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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2441 | 2024-08-07 |
Cell-Free Protein Synthesis From Fast-Growing Vibrio natriegens
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.01146
PMID:29910785
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研究论文 | 本文报道了一种基于快速生长的非致病性细菌Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统(CFPS)的开发 | 开发了一种新的基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统,并通过激活内源转录单元展示了其潜力 | 系统存在rRNA稳定性问题和关键底物消耗(如氨基酸)的限制 | 开发和优化基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统,以应用于生物技术和合成生物学 | Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统及其在生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 细胞外蛋白质合成 | NA | 代谢物分析 | 小规模批次反应 |
2442 | 2024-08-07 |
The Timing of Transcriptional Regulation in Synthetic Gene Circuits
2017-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00118
PMID:28841307
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研究论文 | 本文研究了合成基因电路中转录调控的时间特性 | 首次测量了两种常用转录因子在埃希氏菌中的信号时间,并展示了信号时间的变化范围及其与表达速率的关系 | NA | 探讨合成转录基因电路在活细胞中的转录调控时间尺度 | 转录因子AraC和LacI在埃希氏菌中的信号时间 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 单细胞数据 | NA |
2443 | 2024-08-07 |
Advances in bacterial cancer therapies using synthetic biology
2017-Oct, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2017.05.009
PMID:29881788
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工程细菌作为癌症治疗手段的进展 | 通过遗传修饰编程细菌的疗效、安全性和特异性特征 | 当前面临的挑战包括遗传稳定性等,这些是实现临床应用必须解决的问题 | 探讨合成生物学在细菌癌症治疗中的应用 | 细菌的肿瘤靶向、对肿瘤微环境的特定感知和响应、远程诱导方法及可控药物释放 | 合成生物学 | 癌症 | 遗传修饰 | NA | NA | NA |
2444 | 2024-08-07 |
Control mechanisms for stochastic biochemical systems via computation of reachable sets
2017-Aug, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.160790
PMID:28878957
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研究论文 | 本文提出了一种通过计算可达集来研究控制措施对分子交互模式影响的方法 | 本文引入了一种可达性分析形式,能够描述生物系统(自然进化或工程设计)的潜在行为,并提供一组关于其群体统计动态的界限 | NA | 通过理性引导分子过程来控制细胞行为 | 分子交互模式 | 合成生物学 | NA | 可达性分析 | NA | NA | NA |
2445 | 2024-08-07 |
Beyond patchwork precaution in the dual-use governance of synthetic biology
2013-Sep, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-012-9365-8
PMID:22535577
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学的预防性治理是否能防止其被用于有害应用,并提出了一个更系统的双用途预防网络的必要性 | 提出了一个更系统的双用途预防网络的概念,以更有效地防止合成生物学领域的未来滥用 | NA | 探讨合成生物学的预防性治理在防止其被用于有害应用中的作用 | 合成生物学的双用途治理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2446 | 2024-08-07 |
Cell-free protein synthesis: the state of the art
2013-Feb, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-012-1075-4
PMID:23086573
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成的现状及其在蛋白质工程、生物制药开发和后基因组研究中的广泛应用 | 无细胞蛋白合成技术通过摆脱基于细胞系统的限制,进一步推动了合成生物学的发展 | NA | 探讨无细胞蛋白合成的最新进展及其在特定应用中的潜力 | 无细胞蛋白合成技术及其在蛋白质工程、生物制药和后基因组研究中的应用 | 生物技术 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA |
2447 | 2024-08-07 |
Metabolic analyses elucidate non-trivial gene targets for amplifying dihydroartemisinic acid production in yeast
2013, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2013.00200
PMID:23898325
