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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2401 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of minimal living cells: primitive cell models and semi-synthetic cells
2010-Sep, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-010-9054-3
PMID:21886680
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研究论文 | 本文总结了2009年ESF合成生物学会议上关于生命最小需求和生物学研究中建设性(合成)方法的概念贡献 | 定义了半合成最小细胞,这些人工制造的基于囊泡的系统由最少数量的基因、蛋白质和生物大分子组成,并可被定义为活的 | NA | 探讨生命最小需求和生物学研究中的合成方法 | 最小生命细胞模型和半合成细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2402 | 2024-08-07 |
Professionalization as a governance strategy for synthetic biology
2009-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-009-9037-4
PMID:19816804
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研究论文 | 本文探讨了将专业化作为合成生物学治理策略的问题,并通过与科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的访谈,分析了专业化的优缺点及其在合成生物学治理中的应用。 | 本文提出专业化作为一种治理策略,能够克服当前合成生物学治理辩论中的二分法,如“自上而下”与“自下而上”的治理模式以及科学事实与公众价值观的对立。 | 专业化作为一种治理选项,存在局限性,特别是在战争与和平问题上。 | 探讨专业化作为合成生物学治理策略的有效性及其潜在影响。 | 科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的观点和经验。 | NA | NA | NA | NA | 访谈数据 | 涉及多位科学家、编辑、咨询委员会成员及政策报告作者 |
2403 | 2024-08-07 |
On the origin of systems. Systems biology, synthetic biology and the origin of life
2009-Aug, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/embor.2009.117
PMID:19636296
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2404 | 2024-08-07 |
Mid-Long Chain Dicarboxylic Acid Production via Systems Metabolic Engineering: Progress and Prospects
2024-Mar-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00002
PMID:38442481
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研究论文 | 本文探讨了通过系统代谢工程策略在不同底盘中合成中长链二羧酸的方法 | 利用系统生物学、合成生物学和进化工程的新工具,实现能源密集型生物燃料的可持续生产 | NA | 探索中长链二羧酸的可持续生产方法,并讨论该领域的未来挑战 | 中长链二羧酸的生产 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
2405 | 2024-08-07 |
Engineering living materials by synthetic biology
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0115645
PMID:38505813
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程化活体材料的研究进展,并讨论了面临的挑战和未来的机遇 | 受自然生物材料系统的启发,本文探讨了模仿其复杂精细制造过程和功能的新兴领域 | NA | 探讨合成生物学与材料科学交叉领域的活体材料工程 | 活体材料及其在环境刺激响应和与无机物质耦合中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2406 | 2024-08-07 |
Interfacing Living and Synthetic Cells as an Emerging Frontier in Synthetic Biology
2021-Mar-08, Angewandte Chemie (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/ange.202006941
PMID:38505493
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研究论文 | 本文讨论了将生物细胞与人工细胞结合以创建混合系统的可能性,并介绍了该领域的现状及三种通用的混合模式 | 提出了一种新的细胞仿生学方法,通过结合自上而下和自下而上的合成生物学,模糊了生物与非生物之间的界限 | 目前人工细胞无法与生物细胞的强大功能和行为复杂性相匹配 | 探讨生物细胞与人工细胞结合的可能性,以利用两者的优势 | 生物细胞与人工细胞的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2407 | 2024-08-07 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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研究论文 | 本文通过基因组规模的代谢模型和约束基流平衡分析、几何流平衡分析及流变量分析,设计了一种微生物宿主,通过引入双歧分流途径,绕过丙酮酸氧化,从而提高丙酮酸衍生物的合成效率。 | 本研究通过动态控制流分布和适应性实验室进化,建立了一种新的葡萄糖培养细菌的代谢模式,以在有氧条件下最小化碳损失,并为生产丙酮酸衍生物的细胞设计提供了有价值的见解。 | NA | 旨在通过代谢重编程,提高微生物宿主合成丙酮酸衍生物的效率,同时最小化碳损失。 | 微生物宿主的代谢途径和基因表达调控。 | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型、约束基流平衡分析、几何流平衡分析、流变量分析 | NA | 代谢数据 | 约3,000个基因编码库 |
