烟草属中腺毛表达的酰基转移酶在酰基糖合成中的多样性和机制 | 发现了烟草属中超过300种独特的酰基糖,并揭示了酰基转移酶在酰基供体和酰基受体选择性上的多变性,为合成生物学工具的开发提供了新思路 | NA | 深入理解烟草属中酰基糖的多样性和合成机制 | 烟草属中的腺毛提取物和酰基转移酶 | 生物技术 | NA | 转录组学,液相色谱-质谱联用 | NA | 转录组数据,代谢物 | 涉及烟草属中多个物种的腺毛提取物和酰基转移酶 |
2388 | 2024-08-07 |
Building the Plant SynBio Toolbox through Combinatorial Analysis of DNA Regulatory Elements
2022-08-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00147
PMID:35901078
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研究论文 | 本文通过组合分析DNA调控元件,设计、构建并测试了91个转基因盒,用于评估植物中的相对表达强度。 | 本文首次在植物中进行了调控元件的组合分析,并建立了一个包含37个成员的植物调控元件库,为植物精准代谢工程的构建设计标准化提供了必要数据。 | 文章未提及具体的局限性。 | 旨在扩展植物合成生物学工具箱,通过组合分析DNA调控元件来优化转基因植物的设计和构建。 | 研究对象包括91个转基因盒和37个植物调控元件。 | 合成生物学 | NA | 转基因技术 | NA | 表达数据 | 91个转基因盒,37个植物调控元件 |
2389 | 2024-08-07 |
Manufacturing specialized wax esters in plants
2022-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2022.05.005
PMID:35598886
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研究论文 | 本研究探讨了通过在烟草叶片中瞬时表达不同组合的基因来实现植物内合成特定应用的蜡酯的可能性 | 成功在植物中合成具有工业重要性的类似鲸蜡蜡酯,并捕获了结构类似于蛾信息素化合物的非饱和脂肪酸和脂肪酸酯 | 识别了可能的积累瓶颈,需要进一步稳定转化以积累特定蜡酯 | 探索在植物中合成特定应用的蜡酯的可能性 | 烟草叶片中的蜡酯合成 | NA | NA | 瞬时基因表达 | NA | NA | NA |
2390 | 2024-08-07 |
High-Throughput Transfection and Analysis of Soybean (Glycine max ) Protoplasts
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2164-6_17
PMID:35258837
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研究论文 | 本文描述了一种优化的方法,用于制备大豆暗培养细胞悬浮液,随后进行原生质体分离、自动化转染及后续筛选 | 本文引入了低成本食品级酶用于细胞壁消化和聚乙二醇(PEG)介导的转染,使原生质体特别适合自动化和高通量筛选 | NA | 开发基于植物的系统,以有效加快设计-构建-测试循环的速度,筛选大量合成构建体 | 大豆(Glycine max)原生质体 | 合成生物学 | NA | 聚乙二醇(PEG)介导的转染 | NA | 细胞悬浮液 | NA |
2391 | 2024-08-07 |
An in vivo plant platform to assess genes encoding native and synthetic enzymes for carotenoid biosynthesis
2022, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2022.03.005
PMID:35878991
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研究论文 | 本文介绍了如何在植物体内评估编码天然和合成酶的基因,用于类胡萝卜素生物合成 | 提供了在植物体内表达候选或改造酶的详细步骤,并使用高效液相色谱法(HPLC)和脉冲振幅调制(PAM)荧光测量法评估酶活性 | NA | 研究如何利用植物平台测试编码类胡萝卜素生物合成酶的候选基因及其合成生物学应用 | 编码类胡萝卜素生物合成酶的候选基因及其工程化酶版本 | 合成生物学 | NA | 高效液相色谱法(HPLC),脉冲振幅调制(PAM)荧光测量法 | NA | 植物组织 | 涉及烟草(Nicotiana benthamiana)叶片组织 |
2392 | 2024-08-07 |
Advances in production and structural derivatization of the promising molecule ursolic acid
2021-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202000657
PMID:34096160
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综述 | 本文综述了熊果酸(UA)的生产、结构修饰及其在药物活性增强方面的研究进展 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学实现UA及其衍生物的绿色合成,并讨论了大规模微生物生产UA的潜力 | NA | 旨在探索更多多样化的结构以提高UA的药理活性,并增加其生物产量以满足工业需求 | 熊果酸及其衍生物 | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
2393 | 2024-08-07 |
Plant cell cultures as heterologous bio-factories for secondary metabolite production
2021-09-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2021.100235
PMID:34746764
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研究论文 | 本文探讨了利用植物细胞培养作为异源生物工厂生产高价值植物特异性次级代谢物的潜力 | 提出植物细胞培养作为生产高价值代谢物的新型异源系统,具有安全、低成本和环保的优势 | 目前利用植物平台生物合成代谢物的种类有限,异源生物合成途径的引入尚未广泛应用 | 探讨植物细胞培养在生产高价值植物特异性代谢物中的应用前景 | 植物细胞培养及其在次级代谢物生产中的应用 | NA | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | 涉及多种植物物种的细胞培养 |
2394 | 2024-08-07 |
LED control of gene expression in a nanobiosystem composed of metallic nanoparticles and a genetically modified E. coli strain
2021-Jun-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-00937-x
PMID:34174890