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研究论文 | 本文通过计算和体内代谢途径分析,识别出提高酵母中二氢青蒿酸(DHA)产量的代谢工程目标 | 本文采用极端途径(ExPa)分析和代谢通量分析,结合基因敲除和过表达策略,提出了一种提高DHA产量的创新方法 | NA | 旨在通过代谢工程提高酵母中二氢青蒿酸的产量 | 酵母中的二氢青蒿酸产量 | 合成生物学 | NA | 极端途径分析,代谢通量分析,基因敲除,过表达 | NA | 代谢数据 | 涉及一个DHA合成酵母菌株的代谢通量分布 |
2448 | 2024-08-07 |
Synthetic in vitro circuits
2012-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2012.05.179
PMID:22676890
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research paper | 本文探讨了体外电路作为设计、理解和利用动态生化电路平台的可行性 | 体外系统允许研究人员直接访问和操纵生物分子部件,避免了在活体中常见的复杂性和相互依赖性 | NA | 探索细胞外合成生物学作为理解原生生物电路和工程新功能的灵活测试平台 | 体外电路系统及其在复杂数学计算、联想记忆任务和小分子传感中的应用 | synthetic biology | NA | DNA/RNA/蛋白质基电路技术 | NA | NA | 超过100个编程分子成分的系统 |
2449 | 2024-08-07 |
Meta-DNA: synthetic biology via DNA nanostructures and hybridization reactions
2012-Jul-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2011.0819
PMID:22237679
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研究论文 | 本文开发了一种名为meta-DNA(简称mDNA)的生物化学系统,基于DNA链作为唯一组分分子,通过脚架介导的DNA链置换反应模拟各种酶对DNA分子的操作 | 提出了基于DNA链置换反应的meta-DNA系统,模拟了多种酶对DNA的操作,包括链置换、限制切割、聚合反应等 | NA | 探索通过高度简化的相互作用类能否产生广泛的复杂生物化学行为,特别是通过简单的DNA杂交化学能否模拟蛋白质酶对DNA的操作 | meta-DNA系统及其在模拟酶对DNA操作中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA | NA |
2450 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and the ethics of knowledge
2010-Nov, Journal of medical ethics
IF:3.3Q1
DOI:10.1136/jme.2010.038232
PMID:20935316
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research paper | 本文探讨了合成生物学在伦理学上的重要性和潜在的滥用风险 | 提出合成生物学知识可能被滥用的风险,特别是在生物恐怖主义或战争中 | 未具体讨论合成生物学技术的实际应用和具体伦理问题 | 探讨合成生物学对生物伦理学家提出的要求 | 合成生物学及其伦理问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2451 | 2024-08-07 |
Design and analysis of synthetic carbon fixation pathways
2010-May-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.0907176107
PMID:20410460
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研究论文 | 研究通过计算方法设计并分析了合成碳固定途径,以提高碳固定效率 | 提出了新的合成碳固定途径,这些途径在动力学速率上可能比自然途径有显著优势 | 实施这些合成途径面临表达水平、活性、稳定性、定位和调控等挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学提高食物和可再生燃料生产的可持续性 | 碳固定途径及其效率 | NA | NA | 计算方法 | NA | NA | 约5000种已知在自然界中存在的代谢酶 |
2452 | 2024-08-07 |
Robust synthetic biology design: stochastic game theory approach
2009-Jul-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btp310
PMID:19435742
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机博弈理论的鲁棒合成基因网络设计方法,以实现预定稳态 | 采用Takagi-Sugeno模糊模型和线性矩阵不等式技术,通过Matlab中的鲁棒控制工具箱,近似非线性合成基因网络 | NA | 解决合成基因网络在不确定初始条件和细胞外环境干扰下的鲁棒性设计问题 | 合成基因网络 | 合成生物学 | NA | 线性矩阵不等式(LMI) | Takagi-Sugeno(T-S)模糊模型 | NA | NA |
2453 | 2024-08-07 |
Underlying principles of natural selection in network evolution: systems biology approach
2007-Sep-26, Evolutionary bioinformatics online
PMID:19468310
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综述 | 本文综述了后基因组时代如何采用比较方法和动态系统方法来理解网络进化的基本设计原则,并塑造新兴的进化系统生物学领域 | 将系统生物学与进化生物学相结合,探索生物网络设计的新方向 | NA | 阐明细胞中代谢和调控系统的基本原理,并最终实现对细胞对扰动响应的预测性理解 | 生物网络从基因到有机体水平的进化和功能 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2454 | 2024-08-07 |
Towards overcoming obstacles of type II photodynamic therapy: Endogenous production of light, photosensitizer, and oxygen
2024-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.007
PMID:38486983