2408 | 2024-08-07 |
Rule-based design of synthetic transcription factors in eukaryotes
2014-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400134k
PMID:24933274
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研究论文 | 本文开发了一种用于设计真核细胞中合成转录因子(sTFs)的语法,并将其集成到GenoCAD软件中 | 提出了一个用于设计合成转录因子的语法,并将其应用于GenoCAD软件,以指导用户创建预期的设计转录因子 | NA | 开发一种语法来指导合成转录因子的设计,以实现更可靠、高效和自动化的合成细胞设计 | 合成转录因子(sTFs)的设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2409 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and metabolic engineering for marine carotenoids: new opportunities and future prospects
2014-Sep-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md12094810
PMID:25233369
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综述 | 本文综述了海洋类胡萝卜素合成途径、酶以及多种海洋类胡萝卜素的修饰方法,并讨论了代谢工程和合成生物学在类胡萝卜素生产中的进展 | NA | NA | 促进海洋类胡萝卜素的应用探索 | 海洋类胡萝卜素及其合成途径和酶 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
2410 | 2024-08-07 |
Engineering microorganisms based on molecular evolutionary analysis: a succinate production case study
2014-Sep, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.12186
PMID:25469170
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研究论文 | 本文通过分子进化分析方法,研究了从不同物种中选择合适基因以优化代谢途径的能力,特别是针对琥珀酸生产的研究 | 本文首次探讨了通过分子进化分析来选择不同物种中的基因,以优化代谢工程和合成生物学中的代谢途径 | NA | 研究如何通过分子进化分析选择合适的基因,以优化代谢途径 | 研究对象包括来自糖酵解的九个基因以及参与琥珀酸前体供应的三种基因 | 合成生物学 | NA | 分子进化分析 | NA | 基因数据 | 研究涉及九个基因和三种基因类型 |
2411 | 2024-08-07 |
Protein localization analysis of essential genes in prokaryotes
2014-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep06001
PMID:25105358
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研究论文 | 本文对27种原核生物中的必需基因进行了全面的蛋白质定位分析 | 首次系统地从蛋白质定位的角度考察了必需基因 | NA | 深入理解必需基因的基本功能,并改进基因必需性预测 | 27种原核生物中的必需基因及其编码的蛋白质定位 | 生物信息学 | NA | 基因本体论(GO)分析 | NA | 基因组数据 | 27种原核生物,包括24种细菌、2种支原体和1种古菌 |
2412 | 2024-08-07 |
Computational approaches to metabolic engineering utilizing systems biology and synthetic biology
2014-Aug, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2014.08.005
PMID:25379141
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学工具进行代谢工程的计算方法 | 文章探讨了利用计算工具进行前瞻性预测设计以实现预期结果的方法,以及通过组合实验工具进行经验性探索和筛选所需特性的替代方法 | NA | 探讨代谢工程中系统生物学和合成生物学的计算工具应用 | 代谢工程中的细胞功能和生物化学应用 | 系统生物学 | NA | 计算工具 | NA | NA | NA |
2413 | 2024-08-07 |
Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica
2014-Jul-08, Tetrahedron
IF:2.1Q2
DOI:10.1016/j.tet.2014.03.009
PMID:25045187
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研究论文 | 本文描述了在Salinispora pacifica菌株中鉴定出负责lomaiviticin生物合成的基因簇 | 通过分子方法和基因组测序鉴定了lomaiviticin生物合成的基因簇,并利用比较基因组学识别了几个不寻常的后修饰事件的候选酶 | NA | 阐明lomaiviticin的生物合成逻辑,并为生物催化合成生物学提供有用的分子工具 | lomaiviticin生物合成的基因簇及其相关酶 | 生物化学 | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 涉及两个菌株DPJ-0016和DPJ-0019 |
2414 | 2024-08-07 |
Transient expressions of synthetic biology in plants
2014-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2014.02.003