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研究论文 | 本文设计了一种由生物相容性金纳米颗粒和基因改造的E. coli组成的纳米生物系统,该系统可通过LED光进行光热触发,实现mCherry荧光蛋白的生产。 | 提出了一种新的、更便宜、可扩展且对生物体无破坏性的光热蛋白生产系统。 | 需要进一步研究以优化生物光感受器的设计,并确保其对不同波长的响应。 | 开发一种非侵入性的外部基因表达调控方法,具有时空控制和可扩展性,同时对系统影响最小。 | 基因改造的微生物和金属纳米颗粒。 | 生物技术 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
2395 | 2024-08-07 |
Combining Metabolic and Monoterpene Synthase Engineering for de Novo Production of Monoterpene Alcohols in Escherichia coli
2021-06-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00081
PMID:34100588
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研究论文 | 本研究通过结合代谢工程和单萜合成酶工程,在埃希氏菌中提高了非环状萜醇和双环萜醇的生产 | 通过结构模拟和位点定向突变筛选出能显著提高非环状萜醇或双环萜醇生产的变体,并优化了发酵过程,实现了微生物中萜醇的最高产量 | NA | 开发一种组合工程策略,用于微生物生产天然萜醇 | 非环状萜醇(萘醇)和双环萜醇(硼醇)的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | 埃希氏菌工程菌株ENO2和ENB57分别生产966.55 mg/L萘醇和87.20 mg/L硼醇 |
2396 | 2024-08-07 |
Engineering Tobacco Mosaic Virus and Its Virus-Like-Particles for Synthesis of Biotemplated Nanomaterials
2021-Apr, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202000311
PMID:33135368
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综述 | 本文综述了烟草花叶病毒(TMV)及其病毒样颗粒(VLP)作为生物模板合成功能性纳米材料的特性及其应用 | 文章探讨了通过合成生物学、机器学习等领域的进展,如何加速控制模板均匀性和纳米材料合成的努力,以促进VLP基生物模板在工业中的更广泛应用 | 目前控制VLP表面特征的技术较为成熟,但控制VLP自组装的工具较少,这限制了对模板均匀性和某些模板化纳米材料合成的控制 | 探讨如何通过遗传修饰和自组装过程的控制,扩展TMV及其VLP在纳米材料合成中的应用和功能 | 研究对象为烟草花叶病毒及其病毒样颗粒,以及它们在纳米材料合成中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2397 | 2024-08-07 |
Imaging of multiple fluorescent proteins in canopies enables synthetic biology in plants
2021-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13510
PMID:33179383
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研究论文 | 本文介绍了一种新的平台——荧光诱导激光投影仪(FILP),用于远距离成像表达多种荧光蛋白基因的植物冠层 | 首次展示了在植物冠层中成像多种荧光蛋白的能力,并利用FILP系统进行了快速合成启动子筛选 | NA | 探索利用荧光蛋白技术在植物生物学中的应用,特别是通过成像技术研究转基因植物的表型 | 转基因植物中表达的多种荧光蛋白 | 生物技术 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | 在实验室激光范围内对20种荧光蛋白进行了成像 |
2398 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology of Cannabinoids and Cannabinoid Glucosides in Nicotiana benthamiana and Saccharomyces cerevisiae
2020-10-23, Journal of natural products
IF:3.3Q1
DOI:10.1021/acs.jnatprod.0c00241
PMID:33000946
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研究论文 | 本文通过元转录组分析大麻,识别了UbiA超家族的芳香性预转移酶和查尔酮异构酶样(CHIL)蛋白基因,并在烟草和酵母中进行了异源生物合成大麻素的研究。 | 首次在烟草和酵母中实现了大麻素的异源生物合成,并发现了新的糖基化大麻素。 | NA | 探索大麻素的异源生物合成及其糖基化衍生物的生产。 | 大麻素及其糖基化衍生物。 | 合成生物学 | NA | 元转录组分析 | NA | 基因数据 | NA |
2399 | 2024-08-07 |
Use of synthetic biology tools to optimize the production of active nitrogenase Fe protein in chloroplasts of tobacco leaf cells
2020-09, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13347
PMID:31985876
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研究论文 | 本文利用合成生物学工具优化烟草叶绿体中活性固氮酶铁蛋白(NifH)的生产 | 首次在烟草叶绿体中成功优化活性固氮酶铁蛋白的生产,并证明了叶绿体作为功能性固氮酶蛋白宿主的适宜性 | NA | 旨在通过合成生物学工具优化固氮酶铁蛋白在烟草叶绿体中的生产,以推动农业绿色革命 | 烟草叶绿体中的固氮酶铁蛋白(NifH)及其相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 蛋白质 | NA |
2400 | 2024-08-07 |
Activity evaluation of glycolytic promoters from Escherichia coli and application for mevalonate biosynthesis
2020-07, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2020.105946
PMID:32413369
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研究论文 | 本研究通过使用单体红色荧光蛋白(mRFP)作为报告基因,克隆并表征了来自大肠杆菌糖酵解途径的十个启动子,并将其应用于甲羟戊酸生物合成系统,以评估其活性并探索其在代谢工程中的应用。 | 本研究发现糖酵解启动子具有组成型启动子的优势,并且在强度上高于常用的诱导型启动子Plac,为大肠杆菌的代谢工程提供了新的工具。 | NA | 识别更多组成型启动子以避免诱导型启动子带来的代谢负荷和成本问题。 | 大肠杆菌糖酵解途径的启动子及其在甲羟戊酸生物合成中的应用。 | 代谢工程 | NA | 基因克隆 | NA | 基因表达 | 十个来自大肠杆菌糖酵解途径的启动子 |