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综述 | 本文综述了通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服传统光动力疗法(PDT)障碍的方法 | 利用合成生物学的进展,通过基因工程细胞内源性生产光、光敏剂和氧气,以提高PDT的效果 | NA | 探讨如何通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服PDT的障碍 | 光动力疗法中的光渗透限制、肿瘤对光敏剂的低摄取以及肿瘤微环境中氧气的缺乏 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2455 | 2024-08-07 |
A framework for evolutionary systems biology
2009-Feb-24, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-3-27
PMID:19239699
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研究论文 | 本文提出了一种将进化理论与当前系统生物学方法结合的新框架,用于量化突变的小效应及其上位相互作用 | 该框架通过定义可在当前系统生物学模型中计算的适应度相关性,利用计算系统生物学中的严格算法,结合模型的现实性和进化理论中对真实系统的理解需求 | NA | 旨在更详细地理解生命的基本原理,结合多个学科的已知生物系统知识 | 突变的小效应及其上位相互作用,适应性景观的不同‘层次’,以及突变效应的分布、有利突变的性质、上位性和鲁棒性 | 系统生物学 | NA | 计算系统生物学算法 | 系统生物学模型 | 生物系统数据 | NA |
2456 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: discovering new worlds and new words
2008-Sep, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/embor.2008.159
PMID:18724274
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2457 | 2024-08-07 |
Synthetic morphology: prospects for engineered, self-constructing anatomies
2008-Jun, Journal of anatomy
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/j.1469-7580.2008.00896.x
PMID:18510501
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研究论文 | 本文探讨了将合成生物学新兴技术应用于解剖学领域的前景,旨在编程细胞自我组织成特定的、新颖的排列、结构和组织 | 提出了一种新的交叉学科——合成形态学,旨在开发细胞自我构建组装的方法 | 需要开发大量的传感器模块、调节模块和效应器模块,并实现这些模块在细胞内的功能连接 | 探索合成生物学在解剖学中的应用,实现细胞的自我组织和构建 | 细胞的自我组织和构建 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2458 | 2024-08-07 |
Multifunctional 5-hydroxyconiferaldehyde O-methyltransferases (CAldOMTs) in plant metabolism
2024-Mar-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae011
PMID:38198655
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综述 | 本文综述了多功能5-羟基松柏醛O-甲基转移酶(CAldOMT)在植物代谢中的作用及其相关蛋白质,并讨论了其在生物炼制、农业和合成生物学中的进化、分子机制和作用。 | CAldOMTs在进化过程中发生了多次新功能化,产生了具有新颖催化活性和/或接受新底物的独特O-甲基转移酶(OMTs)。 | NA | 总结CAldOMTs及其相关蛋白质在植物代谢中的多方面作用,并探讨其在不同领域的应用。 | CAldOMT酶及其在植物代谢中的作用。 | 植物代谢 | NA | O-甲基转移酶(OMT) | NA | NA | NA |
2459 | 2024-08-07 |
Aggregation-Induced Emission Luminogens: A New Possibility for Efficient Visualization of RNA in Plants
2024-Mar-06, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13050743
PMID:38475589
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研究论文 | 本文探讨了利用聚集诱导发光分子(AIEgens)在植物中高效可视化RNA的新技术 | 首次将AIEgens技术应用于植物RNA成像,并结合点击化学和CRISPR/Cas13a系统进行精确RNA修饰 | 需要寻找一种特定的酶,该酶能以AIEgens为底物并通过点击化学反应将其修饰到目标RNA上 | 开发新的技术以提高植物RNA成像的效率和精确性 | 植物中的RNA | 生物技术 | NA | 聚集诱导发光(AIE) | NA | NA | NA |
2460 | 2024-08-07 |
Promoter screening and identification for metabolic regulation in Acremonium chrysogenum
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300683
PMID:38479986
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据,筛选并验证了27个候选启动子,用于提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产 | 开发了一种快速筛选潜在双向启动子的方法,并利用Golden Gate方法将启动子模块与目标基因结合,成功提高了头孢菌素C的产量 | NA | 提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产效率 | Acremonium chrysogenum中的启动子筛选与代谢调控 | 合成生物学 | NA | Golden Gate方法 | NA | 转录组数据 | 27个候选启动子 |