PMID:24631883
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研究论文 | 本文探讨了植物中合成生物学瞬时表达方法的最新进展及其在生产大分子复合物和代谢途径分析与调控中的应用 | 瞬时表达方法使得在几天内高效传递和表达多个基因成为可能,并且可以微调载体以实现不同基因的差异表达 | NA | 研究瞬时表达技术在植物合成生物学中的应用 | 植物细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达方法 | NA | 基因表达数据 | 多种植物细胞 |
2415 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-based synthetic biology for the study of infectious diseases
2014-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2014.05.022
PMID:24997401
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研究论文 | 本文讨论了基于噬菌体的技术及其在研究传染病中的应用 | 提出了新的基因组工程策略,有望加速新型噬菌体疗法、诊断和工具的设计 | NA | 探讨噬菌体技术在传染病研究中的应用 | 噬菌体及其在分子生物学、遗传工程和合成生物学中的应用 | 分子生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2416 | 2024-08-07 |
Yeast synthetic biology platform generates novel chemical structures as scaffolds for drug discovery
2014-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400177x
PMID:24742115
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research paper | 本文首次报道了使用面包酵母通过组合遗传学方法生成74种新型化合物,这些化合物作为药物发现的支架结构 | 本文引入了一种新的合成生物学方法,通过与目标蛋白质的“共进化”生成新型化合物,这些化合物具有良好的生物活性,且结构复杂性高于合成片段 | NA | 开发一种新的合成生物学平台,用于生成新型化学结构作为药物发现的支架 | 74种新型化合物及其生物活性和结构特性 | 合成生物学 | NA | 组合遗传学方法 | NA | 化合物 | 74种新型化合物 |
2417 | 2024-08-07 |
Genetically engineered transvestites reveal novel mating genes in budding yeast
2013-Dec, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.113.155846
PMID:24121774
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研究论文 | 通过基因工程改造的“变装”酵母细胞揭示了新的交配基因 | 发现了新的MATα特异性蛋白Afb1,该蛋白干扰a因子(MATa细胞分泌的pheromone),并证明了强烈的pheromone分泌对有效交配至关重要 | 变装细胞的交配效率较低,且在所有潜在伙伴都分泌较少pheromone的情况下交配更弱 | 研究酵母交配过程中的效率控制因子 | 酵母细胞的交配类型特异性蛋白 | NA | NA | 基因工程 | NA | 转录组 | NA |
2418 | 2024-08-07 |
Design and analysis of a tunable synchronized oscillator
2013-Nov-18, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-7-26
PMID:24245660
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研究论文 | 本文设计并分析了一种可调谐的同步振荡器遗传电路,用于研究同步转录反馈环路 | 通过引入化学诱导的抑制因子,扩大了振荡发生的条件范围,并允许调节振荡频率 | NA | 研究同步转录反馈环路在不同条件和实验设置下的行为 | 设计了两种遗传电路,能够在小规模的大肠杆菌细胞群体中展示同步振荡的绿色荧光蛋白表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 小规模的大肠杆菌细胞群体 |
2419 | 2024-08-07 |
Tuning response curves for synthetic biology
2013-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb4000564
PMID:23905721
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中系统响应曲线的调整问题 | 提出了一个数学公式来捕捉广泛的生物响应曲线,并定义了一系列调整变体 | NA | 研究如何通过实验改变系统的响应曲线形状 | 细胞系统的响应速率调整 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2420 | 2024-08-07 |
A survey of enabling technologies in synthetic biology
2013-May-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-7-13
PMID:23663447
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的关键技术,并探讨了这些技术如何促进该领域的创新和发展 | 本文通过调查合成生物学实践者的意见和经验,总结了支持生物系统工程的关键技术,并强调了这些技术对合成生物学创新的重要性 | 文章主要基于调查结果,可能未涵盖所有合成生物学领域的关键技术,且对技术的未来发展趋势和挑战讨论有限 | 旨在探讨合成生物学中的关键技术及其对创新的影响,并提出相应的政策和管理建议 | 合成生物学领域的关键技术和实践者 | 合成生物学 | NA | DNA合成和测序技术,生物部件的公共和私有注册库,DNA构建体的物理组装标准方法,基因组数据库,DNA序列搜索、比对、分析和编辑的软件工具 | NA | 文本 | 自认参与合成生物学研究的实践者社区 |